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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI009242Chr72387114823880818;23881812+MADS-box transcription factor 6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI009242.m11057PF00319.21SRF-TFDomain89.67.10E-26
LITCHI009242.m188171PF01486.20K-boxFamily76.41.60E-21
LITCHI009242.m21057PF00319.21SRF-TFDomain89.67.10E-26
LITCHI009242.m288171PF01486.20K-boxFamily76.41.60E-21
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>LITCHI009242.m1
ATGGGGAGAGGCAAAGTGGTCTTGGAGAGGATCGAGAACAAAATCAATAGACAAGTGACC
TTCTCTAAGAGAAGAAATGGACTGCTCAAAAAAGCCTACGAGCTCTCTCTGTTATGCGAC
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ATAAACGAAGCCAGAACATCTGTGATGGGCAGCATCGGTCAAGGATGGATTTAA
>LITCHI009242.m2
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>LITCHI009242.m2
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ATGTTATTCAATACTCTTCAATCATATTGCATATGTTTACAAGAATAAAAGAGAATTTGT
GTATCGAAAGAGGAAAAATTACAATTTTATCAAGTCAAAATCCTAATCAATCAAGCATTC
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TTTGAATATTATTCTTAATTTTGTTTCTTAATGTTTAATAATTCTTAGTTTCATTGATTG
AT
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TGTTGCGTCCCTTAAAACTATGTCAAACTAAATCATTTAATCTAGAGTTATAATGTAGCC
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GACCTTAGTTTACCACTACAGTGAATTTGTTACTTGTGGGTCGAGGTTCGTCATTTGTAA
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GTATTTACCGTATTTATAGCACGAGAAATAAAAGAGTGTGAAGTGGGGACACGATCAGTA
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CTCCAAAACCCATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTGTCAGGTGTCACCAGCTCCCAT
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ATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTACTAATTAATGAGCTTGGTCGAT
GGACAGGTTTTCTTCTTCATTTCACTTACCAAACTTTTAGTTTTTTCCTTCTTTTTGCCA
TCTAGGGTTTGTTTCAGTTTCCTTTTTTTTTCCCTCTATTATTTTGCCTTTTGTTGTTAA
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TCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTAGACTCCTTTTTAATCAATTT
GATTGACTAATTTGTGCTAACATGTGCCAGATGTTACTTTTATATATACTTTCTCTACGA
TGATTTACATGCATCAAACCTCTTTAGAACTCTACATTGAATATATGTGTTACCCACTAT
ATATAGCTAGCTGTTTGGGAATATAATATGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTTTGAAGGGTG
GGCTCGATTTTGTGGGTAAA
>LITCHI001249.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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AAATAGTAGAAACGGAGCATTAAGAGGCAGTAGTAGTGTCTTTTCAACACTAACAATGCT
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TGTTGCGTCCCTTAAAACTATGTCAAACTAAATCATTTAATCTAGAGTTATAATGTAGCC
