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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008851 | Chr7 | 18453233 | 18455941 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008851.m1 | 60 | 167 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 48.1 | 1.60E-12 |
LITCHI008851.m1 | 278 | 371 | PF10551.12 | MULE | Domain | 104.8 | 2.70E-30 |
LITCHI008851.m1 | 524 | 545 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 21.1 | 0.0002 |
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>LITCHI008851.m1 ATGTCCACTAACAATCAGTTGCAATTCTTTATGTCAGAGTCTTTGGAGGACTTGTCATCC AATCCGGTAGTTGACACACTTGAAGAACAGAGTGATGAAGCAAGCATTCAAAAAAATGTT GAACAACTTGAAGCACCATATGTGGGGATGGTTTTCGAAACAATGGAAGAAACCAGAAAT TACTATGAAAATTATGGTCGGCAAGAGGGATTTTGGATTCAAACTCACTCTTCATTAAAA ACTAGACAAGATACAAATGAGGTGACAAGTACACAATTTGTTTGTGCTCATGTAGGGAAG TATGTCCCTAAAAATAAGAGACATGATGTTGTAGAAGAAAATGATGATGGAGAGATGAAT GAGAAAGATGCAAAGAACAAAGGTAACAAGTGCTCAACTATCAAATGTGGGTGTGAAGGT AGTATGCGAGTTGTATGCGACAAGTACTCTACCAAATGGAAAGTTTCAGTTTTTAAGGAT ACTCATAATCACAAAATAGTGTCTCCTGCAAGAAGAATAAAAATGAAGTCCAACAAAAAT ATGCCTAAGGTTGCAAAAAAATTGGCTGAAACTTTTCAGAGAGAAAATTTGCAAATTGGA AAGACTTGTTCTACTTTGGGTGGGGCAAACATTGGATTTGATAGTAGAGATTGTTATAAC CACTTGAGGAATATGGAGGGGATGCTCAATCAGTTCTTACTTACTTTAGAAAAAAAACAA GCTAAGAACCCTCAATTCTTTTATGCGATTCAATGTGATGAAGAAGGGAGGGCAGCTAAT TTTTTTTGGGTTGATTCTCGATCACTCATATTGTATCAATATTTTGGGGATGTAGTCACC TTTGATACGACTTATAGGACAAACAAATATGATATGCCTTTCGCACCATTTACAAGAGTT AACCACCATTTGCAATCAATTCAATTTGGATGTGCACTTTTACAAGATGAAACGGAAGCA ACATTTTTGTGGTTATTTGAGACATGGCTTGAAGCTATGGGAGGAAAGCATCCGATTTCT ATCATTACTGACCAAGATTTAGCAATGAAGGGAGCAATTGCCAAGGTTTTTCCTAACACC CACCATCGTTTATGTTTATGGCACATTAAGAGAAGTTTGTTGAGAAGTTGTCCTATGTGT ACTTCAAGAAGTCAAAATTCAAGAAAATTTGATGAACAATGGAAGACTCTGGTGATACAA TATGGTTTGGAAAATAATGAATGGTTAAATCACCTTTATAAAATTCGAGCTTCTTGGGTT CCTGTTTACAATCGTGGCATATTTTTTGCTGGAATGAACACTACTGAACGTAGTGAGGGT ATTAATTCATTTTTTTATGGATTTGTTACATCAACCACAAATCTTAGTGAGTTTGTTGTC AAATATGAGCAAGCATTGAAGAAGATAATGGAAAAAGAGAGTAATAAGGATTTTGAGTCT GAGCACAAGTATCGAATTGTGAATGATGGGGAGCTACTTTTGAAATGTGCTGCACAATTA TATACCAGAAAAACAAAGTATGGGGAACTTGAAGAATTCATGGTAAAATTAAATTTACAA TCCCACAAAGGTACATGTGAATGTCAAAAATTTGAATTTTTGGGAATACTTTGCAGGCAT TTTGTGAAGGTACTTGTTCGTTTGGATATTGATACAATACTAGACCATTTCATTCTTGCA AGATGGAGACAAGCAGCTAACAAGTTTAGAATTATGGATTTAGAAATTTTGATGAAGAAT GATGGAAAAGAAGATTCAGAAGCATTACGACTTAGTCATATGTGTCACCAAGCCACTAAA TTAGCTTGTGTTGCAGCTTCTTCAAATGAGGCATACACAATTTACATGGAGACTCTGAAG AAATTATCAAAACAATTGTTGGACTTTGATAAGCATCAAACTGATGAACACCAAAAGAAA GATGATCCATGTATTCAAGTTCATTCCTCTCCATCAATGCTTTTGGATCCTAATATCTCA CAAACGAAGGGTAGGAAGAAAGATAACAAAAATTCTGGTAGACTCAAAAGTGGTATCAAG TTAGCTCTCGATAAGAAGAAAAGACTGTGTGCCTGTTGTCATGAACTTGGATATCATGAT AAGTGA
