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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009817 | Chr8 | 81079 | 85584 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 37 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009817.m1 | 117 | 141 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35 | 1.00E-08 |
LITCHI009817.m1 | 120 | 141 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 12.7 | 0.17 |
LITCHI009817.m1 | 169 | 194 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.1 | 1.90E-08 |
LITCHI009817.m1 | 172 | 193 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.9 | 0.0077 |
LITCHI009817.m1 | 250 | 270 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.2 | 7.70E-08 |
LITCHI009817.m1 | 251 | 269 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.7 | 0.077 |
LITCHI009817.m1 | 325 | 349 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.70E-10 |
LITCHI009817.m1 | 328 | 349 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.5 | 0.088 |
LITCHI009817.m1 | 412 | 433 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.6 | 1.80E-10 |
LITCHI009817.m1 | 413 | 433 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.7 | 0.0091 |
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>LITCHI009817.m1 ATGGCCAACCAGCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCCAACAAGCGTCTACACTTCTCGT TCCATGACGGACGCTGCTCTCCATTACGATCCTGATCATTCTCTTTACCATTACTCTCAC ACTGATATGTTGAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTCCCAACCCTGGCCTCCTGGTGTC GATCCCACTTCTGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGCGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGT ACCCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGTATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGC ACTAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTATATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGAT TGTGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAATTTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCAT CCTATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATTGGAAAGAGGTTCCACTTATCACAACG ACTGAATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTGTCCCTACTTTCTGAAAACTCAA AGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGCAAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTGGTTACTTCG AGTGCTTCAGGAAATGCCGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTTCTGAGCCTGCATGT GCTGTAAGATTTTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTTGGTTCTGTGATTTG CTCTTCCTATATCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACGGGAGCTTGTAAATTT GGTGCAACATGCAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCATCAGCTGGACAAGAA AATGCTAGTGGCAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACACAACAGGTGGTATG AATCCATATAATCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATAACACAAAAGGACTT CCTTTGAGACCGGGTGAAGTGGATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGTTGCAAATAT GGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGCAATTAATCCTCCTGCTGCTGCA ATAGGCCACCCACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATCCA GCTGTCTCAATATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTCTTGGAGTTGGC CCAAATATCTATCCTCAACGCCCTGGGCAGATGGAATGTGATTACTATATGAAGACTGGG GAGTGTAAGTTTGGCGAAAGATGCAAGTTTCATCACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACA TTGTCAGCAGCTGAGCAAACTTTTCTAGAGCCTGTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCT AGGAGAGAGGTATCAAATTCCTTTTGA
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>LITCHI009817.m1 MANQLYYGAAKSPTSVYTSRSMTDAALHYDPDHSLYHYSHTDMLRYSSINTSSQPWPPGV DPTSAIKRSSEALYHPSVLGTHTTIGQSEAWYATNSLAKRTRFESAGNLPVYPQRPGEKD CAHYMQTRTCKFGETCKFDHPIWVPEGGIPDWKEVPLITTTESLPERPGEPDCPYFLKTQ RCKFGLKCKFNHPKDKLVTSSASGNADIFALPERPSEPACAVRFFMFGSLAELAIWFCDL LFLYPVILEQFYMKTGACKFGATCKFHHPKDIQIASAGQENASGKQNEFSFKAGDTTGGM NPYNPLVSFAPATLHNTKGLPLRPGEVDCPFYLKTGSCKYGSTCRYNHPDRNAINPPAAA IGHPLITSPAASLNIGVVNPAVSIYQTMDPRLAQQTLGVGPNIYPQRPGQMECDYYMKTG ECKFGERCKFHHPIDRSAPTLSAAEQTFLEPVKLTLAGLPRREVSNSF.
