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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009950 | Chr8 | 1067044 | 1071877 | + | High mobility group B protein 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009950.m1 | 36 | 108 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 60.2 | 2.40E-16 |
LITCHI009950.m1 | 39 | 108 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82 | 3.30E-23 |
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>LITCHI009950.m1 ATGAAAGGAGGTAAATCTAAGTCGGAATCAAAAAGCACTAAGCTTTCTGTGAACAAAAAG CCGCAAAAAGCTGGTGGTAGGAAATCAGGCAAGGCAGCCAAGGACCCTAACAAACCTAAG AGGCCTGCTAGTGCTTTCTTCGTCTTCATGGAGGAGTTCCGTGAGCAGTATAAGAAGGAC CACCCCAAGAACAAATCGGTTGCCGCTGTTGGCAAAGCTGGTGGGGAGAGATGGAAGTCG ATGTCTGAGGCTGACAAGGCGCCGTATGTTGCTAAAGCTGAGAAACGTAAGGTTGAATAT GAGAAGGACATGAAAAACTATAACAAGAGACAGGCTGAGGGTCCTAAGGCCGATGAAGAA GATGAGTCTGAGAAGTCAATGTCTGAGGTGAATGATGAGGAGGATGATGATGAGGGCAGT GGCGAGGAGGATGATGACGAGTAG
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>LITCHI009950.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATATATAAATATATAAGGACAGGATCGGGGAACACAAATTTTTACATAAGTTTTGATACA AAATTTCGACCATTAGATTGAAAACCAATGAATGATGTATATATATATTTTTAGAATAAT AAAGTTGTTGGAGAGTTGTGTTATACTAGATTATTGTATGTGGACCAATTTCTCTATCTT CATTTATATTCTTTTCTATTCTCTATTTACTTTATTTATCTAGTTTTTAATTGATTTTTT TTTTTAATTTGGACGATTCTGATTTATATGTTTATTTAAACTTATTTGAAAGTTGATGTT AAGAGCTTTAAATCTATATATTATTTACATAATTTGGTTAACTGAATGAAGAGAAAAAAT TAAATGAAAATTAAATTGACAATTTTTTTTTTTATTTGAATAAAGGTAGATATAAAATAG GATGAAATGCATAAATTCAAATTTAACAACTAATCTATGCTATTCATTGCTTTTCAATCC AATAGTTGAAAAATCGTGTCAAAAGTTGTGTCAAAATTTGTACCCTCGATCTTGACCCAT ATATATATATACATATATGTTTAATAAGTTGTGATTAAAATAGCCATCACTTTGTCTTTT GTGCTTCTCTTTAAAGTAAACTTTAAAAGCACATGCTTCCATGAACAAAGTTCCTTGAGA AATTGATTGATTAATATGTTAGGATCATAATTTTTTTTTTTAATTTCCACTTTTTTTTAA AAAAAAAAAACTCAAAACATTTTAATGGTTAAAATTATATCTAATACAAGTTTTTTTTAA TATGTGTTAATTACCGCTACATGTAATTTGACGCATGTGTTGTGCCTTAAAACCCTAAAA ATGGTATATTTGATTAAAAAAATAAATTACTGTCTAATATACATCATCATCAAATTTTTT