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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010101 | Chr8 | 2180754 | 2185059 | + | Receptor protein kinase CLAVATA1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010101.m1 | 24 | 64 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 31.2 | 2.20E-07 |
LITCHI010101.m1 | 286 | 308 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.3 | 0.022 |
LITCHI010101.m1 | 286 | 300 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.2 | 1.5 |
LITCHI010101.m1 | 572 | 586 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 11.8 | 0.23 |
LITCHI010101.m1 | 692 | 963 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 146 | 1.50E-42 |
LITCHI010101.m1 | 693 | 965 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 146.9 | 7.20E-43 |
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>LITCHI010101.m1 ATGAAAGCTTACCTGTTTATAGTTGCTTCACTTCTCATACTTTTTGTCAAGTGTTGTTCT GGGTACGGTGAACTTGATGTTCTCTTGAAGCTCAAGTCCTCAATGATTGGTCCAAAAGGG TCGGGACTCAAAGACTGGGTGCCTTCCTCTTCTCCAACAGCTCATTGCTCCTTCTCTGGT GTACGTTGCGACCGGAACTCGCGTGTGGTGGCTCTGAACGTGTCGTTTGAGCTTCTGTTT GGGACTCTTCCGCCGGAGATTGGGCTGTTGAACAAGCTTGTGAACTTGACAATCTCCACT GTCAGCCTCACTGGGAAGCTGCCTTCGGAGATGGCGAATCTCACGTCCATTCGAGTCCTC AACATCTCCAACAACGTCTTCGTAGGCAACTTCCCTGGAGAAATCGTTCTCGGGATGACA GAGCTCGAGACTCTCGACTGTTACAACAACAACTTCACCGGTCCCCTCCCGCTCGAGATT GTGAGTCTAAAGAACCTGAAACACCTCTCTTTCGGCGGTAACTACTTCACCGGAGAGATA CCGGAGAGTTACGCGGAGATTCAGAGCCTGGAGTTTCTGGGTTTGAATGGTAACCAACTT CAAGACAAAGTCCCAGCATTTTTGTCCAAGTTGAAAAACCTGAGAGAAATGTATATTGGC TACTACAACACCTATCATGGACAAATCCCACCTGAGTTTGGTACGTTGAGTCGACTCGAG GTTCTCGATATGGCGAATTGTAGCATCTCAGGTGAGATTCCTACGAGTTTGAGCCAGTTA AAGCACTTGCACTCTTTGTTTCTCCAAGTAAACCATCTCACAGGTCACATACCCCCGGAA TTGTCCGGATTGATTAGCTTGAAATCGCTTGATCTCTCTAACAACGTTCTAACCGGAGAG ATACCTGAGAGTTTCTCTGCATTGACCAACTTCACGCTCATCCAGCTCTTCAACAACGAC CTCTACGGTCAAATTCCTGCCTTCATCGGAGATTTGCCAAACCTTGAAGTACTCAAGTTG TTTGGAAACAACTTCACTTTCGAACTGCCACGTAATCTCGGTCGAAACGGGAAGCTAAAG ATTCTCGACGTCGCGACCAACCACCTCACCGGACCCATCCCTCGTGACTTGTGCAAAGGC GGGACGTTGCAGTCGCTGATTTTGATGGAGAATGCGTTCCTTGGTTCAATTCCTGAAGAG