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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI009242 | Chr7 | 23871148 | 23880818;23881812 | + | MADS-box transcription factor 6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI009242.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 89.6 | 7.10E-26 |
| LITCHI009242.m1 | 88 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 76.4 | 1.60E-21 |
| LITCHI009242.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 89.6 | 7.10E-26 |
| LITCHI009242.m2 | 88 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 76.4 | 1.60E-21 |
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>LITCHI009242.m1 ATGGGGAGAGGCAAAGTGGTCTTGGAGAGGATCGAGAACAAAATCAATAGACAAGTGACC TTCTCTAAGAGAAGAAATGGACTGCTCAAAAAAGCCTACGAGCTCTCTCTGTTATGCGAC GCTGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCGAGCCATGGAAAGCTCTCCGAGTTTGGTAGCACC GATGTGGCCAAAAGCCTTGAACGGTACCGGCAATGTTGCTACACCTCAGAAGGCAGCAAT ATGATTGAGAATGAACCAGCTGAGGTAGTATACCCTGAAGTCTTGGGATTAAGGGCAAAA TATGAGTCTCTCCTGCGCTTACAAAGGAATTTTATTGGAGAAGATCTTGGACCTCTTAAT GCAAAAGAGCTTCAGAAGATTGAAAAACAGCTTGAAAGAACTCTCTCACAAGCTAGACAG CGAAAGACGGAATTGATGCTTCGGGAATTGGAAAAACTCCGGAAAAAGGCACACGATCTT GGCGAAGAAAATATACAGCTGAAGTCTAAGCTGGAGGAAGTAAAACATCTTCAAGCAGCT GCTCAAGAATCAGGAGGTCCTAGCGTTGTAGCTGTGAGTCACAACCTCTTGAGGGTGCAC CCTTCACAATCTATTCACAATGTACAAATGGGGTACCATCAATACGTTCCCCAAAATAGA ATAAACGAAGCCAGAACATCTGTGATGGGCAGCATCGGTCAAGGATGGATTTAA >LITCHI009242.m2 ATGGGGAGAGGCAAAGTGGTCTTGGAGAGGATCGAGAACAAAATCAATAGACAAGTGACC TTCTCTAAGAGAAGAAATGGACTGCTCAAAAAAGCCTACGAGCTCTCTCTGTTATGCGAC GCTGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCGAGCCATGGAAAGCTCTCCGAGTTTGGTAGCACC GATGTGGCCAAAAGCCTTGAACGGTACCGGCAATGTTGCTACACCTCAGAAGGCAGCAAT ATGATTGAGAATGAACCAGCTGAGGTAGTATACCCTGAAGTCTTGGGATTAAGGGCAAAA TATGAGTCTCTCCTGCGCTTACAAAGGAATTTTATTGGAGAAGATCTTGGACCTCTTAAT GCAAAAGAGCTTCAGAAGATTGAAAAACAGCTTGAAAGAACTCTCTCACAAGCTAGACAG CGAAAGACGGAATTGATGCTTCGGGAATTGGAAAAACTCCGGAAAAAGGCACACGATCTT GGCGAAGAAAATATACAGCTGAAGTCTAAGCTGGAGGAAGTAAAACATCTTCAAGCAGCT GCTCAAGAATCAGGAGGTCCTAGCGTTGTAGCTGTGAGTCACAACCTCTTGAGGGTGCAC CCTTCACAATCTATTCACAATGTACAAATGGGGTACCATCAATACGTTCCCCAAAATAGA ATAAACGAAGCCAGAACATCTGTGATGGGCAGCATCGGTCAAGGATGGATTTAA
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>LITCHI005853.m1 MRKSTLGIKRLHASKNNEKYGVVPQWLIVMYNTMFFRTCIVHPNTKKNELDRFCIDCLCS LCSHCLHAHIRHKHVKIRRYVYSDVINRHDLCKLFNCSGIQTYHTNKTKVLFLKQRNHHH QQQQHINSKDYSCIICDRNLQDNSLYCSIACKVVAIFGDRHKEEINSSHNEVLLRIKNND EEEDEAEGYLTPPSPKERNPKRSRKGVPLRAPIL. >LITCHI005853.m2 MRKSTLGIKRLHASKNNVYFSSFLFFVSGLYYAGSLIYKIFHILFTYLIMRRKWFNLQEK YGVVPQWLIVMYNTMFFRTCIVHPNTKKNELDRFCIDCLCSLCSHCLHAHIRHKHVKIRR YVYSDVINRHDLCKLFNCSGIQTYHTNKTKVLFLKQRNHHHQQQQHINSKDYSCIICDRN LQDNSLYCSIACKVVAIFGDRHKEEINSSHNEVLLRIKNNDEEEDEAEGYLTPPSPKERN PKRSRKGVPLRAPIL.
