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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI009158 | Chr7 | 23049299 | 23052722 | + | Protein NSP-INTERACTING KINASE 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI009158.m1 | 29 | 69 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 34.8 | 1.60E-08 |
LITCHI009158.m1 | 169 | 228 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28 | 1.50E-06 |
LITCHI009158.m1 | 413 | 675 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 99.7 | 1.90E-28 |
LITCHI009158.m1 | 416 | 677 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.1 | 8.20E-41 |
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>LITCHI009158.m1 ATGGCTTTGAATTTGAAGACGTTGAACCCATTTCTCTTCTCTATGCTTCTACTACAGCTA ACATGGGCGGTAGTATTTAGTGAAGACACGGAGCTAAGAGCTCTCTTGGACATGAAAGCA TCTCTAGACCCAGATGACAGGTACCTCTCTTCATGGACCATCAATGGTGATCCATGTGAT GGCTCCTTTGAAGGAATAGCCTGCAACGACAAGTCTCGAGTGGCCAACATTTCCCTCCAG GGAAAGGGCTTGAATGGCAAGCTCTCTCCTGCCATTTCAGGTCTCAAACACTTGACTGGC CTCTACTTGCATTACAACTCTTTGTATGGAGACATACCAAGAGAAGTAGCCAACTTGACT GAGCTTGCTGACTTGTACTTGAACGTCAACAATCTCTCTGGTGATATACCTCCTGAGATC GGTCACATGGGTAGCTTACAAGTGTTGCAGCTTTGCTATAACCAGTTAACAGGAAGCATA CCCACACAGTTAGGTTCTTTGGAAAAGCTTAGTGTTGTTGCTCTTCAATCTAATCAACTA ACTGGTGCAATCCCTGCAAGTTTGGGGGATTTGGGTTCACTAATGAGGCTAGATTTGAGT TTCAATCGTCTTTTTGGTTCGATCCCTCGAAAACTAGCTGATGCTCCTTTGCTTGAAGTC CTAGACATTCGAAACAACACTCTATCTGGCAATGTACCTCCTGCATTAAAGAGACTAAAT GAAGGGTTTTTGTATGAAAACAATCTTGAACTTTGTGGTGATGGGTTCTCCTCATTGCAA GCTTGCAAGGCTTCAAATAACATCAATCCTAGTAGACCTGAACCCTACGGAGCAGGCACC ACTTTATCTACTAGAAACATACCAGAGACAGCAAATTTGCCATTGCCTTGCAACCAAACT CGGTGCTTGAATTCGCCAAAATCCCACCATGCATCTGTCATTGTTGGTGTGCTTGTTGTT ACTATAGCAGTATCAGCTATAGGAATCCTTACCTTCACACAATATCGTCGAAGAAGACAG AAGCTTGAGAGCTCATTTTATGTCTCTGATAGCCGTCCTAGTGTTGATCAGGCCAAGGGG GTTTATAGGAAGAATGGCTCTCCTCTTATAAGTCTTGAGTATGCTAATGGATGGGACCCG TTGGCCGATGGAAGGAACCTTGGTGCATTTCCCCAAGAAGTCTTCCAGAGCTTTAGATTC AATCTTGAAGAGGTTGAGACGGCTACTCAATACTTCTCTGAGGTGAATTTGTTGGGTAAG AGTAACTTTTCAGCAACTTACAAAGGGATTTTAAGAGATGGATCTGTTGTTGCAATAAAG AGCATAAGTAAAACTAGTTGCAAGTCAGAAGAAGCTGAGTTCTTGAAGGGATTGAATATT TTGACCTCTTTAACACATGAGAATGTAGTCAGGTTGAGAGGATTTTGCTGCTCAAGAGGG CGGGGTGAGTGCTTTCTCGTTTATGATTACGTTCCCAATGGAAATTTGCTTCACTATCTT GATGTCATAGACGGTGATGGCCACATCCTTGAATGGTCCACCAGAGTTTCCATTGTCAAG GGCATTGCTAAAGGTATGGCGTATTTACACAAGTACAAAGTGAACAAACCAGCTCTGATA CATCAGAACATTTCGGCTGAGAAGGTTCTCATTGACCAGCGATACAACGCATTACTAGCG GATTCTGGCCTAAACAACCTTCTTACGAATGATGTTGTCTTCTCAGCATTGAAGGCCAGT GCTGCGATGGGTTACCTTGCACCTGAGTACTCTACCACTGGTCGGTTCACAGAGAAAAGT GACGTGTATGCATTTGGAGTGCTGGTTTTTCAAGTGCTCTCAGGGAAGCGGAAAGTAACT GGCCTGGTACGACTTGAAGCTGAGTCATGCAGAGTCCAAGACTTCATTGACACAAACCTT CATGGCAGATTTTTCGAATTTGAAGCTGCTAAACTTGCAAGAATTGCCTTGCTTTGCACT CATGAATCTCCTAGTGAGAGACCAACCATGGAAGAGATCGTTCAAGAGCTCAGTAACTGT AGTAGTTGTCTTCTTTAG
