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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009158 | Chr7 | 23049299 | 23052722 | + | Protein NSP-INTERACTING KINASE 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009158.m1 | 29 | 69 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 34.8 | 1.60E-08 |
LITCHI009158.m1 | 169 | 228 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28 | 1.50E-06 |
LITCHI009158.m1 | 413 | 675 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 99.7 | 1.90E-28 |
LITCHI009158.m1 | 416 | 677 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.1 | 8.20E-41 |
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>LITCHI009158.m1 ATGGCTTTGAATTTGAAGACGTTGAACCCATTTCTCTTCTCTATGCTTCTACTACAGCTA ACATGGGCGGTAGTATTTAGTGAAGACACGGAGCTAAGAGCTCTCTTGGACATGAAAGCA TCTCTAGACCCAGATGACAGGTACCTCTCTTCATGGACCATCAATGGTGATCCATGTGAT GGCTCCTTTGAAGGAATAGCCTGCAACGACAAGTCTCGAGTGGCCAACATTTCCCTCCAG GGAAAGGGCTTGAATGGCAAGCTCTCTCCTGCCATTTCAGGTCTCAAACACTTGACTGGC CTCTACTTGCATTACAACTCTTTGTATGGAGACATACCAAGAGAAGTAGCCAACTTGACT GAGCTTGCTGACTTGTACTTGAACGTCAACAATCTCTCTGGTGATATACCTCCTGAGATC GGTCACATGGGTAGCTTACAAGTGTTGCAGCTTTGCTATAACCAGTTAACAGGAAGCATA CCCACACAGTTAGGTTCTTTGGAAAAGCTTAGTGTTGTTGCTCTTCAATCTAATCAACTA ACTGGTGCAATCCCTGCAAGTTTGGGGGATTTGGGTTCACTAATGAGGCTAGATTTGAGT TTCAATCGTCTTTTTGGTTCGATCCCTCGAAAACTAGCTGATGCTCCTTTGCTTGAAGTC CTAGACATTCGAAACAACACTCTATCTGGCAATGTACCTCCTGCATTAAAGAGACTAAAT GAAGGGTTTTTGTATGAAAACAATCTTGAACTTTGTGGTGATGGGTTCTCCTCATTGCAA GCTTGCAAGGCTTCAAATAACATCAATCCTAGTAGACCTGAACCCTACGGAGCAGGCACC ACTTTATCTACTAGAAACATACCAGAGACAGCAAATTTGCCATTGCCTTGCAACCAAACT CGGTGCTTGAATTCGCCAAAATCCCACCATGCATCTGTCATTGTTGGTGTGCTTGTTGTT ACTATAGCAGTATCAGCTATAGGAATCCTTACCTTCACACAATATCGTCGAAGAAGACAG AAGCTTGAGAGCTCATTTTATGTCTCTGATAGCCGTCCTAGTGTTGATCAGGCCAAGGGG GTTTATAGGAAGAATGGCTCTCCTCTTATAAGTCTTGAGTATGCTAATGGATGGGACCCG TTGGCCGATGGAAGGAACCTTGGTGCATTTCCCCAAGAAGTCTTCCAGAGCTTTAGATTC AATCTTGAAGAGGTTGAGACGGCTACTCAATACTTCTCTGAGGTGAATTTGTTGGGTAAG AGTAACTTTTCAGCAACTTACAAAGGGATTTTAAGAGATGGATCTGTTGTTGCAATAAAG AGCATAAGTAAAACTAGTTGCAAGTCAGAAGAAGCTGAGTTCTTGAAGGGATTGAATATT TTGACCTCTTTAACACATGAGAATGTAGTCAGGTTGAGAGGATTTTGCTGCTCAAGAGGG