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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI010040Chr817004821705548+High mobility group B protein 9

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI010040.m143124PF01388.24ARIDDomain64.41.30E-17
LITCHI010040.m1254321PF00505.22HMG_boxDomain43.14.50E-11
LITCHI010040.m1254320PF09011.13HMG_box_2Domain35.61.20E-08
LITCHI010040.m2155222PF00505.22HMG_boxDomain442.40E-11
LITCHI010040.m2155221PF09011.13HMG_box_2Domain36.46.30E-09
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>LITCHI010040.m1
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GTGGAAAACAAGCAATATCCTGCCCCACTAGCCTCCCATGAAATGGTTGTCAAGGATCCT
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GTTTACCAGAACATTGGGTTAAAGGACAAGGAAAGATACAAAAGAGAATTGAAAGAGTAC
AAGGAGAAACTGAAGCTCAGGCAGAATATGGAAGTTGATAAAGCTGCTTATTAG
>LITCHI010040.m2
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>LITCHI010040.m1
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>LITCHI010040.m2
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TCTGTGCTCCCTCAGCTGCATTCTCTGCTAACAGCCCTTCAGGTTCAGGTAGGCCTGACT
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CTTCTTGCTTTACTGCTATGGGGACAATTGAAGGAAAATTCGATTGTGGTTATTTGGTGT
CTGTGAAGTTGGGTTCAGAGACTCTTAGTGGGGTACTTTATCATCCAGACCAACCTGGGC
CCTCTACCTCAATTTCCCAAACTAATGGCGGCGCCATTGTACCATATAACTGCAGTCACA
AACCTCACCGTTCTGGCCGGAGAAGGAGAAACAGAAGAAGGGGAGACCCCAGCTACCCGA
AGCCCAACAGAAGTGGTTACAACTTCTTTTTTGCTGAAAAGCATTACAAGCTCAAATCGC
TCTTCCCAAATAGAGAGCGGGAGTTCACAAAAATGATCGGTCAGTCTTGGAATAGTCTCG
GTGCGGAAGAGAGGAAGGTTTACCAGAACATTGGGTTAAAGGACAAGGAAAGATACAAAA
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CTGCTTATTAGAGCTTTGATTAATATGAGGAACAACATCTATAGCCTGAAAATATGGTTC
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TTGATGATCCAGTGTCTGAAACTCGTCACGCGTGCTGGTTAAGACCATGAACGAAACTGC
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TCTATTTGTCTTGAGACAGTCCCTCCTGGGTGACTAAAAGACAATGGTATTTTATTTATT
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>LITCHI010040.m1
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AACATAGCCTGTGCAAAAATAAATTATAGCTTCAACTAGCTTATATTTTGCATTACTTGC
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AAATAAATGCCCAGAAAAAGCCAATTTTGCGTAACCGTTACATCCCCCACGCGTCCATCT
CTTAGCTTTAATTCACTTGCTTTGTTTCTGACTTACTTCTTAATTACAATCTTATCTTTA
AATCACGTCTTCTTTTCTTTTCCCTTTTGTCACTAATATTTACCTCGCTGTCTCTCTCTA
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TGGGACACCCTCAGGCGCTTCCATTTCGTAATGGGCACCAAGTTCATGATTCCTGTGATT
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GAGAAGGTTGTTGCAGAGAAGAAATGGAGGGAAGTGGGTGGTGTTTTTATGTTCTCTCCA
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GAACAGGTTCACTTCTTTAATATGCAGGGCCCTCTCTGTGCTCCCTCAGCTGCATTCTCT
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GGCGGCGCCATTGTACCATATAACTGCAGTCACAAACCTCACCGTTCTGGCCGGAGAAGG
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>LITCHI010040.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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AGATAGGTCTGCAAATGTGTCAGGTTTCGAATGACACCAGAGAGAGAAACAGAGAGGGTG
ATGGGATTAGGGAGTTGTGTGTAATAATGAACATAGCCTGTGCAAAAATAAATTATAGCT
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GCTTTGTTTTGGGTGGCTATTCAAAAAATAAATAAATGCCCAGAAAAAGCCAATTTTGCG
TAACCGTTACATCCCCCACGCGTCCATCTCTTAGCTTTAATTCACTTGCTTTGTTTCTGA
CTTACTTCTTAATTACAATCTTATCTTTAAATCACGTCTTCTTTTCTTTTCCCTTTTGTC
ACTAATATTTACCTCGCTGTCTCTCTCTATATCTATCTCCATCTATCTTTCATTTTCTTG
