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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI008918 | Chr7 | 19556282 | 19561513 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 30 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI008918.m1 | 80 | 156 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 46.1 | 5.80E-12 |
| LITCHI008918.m1 | 88 | 139 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 29.8 | 7.00E-07 |
| LITCHI008918.m1 | 88 | 116 | PF13606.9 | Ank_3 | Repeat | 19.2 | 0.0013 |
| LITCHI008918.m1 | 89 | 116 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 21.7 | 0.00021 |
| LITCHI008918.m1 | 125 | 156 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 24.5 | 2.80E-05 |
| LITCHI008918.m1 | 308 | 328 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 22.7 | 7.40E-05 |
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>LITCHI008918.m1 ATGTGCTGTGGACAGGAGCGGTTAAATCTCAGGCCGTCTCCAAAACCATCTATTATTTCT TTTGACGAAAGTAGACCTACGAACATAGACATGAATCACTTGACTGTTGAGACAGACGAT ACTTTTGCAAGCTTGCTTGAGCTTGCGGCTAACAATGATGTCGAGGGCTTCAAGCGATCA ATTGAGTGTGATCCGTTGGGTGTTGATGAGATTGGATTATGGTATGGCCGGCAGAAGGGC TCGAAGCAGATGGTAAATGAAGAGAGGACTCCGCTAATGGTGGCTGCCACATATGGTAGT ATTGATATCATTAGGTTGATTCTTTCTCAATCTGATGCTGATGTGAATAGGTCTTGTGGC AATGACAAGAGTACTGCCCTTCATTGTGCTGCCTCGGGTGGAGCAGTGAATGCCGTTGAT GTTGTGAAGTTGCTCTTAGCTGCTGGTGCTGATCCGAATTTGGTGGATGCAAATGGTCAT CACCCTGTGGATATAATTGTTGTTCCTCCTAAGTTCCAAGAGGTTAGACTGGCACTTGAA GAACTTCTTGCTGCTGAAGGCACTGTTGTTGAGCGTAATCTTAGGGTGTCAACAGCTCAC TCTAATTCTAATTCTAATTCACCACCGTTTTCACCCACACTTGAAAATGAATCACCAACA TCAGCTTTGGATTCCCCTATGAAGTCTAAGCTAAATGATGTTCCTATGTCTTCTACATCG GAGAAGAAAGAGTACCCCATCGACCCATCTCTCCCAGACATCAAGAACAGCATCTATTCT ACTGATGAATTCCGGATGTATTCATTCAAGGTGCGGCCTTGTTCACGTGCCTACTCTCAT GATTGGACTGAGTGCCCATTTGTGCATCCTGGGGAAAATGCTCGAAGGAGGGATCCTAGA AAGTTTCATTACAGTTGTGTTCCTTGTCCTGATTTCCGTAAGGGTGCTTGTAGACGTGGA GATATGTGTGAATATGCTCATGGTGTTTTTGAGTGCTGGTTGCACCCAGCTCAATATCGA ACTCGGCTTTGCAAGGATGGTACAAATTGTGCCAGGCGAGTCTGTTTCTTTGCACACACT CCTGATGAACTTAGGCCATTGTATGTGTCCACTGGTTCAGCCGTCCCCTCTCCTCGCTCA