CTTGGAGAGTGTCAGTCGCTGCTCAAAATTCGTGCCATGAAAAACGAACTCACTGGAAAT ATTCCTGCAGGTATCTTTAAGTTGCCTTCGTTGTCCATGATTGAGTTGAATGATAATTTC TTGTCTGGGGAGCTTCCAGAGACCATGTCAAGTGCTTCACTCAGTCAGCTGAAACTCGCG AACAATAACATCACCGGTAAGATCCCTCCAGCGATTGCAAACTTGCCTAATTTAACCGTC TTGTCTCTTCAAAACAACAGACTCAACGGTGAGATACCGATGGAAATTTTCAATCTCAAA CAGATTTCGACTATCAACATCAGTGGCAACAACATTAACGGTCAAATTCCATCGTCCATT TCTCGTTGCCATTCTCTGATTTCCATCGATTTTAGTAGAAACAGTTTCAGTGGAGAGATT CCAAAAGGAATTTCGGAACTTTCAGTTTTGAGCATACTGAATATCTCTAGAAACCAATTC ACAGGTCCAATTCCAGACGAAATTGGACTCATGACCAGTCTCACAACTCTTGATCTCTCT TACAACGATTTCATTGGTAAAATTCCAAGTGGAGGTCAGATTTTGGCATTCAACGATTCC TCTTTCGCTGGAAACCCCAGCCTCTGCTTCCCACGCTACGTGTCATGTCCATCGCTCGCT AGTTCGATGAAACACTCTGGTCACAACCATACGACGTCGTTTGGTTGTTCCAAGGTTGTA ATCACAGTCATTGCACTGGTCACGGCCCTTTTGTTGGTCATTGTCACGCTTAATAGACTA CAGAAGAAGAGGTCGCAGAAATCAGGGGCCTGGAAGCTGACTGCGTTTCAACGGTTGGAC TTCAAAGCAGAGGACGTGGTCGAGAGCTTGAAAGATGAGAACATCATAGGCAAAGGCGGT GCCGGGATCGTCTACCTCGGGTCCATGCGTGACAACGTCGACGTGGCAATTAAACGCTTG GTGGGTCGGGGGACGGGCCGGTCCGACAACGGGTTCTCGGCTGAGATTCGGACTCTGGGT CGGATCAGGCACAGGAACATCGTGAGGCTTCTGGGTTACGTTTCGAATAAGGATACCAAC TTGTTGTTGTACGAGTACATGCCGAATGGGAGCTTGGGGGAGCTGTTGCATGGAGCCAAG GGAGGACACTTACAGTGGGAGACAAGGTACACAATCGCTTTGGAGGCTGCCAAGGGGTTG TGTTATCTCCACCATGACTGCTCCCCGTTGATCATTCACAGAGATGTCAAGTCTAATAAC ATATTACTTGATTCGGATTTTGAAGCTCATGTTGCTGATTTTGGACTCGCCAAGATCCTG CAGGACCCTGGCTCCTCTGAGTGCATGTCCGCTGTCGCTGGCTCTTATGGCTACATCGCA CCAGAGTATGCCTACACATTGAAGGTGGATGAGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGTGTG GTGCTGTTGGAACTAATAGCAGGGAAGAAGCCAGTTGGGGAGTTCGGAGATGGGGTGGAC ATAGTTAGGTGGGTAAGGAAAACCACATCAGAAGTCTTTCAGCCGTCTGATGCAGCTTCT GTGATGGCAGTTGTGGATCCCAGGCTTAGTGGGTACCCACTGACAAGTGTCATTCATTTG TTCAAGATAGCTATGATGTGTGTTGAAGATGAGAGGTCCGTTAGGCCCACCATGAGAGAA GTTGTCCACATGCTTGCCAGTCCTCCACAGTCCGCCCCAAGCCTACTCAGTCTTTAG
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>LITCHI010101.