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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010016 | Chr8 | 1515731 | 1519286 | + | Lysine-specific histone demethylase 1 homolog 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010016.m1 | 140 | 217 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 50.3 | 2.50E-13 |
LITCHI010016.m1 | 222 | 274 | PF01946.20 | Thi4 | Family | 27.1 | 2.40E-06 |
LITCHI010016.m1 | 229 | 277 | PF01262.24 | AlaDh_PNT_C | Domain | 23.5 | 3.10E-05 |
LITCHI010016.m1 | 241 | 302 | PF13450.9 | NAD_binding_8 | Domain | 42.9 | 4.70E-11 |
LITCHI010016.m1 | 246 | 674 | PF01593.27 | Amino_oxidase | Domain | 322.3 | 7.30E-96 |
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>LITCHI010016.m1 ATGGACCCAGCAACCGAGCCACCGCTAGAACCCTCCGATAACCCCATCGACGACGCCGTT TACGACGACGACTCCTCACCGGAAACCGACGCCACTCTCTCTCCGGTCCCACCCGAACCC GAAGACCCCCAAACCTTACCGGAGACGAACCTCACTCAGTCCCCGACGCGCAACACGACA CTCGACGCCCCGGTTTCGGACTCTTTAGACGACTCGTCCGATCCAATCACCGAAGACCAG CAGCCACAAAACCCTAATCCGGCGGAACCGGGTCCCCCTCCTAGGAAACGGCGCCGTAGG AAGCGATTCTTCACCGAAATCAACGGCACCCCGTCCTTCGCCAAGAACCGCCGGCCCAGG CTGTCGTGCCTGTCGAAAGAAGTCGACACCGAGGCCCTTATCGCGATCTCGGTTGGCTTC CCGGTCGACTCGCTCACTGAAGAAGAAATCGAAGCCAATGTAGTTGCCAAAATTGGCGGC ACCGAGCAAGCCAACTACATAGTTGTGAGAAACCACATTCTGGCTCGCTGGAGGTCGAAT GTCACCGTCTGGTTGACGCGTGAGCACGCGCTGGAGTCGATCCGGTCCGAGCACAAGAAT CTGGTGGACTCTGCTTATAATTTCTTGTTGGAGCATGGTTATATTAATTTCGGGCTGGCT CCGGCTATTAAAGAAGCGAAATTGACCTCGTTGGACGGCATGGAGAGGGCCAATGTGGTG ATTGTGGGGGCTGGACTGGCAGGGTTGGTGGCGGCGAAGCAGCTGGTTTCGATGGGGTTT AAAGTTGCGGTTTTGGAAGGCAGAGCACGGCCTGGTGGGCGCGTGAAGACGCTTAAAATG AAAGGCGAAGGAGTTGTCGCTGCAGCTGATCTCGGTGGGAGTGTTCTCACCGGAATTAAT GGCAACCCACTTGGAGTTTTAGCTAGACAGTTAGGATTGCCGCTTCATAAGGTGAGAGAT ATTTGTCCTTTGTATTTACCTGACGGTAGAGCAATTGATACTGATATTGATTCTAGGATA GAAGTGCTGTTTAATAAGTTGTTGGATAGAGTTTGTAAGCTTAGACATGATATGATTGAA GAATTTAAAGCCGTAGATGTTCCACTAGGGAGTGCACTTGAAGCTTTTAGGAATGTTTAT AAGGTAGCCGAGGATCAGCAAGAGCGAATGCTCTTGGATTGGCATTTAGCAAATTTGGAG TATGCGAATGCTTCATTGATGTCTAATTTGTCAATGGCGTATTGGGATCAGGATGATCCA