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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009519 | Chr7 | 26844664;26844743 | 26848345 | - | Transcription factor SPEECHLESS |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009519.m1 | 121 | 172 | PF00010.29 | HLH | Domain | 42.2 | 6.30E-11 |
LITCHI009519.m2 | 121 | 172 | PF00010.29 | HLH | Domain | 42.3 | 6.10E-11 |
LITCHI009519.m3 | 121 | 172 | PF00010.29 | HLH | Domain | 42.2 | 6.20E-11 |
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>LITCHI009519.m1 ATGGGTGATAATTTGTCTGATTTTTTCGAGGAATCTGAGCTGGGAGAAGATGATTTGTTT GCCATCTTTGAGAGCTTGGACTCGGTCACTGAGTTTTCTCCGTTCACGGTGGCGGCGGAC GAAACAGCTGTGAGCTCGTTTGTTCAGGATGGTCATCATCATCATCAACAACAACAACAA CAAAAACAACAAGAAAAAGCAAGATTGGGGTCTGATCAGAAAATGACAACAGTTTCTTCT AGTACTGTTTTACAGGAGTCTGAAACTGAGCTTGAAACGTCGCCGAAAAGGAAGAGACAG AAGATCTCCGCTGTGGTGGCGGCTGCTAGCTTGGATGAGCTGACCAACTCGGACGGGCAG CAACGGATGTCTCATATAACGGTGGAGCGAAACCGGAGAAAGCAAATGAATGAACACTTG TCTGTGTTGAGATCACTTATGCCTTGCTTCTATGTCAAAAGAGGAGATCAAGCATCAATA ATAGGAGGAGTTGTTGACTACATCAATGAGTTACAACAAGTTCTACAATCACTTGAAGCC AAAAAGCAAAGAAAAGTAGTTTACAGTGAAGTTCTAAGCCCTAGACTTGTTTCAAGTCCA AGAATAGCTTCACCACTTAGCCCTAGAAAACCACCACTGAGCCCTAGACTCAACCTCCCA ATAAGTCCAAGAACCCCACAACCAGGAAGCCCTTATAAGCCAAGAATTCAACAAGCTAGT ACTACTGGTTATCTCTCCCCAACCAAGACAGCAGCTGCTAGCTCCGTCGAACCGTCTCCT TCCTCATCTTCTGCTTCTTCTAACATTGACACCATTAATGAGCTTGTGGCGAATTCGAAA TCAGCCATTGCTGATGTGGAGGTGAAGTTTTGTGGCCCGAACCTTCTTTTAAAGACGGTT TCTCCCAAAATTCCTGGCCAAGCTGTGAAAATTATAGCTGCCCTTGAAGACCTCTCCTTT GAGATCCTCCAAGTGAGCATTAGCTCTGTTGATGAAACCATGCTCAACTCCTTCACTATC AAGATTGGAATTGAATGCCGACTTAGTGCAGAAGAACTTGCTCAACAGATCCAGCAAACA TTCTGCTAA >LITCHI009519.m2 ATGGGTGATAATTTGTCTGATTTTTTCGAGGAATCTGAGCTGGGAGAAGATGATTTGTTT GCCATCTTTGAGAGCTTGGACTCGGTCACTGAGTTTTCTCCGTTCACGGTGGCGGCGGAC GAAACAGCTGTGAGCTCGTTTGTTCAGGATGGTCATCATCATCATCAACAACAACAACAA CAAAAACAACAAGAAAAAGCAAGATTGGGGTCTGATCAGAAAATGACAACAGTTTCTTCT AGTACTGTTTTACAGGAGTCTGAAACTGAGCTTGAAACGTCGCCGAAAAGGAAGAGACAG AAGATCTCCGCTGTGGTGGCGGCTGCTAGCTTGGATGAGCTGACCAACTCGGACGGGCAG CAACGGATGTCTCATATAACGGTGGAGCGAAACCGGAGAAAGCAAATGAATGAACACTTG