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>LITCHI005853.m2 TACATTAATATGCTCATACTGATCATGAGTGACGATAGAGACGTTCAACGTGAGAGTTTT TCCAGAGCAAAACTATGAGAAAAAGTACTTTAGGCATCAAACGACTCCATGCATCCAAAA ATAATGTATACTTTTCTTCATTTCTCTTCTTTGTTTCTGGCTTATATTATGCCGGCAGTC TCATTTACAAAATCTTTCATATACTATTTACCTATCTCATTATGAGAAGAAAATGGTTTA ATTTGCAGGAGAAATATGGAGTTGTTCCGCAATGGCTGATTGTCATGTACAACACCATGT TCTTTCGAACTTGCATCGTTCATCCGAATACAAAGAAGAACGAGTTGGACCGTTTTTGTA TTGATTGTCTTTGTTCTCTGTGCTCTCACTGCCTTCATGCTCATATTCGACATAAGCATG TTAAGATTCGAAGATATGTCTACAGTGATGTCATCAATCGCCATGATTTGTGCAAGCTCT TCAATTGTTCTGGTATACAGACTTATCATACAAATAAAACCAAGGTGTTATTCTTGAAGC AAAGGAATCATCACCATCAACAACAACAACATATCAATTCAAAGGATTATAGTTGCATAA TCTGTGACAGGAATTTGCAAGATAATTCACTGTATTGCAGCATTGCATGCAAGGTGGTAG CCATATTTGGAGATAGACACAAAGAAGAAATCAATAGCAGTCATAATGAAGTTCTACTCA GGATTAAAAATAATGATGAAGAAGAAGATGAAGCCGAAGGGTACCTAACACCACCATCTC CAAAGGAGCGAAATCCAAAGCGATCTAGAAAAGGTGTTCCATTAAGGGCTCCAATTCTCT GATTTGCATGAAAAGTGTTTGTACTGTCGCTACATATACGTAACTGTATAAGACTATGCA TAGTCATTTTTAACTGTCGCTTTCGTTGTGCATTTAGTAGGAAAACACATTGGCCACAGT CACCTGCACAGCTTCTCACAACACATCGCACGTTCAAGTGTCATCCACTAAAAGTTGGTA ATTTATGTATAACCCTACTATTAGAGAGCAAATTACTCAATGAGCCCCTAGTTAGAAAGC TAATTTTTCTCATTCAGTGTAGGGTCTCTCTCTCTCTCAGCTATTATAAGGAGTAGAGTT TAAAATATTACTTTCTGAGCTATTCCATAAGAGTTGGTGCCTAGAGAATTTGATTATAAG TATAACTTGTATTTATAATAATTATTATTATTAAAAAAAAAAA >LITCHI005853.m1 TACATTAATATGCTCATACTGATCATGAGTGACGATAGAGACGTTCAACGTGAGAGTTTT TCCAGAGCAAAACTATGAGAAAAAGTACTTTAGGCATCAAACGACTCCATGCATCCAAAA ATAATGAGAAATATGGAGTTGTTCCGCAATGGCTGATTGTCATGTACAACACCATGTTCT TTCGAACTTGCATCGTTCATCCGAATACAAAGAAGAACGAGTTGGACCGTTTTTGTATTG ATTGTCTTTGTTCTCTGTGCTCTCACTGCCTTCATGCTCATATTCGACATAAGCATGTTA AGATTCGAAGATATGTCTACAGTGATGTCATCAATCGCCATGATTTGTGCAAGCTCTTCA ATTGTTCTGGTATACAGACTTATCATACAAATAAAACCAAGGTGTTATTCTTGAAGCAAA GGAATCATCACCATCAACAACAACAACATATCAATTCAAAGGATTATAGTTGCATAATCT GTGACAGGAATTTGCAAGATAATTCACTGTATTGCAGCATTGCATGCAAGGTGGTAGCCA TATTTGGAGATAGACACAAAGAAGAAATCAATAGCAGTCATAATGAAGTTCTACTCAGGA