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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009842 | Chr8 | 337023 | 343987 | + | Protein LYK5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009842.m1 | 140 | 271 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 41.5 | 1.00E-10 |
LITCHI009842.m1 | 171 | 269 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 51.1 | 1.20E-13 |
LITCHI009842.m1 | 499 | 540 | PF01476.23 | LysM | Domain | 20.4 | 0.00042 |
LITCHI009842.m1 | 694 | 936 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 133.3 | 1.10E-38 |
LITCHI009842.m1 | 696 | 937 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 128.1 | 3.90E-37 |
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>LITCHI009842.m1 ATGCATGCCATGAAAATACTGAATGCATCGACTATGCACATGGCAATGGATATCATTGTG GGTGCAGTCCAGGTTACCGAGGCAATCCTTATCTTCTCAATGGCTGTAAAGCTAATATCG GTAAGTGCAAAATTGGAACAGCAAAATGTGCACAGCAAGCAAAAAGCAAGAACACTGAAG CAGCATATCATTGCAGTTGCCCTAAAGGCTACCACGGCGATGGCTCGGGAGGCAATGACA ATTGAAAGTTTGAAACAGAGGCAAATGTTCTTTAGACGAAATGGTGGCTTGTTATTGCAA CAACAGATTGCTTCACGGAAAGGAGCAGTTGGGACAGCCAAAATATTTGGTATTGAAGAG TTAGAAAGAGCAACAGACAACCTCAATGCAAGTCGAATTTGTGGAACTAGGGACTACAGT TCACTTTACAAAGGCATGCTATCTGATGGCAAGATAGTAGCCCTCAAGGAGGCTCGAATT ACGGATGAAAGTCAAGTTGATCAGTTTATCAATGAAGTAAATAAGTTGCTGGGTTGTTGT CTTGAGACAGAAGTCCCTTTACTAGTTTTTGAATTTGTTCGCAATGGAACACTCTCCGAC CACCTTCACGACCAGGATCATGTTTCGTCTCTTTCTTGGGAATGTCACTTCAGGATTGAC TTGGACATTGCTGGTGCTCATGCTTATTTGCATTCTGCAGCCTCTACATCCATCTTTCAT CAAGATGTACAGTCGACCAACATTCTCTTGGACGAAGACGAAAACTATAATGCTATAGTT GCCGATTTTGGTCTCTCAAGTAAAAGAGAAGCGTCTATTACAATCTTAGAGGCTCGTGCT TTTAATGAAGCAAAAGAAGAAGAGTTGAAACTTGAAGGCAGTTCAATCTGTTTATCTGGA GTTGTTCTTGGAGATATTTTGGCCGATGCGATGATGTTCATGTCTAAATTGTGTGCGTGT GTGTTGTTGCTTCTGCTGGTTTTGCAATCCGAAGCACAACAACCGTATATAAACAATCGT CAGCTAGCCTGCGAAAACCATGCCTACGATAATCTAACAAAAGGATTCCAATGCAACGGA GCCCAATCAACATGTCCATCCTACGTCACCTTCAGATCCAACACACTCTACAACTCAGCC GCGGAGATCGCCTATCTGTTGGGAGCCACACCCGCCGACGTTGCCTCCATCAACAACATC