Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI008918 | Chr7 | 19556282 | 19561513 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 30 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI008918.m1 | 80 | 156 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 46.1 | 5.80E-12 |
| LITCHI008918.m1 | 88 | 139 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 29.8 | 7.00E-07 |
| LITCHI008918.m1 | 88 | 116 | PF13606.9 | Ank_3 | Repeat | 19.2 | 0.0013 |
| LITCHI008918.m1 | 89 | 116 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 21.7 | 0.00021 |
| LITCHI008918.m1 | 125 | 156 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 24.5 | 2.80E-05 |
| LITCHI008918.m1 | 308 | 328 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 22.7 | 7.40E-05 |
Download Copy
>LITCHI008918.m1 ATGTGCTGTGGACAGGAGCGGTTAAATCTCAGGCCGTCTCCAAAACCATCTATTATTTCT TTTGACGAAAGTAGACCTACGAACATAGACATGAATCACTTGACTGTTGAGACAGACGAT ACTTTTGCAAGCTTGCTTGAGCTTGCGGCTAACAATGATGTCGAGGGCTTCAAGCGATCA ATTGAGTGTGATCCGTTGGGTGTTGATGAGATTGGATTATGGTATGGCCGGCAGAAGGGC TCGAAGCAGATGGTAAATGAAGAGAGGACTCCGCTAATGGTGGCTGCCACATATGGTAGT ATTGATATCATTAGGTTGATTCTTTCTCAATCTGATGCTGATGTGAATAGGTCTTGTGGC AATGACAAGAGTACTGCCCTTCATTGTGCTGCCTCGGGTGGAGCAGTGAATGCCGTTGAT GTTGTGAAGTTGCTCTTAGCTGCTGGTGCTGATCCGAATTTGGTGGATGCAAATGGTCAT CACCCTGTGGATATAATTGTTGTTCCTCCTAAGTTCCAAGAGGTTAGACTGGCACTTGAA GAACTTCTTGCTGCTGAAGGCACTGTTGTTGAGCGTAATCTTAGGGTGTCAACAGCTCAC TCTAATTCTAATTCTAATTCACCACCGTTTTCACCCACACTTGAAAATGAATCACCAACA TCAGCTTTGGATTCCCCTATGAAGTCTAAGCTAAATGATGTTCCTATGTCTTCTACATCG GAGAAGAAAGAGTACCCCATCGACCCATCTCTCCCAGACATCAAGAACAGCATCTATTCT ACTGATGAATTCCGGATGTATTCATTCAAGGTGCGGCCTTGTTCACGTGCCTACTCTCAT GATTGGACTGAGTGCCCATTTGTGCATCCTGGGGAAAATGCTCGAAGGAGGGATCCTAGA AAGTTTCATTACAGTTGTGTTCCTTGTCCTGATTTCCGTAAGGGTGCTTGTAGACGTGGA GATATGTGTGAATATGCTCATGGTGTTTTTGAGTGCTGGTTGCACCCAGCTCAATATCGA ACTCGGCTTTGCAAGGATGGTACAAATTGTGCCAGGCGAGTCTGTTTCTTTGCACACACT CCTGATGAACTTAGGCCATTGTATGTGTCCACTGGTTCAGCCGTCCCCTCTCCTCGCTCA