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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI008918 | Chr7 | 19556282 | 19561513 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 30 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI008918.m1 | 80 | 156 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 46.1 | 5.80E-12 |
| LITCHI008918.m1 | 88 | 139 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 29.8 | 7.00E-07 |
| LITCHI008918.m1 | 88 | 116 | PF13606.9 | Ank_3 | Repeat | 19.2 | 0.0013 |
| LITCHI008918.m1 | 89 | 116 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 21.7 | 0.00021 |
| LITCHI008918.m1 | 125 | 156 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 24.5 | 2.80E-05 |
| LITCHI008918.m1 | 308 | 328 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 22.7 | 7.40E-05 |
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>LITCHI008918.m1 ATGTGCTGTGGACAGGAGCGGTTAAATCTCAGGCCGTCTCCAAAACCATCTATTATTTCT TTTGACGAAAGTAGACCTACGAACATAGACATGAATCACTTGACTGTTGAGACAGACGAT ACTTTTGCAAGCTTGCTTGAGCTTGCGGCTAACAATGATGTCGAGGGCTTCAAGCGATCA ATTGAGTGTGATCCGTTGGGTGTTGATGAGATTGGATTATGGTATGGCCGGCAGAAGGGC TCGAAGCAGATGGTAAATGAAGAGAGGACTCCGCTAATGGTGGCTGCCACATATGGTAGT ATTGATATCATTAGGTTGATTCTTTCTCAATCTGATGCTGATGTGAATAGGTCTTGTGGC AATGACAAGAGTACTGCCCTTCATTGTGCTGCCTCGGGTGGAGCAGTGAATGCCGTTGAT GTTGTGAAGTTGCTCTTAGCTGCTGGTGCTGATCCGAATTTGGTGGATGCAAATGGTCAT CACCCTGTGGATATAATTGTTGTTCCTCCTAAGTTCCAAGAGGTTAGACTGGCACTTGAA GAACTTCTTGCTGCTGAAGGCACTGTTGTTGAGCGTAATCTTAGGGTGTCAACAGCTCAC TCTAATTCTAATTCTAATTCACCACCGTTTTCACCCACACTTGAAAATGAATCACCAACA TCAGCTTTGGATTCCCCTATGAAGTCTAAGCTAAATGATGTTCCTATGTCTTCTACATCG GAGAAGAAAGAGTACCCCATCGACCCATCTCTCCCAGACATCAAGAACAGCATCTATTCT ACTGATGAATTCCGGATGTATTCATTCAAGGTGCGGCCTTGTTCACGTGCCTACTCTCAT GATTGGACTGAGTGCCCATTTGTGCATCCTGGGGAAAATGCTCGAAGGAGGGATCCTAGA AAGTTTCATTACAGTTGTGTTCCTTGTCCTGATTTCCGTAAGGGTGCTTGTAGACGTGGA GATATGTGTGAATATGCTCATGGTGTTTTTGAGTGCTGGTTGCACCCAGCTCAATATCGA ACTCGGCTTTGCAAGGATGGTACAAATTGTGCCAGGCGAGTCTGTTTCTTTGCACACACT CCTGATGAACTTAGGCCATTGTATGTGTCCACTGGTTCAGCCGTCCCCTCTCCTCGCTCA GGTACCTCTGGTGCTAATGCCATGGACTTCGCTGCGGCATTGAGCCTTTTACCTGGCTCT CCTTCATCAGTTTCTGTCATGTCTCCTTCACCATTTACCCCACCAATGTCTCCTTCTGCC AATGGCATGTCGCACTCAAATGTGCCTTGGCCCCAACCAAATGTCCCTGCTTTGCATCTT