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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008892 | Chr7 | 19088881 | 19092420 | + | Leucine-rich repeat receptor-like tyrosine-protein kinase PXC3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008892.m1 | 87 | 146 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.4 | 2.00E-10 |
LITCHI008892.m1 | 88 | 109 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.2 | 1.1 |
LITCHI008892.m1 | 111 | 133 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.9 | 0.64 |
LITCHI008892.m1 | 135 | 155 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.4 | 0.44 |
LITCHI008892.m1 | 327 | 386 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.3 | 2.50E-06 |
LITCHI008892.m1 | 351 | 372 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.8 | 1.5 |
LITCHI008892.m1 | 610 | 882 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 85.8 | 3.10E-24 |
LITCHI008892.m1 | 611 | 818 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 82.7 | 2.90E-23 |
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>LITCHI008892.m1 + Up_Stream_Len 2000 GAAGGAATCCTAGGTTTGTCATTATAATTTTTTTATATATCTCCTAAGCAATTGCAAGAA TAAATATTTTTTTCTTTGTTAAGTCTTTAACGGCCACTCTAAGGAAGTTATATTCAATCC ATAATTTATTGAAGTTTGATAATTTTTTTTTTTTAATGATAGATGTTGATGGGATTCATA AATTTGTTGAAATTCTTTAATAAATTGAATGAAATTATGAGGAGAATTTATTGAAGTTTG ATATATTTTTTTTAAATGATAGATGTTAATGGGATTCATAAATTTGTTAAAATTCTCTAA TAAATTGAATGAAATTATGAGGAGAATGATATGATTTGTTATAAACTCAATTCTTTATAA AAAATAAAACACCTTGCACAATCTACCAATTGAACTTAATTGAGATGGAGAGATACGAAA CCACTATTGCTAGAATAATATAACTTATGACAAACGAAAAAGAATGTTACTTGCACATGC ATGATTCAATATATTATCTTACTATTTATTTAAAAATTACAAATAGTCTGCATACGTTTT GAATGGCTACATCATATGATAATGTACTTAAAATTAAAAATAGTCTATATTATTGTAATG AATTTTGAATAAAAATTTTGTAATGGTTTTTCCTTTGGTTGGTGAAAGATTTTAGTAGTC TCCCAACAAAATCGCATTTTTGACTGAAAGCTACTAAACAGTGCAAGTCAAGAAATTGAA CGTTCCCAAGCCTAGTATTCAGATGACTAGGTTGCCATGAAAGTAATTTGATGTACTCTG AAACACTTAACATGACATTAAACCCAATGTCAGAAGTACCTCAAAATAAAATAAAATAAA GATCCCCATGTCAGAAGAATAAAAAAAAGAATCTTGACTCCTATGTCTCGAAAAGATTTT GAGAAGCACTGGATCAAACTAGAAAACTAAAGCTAAGCTATTTATTCATGATCTTATAAT CATACCCCCTAATTATGGTCATAATTATGATACCAAGACTCCAAGTAGAGTGATTAAGTG ATTTGTTACTTTCATCCATTACTTTAAATAATAGGTTTTAAATAATTTTATTTTTTGTAT TAATATCATAAAATATATGAATAATTCTCTTTTAACATTTAAAAATATTTATTTGAATTA TATTGTTAAAATTTTATCTAAATTGGTCATGGTAATCTTATGATTCTGTAAATTTATAAG GTATATATATATATGACGACATATGGCCGTATGGGGGCTGCTCCTTGAGTGGTTTCCAAG TATGTATTCTTGGGGGTATCATACATGCGACAGTACTAACTCTGCTTTGCACTCACAGTA GACAGCGGAGAGAGAAAGTGTGAATGTGTGTTTTCATGACTGCTCATTTCTCGTGAAAAG GCTTTACAAAGCCAGAATTCCCTCTCTTTTCAGACCCACAAATCTAGCTGCTCTTTGAAA AGCACCTGTTGCAGAACATTAAGCACACCTCTATTTTTATTTTTTTTTTTCATTTTTCTT