GGTACCTCTGGTGCTAATGCCATGGACTTCGCTGCGGCATTGAGCCTTTTACCTGGCTCT CCTTCATCAGTTTCTGTCATGTCTCCTTCACCATTTACCCCACCAATGTCTCCTTCTGCC AATGGCATGTCGCACTCAAATGTGCCTTGGCCCCAACCAAATGTCCCTGCTTTGCATCTT CCTGGAAGCAATCTCCAATCCAGTCGCTTAAGATCATCTCTTCATGCAAGGGACATTCCT GCTGAAGACTACAATTTGCTGCCAGATTTTGATGTACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTG TTAAATGAGTTATCTAGCCTCTCACAACCATCTTTGAGTTCTAATTCCTTGAACCGTTCT GGTAGGTTGAAAACTCTAGCTCCGTCAAATCTTGATGATTTGTTCTCTGCTGAGAGCTCA TCTCCCCGGTACTCTGATCAAGCATTGGCCTCTGCAGTTTTCTCTCCGACACACAAATCT GCTGTTCTTAATCAATTTCAGCAGCAGCAGCAGACCATGTTATCACCAATCAATACAAGT TTTTCACCTAAGAATGTCGAACACCCTCTATTGCAGGCCTCTTTTGGAGTGCCATCATCA GGGAGGATGTCTCCTCGAAACGTGGACCCTATATCACCCATGAGCTCAAGGGTTTCCTTG TTAGCTCAACGTGAAAAGCAGCAACAGTTTCGCAGCCTCAGCTCTCGTGAACTCGGCTCC AACTCTGCTGCTGCTGCTGTTGGTTCTTCGGTTAATTCCTGGTCAAAATGGGGTTCCTCC AATGGGAAGCCAGATTGGGCTGTAACTACAGATGAATTGGGTAAGCTTCGGAGGTCATCC TCATTCGAGCTTGGCAATGGAGAAGAGCCTGATCTGTCATGGGTTCAATCGCTTGTTAAA GAATCACCAACTGAGGTGAAAGAAAAGGTAGCTACACCTGCCTCGGGTGTCACTGCTGTC CCTTCTTCAAGTGAGGGTTCAAATATGAACCCCCAAATTGACTCAGTCGACCATGCTGTT TTGGGAGCGTGGATTGAGCAAATGAAGCTAGATCAGCTTGTGGCTCAGCAAAACTGA
Download Copy
>LITCHI008918.m1 MCCGQERLNLRPSPKPSIISFDESRPTNIDMNHLTVETDDTFASLLELAANNDVEGFKRS IECDPLGVDEIGLWYGRQKGSKQMVNEERTPLMVAATYGSIDIIRLILSQSDADVNRSCG NDKSTALHCAASGGAVNAVDVVKLLLAAGADPNLVDANGHHPVDIIVVPPKFQEVRLALE ELLAAEGTVVERNLRVSTAHSNSNSNSPPFSPTLENESPTSALDSPMKSKLNDVPMSSTS EKKEYPIDPSLPDIKNSIYSTDEFRMYSFKVRPCSRAYSHDWTECPFVHPGENARRRDPR KFHYSCVPCPDFRKGACRRGDMCEYAHGVFECWLHPAQYRTRLCKDGTNCARRVCFFAHT PDELRPLYVSTGSAVPSPRSGTSGANAMDFAAALSLLPGSPSSVSVMSPSPFTPPMSPSA NGMSHSNVPWPQPNVPALHLPGSNLQSSRLRSSLHARDIPAEDYNLLPDFDVQQQQQQQL LNELSSLSQPSLSSNSLNRSGRLKTLAPSNLDDLFSAESSSPRYSDQALASAVFSPTHKS AVLNQFQQQQQTMLSPINTSFSPKNVEHPLLQASFGVPSSGRMSPRNVDPISPMSSRVSL LAQREKQQQFRSLSSRELGSNSAAAAVGSSVNSWSKWGSSNGKPDWAVTTDELGKLRRSS SFELGNGEEPDLSWVQSLVKESPTEVKEKVATPASGVTAVPSSSEGSNMNPQIDSVDHAV LGAWIEQMKLDQLVAQQN.