GGTACCTCTGGTGCTAATGCCATGGACTTCGCTGCGGCATTGAGCCTTTTACCTGGCTCT CCTTCATCAGTTTCTGTCATGTCTCCTTCACCATTTACCCCACCAATGTCTCCTTCTGCC AATGGCATGTCGCACTCAAATGTGCCTTGGCCCCAACCAAATGTCCCTGCTTTGCATCTT CCTGGAAGCAATCTCCAATCCAGTCGCTTAAGATCATCTCTTCATGCAAGGGACATTCCT GCTGAAGACTACAATTTGCTGCCAGATTTTGATGTACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTG TTAAATGAGTTATCTAGCCTCTCACAACCATCTTTGAGTTCTAATTCCTTGAACCGTTCT GGTAGGTTGAAAACTCTAGCTCCGTCAAATCTTGATGATTTGTTCTCTGCTGAGAGCTCA TCTCCCCGGTACTCTGATCAAGCATTGGCCTCTGCAGTTTTCTCTCCGACACACAAATCT GCTGTTCTTAATCAATTTCAGCAGCAGCAGCAGACCATGTTATCACCAATCAATACAAGT TTTTCACCTAAGAATGTCGAACACCCTCTATTGCAGGCCTCTTTTGGAGTGCCATCATCA GGGAGGATGTCTCCTCGAAACGTGGACCCTATATCACCCATGAGCTCAAGGGTTTCCTTG TTAGCTCAACGTGAAAAGCAGCAACAGTTTCGCAGCCTCAGCTCTCGTGAACTCGGCTCC AACTCTGCTGCTGCTGCTGTTGGTTCTTCGGTTAATTCCTGGTCAAAATGGGGTTCCTCC AATGGGAAGCCAGATTGGGCTGTAACTACAGATGAATTGGGTAAGCTTCGGAGGTCATCC TCATTCGAGCTTGGCAATGGAGAAGAGCCTGATCTGTCATGGGTTCAATCGCTTGTTAAA GAATCACCAACTGAGGTGAAAGAAAAGGTAGCTACACCTGCCTCGGGTGTCACTGCTGTC CCTTCTTCAAGTGAGGGTTCAAATATGAACCCCCAAATTGACTCAGTCGACCATGCTGTT TTGGGAGCGTGGATTGAGCAAATGAAGCTAGATCAGCTTGTGGCTCAGCAAAACTGA
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>LITCHI015752.m1 MDSLPRRRRRTARKNRFSSQQPKMRSTTDNSNSLSRRREASRERMDVGRTRDVSKSKQMR DESDAETSKEDEWPPSKKKKVPRGANGDVAGYVEGKSEKSVSKTGVKVEVGIRTDILLVN DKLKPKGCSGWKKGVFDMGAGWQQDRSKKVKRWSFMCHQCQRSDKNGVVFCSNCNKRFCY DCITNWYHPKTREEIQKACPYCCGNCNCKACLREVPVKVGVFSFSLMSIWHCYGKVENTF KLQQLQYLLYKSLPVLRHIHGELSSELEFESKLQGIQLIEEDIMRIELAKGERLYCDNCR TSIVDLHRSCPNPDCSFDVCLTCCQELRKIIQPGEAETSSPQILKSNIQKEKSGWQSQVA LVNDLIAETSSHSFGWKANADGSIPCPHKEHGDGGTTKLELRRLYNANWVTKLIKSAEDI TSCYKPPDVDFSERCCTCHRSGSEGNRNTNPEVRQAAYRNEGDDNFLYSPNAVNLTDHEI EHFRKHWMNGEPVIVRNSLDKTSGLSWEPLVMWRAMREMGANVRFEEETRSVRAIDCLDW CEVEINIRQFFTGYAKGRMHRNGWPEMLKLKDWPSSTSFEERLPRHCAEFFAALPYIDYT DPKSGLLNLAAKLPDNVLKPDLGPKTYIAYGFSEELGRGDSVTKLHCDISDAVNILTHTT KIKSDPWHHDKIKALQKIYVAEDFHEQYGGSDNAKGGTTRPMIKITYERRLKNAKCRKDM NSLENDHGGAVWDIFRRQDVPKLIEFLKKHKNEFRHINGLPVTSVVHPVHDQTIFLSDRH KKQLKKEFNVEPWTFEQHLGEAVFIPAGCPHQVRNRQVID.
