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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI009267 | Chr7 | 24150330 | 24155087 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 48 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI009267.m1 | 112 | 148 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 24.2 | 4.60E-05 |
| LITCHI009267.m1 | 236 | 269 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 17 | 0.0086 |
| LITCHI009267.m1 | 274 | 308 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 17.2 | 0.0075 |
| LITCHI009267.m2 | 112 | 148 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 24.4 | 3.90E-05 |
| LITCHI009267.m2 | 236 | 269 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 17.3 | 0.0074 |
| LITCHI009267.m2 | 274 | 308 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 17.4 | 0.0064 |
| LITCHI009267.m3 | 112 | 148 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 24.6 | 3.60E-05 |
| LITCHI009267.m3 | 236 | 269 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 17.4 | 0.0067 |
| LITCHI009267.m3 | 274 | 308 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 17.6 | 0.0059 |
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>LITCHI009267.m1 ATGGACTTGGACGCCCAGGGTGGCGGCAACAAGCGCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTCCC GCTGACAACAAACAGAAAGTGTGTTTCCATTGGCGGGCTGGCAAGTGCAACCGCTTTCCC TGCCCCTTCTTGCATAGAGAGTTGCCGCCTCCGACGGCCAACGGCGGCGGTTCGAAGCGG TTCACCGGCGGCTCCACGTGGGGTAGAGTTGGAAATAGTAGTAGTAATCATAGAAAGACG GAGAAAGTCTGCAGCTATTGGATTCAAGGGAATTGTGGGTATCGAGACAAGTGCAAGTTC TTGCATTGTTGGAGTATTGGTGATAGTTTTCGGTTGCTGACTCAGCTTGAAGGTCACCAG AAGGTTGTCACTGGAATTGCATTGCCTTCGGGTTCGGATAAGCTTTACACGGGTAGTAAA GATGAGACCGTCAGGGTCTGGGATTGCGCGTCTGGACAGTGTATGGGTGTGATTAATCTT GGTGGTGAAGTTGGGTGTATGATTAATGAAGGTCCTTGGATTTTTGTTGGCATACCAAAT GTTGTGAAGGCATGGAACACCCAAACTAATACTGATTTGAGTCTTACTGGGCCTGTAGGA CAAGTTTATGCTTTGGCTGTCGGTAATGATTTGCTCTTTGCTGGAACACAGGATGGGACT ATATTGGCTTGGAAATTTAATGCTGCCACAAATGGCTTTGAACCAGCAGCATCACTTAAA GGTCACAATCTTGCAGTGGTTTCCTTAGTTGTTGGAGCTAATAGGCTGTACTCTGGTTCA ATGGACAATTCTATACGAGTCTGGAACCTTGAAAATTTGCAGTGCATACAGACTTTAACG GAACATACTTCAGTCGTGATGTCCCTTCTTTGTTGGGAGCAGTTTCTTTTATCATGTTCA TTGGATCAAACAATAAAAGTGTGGGTTGCTACAGAAAGCGGAAATTTAGAAGTAACATAC ACTCAAAATGAAGAACATGGAGTGCTAACTCTTTGTGGAATGCCTGATTCCGAAGCGAAG