CACTGTCAAAATTGAATTTTCATATTTCTTAATTTCTAAAATGGGTAGTATTGAATTTCC TTATTTTGGATCCATATCTTAATACATTAATTTATTTGATTTTAGAAATTAGATGCATTG AATTCTTCGATTTTAGAAACTAGTACTTTTTAGGAATCTAATAGTAACGTTAAAATACCT CAAATTTATTAAAAAGTTTCGTGTAGATAAATTATCAATTTCAAACTTTCTCCAGAATTT TGTTTTAAAAAAAAATCCTAATTTCCCATTAAGAAATTGAAAAAATCACTAATAAACTTT CCACTGAATTTATTAAAGAAACATTATCTTATAAAGAAAGATTTTTGTTTACTTTTCCAA ACCAATCAAAACACAGTTTACTTTTCCCAATTCAACCCCCCAAAAAAAAGCACAATTTCC ACTTTATAAAACAAAGATGGATCCCACGTATCCCTATAAAAATAAATCGATAAAATAATT CTAGAAGACACAATTTTGTTCCTTGCAAGAAATAACGAAACCTAACTTTGTCATCATCAC CCACCATCAATCAGGCCCAAATAAATCGAGCCCAATGGGCCAGAGTTGACCAGATCCGAA CCCGACCAACCCAACCCGCAAGTCGCGGCAATGCAAAAATCGCACAAGAAGAGCAGTCTC GCTGAGACAGAAGAAGCACAAAGAAAACACAAAAGGCAAATCAACGCTCAAGCTCGGCAG CGAGACACCCCCAATCACAACAAACCACACGGATCGCTGACGTGGCAACCAAAATATTAT TTTCGAAATCCCGCCTAAACCCCTGGACACCAAAATTTTCATTTCGTGCGCAATTGAATT TCAATTTGCCCCACACACATACACACACACACACACACTCGGCCACTTAATAATATCCCC CTCTACTCGCTCTTTCTCTCTACGCTTTGTGTTGTTGTTGTTGTGGTTTTTTCTTCCTTT GTTTTTTTTCTCTCTCTCTATCTCCAAACCCTAACCCTAACCGGTGGTAAATTCTGCCTC AATCTTCCTTTTTTTCGTGGTTTGTGATCGATTCGTATTGTTTTCTTCACTGATCTGTTG TTTTTTACGCAGGATTCGTC
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>LITCHI031869.m1 GenomeSequence + ATGCAGTCGAGGTTGGAGGAGGAGGAAGAAGTTAAAGCTGCTCTTAGGAGCAGAATCCGG AGACTCACCAAGCTCATACTTGAATCTACAAAAAATAAACTTCCTAGTTTGAGTGATGTG TTTGGCCATCAGCATAGTAATTTTGTTGGTAAGGATGCTGTAAGTTCTTATTCTCATTTT TATCATGTTAATTTCATTATGGTTACTGGTTTGTGTATTTTGGATGCTATTTTGCTTTCA AATTGAAAAGAATTTGGGGCACTTGTCTTGAATAATGTTCCAAATGCGTGATACAAAAAG ATCAAATATGCAACAGAATTTATTAAACTGAAAATTGGATCTCACCTTCGCTTTCTGAAT TTATGGCAATTGTTATTTTTTTATTTTTGAGACATCATCCTCACTTACACAACTGTTGGA CTTGTAAGGCTGAATCAAATTTGGTTATCTTGGTGCCAGATCAATTAGTTGTCATCATTT TTTCGTAACATGTTCTCAGTGTTCCTTTATTCATACCAGGCAATCGAACAATAACCAATT GAGTGGAGGAATATCTGATGCCTTTCAAAAGCTGACAGGATTGACTGATTTGTAGGCATT TTTCTGATGAATTACATACATTTCGATTGTATTCATATCTAAGTTTGAGTTGTGATCATA TATATTGTGGTGCAGGGATATATCAGCTGACAAACTGCCTCCCTTAATGGCAAATTTGGC