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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009232 | Chr7 | 23681863 | 23683285 | + | Transcription factor bHLH118 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009232.m1 | 55 | 106 | PF00010.29 | HLH | Domain | 25.5 | 1.10E-05 |
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>LITCHI009232.m1 ATGTTTCCTCCTCCACCAATTGATGACTTCTTCACCCACTTTCATCCCCACCAAGAAGAT TTTATTCAACGGGATCTGATCCTGGATCAAGCTTCGATGGAGGGGAGTAACCAATCCAAC AAAAATAATAGTGAAGGAAAGGGCAATAATGAGTGTGAGAAGAAGATCTTGCGTAAGGAA ATCGAACGGCAGAGAAGACAACAGATGTCCAAGCTAAATGCCTCACTACGAGAACTCCTC CCTGTTGAGTCCATCAAGGGAAAACGTTCTGTTAGTGATTGCATAGATGAGGCTGAGAAA TACATAACACATTTGAAGAAGAACATCGAAGACTTGAGTGTCAAGAGAGACAAACTTAAG TATTTGCCCAATTCGGAGGTTCTTGACCATGGAAACACCAGTTCGGAGAACTGTTTAGAG AACTGTGTGTCGGTCCGCCCTTATTGTGGTGGAATGGAGATCGTGATTAGTGGTGGCCTT CAAAAGGAAAGCTTGCTCCTATCAAGAGTGCTTGAAATAGTGGTCGAAGAGGGGCTTGAT GTTGTTCGATGTGTTTCCCACCAAACAGATGAAGGGCGTTTTCACACAATTCAGTCTGAG GTTGCGGATCCGACATTTGTTGATCTACATGGGCTGCAACAAAAAATCAACCATGTGATA CAATTCTGA
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>LITCHI005122.m1 MEMNTNAVPEISPGRRRLCMAEGGSVETVCVKRRRRDPSAVSNNQQLGEQKQQLQADHQT TATTVKRSSKFRGVSRHRWTGRYEAHLWDKGSWNPTQRKKGKQVYLGAYDEEESAARAYD LAALKYWGTSASTNFPVSNYEKEIEIMKVVTKEEYLASLRRRSSGFSRGVSKYRGVARHH HNGRWEARIGRVFGNKYLYLGTYSTQEEAAHAYDIAAIEYRGINAVTNFDLSTYIRWLKP GANPPLLPSFQEPNSALVEPQPMTSFSNQFPRDQTTELPIFNSNPFMVEPLNTPRNEDLF QTKTPINACTRSSSPTALSLLLRSSIFKELVEKNLDNSNKEADQDNNNITNVNPPQVGNN NEVGGMFYDAVGVGPVKYMCPSNKMCCLI.
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>LITCHI005122.m1 AAGCAAGCAAAGCTGTTAACATCAAAGGAAAATCAGAATTGAAAAAACAAAAATGGAAAT GAATACAAATGCAGTTCCTGAAATAAGCCCGGGAAGGCGTCGCTTGTGCATGGCAGAAGG TGGCAGTGTGGAGACTGTGTGCGTTAAGAGAAGGAGGAGAGACCCCTCTGCAGTTTCCAA CAACCAGCAGCTAGGTGAACAGAAGCAGCAGTTACAGGCTGATCATCAAACTACGGCTAC TACCGTCAAAAGAAGTTCCAAGTTTCGTGGGGTTAGCAGACATCGATGGACCGGAAGATA TGAAGCTCATTTGTGGGATAAAGGGTCTTGGAATCCAACACAGAGAAAGAAGGGAAAACA AGTGTATCTTGGTGCTTATGATGAGGAAGAATCTGCAGCTAGAGCCTATGATTTGGCTGC TCTTAAGTATTGGGGCACATCGGCTTCCACAAATTTTCCGGTTTCTAATTATGAAAAAGA AATTGAGATAATGAAAGTTGTGACAAAAGAGGAATATTTAGCTTCTTTAAGAAGGAGAAG CAGTGGTTTCTCAAGGGGTGTCTCCAAGTATAGAGGAGTTGCAAGGCACCATCATAATGG GAGATGGGAGGCTAGAATTGGGAGGGTGTTTGGAAACAAATATCTCTACCTCGGCACTTA CAGTACTCAGGAGGAGGCAGCTCATGCTTATGATATCGCAGCAATTGAATACAGAGGAAT AAATGCAGTGACCAACTTTGACTTAAGTACATATATAAGATGGTTAAAACCAGGAGCCAA CCCTCCTCTTCTTCCATCATTTCAAGAACCAAATTCAGCTCTGGTGGAACCACAGCCCAT