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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008947 | Chr7 | 20165692 | 20169010 | - | Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g06940 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008947.m1 | 26 | 65 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 46.5 | 3.50E-12 |
LITCHI008947.m1 | 145 | 202 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.2 | 1.70E-08 |
LITCHI008947.m1 | 145 | 167 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.2 | 0.24 |
LITCHI008947.m1 | 218 | 278 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.7 | 4.20E-07 |
LITCHI008947.m1 | 241 | 256 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.3 | 1.4 |
LITCHI008947.m1 | 458 | 471 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 11.6 | 0.27 |
LITCHI008947.m1 | 459 | 480 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 13.8 | 0.074 |
LITCHI008947.m1 | 596 | 861 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 125.7 | 2.20E-36 |
LITCHI008947.m1 | 601 | 863 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 120.5 | 7.90E-35 |
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>LITCHI008947.m1 ATGGCTAACACCAACCACTGTTCATTTCTTCTGTGTCTTCTCTGCATCACATTCTTCACA TGTAGTTCAGCTGCTTCTTCTGAAGCAGATATTCTTCTCTCCTTCAAGGCCTCCGTTGAT GACTCCAAGAACTATCTCTCTAGCTGGTCCAACACCTCAACTGCTCACCACTGTAAGTGG ACTGGTGTCACTTGTACAACTGCTCCTTCTTCACTCTCTGTAACTTCTCTCAACCTTCAA AGTTTGAATCTTTCTGGCGAAATCTCATCTTCAATATGTGAACTTTCTGGTCTCACTGAC TTGAACCTTGCTGACAATGCCTTCAACCAACCTATCCCTCTACATTTGTCTCAGTGTAGT TCTTTGGAGACTTTGAATTTGAGTAACAACCTCATTTGGGGTCCTATCCCAAATCAGGTT TCACAGTTTGGTTCCTTGAAAGTTCTTGATTTGAGCGGAAACCATGTTGAAGGAAAGATC CCAGAAAGCATTGGCTCATTGGTGAATCTTCAAGTTCTCAACTTGGGCAGCAACTTGCTT TCAGGTAGTGTTCCTTCTGTTTTTGGGAATTTTAGTGAGCTTGTTATTCTTGATTTGTCT CAAAATGCATATTTGGTGAGTGAGATTCCTAGTGATATTGGCAAGCTTGAGAAGCTGGAG CGGCTTTTGTTGCAAAGCTCTGGCTTTCATGGTGAGATTCCTGCTTCTTTTGTGGGTTTG CAGAGTTTGACCATTTTGGACCTTTCACAGAACAACCTGAGTGGTGAGGTTCCTCAGACA CTTGGTTCTTCTCTCAAGAATTTAGTGTCTTTTGATGTTTCACAGAACAGGCTTTTAGGT TCATTTCCTGATGGTATTTGCAATGCAAAAGGCCTTATCAACCTTAGTCTGCATAAAAAT TTCTTCACTGGTTCAATTCCCAACTCCATTGATGTATGCTTGAATCTTGAGAGATTTCAG GTTCAAAACAATGATTTCTCTGATGACTTCCCAGAAAAACTGTGGTCATTACCAAGAATC AAGCTCATCAGGGCTGAAAACAACCGGTTTTCCGGACAGCTACCAGATTCAATATCAATG GCTGCTCAGTTGGAGCAAGTTCAAATTGATAACAACAGTTTCACTAGTAAAATTCCTCAT GGTCTTGGTCTAGTCAAGAGCTTATATAGATTCTCTGCCTCTCTTAATGGTTTCTATGGT