AGCTCTCAAAACATTGTGAGTAATAACCTTGTGATAAAAGAATACATTGCCATTTTGTCC ATGACCTATGTTTACTTTCTGGACTGCAAGCACCTGCAGAACAATAAACTGTCTGGATTT CTCAATGTTTTACGGATTATTCAACTAAATGATTTGTATGCACCTCAGCTCCTTTGCTGC TTTATTTCTGTTTAACAATATCAGTATTGCAAGGTTCTGTTTTAGTTGCATAATAGTAGT AGCAAAGAGCCTTCACCAATTAACAAGTCTCCTCATTTTTACGTAGAAACATATAGAACA ATTTATTCTCCGGGCCTATACCTGACAAGCCATTCTCGAAAAGTACAAGAATCAGCAGAT ACAGCAGCAAAGTGAGTCTCAATCTGATGATCTGAAAAAATATATATATAAAAAGCCTGA AGGAGAATCATGATCAGTCATTGGATGCTGACAATAATCTTAATAATAAATCTACTAGTA GAAGTGATGATGTGGATAATTTTGCTACTAACCAATTATTTTCAATGAAGATGTCGCCTC CGCAAAATGGAGTTGCTGCTTCTGACTAGACTTCTGCACCTGGTGGGCTTGGGGATGGTA ATCCAAATTGTAAGCAAGTCAGTTTTCTGTTTCACATGCTATAAATTCCTCGCACTGGAT CACATATGTTGTTACTAATGTTATATTTCATGATCAATTATTGCAGAGTGAAACATCTAA ACACATGTTCTATGATGATATTTTTGGAGAGACACCTAGTGGAGTTTGCAAGATGGTGAG TTCGATGGTTATATATGTCTTACCAACTACTTTTTCTCGTTCCTGATCTGTGATTGATAA TTTTGCAGTTGCAACATCTTATATTATTGTATAAATTGGTGGTCCTCTCTCTCTTGCGCA CGCGCATTAATTTTTGATTATTCTGAGTCATTTTGATACTTTGGTATATGTGTGATTTTA TGATTAAAGCTTTTGTTCTCTTTTCTTAGTTCTGTCTTATATGATTGAAATAAATTTACT GGTAATCTAGAAAAAAAAATAAAAAAGAAAGAATTCAACTGGTACTTGGAAGGTGCTGGG AATGGTATATATATAGTTTGAAGAATGAAATGAATTCACCTTCTGAACTACAGTTGGTAG ACTTGAAAGTTGTTTTCATCCTCCTATTTAGTACTTTGTGACATTATGCTTATAAAATGT GTCCTGTATAATTAGTCCGTATGTATATTTTTAATATTTCAAAACATACCCTACATGTGT TTATTTTCATATATCTATTTTCGTGTTCTTGCACGTACACAAATAAAGCAAATGCTTCTG TTAATTTCTTCTGTCATGTAAAGTATTTCAGTTTTTTGTTACTTCATTGATGTGTTCTAG TACTTCATTCTGTGACTTTTGCTTACTGAATTCATCTACTGGGAAGAACTAAAGTGATAT AGTCAATTTTAATCCTTTACATTTAGGCAACTTTGATTAAATATTTTGATTATTCTTTGC AGGGTAAAACAAGTCTAAAATTTGTTAGGAGTGGTCTTTATGACGACTGGGATGATGCAG AAGGATATTATAGTAAGTTGTCACCTCTTCCTTTTGCTTACATGATTATTGCCACGAGAG TTGAGATCGATTTAGGTTTGCATGTTAGGGCCTACTTAACAACTCATGTCCTGTGTTAAT GTAGATATTAGATTGGAAGTGATTATGAGCAGTTTTTGCTTTTTTTCATCCTTTAGTTCT TTCGTTTTTGTTTTCACTTGTGATAACATGTTTCCTGTTAAGGCTATCGAGTTCATGGAC AATACAAAGTCACTGCTGCTCATGGGAAACGTGTTTTCTTAACAGTGGTCAGTGCAAAGG ATCTTAAGGCTGGTAATGGTGAATCAGAAGAAGTGGCTATAAAAATAATACATAACAATG