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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008747 | Chr7 | 16153908 | 16156651 | - | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008747.m1 | 12 | 102 | PF02362.24 | B3 | Family | 56 | 3.00E-15 |
LITCHI008747.m1 | 282 | 364 | PF02362.24 | B3 | Family | 31.7 | 1.10E-07 |
LITCHI008747.m2 | 180 | 262 | PF02362.24 | B3 | Family | 32.5 | 6.30E-08 |
LITCHI008747.m3 | 180 | 262 | PF02362.24 | B3 | Family | 32.5 | 6.30E-08 |
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>LITCHI008747.m1 ATGGCTTCAAGGAGGAGAGTAGAACCCTCGCATTTCTTCAAGGTTATCCTGAGTTCCACT CTGGAAGACAAGAAGCTGAAAATTCCTGAAAAGTTTGTAAGGATATTCAGGGATGAACTC TCTACTGTAGCGACACTGACAGTTCCTAATGGTCGAGATTGGCAAGTGAGGTTGATAAAA GATGGGCGAAAGATTTGGTTCGATGATGGTTGGCATGACTTTGTAAAATGTAACTCAATC AGTACTGGGTACTTCGTGGTTTTCAAATATGGAAAGAATTCAAACTTTAAAGTTCTTATC TTTGATATGACTGCTTGCGAAATACAATACCCCTACAATGGTAAAGAACCAGAGAATGAC AAGCAGAACTCATTGCACCAGGATGAAAGTGAGGAAGAAGATTCTGTTGAGATAAAGGAC TTCACAACTCCAAACCCTACTTTTGACTCCCTGAAGAACAAAGCTTCTGCTAAATGTCTA AGGGTATCTAGCACAATGCCATCACATCTGAATCAGGCTAAGACTCCTTTTGATTCTGTT TTTGTGAGTCCAAAATTTAAGTGTGGTTGTGAGCCACAAAACAAGAGGCGTAAATTGGAA GAACCAGCGGAATCACATAAAGCAAATGCTGTAGGTATTGACTTAAATAGTAGGAAAACT GCAGCTGAAGTTGGAACACATTCTTCAGATGAAGCAACAGAAATTGATGAAGATGAGTTT ATGGATGTACTTGAAGAAATGGGAATATGCGTTAATAAGAGATTTAGAAGTCTTGCAGCT GAAGAAAGAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTC ATGGTCATCTTGCGGCCTTCTGACATTAGTCTTCGTCGCGTATATGTGCCTACCAATTTT TCTCACAAGTATCTAAGTAGGAATGACAAGGTTATCGAAGTACTGGATTCTGATGGAAGC AAGTGGTCCATGGCACTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTGGGAAATTTT GCAAAGAAGTTGGATGATGGAGATACCTGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGAAAAACACTA AAAGTTTCAGTGCTGAAGACTATGAAAAGTGAACTGTGGTGA >LITCHI008747.m2 ATGACTGCTTGCGAAATACAATACCCCTACAATGGTAAAGAACCAGAGAATGACAAGCAG AACTCATTGCACCAGGATGAAAGTGAGGAAGAAGATTCTGTTGAGATAAAGGACTTCACA ACTCCAAACCCTACTTTTGACTCCCTGAAGAACAAAGCTTCTGCTAAATGTCTAAGGGTA TCTAGCACAATGCCATCACATCTGAATCAGGCTAAGACTCCTTTTGATTCTGTTTTTGTG AGTCCAAAATTTAAGTGTGGTTGTGAGCCACAAAACAAGAGGCGTAAATTGGAAGAACCA GCGGAATCACATAAAGCAAATGCTGTAGGTATTGACTTAAATAGTAGGAAAACTGCAGCT GAAGTTGGAACACATTCTTCAGATGAAGCAACAGAAATTGATGAAGATGAGTTTATGGAT GTACTTGAAGAAATGGGAATATGCGTTAATAAGAGATTTAGAAGTCTTGCAGCTGAAGAA AGAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTC ATCTTGCGGCCTTCTGACATTAGTCTTCGTCGCGTATATGTGCCTACCAATTTTTCTCAC AAGTATCTAAGTAGGAATGACAAGGTTATCGAAGTACTGGATTCTGATGGAAGCAAGTGG TCCATGGCACTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTGGGAAATTTTGCAAAG AAGTTGGATGATGGAGATACCTGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGAAAAACACTAAAAGTT TCAGTGCTGAAGACTATGAAAAGTGAACTGTGGTGA >LITCHI008747.m3 ATGACTGCTTGCGAAATACAATACCCCTACAATGGTAAAGAACCAGAGAATGACAAGCAG AACTCATTGCACCAGGATGAAAGTGAGGAAGAAGATTCTGTTGAGATAAAGGACTTCACA ACTCCAAACCCTACTTTTGACTCCCTGAAGAACAAAGCTTCTGCTAAATGTCTAAGGGTA TCTAGCACAATGCCATCACATCTGAATCAGGCTAAGACTCCTTTTGATTCTGTTTTTGTG AGTCCAAAATTTAAGTGTGGTTGTGAGCCACAAAACAAGAGGCGTAAATTGGAAGAACCA GCGGAATCACATAAAGCAAATGCTGTAGGTATTGACTTAAATAGTAGGAAAACTGCAGCT GAAGTTGGAACACATTCTTCAGATGAAGCAACAGAAATTGATGAAGATGAGTTTATGGAT GTACTTGAAGAAATGGGAATATGCGTTAATAAGAGATTTAGAAGTCTTGCAGCTGAAGAA AGAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTC ATCTTGCGGCCTTCTGACATTAGTCTTCGTCGCGTATATGTGCCTACCAATTTTTCTCAC AAGTATCTAAGTAGGAATGACAAGGTTATCGAAGTACTGGATTCTGATGGAAGCAAGTGG TCCATGGCACTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTGGGAAATTTTGCAAAG AAGTTGGATGATGGAGATACCTGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGAAAAACACTAAAAGTT TCAGTGCTGAAGACTATGAAAAGTGAACTGTGGTGA
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