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>LITCHI008851.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGTGATAGGAGAAAATCTGAAAAGGCAGTACAATAGATAGTAACATATCGGCTTTTACCA ACGGGCTTTAACTCCTAGTCCGAAGATCGCACTGAGAGCTGGGGGGCTAGTGTTGTAGGT AAATTTTGATCTGCATAAATGGGTTGGTAAAAGCTCAATAAACTGACCCAGAGGATTGAT TCAATAGATAAAACCCAGGATCCACAGGACAGACCCAATAAACGAAGACCACAGCTCGCT AGACATTTAGCTAGTAGAATCTAGCTGTCAGCTCGCTATACATTTAGCTAGCAAGATCTA GCTCTCAACTCGCTATACATTCAGCTAGCAGGATCCAGCTCTCAGCTCGTTATATATTCA GCTAGCAGAATCTCGGTCTCAGCTCTTAACTCTCATGCCTCAGCTCTTAGACCTTAGGTC TCAACTCTCAACTCTCAGATCTCAGGTCTCTGCTCTTAGCCCTCAGGTCTTAGGTCCCAG CTTTAAGATCCCAGGTCTTGTACTTGTGAGATCTATGCAATCCCGAATCCCGAGAAACAA TTAATGCAGGAATGGTCATGTCGGAATTGTTAATTAATGTAGTATGACTATGACAGAGTA GTTAGTATCATTATTGTTTCTTAACGTGTACTACACTCAATTATAAATCTCTCTCTATAA ATAGAGGTGAAGTTCTTTGTAAAGGAGGAGAGAGCTCATTTATTAGTGATATGATCACTC TGCTAAAATATATTGAGAGTGACCCGTGCACGTAGGCACCATCGCCGAACCACGTAAAAA TTTTTGTGTCTCCACCTTGTTCTTCCTCCTTTCTCTTTCATTTTTAGTTGTTTTTATCTG TTGTTATCTGCTTGTTACTCTCTCATTAGCAGTCTTGCTCTTTTAATTGCTTTTGCTGCA TCTATCTTTTAAACAAAAGTATTGAGGTCCGTAATAACTACGGTGTCTTTAAGATAAATT TGTTGCTATTTGTCTACGCTATTCAGTGTTTGTCTCTGAAGATGCAATAATACCAACATC TGACAAACCAAATTACGCCCAAATCTCTATCACTCAAGAAACTTACAATTACAAATAATG TTTGAGAGAAAATAAACTAAAAAACGAAAGGATTCAACTTCTCACTAAACAACTAGAAAT GATATCAATTTATAGATTTTATATAGATAGTTTAAAACCAAGAAAAAAATGGTCTTTTAA ATCACTTTTAATTATATTGATTTGGCAGTTATAAAGCATTAATCTAAGAATTAATACTAC AAATTTAATTTAGAACTGGGGAAGGATCAGGGGATACAACTTTTGACATAATTTTTGATA CAATTTATTGATCATTGGATAAACAAGATTTCAATGGTTCAGATTTACTCACATCATTAT TTACAACTCTATTTCACACTGTACATAAATGTTTTCTCTTCTCTCTTTCATCATTATTAC ACTATCTTTTCTCTCTCTAATTAATAATAAAAACCCACTATTTAAATTATTTTAAACTAT ATTAAACTCTACATAAATTAATTAAGCATCAGGACTTTGTCAAATATGGGATTTTGTTAG AGATTATTAGGAATCTTTTAGTAGAAATGGAGGAACATAAATTAAATTATAAAAGCTTTA ATTCATTTTTAAACTATATTATTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTAATATCTATACAATAC CTTTATCAACACAGTTGATGTTCCATATAAAAGTCATTTAATTAATTAAACCTTGACTTG TAAAATGCAATCCTTGGACTTGCAAAAGCTGTGACCATCATCACGTCATAGAAAACATCA CTCACCATCTTGCTAATTAAATTAAACCCAAATTACAACAAGAAGAAAAAAAAAATCCAA ACAACAACAGCAAAATAAAAAACAGACACCCGAGTCTCTTCATGTCCACTATCACTATTT GCAAATAAACAACAACAACACTATCACTATTTGGAAAATTGTTGCCACCATTGAAGCCCA CTAAACATCCGAGTCTCTTC
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>LITCHI022387.m2 GenomeSequence + CCCTCTTCTGTCACGTCAAAAAAAAATAAATAAGTAATCGGACCCATTAGCTATGCGAGT TGTGACGACTACGCCGCGATCTCTGGCATCCCCAGATGGCAATCCAACGGCTGTGGTTGG AGCAGCACAGAGATGGAAATGATATCAAAGTCCCGTCCGATTTCAGTGAGGTGCTTTAGT CAAGCTGAGGTAATACGTGGGTCCCGTGTCCCAACACTGAACAGACACAGCACGGGCCCA CAACGAATGTTGCCCACCGACGCTGTATGGACCGTAGCTGCGAAACAGCGGCCACTCTCT CTCTACACCACGCGCTGCCTTTTTCTTCCTTCTTATTCACCACCCCCACACCTCCCCCCT CCCTACCAGACAAACGCAAATTCTCTCTCAGAGTACCCTTCACTCTCTTCTCTTCTCTTC TCTTCTCTCTTGTCTACACAACACAAGACTTGTTTGTCACCTCTCTCATTCTCTGATTAT ACACACAGCTTGATAAGTGGTATAGCTAGGAGTGTTAAATGAAGTGTCTTTGAACTCTGA AGAGAAGGGTTTATTATTGGGATCGTTCGTGTGTACTTTTTTTCCTTTGTAGTTGGCTTT CTTTAATTGGACTTACTTCAATGCAAGTTTGCATGGATTCATCTGATTGGCTCCAGGTAT ATGCTTTTACTTGCATTTGAAACTCTAGCTCAATATGCTGTTTGCTTTGCATTATGTCTT TAACATTTTCTCGACACTGCTTCAAATTGTGATAAGCTTTTTTATATGTTTAGGGGTGCA AATTTTACTTTTATATATATGTAATCCAAAATATGATATGCAAGATAATATTTATGTTTG AATTATAACATTTTTTTGGGTCAAAGCTTTTCATTTCATTTTTTTGCTGATTCTTGAACC 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