TCTGTGTTGAGATCACTTATGCCTTGCTTCTATGTCAAAAGAGGAGATCAAGCATCAATA ATAGGAGGAGTTGTTGACTACATCAATGAGTTACAACAAGTTCTACAATCACTTGAAGCC AAAAAGCAAAGAAAAGTAGTTTACAGTGAAGTTCTAAGCCCTAGACTTGTTTCAAGTCCA AGAATAGCTTCACCACTTAGCCCTAGAAAACCACCACTGAGCCCTAGACTCAACCTCCCA ATAAGTCCAAGAACCCCACAACCAGGAAGCCCTTATAAGCCAAGAATTCAACAAGCTAGT ACTACTGGTTATCTCTCCCCAACCAAGACAGCAGCTGCTAGCTCCGTCGAACCGTCTCCT TCCTCATCTTCTGCTTCTTCTAACATTGACACCATTAATGAGCTTGTGGCGAATTCGAAA TCAGCCATTGCTGATGTGGAGGTGAAGTTTTGTGGCCCGAACCTTCTTTTAAAGACGGTT TCTCCCAAAATTCCTGGCCAAGCTGTGAAAATTATAGCTGCCCTTGAAGACCTCTCCTTT GAGATCCTCCAAGTGAGCATTAGCTCTGTTGATGAAACCATGCTCAACTCCTTCACTATC AAGACAGTACACTTTGCTGGTAGCCCTGGTATTGACCATTGA >LITCHI009519.m3 ATGGGTGATAATTTGTCTGATTTTTTCGAGGAATCTGAGCTGGGAGAAGATGATTTGTTT GCCATCTTTGAGAGCTTGGACTCGGTCACTGAGTTTTCTCCGTTCACGGTGGCGGCGGAC GAAACAGCTGTGAGCTCGTTTGTTCAGGATGGTCATCATCATCATCAACAACAACAACAA CAAAAACAACAAGAAAAAGCAAGATTGGGGTCTGATCAGAAAATGACAACAGTTTCTTCT AGTACTGTTTTACAGGAGTCTGAAACTGAGCTTGAAACGTCGCCGAAAAGGAAGAGACAG AAGATCTCCGCTGTGGTGGCGGCTGCTAGCTTGGATGAGCTGACCAACTCGGACGGGCAG CAACGGATGTCTCATATAACGGTGGAGCGAAACCGGAGAAAGCAAATGAATGAACACTTG TCTGTGTTGAGATCACTTATGCCTTGCTTCTATGTCAAAAGAGGAGATCAAGCATCAATA ATAGGAGGAGTTGTTGACTACATCAATGAGTTACAACAAGTTCTACAATCACTTGAAGCC AAAAAGCAAAGAAAAGTAGTTTACAGTGAAGTTCTAAGCCCTAGACTTGTTTCAAGTCCA AGAATAGCTTCACCACTTAGCCCTAGAAAACCACCACTGAGCCCTAGACTCAACCTCCCA ATAAGTCCAAGAACCCCACAACCAGGAAGCCCTTATAAGCCAAGAATTCAACAAGCTAGT ACTACTGGTTATCTCTCCCCAACCAAGACAGCAGCTGCTAGCTCCGTCGAACCGTCTCCT TCCTCATCTTCTGCTTCTTCTAACATTGACACCATTAATGAGCTTGTGGCGAATTCGAAA TCAGCCATTGCTGATGTGGAGGTGAAGTTTTGTGGCCCGAACCTTCTTTTAAAGACGGTT TCTCCCAAAATTCCTGGCCAAGCTGTGAAAATTATAGCTGCCCTTGAAGACCTCTCCTTT GAGATCCTCCAAGTGAGCATTAGCTCTGTTGATGAAACCATGCTCAACTCCTTCACTATC AAGGTAACGCTCTACTTTTTAAATATATGTTATAAAATAGATTTCATTCAACTTTAA