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>LITCHI030608.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATCGGTCGAATTAGTCAGATTACTTGTGGTCTAAAGCTGTTAGGTTTTCTTTGATTCTGG GTCATATTGGCCTTAAATTATCTCAACAACCAATTTAATGTACAAATTAATTGATATTTT TCCGCTCAAGATTCATTGGCATTGGCCATTCTATGAAATTTGGAAATCATTATATCAGTC ACTCCCTCGTACACCCACCACCTTAGTGAAACCAATTTGCAAGTCTCTCCATACGCAAGC TAACTGTGGATACTTACCCAATTTCTAAATAATCAAGAAACTTAAATTGTACATCTCAAA TTTCAAAGCAAATAATGGATGGGTAACGGTTAGAAAATTCCTTTCTTCGCAGAAGGGATT GCAACTCAAAGTACTTTATATTTTATAATCAATTAATATCAACTCTTCATAGTTTTTAGT AATGTTTAGACATCCAAAGGAGTGGCGCAATTTCCACCTCTAAAACTGTGTGTATACCCT CTATTTTATTTATTTTAAAAATTTTAATATTATCTTTAAATTAAATTAAAATATTTTATT TAAAAAACATTATTACTTTTAATTATTTACTTATACTAACTAAATTAAATTTATAAAATG TAAAACAAAATAAAAAATCTATACGAAATAGAGTGGCAAGAGCTTCCAAACCTCAAAACA ATTAATGATGGAGGAGCCTCCTCCATTCTACATCAAAATATGACCACTAGGTAGTGGTGA GGTAGCTCTTTTTAGTTGGAATCGGTGCTAAAAGCAACTCCAACATAGCACCATTTTGAT ATAAAACACTAATTTGGTGTTCAAACTCACTCCAATGTAGCACCATTTTATAATTTTCAA GACAAAATTTAGTATATGAGTTACAGTATAACATCAAATTTGATGTCAAACTGTAATTAA ACATCAAATGGGTTATTGAGCCATGTGTTCTTCCTCTTCTTTTCCAAAATTGCAACAGTG CACACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCTCCCCCCCAATAATAACCACAATAATTTAC ATTACATTTGTGTAATTTACCATATTTAATATATTTGTATAATTTGGTTAACAATTATAA ATATAAATTAAATTATTATAAAAAATTTGATATCATTGGAAAATTTTAATTGAGATCTTT AAAATGAGTATAATATTGAATATGTTTTAATATATTTTTAAGTTTTTAATATATATTATA AATAATATATTAATATAAAAAGAATTAAATTATTTAATTATATAAAAAATTATTATTTTA ATAATTACTTGATAGAACTAGTAATATTTTAATACAAAAACTCAATAATGTAATAAAAAA CAATAACATTAACATTATCATTACCTTAAATTAAATAGATAAATAATTAGTTGCATACAA ATGAGTTAAAAAATATTAAGCGAATAAAAAAAAGGTGGAAAAATAATGAGAATAAAATTT TGTAAAAAATTAAAAAAAATTATGTGAGTATTTAATAATTTTTTAATATATTGTGAGTAA TTATTTGAGAATAAAATTCTATACAAAAAAAATTAATTAATATTGGTTAAAGAATTATAC ATTAAATATTTTTTGAAGATATATTTACACTAATCTAGTATCATATATGTTGAAGTATAA AAAAATTTGATGTAATCAAATAAATATTGATATTAAAATGATGTAAAGTGTGAGGTTGGA CAACGAAGACGGTCTAATAGCTGAAAAATGTAAACGTCTTTTTTTTATTCTTTTTTTGGA CCAGGCTGTAAAGGCTTCTTTCTTCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTGGGACCAGGCTGTAAACGCTTCTTTCTCGAAGGGAATGATAACCCTGTCGTCGCCAAG CCTATGGACTTGCCTTTCCTGCTTGGATCAACTTCCTCAACCCGCTAAGAGATAAATTAA ATATTTATATTTTCACTTCTCTCTCTTACACGACACACAAATCACAAAAAATAAAATATC CAAACTCTCTCCATCCCACG
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>LITCHI030608.m1 GenomeSequence - AGGCTGTAAACGCTTCTTTCTCGAAGGGAATGATAACCCTGTCGTCGCCAAGCCTATGGA CTTGCCTTTCCTGCTTGGATCAACTTCCTCAACCCGCTAAGAGATAAATTAAATATTTAT ATTTTCACTTCTCTCTCTTACACGACACACAAATCACAAAAAATAAAATATCCAAACTCT CTCCATCCCACGATGGGGTCACCGGCGCCGGAATCAGAACTAGGCCCTAACGCGTTACTT TACGACCCTCCGCCATGGCATAAATTAGAACTAGTCCGTCCACCGTCTACCTCTGCAGAG CCACCGCCTGGTTTCTCTGCCGAATCACCTGGCGAGCTACTGCGGTCAACCGTTCCCTAC CTATTGCCGTCGCCTGCCGCCTATTCTCCTGCGCCGTCGCCGTCAAGCTCCCCCAGGTTC GAGCGCATGCCAGTGACAACCAGTAGAATTGGAGCAGTAGGGTTGATAGTAGTTGGGGCC ATTGGGAGCGTGCTCCTCATCATGGCGTTGCTTTGGATCTGCTCTTATATCAACAAAAAT CTTTCTAGACGTAGTTAGTATCATCATCATCATTATTATTCCTTTAAAATTTATATATTG ATTTTTTTTAAAAAAAAATCTAAATTTATGCGTTCATTTATAATATAATTTTTGGGTTTA GGTTAGCTTTTCATTAGTGAATTATTACTGTTAGCCTAAGTGAAAAAAATAAGGATATGA TTCAAACCTACCATCTATAAATGGTAAGGATATTATAAATTTTGTTAGATTTCATTTGTT TAAAAAATTTTTATCAAAGTTTTCTATTTATATTCTAATTTTATTAGTGCAAAATAAAAT CTAAAGTTATCACTTTATTAACTTTTACATTTTTTTCATCCTCATCTTTATTAAGATTTA 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