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>LITCHI015752.m1 GACGTTCCGTCAAACTATAGGGTAAAATAGTATTATCCCAAGATTAAACCAAAGAGTGTC TAGGAATTTACCTCCAGCATAATAGAGACGCGACACAAGTCCACTTCAAAGAGTCATTTT CAATTTTCAGCTTTTATACAAATACTCACCGCCGCGCCTAAACCGTCACTCACCGCCGCG CATGGATTCACTTCCCCGTCGTCGGCGGCGCACCGCTCGGAAAAACCGTTTCTCGTCGCA GCAACCTAAGATGAGGTCAACTACCGACAACAGCAACAGTCTGAGCAGAAGAAGAGAAGC TTCCAGAGAGAGAATGGACGTCGGTCGAACGCGTGACGTCAGCAAATCGAAGCAAATGAG GGACGAGTCGGACGCGGAGACGAGCAAGGAGGATGAGTGGCCGCCGTCTAAGAAGAAGAA GGTTCCGAGGGGAGCGAACGGCGATGTCGCTGGATATGTCGAGGGTAAATCTGAAAAATC GGTGTCAAAAACTGGAGTGAAGGTTGAAGTGGGGATTAGGACAGATATATTGTTGGTGAA TGATAAGCTGAAACCAAAGGGTTGCAGTGGCTGGAAGAAGGGTGTGTTTGACATGGGTGC AGGGTGGCAACAGGATAGGTCCAAAAAAGTGAAGCGTTGGAGTTTCATGTGTCACCAATG TCAGAGGAGTGACAAGAATGGTGTTGTCTTCTGTTCCAATTGCAATAAGCGCTTTTGTTA TGACTGCATTACAAATTGGTATCATCCTAAAACAAGAGAGGAAATTCAGAAGGCATGTCC ATATTGTTGTGGCAATTGCAACTGTAAAGCTTGCTTGCGAGAAGTGCCTGTCAAGGTAGG TGTTTTCTCCTTTTCCCTCATGAGCATTTGGCATTGCTATGGTAAAGTAGAAAACACTTT CAAATTACAGCAGCTGCAGTACTTGCTGTATAAATCTCTGCCTGTACTTAGGCATATTCA TGGAGAGCTAAGCTCTGAGCTAGAGTTTGAGTCAAAGCTACAAGGAATCCAACTGATAGA AGAGGATATAATGAGGATTGAGCTGGCCAAAGGTGAACGATTATACTGCGATAATTGCCG TACTTCCATTGTTGACCTTCACAGAAGCTGCCCCAATCCGGATTGTAGTTTTGATGTCTG TCTCACCTGTTGTCAAGAGCTAAGGAAAATTATCCAGCCTGGTGAGGCAGAAACATCGTC CCCGCAGATTTTAAAGAGCAATATACAAAAGGAAAAATCTGGGTGGCAGAGCCAAGTGGC CCTTGTTAATGATCTTATAGCTGAAACATCTTCTCATTCTTTTGGTTGGAAAGCTAATGC TGATGGTAGTATTCCTTGCCCTCACAAAGAGCATGGGGATGGCGGTACTACAAAACTAGA GTTGAGGCGCCTTTATAATGCTAACTGGGTTACAAAGTTGATAAAAAGTGCAGAGGATAT TACTAGTTGTTATAAACCTCCAGATGTTGATTTCTCTGAAAGATGTTGTACCTGCCACAG AAGTGGTTCTGAAGGGAACAGAAATACAAATCCTGAAGTTCGGCAGGCAGCTTACAGGAA TGAAGGTGATGATAACTTCTTGTACAGCCCAAATGCTGTGAACTTGACAGATCATGAAAT TGAGCATTTTCGGAAACATTGGATGAACGGTGAACCTGTGATTGTTCGGAATTCTCTTGA TAAGACATCTGGTCTTAGTTGGGAACCTTTGGTCATGTGGAGGGCTATGAGAGAAATGGG TGCAAATGTCAGGTTTGAAGAGGAGACACGAAGTGTGAGGGCAATTGATTGCTTAGATTG GTGTGAGGTTGAGATTAATATCAGGCAGTTTTTTACTGGCTATGCGAAAGGGCGTATGCA