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>LITCHI009817.m1 GGGGTATAGATAGTGGGCGGGGTGCAGATAATGTCTAATTAAGAGGCCCAGGAGGGCGAG GAGTGAATAAGAAAAAGCCCACGTCCAAAATATGCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTT GTTGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATGAATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATC AAATGGTTGCTGTTAGTTAATATGATTCATGTGATTTAGGGTTTGGATTGAGTAGAGTGG AGTGAAAAAGAGAGAGTGATTGATGGCCAACCAGCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCC AACAAGCGTCTACACTTCTCGTTCCATGACGGACGCTGCTCTCCATTACGATCCTGATCA TTCTCTTTACCATTACTCTCACACTGATATGTTGAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTC CCAACCCTGGCCTCCTGGTGTCGATCCCACTTCTGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGCGCT CTACCATCCGAGTGTTTTGGGTACCCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGTATGC TACCAACTCTTTAGCCAAGCGCACTAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTATATCC ACAAAGGCCAGGAGAGAAGGATTGTGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAATTTGG AGAAACTTGCAAGTTTGACCATCCTATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATTGGAA AGAGGTTCCACTTATCACAACGACTGAATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTG TCCCTACTTTCTGAAAACTCAAAGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGCAAGTTCAATCATCC AAAGGATAAATTGGTTACTTCGAGTGCTTCAGGAAATGCCGACATTTTTGCCTTACCGGA GAGGCCTTCTGAGCCTGCATGTGCTGTAAGATTTTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCT TGCTATTTGGTTCTGTGATTTGCTCTTCCTATATCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATAT GAAGACGGGAGCTTGTAAATTTGGTGCAACATGCAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCA GATAGCATCAGCTGGACAAGAAAATGCTAGTGGCAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGC TGGTGACACAACAGGTGGTATGAATCCATATAATCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAAC ATTACATAACACAAAAGGACTTCCTTTGAGACCGGGTGAAGTGGATTGTCCATTCTACTT GAAAACTGGGAGTTGCAAATATGGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGC AATTAATCCTCCTGCTGCTGCAATAGGCCACCCACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCT GAACATTGGTGTTGTTAATCCAGCTGTCTCAATATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGC ACAGCAAACTCTTGGAGTTGGCCCAAATATCTATCCTCAACGCCCTGGGCAGATGGAATG TGATTACTATATGAAGACTGGGGAGTGTAAGTTTGGCGAAAGATGCAAGTTTCATCACCC TATTGATCGGTCAGCTCCTACATTGTCAGCAGCTGAGCAAACTTTTCTAGAGCCTGTTAA GCTCACTCTTGCAGGATTGCCTAGGAGAGAGGTATCAAATTCCTTTTGA
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>LITCHI009817.m1 + Up_Stream_Len 2000 GAAATGTTGTGTAATTAGAATTGCTGTGAGATGATGTGCTCTTCTCTATGGTTGGTGTAC ATCCATTACAAGTTTGCAAGGGGGACGTAGGACAACTTTGCAAATTAAGAATTCTAGAAC TTATATGTGGTAACAAAGAGAATTTCAGGTTAGGGCAGTAGAATTTCGTTCATTAGCATA TTATTATGGTCAACATCCTCATTAATCTGAAAGTCTCTGTTGAAAATTGATCCAAGAACT CTGAATTGACTGTTTAGGTGTATCTCAACCATCAGTTTTTGCCACATCCTCCCCTCTAGA GCCAGTGTTACTTAAATGCATTCATGTAGTGTTAAATCTTAATTTTCATTATCAGTTGTT TGGTCATCAACTATTGTAATCTTACCTAACATTGTACAATGTTTTGTAGTTTGCGAACAA AATTCAAATAGATAATATTTTCATTTGCCCTAATTTCATAGATTAGGCATACATAATGAC TTCAAGACAACTAGGAGAGCAGTGCCAAGTTATCAATTTTTGGGATTTGTCCTGTCAGCA GGAACTGCTGAAGATGCTTGATTTTTGAATGTTTAGAATCTAGATAAATTGTTGCTTGCT TGTCCATTGCTTTTGTAGTCATTGGAACCCATACTGCAACGTGTTCTAGAGTTGATTTGT ATAACTTTTGAATCCATAAAGCTAGGAGAAGTCATGAAAAGCAGAACTACTTTTGCTTTC TCTTACTAATAAGATTTTAGACTTTCCAAAGATTATTGTTGAGAATTGTCTGGCTGATGA TGTGCATTGTGAAGTGAGCATTGGTCCAGAGGGTCTAGCTCTAGCCTGTAATCTAAGGCT TCATGGGAAATGTCAGTTGCATTCTGTACTTGTCCTGACTTGGGATGCAAATTTTCCGTT