CCAGTCTTGCTGAGCTCTTGTAATGACAATTCCGTCCGCCTCTATGATTTGCCATCGTTC TCTGAGAGGGGTAAAATTTTTGCAAAACAGGAGATTCGTTCCATTCAACTAGGCCCTGGC GGTTTGTTTTTCACTGGTGATGGAACTGGTCAAGTGAAAGTATGGCAATGGTGGAAAGAA CCAACTGCCACATCCTGA >LITCHI009267.m2 ATGGACTTGGACGCCCAGGGTGGCGGCAACAAGCGCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTCCC GCTGACAACAAACAGAAAGTGTGTTTCCATTGGCGGGCTGGCAAGTGCAACCGCTTTCCC TGCCCCTTCTTGCATAGAGAGTTGCCGCCTCCGACGGCCAACGGCGGCGGTTCGAAGCGG TTCACCGGCGGCTCCACGTGGGGTAGAGTTGGAAATAGTAGTAGTAATCATAGAAAGACG GAGAAAGTCTGCAGCTATTGGATTCAAGGGAATTGTGGGTATCGAGACAAGTGCAAGTTC TTGCATTGTTGGAGTATTGGTGATAGTTTTCGGTTGCTGACTCAGCTTGAAGGTCACCAG AAGGTTGTCACTGGAATTGCATTGCCTTCGGGTTCGGATAAGCTTTACACGGGTAGTAAA GATGAGACCGTCAGGGTCTGGGATTGCGCGTCTGGACAGTGTATGGGTGTGATTAATCTT GGTGGTGAAGTTGGGTGTATGATTAATGAAGGTCCTTGGATTTTTGTTGGCATACCAAAT GTTGTGAAGGCATGGAACACCCAAACTAATACTGATTTGAGTCTTACTGGGCCTGTAGGA CAAGTTTATGCTTTGGCTGTCGGTAATGATTTGCTCTTTGCTGGAACACAGGATGGGACT ATATTGGCTTGGAAATTTAATGCTGCCACAAATGGCTTTGAACCAGCAGCATCACTTAAA GGTCACAATCTTGCAGTGGTTTCCTTAGTTGTTGGAGCTAATAGGCTGTACTCTGGTTCA ATGGACAATTCTATACGAGTCTGGAACCTTGAAAATTTGCAGTGCATACAGACTTTAACG GAACATACTTCAGTCGTGATGTCCCTTCTTTGTTGGGAGCAGTTTCTTTTATCATGTTCA TTGGATCAAACAATAAAAGTGTGGGTTGCTACAGAAAGCGGAAATTTAGAAGTAACATAC ACTCAAAATGAAGAACATGGAGTGCTAACTCTTTGTGGAATGCCTGATTCCGAAGCGAAG CCAGTCTTGCTGAGCTCTTGTAATGACAATTCCGTCCGCCTCTATGATTTGCCATCGTGA >LITCHI009267.m3 ATGGACTTGGACGCCCAGGGTGGCGGCAACAAGCGCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTCCC GCTGACAACAAACAGAAAGTGTGTTTCCATTGGCGGGCTGGCAAGTGCAACCGCTTTCCC TGCCCCTTCTTGCATAGAGAGTTGCCGCCTCCGACGGCCAACGGCGGCGGTTCGAAGCGG TTCACCGGCGGCTCCACGTGGGGTAGAGTTGGAAATAGTAGTAGTAATCATAGAAAGACG GAGAAAGTCTGCAGCTATTGGATTCAAGGGAATTGTGGGTATCGAGACAAGTGCAAGTTC TTGCATTGTTGGAGTATTGGTGATAGTTTTCGGTTGCTGACTCAGCTTGAAGGTCACCAG AAGGTTGTCACTGGAATTGCATTGCCTTCGGGTTCGGATAAGCTTTACACGGGTAGTAAA GATGAGACCGTCAGGGTCTGGGATTGCGCGTCTGGACAGTGTATGGGTGTGATTAATCTT GGTGGTGAAGTTGGGTGTATGATTAATGAAGGTCCTTGGATTTTTGTTGGCATACCAAAT GTTGTGAAGGCATGGAACACCCAAACTAATACTGATTTGAGTCTTACTGGGCCTGTAGGA CAAGTTTATGCTTTGGCTGTCGGTAATGATTTGCTCTTTGCTGGAACACAGGATGGGACT ATATTGGCTTGGAAATTTAATGCTGCCACAAATGGCTTTGAACCAGCAGCATCACTTAAA GGTCACAATCTTGCAGTGGTTTCCTTAGTTGTTGGAGCTAATAGGCTGTACTCTGGTTCA ATGGACAATTCTATACGAGTCTGGAACCTTGAAAATTTGCAGTGCATACAGACTTTAACG GAACATACTTCAGTCGTGATGTCCCTTCTTTGTTGGGAGCAGTTTCTTTTATCATGTTCA TTGGATCAAACAATAAAAGTGTGGGTTGCTACAGAAAGCGGAAATTTAGAAGTAACATAC ACTCAAAATGAAGAACATGTATGTCATTTTCTGCAAATCTGGTGTTCCTGA