GAACTTCCTCCAAATTTTTGTGACTCTCCTGTCATGAGTATCATGAATTTCTCCCAAAAT TCAATTTCTGGTCATATTCCGGAGCTGAAAAAATGTCCAAAACTAGTCTCATTGTCCTTG GCAGACAATAGTCTTACAGGAGGAATCCCCCCATCTTTAGCTGAATTGCCAGTCCTCACT TACCTTGATCTATCTCATAACAATCTAACTGGTCCAATCCCACCAGGCCTTCAAAACTTG AAGCTTGCCCTCTTCAATGTATCCTTCAACCAACTATCCGGTAAAGTCCCTTATTCCTTA ATCTCGGGTCTTCCAGCATCATTTCTGCAAGGAAATCCTGGACTTTGTGGCCCTGGATTG CCAAACTCTTGCAGTGAGGACCAGCCAAAACACCACACTAGTGGTTTTACAACATTGACA TGTGCAATGATTTCTGTAGCGTTTGTTCTTGGTATTGTGATGATTGCTGTTGGCTTTTTC TTGTTCCATCGATATTCCAAGCGAAAATCTCAAGCGGGTGGCTGGCGCTCGGTGTTCTTT TATCCGCTCAGAGTCACTGAACATGATTTGGTGATTGGAATGAATGAGAAAAGTGCAGTA GGAAGCGGTGGACCATTTGGTAGAGTTTATGTTTTTAGCCTACCAAGTGGTGAACTAGTT GCCATAAAGAAACTTGTCAATTTCGGGTGCAATTCTTCGAAAACTTTGAAAACTGAGGTC AAGACTTTAGCCAAGATCAGGCACAAGAACATCACCAAAGTTCTTGGATTCTTCCATTCA GATGAGTCAATCTTTCTGATATATGAATTCCTACAAAATGGAAGCCTAGGAGATTTGATT TGCAGACAGGACTTTCAGTTGCAGTGGACTACTAGATTGAGGATTGCCATTGGTGTTGCT CAGGGACTGGCATATCTTCACAAGGATTATGTTCCACACTTGCTTCACAGAAATGTCAAG TCGAAAAATATTCTCCTGGATGCAGATTTTGAGCCAAAGCTCACAGATTTTGCACTTGAC CGAATTGTGGGAGAAGCTGCATTTGAATCAACCATGGCTTCAGAGTCTGCATTGTCCTGC TACAATGCACCAGAATATGGATACAGTAAGAAAGCAACCGAACAGATGGATGTGTACAGC TTTGGAGTTGTGCTTCTAGAGCTCGTAACTGGTCGACAAGCTGAGCAAGCGGAATCAGGA GACTCTCTAGATATTGTGAAGTGGGTTCGAAGAAAAATCAACATTACTAATGGGGCATTA CAAGTCCTAGACCCCAAGATATCAAATTCTGCACAACAAGAGATGGTGGGAGCACTAGAT ATCGCCCTGCGCTGCACTTCCGTGATGCCAGAAAAACGACCTTCAATGTTTGAAGTTGTC AGAGCTCTTCACTCCTTGACCCCAAAGACTAGCCTTTCGAATTCGGGGCTCTCACCATTG GAGGAGCACTCCATTCCTGTTTGA
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>LITCHI010158.m1 ATTAAAGGGTCTCACATTGAAACGGCACAGCAGAGGAGACGGAGGGGTCTAGGGTTTCCT GGTCGCTCTGTGTGTCACTAGTTGATAATATAGATGTTATTTTGAAATCTATATATACAT AATATATATATATGTATGTCTTTGTCTATCGATCTCTATATATGGTCCGATCACTCTCTC CAGTTCTATCTTCTAAAATGTTTTTACGGTTTATTAGGGTTCTCAAAATTTAGGTAAGTT GGTATATATAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTATTCATAAGAGAGTCTTCTTC TAGGGTTTCGAATCTGAGAGAAACCCTAAAATTGAAAACCTTTAATTGTTTTTTGAGTTT TAACAATAGACATCATGTATTGAGAATCGGAGCTGGAAAAAGGATTTGATTTTTATTTTT GGTTGTATTTTATTATTTATTGGGGGGATTTGAGAGATTATTGTAAATATGCGAGGATTG CACAAATCGAAAAGGGTTTCATGGGCACCGGATGTAAATCTTTGTCAGGTAAGGTTGTTT CTGGCAGAGGACTCTCCTTCGCAAGTTGGGTTGGCTGCCCAAGATCACCTTCAAGCAAAG TCTTCAGGGGTGACGCATACAAATGGAGCTGGCACAGATGATTTTCTTCCTCCTGGCTTT GAAGGAGCTCATCCACCAAATCAGTTGCAAATTAATTTATCTGAAATTCCCATTATCCAA TGGAGATGCCCTCCTAGGTTCTGTTTGGACTCAAAGTGGCAAGTGGTTGCTGGGGATGAA