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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009809 | Chr8 | 20176 | 24609 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 37 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009809.m1 | 117 | 141 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35 | 1.00E-08 |
LITCHI009809.m1 | 120 | 141 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 12.7 | 0.17 |
LITCHI009809.m1 | 169 | 194 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.1 | 1.90E-08 |
LITCHI009809.m1 | 172 | 193 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.9 | 0.0077 |
LITCHI009809.m1 | 250 | 270 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.2 | 7.70E-08 |
LITCHI009809.m1 | 251 | 269 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.7 | 0.077 |
LITCHI009809.m1 | 325 | 349 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.70E-10 |
LITCHI009809.m1 | 328 | 349 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.5 | 0.088 |
LITCHI009809.m1 | 412 | 433 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.6 | 1.80E-10 |
LITCHI009809.m1 | 413 | 433 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.7 | 0.0091 |
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>LITCHI009809.m1 ATGGCCAACCAGCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCCAACAAGCGTCTACACTTCTCGT TCGATGACGGACGCTGCTCTCCATTACGATCCCGATCATTCTCTTTACCATTACTCTCAC ACTGATATGTTGAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTCCCAACCCTGGCCTCCTGGTGTC GATCCCACTTCTGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGTGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGT ACCCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGTATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGC ACTAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTATATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGAT TGTGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAATTTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCAT CCTATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATTGGAAAGAGGTTCCACTTATCACAACG ACTGAATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTGTCCCTACTTTCTGAAAACTCAA AGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGCAAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTGGTTACTTCG AGTGCTTCAGGAAATGCTGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTTCTGAGCCTGCATGT GCTGTAAGATTTTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTTGGTTCTGTGATTTG CTCTTCCTATATCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACCGGGGCTTGTAAATTT GGTGCAACATGCAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCATCAGCTGGACAAGAA AATGCTAGTGGCAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACACAACAGGTGGTATG AATCCATATAATCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATAACACAAAAGGACTT CCTTTGAGACCGGGTGAAGTGGATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGTTGCAAATAT GGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGCAATTAATCCTCCTGCTGCTGCA ATAGGTCACCCACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATCCA GCTGTCTCAATATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTCTTGGAGTTGGC CCAAATATCTATCCTCAACGCCCTGGGCAGATGGAATGTGATTACTATATGAAGACTGGG GAGTGTAAGTTTGGCGAAAGATGCAAGTTTCATCACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACA TTGTCAGCAGCTGAGCAAACTTTTCTAGAGCCTGTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCT AGGAGAGAGGTATCAAATTCCTTTTGA
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>LITCHI009809.m1 MANQLYYGAAKSPTSVYTSRSMTDAALHYDPDHSLYHYSHTDMLRYSSINTSSQPWPPGV DPTSAIKRSSEVLYHPSVLGTHTTIGQSEAWYATNSLAKRTRFESAGNLPVYPQRPGEKD CAHYMQTRTCKFGETCKFDHPIWVPEGGIPDWKEVPLITTTESLPERPGEPDCPYFLKTQ RCKFGLKCKFNHPKDKLVTSSASGNADIFALPERPSEPACAVRFFMFGSLAELAIWFCDL LFLYPVILEQFYMKTGACKFGATCKFHHPKDIQIASAGQENASGKQNEFSFKAGDTTGGM NPYNPLVSFAPATLHNTKGLPLRPGEVDCPFYLKTGSCKYGSTCRYNHPDRNAINPPAAA IGHPLITSPAASLNIGVVNPAVSIYQTMDPRLAQQTLGVGPNIYPQRPGQMECDYYMKTG ECKFGERCKFHHPIDRSAPTLSAAEQTFLEPVKLTLAGLPRREVSNSF.