GAAAGAAATGCTAACATGCCAATTAATTACTGGAAAAGAGATGTTTCTATTTTCTCCTTA ATTTCTTATGTCTTTATACTCTTATGAAGATGGTTAAATATAGGTTTTTTGGCATTTGAA ACTGAAGCTAATTGCTGATGTCATGATCGTTTAATTATTGTTGCAGGTCTGGCTGGATGG TCTCAATATTGCCAATAAAGGAGTAAATGATCTTACTCTCTCATTCATTTAGCAATTACG ATGAGTAATCATCTGTTACACATTTTACCAACTTAATTAACACCTGTTTGTGTAGTACCA ACACTTGTAATCCTGTATTGAACGGTTCAATTGTGGTATTTTCGTTGTATGTTTAGTGAG GAATGAATAAAGCTACTAAAAGATGGGTTGTTTCATGGCCCAAAATTATGGTTTTACTGA CTGATCACATGTAGTGCACTGATGTTAATCTTGCTGCCCTCTGTTACGAACTCCGAAAAA CATATTACTGGTGAACTTGAATAAACAGAGTGGACTACATACACAAAGTAAATCAAGTTA ACCAACAAAGATCGGCTTTTACCTCTCTGTCTATGGACTGCTTATGGAGGTGCAACCAAA GCAACAAAATCCTAATAATATATAACATTTATCAAACATGATCAACAACAAATTTCTAAT TCAGGGATTAATATATATAAGATTTATGTCCCATTAAAATTATATATGCAACCCTTTTGC TTTGGTGAGCACAACCCATCACATATTTAAAAGCATTCTTAGTTGGAATAAATTTAAGAA AACAAGTAGAATGCACATACGTATCATAATTGTATTTTAATGAGACGTATTCGGGAAAGG GGTATAGATAGTGGGCGGGGTGCAGATAATGTCTAATTAAGAGGCCCAGGAGGGCGAGGA GTGAATAAGAAAAAGCCCACGTCCAAAATATGCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGT TGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATGAATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAA ATGGTTGCTGTTAGTTAATATGATTCATGTGATTTAGGGTTTGGATTGAGTAGAGTGGAG TGAAAAAGAGAGAGTGATTG
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>LITCHI009817.m1 GenomeSequence + GGGGTATAGATAGTGGGCGGGGTGCAGATAATGTCTAATTAAGAGGCCCAGGAGGGCGAG GAGTGAATAAGAAAAAGCCCACGTCCAAAATATGCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTT GTTGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATGAATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATC AAATGGTTGCTGTTAGTTAATATGATTCATGTGATTTAGGGTTTGGATTGAGTAGAGTGG AGTGAAAAAGAGAGAGTGATTGATGGCCAACCAGCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCC AACAAGCGTCTACACTTCTCGTTCCATGACGGACGCTGCTCTCCATTACGATCCTGATCA TTCTCTTTACCATTACTCTCACACTGATATGTTGAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTC CCAACCCTGGCCTCCTGGTGTCGATCCCACTTCTGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGGTTC CTCCTCTTAATTTCATTTGCCCTGCATTTCTATCATTTAACACTCCTTCATTTAGTCTTT GTCTCATGTGTCGGAGTTCAGATATTCTGCTTTTTTATACAATATATCGAATAGCTACAA GATTGGGCACCTGTATAATGTATCATAACATGTGCTTGCTTTGGCATGCATGCCTCTATT GACAACTCTGCTTTCCTTTCACTTGAGTTTTAACATATGCTACAAATATCATTATATTTT CATTTGTTTATTTCAATTATTATTAGTAGTTGCTAATAATATCCGTGAGGAGAGGTTAGT AATAATGGTTAGGCCTATGGTTTGCTCCCACAAGGTCTGAGCTTCAAACCCTCATGGTCA TGGGTACCTACTTGGCCAAAGCCCATAGCATCTTGCTTCCTAAAGATTCTAGAGTTTGGT CGGAGTTCCAATATTGAACTCAGATTCGCTAGGTAATGCAGGGGATTTCTGGATTATCAA AATAAAGAAAAGAAAATTGTAGTTGCTTGTATATTTCAAGCCATATTAATATAGTTTTTC CCTTAAATATAAAATTTTAAGATTGTTTTGCTTACCTGATGTACTGTTGCATTGGGCTAC TTTTATATTTTGTAAGTGTAAAGTTTACTTATTTCTATAGCAAATGTATTTCTTAGCTGG TATTACTCTTCATATATAATTTTTATTTCCATGTATCTGTATATAGTTATTTACATTTGT AGTTAAAAATTATTTTATACATTATACTTATTTAGTAGCATATAACTTTTTTTCCTGTTT TCTTGTATAAATGTATATACTATGTATTATAGCGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGTAC CCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGTATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGCAC TAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTATATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGATTG TGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAATTTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCATCC TATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATTGGAAAGAGGTGAAAGCACGTTGCTGTTT TCTATGTCTCTTATAATATATCTTATTAAACTAAACATTGATATATAATTCTATAATCTA