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>LITCHI009517.m1 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATTTCCTTCTGTACTTCATC ATTCAAAAAGAAAACATGCACCTCTCCATAAATCACAAACCCCATTTCCTCTCTCTCGCC CTCACACCATTTCAATTTTCCTCTTGGGTTTTTTTCTTTTACCATTTTTGTTTGTTTTTC ATTGAATCCACTGGAAGGTTCACTCAAAAATACTTACATATATACACACACCCGGTTCAT GGTTTACACTTTTTGTGTTGTTTTCAGATTCTTGTTTGAGCCTGTGCATTCTAGTTGGTG CAGTGGTGGTGATATATAGATCATCCATATATAGAAATGGAGAACATGGGAGATTGGGAG CATAACAATCTGATAAGTGAGTTGACACAAGGGAGGGAGCTGGCTAGGCAGCTCCAAATG CATCTAAACATACCGTCCTCTCAGGAAACTCGTGAAGGGTTGGTACAACGGATTGTGTCT TCTTATGAGAACGCGCTTTCCATGCTGAATTGGAGCAGCGGCAGCAGCGCGGTGGGTGGC CTTGACCAGCCTGCAGCTCATGCAGCTGCCGTGCAGCCTGTCTCTGGTGGCAGTCTTGCA ATTGAATCCCCACCACTCAGTGGAAGTCCTCGTAGTGAGGACTCCGACCGTGACCAAGAG CTCAAAGATGGCTCTAAGAAGAGAAAGGCAAGTCCAACACGGAGACAGGTGAGAGTTCAT CCAGGAGCAGGTTTGGAAGGGACGCTTGATGATGGTTTTAGTTGGAGGAAATATGGACAG AAAGAAATTCTTGGAGCCAAGTATCCAAGAGGCTATTACAGGTGCACTCATCGACACGTT CAAGGTTGTTTGGCCACGAAACAAGTGCAGAGATCTGATGAGGACCCAATGGTCTTCGAA ATAACCTATCGAGGAAGGCACACTTGTACTCAAGCCTCTAAGGCAACCAACTCTTCCATT TTAACTCCACCAGAAATTCAAGAACCAAACAACATCACCTTAGACCCTTTACAACAACAA CTCAGCAACTACCAGCAGCAGCAACAAAACACCCAAGAAGCACTTTACAAACTCAGAGAA AACCTTAGAGTTGTTACACAAGACTTGGACATCCGCCATCATGAATCAGTTCCTCACCAC TTTCACTTTCCCTCAACTTCAACACCTGATCATCCTCATCATCAAAGGCAAGTGTTTTCT CCATCTATGATGCGTCCCAACAGCACTTTGATCACCACGACAGGATCAGTCAACTTCCCA TCACCAGGTAATATCATGTCTCCAGCGACGCCTTCAAGGACCAGCTTTTTCCCTCCAATA TCTGCATCTCCAAGTGGGGTCATAAACAGCTTCCAAAGCAGCCCCAACACCACCACCACC AACAACCAGAACTTTCAAACCTCAGACCAGTCTGCAGAGCTTACTGAGATCATCTCCGCC GCGGCTTCCGCCGCCAATTCCCCCACTGTTGGTGTGGATTTCCCATTTGGTAACGCTGAT CAGTTTGAACAAAACTTCACATTTGACGACTTGGGGTACTTTTCCTCATTTCGTCCATTC GAAAAATGTGCTTCTTCCTCCAACCAACACGCAAGACAAGACATTGAAACGATGGACATT GATTCTGTTTGTGGAATCAATCCAGACCGGTTTGCAGACGACCAGTTATTGAACGACACG CTTGCAGTTGACTCCCATGAGAACCGGGGGGTTGTTATTCGTGATCATATGGTAATGTTC ACGTTCATGTTCCTGGTCATGATGATTATCATCTTCCAGAACCACCGTCAAGTGTTTTTG GACCAAGAATTGTTGTGGTTCAACAATAACAATTCAAGTGATTGTTGGGTCGCTGCTGCT AGTCTGGAGTATGCTACTGGTCCTTGTACTTCCAAGGCTGTTAGTCTTACTGTTGATCAG CTGAACATGACCAACCATCATCATGTTCAAGAGTTTCACAACATGGAGATCATGGAGAAT CCAATCAAACAACTTTCAGGTGTTTGTTGGTCCGCTGCTGCTAGTCTGGACTATGCTACT GGTCCTGGTACTTACGAGGTTGTTAGTTTGACTGGTGATCAGCTGAACATGACCAACCAT CATCATGTTCAAGAGTTTCACAACCCAATAATAAATTATACAGTTAGTCGTTCAGATAAA CACTTTTCTGAGGTGCATCTGTTGCCACCAGACAGTGATGGGGAGGATGTGATGTCATTG