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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009842 | Chr8 | 337023 | 343987 | + | Protein LYK5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009842.m1 | 140 | 271 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 41.5 | 1.00E-10 |
LITCHI009842.m1 | 171 | 269 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 51.1 | 1.20E-13 |
LITCHI009842.m1 | 499 | 540 | PF01476.23 | LysM | Domain | 20.4 | 0.00042 |
LITCHI009842.m1 | 694 | 936 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 133.3 | 1.10E-38 |
LITCHI009842.m1 | 696 | 937 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 128.1 | 3.90E-37 |
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>LITCHI009842.m1 ATGCATGCCATGAAAATACTGAATGCATCGACTATGCACATGGCAATGGATATCATTGTG GGTGCAGTCCAGGTTACCGAGGCAATCCTTATCTTCTCAATGGCTGTAAAGCTAATATCG GTAAGTGCAAAATTGGAACAGCAAAATGTGCACAGCAAGCAAAAAGCAAGAACACTGAAG CAGCATATCATTGCAGTTGCCCTAAAGGCTACCACGGCGATGGCTCGGGAGGCAATGACA ATTGAAAGTTTGAAACAGAGGCAAATGTTCTTTAGACGAAATGGTGGCTTGTTATTGCAA CAACAGATTGCTTCACGGAAAGGAGCAGTTGGGACAGCCAAAATATTTGGTATTGAAGAG TTAGAAAGAGCAACAGACAACCTCAATGCAAGTCGAATTTGTGGAACTAGGGACTACAGT TCACTTTACAAAGGCATGCTATCTGATGGCAAGATAGTAGCCCTCAAGGAGGCTCGAATT ACGGATGAAAGTCAAGTTGATCAGTTTATCAATGAAGTAAATAAGTTGCTGGGTTGTTGT CTTGAGACAGAAGTCCCTTTACTAGTTTTTGAATTTGTTCGCAATGGAACACTCTCCGAC CACCTTCACGACCAGGATCATGTTTCGTCTCTTTCTTGGGAATGTCACTTCAGGATTGAC TTGGACATTGCTGGTGCTCATGCTTATTTGCATTCTGCAGCCTCTACATCCATCTTTCAT CAAGATGTACAGTCGACCAACATTCTCTTGGACGAAGACGAAAACTATAATGCTATAGTT GCCGATTTTGGTCTCTCAAGTAAAAGAGAAGCGTCTATTACAATCTTAGAGGCTCGTGCT TTTAATGAAGCAAAAGAAGAAGAGTTGAAACTTGAAGGCAGTTCAATCTGTTTATCTGGA GTTGTTCTTGGAGATATTTTGGCCGATGCGATGATGTTCATGTCTAAATTGTGTGCGTGT GTGTTGTTGCTTCTGCTGGTTTTGCAATCCGAAGCACAACAACCGTATATAAACAATCGT CAGCTAGCCTGCGAAAACCATGCCTACGATAATCTAACAAAAGGATTCCAATGCAACGGA GCCCAATCAACATGTCCATCCTACGTCACCTTCAGATCCAACACACTCTACAACTCAGCC GCGGAGATCGCCTATCTGTTGGGAGCCACACCCGCCGACGTTGCCTCCATCAACAACATC ACCTCAGACGTGGCCACCCTACCCATAGACACCCAGCTGGTCGTCCCTGTCAACTGCTCT TGTTCCGGTGACTACTACCAGCACAATGTCACCTACGAGCTGAGAGACGATTCCGAGACC TACTTCACAGTTTCCAACAACACCTTCCAGGGACTCACCAGTTGCCAGGCTATGGTGGCT CAAAACGAGTATGGAATCAGGAACCTGTATCCGGGTTTGAATTTGTTGGTTCCACTTAGA TGTGCTTGTCCAACTAGAAACCAGACAACTTCGGGTGTCAAATACTTGTTGAGTTACTTG GTCACCTGGGGTGATTCCATTTCTTACATAGCAGACCTTTTCGGTGTCGACCAACAAGCC GTTTTGGATGCAAATAAACTCACTGAGGACCAAAACATATATCCATTTACGCCCATTTTG