AGCAAAGAGGTGGAGATTCAAAATCAAAGAGAGATGAGGGTGCTTGAAGCAGTTTATCCG CGCCCATCTGCAATACCTCCCAACCCCTCTGTCTCAGTGGATGTAGAAGGCTCACACTAC AATGATCAGCAAACTCCTGTCATACCCATTACTCCCATCGAAGATGAAGAAGCGGTAGGA GATACACCATCTGGTCTGACAGCACCATTCAATGCTGGCATGAGCTCACAGTCTCCACTT TCAGCTCCTGGAATTCCGCCACCTCCTCAGGGCAGCATACCTAGCGTTTCACACCCTCCA GTCAATGAGAATCCAGCTTCTGGAGCACCCCTTGCTGTTGACCCTGTTGTAGTTGCTGCG GCCACTGCTGCCTTAACTGAAATTTCAAAAAGCAATGGGCATGGTAGTATGATTGACCAT GATTTGCTAATAAAAATCCTCAGCAACCCAAGATTGATTGAGAGATTGGTGACCGATCAT GGATCAGCTTCCAGCGCACAGAACATACCCCAGCCAACTTTCCCTGCAGTACCACCATCA TCAGATCATCCACCATCTGTGCCGTTGTCGCATCCATCTCCTCTTCGAGCCAACATGATA GAAACTAGTTCACCTTCAATGGCAGCTAGTTCAAGTGGAGCTTTCTATCCTCAACCGAGT GCAGTTGGAATGGGGCATCATCCTAACGCATGGGGTAAACCCCCACCTGGGGTTGTTCCG GCATCATCTTCCCCTTCCCCAACCTATGGAGTTTCTCAAGCGAAAGATTTGAACTACTAC AAAAACTTGATCCAGCAACATGGAGGAGAGCGACAAGACACCCCTCAGCAATTTGGTGGC CGATACAACAGTCAGCAACCAGGAATGAACCAAGAACCAGTAAATAACAACCCGAAATCA AGAGACTCAAAGCCTAAAATAATGAAGCCATGTATTTACTTTAACACTTCAAGGGGATGC AGGCATGGAGCCAATTGTGCATACCAGCACGATCCATCCTCCCAGCAAAGGGGCGGTAGT AACATGCCAGAGGCACAAAATGCAAAGAGAATGAAAATGGATAGAGAGATTAGTAGTTAA ATGTTACATGCATGTAAGTTTTTTCTGGTTGTGGAAAGGCTTATTGCAGTTTAAAAAGGA AAAAGAAGAAAGAAGAAAGAAGAAAGACTTGCTTTTGCTTTAAAATAGTGTAAGTTCATT CTCATACATTATCTAGCGGTGATCATCAGGAGTTCATGAGTGAGGTTCGTTCTTGTATTT AACGATCCCAACTGAGGATTTTGCCTGTTCTGATGACAAATTTTCTTTAAATTTACATTA TTCAGCAACTGCTTCTGTCGTTTACACCACAAAATTGCTTAATAGAGTAAAATCATCTGG TATAAATAAATAATGTTGCTCATTGATTCTAAACATGAAAACCATTATTGGATCAAAATA GTGTGAAATATAGGCGACACACAGGAGCCTGAATCGTTGGGTTCATCGACCCAGAGACCT GACTGGATTGGGCCCAAC
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>LITCHI010158.m1 - Up_Stream_Len 2000 CATTTTCTTTTCATCTATAACTTAATCATATGTAATGATTTTATATTTGTTGAACTTTTG TCATATGTTATTATTTATGTAAGAGGACTGTAATTATTTTGTAATATTGTGAACTTAATA TGTCTTTGAGCCCACCCACAAGAGGATTCATATTGGCATCCTTCTATACACCCTTTAGTA AGTTCACCACAATAAATAGTTTTTTAAAAAAAATCTAATTTACATAAAAAAGTTTTGATA ACGTTTATTTACAAATGTATAATGCATATAAAAGTTATTAAGTGAGTCATAATTATAAAT TATAATTTTTTGAAATAATATTCAATGGAGTATATAAACGAAAGGGGTGTACATACAGCT TTAATGAGGTACAAATAGTGATACTCCACACCCTACATACTTCCAATTGGGTACTTTGGA GGGGTTACAGAAAGCGTGAAGGAACGGAGGAACCCACCTTCATCCTCATTTGCTCCCAGC CCCAGGAGCATCTTTAAATGTTCATCATCCCTTACGTATATCCATTGAACGAAGAAGTAT GTACTTAAAACAAACTTGGGAATTATTCAGAATCATGTTAAAAATAATGGGCCATCAACA CAACAAAACAAGCCCATTCAAGAACCAAATAACAAAAACAAGCCACGTGTCAGCAGACAT GACCTTGTAACTGGTCTGAGCTGGACCCCACCGTCCTTTCATGGTTCCTCTCAATGTACT