TATGAAATGGGTGGTGATCATTGTTTTATTCCCGGGGGCAATGAGAGGTTTGTTAGAGCA CTTGCTGAGGATCTTCCAATATTTTATCAAAGGACTGTGGAGAGCATTAGGTATGGAGTT GATGGGGTTATGGTTTATGCAGGTGGGCAGGAGTTTCGTGGGGATATGGTTCTCTGTACC GTGCCGTTAGGTGTGCTTAAAAGGGGGTATATTGAGTTTGTACCTGAACTTCCACAACGG AAGAAGGATGCCATTCAGAGACTAGGTTATGGCTTGCTTAATAAGGTTGCGATGCTGTTT CCGTATAACTTTTGGGGTGGAGAGATCGACACTTTTGGGCATTTGACAGAAGATTCAACT ACGAGAGGTGAATTCTTTTTGTTTTATAGCTATTCTTCTGTATCGGGAGGTCCTCTTCTT GTTGCTCTTGTCGCAGGGGATGCTGCTGTTAAGTTTGAGACAATGTCTCCTGTGGACTCT GTGAAAAGAGTGTTACAAATATTGAGGGGTATTTACCATCCAAAAGGAATTGTTGTTCCA GATCCAGTTCAGGCAGTCTGTACTCGCTGGGGAAAAGACCGTTTCACACATGGTTCTTAC TCTTATGTTGCAGTTGGTTCTTCAGGTGATGATTATGATATATTAGCTGAAAGTGTTGGG GACGGAAGAGTTTTCTTTGCAGGAGAAGCCACTAACAAACAATATCCGGCAACCATGCAT GGAGCCTTTTTGAGTGGGATGAGAGAGGCTGCTAACATAATGAGAGTGTCCAAAAGGAGG TCTATTGCTCTAACCAACAAAGCATATAATGACAGTGAGGAAAATTGTAATTTGGATAAA TTATTTGATACCCCTGACCTGACATTTGGGAGAATTTCAGCTTTGTTTGATCCTGGGTCT AATGATCTTGAATCTCATGCATTGTTGAGAGTCAAATTCCAAGGCAAAAAATTGGATTCT GATTGTCTCTCACTGTACGGCTTGGTGTCAAGAAAGCAAGCCATTCAGTTGAGTGAGTTA GATGGAGATGAGAACAGAATGAAAATGTTACATTACAACTTTGGGGTGAGGTTGGTTGCA AGGAGAGGCCTATGTAATGCTGGAGAGTCTCTTATCACAAGCATCAAAGCTGCGAAATTA AACCTAAATTGA
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>LITCHI010016.m1 MDPATEPPLEPSDNPIDDAVYDDDSSPETDATLSPVPPEPEDPQTLPETNLTQSPTRNTT LDAPVSDSLDDSSDPITEDQQPQNPNPAEPGPPPRKRRRRKRFFTEINGTPSFAKNRRPR LSCLSKEVDTEALIAISVGFPVDSLTEEEIEANVVAKIGGTEQANYIVVRNHILARWRSN VTVWLTREHALESIRSEHKNLVDSAYNFLLEHGYINFGLAPAIKEAKLTSLDGMERANVV IVGAGLAGLVAAKQLVSMGFKVAVLEGRARPGGRVKTLKMKGEGVVAAADLGGSVLTGIN GNPLGVLARQLGLPLHKVRDICPLYLPDGRAIDTDIDSRIEVLFNKLLDRVCKLRHDMIE EFKAVDVPLGSALEAFRNVYKVAEDQQERMLLDWHLANLEYANASLMSNLSMAYWDQDDP YEMGGDHCFIPGGNERFVRALAEDLPIFYQRTVESIRYGVDGVMVYAGGQEFRGDMVLCT VPLGVLKRGYIEFVPELPQRKKDAIQRLGYGLLNKVAMLFPYNFWGGEIDTFGHLTEDST TRGEFFLFYSYSSVSGGPLLVALVAGDAAVKFETMSPVDSVKRVLQILRGIYHPKGIVVP DPVQAVCTRWGKDRFTHGSYSYVAVGSSGDDYDILAESVGDGRVFFAGEATNKQYPATMH GAFLSGMREAANIMRVSKRRSIALTNKAYNDSEENCNLDKLFDTPDLTFGRISALFDPGS NDLESHALLRVKFQGKKLDSDCLSLYGLVSRKQAIQLSELDGDENRMKMLHYNFGVRLVA RRGLCNAGESLITSIKAAKLNLN.