ATATTCCGGCGACTGACTTT
>LITCHI010040.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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TGTCCGGGCTTCATAAAAATAACATCGATCTGCTATATCCACGCCCTGAAGACTATATGG
GCTTTGTGCAGCCGGCCCATTAACCCTATACACTTCACCTTCGCTTAAAAATTGAAATTG
AATTGCTTCTCTGTTCAAAGTTGCATGTACATATATTTTTTTTCAGAGAAAGTTCCATGT
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TCTCCTTTACAGTATCTTCCACATTGTCCCAATATTCCTGAACAGTAGATTAAGCAACTT
TATCATTTGTTACTTATTCCAAAAAAAAAAAAACTTTAACATTTATTACATGCCCTTTAC
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CATGCGTTGCATTCACTCTCGTATAAATCTTTCTTTTACTTTTATACGGATAAATGTTTT
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TTTCGATCCGTCCTAATCCTAAAAAAAATCATAAAAATAAAGTTTCTCTGATAACTTTTC
AACCAAACCCAGTTTTACTTGAGTACACCGAAGACCAATCCCCTGAAAAGTCACAGCAGA
TATCTTCTAACAGGTGTACGCTAAGATTTTGTTTCAGACCGAAAAATCAGAAACCAAGTA
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CCAGTCCAGTGTTTGCTTTGTTTTGGGTGGCTATTCAAAAAATAAATAAATGCCCAGAAA
AAGCCAATTTTGCGTAACCGTTACATCCCCCACGCGTCCATCTCTTAGCTTTAATTCACT
TGCTTTGTTTCTGACTTACTTCTTAATTACAATCTTATCTTTAAATCACGTCTTCTTTTC
TTTTCCCTTTTGTCACTAATATTTACCTCGCTGTCTCTCTCTATATCTATCTCCATCTAT
CTTTCATTTTCTTGATATTCCGGCGACTGACTTTATGGAAGTCGCCGGCAACCCAATGTC
GTCTTCGTCGTCGTCTAAAAAGGCCAGGGGTGTGGTGGAAAACAAGCAATATCCTGCCCC
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ATTTGTGAGTAAAAAAAAATGATGTATAGTATGTGTAGGTTGTTGCAGAGAAGAAATGGA
GGGAAGTGGGTGGTGTTTTT
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>LITCHI010040.m1 GenomeSequence + 
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TGCTCTCCCAACTTATACATGCGTTGCATTCACTCTCGTATAAATCTTTCTTTTACTTTT
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AATTTTGGTATTGGGTTTTTCGATCCGTCCTAATCCTAAAAAAAATCATAAAAATAAAGT
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TGAAAAGTCACAGCAGATATCTTCTAACAGGTGTACGCTAAGATTTTGTTTCAGACCGAA
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AATGACACCAGAGAGAGAAACAGAGAGGGTGATGGGATTAGGGAGTTGTGTGTAATAATG
AACATAGCCTGTGCAAAAATAAATTATAGCTTCAACTAGCTTATATTTTGCATTACTTGC
AACAACTTTGCTGTTGTCCAGTCCAGTGTTTGCTTTGTTTTGGGTGGCTATTCAAAAAAT
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CTTAGCTTTAATTCACTTGCTTTGTTTCTGACTTACTTCTTAATTACAATCTTATCTTTA
AATCACGTCTTCTTTTCTTTTCCCTTTTGTCACTAATATTTACCTCGCTGTCTCTCTCTA
TATCTATCTCCATCTATCTTTCATTTTCTTGATATTCCGGCGACTGACTTTATGGAAGTC
GCCGGCAACCCAATGTCGTCTTCGTCGTCGTCTAAAAAGGCCAGGGGTGTGGTGGAAAAC
AAGCAATATCCTGCCCCACTAGCCTCCCATGAAATGGTTGTCAAGGATCCTATCGTGTTT
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TTTCATTTTTTTTTTTTTAATTTTTTTGCGTTTTTTTTAAGACTTTCCCGTCATAGAAAT
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AAAACCTGTCTTCTGATCTGTCTTTTGTAGGTCATTCTTGTTCAGATCTCTGTTTCCTAT
CTACTTTTTTTTTTCTTATTTTTTAAATTTTGGTTTGTTTTGTTGGTCAAAATATTATCT
CTCTTTGCAGCTGCATTCTCTGCTAACAGCCCTTCAGGTTCAGGTAGGCCTGACTTGGCT
CTGGTGGAATATTCTCCCAAAACTATAAATGATCCAGATTCACTTAGTGAAGGTGAGTTT
TGTAAAAGCTGCTATTTTTTATCACCCCATAATATATATTATTAGCACATAATTGAAGAA
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TATATATATATGTATATATGATCTTTTATTCCCACTTCCTACAGGGTCCCACTACACATT
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GGAAATCTTTTTCTTTGTTATCCCTTTCTATAGTTTTCATTTATTGTGTGATATTAACTC
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AATTTTCCATTAATCTGTCCCGTGCTAGTATTTAAAACGTTTTTTGTAAGCTTTTTCTAG
CATTGATGTCTATGGCCACCAATTTTTGAGTCATAAAATCATGACATTTTGTTCTTTGAT
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