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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008756 | Chr7 | 16364449 | 16379484 | + | DNA helicase INO80 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008756.m1 | 342 | 472 | PF13892.9 | DBINO | Domain | 155.6 | 9.90E-46 |
LITCHI008756.m1 | 584 | 750 | PF04851.18 | ResIII | Family | 27.6 | 2.80E-06 |
LITCHI008756.m1 | 599 | 886 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 234.5 | 1.50E-69 |
LITCHI008756.m1 | 1207 | 1316 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 61 | 1.30E-16 |
LITCHI008756.m2 | 342 | 472 | PF13892.9 | DBINO | Domain | 155.8 | 8.30E-46 |
LITCHI008756.m2 | 584 | 750 | PF04851.18 | ResIII | Family | 27.8 | 2.40E-06 |
LITCHI008756.m2 | 599 | 886 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 234.7 | 1.20E-69 |
LITCHI008756.m2 | 1207 | 1316 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
LITCHI008756.m3 | 342 | 472 | PF13892.9 | DBINO | Domain | 155.5 | 1.00E-45 |
LITCHI008756.m3 | 584 | 750 | PF04851.18 | ResIII | Family | 27.5 | 3.00E-06 |
LITCHI008756.m3 | 599 | 886 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 234.4 | 1.60E-69 |
LITCHI008756.m3 | 1263 | 1372 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 61 | 1.40E-16 |
LITCHI008756.m4 | 342 | 472 | PF13892.9 | DBINO | Domain | 155.5 | 1.00E-45 |
LITCHI008756.m4 | 584 | 750 | PF04851.18 | ResIII | Family | 27.5 | 2.90E-06 |
LITCHI008756.m4 | 599 | 886 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 234.4 | 1.50E-69 |
LITCHI008756.m4 | 1240 | 1349 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 61 | 1.30E-16 |
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>LITCHI008756.m1 ATGGACAAGAGGAGGCAGCAGCAATCCAGGGACTCCTCCTTGTCGAATCTCTTCAATCTT GAGTCTTTGATGAACTTCAAACTTCCACAACAAGATGATGATTTTGATTATTATGGGAAT AGTAGTCAGGATGAGAGCAGAGGTAGCCAAGGTGGAGCAAGGGTGAATTACAGTAATGGG ACTATGTCTGACTTGGGAAAGATAAAGAGGCGATCTCACAACAGTGATGAGGAGGATGAA GATGGATATTATGGATCACACATGACAGAAGAAAGGTATCGATCGATGCTCGGAGAACAC ATCCAAAAGTACAAGAGGAGGTACAAGGATACCCCAGCAGCTCCGATGCCACCTCGGATG GGGATCCCTGCTGCAAAATCTAATTTGGCTGGTTCAAAAACTAGGAAGTTGGGGAGTGAG CAGAGGGGAGGGTTATATGAGATGGAAACTACATCTGAATGGCTCAATGATATTAGTCCT CAGAGGCCACTGCACTCTCAAGAGGCGGAATTTATACCCAAAATAATGTATGAACCTGCT TATTTGGACATTGGGGAGGGTATCACTTACAGGATCCCTCCAGCTTATGATAAGCTGGCA CCATCTTTGAACTTGCCAAGCTTTTCAGATATTCAAGTGGAGGAGTTTTATTTGAAGGGT ACCTTAGATTTGGGATCCTTAGCAGAAATGATGGCCAATGATAAAAGGTTTGGGCCAAGA AATCGAGTCGGAATGGGGGAGTCTCGGCCTCAATATGAGTCACTGCAGGCCAGATTAAAG GCATTGGTAGCTTCTAACTCAGCCCAGAAGTTCAGTCTCAAGGTTTCTGATGTTGGGATT TCTTCCATCCCTGAAGGGGCTGCTGGAAATATCCAACGATCTATACTGTCAGAGGGTGGT GTATTGCAGGTTTACTATGTGAAGGTTTTGGAGAAAGGAGACACATACGAGATAATTGAA 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