CGGGGTGAGTGCTTTCTCGTTTATGATTACGTTCCCAATGGAAATTTGCTTCACTATCTT GATGTCATAGACGGTGATGGCCACATCCTTGAATGGTCCACCAGAGTTTCCATTGTCAAG GGCATTGCTAAAGGTATGGCGTATTTACACAAGTACAAAGTGAACAAACCAGCTCTGATA CATCAGAACATTTCGGCTGAGAAGGTTCTCATTGACCAGCGATACAACGCATTACTAGCG GATTCTGGCCTAAACAACCTTCTTACGAATGATGTTGTCTTCTCAGCATTGAAGGCCAGT GCTGCGATGGGTTACCTTGCACCTGAGTACTCTACCACTGGTCGGTTCACAGAGAAAAGT GACGTGTATGCATTTGGAGTGCTGGTTTTTCAAGTGCTCTCAGGGAAGCGGAAAGTAACT GGCCTGGTACGACTTGAAGCTGAGTCATGCAGAGTCCAAGACTTCATTGACACAAACCTT CATGGCAGATTTTTCGAATTTGAAGCTGCTAAACTTGCAAGAATTGCCTTGCTTTGCACT CATGAATCTCCTAGTGAGAGACCAACCATGGAAGAGATCGTTCAAGAGCTCAGTAACTGT AGTAGTTGTCTTCTTTAG
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>LITCHI009158.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAAAGAGTAAACAAAAATATCTATTGTTTAAATTTGAATATATGTATATATGTACATAAA ATCATGCGAAAAATGAAATATAAAATATATGAAGAATTTCTTTCGAAAGCATTAGAATTT CATAAATACGACATTATTGTAGTGTCAGAACCTGAGATGGCACCAAGAATGGGTCCCACA TAAAGAGGCCACAAAAATATGCACAAAATCCTAACTATCTGCCAAATCACAGACAGCCAA TTTTTCATTTTAACTTGAATCGATAGTCACTGACAACAATTACAGAGAACAACGGTACTT GATTAAAAATTCTTTAACATCTCTGTCTATTTTCAAATTTGGAGGGCGTGGATTAGGGCT TTATTAGATTTTATAATGAGGTTGTGTGCACATGATTCTGCTGTTTCGGGAATTTCACTC GTATTTTAGACATCTCGGTGTTGACGATGGCTACAACCACGCGCTTTGCTAACTGACCAA TCATTATTAACCACGTGGTTATCGCTGCTTCATTTGACGGATTTATTCTAACCGTTGGAT TGGTTGATTAGGAAAATAAAATCAGTCTCGCATAATTTGTTGATCATTGTTTTTAATTTT TCAATGCCACTTGTGTCTAATGACTCAAATTTATGATTTTTCTTTTTTTGAGAATTCAAA TTTATGATATTCGTGATCCTTATTTTGTATTGAACTGATTTATATCGACATTAAGGAAAA TATAAATATTAATATATGTTTTGAGGATATATGTTAAAGATTAAAAATATGATAAAAATT AAAATTATATTTATTTTTTAAAGAGTTGAAAGTTGTAAATTGATGTGTTTAAAAAATAAA TATATGTATAACTAAATTTTGGATTGTTAAGTTGTGTCTTTAAAATATATTATAATATGA TCCTAAATTGATTGTCTAAACTAAGATTGATTAAACAGGTTGTAACATATGTCTCAACAT CTCATGGCAAATGTCAAAAGTTTAAACTTAAACAAATGCTTCATATTTATTCACACATTT TTTTATATATACATTTAATGTCACACATTTTTTAAAAAATATATAAGCCACGCATTAATA ATCACTTATACGTATTGACGAACTTATAAAATCAGAATAAATTTGATGTATTTGAGATTG GTTTAGATGAAAGCTCTTGCTCAATGAAAAATGAGTTTAAATTACTTTCCTTTTCAAAAC CTTTAAATTTGTAATAAGGATGCAGATATTGCCACACAATAATATGATTTATGCTCATAA ATTACCTTTGAACATATATTTCATGAGAACAAAACAAAGAAAAAGATTTGTTATTAGAAT