Download Copy
>LITCHI008918.m1 CTCCTTCAAGTCCGCTCCAGTTAGGACTACCGCACTTGAAGAGACCGGACCCTCTTATTG GCGGACGCTAGTCCCTCTTTTAAATCCACTTTAATCTCTCACTTGCTGCCTCCTCCGGTT ACCTCTCTCCACTCGCTTACTTACCTAACCGGTTATTCTTCCTACCTTTCCACCTCCCCA GCCCGTTCCCGATAACTTCTCCAACCAATCACCACAACCCACGTGCCCACCTCTCGTTGC CCATATAGGTGGATTCGTACGTCTTTCCAGACACTTCCGAGGGCATTTTGGAAACTAAAA TTCCGTGATAGTGGACTAGCGGTAACATTATCCAATAAACAAATGCCAGGTGAGTCTGCA GTAGCATTTAATTAATGAAACCAGATAACACCGGATTGGTCCCCCTCTCAAAATTTAACT TTCATGTAAGACGAATTTGGGTTGAATTTCCATGAAATTTGACTATGTTTAAATTATTAC ACGCCCGAGTAATGTTGTCGTTTCCGGTTCCACACCACTTATCTTACCACCGACCAATAC CGACCTTCCACGTCACCAAAACCAACAATAGAGCATGCCGTGGCGGGATGTGACTGGTGG CGTAAAAAAGCAAATGAATAATATCAAATCATGCACAATAACTCTCAGTGCGTCCGTCTT TAATAATTTCTCTCTCTCTCTACTCTATTGGATAGGCGATTTTATCAAAAAACAAAAAAG GAAAAAAATACCCCACCAAAATAAAAAATTTAAAAAAATAAAAGATTGCATTTCATGTTA ATTAAATTATTATTTATTTAATTTATTTTTCTGGGTTCTCATGAAACTGAAAGAAAAAGC AGAGAGCTTAGTAGTTGGAGAGATGATTGAAGAAGAAGCTCTCTATCTCTCTCTTTCTCT GTCTATCTCTTGAAGTAGATCTGTGACAGTGAAACAATCTCTCAAATGGGTTTTTATGGT TCTGGTTTCTTCTCTGTTTCCTAGCTGCTAGTTTTTAAGCAAATGAAAGCATGTGCTGTG GACAGGAGCGGTTAAATCTCAGGCCGTCTCCAAAACCATCTATTATTTCTTTTGACGAAA GTAGACCTACGAACATAGACATGAATCACTTGACTGTTGAGACAGACGATACTTTTGCAA GCTTGCTTGAGCTTGCGGCTAACAATGATGTCGAGGGCTTCAAGCGATCAATTGAGTGTG ATCCGTTGGGTGTTGATGAGATTGGATTATGGTATGGCCGGCAGAAGGGCTCGAAGCAGA TGGTAAATGAAGAGAGGACTCCGCTAATGGTGGCTGCCACATATGGTAGTATTGATATCA TTAGGTTGATTCTTTCTCAATCTGATGCTGATGTGAATAGGTCTTGTGGCAATGACAAGA GTACTGCCCTTCATTGTGCTGCCTCGGGTGGAGCAGTGAATGCCGTTGATGTTGTGAAGT TGCTCTTAGCTGCTGGTGCTGATCCGAATTTGGTGGATGCAAATGGTCATCACCCTGTGG ATATAATTGTTGTTCCTCCTAAGTTCCAAGAGGTTAGACTGGCACTTGAAGAACTTCTTG CTGCTGAAGGCACTGTTGTTGAGCGTAATCTTAGGGTGTCAACAGCTCACTCTAATTCTA ATTCTAATTCACCACCGTTTTCACCCACACTTGAAAATGAATCACCAACATCAGCTTTGG ATTCCCCTATGAAGTCTAAGCTAAATGATGTTCCTATGTCTTCTACATCGGAGAAGAAAG AGTACCCCATCGACCCATCTCTCCCAGACATCAAGAACAGCATCTATTCTACTGATGAAT TCCGGATGTATTCATTCAAGGTGCGGCCTTGTTCACGTGCCTACTCTCATGATTGGACTG AGTGCCCATTTGTGCATCCTGGGGAAAATGCTCGAAGGAGGGATCCTAGAAAGTTTCATT