Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI010154 | Chr8 | 2623421 | 2635432 | + | Auxin response factor 5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI010154.m1 | 151 | 233 | PF02362.24 | B3 | Family | 30.7 | 2.40E-07 |
| LITCHI010154.m1 | 258 | 341 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 113.6 | 4.20E-33 |
| LITCHI010154.m1 | 807 | 894 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 44 | 2.50E-11 |
Download Copy
>LITCHI010154.m1 ATGATGGGTTCTTCTGTTGAAGAGAAGATGAAAACAGGAGACTTGGTTGGGGTTGGTCGA GCACAAACAACTTTGCTCGAGGAAATGAAGCTGTTGAAAGAAATGCAGGATCAGTCTGGA ACCCGGAAAACCATAAATTCCGAGCTATGGCATGCCTGTGCTGGTCCTCTTGTTTCGTTG CCACAGGTGGGAAGTCTTGTGTACTACTTCCCTCAAGGACATAGTGAACAGGTGGCAGTT TCCACTAAAAGGACAGCGACGACCCAAATTCCAAACTATCCTAATCTTCCATCTCAGCTA TTGTGCCAAGTTCACTATGTTACATTACATGCAGACAAAGAGACTGATGAAATTTATGCC CAAATGAGTCTTCAGCCGGTGAACTCTGAGAAGGATGTCTTCCCCATACCAGACTTTGGA CTCAAGCCAAGCAAACACCCAAATGAGTTTTTCTGCAAAACCCTGACTGCAAGCGATACA AGCACACATGGTGGTTTCTCAGTGCCACGCAGGGCAGCAGAAAAGCTCTTTCCTCCATTG GATTACACAATGCAACCACCCACTCAAGAGCTTCCCAAGAGACACCTTCTCACAACAGGG TGGAGTTTGTTTGTTGGGTCAAAAAGGCTTAGAGCAGGTGATGCTGTTTTGTTTATCAGG GATGAGAAGTCACAGTTGTTGGTGGGTGTAAGGCGCGCAAATCGTCAACAAACAGCATTA CCCTCGTCAGTTTTATCTGCTGATAGCATGCACATTGGTGTCCTTGCTGCTGCAGCTCAT GCTGCCTCCAATAGAACCTCATTTACAATTTTCTACAATCCTAGGGCATGTCCGTCAGAA TTTGTTATTCCTTTGGCAAAATATCGTAAGTCTGTTTATGGGACTCAAATCTCAGTTGGT ATGCGGTTTGGGATGATGTTTGAAACAGAGGAGTCTGGTAAACGTAGATATATGGGTACG ATAGTTGGTATTAGTGACTTGGATCCATTGAGGTGGCCTGGTTCCAAGTGGCGAAATCTT CAGGTGGAATGGGATGAACCGGGGTGTAGTGATAAGCAGAAAAGGGTTAGTTCATGGGAA ATTGAGACTCCTGAAAGTCTCTTCATTTTCCCTTCTCTGACTTCTGGACTCAAACGACCA TTTCATCCTGGATTATTAGGAGCAGAAGTTGAATGGGGAAATTTGTTGAAGAGGCCCCTT CCCCGTCCTCCTGAAATTGGAAACGGGGTTATTCCCTACTCTTCAATTTCAAACTTGTGT TCTGAGCAATTGCTTAGGATGATGCTAAGACCTCCACTCGTTAACCATTCTGGGACCTTT GCATCTTCCCTTCCGCAAACCTCTGCTGTTAAAGGAACTCCACTGGAAGAGGTTAAGACC TTGCAGGCTACGGTCAATCAGAAACCCCAACTTATCCAGTCAGAAAATACAATCATAGAA AGCCAAAATTGTTTCCAGTCCGGCCTCGACCAAGCTGATACCATAAATTCAAGTTCATCA AAAATAAATTTACCTGAAAGGCCAAATCCTTCAAGCAAATGTGATAAGCAAACACCAGCT GGAACTAATATTGATAGTTTAAAATCAGAGCCTGAGCAATCAACACATCAGTTGAGCCAT