ATAAGTTTTATCTTGAGATGGATATCTGCTTTATACTGATGAGGGTATTGATATAACATA TGAGCTTTATTTTAATATATGTATATACAGAATTTTTGACATAATATATGAGACAGCAGT AAGATAGTATGTATATACATTTACCACTATTTACATAGATTATTTCCCTAGGTTTCCCCT TTCATTTGTTTTTGAGACAGGCTTTTCGCCCCTATGTGTTTCTCTCTTCTCTTACACTCG TTTTTCTCTTAGATATCTAGGTAAAATAATTGTTGTACCAGATGAGTATGTATTCTTAGT TTACTTGAAGTGGTTAATTTGATAATTAATGCCCGAGTCTTTGTAGCTTGCTTTTGTAGT TTATGTTACCTGGATGTTTTAAGAGTGAACGATGTTATTGGAAAAGGTATCTGTAGTTGT TCTAGCCTCTAGGTGAGGAGAAATGATTTATATAGGTTAGTTATTTTGTGTTTCATCGTA CCCTGGAGACACAAATAAGTAGAGTAACAAAGTTGGCTTCTCTCTGTTACACATCAATAG CATAGCATATCAATCATGAGCAACATTTCTTACTTTAAGATAACATCGTCATTGATTCGT TGTTAATCAGGTTCCACTTATCACAACGACTGAATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACC AGATTGTCCCGTAAGCAAGATTTTAAACTTTCTTATATTTGCAAGTTATGTAATTATATT TTGGAGCTGTTAAAGTCTTAACCATTTCATCTTCTGTTTAATTTGTTGCAGTACTTTCTG AAAACTCAAAGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGCAAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTG GTTACTTCGGTAGGTGCAATTTGCATATAATGTGCCCAGTTAGTTCAAGTTTATTCTGAG TTATTTTCTTTAATTCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTTTGTTTCAGAGTGCTTCAGGAA ATGCCGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTTCTGAGCCTGCATGTGCTGTAAGATTTT TTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTTGGTTCTGTGATTTGCTCTTCCTATATC CTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACGGGAGCTTGTAAATTTGGTGCAACATGCA AGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCATCAGCTGGACAAGAAAATGCTAGTGGCA AGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACACAACAGGTGGTATGAATCCATATAATC CTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATAACACAAAAGGACTTCCTTTGAGACCGG TAACTAACTATTTTGTCTGCTGTACTGGTGCACATGGTTTTAGTTACTTATATAATCATA TACACACACACATACATATTTTTTGGAACTGGTGCTTGTGTGGTTTGTTGTTATAATTAT TATCATTATTATATCGCAAGTTGTACTTGTGTGATGACATCTTTTGTCTCCTTTATCATT TTGTTGAGCTTGTGATTTTCTTTTTCTTGAGGGTCTTTGAGGATAGTTAGCTGCTTAGCT TACAAGAATTTAGTGCTTCTATGGGCGAGTATGATTCAAATTGGCTGTGAACTCAAGATA GGTTCTTGTCATTTATTAGATTTCTAGTATCTTTTCTGATTAAATATTAGAGACTAAAAA TAAGATGGTTTTTGAGTTTCAAATTACGTAACAATTGTTATTTAAAATGAAGGTGACTCT TTCCTTTTTGATTGTTAGTATGTTAGGCTTTGCATTGACAATGTAGCTTTTGCTTCTCTC AGGGTGAAGTGGATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGGTGAATATATGAATATATGC CCATTGATGTTTAATGTTTTAGATACATATAAAGGAAGTGACAGAAGATGCTTAGATGTC TTTCATGTTTTGTGTATCAGTTGCAAATATGGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGAC AGGAATGGTATGCTTGGAATTAAGAATAATTGTTCAATCTTCTCAAATGTCAATTTCAAC ACTTTTTTTTCTTTAAATTTCATTGCTCAATGTGTGCAGCAATTAATCCTCCTGCTGCTG CAATAGGCCACCCACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATC CAGCTGTCTCAATATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTGTAAGTGTGG TTTTTCCCTGCCTCTAAAACAACCATTTTGTTGTGATTATACCCAAACAAAATGGCCAGT TATTTCCAGGTTTTCTCTTGACACTCTGGCTATAAATAAAGTAACTTTGTGGTCATATTT GAGACGTGATGTTTTCTGTTGTTTGCCTTTTGCAGCTTGGAGTTGGCCCAAATATCTATC CTCAACGCCCTGGGCAGATGGAATGTGATGTGCGCATCTACTTAATTTAATATTCTTCTA GTAGCAACTTATCCTATTGCCATTATCTTGTCACTGATTCTGAATTACTGAGACTTGGGG AATTTTCCTTAACCTCTTTTCATACTTGTACATTAATTTTGTTCAATTACATTTGGGGGT GAATTTTCTAGTTTCTTTTGCTGTACAATGGATGAAAACTTCCTTGTGGCTAAGCTCTTT TTGTCAAGACACCTCTTATTAGATTTAGTGCACCCTTAATGACTTATTTTTCTATTGTAT TTTGTATTTTACATGCTGTAGTACTATATGAAGACTGGGGAGTGTAAGTTTGGCGAAAGA TGCAAGTTTCATCACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACATTGTCAGCAGCTGAGCAAACT TTTCTAGAGCCTGTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCTAGGAGAGAGGTATCAAATTCC TTTTGA