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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008931 | Chr7 | 19846099 | 19847572 | + | Auxin response factor 18 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008931.m1 | 18 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 38.8 | 6.90E-10 |
LITCHI008931.m1 | 123 | 179 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 34.7 | 1.70E-08 |
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>LITCHI008931.m1 ATGAGTCTGAATTCTGTTAGTTCTAATACTGATTCAGAGAAACCAGCCTCTTTTGCTAAG ACTTTAACCCAATCTAATGCCAATTATGGGGGTTGCTTCTCTGTGCCTAGCTATTGTACT GAGACTATATTTCCAAGGTTGGATTACACTACTAATCATCCTGTGCAAACTGTGGCGGCT AAAGATGTTCATGTTGAGATTTGGAAGTTTAGGCATATTTATAGAGGCACCCCTAGAAGG CATTTGTTAACTACTGGGTGGAATACTCTTTTTAATCAAAAGAAACTTATTGCTGAGGAA TTTAAAGAGAAGGGGTGGTGGGGAGGGGTTCGGGTGCTGATGGGAAACAAAGTGAAGCCT GAGGCAGTGGCGCTTGCAGTTGGTGGGCAGCCATTTGAGGTTGTTTATTATCCTGGGCAA CCATCTGAGGGCGGTAATGATCATTGGTGTTCTGGAATGAGATTCAAGATGGCTTTTGAA ATGGAGTATTCTTGTAAGATAAGTTGGTTTATGGGGACTATATCATCTGTGCAGCTAAAA GGAATATCATCCTCATCTCAACGGACAAGAACCACATGCATAGCATTCTACCTTGAGAGT CTTGTTAGGGCATCTTTGTCGTCAATAAATGAGTAG
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>LITCHI008931.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCTTCATCAGGATTCGCGACACGCGGTTGGGTTTTAATATACTAAGTAGGAATGGGTTCT ATGTTAATAGAAGATTGTTCACTCTGGTAAGTGTCTGGGTCGGTAAGAATATGGACTGAC TCATTTTCTGTTGACTAAGAAAATGATGGGGCTGATGAATCTTCTAAGAAGGCTGAGTTA TCAAGTTTTATTGAAACCTTCATTCGAGGAATTTGTTAAGGTGCCATTTCTTTCAGCATT GGGGTTATAGGATTTTATACCACAAGTTGCATTGGATTTTGTTGATCTGAAATGTCAGGA TCATTAAGTTCCATCTTTTTGGTGGATGTTGATGTAGAGATTTGAGTTTGCTTACCTTTC TTCTTAAGAAGTCTTGCTTACTGGTATTGCTTTTCTCTATCTTTTCAGAGTTTAACATGT AATTGCTTAATGGCTCCAAAAGCAATTTCTATATTGGATAGAGTGTTTGGTACAGCAAAA GGCTGATTGTATTTGGAGAAGATATGTATGGAAGAAGGATTCCATGTGATGTTATCAAAA GGATTATACAACGACTGAACTGGTTAGAATGTCTCTATAGATTATCGATAGAATTCTTGT TGCAAATAGGCAAGCTAGGCTTTGAGATTACCCATTTCTGCATTTTTTTGGAGGAAAGTA GATAAGAATCCTTGAGGAGTATGGGCTAAATGCATTAGCTCATTATAAAGCTCTGTAATC TAGTTCTGAGCCTGTTGGATAATTTTTGCTATCCATTGTGCACTAGAGTCTACTTGAAAA ATGACAAGATCGATATTTTGTTCGATTCTATGCATAACTCTATTTTGTGTTATAACGTTT TCAAATTGCTAATTTAATATAGCCTATGCTTGTGATATTGGTTTGACTAAACCATCTGGT TGTATGGTCTAAGAAGTGTTAACCTTTCGCTTTTGGTTTTGTGTTTCCTACAAAGAGGGA AAGTTTTCTTCATGGTAGATTCACTTAAAATAATTGTCTCAGATTGTTTGAAAGTAGTCT CATAGTTGGTTACCTCCTATTCTAGTAATAGCTGTATGAGTTCTTCTCTGCTGATTTGTC AAGGTACTAATACATAATGGGGAGTCCATTGTAAATCGACCACAAGGATCAAGGCATCAA