TTAAAAATAATGATGAAGAAGAAGATGAAGCCGAAGGGTACCTAACACCACCATCTCCAA AGGAGCGAAATCCAAAGCGATCTAGAAAAGGTGTTCCATTAAGGGCTCCAATTCTCTGAT TTGCATGAAAAGTGTTTGTACTGTCGCTACATATACGTAACTGTATAAGACTATGCATAG TCATTTTTAACTGTCGCTTTCGTTGTGCATTTAGTAGGAAAACACATTGGCCACAGTCAC CTGCACAGCTTCTCACAACACATCGCACGTTCAAGTGTCATCCACTAAAAGTTGGTAATT TATGTATAACCCTACTATTAGAGAGCAAATTACTCAATGAGCCCCTAGTTAGAAAGCTAA TTTTTCTCATTCAGTGTAGGGTCTCTCTCTCTCTCAGCTATTATAAGGAGTAGAGTTTAA AATATTACTTTCTGAGCTATTCCATAAGAGTTGGTGCCTAGAGAATTTGATTATAAGTAT AACTTGTATTTATAATAATTATTATTATTAAAAAAAAAAA
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>LITCHI005853.m2 - Up_Stream_Len 2000 GAACCTTATGCATGTGTCCGTAGGAAGTGGAGTTTCCTTTTCTCCTAGGTTATCTAATTT TTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTCCCTTATAAATGACAGTAAATGAGTTAATGGGAACCT CTGAGGTCAAATAGCTCTATTTGTGCGGTACCAATTTTTTTCCTAAAAAAATGAGAATCA ACTACTTCCAAAATAAGAAAATAAAATTACTCATATAAATTTGGAAATGTGTTTAGTGAA AATTGAATCCCTAGCACTTTTTGTGAATGAAAGATTGTCTGACTACCTCTTCTAATAGGT GATGTGTTTAGATTATCTAATTGATTGCTTATACACTTTTCAAGTTTTCTGCAACCATAG ACTTGTTTTTCTTTTGTCGTCTATGCATGGATACTTATATTTTTAGGATCAAGGATTATC CTTCTTGTGTGAAGGCATTAGTTTTGAGTGATGTCGTAGATTAGTTGTAATCCTTTTGCT TCCGAAGGGGGTTCTTTCATATTTATATTATAATAATATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAA CCCACCCACTGATGTGAAATCCCAATGAAGAAGAAAGTCCACGTCTCGATTAATGATTGT TGTTATCATTCAAGGGAAGGAGATAAACACCATTCCTATCCACGTTTTTGCCCAACTCCT AATTAATGTTTATCTTGTAGAACTCTACATTAATTTAACAATATTTCTTAGGTAAACTCC TAAGCCAATGACTGCAAACGAATTTAAATTTATAGATTTATCAGCAAACTATTAAGAGTA TTTTATTTTATTTTACTTTCTAATTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTTTAAGAACCTTAA TTTGAATTGTAATCTAATAACCAATAACTATCTTAATTTGTAACTATACTAAACTCGTAC AGTAGCATGACCTCTCTCTCTCACACATACACACGTGTGTATATATATACACACACCAAA TCTAAACTTCTAGAGCTGTATATATTTTTAAATCAATTCGAATTAATTAATGCAATAAGA TCTTCTAATGAATGTTACAGCGACTACTACACTTGCCTTTTAGCTGTGCGATAAAGTCCT GGAAACCTATTTATAAAGTTGATGCAGTACCCTTCTAAATTCAATCAAGTCCCTACAAAT TAATAACTGGCTGAAAATGGTAAGAGCTATACGACTTTATTTGGACATGTAGATCAATTA ATTATAAGAACCTGCTGCCGTGGCATTGTTGAATAATTGCATTAGTGAGGGTAGGTGAGG