TTAACTTCAACGGCAGAGTGCAGTGAGGAGAAGCTGGTCTCTAGTCCTCTAAATCCACAG ACCATTTTAAACCAGCTTATGTTACAAAACCAGAACCAGGGTCTAATGCAATTGCAATCT AGTATGTGGCCTATTCAGTCACCATTGGAATCAACAGTATTTCAGGCACAACAGGTTAAC TTACCACAATCTGATTCTGCTAATCTAAACGGCTTACTTCCTTTCTCAGATGCTGAGGAA TGGATTTATAATAAAGTATCTGGGCCTCTATCAATGTATGGTTTGCAAGACCCTTCAACA GCATTCCCCGAAGTGATTAATCCACCTCTACCTTCCACGGGTCAGGATATGTGGGATCAT CAACTGAATAATTTAAAATTCTTATCCCAAGTTGACCAGTTCACTCCATTTGCCCAGCAA GATACATCTAACCTCAATTCTAATGGATTGAGAGATTTGTCAGACGAAAGCAATAATCAA AGTGGGATCTACAGCTGTCTTAATGTTGATGTTAGTAATGGAGGGGGAGCTGTGATTGAT CATTCAGTTTCAAGTGCCATTCTGGATGACTTTTGTACATTGAAGGATGCCAATTTCCAG AATCCTGCAGATTGTTTGATGAACAACTTTAGTTCTAGCCAGGATGTTCAGTCTCAGATT ACTTCTGTAAGTTTAGCTGACTCGCAGGCTTTCTCTCGTCAAGATTTCCCTGACAACTCA GGTGGCACATCATCAAGCAATGTGGATTTTGATGAAAACAGTCTATTGCAGAAGACCTCG TGGCAGCAAGTAGCACCACCTGTGCGGACGTATACAAAGGTTCAAAAAGCAGGATCTGTT GGGAGGTCGATTGATGTCACAACTTTTAAAAATTATGAAGAACTACGCTCTGCAATTGAA CGCATGTTCGGACTTGAGGGGTTGCTTACGGACCCCAAAGGTTCTGAGTGGAAACTGGTG TATGTGGATTATGAAAATGATGTTCTGCTTGTTGGGGATGACCCTTGGGAGGAATTTGTC GGCTGCGTCCGCTGCATCAGGATTCTGTCGCCTCAAGAAGTTCAGCAGATGAGTGAAGAG GGAATGAAGCTTCTTAACAGCGCTGCAATGCAAGGCATTGATTGTTCCATGGCAGGAGGT GACCGCGCCTGA
Download Copy
>LITCHI010154.m1 MMGSSVEEKMKTGDLVGVGRAQTTLLEEMKLLKEMQDQSGTRKTINSELWHACAGPLVSL PQVGSLVYYFPQGHSEQVAVSTKRTATTQIPNYPNLPSQLLCQVHYVTLHADKETDEIYA QMSLQPVNSEKDVFPIPDFGLKPSKHPNEFFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKLFPPL DYTMQPPTQELPKRHLLTTGWSLFVGSKRLRAGDAVLFIRDEKSQLLVGVRRANRQQTAL PSSVLSADSMHIGVLAAAAHAASNRTSFTIFYNPRACPSEFVIPLAKYRKSVYGTQISVG MRFGMMFETEESGKRRYMGTIVGISDLDPLRWPGSKWRNLQVEWDEPGCSDKQKRVSSWE IETPESLFIFPSLTSGLKRPFHPGLLGAEVEWGNLLKRPLPRPPEIGNGVIPYSSISNLC SEQLLRMMLRPPLVNHSGTFASSLPQTSAVKGTPLEEVKTLQATVNQKPQLIQSENTIIE SQNCFQSGLDQADTINSSSSKINLPERPNPSSKCDKQTPAGTNIDSLKSEPEQSTHQLSH LTSTAECSEEKLVSSPLNPQTILNQLMLQNQNQGLMQLQSSMWPIQSPLESTVFQAQQVN LPQSDSANLNGLLPFSDAEEWIYNKVSGPLSMYGLQDPSTAFPEVINPPLPSTGQDMWDH QLNNLKFLSQVDQFTPFAQQDTSNLNSNGLRDLSDESNNQSGIYSCLNVDVSNGGGAVID HSVSSAILDDFCTLKDANFQNPADCLMNNFSSSQDVQSQITSVSLADSQAFSRQDFPDNS GGTSSSNVDFDENSLLQKTSWQQVAPPVRTYTKVQKAGSVGRSIDVTTFKNYEELRSAIE RMFGLEGLLTDPKGSEWKLVYVDYENDVLLVGDDPWEEFVGCVRCIRILSPQEVQQMSEE GMKLLNSAAMQGIDCSMAGGDRA.