GAGAGTGATGAGGATGAGGTGCAGTCTGAATCATCGGTTAATTTTCAAGTTCCTGAAACT GGAATGAAGTTTTCATCTGAAGAGGAGGCCTACAAGTTCTACTCAACTTACGAGAAAAAA GTTGGTTTTAGAGTAAGAAAAGGGAAGGTAACACGATTGTCAAATGGAAATATCAGGACC AAGTTTTTCTTTTGTTCGCGACAAGGGTTTAAATGCAAGAAGGATTCCACCAAAACGGCG TCAAAGTATCATAGGAAAGAGACCAGAACAGGTTGTCTAGCCATGGTCAAACTCACAATT GAAAATGGCAAGTGTGAAACCTCCAAATTTGTTCCTCACCACAATCATGAGCTTGAAGGC AAGTCTAAGCTCATTGTAGGTTCATCCATCAATGACTTAGAGGATCATTCGATGAGTACT GCTTTAAATAAGACTAGGATTGAGGCAGTGGCAGAGGCAGATGCAGAGGATTTCTTACAT GATGAGAAAACAAATTGCATACAAGCTGTAGATGGCCAGGGTTTGATTGATTGCCTCAGG CATGTCCAACTGGACGATCCTTCGTTTTTGTACAGAGTGCAAGTCATTGATAAAAACTGC CTCACGAATATTTTTTGGACGGATGGCAGGTCTAAAACAGACTATGATTGCTTTGGTGAT GTGCTTATCGTGGACACAACGTTGATTGACGCCTATAATATGATTTTTGCAACATTTTTT GTCATCAATCATCATGGAAAATGTGTCTTGTTTGGAGTGATAGCAGCATTGCTTCATTTG ATTGGTTGTTCAAGACTTTTATGGAAGTCATGGGCGGGCATCAACCAAAGACAATATTCA CTGATTGTTGTCAAGCAACGGAAAAGGCGATAG
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>LITCHI009517.m1 + Up_Stream_Len 2000 GATCTTCATTGTTCATCATATAATAATAAATAGATAGTGGAGATTAATTAATTTGAAAAA ATATATTTTTTAAAAAAATTGAAAATCAAAAAATTAAAAAACACAAAAGCCCAATCACCA CTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTTCTGATCATCATTATCTCTCTCCTATCTC TTGTTCTTGTTCTTGTTCTTTTCCTTTTTCTCTTCTTATTCTTCTTCTCCGAAACCAAAT TTGACTTTAATTCAAACCCAAATCTAGGTTCGCTCCATGTTTGATGGAGCTTCTATTTTT GAGTGAAGTTGAGGTTCAAAGTTATGTCGTCTGATCATCACCATCATCATAGCCATTAAC TGTGTTTTAAGCCTAGTCAAGGTTTGATAAAGTCATCGACGGTTTCGAGTTCGAGGAGTG ATGTAGTGTAGTTGAGGTTTGCTAAGGAGAATGTAATTAGTTTTTCAGATGGGTTGAAGG TGATTCTAGATGGGTTGAGGTTGAATGTGATTTTGAGTTTGATTTTTTTTTTTTGTAGAG TTCTTGTAGAAGATCTGAGGTTGATGATGATTTTCATACGGATTTTTTTTTTTTTATCTT TTTGAGGTTGATGATGATTTTTTCAAATGAGTTTTATATGATTTTTTTGAGGTTGAAAAT GGTTTGTTTTCTCTTTTTTTGTTTTGTTTTGCTTTTTTGAGGTTGAAAATGACAAATCAA ACCCAATTCTGAGTTCGAAGAAGAATAAGAAGAAGAAGAAGAGAGAGTGAGAGAGAGAAG GATGAATATTATTATTATTTTTTAATTTTTATTTAAATTTTTAATTTTTTCTCAAATTAG TCTCAATCGTCCATTTTCAGATTTGATTAAAAAAATATTTTTATTAAAATTTTAAAATTT TTCTCAAATTAATTTCCATCGTTCATTTTTAGATGAACAGTTGAGATTTGATTCAATTTA TTTTAAAGTTTTTAAAATTTATTTTAAAAGAAAAATAAAAAAGTAAATTTATTGAGAAAT