CCTGGAAGCAATCTCCAATCCAGTCGCTTAAGATCATCTCTTCATGCAAGGGACATTCCT GCTGAAGACTACAATTTGCTGCCAGATTTTGATGTACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTG TTAAATGAGTTATCTAGCCTCTCACAACCATCTTTGAGTTCTAATTCCTTGAACCGTTCT GGTAGGTTGAAAACTCTAGCTCCGTCAAATCTTGATGATTTGTTCTCTGCTGAGAGCTCA TCTCCCCGGTACTCTGATCAAGCATTGGCCTCTGCAGTTTTCTCTCCGACACACAAATCT GCTGTTCTTAATCAATTTCAGCAGCAGCAGCAGACCATGTTATCACCAATCAATACAAGT TTTTCACCTAAGAATGTCGAACACCCTCTATTGCAGGCCTCTTTTGGAGTGCCATCATCA GGGAGGATGTCTCCTCGAAACGTGGACCCTATATCACCCATGAGCTCAAGGGTTTCCTTG TTAGCTCAACGTGAAAAGCAGCAACAGTTTCGCAGCCTCAGCTCTCGTGAACTCGGCTCC AACTCTGCTGCTGCTGCTGTTGGTTCTTCGGTTAATTCCTGGTCAAAATGGGGTTCCTCC AATGGGAAGCCAGATTGGGCTGTAACTACAGATGAATTGGGTAAGCTTCGGAGGTCATCC TCATTCGAGCTTGGCAATGGAGAAGAGCCTGATCTGTCATGGGTTCAATCGCTTGTTAAA GAATCACCAACTGAGGTGAAAGAAAAGGTAGCTACACCTGCCTCGGGTGTCACTGCTGTC CCTTCTTCAAGTGAGGGTTCAAATATGAACCCCCAAATTGACTCAGTCGACCATGCTGTT TTGGGAGCGTGGATTGAGCAAATGAAGCTAGATCAGCTTGTGGCTCAGCAAAACTGA
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>LITCHI008918.m1 MCCGQERLNLRPSPKPSIISFDESRPTNIDMNHLTVETDDTFASLLELAANNDVEGFKRS IECDPLGVDEIGLWYGRQKGSKQMVNEERTPLMVAATYGSIDIIRLILSQSDADVNRSCG NDKSTALHCAASGGAVNAVDVVKLLLAAGADPNLVDANGHHPVDIIVVPPKFQEVRLALE ELLAAEGTVVERNLRVSTAHSNSNSNSPPFSPTLENESPTSALDSPMKSKLNDVPMSSTS EKKEYPIDPSLPDIKNSIYSTDEFRMYSFKVRPCSRAYSHDWTECPFVHPGENARRRDPR KFHYSCVPCPDFRKGACRRGDMCEYAHGVFECWLHPAQYRTRLCKDGTNCARRVCFFAHT PDELRPLYVSTGSAVPSPRSGTSGANAMDFAAALSLLPGSPSSVSVMSPSPFTPPMSPSA NGMSHSNVPWPQPNVPALHLPGSNLQSSRLRSSLHARDIPAEDYNLLPDFDVQQQQQQQL LNELSSLSQPSLSSNSLNRSGRLKTLAPSNLDDLFSAESSSPRYSDQALASAVFSPTHKS AVLNQFQQQQQTMLSPINTSFSPKNVEHPLLQASFGVPSSGRMSPRNVDPISPMSSRVSL LAQREKQQQFRSLSSRELGSNSAAAAVGSSVNSWSKWGSSNGKPDWAVTTDELGKLRRSS SFELGNGEEPDLSWVQSLVKESPTEVKEKVATPASGVTAVPSSSEGSNMNPQIDSVDHAV LGAWIEQMKLDQLVAQQN.
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>LITCHI017143.m1 AAATGATCTAAAACTCGGAAGAATTTACGCTACAGTTGCTTTTACATCTCCGAATCTTCC AACCTTAATAAAAAAAAAAAAAAAATCTTCAATATAAGGTCAATAGTTACAGTGGCCCCA GTCTGTCTAATTGTTATGGGTCCCATGCAAATCCGGCCCTTTTTTCAGTTGCGTCTTGGA CTCTTCCAAGACCCAAGCGACTGCGTTCACCTTGTACCTATCAATCACTCCCTGGCCAAA ACAAATTTCATTTTTCAAATTTTTTACAATTTTTTCAAATATTCAAAAAGTATTAAACAT CAGCCGTCGATCGAAGCATTGTGTCAAATCAAACCTCATCTGGGCTGTACACGTGCACAA CGCGCAACAAGCCAAGACCATATCCCTCTCGGTCTCGAGTTTCATTAGCGCCAAATTCCA