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTGAGAATAATATATTGAAAGAAAATGGAAGAAATAAAATAAAAATAGTGGATACGAGAT TTATGTGGTAAAACCTTCAATGTGAGAAAAACATCTATAGACTAAAACTAAAAAAATGTT ATTAAACCAACAACTACAATACAATCTCTCTCTAAAATTTTAGAAAAAAGCTAAGGAGAA GAGACACGAGACTTGGGACGTGTTAAAATGACTAGTGCCCATGTCTTTATATTAACATAG CGGTGCAAATGTAATAATATATTTGTTTACTCATAAAATTTTAATATTTTAATATTCATA ATAGTGTACAAAAATTTATTTTATTATCTTTTAATTGTTTCATTGTCTTTTAATTGTCGT CAAAAATTGTGGTTTCACCATCATATAATATAATATGTCTTCATCTACTCATTTAACTTT TTCTAATATAATATAATTTTGATAGTATAATTTTGAATTATATGTTTAGAGACTTACATA AATTAGATCTCAATAATATATTAATCTAGTGTCAAAAGAGACGAGAATAATCTTACCTAG AATTCCAATGTACACTTTAAAAAGAAAGTCCACGATCCAAACAAGTTTTGAGTTACAATT GTGAGTCGGTTCTAGAAACCAAGTGAAGATCAGATATGGTCACAAATGTGTGATCAAACC TTATCTTTACCTGCTAACCGTTCGATAATGACAAAGGTGGAGAAAGTAAACGTGATGGAG GGACCGTAGAATGCCGTTTGACCAAGGGCCCACCACTGGACGATCCAGACCGGAGAAAGG ACAAAAAAGAGAGTGGACTTTCAGGTCACAACGAATTGGGGGAATCAGAAAGAAAATGTC TGTTTGGGAAAGGACACACACAGCCTTTGCTACATGGGCCCGGTTCTATTTTTATTTTTT TGTTACCAGAAATCAGAAATCATAAATCCATCCAAAACTATTCATAAATTCCTCAAAAAG ACAGCATCCACATTGATATTTGTTGGATCCAAAAAGCCTATACATATTTGAGTTTTCCAA TGCAATCTAAGTAGTGTACATATCCTTTAACAAGTTTTAAAGTCCATCAAATTAAACCAT TCACGCGTACCTTTTTAAGACTATGGTCTGTTTGAATGATTATGAGATCCATCAGATGGA GAATTTCATACGTTTTTTATGGAAAAAAATAATTTTATAATATTATAAATTAATTGTATA GTATTGCCAGTATACAGTTGAAGAATTAGAAATTTTATATTAAAAATATGTGAAATTTGG CATGAAATTTCTTATCTAAATATAATATTATTGATAGTCTTCTGGTACCGATAATTTAAA AAAAAAAATTGTCACCGTGATCATTGGCCGCGTTAATAAACAACTGGCAGAGATCTGACA CGAGAGCGGAAAAAACTGCAACACTATCATGGCGCTGTCCATCAAGAGCCAGATCACGCC GTCAAAATTTTACCTATCAGTACGTACGATTACTCCATAGACCCTACATATATAGAATAC CAACCGATACTACTGGTAGCATACTCCGTTTAAATTCGTCCATATAATGGAAACGTCGTT TGAACACCGTCAACTAGAGTATCGTACAACCTAACCATACCAAATTGCTGGTGCTACAAG AGACTAGGACACAAGACAGACACGCGGCTCTCATGCAATCTCTCTATCTGTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCACCCTCTCGCGCGCGCGCCTTGCTGTTTTTGCTTTTGTTTTGTTTTGT TTTGTTTTTTTTTTTTTTAATTCTTTATTAATTCAAGCGTTTGATTTGTTATATATAAAT ATATATTATTTGAAGTCTACGATTCTCTCTACAAAGGCCAGTGCGCAGCACTACTTAATA TAGCTATACACACTACTGTGATTTGAAGTACTGCATGCATTGAACTACAACGCTACTTTG ATTCTCTTCTCTCTAGAGAACAAACAAAAGCAAAAACAGAAACAAACCAGTGAGAGAGAG AGTGAAGGGAGATTACAGAT