ACAGTTGTGTTCCTTGTCCTGATTTCCGTAAGGGTGCTTGTAGACGTGGAGATATGTGTG AATATGCTCATGGTGTTTTTGAGTGCTGGTTGCACCCAGCTCAATATCGAACTCGGCTTT GCAAGGATGGTACAAATTGTGCCAGGCGAGTCTGTTTCTTTGCACACACTCCTGATGAAC TTAGGCCATTGTATGTGTCCACTGGTTCAGCCGTCCCCTCTCCTCGCTCAGGTACCTCTG GTGCTAATGCCATGGACTTCGCTGCGGCATTGAGCCTTTTACCTGGCTCTCCTTCATCAG TTTCTGTCATGTCTCCTTCACCATTTACCCCACCAATGTCTCCTTCTGCCAATGGCATGT CGCACTCAAATGTGCCTTGGCCCCAACCAAATGTCCCTGCTTTGCATCTTCCTGGAAGCA ATCTCCAATCCAGTCGCTTAAGATCATCTCTTCATGCAAGGGACATTCCTGCTGAAGACT ACAATTTGCTGCCAGATTTTGATGTACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTGTTAAATGAGT TATCTAGCCTCTCACAACCATCTTTGAGTTCTAATTCCTTGAACCGTTCTGGTAGGTTGA AAACTCTAGCTCCGTCAAATCTTGATGATTTGTTCTCTGCTGAGAGCTCATCTCCCCGGT ACTCTGATCAAGCATTGGCCTCTGCAGTTTTCTCTCCGACACACAAATCTGCTGTTCTTA ATCAATTTCAGCAGCAGCAGCAGACCATGTTATCACCAATCAATACAAGTTTTTCACCTA AGAATGTCGAACACCCTCTATTGCAGGCCTCTTTTGGAGTGCCATCATCAGGGAGGATGT CTCCTCGAAACGTGGACCCTATATCACCCATGAGCTCAAGGGTTTCCTTGTTAGCTCAAC GTGAAAAGCAGCAACAGTTTCGCAGCCTCAGCTCTCGTGAACTCGGCTCCAACTCTGCTG CTGCTGCTGTTGGTTCTTCGGTTAATTCCTGGTCAAAATGGGGTTCCTCCAATGGGAAGC CAGATTGGGCTGTAACTACAGATGAATTGGGTAAGCTTCGGAGGTCATCCTCATTCGAGC TTGGCAATGGAGAAGAGCCTGATCTGTCATGGGTTCAATCGCTTGTTAAAGAATCACCAA CTGAGGTGAAAGAAAAGGTAGCTACACCTGCCTCGGGTGTCACTGCTGTCCCTTCTTCAA GTGAGGGTTCAAATATGAACCCCCAAATTGACTCAGTCGACCATGCTGTTTTGGGAGCGT GGATTGAGCAAATGAAGCTAGATCAGCTTGTGGCTCAGCAAAACTGAAATGAGTTTCACT GAGCCCTGAGTTAGTGAACAACAGAAAGTTTTGGTAAATAATGTGATCTTGTTTTTTGGG GTGATGGTGTGGATGTGGAAGATTAACAACAGAAACAGCAATGGGAAAGGCAATGCAAGA AGTCAGTTAGTCTATTGGAAAGGGAAAATTCATTTTCACCATTTATTATTACAACAGAAG TTAGAAAAAGGGTGAGTAAAACAACAACCTCTGGGTTTTGTAGCAAAAAGACTAGAGCCC AGACTGGATGATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAATATTTTCTCAAATCAACAT TCCTATTATTGTCATTTTTTACCTTTCTAAGATGAGCAACATGTTCCATTACAAAGAAGC TAGAAGAAGTCTTTATGTTTGGTTTATCCTTCTTTTCTCTTGTAATTCCATTAGCATCTT TGGAGATTAAGTGAGAGGGTATTGCAGTTAGTTCTCTTACCCAAGAGTTCCAAAGTGTTT GGTTTTGGTCCATTTTTTGGGATGAGAGAAACAGGAAATTTTGTCTCTTTTTGTTGTAGT