ACCTCAGACGTGGCCACCCTACCCATAGACACCCAGCTGGTCGTCCCTGTCAACTGCTCT TGTTCCGGTGACTACTACCAGCACAATGTCACCTACGAGCTGAGAGACGATTCCGAGACC TACTTCACAGTTTCCAACAACACCTTCCAGGGACTCACCAGTTGCCAGGCTATGGTGGCT CAAAACGAGTATGGAATCAGGAACCTGTATCCGGGTTTGAATTTGTTGGTTCCACTTAGA TGTGCTTGTCCAACTAGAAACCAGACAACTTCGGGTGTCAAATACTTGTTGAGTTACTTG GTCACCTGGGGTGATTCCATTTCTTACATAGCAGACCTTTTCGGTGTCGACCAACAAGCC GTTTTGGATGCAAATAAACTCACTGAGGACCAAAACATATATCCATTTACGCCCATTTTG GTATCACTTAAGACTAAACCCACCAAGATTGAGCCTTCACGGACGTCTTCACCGCCAGCA CCTGCCCCCCACTCACCACCAGCCTTCTCTCCTAATTCCACCTCTTCTAAGAAGTGGGTT TATGTGGGCGTTGGGGTTGGTGCCGCTTTGCTGCTTCTTCTTTCCTTATTGGGACTCGTT TTCTGCTTCCATCGTCGTCGCTCTACCAAGACCAAGTCGAAGTCGAAGCCCGTCCCAGTC CCACCCAAGAATTTCTCAGAGTCGTCTACTGATTACTCAGCTTTGCCTGATAACAGCAAA TCTTTTGCTTCTTCCGTCTCCTCCCAAGGGTTTCGAGATGCTGTTGAGTCCTTGACAGTC TATAAATTTCAGGACTTGCAGCTTGCCACTGTCAATTTCAGCCAACAGAACAGAATCCAG GGATCCGTTTACAAGGCATCCATCAAGGGCGATGATGCAGCTATAAAGGTGATGAAAGGA GACGTCTCAAGCGAGATCAACTTATTGAAGAAGATCAATCACAGCAACATCATCAGGCTT TCTGGTTTCTGTGTCCATCAAGGCAACACCTATCTTGTTTACGAGTATGCAGACAATGGC GCTGTCGGTGACTGGCTCCACTCCAATAAGTTCCAAGCTTGTGATACTTTGTCGTGGAAG CAGCGAGTCCAGATTGCTAACGACGTCGCCAATGCCCTCAATTATCTCCACAGATACACC AATCCTCCCTATATCCACAAGAATTTGAAGACCAGTAACATTCTTTTGGATGCAAACTTT AGAGCTAAAGTTGCTAACTTTGGCTTGGCAAGAAGTGTGGACGGCCATGACCAGGGTGGA CTGCAATTGACTAGGCATGTGGTTGGTACTTATGGTTATATGGCTCCAGAGTACATCGAG CATGGAGTGATCACCCCAAAACTCGATGTTTTTGCCTTTGGGGTTGTGGTGTTGGAGCTT TTGTCCGGAAGGGAAGCTGCCTCAGGTGACAAAAACAGCGGAGAGGAGTTGCTATCTTTG TTGATAGATAGGGTGCTTGAAGGAGACAATGTGAGAGAGAAACTAAGAGGCTTCATTGAT CCTTCTTTGAAGAACGCATACCCCTTGGATTTGGCCTTCTCCATTGCTCAGCTGGCTAAA AGCTGCGTAGCTCACGATCTAAATGCTCGCCCATCCATGTCTGATGTTTTCATTAACCTG TCAAAGATTGTATCATCCTTATCAGATTGGGATCCATCTGATGAGCTAGATAACTCCAGG TCACTAGGCAGTGGCAGGTAG