Download Copy
>LITCHI027396.m1 CTTACACACTCTTTTCTCAATATTCTCCTACGACCCCCATTGCGCACTCTCTCTTATACC TCTCTCTATTTACATCTACTTTGTTTCTTTTGGCTTCCTTCTTCTTTTTCACTTTTAGAC TTTTGTTTTTCAATCTGCAGTCATGGGTGGAAACTCACCATGTGCTTCTTGCAAGTTGCT GCGCCGCCGTTGCGCCAAAGACTGTGTCTTTGCTCCTTACTTCCCCTCCGATGATCCCCA CAAGTTTGCCATTGTTCACAAAGTCTTTGGTGCTAGCAATGTTAGCAAAATGTTGCAGGA GCTTCCAGTTCATCAGAGAGCAGATGCAGTGAGCAGTTTGGTGTATGAAGCAAACGCTAG AATGAGAGACCCAGTTTATGGATGTGTTGGGGCCATATCTTTCCTTCAAAACCAGGTTTC TCAGCTGCAAATGCAACTAGCAGTAGCTCAGGCAGAGATTCTCTGCATCCAGATGCAGCA AGAGCCCGTGATGCCTACCCCACAAATCATAGACCCAGATGATCATCAAGATTACCATCA TCATCATCAGAAGTCATCATCAACATCATTTCTTGATCTCCAAAATAACCACCCTCAGTA CCTCAATTTTGCCTCCACCACTTCTAGCAATGTAATCCATGATTATTCTCTCAAAAGAGA GAGCATTTTTGGACATGACATGGTTTCTTAATTAATTTGATTAATAATAAAATTTTCCCT TTTGCTTTAATTAGTTCATACTTCTTATCAATGATAGACAAAGTTTTGTCTTCCTTTTTT TTTTTTCTTTTTGTTTTTTGTGTCTTTTGTTTTAC
Download Copy
>LITCHI027396.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTGGTCAAACCATGTGTATTGAGAGGGAGAAAGAGAGATGTTATGGTCATTAATTGTCT GAATATATATATATATATATATATATTTATGTTTTCATATATGTTTGTGTTCACGTGAAT GTTTGTGTGAAGCTAACAAACATTCACGTTGAGCCTCTTCTCATCTCATGATCATGCTAG TCTTTGGTTTAGGGTTTCTCAATTGTTGCAATTTTCTTAAACTTGGATGTTTAAGGATGT TGGGTGCTTGCAGTTGAATTCATCTCACATATCCTTGGTTACAATTATGATATATTACAA TTTTAAGATTATATTATATGATTTAATTTTAATAAATGAAAATATTATATATCAATGTAT CATAACATTAAATCATAAATATTATAATTTGACTTTTTCCTATCAATTTAAGCTCTTGGA CTAATGATAATTAATATAGTGAAGATCTCTAGTCCAAATTTTATTACTTAATTAAACTTA TATAATTCGGTCTCAACAACAGACGTATAGTATATTTTGTTGTGTGCAAAAAAACATTGA CCTTTCACGCGGCTTGTCCACTTTAAGGACCCTATGGTAGCGCACCCAAACGCACGCACG CACACAGAGGGCTAAGTAGTCTGCACATTCAAATTAACTAAAGCTAGTTCATAGTTGTTG AATTTTTTAATAGAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAATATAAAAGAGAGAACGTGGAAGCC ATATAACCTATTATTGTTTACAGAGTTAATACATATAAACGTAGGTGCCAACCTAACACA CGGTTTGGCTGTGGTCAACCATAGCCGTTTGTTTCACTCAAACTTTGATGATGAGCTGTG CACCAGGCTAAACGGCAGCCCCTTCACTTTATATTGCCCCTCCGTAGAATTGGTTTGGAT TTGTTTTTTTTTAAGTAAAAATTAATTTGGACTTCGTGGACGTCCTTAAAAGAAATACTT TAATTTGTACGGTATGTATGTCATAACCACTCATATAAAATTTTTTATACCATATAATAC GATATAAGTAAAATAGATACACATTGTTTAATTTACTCATATATTGAAATTTAATGGATA TATAAGAATTTTATTTGTTTTTTTCTAGACATAAATAAATATACATTTATATGCAAAAAG