TTTCTTTGCTTCACTTTCTTTCACTATCATTCACAAACAGCTTTGCTTCTGGGGTCATTT TCTTGTTTGGTCCCTTCCTGATGTGGTTGTGTCGCAATGAGAAAAATGAGCGAATATGCT TCTCATGTTGTATGATGCACTGTTTTTTGGGACCTTCTTTTGTATTTTTGTTCTTGTTTT TGGCTCACCATTCGCGTCCATCTGGCTTCTGATCAAAAATCTTTGATGCTTGTCCTCTTC TTTTTTTTCCTCTGAAATTAAGAGATTAGATTCCTCTTAAATGCTTATAGTCCTAGAAAT CTGAAATGGTTAAATGCACTTTGATTCTTTGATCAATAAAACAAAAAGGTGTGTTTGATA AACAGTTTAGTCATGTTATTGAGGAAAAGTCCAGCAAGATTTGGTGCTGCTGTGACTTGG TGTTTATGGCCTTTTGATCAGTGATAAAAAAGGATTCTGAGTTGCTGCATTGAAGAAGCA ATAAAGACAATATCCAAACA
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>LITCHI003293.m1 GenomeSequence + AAGATATTCAACCTTGCTTATTGACTTTGGTTTCTAAATTGACTTGCATTTATAACAAAA TTAAATTAAAATTAAAACTCATATGAAAAAGCTAGCTAAGCTAGTTGTGACTCAGCATGG TAGATGATGAATTGGGTAAGTGTAAAAAAGTGCGTTTTGCTTCCCTCCTCAATCAACTCA CTGTATCTATATAAACACTCGCATACTTATGGTACTATTTGAAAGGTCTATAGAAGCCCA GAAACCAAACTAGAGAGAGAGATAAAATAAAAAAAATAAGAAGCCATGGGAAGGCCTCCT TGCTGTGACAAAGTTGGAATCAAGAAAGGTCCATGGACCCCTGAAGAGGACATCATCTTA GTCTCATACATCCAAGAACATGGTCCTGGAAATTGGAGATCAGTGCCCACTAACACTGGT AAATTCTTTAGATCCACTCAATTCTGACTCTTATCATATATATATATATATATATGTATA TACATACACATATATTCTTGATTTAGTTTTGACTTGTTAGCTATGAATATTTTTCATTGA ATTTTGTGGACTGATGGATCAATAATCTGTTTTGAATTGCAAAAGGTCTATTAAGGTGCA GCAAAAGTTGCAGGCTGAGATGGACTAATTACCTTAGGCCAGGAATCAAGAGAGGAAATT TCACTCCTCATGAAGAAGGAATGATCATTCATTTACAAGCTTTATTGGGTAACAAGTAAT CTTCAAACATCTCAATTTTCCTTCTTTTAAAAATCACCTAAAATGTCATTATTTTTTTCT CTTTATTACTATAATTAGTACTATATATGCTCTACTATAGATTTAATGTACATATATGAT CCGATCATTAGTGAATTTGATATTTGTTTTTGGACAGATGGGCAGCCATAGCTTCATATC TTCCACAAAGAACTGATAATGATATAAAGAACTACTGGAACACACACCTGAAGAAGAAGC TAAAGAAGTTTCAATCAAGTTTGGACCCGCATGGCCATGTGACACCGTACATATCAACCA CCAGTCATCACTTTGTACCCAAGAGCTTCAGTGACAGAAGGAGCATAGACTTCACCAACC AAGCCTCCAATCTCCGCCTCAATGAGGCTGCTGCTGCCGCCTCCTCCTATGCGTCCAGCA CCGAGAACATTTCCCGTCTCCTCGAAGGCTGGATGAGATCACCACCAAAGACCAACAACT CTGATAATATCAATCTTGTCAAGGGAGTACCCCCAGATGAAAAATCATCATCACCAGCAC AGCAACATAACAACAACAACAATGATAGTGTGGATACTTCAGTTGCTGCTACTTCTCTCC ATTGCTACAGACCAAAAGAGGAGCAAGAAGGTGGTGGTGGTGGTGATCATTTGATTACTA ATGAAGAATTTATATCAATTTTTTCATTTGAGAATTTGAACAATGTGTCATGGGACAAGT CCACTAGTGACAATTCTACCACAAAGGGTAGTCAAAATTCTGCTACTAATGAAGAGAAGA TAAGTACTACTGTCTCCACACTGGCTGATCAGAAGAAGCAAAGATCTGATCAGAATAGTA CTACTCCTCCATTGTCAATTCTTGAGAATTGGCTCTTGGATGAATCTAGTGCTGGTCAAG TAGAAGAGATCAATCACATGATGGAACTCTCTCCAATATTCTGATATAATTAATTAATTG TCTTTTTTTTTTCTTGTCTTTTTAATGTTTTTTTTTTTTTTGTTTATTTTAGTTTGAGCT AGCTAATATCAATAGACATCAAAATAAGATAGCCAAAAAGGATTTATGAAAAAAAAAGGA CAAGTGTTTGATTTCTCAGGGGTTAATCTTGTAGTAATAATCTAATTATCTCTTTATTGC CAAATGTAATTAACCTTAATATTTGAATCGCTGTTGAAAACCCAGCTAATTTGGCTGTAG TGTTTAATTTCTCTTTCAATTTGTGCGTG