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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008939 | Chr7 | 20044461 | 20049133 | + | Transcription factor bHLH60 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008939.m1 | 202 | 253 | PF00010.29 | HLH | Domain | 29.4 | 6.50E-07 |
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>LITCHI008939.m1 ATGGAGGCTGTTGGAGCTAGATCCAGTACAATTAAGCCATCGCTGGACCAAAACGCACTC GATTCACTGCAATTTAACGAAGAGATTCAACACTTGATGACCGTACCGACGGAGAATGCC AACTCCTTCACCGCCTTGCTCGAGCTAACGCCGTCGCAAGCCATGGAAGTCCTCCACCAT TCGCCGGAATCCGCCGCATCAGCAGCAGCGGCACCGCATCACTACCATTTCTCTCCAGGG GTAAACCTGACTTCTCCCTCTAACATCGCCTTGATTGAACGCGCCGCCAGACTCTCTGTC TTCGCCGACAATAACAACACCAACAATAACTCGCCGGAGACGACGGGGTCGGTGCCGTCG AATTGGAGCGGGAATCTCGGGAAAGTGAAGTGCGAGCCGGCGGAGTCGGACTCCAACCAC GACAATCCCAATTCGCCGCAGCCGAGTCAGAATCAGAATCAGAAGTCGATTAAGAGAAAA GAGCGAGAGAAGAAGGCCAAAGCGGCGACAAAGAAGAGCAAAAGCGGTACAAATGAGAGT AGCGAAGATGCAGAGAAGCTTCCCTATGTTCACGTTCGAGCTCGTCGCGGTCAAGCCACT GATAGCCATAGCTTAGCTGAGAGAGCCAGGAGAGAGAAGATTAATACTCGGATGAAGTTG CTGCAAGATCTGGTCCCAGGATGCAGTAAGGCGGGCGATAAGATTTCTGGTACAGCATTG GTTTTGGATGAGATCATCAACCACGTGCAGTCTTTGCAGCGTCAAGTTGAGGTCTTATCA ATGAGACTTGCAGCAGTCAATCCAAGAATTGATATCAATCTTGACAGTATACTGGCTGCA GAAAGTGGATCTTTAATGGACAGTAACTACCCAGGGATGGTCATGCCTCTAATGTGGCCT GAACCCCAAGTTAATGGAAACAGACAACAGTATGAACAGCAATGGCACCTTGATGCGCAT CACCAGCCAGTTTGGGGAAGAGAAGAAAGCCAAAACTTTGTGACTCCAGAGAACTCACTT TTGAGTTATGACTCCTCGGCAAATTCAGCATCTTTGCACTCAAATCAACCGAAATGGAGA TATGAAAGCAAGATGAAGTTCAAGCGGTAG
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>LITCHI008939.m1 MEAVGARSSTIKPSLDQNALDSLQFNEEIQHLMTVPTENANSFTALLELTPSQAMEVLHH SPESAASAAAAPHHYHFSPGVNLTSPSNIALIERAARLSVFADNNNTNNNSPETTGSVPS NWSGNLGKVKCEPAESDSNHDNPNSPQPSQNQNQKSIKRKEREKKAKAATKKSKSGTNES SEDAEKLPYVHVRARRGQATDSHSLAERARREKINTRMKLLQDLVPGCSKAGDKISGTAL VLDEIINHVQSLQRQVEVLSMRLAAVNPRIDINLDSILAAESGSLMDSNYPGMVMPLMWP EPQVNGNRQQYEQQWHLDAHHQPVWGREESQNFVTPENSLLSYDSSANSASLHSNQPKWR YESKMKFKR.
