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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009232 | Chr7 | 23681863 | 23683285 | + | Transcription factor bHLH118 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009232.m1 | 55 | 106 | PF00010.29 | HLH | Domain | 25.5 | 1.10E-05 |
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>LITCHI009232.m1 ATGTTTCCTCCTCCACCAATTGATGACTTCTTCACCCACTTTCATCCCCACCAAGAAGAT TTTATTCAACGGGATCTGATCCTGGATCAAGCTTCGATGGAGGGGAGTAACCAATCCAAC AAAAATAATAGTGAAGGAAAGGGCAATAATGAGTGTGAGAAGAAGATCTTGCGTAAGGAA ATCGAACGGCAGAGAAGACAACAGATGTCCAAGCTAAATGCCTCACTACGAGAACTCCTC CCTGTTGAGTCCATCAAGGGAAAACGTTCTGTTAGTGATTGCATAGATGAGGCTGAGAAA TACATAACACATTTGAAGAAGAACATCGAAGACTTGAGTGTCAAGAGAGACAAACTTAAG TATTTGCCCAATTCGGAGGTTCTTGACCATGGAAACACCAGTTCGGAGAACTGTTTAGAG AACTGTGTGTCGGTCCGCCCTTATTGTGGTGGAATGGAGATCGTGATTAGTGGTGGCCTT CAAAAGGAAAGCTTGCTCCTATCAAGAGTGCTTGAAATAGTGGTCGAAGAGGGGCTTGAT GTTGTTCGATGTGTTTCCCACCAAACAGATGAAGGGCGTTTTCACACAATTCAGTCTGAG GTTGCGGATCCGACATTTGTTGATCTACATGGGCTGCAACAAAAAATCAACCATGTGATA CAATTCTGA
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>LITCHI009232.m1 CTGATTATTACTGGCACTTTATTGCAAGAAAAGCATAGCTAATGAGTCAATTTTCTCTGT TCTTCGTCATGCCCATAATATATTTTATAAACACAGTACTTCAAAGCAATGATTCAAGAA ACATGCCGACAAGGAGATCCACCAAATGTGAGCGTATGTGAACAGCAATTTCAGCCGAAG AAGATAAAGCAAAGAGAGTCCCACCACTCGCCTTTATTTCTCATCCCCGGACAGAAAAGA TTGTAGAGATCTTCACACATCTTAGGACAATTAAAACAATTTACAAGCTCCAAACCGACG TACGTATCTATCTGTTTAAACTCATAATATCACTACAAAGATATATAGCGCTTGAAGCCC TTGAATAGTCTTCGTTCAATGTTTCCTCCTCCACCAATTGATGACTTCTTCACCCACTTT CATCCCCACCAAGAAGATTTTATTCAACGGGATCTGATCCTGGATCAAGCTTCGATGGAG GGGAGTAACCAATCCAACAAAAATAATAGTGAAGGAAAGGGCAATAATGAGTGTGAGAAG AAGATCTTGCGTAAGGAAATCGAACGGCAGAGAAGACAACAGATGTCCAAGCTAAATGCC TCACTACGAGAACTCCTCCCTGTTGAGTCCATCAAGGGAAAACGTTCTGTTAGTGATTGC ATAGATGAGGCTGAGAAATACATAACACATTTGAAGAAGAACATCGAAGACTTGAGTGTC AAGAGAGACAAACTTAAGTATTTGCCCAATTCGGAGGTTCTTGACCATGGAAACACCAGT TCGGAGAACTGTTTAGAGAACTGTGTGTCGGTCCGCCCTTATTGTGGTGGAATGGAGATC GTGATTAGTGGTGGCCTTCAAAAGGAAAGCTTGCTCCTATCAAGAGTGCTTGAAATAGTG GTCGAAGAGGGGCTTGATGTTGTTCGATGTGTTTCCCACCAAACAGATGAAGGGCGTTTT CACACAATTCAGTCTGAGGTTGCGGATCCGACATTTGTTGATCTACATGGGCTGCAACAA AAAATCAACCATGTGATACAATTCTGAGTGATATCTCATTTGAGTGCCTTTTAAATTTTA ATTTCTATTTGCTAATCATGAACTGAAATGTTTGATCTTAATTCTTATGTTG
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>LITCHI028965.m1 - Up_Stream_Len 2000 TATGGGCATACATTAATAACCAAAAACTTAAATAACAATTTATAATTATTATTAGACAAA AATTTCGAATGCATGTCAAAGCTTACATAGAGGAAAAGAGAAAATAGGAAAAGAAAGAAA CTTTTTGTGCAGAGAGGGAAGAAAATTAAAATGTAGGTTAAAAGTATTCTGGTCAAGTAT GGCTAAAGTTGATAAAAAAGGAAAAGCTATTGAGATTTGATAAATTTAAAATTTCAATCA AGTAGAGAGTTAAAGTTAAAATTTTCATAGTATTATTTTAACAAATCAATACACAATTTT TTTATTAAATAATAAACATAACTTCTTATTCAATTTAACATTTCTTATATACTGAGTTTA