AATAATTAGGGTTTTGAATTCATATCGAAATAATTTTACGTATTTTGTTGTTATACCTAA GAGTTATTGTTACTGTTTTTAGATTAAATATGTTACTCACATGAGTTTATAATCAGTAGT TTTCTATGCAATAATTGCAATGGAGAAAATGTTGTATAGACTTCCACAACTCGAATGAAA TTTTACGTAGAAAAAAATTAATTCAAATTATAATTGGCAATATTCTTTATTTTGTGCAAA TCAACCCTATTGTCAATCCTTCAAAGCCAAAAATGACCATTAGAAGCCACATGATATTGA ATATGACCTATACTATTCTTCGAAATGATTCACTTCCATTATTAGCATGTTTTATTGGAT GAGTATGAACTTGTACATGAGCTTGAAGCTGGCTAGCATTTCTTCTTCAAAACTCAATCA TGTACTCAAATTTTTCTCTCCTCTGTAAGATACTATAATAATTAACTATTCAAATTACAT TAATCAAACCAAACCAACCCTTCTTCTAAATTATATTATTGTAGGTAAAGAGCCAACCCT TTTGATCTATAGTACACTCAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCTCGCTCGCTCGCTCGCTCTCGCACACGTACACAC TACACATACAAAAAGTAACTCATCACACGTTCTAGACTATTATAAATACACACACCCACT TACACACTCTTTTCTCAATATTCTCCTACGACCCCCATTGCGCACTCTCTCTTATACCTC TCTCTATTTACATCTACTTTGTTTCTTTTGGCTTCCTTCTTCTTTTTCACTTTTAGACTT TTGTTTTTCAATCTGCAGTC
Download Copy
>LITCHI027396.m1 GenomeSequence + CTTACACACTCTTTTCTCAATATTCTCCTACGACCCCCATTGCGCACTCTCTCTTATACC TCTCTCTATTTACATCTACTTTGTTTCTTTTGGCTTCCTTCTTCTTTTTCACTTTTAGAC TTTTGTTTTTCAATCTGCAGTCATGGGTGGAAACTCACCATGTGCTTCTTGCAAGTTGCT GCGCCGCCGTTGCGCCAAAGACTGTGTCTTTGCTCCTTACTTCCCCTCCGATGATCCCCA CAAGTTTGCCATTGTTCACAAAGTCTTTGGTGCTAGCAATGTTAGCAAAATGTTGCAGGT GACCTCTCTTTCTCTCTCTCTCATTTATATAACATGCACATATATTTATATATACATGTT ATACTGGATTTTCTCTAGTAAGGACGGTTGTGATTTCAATTCCCACCGTACCCTAATCAC ACGAATGTAGTTTAGTTTCCAGGTTGATTAAAATCATCAGGATGATTTTGTTGCATTTGC ACACGTATATAAGTTAGAAAATGAATGTGTACATTTTACCTGTTTTAGGACTCATTAATT ATTTCCCATGTGACAAACAACATTTGTGTTTATGTAACCATTTCTAGGTTCGAATCTCTT CACATGATTACATGAGTCAGTATATGATGTCATGAGTATTGTTATGTGATTTGTAGAATC TTTTTAATTAACCTTGTCTAGTTGATCAAGCAGGAGCTTCCAGTTCATCAGAGAGCAGAT GCAGTGAGCAGTTTGGTGTATGAAGCAAACGCTAGAATGAGAGACCCAGTTTATGGATGT GTTGGGGCCATATCTTTCCTTCAAAACCAGGTTTCTCAGCTGCAAATGCAACTAGCAGTA GCTCAGGCAGAGATTCTCTGCATCCAGATGCAGCAAGAGCCCGTGATGCCTACCCCACAA ATCATAGACCCAGATGATCATCAAGATTACCATCATCATCATCAGAAGTCATCATCAACA TCATTTCTTGATCTCCAAAATAACCACCCTCAGTACCTCAATTTTGCCTCCACCACTTCT AGCAATGTAATCCATGATTATTCTCTCAAAAGAGAGAGCATTTTTGGACATGACATGGTT TCTTAATTAATTTGATTAATAATAAAATTTTCCCTTTTGCTTTAATTAGTTCATACTTCT TATCAATGATAGACAAAGTTTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTTTTTTGTGTCT TTTGTTTTAC