GACGAGCTTCTCCAACCAATTTCCAAGAGATCAAACAACCGAGCTGCCCATCTTCAATTC GAATCCTTTCATGGTAGAACCCTTAAACACCCCTAGAAATGAAGACCTGTTTCAAACAAA GACACCCATCAATGCCTGCACCAGGTCATCTTCACCAACTGCACTCAGCCTCCTCCTCAG GTCTTCCATATTTAAAGAGCTGGTGGAGAAGAATTTAGATAACAGTAACAAAGAAGCTGA TCAAGACAATAATAACATAACCAATGTGAATCCACCACAAGTGGGCAACAATAATGAAGT TGGAGGCATGTTCTACGATGCAGTCGGCGTTGGCCCTGTCAAATACATGTGCCCTTCCAA CAAGATGTGTTGTTTGATTTAGCCTTGAAGGAAATCACTTCCCCATGGTAAAATAAAAAA GCATAGTCCTTGTGCAATGGTACCTTAAGCCAACTGTTTCTACTTGAGACTTTACTGGTT AATTAATTGAAGCAAACATCTCAGTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTCTGATT TTGTTTTCCTTTTT
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>LITCHI005122.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTTATGCAAATTACCGTTGCCTTTAACCACTTTGGAAAGGGGTTGGTTCAGAGGATGCC CAGATGCAGACTTGGATTCATCCACGTAGTTAACAATGATTACACTCGCTGGCTCATGTA TGCTATAGGTGGTAGCGGTAACCCCACCATTATTAGCCAGGGAAATCGCTTTATTGCACC ACCAAATTTGAGTGCTAAAGAGGTGACCAAGAGAGAGTATTGCCCGGAATCTGAATGGAG AAAATGGACTTGGAGATCAGAGGGAGATTTGTTGCTTAATGGAGCCATCTTCGTCCAATC TGGAAACCCAAATTATGACCCTAAAGTCAAGGAAGGTCTGATCACAGCCCAGCCGGGACA TATGGTCAGTTCAATCACTCGCTATGCTGGTACTCTCAGATGCAAAAAGGGCTTTCCTTG TTAGATTTTTGTGCTGCTCTTTTTATAGACATCAACATTTTTTAATTTCTATAATTTTCA CACAATTATAGCGAGCAGTTGCTTTCTAATATTTGTTATTGTCATTTATTCTCATATAAA TTCTTTGCTGGTTTAATTCCTTAAATCATAGGCAAATTAATTAATTTTTTTACATAATTT AATTTGAATGGGATTGACTTAATTAATAATAACCAAATAAATTACTTTTTAAAGAATCCG TTTTACTTAAGTTGTTTATTAAATCCTTTAATTTCAATCAATTATATCAATTCATTATAA TATTATAGTCGAATTTAATCCTAAATACTATAACATATATTTTATAAAGATTGTTTTTAG ATCGATACTAGTAAAAATAATTATTCTTTCAATAAAATTATATATGTTATCTTAACCTCA TGTTTTATAGCAATATTGTGGACTAAATACAACATTAATTAGATATTATCAAATAAACAA TCTAAAAGAATATTATAAGTAAAAATTCCATAGAAAACATCGGTAGAGAGGTTGGTAGCT GAAGCAATTTCTCCCTGCTCTTCGCCTCCGCAGTAGTTATCCACAGTTAGTTGGAATCTG ACAGAAGAGTCAAAACTGACGACGAACAACTCTAAGCATAGATAATGGTACAAGACACAA AGGTTTTGTCTTGTTAATTATAGACCTGGGAATGGCAGGTTCCTTTTTATGTCTCTTATC CAAGAAAACAAAGTTGGGTTTGTCTCTGCTTGCAATTTCGTGTTTTGTCAGGTTGCATGG TTCCTCTTCCTCCAATTTTGTCTGTTTTGGTTTAGGGCCAAGGCTGTTTATGCCACCTGA GAAAATTGCATGTACGCTACTGTTAATTACTTCTTGGATCCGACAAAAATTACCAGACGC CGTTCCGTTTTATTATTTTTTATTATTTTTATATTCTAAACTATTAATATTGGGATGATT TTCGAAAAATATTGTTGATAACAATAACACTTCATAATCTAAATTAAAACTTTTATGGAT TTCAATAGATTATATCGTGACTTGATTAGTTCACTTAAACCCTTAATACAAGTAATTATG AGTTTCAAAAATTACATTTTGTATAATTAAAAACAAAAAAATAATGATACGGGAATTGAC GTGTAATGGATTAACTTCAATTAGTTAATTAACAAATTATATATATGTGTGTGTGTGCGT GTGTTTTATCAAGACAAGGGTACCCTTGAAAACACCGATGGATTGTTGTGCCATTTTAAC TCTTACGTGGAGGTGGATAATTAAACTTTATTGATGAACCACAAGTCTCTCACTTTGGTT ACTTATTTGGCTGCATAGTAGAGTGTAGAGTCACTTTGAATATTTTTGGTCTCCAATCGA TGTACCGTATTTATCGACGGCATTTGTCTCAACACTAATGAAGTCATTGTAGCGACAAAA AAGACAAATCCAACAACAAAACAAACTACATATGATACTTGTGTATATATATACAATCCT GTGTATGTCATTCAGTTACTACTCGTACAAGCAAGCAAAGCTGTTAACATCAAAGGAAAA TCAGAATTGAAAAAACAAAA