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GTATTTACCGTATTTATAGCACGAGAAATAAAAGAGTGTGAAGTGGGGACACGATCAGTA
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TTATTTGGCTATAGACAGAATGTTCTTCTTCTCTCTCTTTCCAGAACTAGGTTTTTCTCT
CTCCAAAACCCATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTGTCAGGTGTCACCAGCTCCCAT
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ATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTACTAATTAATGAGCTTGGTCGAT
GGACAGGTTTTCTTCTTCATTTCACTTACCAAACTTTTAGTTTTTTCCTTCTTTTTGCCA
TCTAGGGTTTGTTTCAGTTTCCTTTTTTTTTCCCTCTATTATTTTGCCTTTTGTTGTTAA
TAATGAGCTTCTTTTTTTGGAAAACCATTTTTTATTTTAATCTTAGTTGCATGCCAGATT
TCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTAGACTCCTTTTTAATCAATTT
GATTGACTAATTTGTGCTAACATGTGCCAGATGTTACTTTTATATATACTTTCTCTACGA
TGATTTACATGCATCAAACCTCTTTAGAACTCTACATTGAATATATGTGTTACCCACTAT
ATATAGCTAGCTGTTTGGGAATATAATATGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTTTGAAGGGTG
GGCTCGATTTTGTGGGTAAA
>LITCHI001249.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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CAAGTCAGACTAGTGTTTAATCCAATTTGAAGCTTGAAAAATACTCAAGACATCAGCAGT
GACTTTTCCTTTATTTTTTTATTTATTTTTAATGTTATTTTTGATGAATTTGAATATTTT
TGTTGCGTCCCTTAAAACTATGTCAAACTAAATCATTTAATCTAGAGTTATAATGTAGCC
AATTTATTTATCAGTCTGTTTGATAATTTATCGTGTGTAAATTTTATTTATTTTTATATT
TGTATTATATTCTATTAGATCTTCATGCTATCAATTAAACAAGACCCTTTAATTGGTAGA
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AATTTGTATGAGATAGAAATGTACTTGTAGGAGTTGTGTAATCATATGTGGATAATTGAG
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ATTTGTCAATTGATCGTTCGAAAGAGGCTAGTAAATAATTTAGAATTACTTGATAAAATA
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TCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTAGACTCCTTTTTAATCAATTT
GATTGACTAATTTGTGCTAACATGTGCCAGATGTTACTTTTATATATACTTTCTCTACGA
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>LITCHI001249.m3 GenomeSequence + 
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ATTTCACTTACCAAACTTTTAGTTTTTTCCTTCTTTTTGCCATCTAGGGTTTGTTTCAGT
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GGAAAACCATTTTTTATTTTAATCTTAGTTGCATGCCAGATTTCTCAGCATTTTCATATA
CAGAAATATTCTCCCACTTGTAGACTCCTTTTTAATCAATTTGATTGACTAATTTGTGCT
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CCTCTTTAGAACTCTACATTGAATATATGTGTTACCCACTATATATAGCTAGCTGTTTGG
GAATATAATATGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTTTGAAGGGTGGGCTCGATTTTGTGGGTA
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CATTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTG
ATGCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCT
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CTCCTTCATTTTTCTTTCTGTTATTATGTACTTGGTTCGGTCATTTCATTTATTGTTTAA
TTCATTTTCTGCAACTTGCGATGGTACTATGTTTTGTGTGTTCGAGTGTGACTGTCAGAG
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AAGGATTTGATGTAATTTGGATCGATTCTCTAGGGACTCATCTCTAAATTAACTTATTTT
ATTCAAACAAAATAATTTATTTCTTGAGGAAAGAGTTTCCCGTTATTCTTGTAATTTTAA
ATTACAACAGTTACTGTCTTCATCCTTTAGACTGATTATAGTGAGATTGAGGGGTTTCAT
GTTTCTTGCTCTACAATTGGATTATAATTTTATGATTGATTTGGGTATTGCTACTACCTT
CTATATGGTTATTACCCTATTCAATAATGACTATGTGATGGAATGTTTGAATAATTGTAA
TGCAATTGAAACGATTACAGTCTATGATGGTTTGAATTAGTTGTAATAAAAAAAGTAAGC
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TATGAGAAGAATTTCAGGAAAGAAATCTCTAGTACACCTATTTTGGAGAAAGACATCTAA
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ATCTTAAAACATAATGTGTGGGTAGTTTTCTTTGAATTTAATGATAGTTTTCTCCCACCA
TAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGAGGAGGGCACGAAACATGTGTGTTAAAGAAAAGTACCCC
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ACGTTCATTTAACAAGTTATAAAGTTTCCTAATTCGAAAGCTATTTTAAGAACTCAATTT
AAGGTAATCAGTAATACACAATAATGTGTGGCGCATGTTGCTGTTGTGTTGTGCATAACA
TTGAAAGCACTTTTGACAAAAAAAACTATAGTAGAATTGGCATGGCTATTCAATTATATT
TGTAGACAGATTTAGAAAACAAAGAAGATACTAATTTATTGCCCTATAAATAAAGCTTAT
GATATATATATCCAAAGATTGCAATCTTCTTTTTGATATGATGCTTCCAACATACAATTA
ATGACACTTCTATGAAAGTATGTCCTCATAAAATATAGGACTTCCCAACAAGCTGCTAAT
GGTTTCTTTATATTCTAAATGCAAATTGTTCTGAGAAGATTTTTCTTAACAAATAGATTG
ATGTTGATGTATTGTTTAAACAGAAAGATATTTATGTAGGATGTATGATGTCAAATGGGT
TAAACACCGGAATTTTCTTGATAGCCAAATGATCGTTTATTATGATTTAAGTTTACACTT
TAGCTAAATATCTTTAGAAATTGCTTTTGTGTTATAACAAGGATAGACTTCTCAGCTTCT
TTGTGCGGTAATTATACATTTAATTAATAACTGAATTTTACAATAATCAAACTTAAGATC
ATGAGGTACAACATGATACCATATCAGTAACCATTAAATCTAATAAACTTAACTTAGTTG
GTAAAGGTCCAACAGATACTATTTAAACTCTAACAAAGACTTTTCATAAGTTATAATTGA
CTCTTGTTTGTTTAGGATTATAGATTACAATTATGTTAGATATCTCACGTTTTGTATTCC
TTTATTTCAACTCATGAAGGATTAATAGATGAAGGAATACATCTCTCAGGCGAAACAAGT
AATCATTTATGAATATCCATTTATTAATTGACATATTATGAGTTGAGATCTTTGTTGGAG
TACGATGTGGAATTGCTCTATAATTTATATTTACTTTGCCAACTCAAAATTTTCTCATCG
TCAAAGGTTTTGACATTTATAATTTAAAGACTTGGTTTTTGGTATTAATTTAAAAGTATA
AAACTCTATGTTCATTCATCACATCAATTTCAACAAACTTTGTTGATGAGAAACCAGTAA
GTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATCAACAATTTGGATGTGAAAAAACTATAACTGGAAATT
ACATTAAAATACAAGAAAACTCTGATCTATGAAATCACTTAGATGCCAAGATAAACCTAC
TAAATAGTCTATTGAATTTGTTGATATATATGTTGTAGGTTCCCTAACAACTGTCCATCA
AATTAAGTGCTTTTCTACTTATGTGTAATTATCCTTTTAATTCCTTCTTTGTATAGTACA
TTAAAATACAAGAAAACTCTGATCTAGAATTACTTAGATGCCAAGATAAACCCACTAAAT