TAGGTGTGAAATTCACACCGTGCAGGTTGTTATGTAAGTATGTAACCCAACGAAGGAAGG GAAAGAACAATTAAGTGGGAATAGTGATCAAGCTTGAAGAGTGCTCTTTCTGATAGGATC TTTAAAATCAATTTGGTGTAGAGAGTAAATAGCAGCAGGTATTTCCCATTAATGTTTAAG GCTGCAAATGAATGAAGAGAATGAGTGCTACAGTTTAATTATGGCCGTTATTCACACATA ACCAAATCATATAACAATGACGATGTGTAGAAAATTATATTGATACGTACTCAAGTCATA TATCTTGGCCTTCTTAAACCCAATTAAAATCAAAATAATAAATCAAGAGCACTTTGCCTT GGAGTTGAATTTCTATCCTTGGATAAGGAGATCAAATTATTTTAAGAAGAAAATTTTGAG TTGAGAACTTTAATCAAATAAAAAGTAACCAAATAATCAAAGAATTAGTTTAAATCCTCT GATGTTTACTTATATGACATGATAATCAAGAACAATTTATTTCCTGATTTGTTTATTATT AAACTTCGACTGCTAAATAATCTAATTTTTATAATACACTCAAATCAAACTTACGAGAAC TTGAACCTAATACCTCATGTATATTTTGGTGCATACAGTGAACTTGACCAAGTAAAGCCC TACAGCTACATTAATATGCTCATACTGATCATGAGTGACGATAGAGACGTTCAACGTGAG AGTTTTTCCAGAGCAAAACT >LITCHI005853.m1 - Up_Stream_Len 2000 GAACCTTATGCATGTGTCCGTAGGAAGTGGAGTTTCCTTTTCTCCTAGGTTATCTAATTT TTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTCCCTTATAAATGACAGTAAATGAGTTAATGGGAACCT CTGAGGTCAAATAGCTCTATTTGTGCGGTACCAATTTTTTTCCTAAAAAAATGAGAATCA ACTACTTCCAAAATAAGAAAATAAAATTACTCATATAAATTTGGAAATGTGTTTAGTGAA AATTGAATCCCTAGCACTTTTTGTGAATGAAAGATTGTCTGACTACCTCTTCTAATAGGT GATGTGTTTAGATTATCTAATTGATTGCTTATACACTTTTCAAGTTTTCTGCAACCATAG ACTTGTTTTTCTTTTGTCGTCTATGCATGGATACTTATATTTTTAGGATCAAGGATTATC CTTCTTGTGTGAAGGCATTAGTTTTGAGTGATGTCGTAGATTAGTTGTAATCCTTTTGCT TCCGAAGGGGGTTCTTTCATATTTATATTATAATAATATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAA CCCACCCACTGATGTGAAATCCCAATGAAGAAGAAAGTCCACGTCTCGATTAATGATTGT TGTTATCATTCAAGGGAAGGAGATAAACACCATTCCTATCCACGTTTTTGCCCAACTCCT AATTAATGTTTATCTTGTAGAACTCTACATTAATTTAACAATATTTCTTAGGTAAACTCC TAAGCCAATGACTGCAAACGAATTTAAATTTATAGATTTATCAGCAAACTATTAAGAGTA TTTTATTTTATTTTACTTTCTAATTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTTTAAGAACCTTAA TTTGAATTGTAATCTAATAACCAATAACTATCTTAATTTGTAACTATACTAAACTCGTAC AGTAGCATGACCTCTCTCTCTCACACATACACACGTGTGTATATATATACACACACCAAA TCTAAACTTCTAGAGCTGTATATATTTTTAAATCAATTCGAATTAATTAATGCAATAAGA TCTTCTAATGAATGTTACAGCGACTACTACACTTGCCTTTTAGCTGTGCGATAAAGTCCT