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>LITCHI009809.m1 GCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGTTGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATG AATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAAATGGTTGCTGTTAGTTAATAAGATTCATGTG ATTTAGGGTTTGGATTGAATAGAGTGGAGTAAAAGAGAGAGAGTGATTGATGGCCAACCA GCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCCAACAAGCGTCTACACTTCTCGTTCGATGACGGA CGCTGCTCTCCATTACGATCCCGATCATTCTCTTTACCATTACTCTCACACTGATATGTT GAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTCCCAACCCTGGCCTCCTGGTGTCGATCCCACTTC TGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGTGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGTACCCATACCAC AATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGTATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGCACTAGATTCGA GAGTGCCGGCAATTTACCTGTATATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGATTGTGCCCACTA TATGCAAACAAGAACCTGTAAATTTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCATCCTATTTGGGT TCCTGAAGGTGGAATCCCAGATTGGAAAGAGGTTCCACTTATCACAACGACTGAATCTCT TCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTGTCCCTACTTTCTGAAAACTCAAAGATGTAAGTT TGGTTTGAAGTGCAAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTGGTTACTTCGAGTGCTTCAGG AAATGCTGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTTCTGAGCCTGCATGTGCTGTAAGATT TTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTTGGTTCTGTGATTTGCTCTTCCTATA TCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACCGGGGCTTGTAAATTTGGTGCAACATG CAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCATCAGCTGGACAAGAAAATGCTAGTGG CAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACACAACAGGTGGTATGAATCCATATAA TCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATAACACAAAAGGACTTCCTTTGAGACC GGGTGAAGTGGATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGTTGCAAATATGGCTCCACTTG TCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGCAATTAATCCTCCTGCTGCTGCAATAGGTCACCC ACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATCCAGCTGTCTCAAT ATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTCTTGGAGTTGGCCCAAATATCTA TCCTCAACGCCCTGGGCAGATGGAATGTGATTACTATATGAAGACTGGGGAGTGTAAGTT TGGCGAAAGATGCAAGTTTCATCACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACATTGTCAGCAGC TGAGCAAACTTTTCTAGAGCCTGTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCTAGGAGAGAGGT ATCAAATTCCTTTTGA
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>LITCHI009809.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTAATTAGAATTGCTGTGGTTGTTGCTGAGATTATGTGCTCTTCTCTATGGTCGGTGATA CATCCATTACAAGTTTGCAAGGGGGACGTATTTCAACTTTGCAAATTAAGAATTCTAGAA CTTATATGTGGTAACAAAGAGAATTTCAGGTTAGGGCAGTAGAATTTTGTTCGTTAGCAT ATTATTATGGTCAACATCCTCATTAATCTGAAAGTCTTTGTTGAAAATTGATCCAAGAAC TCTGAATTGACTGTTTAGGTGTATCTCAACCATCAGTTTTTGCCATATCAGCCCCTCTAG AGCCAATGTTACTTAAATGCATTCATGTAGTGTTAAATCTTAATTTTCATTATCAGTTGT TTGGTCATCAACTATTGTAATCTTACCTAACATTGTACAATGTTTTGTAGTTTGCGAACA AAATTCAAATAGGTAATAATTTCATTTGCCTTAATTTCATAGATTAGGCATACATAATGA CTTCAAGACAACTAGGAGAGCAGTGCCAAGTTATCAATTTTTGGGATTTGTCCTGTCAGC AGGAACTACTGAAGATGCTTGATTTTTGAATGTTTAGAATCTAGATAAATTGTTGCTTGC TTGTCCATTGCTTTTGTAGTCATTGGAACCCATACTGCAACGTGTTCTAGAGTTGATTTG TATAACTTTTGAATCCATAAAGCTAGGAGAAGTCATGAAAAGCAGAACTACTTTTGCTTT CTCTTACTAATAAGATTTTAGACTTTCCAAAGATTATTGTTGAGAATTGTCTGGCTGATG ATGTGCATTGTGAAGTGAGCATTGGTCCAGAGGGTCTAGCTCTAGCCGGTAATCTAAGGC