AGTCTATTGAATTGTTGATATATATGTTATAGGTAGCCTAACAACTCTCCATCATATTAA
CTGCTTTTCTACTTATGTGTGTAATTATCCTTTTTATTCATTCTTTATGTATTACTTGTC
AATTCACTCTGCTATAATTAAATATGTATTTCAGTTGCTTAAAAATAACTTGGTACACAA
GGTAGAGTTTGTGGCACTGTTTTTAAACCTGAAGATGTTTGAATTTGACTAAAGATTGAA
TGAATATGATTGTAAAAGTCACTTGATTTTTATTTTTTATTAATGAACTATTAATTTCAG
AGTTGGATAGGGGATGACTCGAACCTAATATCTCATTGGATTTGATATGAGGAATTATCA
CTAGGCCATCTCAAAATATTAAGTTAATTGTTTTATGTACATAAAACCAAAAAAAAAAAA
AAAAAAATTTAAAAGTTAATATTTGGCACATATTTATTATTAAAAACTTAAATTAATATA
AAATTTTACAAATTTATGAATTTAAAACCAAGGGAGGAGGCTTCGGTAGAGCAAGTGTAT
CTATAAATATTGTTAAACTTTTGCTTTCCATGAATTACTAAATTTGGTAGTTAAGGGAGA
TGGAGATATCTTGAACCTATAACTTCGTGTATATATGAGTGTAAGGCGCTTAACAATAAA
TCAACCTTAGCTCTGTAAGAAATTGTTTAAGGCTTGTGTTATCGGTACACTCCTTTGATA
GTTTCACTGAGTAATAATGGTGGGTGCTAATAACGGTAGCCAAACCTTGAACTTTGAACT
GTTAACTTACAAGTCGGTATGCTAGTATTTGCATATATCTTTGAACACATTTACATGTAA
ATACGAGTCAGAAGTTTTAATTATTTTTAGATCTAAATAAGAAAATGTAAGCTTGGGGAA
ACAAATAAACTCAATTTGTTTTTATATAACCATTCAGACCCAATTTTTTTTTTCTTTCTG
CAGAAAGCAATCAGCCTTTGAGATTGATAATGAAAATAACGAGGAACATGCAATACGTGT
AGAAGATAATGAAAATAAAGAGGAACATGCTATATGTGTAGAAACTATCCTAGAAAGTTG
TCAACATATAACATATTAAAACTTTGTATTTCATTTTTGGAATGATAGTGATTTATACTA
GATCCAATCATATATTAAAATGATAAAATGAAATTTAATTTGATAGTTCCTTTTATCTAT
TGATAAAAGTTGCTATATAGAGTAAATTGTCTTTTGATTGAACGGTTGTTTACCTTTTCT
TTTGTATTAGTGATAGAGGTTTGAGTCGGACCTCATTAATGGAAATACAAGTTTGGAGAC
ACCCAAGTTTCATAAAAAAGTAAGTCATATATATAAAGGAAGAAAGAGTAGCCATATAGG
AAGAATACCTAACCTCTTTTGTTTAAAGATACTTTAACCCAAACGGAGTTAACAGTGAAG
AGAAGTATGGGCATCCTTAAATTAATAGGGTTTTAGACTTTCGTAGAAAATCATTTGTAT
TTTAGAAATTTTTTATTACATGTTTGGCACACTTAACAATATTAAATTGGATAGGATTGA
ATTATAATGGAAACATTGAACTAAATTTAGTACATATGATGTTTGGTTGTATTAGGTATT
GTACAAGGGTTTCCATTAGGTATGACATTTATGATAAAATGTCTCTCATCAGTCTGTTAG
GTCTTTGTACAATAAAATGTCTCTCATCAACCTCTCATTATTTAGCTGGAGTGAAACTTC
TCTCGAATAAAATAAAAACTCTTTCTCCTCCACATCATAATACTCTTATAGTACACTCAC
TATTAGTTTGCAAAGTATATATAAAACTAAAATGTAAATCTAGCCTATTAGGTCTTAGTG
AGACTAAGATTCAATCTTGTTGGCTTGTAGCAGTCAGTTTATTCAATTTTTGACTTCGGT
GGATGACATAGGGGACCTCTTGCATGGAGTATGTGACTGGCCAGCACATGATGCCATGGC
ACAGGCCCATGCCCACCTGTCACTTAGTTCTCAACTTGAGGAAATAACAATTATATATAG
CGTATGTCCTGGTGGTAAGCGTTAGATTCTGTGTCATAGAAGGAGCAATTGAGTGTTATA
AGAAAGTTAATGTTTTAGGGGTGGTGGTGGTTTGGCTTATTGGGGCTAGCAATTCACCTT
TGATGAGATGTAGATCTTCTACTTATATTGTTTGTGTGTCGTAAAAACCATGAAAACCTG
GATTAGATTCAAGGAATTTAATGAAATTTGGTGATTGCATAAGTACTAAATACATTATCT
TATAAGTCTTAGAATTATTAAAATGTTTTAAAAATAATTTATATCATTTAACATCATTAC
ATTATTATTTATCTGAAATATACAAAAAAGTACAAATCTAGTTTCCTACTTAGTTTTTTA
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