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>LITCHI010101.m1 GenomeSequence + CACGCGGCTCTCATGCAATCTCTCTATCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCCTCTC GCGCGCGCGCCTTGCTGTTTTTGCTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTAA TTCTTTATTAATTCAAGCGTTTGATTTGTTATATATAAATATATATTATTTGAAGTCTAC GATTCTCTCTACAAAGGCCAGTGCGCAGCACTACTTAATATAGCTATACACACTACTGTG ATTTGAAGTACTGCATGCATTGAACTACAACGCTACTTTGATTCTCTTCTCTCTAGAGAA CAAACAAAAGCAAAAACAGAAACAAACCAGTGAGAGAGAGAGTGAAGGGAGATTACAGAT ATGAAAGCTTACCTGTTTATAGTTGCTTCACTTCTCATACTTTTTGTCAAGTGTTGTTCT GGGTACGGTGAACTTGATGTTCTCTTGAAGCTCAAGTCCTCAATGATTGGTCCAAAAGGG TCGGGACTCAAAGACTGGGTGCCTTCCTCTTCTCCAACAGCTCATTGCTCCTTCTCTGGT GTACGTTGCGACCGGAACTCGCGTGTGGTGGCTCTGAACGTGTCGTTTGAGCTTCTGTTT GGGACTCTTCCGCCGGAGATTGGGCTGTTGAACAAGCTTGTGAACTTGACAATCTCCACT GTCAGCCTCACTGGGAAGCTGCCTTCGGAGATGGCGAATCTCACGTCCATTCGAGTCCTC AACATCTCCAACAACGTCTTCGTAGGCAACTTCCCTGGAGAAATCGTTCTCGGGATGACA GAGCTCGAGACTCTCGACTGTTACAACAACAACTTCACCGGTCCCCTCCCGCTCGAGATT GTGAGTCTAAAGAACCTGAAACACCTCTCTTTCGGCGGTAACTACTTCACCGGAGAGATA CCGGAGAGTTACGCGGAGATTCAGAGCCTGGAGTTTCTGGGTTTGAATGGTAACCAACTT CAAGACAAAGTCCCAGCATTTTTGTCCAAGTTGAAAAACCTGAGAGAAATGTATATTGGC TACTACAACACCTATCATGGACAAATCCCACCTGAGTTTGGTACGTTGAGTCGACTCGAG GTTCTCGATATGGCGAATTGTAGCATCTCAGGTGAGATTCCTACGAGTTTGAGCCAGTTA AAGCACTTGCACTCTTTGTTTCTCCAAGTAAACCATCTCACAGGTCACATACCCCCGGAA TTGTCCGGATTGATTAGCTTGAAATCGCTTGATCTCTCTAACAACGTTCTAACCGGAGAG ATACCTGAGAGTTTCTCTGCATTGACCAACTTCACGCTCATCCAGCTCTTCAACAACGAC CTCTACGGTCAAATTCCTGCCTTCATCGGAGATTTGCCAAACCTTGAAGTACTCAAGTTG TTTGGAAACAACTTCACTTTCGAACTGCCACGTAATCTCGGTCGAAACGGGAAGCTAAAG ATTCTCGACGTCGCGACCAACCACCTCACCGGACCCATCCCTCGTGACTTGTGCAAAGGC GGGACGTTGCAGTCGCTGATTTTGATGGAGAATGCGTTCCTTGGTTCAATTCCTGAAGAG CTTGGAGAGTGTCAGTCGCTGCTCAAAATTCGTGCCATGAAAAACGAACTCACTGGAAAT ATTCCTGCAGGTATCTTTAAGTTGCCTTCGTTGTCCATGATTGAGTTGAATGATAATTTC TTGTCTGGGGAGCTTCCAGAGACCATGTCAAGTGCTTCACTCAGTCAGCTGAAACTCGCG AACAATAACATCACCGGTAAGATCCCTCCAGCGATTGCAAACTTGCCTAATTTAACCGTC TTGTCTCTTCAAAACAACAGACTCAACGGTGAGATACCGATGGAAATTTTCAATCTCAAA CAGATTTCGACTATCAACATCAGTGGCAACAACATTAACGGTCAAATTCCATCGTCCATT TCTCGTTGCCATTCTCTGATTTCCATCGATTTTAGTAGAAACAGTTTCAGTGGAGAGATT CCAAAAGGAATTTCGGAACTTTCAGTTTTGAGCATACTGAATATCTCTAGAAACCAATTC ACAGGTCCAATTCCAGACGAAATTGGACTCATGACCAGTCTCACAACTCTTGATCTCTCT TACAACGATTTCATTGGTAAAATTCCAAGTGGAGGTCAGATTTTGGCATTCAACGATTCC TCTTTCGCTGGAAACCCCAGCCTCTGCTTCCCACGCTACGTGTCATGTCCATCGCTCGCT