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>LITCHI009842.m1 ATGCATGCCATGAAAATACTGAATGCATCGACTATGCACATGGCAATGGATATCATTGTG GGTGCAGTCCAGGTTACCGAGGCAATCCTTATCTTCTCAATGGCTGTAAAGCTAATATCG GTAAGTGCAAAATTGGAACAGCAAAATGTGCACAGCAAGCAAAAAGCAAGAACACTGAAG CAGCATATCATTGCAGTTGCCCTAAAGGCTACCACGGCGATGGCTCGGGAGGCAATGACA ATTGAAAGTTTGAAACAGAGGCAAATGTTCTTTAGACGAAATGGTGGCTTGTTATTGCAA CAACAGATTGCTTCACGGAAAGGAGCAGTTGGGACAGCCAAAATATTTGGTATTGAAGAG TTAGAAAGAGCAACAGACAACCTCAATGCAAGTCGAATTTGTGGAACTAGGGACTACAGT TCACTTTACAAAGGCATGCTATCTGATGGCAAGATAGTAGCCCTCAAGGAGGCTCGAATT ACGGATGAAAGTCAAGTTGATCAGTTTATCAATGAAGTAAATAAGTTGCTGGGTTGTTGT CTTGAGACAGAAGTCCCTTTACTAGTTTTTGAATTTGTTCGCAATGGAACACTCTCCGAC CACCTTCACGACCAGGATCATGTTTCGTCTCTTTCTTGGGAATGTCACTTCAGGATTGAC TTGGACATTGCTGGTGCTCATGCTTATTTGCATTCTGCAGCCTCTACATCCATCTTTCAT CAAGATGTACAGTCGACCAACATTCTCTTGGACGAAGACGAAAACTATAATGCTATAGTT GCCGATTTTGGTCTCTCAAGTAAAAGAGAAGCGTCTATTACAATCTTAGAGGCTCGTGCT TTTAATGAAGCAAAAGAAGAAGAGTTGAAACTTGAAGGCAGTTCAATCTGTTTATCTGGA GTTGTTCTTGGAGATATTTTGGCCGATGCGATGATGTTCATGTCTAAATTGTGTGCGTGT GTGTTGTTGCTTCTGCTGGTTTTGCAATCCGAAGCACAACAACCGTATATAAACAATCGT CAGCTAGCCTGCGAAAACCATGCCTACGATAATCTAACAAAAGGATTCCAATGCAACGGA GCCCAATCAACATGTCCATCCTACGTCACCTTCAGATCCAACACACTCTACAACTCAGCC GCGGAGATCGCCTATCTGTTGGGAGCCACACCCGCCGACGTTGCCTCCATCAACAACATC ACCTCAGACGTGGCCACCCTACCCATAGACACCCAGCTGGTCGTCCCTGTCAACTGCTCT TGTTCCGGTGACTACTACCAGCACAATGTCACCTACGAGCTGAGAGACGATTCCGAGACC TACTTCACAGTTTCCAACAACACCTTCCAGGGACTCACCAGTTGCCAGGCTATGGTGGCT CAAAACGAGTATGGAATCAGGAACCTGTATCCGGGTTTGAATTTGTTGGTTCCACTTAGA TGTGCTTGTCCAACTAGAAACCAGACAACTTCGGGTGTCAAATACTTGTTGAGTTACTTG GTCACCTGGGGTGATTCCATTTCTTACATAGCAGACCTTTTCGGTGTCGACCAACAAGCC GTTTTGGATGCAAATAAACTCACTGAGGACCAAAACATATATCCATTTACGCCCATTTTG GTATCACTTAAGACTAAACCCACCAAGATTGAGCCTTCACGGACGTCTTCACCGCCAGCA CCTGCCCCCCACTCACCACCAGCCTTCTCTCCTAATTCCACCTCTTCTAAGAAGTGGGTT TATGTGGGCGTTGGGGTTGGTGCCGCTTTGCTGCTTCTTCTTTCCTTATTGGGACTCGTT TTCTGCTTCCATCGTCGTCGCTCTACCAAGACCAAGTCGAAGTCGAAGCCCGTCCCAGTC CCACCCAAGAATTTCTCAGAGTCGTCTACTGATTACTCAGCTTTGCCTGATAACAGCAAA TCTTTTGCTTCTTCCGTCTCCTCCCAAGGGTTTCGAGATGCTGTTGAGTCCTTGACAGTC TATAAATTTCAGGACTTGCAGCTTGCCACTGTCAATTTCAGCCAACAGAACAGAATCCAG GGATCCGTTTACAAGGCATCCATCAAGGGCGATGATGCAGCTATAAAGGTGATGAAAGGA GACGTCTCAAGCGAGATCAACTTATTGAAGAAGATCAATCACAGCAACATCATCAGGCTT