CTCCAATCACTTTCCTATAAATAACCTAAAGATGGCTCAATCCAACGGCTGATGAACGCT CACCTCTCTCATGCCGAATCTCATCCGTCAACCGAACTCTTTCAATTTCACCCGTCCGAT CACCCCTCCCCTCTATCCAACCGTTAAATATTCAGCAAATTCAATTTCAAAGAGTGTGAG AGGGAGAGAAGAGCAAACAAAATAAAAAAGCTTCCTCTTCGTTCCTCTTTCTCGACTCAC AGCAGTAATTCAGATCATCAGATTCCATAAATTCACAGAAAATCTACCGCGCCATCTCGC ATTCACAAGTCGGTTGAAGCTGAAAGGTCACCGTTTTCGATTTTTTTTTTTTTGTTTTTT CCTGGAAAATCGAAAAAATTCCTGTTTGTTCATTTGTTATTAGTAGCTGTTAAATTAAGA TGAATTATAGAGATTTTTTTAATTGATTTTGAATTGACTTTCGACGACTAAAGCAGCTCA AAATCGGCATTGATAGAAGTGGCGATTTAAGGCAGATTTTGGATTTAGACTAATTTATAT 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GTCATTGCAGAAATTCTCGATGCTTGAAATTGTACTGTGAGTGCTTTGCTGCTGGGGTTT ATTGTGATGGATGCAATTGCACAAATTGTCATAATAATGTGGAGCACGAGACTGCTAGGC AGGAGGCTGTTGGAGCAACTTTAGAGCGTAATCCAAATGCGTTCAGACCAAAGATAGCTA GAAGTCCTCATGGATCTCAAGATGCTAGGGAAGATGCACAAGAGGCTCAACTAGCAGCAA AGCACAATAAAGGATGTCACTGCAAGAAATCAGGATGCCTTAAAAAGTACTGCGAGTGCT TCCAAGCTAATATTCTGTGCTCTGAGAATTGTAAATGCTTAGACTGCAAAAACTTTGAAG GAAGTGAAGAACGAAGAGCTCTTTTTCATGGAGATCATAATGCATTGGCCTTCATGCAAA GAGCAGCCAATGCGGCAATCAGTGGGGCCATTGGCTCATCTGGATATGGGACTCCTCAGG CATCAAAGAAAAGAAAAAGTGAGGAACTCTTTTTTGGTGTAGCAGCAAAAGATCAATCCA TAAACAAGAATGGACCAAGTAAACAGGAAAACCATCTACAAGTTTCTGCTGCCTCTTCTT CTCAATCTGTCCCTGTTTCTCGGACTGTCAATACAGCAGTATTGGGATCTTCAAAATTTG CATACAGATCTCCATTGGCGGACATCCTGCACTCAAAGGACATGACGAAGCTGTGCTCAC TTTTGGTCGTAGTTTCATCTGAGGCTACACAGACACTTACAGAAACAATGGGCGAAATGG ATGGACAAACAGAAAGAGATAGTACTAGAATTTCTCTTGCTTCGCCCATTCAGGAGAGGA AAGATTGTCAGAAGGAGAATGAAGTTCATAATGGTGTGCCTGATGATCATACAAGTAGGA ACCTAATGGATAAGGATGGAATCAATGGTTCTGGTTCAGATGGTTGTGAAGTTCAAAATG 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>LITCHI017143.m1 - Up_Stream_Len 2000 GGAGAGATAATTTATTTTAAAAGGGATAATACAATGAGTAAATTTGATTGTGGTTCTTAT TTTCAAGGTTAGACGTCCTGATTATAAAAGTTTCATATATATATATTTCCCAATACGTAT TGATATAATAAGTTTAATGTTTTAATTATTAGTTATTAAATTTATTTATTTTTGCTTGTA CAACCACTTATACTTAATTAATGGTCCAAATACAAAACACTGACTTAATTTATTTTAACA TGTATTGAAATGAAAAATATATATAAGGTAATAAGGATTTAGCAAGATTTATTGAGATTA CATATTATAATGTGGCCACAAATTCTATTATCATAATACCATAGACATATGATATATTTT GTTGTGTATATTAGAACTTAAGCCCTATTATAGACGTAAATGGAAAATATAAAATACATT AACCTCTTAGGTTGTGAGTGTATGTGCATTTCAAATATATATTTGAGGCCAAGAAAATTT TTCCAAACACATGTTTTAATCAGACTTAATCATGTATGTGTGTGTGTATATAAAGTGGCG TCATAACATGTGTTAGTGAAATCTTCGATGGCACTAGTCACATGTTTGAAATTTGCAACT