CAAATTTGAAATTGAATTAAAAATTCACCATTTCTAAGCAATACTTGAATTTTAAAAAAT AGTTTCCGGACACATATATTATTTTTATTCTCTTAATACATTAATATACAAATATTCATA TTTTAAAACATAAATAAATTTCTATTCACTGTCCCATTACCCAACGTACTTGACAACACT TTCCTATTTTTTTAACAAGCAAATTTTAAACAACTCGCCAACGTGGCATAACCCCGGGTT TCGTTCATATTACAAAATCAAGGCCCCAGTTCGGGTCGGGTTCGGTTTGGAACCGAAACT CAGAGACAACCACAGTCTCCTCTTCACCTAAAATTGCTAACATGCAGCTGAGCCTGTAAA TATTTCTATGATCATTCAACAAGTCAAAAAATCCAACGGCCATCAAGCGCCGTTCTTTAA ACTGGAAAAAAATAAACCAAAATCTTTTTTTTTTTCTCTTTTTGAGTTATACGATATAGT AATCCACACCGAGGAAGTATATGGATTTCTCTGCATCTTTGTCTCTTCCCTAGCATTTCT TCTCTCTGTCCTAGACACAAAAACAGAGAGAGAGACAAGTGCTTTGGGTTTTGGGTGCTT TTGCTTATTTGCAAGCCAAAAACAGATAAAAAAACGGAAACACTAAAAGAAAGTGAAACC ATCTTCAAACCAAAACCAAC
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>LITCHI009158.m1 GenomeSequence + CAACAAGTCAAAAAATCCAACGGCCATCAAGCGCCGTTCTTTAAACTGGAAAAAAATAAA CCAAAATCTTTTTTTTTTTCTCTTTTTGAGTTATACGATATAGTAATCCACACCGAGGAA GTATATGGATTTCTCTGCATCTTTGTCTCTTCCCTAGCATTTCTTCTCTCTGTCCTAGAC ACAAAAACAGAGAGAGAGACAAGTGCTTTGGGTTTTGGGTGCTTTTGCTTATTTGCAAGC CAAAAACAGATAAAAAAACGGAAACACTAAAAGAAAGTGAAACCATCTTCAAACCAAAAC CAACATGGCTTTGAATTTGAAGACGTTGAACCCATTTCTCTTCTCTATGCTTCTACTACA GCTAACATGGGCGGTAGTATTTAGTGAAGACACGGAGCTAAGAGCTCTCTTGGACATGAA AGCATCTCTAGACCCAGATGACAGGTACCTCTCTTCATGGACCATCAATGGTGATCCATG TGATGGCTCCTTTGAAGGAATAGCCTGCAACGACAAGTCTCGAGTGGCCAACATTTCCCT CCAGGGAAAGGGCTTGAATGGCAAGCTCTCTCCTGCCATTTCAGGTCTCAAACACTTGAC TGGCCTCTACTTGCATTACAACTCTTTGTATGGAGACATACCAAGAGAAGTAGCCAACTT GACTGAGCTTGCTGACTTGTACTTGAACGTCAACAATCTCTCTGGTGATATACCTCCTGA GATCGGTCACATGGGTAGCTTACAAGGTTAGTTTATTGTTTTATGTATCAATCTAAAACT TTGTTAACTCCCTGTTTTGTTTTTAGTCCTTGTCGTTCATGATTTCTGCGTGTTTTCTTG TTAATAGTTTTCTACTTTTTGTATTGCATTTTCTTTGTTTTGAGAAAATGTAAAATAGGC TTGTAAGTAGTATATGCAATATCAGTTGTATCTGTGAAAAAATGTTGCAGCATTTTTCTC TAATTTTGGTGTTTTTGCATATGATTCTGTAGTGTTGCAGCTTTGCTATAACCAGTTAAC AGGAAGCATACCCACACAGTTAGGTTCTTTGGAAAAGCTTAGTGTTGTTGCTCTTCAATC TAATCAACTAACTGGTGCAATCCCTGCAAGTTTGGGGGATTTGGGTTCACTAATGAGGCT AGATTTGAGTTTCAATCGTCTTTTTGGTTCGATCCCTCGAAAACTAGCTGATGCTCCTTT GCTTGAAGTCCTAGACATTCGAAACAACACTCTATCTGGCAATGTACCTCCTGGTAATCA TGTTTTTTCAACTCACTTTGAATTGTTTGGTTCATTTGTTGGTTAATGTTCATTTTGATT