CAAATCTATACACAATTTTTTTTGTTCTTAACTGATGCTTTAACATTTTTTAAAATGCTC GGTTTGCAAATGTATTATTGATCAAGCGTGTAATAATATATCGTGTTTGAAACAGTGTTC ACTGTAGGAATACAGTAAAAAAGAAAAAGAGACCACAATAATAAGAAGAGAAAGGTGTAG AAACAGTTGGGGGGATGTCTTTGGTGTTTTGGAGTTTGCATTTGGTCAACTTGCGTTTTG GACTTTTTAAGTCTGCCATTAAGCTGGCGTTTTAATAGTCAAAGTTGAAAACTTTGCTTT TGTATGCCAATGCCAGTTAGCATATACATATATAGACATGCAAAAACATCTCCTGCGGCC GCACTCAAAAGAAGGTGACCCGGACCCCCTCTCTCCCTAAATTCCACCGCGCCATGAACT CATCTGGGCCCCCACGTCCTTTATTTTGGTCAACCCTCTGGAGCAAATCCTATGCACGTT TGCACTTCGCACACGTTACAACACAATACAATACAGCCCACTTTCATTTTCTCTTCATTT TCACCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGTAATCATCACCATAAGTCTTTGAC AATATTTTCAATATACGTGTATGTGCATATACTAGACATGTTAAATATAGTCACCTACTT TATCTTATCGCCATAGATTGTTTTGTTCTCTCTGATAATCTGGCCTCATGCTAATCTAAA GGAGAGGAAAGAGCTGAAATTTTGCAATTTCAAGACATTAAAAGCAAACCCACCTCCCCT TTTTTTTTTAGATATGGTACTTCCTTTTCGGGATGTCTAATTTCTGATTTGTGGATATTA ATTTATCGTGTTGATACAGCAAATGTTAAAAAAAAAGGTTTGAATAGAAAACCAGGACAG ATGCTAATTTGAACCAAGATTTTAATTTGAGACATACCTATTTTAAAATCCAAGGGCTTT GTGGATACAAAGCAAGATTCGTGTTTGGTTTGTTCACGAAAACAACAAGTTTAGACAGTG ATTATTTAAATTAAAAATCATAGAGACCTGTATATTTAGTGCTTGGTTATATTGTAATAA AACTGTAGGGTAGAAGAAAGAAACGAATGGACAGAAATCTGGATAATTATCCATCAAAAC CGTACAAGTCATTTTCAACATAAGTGCATTGAATTTTTTAGCAGAGAGAAAGGGCAAGAG CAAAAAAAAAAAAAACCAAAACCAAACCAAACCAAACAAGGCTTGGAAATTCACTCACAT TTTCGTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTGTACGCGGATACGGCACACAAACAATCACATTAAA GAAAACAAAAAAGGAAATTCATGTTCTCATTTTAACTTAAAAAGAAACCCTTTTTGTAGA CCAACGCTTGCCTGCCTCTCTTCCTTCTTCTACCTTTGAAGATTCAAGTCACAAACAAAA AACCAAGAAAACCCAGAAACAGTAAACGTTTTCTTCAAGTCCTTGTTTTTAAGTTTCGAT TTTTATTGTTTCTTGTTATATATTTTGTGTTGTATTGCAGAGAGAAATAAAAAATCTCTA GATCTAAAAAAAGACTATTAGCTATTGCAGATTGAAGGAATTGTGGGGGGGTGTATATAT AAAAAATTGTTGAATTTTGA
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>LITCHI002239.m2 GenomeSequence - ATATATAAGTGATTTGTTTGTGAAACAAAAACCATTCTTCCACCCACTTGAAGCTGCCGA ACTGCACCCCACCATAGCAGAAAACAAAATCAAAAAAAGAAGGAGAAACAAAGGAGAAGA GAAGGAAATAAAGGAAGCTAAGTTAAGGGTTTTGGTGTAAGATTTATTCCAAGTTAGTTT CCATCTTCATGATCTAGTTTTTACAAACTTTAAATGAGCTGATGTTGTTTTAGGTGAGCA AGGACACAAGGAGAAAGCAATCTCAAGTAGGAATCCATAAGCCTAGAAAGTGAATTAGTG AGTGGAATTTTTCTTTAACTTGTTTTATGAAAACAATTTTTATGTTGTTTTAAGTTTCCT TACTTCTTGAACTTTAAATATATTATGAACTTTATGCTTTGAGAAGTTGAAGTATATCTT AGAAATTTTAAGTATGTTTTAAGATTTGGATGGTGTTTTAATAATTGAGAAAATTAGATT GTGATGAATATGAAGATTGCATGAGAAAATTTAATTTTAGTGTGTTCTTGGACATTTTAA AGGATGTTGAAATCATAAACTTTAGAATTGTATTTCCAAAATTTTATGGCATAATTTTTA GCATATAAAATGTGGATTTTCTTGAAGCCATCAAATATATTTTTGTAACTTATGAAAATT AGATTATGGTTGAGATCTTTAAATGATTGGAGGGATTAAAAACCATACCATTTTGAATAT ATCATGAAACTAGTAAGCTTATTATTGTGGTTATTCCTATTAATGTTAATTAGTTTGTGA AATTTTATGTTATACGAATTCTAAAATGAATTTTATGAATGGATAAAGTCAATTACACTC TGTGTTTTATAAACTTGTTTTGGAATTATGAAAGTTGTATTATGTTTTATAAGCTGAAAT 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