TAGAAATGGGTGGCCAGAGATGTTGAAATTGAAGGATTGGCCCTCATCTACTTCATTTGA GGAGCGTTTGCCAAGGCATTGCGCTGAGTTCTTTGCAGCCCTTCCCTACATCGACTATAC TGATCCAAAATCTGGTCTTCTAAACCTTGCCGCTAAACTTCCTGACAATGTATTGAAACC TGATTTGGGACCCAAAACATACATTGCTTATGGATTCTCTGAAGAGCTTGGTAGAGGTGA TTCAGTAACAAAGTTGCATTGTGATATCTCTGATGCGGTGAATATTTTGACACATACGAC CAAGATCAAGAGTGATCCCTGGCATCATGATAAGATAAAGGCATTGCAGAAAATTTATGT AGCTGAAGACTTCCATGAACAGTATGGTGGTTCAGATAATGCAAAGGGTGGAACTACGAG ACCTATGATCAAAATAACTTATGAACGTAGATTAAAGAATGCAAAATGTAGAAAAGATAT GAATTCATTGGAGAATGACCATGGAGGTGCTGTTTGGGACATATTTCGTAGGCAGGATGT TCCAAAGTTAATTGAGTTCTTAAAGAAGCACAAAAACGAATTTCGCCACATAAATGGCCT TCCTGTTACTTCTGTCGTTCATCCTGTTCATGATCAAACAATTTTTCTGAGTGACAGGCA TAAGAAGCAACTGAAGAAGGAATTTAATGTAGAACCATGGACATTTGAGCAACACCTTGG TGAGGCTGTGTTTATTCCGGCTGGCTGTCCACATCAAGTGAGAAACAGACAAGTAATTGA TTGA
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>LITCHI015752.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCAAAACCAGATGTCAAATAGGACTTAATTTATTTATTTGAAGGAAATAGAACTTTAGTT TAAAACCCATAATTAATTTATTTATTTGAAGGAAATAGACCTTTAGTTTAAAACCCATAA TTGTTGTCTCAAAAAATTAAAAAATAAAAACAAAAACCCCATAATTGTGTATCAAGTTCA AGCCAAAACCCATTATTGGGTGACGCTTATATAAACTTGAAACTAATAAAAATTTAGTTT TGAAAAGGGATAATCCCAATTCCCCCTTATAGTTTAAAGTAATCATTAATTATTCCTTAT AGTTTCTAAAAATCTTATTTTACCCTTTCTATTAACTTTGTTAGTGAAAGGTGGATTCGA CCAACATAGTGTGCAAAAAGACTAAACCGCCCCTCGATTAAAAATAAAAAATATAATATA ATAAAATTTTTTTATGTAATAAAATTTAAAAAAATAAAAAAGTAGAGATTCAATCTTTTA GTGTACCGTATCTTTTTTATTTTTTTTTCTTTTTGAAGTATCAGTGTACTATATCTTGTT CTTCTTAACATGAAGAACATCATCATCATCCATTCAACCAACCTACACATCTTCACTTAT CTTCATTCAACCATCCATTCAACCAAACTATCATTAACAACAAATACCATCATCATCAAA CCCTCCAACACTGTAACACCAACATCAAACACAATAGCAACATAAAAAAAAATAAAAAAC AACACAACTTTATGAGTTTCCAATGCTGGACACTTAAAAATCTCTGGGTTTTCAATATTG AAAACTGAAGGATTTTTGGATTTTCGACGTGAAAACCTAGAAATCCATTGAAAACTTAGA GATTTTTGGATTTCAAGTAAAGATCAATAGCCTTATGCTCTGGAGACCCATAGATCTATG GGTTTCCAACGGAAACATAGTATGAGTCTCTATTGATGGAGATCATCGGAAACTCATAAA TCTATGGGTTTCCGACGAAAACTCAATTCGAGTCGCTTTCGATGGAGACCTCTGTCGAAA AAGAGAGAATAAGAAGAAGAAGAGAGAGAGAGAGGAAGAGAGAGACTAAGAAATAGAGAG