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>LITCHI031191.m5 GenomeSequence + CGGGACGAAAAGGTTTTCGTAAAAAACACCTCTAGAAACGTTTTCAGCAAACGTTTCTCA GCGAAACCTTTCCCATGAAACGCGTTTTTCGACGACAAAAGAGACTGATGAAGGAACTCA GCAGCTGAACAAAGCAGGGTTTTAGAACCAGAGAGACAGAGACAGAGAGAGTTAGGGTTT TAATGACCAACCATGTCCATGTCAATCTCCACCACCACCAAAACCCTCTCTATCCCCACA CACTTCACCACCTTCTCATCTCCAACACCCCATTTCCAGCTCTCTTTCCCTCCCAATTCC CTCCCTTCTTCTTCTCTCCTCCACAACCACCCCACCACCAACAAACCCTCCAAGCTCAGC CCCCTCTTCGCTTCCCACCACCCACCCGAAAGCCACCTGGACTATCCAACGCTGACCCGC CAAGCGCTCTCTGAGTTTCTCCTCCAACTGGGGCTGCTCAATGTGGAGGCTGCCTCCATT TCATCCAATTCGCCTAAATACGTGCAGATGCTAATGGACAGCGTGCTGGAGCTGGACGAG TTGGCTTCTTGGAAGACTAATGATAACGGGGAGGAGGGTTTTGTTGGGTTTAAGGAGAGA GTGATCAGATTGGCCAAGGAGAAAGGTGATAATGGCAAGGTTGCCTTTTTGGAGAGTCTT GGATTGAATCTCTCCTCTGCTTTCAGTGTTGCCAGATACTTGTCTGGGGAGCCACTTCCT GCTCTTATTGATAAAGTAAACATCAAAGATTTTATGCTTTTCGCTTAGTTTGAACAGAGT TATGGGATTGTTTGGCTTCAAAAGATTGAATGTGGGACATTTGTGATATGTAGTTGTACT ATGCTTTTTTATTTTTATTTTTTATGGTTTTTCACATAATTTGAATAGAGACATTGGATT 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GTTTGCTAACGTACTAAGTTAGAATTGCTGACTGTGTAAAGTTTTATTTTCTCTCTTTTC TTTTTTATTTATGTGATCTATTTTGCTGAGATTTAAGGAATTTTTCTTCAAATATTTTTC TTATTATTGATTCAATCTTTTATGTCAATTGTTGAGATCTTCGGTTGGTCAAATGTGAAA AGAGACAAAGGTGCTGGGATCGTAGCTAATTCAATGATGCTTTTGGCACATATATATCTG GATGGCCTATTTCCAATCTCTAATTGAAACTATTAAACTGCAATCTATACCCTTGAAATT GAGTGATTTGATTTTTACATTGTTGCTTGAGTTTCTTTCAAATGTTTTTACCGTCCTTTT CAGGTGGTTTCATTTTTGGAAGATCTAGGATTTGATGGTGAGAATGTGGGGAAGATACTT GCTCGCTGCCCAGAACTTTTTGCTGCTAGCATTGAGAAAACTCTGAAGAAAAAGGTTGAA TTTCTATACAGCATTGGAGTTTCTAAAGACCACATACCTCGAGTTATCAATAAATACCCA GAGCTTCTTGTTTCAGACGTTGACAGAACCTTTCTTCCTAGGTAACACTTTTCCTTTTTA GAAAAGACGCAAAATGTTTGATGAATTGAAGTCACATTATCTCTTAATAAAAAATTTTTC TAAATCTCATGATACCATGAATAGGATGAGTTATTTGATGGAGATAGGGTTATCAAAGAG GGATATCGTGTTCATGGTCCGAAGATTCTCTCCTCTGCTGGGGTACAGCATTGACGAGGT ATTACAACCGAAGGTGGACTTCCTGATAAACACAATGGACAAGTCACTAAAGGAGGTAGT GGATTATCCGAGGTATTTTAGCTATTCGTTGGAAAAGAAGATAAAACCCAGATTCTGGGT GCTGAAAGGAAGAAATGTTGAATGTAGCTTAAAAGACATGTTGGGTAAAAATGATGAGGA 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