GCGGTCAGAATCTCCAAGTCTGAAACAACAAGTTAAAACTCACACCCCACCCTCATTCCC CACGCGTGCCCATCACCTCCTCTTTCTAAATGGTCGTTTGATGTTTTATGTAAACAGTGT TAAAATTTTTAAAAACCGAATAATAATTAAAATCCGAAATATGAATAATATATATATTTT TACCTTTTGAATGTATTATAATATTATTTATTTTTTAAATTAAATTATCTAATAATTAAT AATTTGATATTTATATTTTTATTATTAATTTTTATGAAACTTTATTTAATATAATAAAAA ATAATTATTTGTAATATCTATTTATAATTAAAATATGGTTAAATATAATAAATTGATTTT ATTTATATATTTAAATAAAAATAATGAAATTAATTATATTCTAAAGGTAGCTAAAAAAAT AAATTTTAAATTGTAAATTACATACATTAGTCCAATTTTAAAAAATTTTAGGATAAAGTT TTTTTTTTAAAAAAATTATGTCATATAAGTATTAGGGAAAAATATTTATGTTATAAAATT ATGATAAAATTGAAAATATATTATTTGAGAAGAATGAACTTATAATAGAATATTTTAAAT TTTTTAAGTATTTTAAATACTATTAAGTGATTTATAATTAAATTAAAATTTAATTATTTT TAAAATTATTTTAAATGATTTGAAGCTTTGAAAAAAAAAAAATAATAACTTTACTCCTAA CTTCTGCTTCCATCCGCGCTCCACACCCCAGCGCGTCCGAACAGACACATGGACAATAAA AATTAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTAAAGGGTCTCACATTGAAACGGCAC AGCAGAGGAGACGGAGGGGTCTAGGGTTTCCTGGTCGCTCTGTGTGTCACTAGTTGATAA TATAGATGTTATTTTGAAATCTATATATACATAATATATATATATGTATGTCTTTGTCTA TCGATCTCTATATATGGTCCGATCACTCTCTCCAGTTCTATCTTCTAAAATGTTTTTACG GTTTATTAGGGTTCTCAAAATTTAGGTAAGTTGGTATATATAAAAAAGAGAGAGAGAGAG AGAGAGAGACTATTCATAAGAGAGTCTTCTTCTAGGGTTTCGAATCTGAGAGAAACCCTA AAATTGAAAACCTTTAATTGTTTTTTGAGTTTTAACAATAGACATCATGTATTGAGAATC GGAGCTGGAAAAAGGATTTGATTTTTATTTTTGGTTGTATTTTATTATTTATTGGGGGGA TTTGAGAGATTATTGTAAAT
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>LITCHI010158.m1 GenomeSequence - ATTAAAGGGTCTCACATTGAAACGGCACAGCAGAGGAGACGGAGGGGTCTAGGGTTTCCT GGTCGCTCTGTGTGTCACTAGTTGATAATATAGATGTTATTTTGAAATCTATATATACAT AATATATATATATGTATGTCTTTGTCTATCGATCTCTATATATGGTCCGATCACTCTCTC CAGTTCTATCTTCTAAAATGTTTTTACGGTTTATTAGGGTTCTCAAAATTTAGGTAAGTT GGTATATATAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTATTCATAAGAGAGTCTTCTTC TAGGGTTTCGAATCTGAGAGAAACCCTAAAATTGAAAACCTTTAATTGTTTTTTGAGTTT TAACAATAGACATCATGTATTGAGAATCGGAGCTGGAAAAAGGATTTGATTTTTATTTTT GGTTGTATTTTATTATTTATTGGGGGGATTTGAGAGATTATTGTAAATATGCGAGGATTG CACAAATCGAAAAGGGTTTCATGGGCACCGGATGTAAATCTTTGTCAGGTAAAATGAAAT TATTATCAATGAAATTTAATGGGTATGTGTGTGAATTTTGGAGATACAATTGAACAAATG AATTAATGAGAGCCGAAATGATGGAGCAGATTAGAGTTGTGTTGTGAGACCGGATTGATC GATTGGTTGTGGTGGTATTTGTGGGTGGTGTTGTTTGCTGTATCGGCTGTGGCATTTTTT TAGTGGCTCTGGTTTTAGTACTTTGTTATATCCAAGTCTTTTGCTTATGTGCAATGATGG GGTTTTCGTTGATCTAGACTTGCATGCACGAGTAGTTGTTGATATAAGAGATGTTTTGAT CAGATTGTAAATACATTAGTTTTTAATGTTTTTGTGAATAGTATGTGATTGATCATGCTT 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