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>LITCHI010016.m1 TTCACGTGTTTGATTTTATCCTAGGATACCCAAAGCCAGAAACATCTCTTTTTGGATCAT AAACCGAAACATGGACCCAGCAACCGAGCCACCGCTAGAACCCTCCGATAACCCCATCGA CGACGCCGTTTACGACGACGACTCCTCACCGGAAACCGACGCCACTCTCTCTCCGGTCCC ACCCGAACCCGAAGACCCCCAAACCTTACCGGAGACGAACCTCACTCAGTCCCCGACGCG CAACACGACACTCGACGCCCCGGTTTCGGACTCTTTAGACGACTCGTCCGATCCAATCAC CGAAGACCAGCAGCCACAAAACCCTAATCCGGCGGAACCGGGTCCCCCTCCTAGGAAACG GCGCCGTAGGAAGCGATTCTTCACCGAAATCAACGGCACCCCGTCCTTCGCCAAGAACCG CCGGCCCAGGCTGTCGTGCCTGTCGAAAGAAGTCGACACCGAGGCCCTTATCGCGATCTC GGTTGGCTTCCCGGTCGACTCGCTCACTGAAGAAGAAATCGAAGCCAATGTAGTTGCCAA AATTGGCGGCACCGAGCAAGCCAACTACATAGTTGTGAGAAACCACATTCTGGCTCGCTG GAGGTCGAATGTCACCGTCTGGTTGACGCGTGAGCACGCGCTGGAGTCGATCCGGTCCGA GCACAAGAATCTGGTGGACTCTGCTTATAATTTCTTGTTGGAGCATGGTTATATTAATTT CGGGCTGGCTCCGGCTATTAAAGAAGCGAAATTGACCTCGTTGGACGGCATGGAGAGGGC CAATGTGGTGATTGTGGGGGCTGGACTGGCAGGGTTGGTGGCGGCGAAGCAGCTGGTTTC GATGGGGTTTAAAGTTGCGGTTTTGGAAGGCAGAGCACGGCCTGGTGGGCGCGTGAAGAC GCTTAAAATGAAAGGCGAAGGAGTTGTCGCTGCAGCTGATCTCGGTGGGAGTGTTCTCAC CGGAATTAATGGCAACCCACTTGGAGTTTTAGCTAGACAGTTAGGATTGCCGCTTCATAA GGTGAGAGATATTTGTCCTTTGTATTTACCTGACGGTAGAGCAATTGATACTGATATTGA TTCTAGGATAGAAGTGCTGTTTAATAAGTTGTTGGATAGAGTTTGTAAGCTTAGACATGA TATGATTGAAGAATTTAAAGCCGTAGATGTTCCACTAGGGAGTGCACTTGAAGCTTTTAG GAATGTTTATAAGGTAGCCGAGGATCAGCAAGAGCGAATGCTCTTGGATTGGCATTTAGC AAATTTGGAGTATGCGAATGCTTCATTGATGTCTAATTTGTCAATGGCGTATTGGGATCA GGATGATCCATATGAAATGGGTGGTGATCATTGTTTTATTCCCGGGGGCAATGAGAGGTT TGTTAGAGCACTTGCTGAGGATCTTCCAATATTTTATCAAAGGACTGTGGAGAGCATTAG GTATGGAGTTGATGGGGTTATGGTTTATGCAGGTGGGCAGGAGTTTCGTGGGGATATGGT TCTCTGTACCGTGCCGTTAGGTGTGCTTAAAAGGGGGTATATTGAGTTTGTACCTGAACT TCCACAACGGAAGAAGGATGCCATTCAGAGACTAGGTTATGGCTTGCTTAATAAGGTTGC GATGCTGTTTCCGTATAACTTTTGGGGTGGAGAGATCGACACTTTTGGGCATTTGACAGA AGATTCAACTACGAGAGGTGAATTCTTTTTGTTTTATAGCTATTCTTCTGTATCGGGAGG TCCTCTTCTTGTTGCTCTTGTCGCAGGGGATGCTGCTGTTAAGTTTGAGACAATGTCTCC