AATTGAATACAGTTTAATGTTGTTTTTGATGTGGTTGGTGTAGCATTAAAGAGACTAAAT GAAGGGTTTTTGTATGAAAACAATCTTGAACTTTGTGGTGATGGGTTCTCCTCATTGCAA GCTTGCAAGGCTTCAAATAACATCAATCCTAGTAGACCTGAACCCTACGGAGCAGGCACC ACTTTATCTACTAGAAACATACCAGAGACAGCAAATTTGCCATTGCCTTGCAACCAAACT CGGTGCTTGAATTCGCCAAAATCCCACCATGCATCTGTCATTGTTGGTGTGCTTGTTGTT ACTATAGCAGTATCAGCTATAGGAATCCTTACCTTCACACAATATCGTCGAAGAAGACAG AAGCTTGAGAGCTCATTTTATGTCTCTGATAGCCGTCCTAGTGTTGATCAGGCCAAGGGG GTTTATAGGAAGAATGGCTCTCCTCTTATAAGTCTTGAGTATGCTAATGGATGGGACCCG TTGGCCGATGGAAGGAACCTTGGTGCATTTCCCCAAGAAGTCTTCCAGAGCTTTAGATTC AATCTTGAAGAGGTTGAGACGGCTACTCAATACTTCTCTGAGGTGAATTTGTTGGGTAAG AGTAACTTTTCAGCAACTTACAAAGGGATTTTAAGAGATGGATCTGTTGTTGCAATAAAG AGCATAAGTAAAACTAGTTGCAAGTCAGAAGAAGCTGAGTTCTTGAAGGGATTGAATATT TTGACCTCTTTAACACATGAGAATGTAGTCAGGTTGAGAGGATTTTGCTGCTCAAGAGGG CGGGGTGAGTGCTTTCTCGTTTATGATTACGTTCCCAATGGAAATTTGCTTCACTATCTT GATGTCATAGACGGTGATGGCCACATCCTTGAATGGTCCACCAGAGTTTCCATTGTCAAG GGCATTGCTAAAGGTCAGCGTTTTCTTCTAGTTTTTGGCATTGTCACTTGAGGATTTCAC TTTTTTAAAAGCAATAATGTTTTAATGGGGTACTTATTTTCTATGCTAATTTTTTTTTTC TTCAATTTTCGTTGTTTCCTGAGCAGGTATGGCGTATTTACACAAGTACAAAGTGAACAA ACCAGCTCTGATACATCAGAACATTTCGGCTGAGAAGGTTCTCATTGACCAGCGATACAA CGCATTACTAGCGGATTCTGGCCTAAACAACCTTCTTACGAATGATGTTGTCTTCTCAGC ATTGAAGGCCAGTGCTGCGATGGGTTACCTTGCACCTGAGTACTCTACCACTGGTCGGTT CACAGAGAAAAGTGACGTGTATGCATTTGGAGTGCTGGTTTTTCAAGTGCTCTCAGGGAA GCGGAAAGTAACTGGCCTGGTACGACTTGAAGCTGAGTCATGCAGAGTCCAAGACTTCAT TGACACAAACCTTCATGGCAGATTTTTCGAATTTGAAGCTGCTAAACTTGCAAGAATTGC CTTGCTTTGCACTCATGAATCTCCTAGTGAGAGACCAACCATGGAAGAGATCGTTCAAGA GCTCAGTAACTGTAGTAGTTGTCTTCTTTAGTTTCCATTTCATCATCCATTGCCTGAACA ATTTTCAAGTGAGTAATGGCAGGCTAGCGATGACCATGGCACCAACTACTCATCGATGAT GAAGCGTTTTAGGATTTATTGTCATTATGTGCTCATGCCCTCTTACCGAGGACCAAGCTT TGTAGTTGTACTATAATTGAAAACAAGTTTCCCACAACCTGTAGATGGAATATTATGGAG GGGTTTTTCATCTATAATCACCCTTATTAAAGCTTTCATTTTTCCCGCTATTAACAAATT GTAGTCACTTGATAAGAACTTCTAAGAATCCAAGGTTTATTTATGTAGACTTGTATGAAT CTCTGTAGTACTGTATATCCTGTGAGCTCGCGTCGCACCTACTCCATAATTCTATATTTG CTGTGCTTTAATACTTATCAATGCCTAGGAGTATCCGATGTAGCACTGCAGCAACAATAT CGGTGCAACTATCCTATCTAACAATTTAGTGTTTGCTGTTGAAAGTAGTGAGCATTCAGA ATCTATTCCCTTGAGAAAATTATGAAGTTTGCTTTTCAAGCTGTTAAATAACATTGTCTG AAAG