AATTTCATTTTTCAATATATTTTACACAATCAATCATGTTTAGTAATGGTTAAAGCAGTC AATCCGTTAATCAAGGGGAGGACATTATAAAATAAAATAAAATATTGTATTCATATGTGA ATACAAAACTTTTAAATAAGTTTATGATAATTTTCCCTGTATAAATATATGCATATACAT ATATATTATTTTTTTTAACGTAAGCAGAAGGACTCAAATGTAGTGCCAGACTCACGTCAT CACTAGTATCATCATCATTCTCTTTCGCGTTTTGCGTACTAATTTGGAGTTGATTGTAAG ATAGTAATGACGCGGAACCAGATTTGAAGATTCTCGGTCATCTTCGCATGAAGCTATGTA TCTTTGACTTTCTCTCTCTCTAATTTTTTCAAATTATTTTCTGGGTTAAACTAAGATTTG AAAATTCTACTCCGTCTAGTGGTATGTAAATAGTGTGATAGATTAAAAAACAAAAAAAAA CTAAAATATAAATGTAAAAAGAATGTAAAGGTCAGTCAGTGTATTGATGAAGAAATGGTC AGCATTGGACCTTGTGTTTGCTCAACTTTGAAACCATTTTTCGTTCCTATGACCAAAGAC CAGTCTTCATGAAGAACACCAATCAGATGTTTCCTCAGTCAAACCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATTTCCTTCTGTACTTCATCATTCAAAAAGAAAACA TGCACCTCTCCATAAATCACAAACCCCATTTCCTCTCTCTCGCCCTCACACCATTTCAAT TTTCCTCTTGGGTTTTTTTCTTTTACCATTTTTGTTTGTTTTTCATTGAATCCACTGGAA GGTTCACTCAAAAATACTTACATATATACACACACCCGGTTCATGGTTTACACTTTTTGT GTTGTTTTCAGATTCTTGTTTGAGCCTGTGCATTCTAGTTGGTGCAGTGGTGGTGATATA TAGATCATCCATATATAGAA
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CCCTTTTTGATGTCAATGATAGTTCTGGACATTTATTATACAGAAATTATCAGCTTTAAA AGAGATCTTGAATCAAGTTCTCTTATTGTGCTGATCCTTATTCTCTTTTTTCTTGCATTG TAGGATGTGGCTAGTTTGACCAATTTTTTCCAGAACAATTGTGGTATAACACCAGAGGAG AAACAGCTTTCTGTCAGTGGGCGTAATTGGGGAGAAGTTGATTTAAATGGTCAGTTATCA TTGTTTTGTTTTCAAGTTGATGCTTATAATCATTTTAGTTGTTTTATTTCATGTTCTCTG AAATCTGTGTTGCTGAATGATCTATGGTCTACATTAATTTCATAGTATTTCCCAAAGTTG AAATTTGTTGAAACCATTTTTTGCTACATGCAGGGAATATGCTGACTTTTTTGGTTGGTC AAAAGCAAGCTTTTGAAGTGTCTTTAGCGGATGTCTCACAAACACAGATGCAAGGAAAAA ATGATGTCATTTTGGAGTTCCATGTTGATGACACAACTGGAGCTAATGAGGTTTGTTGCG GTCAAATCATACTTTTAAAATGATATAAGCTGTTTAATACATTTTACTACTGGGAACAAA ATTCGGGCTTCTGTTAGTATAAGATTATAATTCAAGGCTACTAACTTTTTTAGATTGTTT CTTCTGGGGTAATGTTATTGTAACTCTAATTTTATTTTTGTTCATTGATGACAGAAAGAC TCACTGATGGAGATAAGTTTTCACATACCGAATTCTAATACTCAATTTGTTGGTGATGAG AATCATCCGCCAGCTCAAGTGAGTTAATTTCTTGTTATTATGTTTTATGAATTGTTGGTA AAGTCTTGTTATTTTTTACTAATTTCTGGTCACTAAACCATATGCTAGGTTTTTCGTGAT AAAATTACTTCAATGGCTGATGTTGGTGTTGGAGGTGAAGATGCTGTCGTTACATTTGAG 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