GTATCACTTAAGACTAAACCCACCAAGATTGAGCCTTCACGGACGTCTTCACCGCCAGCA CCTGCCCCCCACTCACCACCAGCCTTCTCTCCTAATTCCACCTCTTCTAAGAAGTGGGTT TATGTGGGCGTTGGGGTTGGTGCCGCTTTGCTGCTTCTTCTTTCCTTATTGGGACTCGTT TTCTGCTTCCATCGTCGTCGCTCTACCAAGACCAAGTCGAAGTCGAAGCCCGTCCCAGTC CCACCCAAGAATTTCTCAGAGTCGTCTACTGATTACTCAGCTTTGCCTGATAACAGCAAA TCTTTTGCTTCTTCCGTCTCCTCCCAAGGGTTTCGAGATGCTGTTGAGTCCTTGACAGTC TATAAATTTCAGGACTTGCAGCTTGCCACTGTCAATTTCAGCCAACAGAACAGAATCCAG GGATCCGTTTACAAGGCATCCATCAAGGGCGATGATGCAGCTATAAAGGTGATGAAAGGA GACGTCTCAAGCGAGATCAACTTATTGAAGAAGATCAATCACAGCAACATCATCAGGCTT TCTGGTTTCTGTGTCCATCAAGGCAACACCTATCTTGTTTACGAGTATGCAGACAATGGC GCTGTCGGTGACTGGCTCCACTCCAATAAGTTCCAAGCTTGTGATACTTTGTCGTGGAAG CAGCGAGTCCAGATTGCTAACGACGTCGCCAATGCCCTCAATTATCTCCACAGATACACC AATCCTCCCTATATCCACAAGAATTTGAAGACCAGTAACATTCTTTTGGATGCAAACTTT AGAGCTAAAGTTGCTAACTTTGGCTTGGCAAGAAGTGTGGACGGCCATGACCAGGGTGGA CTGCAATTGACTAGGCATGTGGTTGGTACTTATGGTTATATGGCTCCAGAGTACATCGAG CATGGAGTGATCACCCCAAAACTCGATGTTTTTGCCTTTGGGGTTGTGGTGTTGGAGCTT TTGTCCGGAAGGGAAGCTGCCTCAGGTGACAAAAACAGCGGAGAGGAGTTGCTATCTTTG TTGATAGATAGGGTGCTTGAAGGAGACAATGTGAGAGAGAAACTAAGAGGCTTCATTGAT CCTTCTTTGAAGAACGCATACCCCTTGGATTTGGCCTTCTCCATTGCTCAGCTGGCTAAA AGCTGCGTAGCTCACGATCTAAATGCTCGCCCATCCATGTCTGATGTTTTCATTAACCTG TCAAAGATTGTATCATCCTTATCAGATTGGGATCCATCTGATGAGCTAGATAACTCCAGG TCACTAGGCAGTGGCAGGTAG
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>LITCHI009842.m1 MHAMKILNASTMHMAMDIIVGAVQVTEAILIFSMAVKLISVSAKLEQQNVHSKQKARTLK QHIIAVALKATTAMAREAMTIESLKQRQMFFRRNGGLLLQQQIASRKGAVGTAKIFGIEE LERATDNLNASRICGTRDYSSLYKGMLSDGKIVALKEARITDESQVDQFINEVNKLLGCC LETEVPLLVFEFVRNGTLSDHLHDQDHVSSLSWECHFRIDLDIAGAHAYLHSAASTSIFH QDVQSTNILLDEDENYNAIVADFGLSSKREASITILEARAFNEAKEEELKLEGSSICLSG VVLGDILADAMMFMSKLCACVLLLLLVLQSEAQQPYINNRQLACENHAYDNLTKGFQCNG AQSTCPSYVTFRSNTLYNSAAEIAYLLGATPADVASINNITSDVATLPIDTQLVVPVNCS CSGDYYQHNVTYELRDDSETYFTVSNNTFQGLTSCQAMVAQNEYGIRNLYPGLNLLVPLR CACPTRNQTTSGVKYLLSYLVTWGDSISYIADLFGVDQQAVLDANKLTEDQNIYPFTPIL VSLKTKPTKIEPSRTSSPPAPAPHSPPAFSPNSTSSKKWVYVGVGVGAALLLLLSLLGLV FCFHRRRSTKTKSKSKPVPVPPKNFSESSTDYSALPDNSKSFASSVSSQGFRDAVESLTV YKFQDLQLATVNFSQQNRIQGSVYKASIKGDDAAIKVMKGDVSSEINLLKKINHSNIIRL SGFCVHQGNTYLVYEYADNGAVGDWLHSNKFQACDTLSWKQRVQIANDVANALNYLHRYT NPPYIHKNLKTSNILLDANFRAKVANFGLARSVDGHDQGGLQLTRHVVGTYGYMAPEYIE HGVITPKLDVFAFGVVVLELLSGREAASGDKNSGEELLSLLIDRVLEGDNVREKLRGFID PSLKNAYPLDLAFSIAQLAKSCVAHDLNARPSMSDVFINLSKIVSSLSDWDPSDELDNSR SLGSGR.