TCTGGTTTCTGTGTCCATCAAGGCAACACCTATCTTGTTTACGAGTATGCAGACAATGGC GCTGTCGGTGACTGGCTCCACTCCAATAAGTTCCAAGCTTGTGATACTTTGTCGTGGAAG CAGCGAGTCCAGATTGCTAACGACGTCGCCAATGCCCTCAATTATCTCCACAGATACACC AATCCTCCCTATATCCACAAGAATTTGAAGACCAGTAACATTCTTTTGGATGCAAACTTT AGAGCTAAAGTTGCTAACTTTGGCTTGGCAAGAAGTGTGGACGGCCATGACCAGGGTGGA CTGCAATTGACTAGGCATGTGGTTGGTACTTATGGTTATATGGCTCCAGAGTACATCGAG CATGGAGTGATCACCCCAAAACTCGATGTTTTTGCCTTTGGGGTTGTGGTGTTGGAGCTT TTGTCCGGAAGGGAAGCTGCCTCAGGTGACAAAAACAGCGGAGAGGAGTTGCTATCTTTG TTGATAGATAGGGTGCTTGAAGGAGACAATGTGAGAGAGAAACTAAGAGGCTTCATTGAT CCTTCTTTGAAGAACGCATACCCCTTGGATTTGGCCTTCTCCATTGCTCAGCTGGCTAAA AGCTGCGTAGCTCACGATCTAAATGCTCGCCCATCCATGTCTGATGTTTTCATTAACCTG TCAAAGATTGTATCATCCTTATCAGATTGGGATCCATCTGATGAGCTAGATAACTCCAGG TCACTAGGCAGTGGCAGGTAG
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>LITCHI009842.m1 + Up_Stream_Len 2000 GACTATTTATATAACTTCTCCACAACATGATACAATGAGAAATGCGTTGTATCAGCTGCA ATTTAAATTATTTTCTTGCTTAATTGTAATTTGTTGGTCCCTGTCTCTCAGTGTTGCTTC TCGCCTGGGTAGGACTCTGTTTTGCAGCTATATCAGCCTTCAGATCATGCATCTGCAAAT CCAAGCGTGACTGACCATATGATGAGGTGTATCGCAATTTGCATTAAGATTTTTCACCAG CAGGAAACCAATTTCTGACTTGCTAATTGGTACTTCAGAGTAACTTCAAAAATGTGGAGG TTTCTTTAGGTAGATGTAATACCCCCATTCATGTTTGTTGTTATATTGAGTGGCAGTTTT AGAGTCTCTCAACAGAGTTAGCTTTAAGATGTAGTGGAGTATTTTACTCCAAAAAAAAGA AAAGGAAAAATTGAAATCTTATTTTTGCAGGTCTCATGGCTTCAAAGTTTGTAATGATAT TAGAGGTAATTTGCGCCATGGCAACAACTTTCCAAGTTCTACAATAAAATTGCGTCATCC CCAAGCCACAAGGGCAGGAAAATGAAGAAAAATTATGCATTTTAGTATACAGTAGTTCGA ATAAATTTGCTCCTTTCTATAAGTTTTGATTCCCATAATCCTACAGAGTAAATAATTAAA AATAAAGTTACTCAAATTGCTACCAACTGTTTTGAAAATCTAAAAGATATTAAAGTAAAA TCATGATTTTGGGAGATGCATATTTATGTTAGATGGACCGTTTAATTATATATATATAAT TAAAAAACATGCTCATTTATGTGACTTTGTTTTCTACTAGCTATACGTACATTTGTACTC ATACATCAATGAGAATATAAGAATGTGCCATTGATACTCCTATATTAATATGATTTTAAG TGGAAGCAAGTGACCCATGTGCACAAAGTGCGCCCATCATTGTCCTGAACAAAGTGGTAG TTGTATTTACTTAGTAAGATTTATTATCTCATTCGGCTGAAGAGAGACATTCCTTGGGCA GAGAGCTCATTAACCATAAAAGTTGCATCCATTTGGGCTACAACAACAAAGCCAACATTT TTGGAAGCATTGGATGTTTCTACGATAGTCGCCAAGAGATAAATTACCTCAGATAGCTGG