AAACAATGTGAGTTATCATAGGCCTACATGGTATGTGGTTCACCGTTTCCTTTTTTTTTT TTTTTTCCTTTCTTTTGTTTGGGTTGTCAAGCTTTGGTTTTAATGCATAATTACTTGAAT TATTATATGTGATGAGAACAAAGCTGGTCAAACAGAGATTCAAATATTAGAGAAACTGGC CGGTGCGGATCCAGAGAATAAACGCCGTTGCGTCCTCTTTATTTTGAGTTTTAAATATAG GAATATCTTTGTCTAGTTTTTGAATCTCTTCATATGAATCTGTGCAACTTTATGCTGTGA GAGCATATGCAAAACAGCTTTTTATTGCCTCGAAGCATCTCAAGAACTGTGGTGTTCTTC ATTGTGATATAAAGCCAGATAACATACTGGTATGATTTAGTGTTCCTTTTGTGGTTGGGT TGCTTTTTCAATAAGTATGCATGATCATCTTAACATGTTATTTTTCGCTTATCATTTTAG GTAAATGAGGCAAAGAATGTGCTGAAGCTTTGTGATTTTGGTAATTCCGATTTACCTTGT GAGCTACTTTAATTGTGCCATTGAGATAAGCAAGTCCTAGTCATCACCTATTGGCTATTA GAAAACGATGAAACTTTTGTTTTTCCTTCTGTTGGATATGTTATATTTAGTGTTTCAAAA CCGATTCGAGGTGGTGTCTTGAGGCCTGCCTCGGCCACCTCATGGACTTAGGTGCCTCAA GGCGGCTCACTCACCTGAGGTGGTCCAATTACAACATATATATATATATATATATATATA TATGTATTGCTTCTATAAGTATTTTTATCATAGTCAATTTCTTTTTCTAATTTCCACACA TTAGTGGCTGAGATCAATCTAGATCAAAAAGTAAAGTAACAAAAGACAGAATAAATCATC TAAAGCAAAGAAACAACAACTCAGCAGTGTGTAAGTGATTCAACGGAATGTTGTCTACAT TGTTGGGTTGCCTCTTATCTTGGGAGATGAAGATGTAATCTCTTTTCCTCCCTCCCTCTA TCTGCGTGTGTGGGTATAGGCCTGGGTGCACATGCACAGGTGTTGTGCATATGGGTGTTT GTCTGCTCTTGTTCAATGTGTTCTGAACATTTTATGACATTATTATGCAGATTCTTCAAT GCAAAGAATATTTTGGCCAGTATAGGAAGGTTCTAAAAGTATCCATGTCTTGTACTGCTA CTGGTGTCATTTAGCAATTTTCAATCAGTATTTGTAGTGTGTAAGTTTAAATGTTATCAC TATGTCTGGCCCTTATTTGCTTTGAAATAGTAAAAGTCTTCATGTAGTTGGATTTGTTGA CATCAATTAGAGTGCTCTTGATATTTTGGGACAACAGAAGTAGGCTATAAATTTTCTTTT TTATAACTTGGACATTATTTGCCTGCTTATTTTGTAACATTATTTTATAGCTTGATGGCT TATATTGGATTGAATCTCTACCACCTATGTAGGTAGAATTCATAAAAGTGTTAGTGTCAT ATCAAAATGCTATTTAATTAATTCTATATGCTGGTTACAAGATTTGGTTATATTTTCTTC CAAATTAGACTAACATGGGAGCAGCACATGCAGCAGGGAGCACTGTTCCATATCCAACAG CCAGGTACACTTTGTATGGCTCTTAAGGTTTAAGAATGACTTTGCTAAACATATTCAAAG ATTGGCTTGGGTGAAAATAAAAACTACTGCTCCTACGGCAATTGAAACTAATTTGTTAAA CTGTTACGGAAAATTTCTTGTCTCCGTGCTTGCATGTTGATTGAATTAGCTTATTTGAAT GTTATATTAACTTACACCTATGAAAATATGTAGAAGTTTCTATGCATGAAATCTAATAAA TTGCAAGATAATTTTAATCTGTTAAGCAACCGAAGTCGCACCATATTTACATTAGTAGTC ATTTTTCACATTGATGAACATTACTTAACT