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>LITCHI008939.m1 GGTTGATATAATAATAATAAGGTACAGAAGCTTTGATATTATGAAAAAAATAAAAAAGAA GAGAGGAACTGGGGTGGGTCCCATCCCAATCGCTCTTCCAGTTTCCCAGTTTTTCAACTT TCTCCTAATCTGAACGAACTGTATAGTTGGAACTGAACAAATCACATCAGGGCTAGTAAA AGTCCTCCACCTCCACAAAATAATATTAATATTTTTATTTCGAAAAAAAGAAAAAAAATC CCCGTACCATAAATACACCGAGTGCAGCCGAGGTTTCTTTCTCACTACTTCAAATTGGTG ACAAGTAATATCTTACACACACAAGGAGAGAACCTCAACATAAACGGGCAACTTACAATC ACAATTACAATTGTCTCCAAACACTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATCACCTT CTGTAAGAGCATCGTTTCCTGCTTCTCTTCAATTTGATTCGAATTATCCAACTGTTTTTC GTATTTGACGACGTGGGTGAAATGGAGGCTGTTGGAGCTAGATCCAGTACAATTAAGCCA TCGCTGGACCAAAACGCACTCGATTCACTGCAATTTAACGAAGAGATTCAACACTTGATG ACCGTACCGACGGAGAATGCCAACTCCTTCACCGCCTTGCTCGAGCTAACGCCGTCGCAA GCCATGGAAGTCCTCCACCATTCGCCGGAATCCGCCGCATCAGCAGCAGCGGCACCGCAT CACTACCATTTCTCTCCAGGGGTAAACCTGACTTCTCCCTCTAACATCGCCTTGATTGAA CGCGCCGCCAGACTCTCTGTCTTCGCCGACAATAACAACACCAACAATAACTCGCCGGAG ACGACGGGGTCGGTGCCGTCGAATTGGAGCGGGAATCTCGGGAAAGTGAAGTGCGAGCCG GCGGAGTCGGACTCCAACCACGACAATCCCAATTCGCCGCAGCCGAGTCAGAATCAGAAT CAGAAGTCGATTAAGAGAAAAGAGCGAGAGAAGAAGGCCAAAGCGGCGACAAAGAAGAGC AAAAGCGGTACAAATGAGAGTAGCGAAGATGCAGAGAAGCTTCCCTATGTTCACGTTCGA GCTCGTCGCGGTCAAGCCACTGATAGCCATAGCTTAGCTGAGAGAGCCAGGAGAGAGAAG ATTAATACTCGGATGAAGTTGCTGCAAGATCTGGTCCCAGGATGCAGTAAGGCGGGCGAT AAGATTTCTGGTACAGCATTGGTTTTGGATGAGATCATCAACCACGTGCAGTCTTTGCAG CGTCAAGTTGAGGTCTTATCAATGAGACTTGCAGCAGTCAATCCAAGAATTGATATCAAT CTTGACAGTATACTGGCTGCAGAAAGTGGATCTTTAATGGACAGTAACTACCCAGGGATG GTCATGCCTCTAATGTGGCCTGAACCCCAAGTTAATGGAAACAGACAACAGTATGAACAG CAATGGCACCTTGATGCGCATCACCAGCCAGTTTGGGGAAGAGAAGAAAGCCAAAACTTT GTGACTCCAGAGAACTCACTTTTGAGTTATGACTCCTCGGCAAATTCAGCATCTTTGCAC TCAAATCAACCGAAATGGAGATATGAAAGCAAGATGAAGTTCAAGCGGTAG
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>LITCHI008939.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTATCCTAGACCAATGCGACTGTAGATTCAAGTCATGTTCCCCTCTGTAAAACTTGAATT AATTATAATATTTTATAAAAATAATGTAATTACAATATAATTAAAAATGCTAATATTAAT AGTTAAAAGTCTACTGAATTTACTGAATCTAGACATTATGTGTAATCTGATTTTGAAAAT CTACTCCTATAGCATATGAAGAAATCTAATCTCGTATGACGGAGTTAAAATTCTCCACAA TGTTGATAAATACATATAATATATAATTTATACTTCGATCATGAATATGAAGAAGAAGTA TATTAACCATTGAAGTTATAAGTGAATGTGTATCTCAATTATTTTTTTTACTGTTGAGAT