ATCATGACATGATTCCATTGCTGGATAAAGTGACATCCATAACTTTGAATTCATCAAATA CTTGCCAAGTGCATGGATGTCGTTAACACTAGGCTTCCTGTTTAAGCTCCTAACCATTGT TTTGATTTTGGAAAGTAATGATGGTGTTGCCGCCAAGCCGTACTGTCCAAGTAAATGTGG GAACCTCAATACTTCCTACCCGTTTGGTGTTGGTCAGGGCTGTTACAGAAACAAACGGTT TGAGATCACATGCCGGAATCATTCTGCAAACCTGCAACAAGTCCCCATTTTGCATGCTTA TCAAGTCAAAATTTTGAACATTTCAGGTTCTGAGGTACAAGTTGCATACACTTGGAATTT TTCTGACTGTTATCCCACCAAAGCCGGATTGAATCTGGGTTGGAACAATTTATAAGACCT ATTTATAGAGAGATAGGAGTTTCAAACCCTTACGCGTTCTCACACTTTAATAACAAGCTG GTTGCAATTGGTTGTGATGTTTACACCTATATCACCAACCGATTCTTTGATAATTACACA ACAGGCTGTCTATCCTTATGCCACTCTCAAAACCCTTTAAATTTTAATACACAGCCCTCT CCTTGTGCTGGTGTGCATTGCTGTCAGACTGCTCTTTCTGTAGGCCTTAAGTCCTTCCAC GTCAGTATTGTCGAAGTTAGCTAATTAGGAGTTCCAGGTCAGCATGGTCGACCTGGTTGC GCTCGTGCATTCCTTGCTGAGCATGCCTTTACTAATTACTGTTCTTATGATCATGAGGTT CCAGTGAGACTGGCTTGGGACTGACTTGGGTTGTGGGCAACGGCTCGTGAAAAAAAATCA AAGACAGATTAACAGTAGCC
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>LITCHI009842.m1 GenomeSequence + ATGCATGCCATGAAAATACTGAATGCATCGACTATGCACATGGCAATGGATATCATTGTG GGTGCAGTCCAGGTTACCGAGGCAATCCTTATCTTCTCAATGGCTGTAAAGCTAGTTTTT GATTCTACTGGTAACACATTATGTAGTGTTACTGTTACATTGCCAAAGGCCTTTTTTGTT TTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTTTTTCTTCCCCTTGGTGTGATCTAATCGTGACTAGCTA TAATTCTTCAGATATCGGTAAGTGCAAAATTGGAACAGCAAAATGTGCACAGCAAGCAAA AAGCAAGAACACTGAAGCAGCATATCATTGCAGTTGCCCTAAAGGCTACCACGGCGATGG TATTCCAGAAAATGGTTGCATCCCTGATAAACGACACCTTCCACTGCCTCTAATTTTCTC TTTAGGTGTTGTTATCTTATCCCTTGGCTTCAATGGTAATCTAAGAAATTGAATGGTTGG TAATGCTTTCACATGTGTAGAGGAAAACATTGTGTAATAGTCAAGTTGCTATCTTATATG TTAACCATCCATTTTATGACTTGCAGGAATGGCAGTTGGCTTGAGTTTAGCAGTCATTGC AATATCAGGAATCTTGTTTATATGGAGGCTCGGGAGGCAATGACAATTGAAAGTTTGAAA CAGAGGCAAATGTTCTTTAGACGAAATGGTGGCTTGTTATTGCAACAACAGATTGCTTCA CGGAAAGGAGCAGTTGGGACAGCCAAAATATTTGGTATTGAAGAGTTAGAAAGAGCAACA GACAACCTCAATGCAAGTCGAATTTGTGGAACTAGGGACTACAGTTCACTTTACAAAGGC ATGCTATCTGATGGCAAGATAGTAGCCCTCAAGGAGGCTCGAATTACGGATGAAAGTCAA 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