AGTTCGATGAAACACTCTGGTCACAACCATACGACGTCGTTTGGTTGTTCCAAGGTTGTA ATCACAGTCATTGCACTGGTCACGGCCCTTTTGTTGGTCATTGTCACGCTTAATAGACTA CAGAAGAAGAGGTCGCAGAAATCAGGGGCCTGGAAGCTGACTGCGTTTCAACGGTTGGAC TTCAAAGCAGAGGACGTGGTCGAGAGCTTGAAAGATGAGAACATCATAGGCAAAGGCGGT GCCGGGATCGTCTACCTCGGGTCCATGCGTGACAACGTCGACGTGGCAATTAAACGCTTG GTGGGTCGGGGGACGGGCCGGTCCGACAACGGGTTCTCGGCTGAGATTCGGACTCTGGGT CGGATCAGGCACAGGAACATCGTGAGGCTTCTGGGTTACGTTTCGAATAAGGATACCAAC TTGTTGTTGTACGAGTACATGCCGAATGGGAGCTTGGGGGAGCTGTTGCATGGAGCCAAG GGAGGACACTTACAGTGGGAGACAAGGTACACAATCGCTTTGGAGGCTGCCAAGGGGTTG TGTTATCTCCACCATGACTGCTCCCCGTTGATCATTCACAGAGATGTCAAGTCTAATAAC ATATTACTTGATTCGGATTTTGAAGCTCATGTTGCTGATTTTGGACTCGCCAAGATCCTG CAGGACCCTGGCTCCTCTGAGTGCATGTCCGCTGTCGCTGGCTCTTATGGCTACATCGCA CCAGGTAATTTAACAGTTTTTTTTTCAGGTCATGCTACTATACAGAATCAGAAATAATTC AATTCTATTAGATTAAATTTTACATGATCTGTTGTGCATGAATGATTTTGTATCATTAAG AGTTTCACTAGAATAGAACTGAACTGTTTAATAATACATCCTGGGGTCCTGAGTTTATTT TCATATGGAACGTTAGTACAACAGGATTATTAATTGTGTTTGTTGCAAAATTTTGCATGA TAATTAATTATAATGGGAAAATGGAGTAACTGACTAAAGCAATAATGGGCTTGTCTGGGT AATTAGTGGGCCAAATGGGAGCCCAATTTTGTCTTACTTGATTTGATTAATCAAAGTGCG GCCATGGTCTAGAGATTCAGGAAGATGATCGGTCACCAGGCTTCGAAAGATCACGTGGTT TCGAGTTTTGACCAGGCTTCGAAAGATCACGTGGTTTCGAGTTTTGACCATGACAGGAGC CTTGAATAGTCTTATTGATTTTTCTGTCTGTTTGTTTTGATGTACAACAGAGTATGCCTA CACATTGAAGGTGGATGAGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGTGTGGTGCTGTTGGAACT AATAGCAGGGAAGAAGCCAGTTGGGGAGTTCGGAGATGGGGTGGACATAGTTAGGTGGGT AAGGAAAACCACATCAGAAGTCTTTCAGCCGTCTGATGCAGCTTCTGTGATGGCAGTTGT GGATCCCAGGCTTAGTGGGTACCCACTGACAAGTGTCATTCATTTGTTCAAGATAGCTAT GATGTGTGTTGAAGATGAGAGGTCCGTTAGGCCCACCATGAGAGAAGTTGTCCACATGCT TGCCAGTCCTCCACAGTCCGCCCCAAGCCTACTCAGTCTTTAGTTTCATGTTTTGGTGTG ACACTCTAAGCTAATCCTTTGCAGTAAATAAAAACCAAAACAAAAGCAAATTGTAATAAT TCTGTGACTATAGCCTGTGTTTTGGGTGTTTAAAAAAGGAAGCCACGCTAACTTTCATAG CGGGAGAACACCTGTGTTATATTATTGGTGAAGGGTTTTTTAAGTCATTGTAAAATGTTG ATTTCTGTAACATTGTTGTGATGTTTTTGTTAAGCTTCTCTCTGCAATAACTTGAGAAGT AGTGTTGTATTTCAAATGGTTGCTTGTTCTCTATATTTTTCTTTGATTTTTGTAAATAAA TGTGTTTACCATTTTGTGGGGTGAAGTCTAATATTGTTCTGCTTCTACTCGTTGATTTTT GTGTGGAATGATTGTCTCCTGAAATGCTATTATATGATTCAACAATTCCATCATTTAAAA TCATTGGTTGAGTGATCGAGTCAGTTCGATGAATTATCATTGGTGC