AGAATGTTTTTAGCTTTTACTTTTTATTTTTTTATTTTTTGTTTTTTTTGAATTATGTCC ATCGTCCATCATGTTAATGGATGGTGGATATAATTTTTTTTAAAAAAATTATTAATATTT TAAATTTTTAGTAGTTTTGATCACAACCATTTATTTTAAAGATAGATGGTGATTTTTAAA AAAAATATTAAATTATCATTTTATTAAATTTAATATTTTATTTTGCTTTGATAGTTTTGT CTTTTCATATTAATGGTTAACCGTTGACTTTTAACGTTTAAATTGACAGTTTAGGGTTTT TTTAGATATTTTAATAAACTATAACGGTTTTTTATTTTTTAATATATTTTGGAATCAAGA CGGAGATATTAACAATTTCTTAAAGTGAGAGGGGATTTTGATTATTTCATCAAATTACAT AAAGAAATTAGGATAATTCTTTTTGAAAAAGATTAAAGAGATAATCCAACTTTTCTTTTC TAGTTTGATGTAATCCTTAATTACCTCCTATAATTTTGAAAAATTTTATTTTATCTCTCA TTATTATTGTCATTACTAAAATAAATGAAATGATCAAAATACCTCCATAGTTTTAGCTTT TTATATTAACAGTCATACTTAGATTTTTAACATCAATTTTAATAGTAAAAGATTTTTTTA AATATTTTCATATAGTATAAGAATATTTGATTTATTTTATAAATAAATATTAGTGATTTT AAAATATAAAAAAAATTTTGACGTTCCGTCAAACTATAGGGTAAAATAGTATTATCCCAA GATTAAACCAAAGAGTGTCTAGGAATTTACCTCCAGCATAATAGAGACGCGACACAAGTC CACTTCAAAGAGTCATTTTCAATTTTCAGCTTTTATACAAATACTCACCGCCGCGCCTAA ACCGTCACTCACCGCCGCGC
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>LITCHI015752.m1 GenomeSequence + GACGTTCCGTCAAACTATAGGGTAAAATAGTATTATCCCAAGATTAAACCAAAGAGTGTC TAGGAATTTACCTCCAGCATAATAGAGACGCGACACAAGTCCACTTCAAAGAGTCATTTT CAATTTTCAGCTTTTATACAAATACTCACCGCCGCGCCTAAACCGTCACTCACCGCCGCG CATGGATTCACTTCCCCGTCGTCGGCGGCGCACCGCTCGGAAAAACCGTTTCTCGTCGCA GCAACCTAAGATGAGGTCAACTACCGACAACAGCAACAGTCTGAGCAGAAGAAGAGAAGC TTCCAGAGAGAGAATGGACGTCGGTCGAACGCGTGACGTCAGCAAATCGAAGCAAATGAG GGACGAGTCGGACGCGGAGACGAGCAAGGAGGATGAGTGGCCGCCGTCTAAGAAGAAGAA GGTTCCGAGGGGAGCGAACGGCGATGTCGCTGGATATGTCGAGGGTAAATCTGAAAAATC GGTGTCAAAAACTGGAGTGAAGGTGGTGGATTCTTAAAAATTTTCATGTTTATGTTCTTT TGTTAAACTTTTTAATGATATTTTGTGTTTTGAGTAACGTTTGTTGAAAATGGAAGGTGA AGATTGTATTTTGGTTCGAAAATGAGTGAAATAGTGTGATATTGGACTATTTTTGACTTC ATTGTAGTGTTGTTTGTGTTTAGAGAATTAGATGCGAACTTGGATTGATTTTTCATTTCA TTGTGGTGTTATTTTGTGTTTTGAGTGACGGTTTAAGTAGCTAGTTGAAAATGGAAGGTG AAAAGTGAATTTTTTCTTTTAGCTTCATGGTGTAGCATAGTGTGAATGTGGATGTTTTTG GCTCTTGAATTGAATGGTTGCGCTGGGTAGCTGTAGGTTGAAGTGGGGATTAGGACAGAT 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