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ATAGCAATCCTGCACTGGATTACATGTGAGGGAGGGATCCTTGAGTTGAGTCCCATCTCT TTTTCCAGTCCAGTCTTATGTCATCGGGTTACTGTTATTTCATTTCTTTGTTCATTTGTT TCTTGTACAGGGATGGAATGGGGGGCATAGATGACCGGTATTTTTAGCAAAGTAGACAAG GATTGTGATGAGACAAGTGAAAGAAGGGTAGAAACATTAATGGAGGTTTAAGGGTAGTAG AATTTTTAGAATTAGTAATGAGGTAGTAGGTCTTATTGGGAGGTCAATAGTTGTTGGGAG TCTTGTGTTTTCCTTTCCCTTTTTGTATTCTTTTTCTTCTTTTGCTTCCTCCTCATGGGA ATTCTTTTTGCAGTTCATTTGTTAGTAGAAAATTTCTGAGATATGATTAATGCAATTTGA CAACTTTTGTTATTTCTCTACTCTTTCTGCTTTTAACATTCCTCTATTTAAATCAGC >LITCHI027815.m5 AAAAGCTGACAGACACAAAATGCCAGTACAAACGCAGATGCTATACAACCCACCCCCATC TCTCTCTTGTCTATCTATGTAAGCACCCCATTTAAATCATTGAAATCCGTAGACTTCCAT CTCACAGAACAAAACACAACACACTCAATCAGGGTACCAAATTTTGATTTTTTGAAATGA AGGGATGTGTAGTTTGTCCAAATCCATGATGAGCGGTGAAAACTTTAGAGAAGAGGTGGA GGTGTTGGGGACCCACACGTATCTAATATAAAAGAGAGAAAAGACTTCAACATCAAGACA GTGAAAGAATAGTAAAAGACAGCTAGCAGTGAAGGAGGAGCCTCACCAACCATCCGCGCA CTTCCGTCTCTCCTTTTATTATTTCCATTTCTCCTCTCACTTTTCTCTTAACTCATAGTT TCAAACCACAACAAACTTACTTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCCTCTCTACT 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TTTTGATGGTGTCGGTGAATGGATGGAAGCCACCTCATCCAATTGAATTATTGCCCAAAT AAAATGTCATTATTGTTATTATTATTTTTTTGAGATGCATAATTATTATTATTATTTTTA AATGCAAGTCACGTGCCTGCACATGTTACTACTTAAAAATGAAACGTGTCATGTACAAAT GTTATTAGTTGGCATACATGATATGTTACACTTGATTTGATTTGGTGTGCTTATAATTAT ATCATTTAATGTTCTGGATAGTTTTTGTTGAACCACCGGTTTGTCTTAGATAGATTTTTT TATTAACTTGTTAACGTTGATAATAAATTGATTTTGATGAACAATGTTACAAAAAAAAAA AAAAAAAATTGAAAAGATACGCGTATTCATTTAAAGTGTTGGATGAATAATTGAATACAA TTTGACTGTAACTTATTTTGGCATGTGAATGCAGTATGAGGACATTGTCCAGCTTGAATG GCTATCGAATTTTGTTGAGGATTCCTTCTCTGGAGGAAGCCTTACAATGAATAAACAAGA GGTATCAATGTCATCCAGTGTGAAGAAGGAGGACTCATCCCACAACCAGTTCCAGACTTC CAGCCCTGTTTCTGTGCTGGAGAGCAGCAGCTCTTGTTCGGGCGAGAAAACCGTTCAGTG CAGCCGAGAAGGTGTTGTAACCGGAAAGCGTGGACGTGCTCGCAGCAAGCGTCCTCGTCC TGCCACATTTAATCCCCGCCCTGCCATTCAGCTTGGCTCATCAACCTCATCAGTAGTCAC CGAGCCTTTGCTTGCTCCCAAGGTCCATTCTGATTGTGAGAATTTTGCCGAGTCTCGCCT TGTCATCAAAATACCAAAACAATTCAACTCCGAGCATAAGAAGAAAAAGAAGATCAAACT GTCAGTTCCTCAACCTCCTCCGGCTCAAACTAATGAGGCACAAGCAATTAGGAAATGCTT 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