TTGGAATCAATAATTTTGGGTGCTAGTGAGATTGTTGGGAAGAAGAATAGGAGGATGGAG AACTAATGATCCTCTGATGATGTAACATCAAACTATAGCTTATTATCGCTTTTATGAATA CCTTTATTATTTTTTTAATCTCATGTGCTACCACTCACTTATTCCATTTCCCTAATCTTC CCTCTTATCTCAACGGTATTGGTTTTAGCTAGTTGTGGATTCTTGGGATGGCAAACTTGT GCTTTCATGGATTCCAAATCCCATGAGTGGGATTTTGTGCGTGAAATGTGGATGTGAGAA AGGCTTTTATGTACATATATTTATAAAATTTCTGCAATCTTTACAGCATTGGTAGATCTT GATGCTAATCATGCTAGCTAATTATTTTAACTTGTGTAGTGTCTTGGAATGTGGAGTTTT TATTCTACCTTTAGAGAATGATTAAACTTTATGTTAATGGTATATTATTGTTCTCGTTGT GAT
Download Copy
>LITCHI008918.m1 + Up_Stream_Len 2000 CATTAAACTAAAATGGAACCTCTCCTTCAAGTCCGCTCCAGTTAGGACTACCGCACTTGA AGAGACCGGACCCTCTTATTGGCGGACGCTAGTCCCTCTTTTAAATCCACTTTAATCTCT CACTTGCTGCCTCCTCCGGTTACCTCTCTCCACTCGCTTACTTACCTAACCGGTTATTCT TCCTACCTTTCCACCTCCCCAGCCCGTTCCCGATAACTTCTCCAACCAATCACCACAACC CACGTGCCCACCTCTCGTTGCCCATATAGGTGGATTCGTACGTCTTTCCAGACACTTCCG AGGGCATTTTGGAAACTAAAATTCCGTGATAGTGGACTAGCGGTAACATTATCCAATAAA CAAATGCCAGGTGAGTCTGCAGTAGCATTTAATTAATGAAACCAGATAACACCGGATTGG TCCCCCTCTCAAAATTTAACTTTCATGTAAGACGAATTTGGGTTGAATTTCCATGAAATT TGACTATGTTTAAATTATTACACGCCCGAGTAATGTTGTCGTTTCCGGTTCCACACCACT TATCTTACCACCGACCAATACCGACCTTCCACGTCACCAAAACCAACAATAGAGCATGCC GTGGCGGGATGTGACTGGTGGCGTAAAAAAGCAAATGAATAATATCAAATCATGCACAAT AACTCTCAGTGCGTCCGTCTTTAATAATTTCTCTCTCTCTCTACTCTATTGGATAGGCGA TTTTATCAAAAAACAAAAAAGGAAAAAAATACCCCACCAAAATAAAAAATTTAAAAAAAT AAAAGATTGCATTTCATGTTAATTAAATTATTATTTATTTAATTTATTTTTCTGGGTTCT CATGAAACTGAAAGAAAAAGCAGAGAGCTTAGTAGTTGGAGAGATGATTGAAGAAGAAGC TCTCTATCTCTCTCTTTCTCTGTCTATCTCTTGAAGTAGATCTGTGACAGTGAAACAATC TCTCAAATGGGTTTTTATGGTTCTGGTTTCTTCTCTGTTTCCTAGCTGGTAAGTTCGTCT CTTCTTCTTCTTGTTCAGATTTCCATGTAAGTTCGAAACTTGTTTGGTTGTTGTTGTTGA GGATGATGATGATGATGATCAAGCACACGCTTGCTTTGTCTGTTGTCTAGTAGTTATAGG GACACTTACGTGCACGAGCTAAGTAATGAGTGTGATATGATCACATATGAGAAGATCTTC TAACACGGGTTTCATTTGTCCAAGATTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGT TTCAGATCTTTTACTAGTTTCTGCTATCTGGGTATGTCTCTGTTTGTATTTTTAACTGAT GCCTTGTGTTAAGTTTCAATGTCATGGTTTTGACTTTATATTGTTTGTTAGATCGAGTGT TCTCTGTTTTTCTCTGTTTGGTTTCCGAGAAAATGGGTGTAAGGATAAGCTTCAAGTTAA