GAAGTCAATTTGAATTCTGTTATAATTTCAGATCTATCACATTAAAAAAACTTGCATGAA AAAGCTCTCATACATACTTGTAAAATATATAAGATAAACTTTGAAACCTATATCATAAAG AATTATAATGTTACATTTCTCAAAGATTTTATCTAAATAATATGATAAATTGATTTATAT TTATCATATTAATTTTGAAATAATGTATTAATAATATAATGGTTACGTATATATAAGATT ATTATATTATTTAGATAAATTTTTGGATAGTGTAATATTATCTATCATATATAAATTGTG CACCCAATCCATTATATTTAACAGCAACAAATTGAAGTAATAAATCTTCTTTTTTTTTTT GAAGTACGAGGTAATAAATTCGTATCATAAAGTCAATTATAATCTTTGATTCATAAATGA TCTAAAACTCGGAAGAATTTACGCTACAGTTGCTTTTACATCTCCGAATCTTCCAACCTT AATAAAAAAAAAAAAAAAATCTTCAATATAAGGTCAATAGTTACAGTGGCCCCAGTCTGT CTAATTGTTATGGGTCCCATGCAAATCCGGCCCTTTTTTCAGTTGCGTCTTGGACTCTTC CAAGACCCAAGCGACTGCGTTCACCTTGTACCTATCAATCACTCCCTGGCCAAAACAAAT TTCATTTTTCAAATTTTTTACAATTTTTTCAAATATTCAAAAAGTATTAAACATCAGCCG TCGATCGAAGCATTGTGTCAAATCAAACCTCATCTGGGCTGTACACGTGCACAACGCGCA ACAAGCCAAGACCATATCCCTCTCGGTCTCGAGTTTCATTAGCGCCAAATTCCACTCCAA TCACTTTCCTATAAATAACCTAAAGATGGCTCAATCCAACGGCTGATGAACGCTCACCTC TCTCATGCCGAATCTCATCCGTCAACCGAACTCTTTCAATTTCACCCGTCCGATCACCCC TCCCCTCTATCCAACCGTTAAATATTCAGCAAATTCAATTTCAAAGAGTGTGAGAGGGAG AGAAGAGCAAACAAAATAAAAAAGCTTCCTCTTCGTTCCTCTTTCTCGACTCACAGCAGT AATTCAGATCATCAGATTCCATAAATTCACAGAAAATCTACCGCGCCATCTCGCATTCAC AAGTCGGTTGAAGCTGAAAGGTCACCGTTTTCGATTTTTTTTTTTTTGTTTTTTCCTGGA AAATCGAAAAAATTCCTGTTTGTTCATTTGTTATTAGTAGCTGTTAAATTAAGATGAATT ATAGAGATTTTTTTAATTGATTTTGAATTGACTTTCGACGACTAAAGCAGCTCAAAATCG GCATTGATAGAAGTGGCGATTTAAGGCAGATTTTGGATTTAGACTAATTTATATGTTTGT AGAATTTATTTTGAAAAGTG >LITCHI017143.m2 - Up_Stream_Len 2000 GGAGAGATAATTTATTTTAAAAGGGATAATACAATGAGTAAATTTGATTGTGGTTCTTAT TTTCAAGGTTAGACGTCCTGATTATAAAAGTTTCATATATATATATTTCCCAATACGTAT TGATATAATAAGTTTAATGTTTTAATTATTAGTTATTAAATTTATTTATTTTTGCTTGTA CAACCACTTATACTTAATTAATGGTCCAAATACAAAACACTGACTTAATTTATTTTAACA TGTATTGAAATGAAAAATATATATAAGGTAATAAGGATTTAGCAAGATTTATTGAGATTA CATATTATAATGTGGCCACAAATTCTATTATCATAATACCATAGACATATGATATATTTT GTTGTGTATATTAGAACTTAAGCCCTATTATAGACGTAAATGGAAAATATAAAATACATT AACCTCTTAGGTTGTGAGTGTATGTGCATTTCAAATATATATTTGAGGCCAAGAAAATTT TTCCAAACACATGTTTTAATCAGACTTAATCATGTATGTGTGTGTGTATATAAAGTGGCG TCATAACATGTGTTAGTGAAATCTTCGATGGCACTAGTCACATGTTTGAAATTTGCAACT GAAGTCAATTTGAATTCTGTTATAATTTCAGATCTATCACATTAAAAAAACTTGCATGAA AAAGCTCTCATACATACTTGTAAAATATATAAGATAAACTTTGAAACCTATATCATAAAG AATTATAATGTTACATTTCTCAAAGATTTTATCTAAATAATATGATAAATTGATTTATAT