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>LITCHI000099.m1 - Up_Stream_Len 2000 CAATCCAAAGCCCATCATACCCACGCCAGTAAGAACACTAAATGAGTTTAATTACGCTAA GGCAGTGAATCAGCTCGAGATAAGGAGCTTGCATAAGACACAACTTGAGGTTGTAGTCAT AGAGTAGCCCGTGGCACGTCCTCAACTCATCAGTTTCTTAACAGTGAGAAAGAGTCGAAA ACAAGAAATTTCCTACTAATTGGTAGAAGTTGGCATACTTTCTTATTTCAATGCATGTTT GGAAAAAGGAAAAAAACTACATCAAACAGGAAGATTCTTATAATGCTTAAAAAATTTCTT CGAACGGGAAACTGTCAAAATCACATTATAAGTCAAATATGGATACAATTAATTATAATT TGATTTAGCATATAAATGTTAATGTAGTTTCATGTAAAATAAGAAAAAGAAATATTAGCC TCTTCTATATTGTAGCAATCAAATTACATGTAAACAATGAATTTTAATACTATATAAAGG GTCATTCGCATGTACAATAGATATCTTGCATTCCTGCAAACTTACCTACCACCCAAAAGA GCTCTTATACGAAACTTTACTAAACTTTGTTTCTTCCTAACAATAGTGTAATCATGGATG TAGGCATTATACTTTGGAGCAAACCACGTTAAAAACCTGCTAGCCTTCTTCGTCTTCTCA CCACTTTCTCTTATATATCTCTATTACTTTATTGTATTTATTCATATTCATTTTATTATT ATTATTATTATTATTTGCTTATCATATTATCACTGTAGTTAGATTTCGTTTAACTCCTCA AATTTCATATTAATCATTGTTTTAAGTTAATCTCGATATTGACCAATTTTTGAAGTTAAC AGTTATATACATTACTTTTGACCCAATTGATACCAAAAAGAAAAGGGAACAAAAAAATTT TCTACATTTCTAAATCGTACCAATTAATTGTCAAAGAAACTAAAAAATTTTCGCCTTCCA CTAATTGTTTTTGACTTTGAACAAAAAAATTTACGTTCAAACAACAAAACATTGTTTCAC TCAACTATATAAACTTTGGTTACAACTTCTACGCTAATTTAGACTATAGTAATATGTACA AAAATGCAACAATCTCATTTATGCCAATCGCAATCGCAACAATCCTATTGTCAGTATCTT GGTCAATCGCAACCTTCTCTTGGTCCCACAAACATGAGTTATACATACAATTGTTGAAGT AAAATAGATGTCTACGTTCAAACAATCAACTGTATGATTCATCATATAGTAATATGTACA AAAATGCAACAATCTCATTTATGCCAATCGCAATCGCAACAATCCTATTGTCAGTATCTT GGTCAATCGCAACCTTCTCTTGGTGCCGCCACAATCATGAGTTATATACAATTGTTGAAG TAACAGAGAAGTTTATGTTCAAACAATCAGCTATGTGATTCATCATCAACAAAATATTGT TTCACTCTTTATCAAAAAAAAAAAAAAAATTGTTTCACTCAACGTACTATTATATACAAT TGTTTCACTCAACTTTCAATCAATTCTTTTCATCAAATCCTATATTAATTGCACATTTAA TTGCACATTTTCCGTAAATATTTATATATATATTTTTTGAATGGTATATCTTTATAAATT ATATATTTATTTTATAAATAAAAAAACTGACTACATGTATATTTTTAATTCATAAATACT AATTAAAATGCATGAAAACAATAGATTAATTTTTCTTTTATATAAATTATTTGACATGAT AAAATTTACAAGTAAAAAAACTCATATAAACTATAATTGTTTTTATCTTTAATTTTAATT TAATTTAATTTTATTATAAGGTAGCATCTTAAGATAAATATCTGGGTCTGCCACTACTTG TGCTACTGGGAAAATTTTTGTACTTTTAACCCTTGAATTAATCTTGATTTTAAGATTTGT AAATTATTCTTTTACTACTTCAGCCCCTATCTGAACTTTTACACATGATTTGAATGATTA ATGACCAAGATACATATAAA