TGTGGACTCTGTGAAAAGAGTGTTACAAATATTGAGGGGTATTTACCATCCAAAAGGAAT TGTTGTTCCAGATCCAGTTCAGGCAGTCTGTACTCGCTGGGGAAAAGACCGTTTCACACA TGGTTCTTACTCTTATGTTGCAGTTGGTTCTTCAGGTGATGATTATGATATATTAGCTGA AAGTGTTGGGGACGGAAGAGTTTTCTTTGCAGGAGAAGCCACTAACAAACAATATCCGGC AACCATGCATGGAGCCTTTTTGAGTGGGATGAGAGAGGCTGCTAACATAATGAGAGTGTC CAAAAGGAGGTCTATTGCTCTAACCAACAAAGCATATAATGACAGTGAGGAAAATTGTAA TTTGGATAAATTATTTGATACCCCTGACCTGACATTTGGGAGAATTTCAGCTTTGTTTGA TCCTGGGTCTAATGATCTTGAATCTCATGCATTGTTGAGAGTCAAATTCCAAGGCAAAAA ATTGGATTCTGATTGTCTCTCACTGTACGGCTTGGTGTCAAGAAAGCAAGCCATTCAGTT GAGTGAGTTAGATGGAGATGAGAACAGAATGAAAATGTTACATTACAACTTTGGGGTGAG GTTGGTTGCAAGGAGAGGCCTATGTAATGCTGGAGAGTCTCTTATCACAAGCATCAAAGC TGCGAAATTAAACCTAAATTGAGGGGTGTAACATAAGACAGCTGGCATGAGAAACATAAA TTCTTTCATTGGCTTTGAAAATTAGGTAGATTTGCAATTCATTTGCTTGTTGATTTTTTT TAACTTTATTTCCATTTAACTCTAGATTGGATGGATGGATGAGGCAGAATATAGTCGATT ATGTGGATAGTACTGCCACATCAAGTACATGCATAGTTCCAGGAGTAGTTTAGAATTTAA TTTAGGACATGATTGATTTGTCATTTGGTTACATAATGCTTACAATTATATGTCCAATTC CTTTGAGAGAATGCAACATTTCGTAATAACCTTATGTGGCTGTTTGTTCCCTCAATTTGT TGTACATTCATTGTTGGCTTAACTATTGGAAATTGAATTTTCTTCATTGTTTCCACCTTT GCAACCTGTTTTGTATTATCATGTAGGAAATTGCATGCCTGCATGATGGGTAATATCTGA CTATTGTCGTCTGCTTTTGACGGCCAAAGGATTGTTGAATAAGGGTGCATTTTTCACTTA GGGTTGTCGGAAGGAATTAAGTCTTCAGGCTGATATGTGTGGTAATAAAAATGACAGGGC AGATCATATCTTACATTGTTTAAGCGTAGAATTGAATCACAACCTTTGTATTTACTATGG ATGATTTGTGTTGGTTGCTTCAGTTATTTTCACCTGAATTGCACTTCCCCGTTTGAGCGT AGACACGGCCCTAGAGTATGAGACTTCCTGAAATATATCATCAACTTCTTGTCCACTCTT AGTTAATTTGTAGGACACCATTCATTCATGATGTTTGATTTTTTGGTTTAACATTTGAAG AAGACAAGAAAATAGAAAAATTGCTTTCAACTGTTGCATCCTATGTGCTAAAGACAAGTT CCTACCATGTATGTGTTCTATCTATCTGATTTCTAGCATTCTTGTGGTTATCAGGCATTG AGATTTTTGTCCATGGGGTAACTGTCTAGGCAAAAAATTTCTCTTAAAACGGTAGATATA TTTTGTTATTCATATGCATATATTTCCCGGAAATTGATAGATAAGTAAGGCGATTTTATT AGAAAATATAAGGATA