GGAAACCTATTTATAAAGTTGATGCAGTACCCTTCTAAATTCAATCAAGTCCCTACAAAT TAATAACTGGCTGAAAATGGTAAGAGCTATACGACTTTATTTGGACATGTAGATCAATTA ATTATAAGAACCTGCTGCCGTGGCATTGTTGAATAATTGCATTAGTGAGGGTAGGTGAGG TAGGTGTGAAATTCACACCGTGCAGGTTGTTATGTAAGTATGTAACCCAACGAAGGAAGG GAAAGAACAATTAAGTGGGAATAGTGATCAAGCTTGAAGAGTGCTCTTTCTGATAGGATC TTTAAAATCAATTTGGTGTAGAGAGTAAATAGCAGCAGGTATTTCCCATTAATGTTTAAG GCTGCAAATGAATGAAGAGAATGAGTGCTACAGTTTAATTATGGCCGTTATTCACACATA ACCAAATCATATAACAATGACGATGTGTAGAAAATTATATTGATACGTACTCAAGTCATA TATCTTGGCCTTCTTAAACCCAATTAAAATCAAAATAATAAATCAAGAGCACTTTGCCTT GGAGTTGAATTTCTATCCTTGGATAAGGAGATCAAATTATTTTAAGAAGAAAATTTTGAG TTGAGAACTTTAATCAAATAAAAAGTAACCAAATAATCAAAGAATTAGTTTAAATCCTCT GATGTTTACTTATATGACATGATAATCAAGAACAATTTATTTCCTGATTTGTTTATTATT AAACTTCGACTGCTAAATAATCTAATTTTTATAATACACTCAAATCAAACTTACGAGAAC TTGAACCTAATACCTCATGTATATTTTGGTGCATACAGTGAACTTGACCAAGTAAAGCCC TACAGCTACATTAATATGCTCATACTGATCATGAGTGACGATAGAGACGTTCAACGTGAG AGTTTTTCCAGAGCAAAACT
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>LITCHI006321.m1 GenomeSequence + CTCTTGAGACAGCTTTATAAAACCTCAAATACCAAAAATACCCTCAAAATGATGAAACAG ATAAAAGCAGACAGCAGTTGGCTTACACGCATCAATCATCAACCCAATAAAATCAAGAAA TCGATCACTGGCCACTCCCCACCTAATATGCAATCATTTCTCTTTCTCTCTCTCCCTCTT TTTCATTATTATTATTATTTTTCTTACGAGTATGGGCAAAACCGTAACTGCGGACACAAA CTTTAAAAAGCGCAAACACGAAAGCAAAAAAGAGAAAAAAGTGGTAAGAGGAGACGCTTC AAAACCACAGAGCTCGCAAAAAAGCAGGAGAGTCGACGACGCCTAAAACGACGACGCTTC GATCATCTCTCCCCTTCTTCTCCTCCTCGTCCTCCAATTTTTTTTTTTTTATATATATAA AATTTATATTTATATATATAATAAAAATAAAATAAAAGCGAGATTGGATTTCGAAATCTC GTCGATCGGAGTCGGAAGTTAGAATCGGAACGGTCGTGATCGATCATGTCCTGTTCGTCA TCGTCGGCCTCGGAGGAAGAGGACGAGGGAATCGACTCCTACAGGAAAGGAGGCTATCAC GCCGTCAGAATCGGCGATCAGTTCGCCGGCGGCCGCTACATCGCCCAAGGCAAGCTCGGT TGGGGCCAGTTCTCCACCGTCTGGCTCGCTTACGACACTCAAACCTCTGTACGTCTCCTC CTCCAATATTTGTTTAAATATGGTGATAGATTCGATATATTTATCATCTGATGTTGTTGA TTAAATGTCGCCTCTTTATTCGTTACCTGAATCTTTGTCTTTAAAGATCTTTTAATTTTT TTGTTGGAGGATAACGAGATCAATGAAGACCTAATATATTAAATGAATGGTTCGACTGTC 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