TGTTACTATTATTATACTTTAAACAACCAAAATTAACAAAGAAAAAAATCTCTATTTAAG AATGTTTTTACCAACACAAAATGAAATTGAAATCTATGTTTAAATCTTTTGATTTTCTTA TGGCAATAGAAATTAGCCAATAATAAACCGTTTTCTTTTTGACTCTGCGTCTTTTAGTTT TTACTAATCTAAAAGACTTGTGTGTTCATAGGAATTCAATTTTAGGGGGTGTATTTAATC AAGAATTCATTGACATTTAAAATGTTTAAAAAGTTTGGGTTTATTCAATTAAGATTTAAA TGAATAAATAAAATATATATATATATAGAATCCATTAATAAAATTTAAATATATTTAATT CAGATTAATATAGAACTCATTAAAATCTAAATGTATTCAATTTGGATTCATATGAAATTC AATGAAATGTAGATATATTATAAAAGTTATTGAGTTCAAATTTCATTTAAATGATGAAAG TCGATAGAATATATGAATTCTACCAAAATCTATTATTAAACAAAAATCATCAAATTTTAC TAAATTTTAGATTAAATACACCCTCCTAGTAATATTATCAATCACTATAAATTTTGTGAT GATATCATTGGCGGGTTTTACTCAACTATGGCATACGACGGTATGACATCAATCTTTCAT TTCCATTTTTTGTTCACTTGTAATAATATTTTTTGATTGGGTATATTAAGTATCCATCCT CCCATATTTTAACAAAATTCTAAATCATAAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTAAGT CATATATTTTATTATATAGGTCTCTAACATTATTAGGTAATTACAAAATTTTAGATTGAG ATATACAAAATTTTAAGAATAAAAAAATTTAGAATTTGTAAACTCTCAAGTGGAATCAAG CATGGTACCAGAAGCTTATCTATTTATAATTATAAATAGGTATACGCGAAAACTTGTAAT TAAAATGAGCGAGACAGGTAATAATAATACTATTAACATAGAAGATAAGAAATGAATGAA AACGACGTAACTAAAGTTGGATTTGCAGCAAAAACGTGGGTTAGAATGCGAGTGAAGTGA ATAAAATCATCAAGCCACAACCACCAAATCAGGCTTTTTAAGTTGGTCAATAAATCAACG GTTGATATAATAATAATAAGGTACAGAAGCTTTGATATTATGAAAAAAATAAAAAAGAAG AGAGGAACTGGGGTGGGTCCCATCCCAATCGCTCTTCCAGTTTCCCAGTTTTTCAACTTT CTCCTAATCTGAACGAACTGTATAGTTGGAACTGAACAAATCACATCAGGGCTAGTAAAA GTCCTCCACCTCCACAAAATAATATTAATATTTTTATTTCGAAAAAAAGAAAAAAAATCC CCGTACCATAAATACACCGAGTGCAGCCGAGGTTTCTTTCTCACTACTTCAAATTGGTGA CAAGTAATATCTTACACACACAAGGAGAGAACCTCAACATAAACGGGCAACTTACAATCA CAATTACAATTGTCTCCAAACACTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATCACCTTC TGTAAGAGCATCGTTTCCTGCTTCTCTTCAATTTGATTCGAATTATCCAACTGTTTTTCG TATTTGACGACGTGGGTGAA
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>LITCHI008939.m1 GenomeSequence + GGTTGATATAATAATAATAAGGTACAGAAGCTTTGATATTATGAAAAAAATAAAAAAGAA GAGAGGAACTGGGGTGGGTCCCATCCCAATCGCTCTTCCAGTTTCCCAGTTTTTCAACTT TCTCCTAATCTGAACGAACTGTATAGTTGGAACTGAACAAATCACATCAGGGCTAGTAAA AGTCCTCCACCTCCACAAAATAATATTAATATTTTTATTTCGAAAAAAAGAAAAAAAATC CCCGTACCATAAATACACCGAGTGCAGCCGAGGTTTCTTTCTCACTACTTCAAATTGGTG ACAAGTAATATCTTACACACACAAGGAGAGAACCTCAACATAAACGGGCAACTTACAATC ACAATTACAATTGTCTCCAAACACTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATCACCTT CTGTAAGAGCATCGTTTCCTGCTTCTCTTCAATTTGATTCGAATTATCCAACTGTTTTTC GTATTTGACGACGTGGGTGAAATGGAGGCTGTTGGAGCTAGATCCAGTACAATTAAGCCA TCGCTGGACCAAAACGCACTCGATTCACTGCAATTTAACGAAGAGATTCAACACTTGATG ACCGTACCGACGGAGAATGCCAACTCCTTCACCGCCTTGCTCGAGCTAACGCCGTCGCAA GCCATGGAAGTCCTCCACCATTCGCCGGAATCCGCCGCATCAGCAGCAGCGGCACCGCAT CACTACCATTTCTCTCCAGGGGTAAACCTGACTTCTCCCTCTAACATCGCCTTGATTGAA CGCGCCGCCAGACTCTCTGTCTTCGCCGACAATAACAACACCAACAATAACTCGCCGGAG ACGACGGGGTCGGTGCCGTCGAATTGGAGCGGGAATCTCGGGAAAGTGAAGTGCGAGCCG GCGGAGTCGGACTCCAACCACGACAATCCCAATTCGCCGCAGCCGAGTCAGAATCAGAAT CAGAAGTCGATTAAGAGAAAAGAGCGAGAGAAGAAGGTAAAAAAACATTAGGGTTTGTAG AGTCTGTTTTTCTCTTAGTGGCATTATCGTAAATTAATTGGGAAATTTGGGTAAATTTGC AGGCCAAAGCGGCGACAAAGAAGAGCAAAAGCGGTACAAATGAGAGTAGCGAAGATGCAG AGAAGCTTCCCTATGTTCACGTTCGAGCTCGTCGCGGTCAAGCCACTGATAGCCATAGCT TAGCTGAGAGAGTAATATTTTAATTGATTAATTATTTAATTAATTTAGTCAAACACTAAA TTAATAATCAGTAATCACATGTTTAATCATTTAATTATTGATTGATTATGATTACAGGCC AGGAGAGAGAAGATTAATACTCGGATGAAGTTGCTGCAAGATCTGGTCCCAGGATGCAGT AAGGTTGGTGCATATTGGTGATTGTTTTCTCCTTTTTTTTTGAAAAAAAAAAACTTTTTA ATTAATCATTTGATTAAGATTTTTTTGGATTTAATTAAAGAATATTCTGACTAAGAAAAG TGGAAATTATATCTTTGTTGAGCTTAAGTGCTCTTTTGCTAACGGTTTTGTCACTGTCAC GCTTTTTTTGCTTTTTTAACATAAGTGGATGCTTTTTGTTAAGATGGTCTTGTCAAAGGC GGGCGATAAGGTAATTTCATTAGTGTACCTCGATATTTGGGTCGGGTAGAGTTTGGTAGG AGACCCTTTTGAGATCGTTTTTTTTTAAATAATTTTTTATTTTAAGGACTGACTTTTGAG GTCAGTTTTGTCATTGGGAATTAATGGTTTATTTTATTAAGAAGAAACCGATTGTTTTTA TGTTCTTTTGCAATAGAAAGATTGTGCATCTTTTAAATGACTATAATGCCCTTGAATGGG TTCTAGACAGGAAAATCTGCTTTTGGTGAGTGCTAGCTGGATTGAAAATGCTTAGGGGAC ACATGCTTAGTGGCGTTGTGTTGGATCAAATTCGTTTCTGGGTCCCATTCCTTTGACATC AAAATTTTGATGCTTATTAGGCAGATGCATAGTGTTTACTTCACTTACAAGTTTGGTATC GGCCGGTAACGGGACGGAGAAATGAGACAAAAAATGATTCCTTGTACAAACTCATATGCC AAACTGGCATACCTAACTGCTAGAAGACATGATGTGATTAGTCCCCACGGACACGATAAA GAAGTTTCCGCTACTTGGCAAAGACTAGATGATTGTAATTGTCCATTTAAGTTGAACTGT AACTTTAGCCTAATTAATCGAGCTTTAGTCCTCTGTTCTTCCCCTTCTATTTTTTTAAAA GGATTTTGAATGGATTAAGGTTGAGGCCCATTTGAGTTTCTCAATAGGACCCTGCAATGG CCATACCAAAACATTTATCTACTACCCGTTATGTTTGTCATTAATTGTTATCCTCTCTTG ATCGATAAATGCCTTTGAAATCAAACCGACACAGGTTTTTTTTTTTAAATAAATTTGTGA GTGCTAATATGTTGTACTAGACATATAGCTTCTTCTTATCACATTTTGTTATATCTTATC