TGCTAAAAGGAAGGGAAAGATCAATGGCATGATCTTGGAGTCTCCATACCATCTAGTAGT GTAGACTGGCTTGAATAGATCCAATTTTTCAATTCGCACTAGTGATTTGTGCTTGAATTT TAAGAGCTGATGAGCAAAACTCATCTGCAAGGGACATGTTGAAATTAGGATATAGGGTAA GAACCACTGTTCCTGCATTCCGAGTTGTCTAGAGGGTTCCTATGCAAGCATGTATATATT CATCATATCTAGTGTCTAAGAGGGCAAGCCTGACAGAAACAAGGAGACATTTTCTGTCAT GACAGGTAATAGCTAAATGGATTGCTCCAAAATGGATATGGCAATATCCTTCATATTTCT ATTGTTGAACGGAAGATTGAGGGATTTTCAATGTGACATATTGTTCTTGAGGAGTTGCTA ACAAAGGACAGTTGTCGAATTTACTACACATATCATATACTGAATATATTGAATTAGTCT TTAAATCATTTTGGTAAAATTACTTATTTAAAAAATATATATTGAATTAGATATTGAGAT TGCTTAAAATGTTTCTTAAGTAAAGAATCATATCATATATTCTTATACATTATAAGTCCT GGAAAATTTTTGAAATATTAGATCAAACAAAATTTTTATTGATTATATTGAAATTGTAAT TTGTTCTAATGAGAGTTGTGGTTGAATGTTGTGACGTTTTACACGTTTCTCTTGTGACGT GTTTAAGTTTTCAAAATGATTCTTTGCCGTGTGACTTGTCTCAAGTTCCTTGCGTATTTG AAACCGATCAAGTGTATGCAAAGATAAGCTAGTTCCATTACCAGTACTAATGTGCTGATT TTGAAGAGAACAACAATAAC
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>LITCHI008931.m1 GenomeSequence + ATGAGTCTGAATTCTGTTAGTTCTAATACTGATTCAGAGAAACCAGCCTCTTTTGCTAAG ACTTTAACCCAATCTAATGCCAATTATGGGGGTTGCTTCTCTGTGCCTAGCTATTGTACT GAGACTATATTTCCAAGGTTGGATTACACTACTAATCATCCTGTGCAAACTGTGGCGGCT AAAGATGTTCATGTTGAGATTTGGAAGTTTAGGCATATTTATAGAGGCACCCCTAGAAGG CATTTGTTAACTACTGGGTGGAATACTCTTTTTAATCAAAAGAAACTTATTGCTGAGGTT CAATTGTGTTCTTGAGAGCCCAAAATGGGGATCTTTGTGTTGGGATAAGAAGGGTTAAGA AGGGATTTGGGAATGGAATTGACTCTCCTTCTTCGGGTTGGAATTCGAATAGTGGAAGTG GTGTTAGTGTTGGTATTAGTCCTTATAGAGGGTTTTCGTGTTTCTTGAGAGAAGAAGAGA ACAAGATGATGAGAAATGGAGCTACGAGTTCTAACAATTCTTATAGGAATTTAAAGAGAA GGGGTGGTGGGGAGGGGTTCGGGTGCTGATGGGAAACAAAGTGAAGCCTGAGGCAGTGGC GCTTGCAGTTGGTGGGCAGCCATTTGAGGTTGTTTATTATCCTGGGCAACCATCTGAGGG CGGTAATGATCATTGGTGTTCTGGAATGAGATTCAAGATGGCTTTTGAAATGGAGTATTC TTGTAAGATAAGTTGGTTTATGGGGACTATATCATCTGTGCAGGTTGCTGATCCCATCTG TCGGCCTAATCCCCTTGACGGCTCCTCTAATTATAATTTCTTTTATCTGATAAATATTTC TTTATATAACATGTTGGATTGTTAATGTTTTGACATTAGCATCTCATTTACTGATCCATA TTAAGTTTGTGAATGTCTTTGTTGGGTTAATTAATTAAACTTGATTAACTTAATGCTATT TAAACTATATGATCCCTGTCATTTACTTATGTGAGCCCCTGATTTGCGACAGTTTAGATG AAGTAATCTGTCGATTAAGTGAAGTGATATATATGATCCATAATATACGAGTTCATTGAT TCTTCATTTTAAAGTATGTATATGCATATACATAATTAGTTGCCATTTTTTTCTTCAGAG TTAAACTCTTGAAATTTACATTGTATGCCAATTCCACTCCTTGAATGGTATGGCGTTAAA GCCGATTTGTGACATGACTCGTGGAATTCAATAGCTATCAATTTCACTGAGGTCCATGAT AGTATTACCGGACAATATTTGTTACATTATTAAAATGTATTTATACTCCAATTGAAGTAG ATGAATTCATTCCTAAGTGTTGGGTTATGTCCGGTGTACTTACGTGTTCCAGCTAAAAGG AATATCATCCTCATCTCAACGGACAAGAACCACATGCATAGCATTCTACCTTGAGAGTCT TGTTAGGGCATCTTTGTCGTCAATAAATGAGTAG