TTCATAGGAAATGTCAGTTGCATTCTGCACTTGTCCTGACTTGGGATGCAAATTTTCTGT TGAAAGAAAGGCTAACATGCCAATTAATTACTGGAAAAGAGATGTTTCTATATCCTCCTT AATTTCTTATGTCTTTATACTCTTATGAAGATGGTTAAATATAGGTTTTTTGGCATTTGA AACTGAAGCTAATTGCTGATGTCATGATCGTTTAATTATTGTTGCAGGTCTGGCTGGATG GTCTCAATATTGCCAATAAAGGAGTAAATGATCTTACTCTCTCATTCATTTAGCAATTAC GATGAGTAATCATCTGTTACACATTTTACCAACTTAATTAACACCTGTTTGTGTAGTACC AACACTTGTAATCCTGTATTGAACGGTTCAGTTGTGGTATTTTCGTTGTATGTTTAGTGA GGAATGAATAAAGCTACTAAAAGATGGGTTGTTTCATGGCCCAAAATTATGGTTTTACTG ACTGATCACATGTAGTGCACTGATGTTAATCTTGCTGCCCTCTGTTACGAACTCCGAAAA ACATATTACTGGTGAACTTGAATAAACAGAGTGGACTACATACACAAAGTAAATCAAGTT AACCAACAAAGATCGGCTCTTACCTCTCAGGCTATGGACTGCTTATGGAGGTGCAACCAA AGCAACAAAATCCTAATAATATATAACATTTATCAAACATAATCAACAACAAATTTCTAA TTCAGGGATTAATATATATAAGATTTATGTCCCATTAAAATTATATATGCAACCCTTTTG CTTCGGTGAGCACAACCCATCACATATTTAAAAGCATTCTAGTTGGAATAAATTTAAGAA AACAAGCAGAATGCACATACGTATCATAATTGTATTTTAATGAGACGTATTCGGGAAAGG GGTATAGATAGTGGGCGGGGTGCAGACAATATCAAATTAAGAGGCCCAGGAGGGTGAGGA GTGAATAAGAAAAAGCCCACGTCCAAAATATGCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGT TGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATGAATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAA ATGGTTGCTGTTAGTTAATAAGATTCATGTGATTTAGGGTTTGGATTGAATAGAGTGGAG TAAAAGAGAGAGAGTGATTG
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>LITCHI009809.m1 GenomeSequence + GCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGTTGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATG AATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAAATGGTTGCTGTTAGTTAATAAGATTCATGTG ATTTAGGGTTTGGATTGAATAGAGTGGAGTAAAAGAGAGAGAGTGATTGATGGCCAACCA GCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCCAACAAGCGTCTACACTTCTCGTTCGATGACGGA CGCTGCTCTCCATTACGATCCCGATCATTCTCTTTACCATTACTCTCACACTGATATGTT GAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTCCCAACCCTGGCCTCCTGGTGTCGATCCCACTTC TGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGGTTCCTCCTCTTAATTTCATTTGCCCTGCATTTCTAT CATTTAACACTCCTTCATTTAGTCTTTGTCTCATGTGTCGGAGTTCAGATATTCTGCTTT TTTATACAATATATCGAATAGCTACAAGATTGGGCACCTGTATAATGTATCATAACATGT GCTTGCATTGGCATGCATGCCTCTATTGACAACTCTGCTTTCCTTTCACTTAAGTTTTAA CATATGCTACAAATATCATTATATTTTCATTTGTTTATTTCAATTATTATTAGTAGTTGC TAATAATATCTGTGAGGAGAGGTTAGTAATAATGGTTAGGCCTATGGTTTGCTCCCACAA GGTCTGAGCTTCAAACCCTCATGGTCATGGGTACCTACTTGGCCAAAGCCCATAGCATCT TGCTTCCTAAAGATTCTAGAGTTTGGTCGGAGTTCCAATATTGAACTCAGATTCGCTAGG CGGCAGCAGGGGATTTCTGGATTATCAAAATAAAGAAAAAAAAATTGTAGTTGCTTGTAT ATTTCAAGCCATATTAATATAGTTTTTCCCTTAAATATAAAATTTTAAGATTGTTTTGCT TACCTGATGTACTGTTGCATTGGGCTACTTTTATATTTTGTAAGTGTAAAGTTTACTTAT TTCTATAGTAACTGTATTTCTTAGCTGGTATTACTCTTCGTATATAATTTTTATTTCCAT GTATCTGTATATAGTTATTTACATTTGTAGTTAAAAATTATTTTATACATTATACTTATT TAGTAGCATATAACTTTTTTTCCTGTTTTGTTGTATAAATATATATACTATGTATTATAG TGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGTACCCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGT ATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGCACTAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTAT ATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGATTGTGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAAT TTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCATCCTATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATT GGAAAGAGGTGAAAGCACGTTGCTGTTTTCTATGTCTCTTATAATATATCTTATTAAACT