TTAACTGAATGAATGGGTTAGAAACCTGTTTCGGTTATCTATGTACAGCAGTTTGAAATT TGAGATAATTGAATTTTGTGTGAGATTGCTCTGAAATAGCTGAAACTATCGAATTTGTAA ATATCTAATCTGAGAAAATTATGCTTTGCAGATTTCTGGTACAGCATTGGTTTTGGATGA GATCATCAACCACGTGCAGTCTTTGCAGCGTCAAGTTGAGGTCAGACCAAGCTTCTCAGT CATCAGATTTTCTCACTGCCTTTTTTTCTCCTCATTGGACAATGCAATGAGATGGTTTGA AATTGATAGGGCTTTGATAGGTAACATTTGTTCATAGGGTTTGTATGTTGAACTTCTCAG TCAACATATCTTCACTTCGGCAGAATATCGGAGCATGGGGTGGTGGCAGGACCTTTCTAG TTTACTGAATCCCCAAATTTGTATATTTTTTAGTAATTTTGGCTATCTAAATATTCAAAA TTTTAGTTGCCATTTTCTGTAAAGAAATTGCTTTCCCGAAAACATAGAAACTCAGATGGC CAGTGAATATCATCCTAGGTTTTGTTGGTTAGTTTCCGTTGGGCTAAGCTGCTTTAATTT GTATCTTAATCCTCTCTTTGCATGGCTATTGCTTCAAATGTTTCAAATTTTTTTTTGATA ATGTATTTATTTTCTTCTGTTGCTTTGTTTGCTGTGATTTTATTTTTTATTTGTATTTTT CTTTGGTTTCAGGTCTTATCAATGAGACTTGCAGCAGTCAATCCAAGAATTGATATCAAT CTTGACAGTATACTGGCTGCAGAAGTAAGTATGAAGTGTCTTATCTCTTATTTTTTTTCC AATTCAAGCAACAAGCAGCTTTAGCAAGGTGTAGACTTGTTAAGTTTTGCCTTGGTTTAA TCTAGAAGCATAGTTCTATTTTCCTTTAGAGAGCTGATTCATGATGTAGCATTCCTGAAA TCACTTTTAGCAGTTGGATTGTTGATAATATTCTTGGTTGTGTAACTTTTGGCAAATGAG TGTACATTTTGTTATGTTGGTGGAATGGGGAATAGAAACTTTTTTACTTCTGATATGGCT CTTTAGATGAGACTGGAATTAGTTTTTTACTTTAAAGGATAGGTTTCTTCATTAATGTGC ACAGGGCAGTGGGTCAGACTTGGACCATCTTCTTTTACCTGCCAATTTTACAGTTTCAAC TATTTGTTAGAATGCAATTCATCATGATGGTACCCAATTTAAGCTAAATGCCTTCAAATT GTAATCCTGTAGATATTATTAGACCTGTATGCTATGTCGTGTGGTCCCGCATTCATTGGG TATCGCTAATGTTTATGATTGTTTTTAAAACTTGTAGAGTGGATCTTTAATGGACAGTAA CTACCCAGGGATGGTCATGCCTCTAATGTGGCCTGAACCCCAAGTTAATGGAAACAGACA ACAGTATGAACAGCAATGGCACCTTGATGCGCATCACCAGCCAGTTTGGGGAAGAGAAGA AAGCCAAAACTTTGTGACTCCAGAGAACTCACTTTTGAGTTATGACTCCTCGGCAAATTC AGGTAGAAATAAGATATTATTGTCTATTGTGACAAATTGCACATTTATATAGCACTAGAC TTGATTACCAGAGTAGAAAGGAATCTGAGATACTTCAGTTTTTATAAAATTTATTAACGA ATGACCATTGGTGCTTTGAAGAAAATTTAAGGGGAAAAAAAAAGTTGGATGACTATCATT TCTTATCCTCAAGTTTTAGTATTTATTGTTTTACAAATATCTATTTTAAAAAATCCCTTT TTCAGAAAGAAATGGTTACAGAATTTGATTAAATTTTCCAAGGATTAAATTTTGTCACAA CTTTCCTTTGCATTGAAGTTGTTGAATGGAATTTTATTCTACTTGATATGCTGAAGGCAG ACTTTTTGTTTTTAAATGTTTACTTGTTTAAACTTTGATTTTAAAATCTAACATCTATCA GCGTCGGTATAGGTGTGGATATCATAAGAAGCAAATGATCTGTTGATTCTCTTTTAATGA GAAAACATGTTTAAACCATGAGACTAACTTGGTATAGTTATTGTGGTGCAGCATCTTTGC ACTCAAATCAACCGAAATGGAGATATGAAAGCAAGATGAAGTTCAAGCGGTAG