TAAATCTCAGTTAATTTATGAAAAATATTCATTTGGGAGATAATTGAAGATATATATTAA AAAAATCAAAATTTTGAAGTTGATATTTTTCCCTTTTGTTTCCTGGATTTTTGCTGGAAC GAAACAGACAGTTGACCATGAAACTGATGCTGGTTTCATTGGTTGTTAAAGGAATATAAT GAATTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTTATGGTATTATATACTGTTTG GTTTGTGGAAATTTTGTAAGAAAGCAAAAGAAAATGATAGATAAGGGAAACTGATTTTTC TTCTTTTGACAAAATCAAAGACAGACTAGACTAGGTAGTGTTAGAGAATCTAATGAGATT TGTTTGAGTCATTGTTTTTTCCTATTTATTTCTTGTTAAGGAAATTAGTTTACTATCATT TATGTGGATTTTTTTTTTTGGTTTTGTTAATTATCTATATGTTTGTGAAAGTTCATTGCA TCTAATGAGTCTGTTTATCTAGGGGTGATTCTAATTAATGTGTATGCTCTATTTCAGCTA GTTTTTAAGCAAATGAAAGC
Download Copy
>LITCHI006311.m1 GenomeSequence + ATGCCGGATAACGGCGTGTCAGTCATTTCTAAGTGGTTAATTGCATTTTCAGTATTTTTA TCAATTGCAATTATTTACTACTGTGCTCTAGTGGCTTTTCACGAGGATATGTGTTGAATG CGAAGTTTGGGGATTCTAATTTAAGCACTGCAGCTTCAAAACGAAAGAAAGCCCGTAAAT CAGGAAAGAATAGTGGCAGTGCTGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAATGATG ATGGACACGCTCTCGGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACAGACGACCTTAATAGACTGG TGGATTGTGGTGCTGATGGACGTACAGTTGGTAAGTTATTTGTGACAAATACCGAGATAG CCAAGGGAAGCAATGGTACCATTGTCTTTGAGGGAATCCATGAAGGTCGGCCAGTTGCAG TCAAACGCCTTGTCCGAGCTTATCACGATGTGGCTTTTAAAGAAATTCAAAATCTTATTG TATCTGATAGACATCCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTG TGTATCTTGCTCTGGAGCGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTGATTCAAATTTGTTTAG ATCCATCCTTTGAGTGTAACCTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTACCATGCAGGATCTCA ACTTGTGGAAAGCAAATGGCCATCCCTCACCTCTATTATTAAAATTGATGAGGTTAGTAT TATAAGTCTTCGTTGATGTGATACCTTTGTACAAACACGAAATTTGCACTAGTATTATTT TTCTCTTTTTTCTTTTCTCCTTTATTTGGTGGCTCAGGACTTGAGTTGCATATCTAGTCA TTTGATCTGTCTGTAATGCAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTGCATCTGCATGAGTTGGG AATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATTAGCGAAGGCAGAGGATC TTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAGGCACCTCCTTGCAGATAAGTCTTC TTTGAGTAATCATGCTACTGGCAAGTACCCTTTCCAGCTTAATCAACATAATGCAATTTA CTGTTACTTCCTCGAGATATATTGA