TTATCATATTAATTTTGAAATAATGTATTAATAATATAATGGTTACGTATATATAAGATT ATTATATTATTTAGATAAATTTTTGGATAGTGTAATATTATCTATCATATATAAATTGTG CACCCAATCCATTATATTTAACAGCAACAAATTGAAGTAATAAATCTTCTTTTTTTTTTT GAAGTACGAGGTAATAAATTCGTATCATAAAGTCAATTATAATCTTTGATTCATAAATGA TCTAAAACTCGGAAGAATTTACGCTACAGTTGCTTTTACATCTCCGAATCTTCCAACCTT AATAAAAAAAAAAAAAAAATCTTCAATATAAGGTCAATAGTTACAGTGGCCCCAGTCTGT CTAATTGTTATGGGTCCCATGCAAATCCGGCCCTTTTTTCAGTTGCGTCTTGGACTCTTC CAAGACCCAAGCGACTGCGTTCACCTTGTACCTATCAATCACTCCCTGGCCAAAACAAAT TTCATTTTTCAAATTTTTTACAATTTTTTCAAATATTCAAAAAGTATTAAACATCAGCCG TCGATCGAAGCATTGTGTCAAATCAAACCTCATCTGGGCTGTACACGTGCACAACGCGCA ACAAGCCAAGACCATATCCCTCTCGGTCTCGAGTTTCATTAGCGCCAAATTCCACTCCAA TCACTTTCCTATAAATAACCTAAAGATGGCTCAATCCAACGGCTGATGAACGCTCACCTC TCTCATGCCGAATCTCATCCGTCAACCGAACTCTTTCAATTTCACCCGTCCGATCACCCC TCCCCTCTATCCAACCGTTAAATATTCAGCAAATTCAATTTCAAAGAGTGTGAGAGGGAG AGAAGAGCAAACAAAATAAAAAAGCTTCCTCTTCGTTCCTCTTTCTCGACTCACAGCAGT AATTCAGATCATCAGATTCCATAAATTCACAGAAAATCTACCGCGCCATCTCGCATTCAC AAGTCGGTTGAAGCTGAAAGGTCACCGTTTTCGATTTTTTTTTTTTTGTTTTTTCCTGGA AAATCGAAAAAATTCCTGTTTGTTCATTTGTTATTAGTAGCTGTTAAATTAAGATGAATT ATAGAGATTTTTTTAATTGATTTTGAATTGACTTTCGACGACTAAAGCAGCTCAAAATCG GCATTGATAGAAGTGGCGATTTAAGGCAGATTTTGGATTTAGACTAATTTATATGTTTGT AGAATTTATTTTGAAAAGTG
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>LITCHI017143.m1 GenomeSequence - AAATGATCTAAAACTCGGAAGAATTTACGCTACAGTTGCTTTTACATCTCCGAATCTTCC AACCTTAATAAAAAAAAAAAAAAAATCTTCAATATAAGGTCAATAGTTACAGTGGCCCCA GTCTGTCTAATTGTTATGGGTCCCATGCAAATCCGGCCCTTTTTTCAGTTGCGTCTTGGA CTCTTCCAAGACCCAAGCGACTGCGTTCACCTTGTACCTATCAATCACTCCCTGGCCAAA ACAAATTTCATTTTTCAAATTTTTTACAATTTTTTCAAATATTCAAAAAGTATTAAACAT CAGCCGTCGATCGAAGCATTGTGTCAAATCAAACCTCATCTGGGCTGTACACGTGCACAA CGCGCAACAAGCCAAGACCATATCCCTCTCGGTCTCGAGTTTCATTAGCGCCAAATTCCA CTCCAATCACTTTCCTATAAATAACCTAAAGATGGCTCAATCCAACGGCTGATGAACGCT CACCTCTCTCATGCCGAATCTCATCCGTCAACCGAACTCTTTCAATTTCACCCGTCCGAT CACCCCTCCCCTCTATCCAACCGTTAAATATTCAGCAAATTCAATTTCAAAGAGTGTGAG AGGGAGAGAAGAGCAAACAAAATAAAAAAGCTTCCTCTTCGTTCCTCTTTCTCGACTCAC AGCAGTAATTCAGATCATCAGATTCCATAAATTCACAGAAAATCTACCGCGCCATCTCGC ATTCACAAGTCGGTTGAAGCTGAAAGGTCACCGTTTTCGATTTTTTTTTTTTTGTTTTTT CCTGGAAAATCGAAAAAATTCCTGTTTGTTCATTTGTTATTAGTAGCTGTTAAATTAAGA TGAATTATAGAGATTTTTTTAATTGATTTTGAATTGACTTTCGACGACTAAAGCAGCTCA 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