AAACATTGATATATAATTCTATAATCTAATAAGTTTTATCTTGAGATGGATATCTGCTTT ATACTGATGAGGGTATTGATATAACATATGAGCTTTATTTTAATATATGTATATACAGAA TTTTTGACATAATATATGAGACAGCAGTAAGATAGTATGTATATACATTTACCACTATTT ACATAGATTATTTCCCTAGGTTTCCCCTTTCATTTGTTTTTGAGACAGGCTTTTCGCCCC TATGTGTTTCTCTCTTCTCTTACACTCGTTTTTCTCTTAGATATCTAGGTAAAGTAATTG TTGTACCAGATGAGTAGTATTCTTAGTTTACTTGAAGTGGTTAATTTGATAATTAATGCC CGAGCCTTTGTAGCTTGCTTTTGTAGTTTATGTTACCTGGATGTTTTAAGAGTGAACTGT GTTATTGGAAAAGGTATCTGTAGTTGTTCTAGCCTCTAGGTGAGGAGAAGTGATTTATAT AGGTTAGTTATTTTGTGTTTCATCGTACCCTGGAGACACAAATAAGTAGAGTAACAAAGT TGGCTTCTCTCTGTTACACATCAATAGCATAGCATATCAATCATGAGCAACATTTCTTAC TTTAAGATAACATCGTCATTGATTCGTTGTTAATCAGGTTCCACTTATCACAACGACTGA ATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTGTCCCGTAAGCAAGATTTTAAACTTTCT TATATTTGCAAGTTATGTAATTATATTTTGGAGCTGTTAAAGTCTTAACCATTTCATCTT CTGTTTAATTTGTTGCAGTACTTTCTGAAAACTCAAAGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGC AAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTGGTTACTTCGGTAGGTGCAATTTGCATATAATGT GCCCAGTTAGTTCAAGTTTATTCTGAGTTATTTTCTTTAATTCATAAGAATATGTTGTTT TACTTTTGTTTCAGAGTGCTTCAGGAAATGCTGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTT CTGAGCCTGCATGTGCTGTAAGATTTTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTT GGTTCTGTGATTTGCTCTTCCTATATCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACCG GGGCTTGTAAATTTGGTGCAACATGCAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCAT CAGCTGGACAAGAAAATGCTAGTGGCAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACA CAACAGGTGGTATGAATCCATATAATCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATA ACACAAAAGGACTTCCTTTGAGACCGGTAACTAACTATTTTGTCTGCTGTACTGGTGCAC ATGGTTTTAGTTACTTATATAATCATATACACACACACATACATATTTTTTGGAACTGGT GCTTGTGTGGTCTGTTGTTATAATTATTATCATTATTATATTGCAAGTTGTACTTGTGTG ATGACATCTTTTGTCTCCTTTATCATTTTGTTGAGCTTGTGATTTTCTTTTTCTTGAGGG TCTTTGAGGATAGTTAGCTACTTAGCTTACAAGAGTTTAGTGCTAGCTTACAACAATTTA GTGCTTCTATGGGTGAGTATAATTCACATTGGCTGTGAACTGAAGATAGGTTCTTGTCAT TTATTAGATTTCTAGAATCTTTTCTCATTAAATATTAGAGACTAAAAATGAGATGGTTTT TGAGTTTCAAATTACGTAACAATTGTTATTTAAAATGAAGGTGACTCTTTCCTTTTTGAT TGTTAGTATGTTAGGCTTTGCATTGACAATGTAGCTTTTGCTTCTCTCAGGGTGAAGTGG ATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGGTGAATATATGAATATATGCCCATTGATGTTT AATGTTTTAGATACATATAAAGGAAGTGACAGAAGATGCTTAGATGTCTTTCATGTTTTG TGTATCAGTTGCAAATATGGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGGTATG CTTGGAATTAAGAATAATTGTTCAATCTTCTCAAATGTCAATTTCAACACTTTTTTTTCT TTAAATTTCATTGCTCAATGTGTGCAGCAATTAATCCTCCTGCTGCTGCAATAGGTCACC CACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATCCAGCTGTCTCAA TATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTGTAAGTGTGGTTTTTCCCTGCC TCTAAAACAACCATTTTGTTGTGATTATACCCAAACAAAATGGCCAGTTATTTCCAGGTT TTCTCTTGACACTCTGGCTATAAATAAAGTAACTTTGTGGTCATATTTGAGACGTGATGT TTTCTGTTGTTTGCCTTTTGCAGCTTGGAGTTGGCCCAAATATCTATCCTCAACGCCCTG GGCAGATGGAATGTGATGTGCGCATTTATTTAATTTAATATTCTTCTAGTAGCAACTTAT CCTATTGCCATTATCTTGTCACTGATTCTGAATTACTGAGACTTGGGGAATTTTCCTTAA CCTCTTTTCATACTTGTACATTAATTTTGTTCAATTACATTTGGGGGTGAATTTTCTAGT TTCTTTTGCTGTACAATGGATGAAAACTTCCTTGTGGCTAAGCTCTTTTTGTCAAGACAC CTCTTATTAGATTTAGTGCACCCTTAATGACTTATTTTTCTATTGTATTTTGTATTTTAC ATGCTGTAGTACTATATGAAGACTGGGGAGTGTAAGTTTGGCGAAAGATGCAAGTTTCAT CACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACATTGTCAGCAGCTGAGCAAACTTTTCTAGAGCCT GTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCTAGGAGAGAGGTATCAAATTCCTTTTGA