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>LITCHI000099.m1 GenomeSequence - ATGACAGTAGCAAAGGTGTAACGTTATAAGTAATTGAGTCTAGCTAAATTCTCTTTTTAA CAAACTTGAGATTTACAAGCAATTACGTCTAACATAAATGATTATGGGTTCGAATTTTAC AAGAGACACCAATTGATAGTGATATTTTAAAAAAAAAAAAAGATTTGAAGTACTATCCTA TTATCCCGAATTGGTTTGGAAGCATAAAATTAATTTGCCCACCCCTAGTAGTCACAAAAG AATCAAACACAATAGGAAATAAAAATCCTACTTAATAACACACTAAATTAATAAATGATT GAGTGACATTAAAATTACAAGATCTTGTGAATTTAATTTATATCTAGCAAATCTATGAGA TTCAAAAGATCATGTAGCTTTAATGTCACTCAATCATTTATTTAGTAGGTTATTAAGTAG GATTTTTATTTCCTATTCTGTTTGATCATGTGATTTATGAATAGGAACAGAAAGACATGA ATCATTCTAGCATGCCCTTAAAAAGGTATTGTTGTTTTTTAGTTTAATTGATCTTGCCTG AAGAGTGTTTGTGTGTCCCATTTAAGTTCTTTATTGCTTTCTGCCGTCAATGCTATGCAA CTCAGTGGCTTGAATGCGTTTTAAGGTAAAGTATTGTGTTCCGTGGGTATCAAGGGTAAA ATTTTCTAATAATTAGCTACCATGTTTTATTGTTGTCTCTATGTATAGTTCGGATCTTTT ACTAGTTTGTAGGCTATAGATTTTTCGTTCTTTATAGATTTTTGGTTGCCTTTAGTTTTC TTGATCAGCAGTATGCTCTATTTGATGTGTGTCAGTCTTCGAATTTGTTGTGGACTTATT ATGTACGCTTTTGCCTTTTGTTTCTTGATTAGTATATAAGATTTCGAGGTGCTATGGAGA GAATAGTTTAGGGGAATGAAGTTATGAAAGGCCTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTGTTCCT CCTAATTTTATAAAATGTTTCATTCTTTTTGTTTAGAGAAAACTTTGAAGGCTTTGAAAG AGAGGGAAAAGGAGCCAGAGGCACCAGAGCTGGAACCAGAAACCACTACTGAAGGTTCTA TTTCTTTGCAGTTATGAAGGTTGCGGGAAGACCTCTGTTGATGCTGGTGCATTGAGAAAG CACACTCACATCCATGGTGAGAGACAACATGCTTGTCACCATGAGGGATGTGGAAAGGTA ACACAACTAATGTTTTTACATTGGTTTGATTTGTTTTCTTCAGGATTTATTTTATACTCT GCTGTAGAATTATAAGAGTTCACTTTACTTCTTAAGATTTAAACTAAGATATGCAATCAT AGAAATTTTTGTTTTGACCTGACATGCTTTGGTGTAGAAAGAAGAAAAAGAAAACTATTT GTGTACTTTATTTTTGCATAATTATTTATTTATTCCATAAAGAATCCCTGAAATGCTTTT GAGCAGAAAGAAGAAAATGAAAACTATTTGTGTGCTTTCAAATTTTTAGTAATTCCTGTG GGTATAACCTTGTATCTTGCACTAATACTCAGATAAATTCATTCACATGTGTTTGTTTTT TTCTTGGGAGACACATGGAAACTCTCACAAACTTATATATGAAGACACATGTACTTGGCA TTTTATATATAAACAAATTTGCATCTTTCGGTTGTCCAAAAAACAAAGGGATAGAACCTT ACAAATTTGATTCATTGTGTTGATTCTGTGATCTGAATGTAAAAAATTCTTTCTTTTTTT CTTATATATATATATATATATATATATATGGGGTCAATGTTTAGTTGGTTAGATGGACCT AGTAAATATTAGTGCAGGATATGTTAATTTAGGGAAACTGAGATGTTTTGGGAGTTAAGA TGTAAAAGTTTGGGGAACTTCATGCACGCAACATTACAAATCAACAAACTGAGCTAATTT ATTAGTGAAGCTCTGTTAGGTCTAGCTTGGTGCAATGGTAGTTGATCCTGATTGATATGC AGTTTTCTGTTTTAATCATGATCAATGTAATTTTTTTTTTCTGATGTGTTAAAATTGAGC CTCGTCATCATCATTTCATTGTTATCCAGAATGTTTTTGATTGATAATCTTCTTTCAAAG TTTGATAAAAGTGTTTGAAATATTTTGTTTTTATGCTTTGCAGAAATTTTGGATAGTTCA AAGTTGAAATGACACTTTCTCATTCATACTGAAGAAAGAGATTTTGTATG