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>LITCHI021766.m3 + Up_Stream_Len 2000 CACGTACACATACGCACATGTATGGACACACACACGTGAGAGTTGTTCAAAAGGGTAGAA ATAAATGCGGGATACCGTCCTGCAAAATATATATATATATATATATATATATGGGGAGAG AGAGAAAAGAGAGAGAGATTCATAAATTACTTAAAATAAAATCTTTTATTTATCATGTCT GACGTTTATAAATGTTCGTCTTGTTATCTGTTTTATTATAAGGGCACTGTTCTTATTCAA ATGTTAAAATGTCATCCTTAATTATATGTATTGTGAAATTATAGAGTTTGATATGGAGCA AAAACAGACATGCAATATCAATAGACATGAGCGAGGAGCTGGTCACTTGATGTATACAGG CGTGTTTCGTCATAAGCCGTGTTGTGACTGATCTTCAATAGATTGTGGTCAGTGATTTCA AGGCAGACAAAACTATATAAAGGGGATTATGCTACTATACTGAATCAATATAGATACAGG GTTATAGATAAAAAAATCTCTCATAATTTCTTAGTAATTATACGTGCTCTTCGTATGGCT AAATCCTATAAAGACAAAGTTTGTCTAGTATGCATGGGCATAATAAATTCAGAAGGCATC AATTGGGTTCCTGAATCCTGCTCTATGTGGCTCTTCCCGTTGAGGGATGTCATTTGGCTC TCACAGACTACTACTCAGTCTCAGCATACTTTTCATGTACAGGCATGTGGCTGTATAACA GTTCATATACATAATAACTATGCAACTTTAAAGACCCTACTATATACATTACACTCCCTT TTCATTCACATTGAGCCGTCTAAAACACTTTGGATCCTTGAAATTCGTACAACATGTAAA GGTTTTCAAATGAATTATCACCACTTGTTATTCCTTGTATGCACCGTCGTCGTCGGTGCT 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>LITCHI021766.m3 GenomeSequence + TTTTTAAAGTTTGACACATGTTTTTTTTCAAAAGAAAAATAATTTAATGTGTCTCATCCT TATTTTGAATTGGTGAATAAATAAGCAAAAATTTAGGAAAAGAAAGAAAATAAAATGAAA TTCATAAAAATGTTGTCGGCTGAGAAAAGAGTGGGCTTTATTGAACAAGTAAAAAAGTGA AAGGTGATAGCACGAGAGTCCATTAAAAAAACCCCAAAAGACAATCCCAACAAATCTTGC AGCCTAAGCAAACCAAATTCCGTTGTAGTACCATTATACTCTAAAAAACCACTACGCGGT ATGTATGTACAAAATCCAATCATACGTGTCATAACCCCATTGGAGAACACGACATGACAC GTACGCAATGGCTTCGCGAAGAAAGCGAGTCACACGTGTTCACCAAGACTCTTCACTTAC AAAGATTTGGTAAAGCCAACAGCAAAAACAACACACAACAGAGAGACCAAGAGAAGTGGA AAAACAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATGAGGTTTGTGCCGATGGAATCACTCCCTTTA GGTTTCAGATTCAGACCCACTGATGAAGAATTGATCAATCACTACCTCAGATTGAAGATC AACGGCCGTGATTCCGAGGTCCAAGTCATTCCTGAAGTCGACGTCTGCAAATGGGAGCCC TGGGATCTTCCTGGTACTTCAAACCTATCTTTATTTATAATAATAAAAATGATTTCTTTT TTGTTAATTGTGGTCCGTTCTGGTAAAAAATTCTTTGATTCTGTGAAATATTTGAATAGT TGAATGATTCGTGATTCGTTTTTTGGTGTTTCAATTAGGATTATCGGTGATAAAGACTGA TGATGCAGAGTGGTTCTTTTTCTGTCCTCGTGATAGAAAATACCCGAATGGGGTTCGATC 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