Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI008666Chr71268965412692290+Serine/threonine-protein kinase ATG1t

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI008666.m120144PF00069.28PkinaseDomain92.33.40E-26
LITCHI008666.m121142PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain62.63.70E-17
LITCHI008666.m1180303PF00069.28PkinaseDomain67.11.70E-18
LITCHI008666.m1180298PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain23.53.20E-05
Download   Copy
>LITCHI008666.m1
ATGGAAGCGGAAAGGGTTGTAAATGAGTCAAAAGAGGCAATAGTGAGAGAGTATTTGTTG
AAATCGAAACTGGGAGAAAGCTGTTTGTCTACAGTATGGAAAGCAGAGCACGTAATATCG
GGAGATTTGGTGGCAGTGAAGCAAGTCTACCTCTACAAACTCAGTAACCACCTTAAGACC
TGCTTGGACTGCGAACTCACTTTTCTCTCCTCTGTCAACCACCCCAACATCATTCGCCTT
TTCCAAGTCTTCCAGACTCAAAATTGTAAGTTCCTAGTAATTGAGTTTTGTCCTGGGGGA
AATCTGGCTTCCTATATTCGACGACATGGAAGAGTTCCACAGAATACTGCTAGGAATTTC
ATCCAGCAGCTTGGAGCTGGTTTGGAGGTTCTACACCCTCGACACATCATTCACAGAGAC
TTGAAACCAGAGGTAAGACAAGTTTTAAGTATGCACACTAACAATGATGCATTGTTGTTA
TGTCCTAAATTCTACCTATTTGGCATCTGTTCACTGCCAAATAGGTCGCTTTTGGTGGAG
CAGAACATTCTACTATCTGGTTTGGAGGGTGATTTGGCGCTGAAAATAGCTGATTTTGGC
CTTTTAAGTAATCTACATCCCGGCGAGTATGCTGAGAAAGTTTGTGGGTCCCCTTTATAC
ATGGCTCCTGAGGTTGACATGTGGAGTGTTGGTGCCTTTCTTTTCCAGCTTCTTAATGGT
TATCTGCCTTTCTGTGGTCAGAATAATGTGCAGTTGCTGCAGAATATCAAGTCATGTACA
CATCTTCCATTCTCCCAGCTTATCCTTCCTCAGTTGCAACCAGACTGCCTTGAATTGTGT
TTGAAATTGCTTTCTACTAATCCAGTGGATCGTTTTTCCTTCAATGAATTCTATCAGCAT
AGATTCTTGAGAAGAAACTGA
Download   Copy
>LITCHI007074.m1
MGAPKQKWTAEEEAALKAGVRKHGTGKWRTILSDPEFSTILHSRSNVDLKDKWRNINVTA
IWGSRQKAKLALKRTQPTPKHDGQTQLTPKHDENHMALIPVPPNDEEVVDAKPLAVSSGT
LRASGSKEPAARLDKLILDAIANLKEPSGSDRASIAQYIEEQYWAPENLRKLLASKLKFL
TAKGTLIKVKHKYRIAPSETVPVAKKSPKLILEGSQKVSPKAQKKDINILKSQVDADLSR
MRGMTAQEAAAAAAQAIAEAEVAIAEAEEAAREAERAEAEAEAAQVFAKAAMKALKCRTL
NTW.
Download   Copy
>LITCHI007074.m1
GTTTCTTACCGTGCTTATGGTTATATTATTTGAGTCTTCTTTCCTTTAAATATGTTTAAA
AAAAAAAAAATCCCACTTGGGGACAGCATGCATTTTAATTTGCACAAAAATATTTCTTTT
CATGAATCCCTTTTGATTGGGAATAGTCTTTCAAACCGTATCACCAATATTATATCTAAT
TGATCTTCAAAATTCCTGAATATGTTCTAAATACTGTTATGGTACTTAAAAAAAAAAAAA
AAAACCAGGAGAGAAAATGAAAAAAAAATAAATTTATACGGACATAAACCAAGTCCATTA
ATTGACGGTCACTCTCCCTTGCTCACTCGTTTTCCACAACGGTTTCTTCTCAGAGGACTC
GGCTTTTACAACCATCCGATGACCTACTCTTTGATTTCCAATTCTCGCATTCACTGGCAA
TTTCTCTGATCAGAAATGAACGACCTTTATTGATCTGGAATCGGTTTTCGATTACACAAA
AAAAGTTCGAATCTTGAGCTGGTTTGGACTTATTTCGAACCATATCTGTTTCTTGATATT
GGGGAGGTTTGAGCGGTATAGATTTTGTTTTAGAAGGGTTTTGGAACTTTTCTTGATGGG
TGCTCCAAAGCAAAAGTGGACAGCAGAAGAAGAAGCTGCCCTCAAAGCTGGAGTACGTAA
GCATGGGACGGGAAAATGGCGAACCATACTTTCTGACCCTGAATTTAGTACCATTTTGCA
TTCACGCTCCAATGTGGATCTCAAGGATAAATGGAGAAATATAAATGTGACTGCAATATG
GGGATCTAGGCAAAAGGCTAAGCTTGCTCTTAAAAGGACTCAACCAACACCTAAGCATGA
TGGTCAGACTCAGCTGACACCTAAACATGATGAAAACCATATGGCTTTGATCCCTGTACC
TCCAAATGATGAAGAAGTTGTCGATGCTAAGCCCCTTGCAGTTTCCAGTGGAACGTTGCG
GGCTTCTGGTTCAAAAGAACCAGCTGCAAGGTTGGACAAACTTATATTGGATGCTATTGC
TAATTTGAAGGAGCCAAGTGGTTCTGACAGGGCATCAATCGCTCAATATATAGAGGAACA
ATACTGGGCGCCTGAAAACCTCAGAAAGTTATTGGCATCAAAATTAAAGTTTTTGACGGC
TAAAGGCACTTTAATCAAGGTAAAGCACAAGTACAGGATTGCCCCCAGTGAAACAGTTCC
TGTAGCAAAAAAGTCGCCAAAGTTAATCCTGGAGGGAAGCCAAAAGGTTTCACCAAAAGC
ACAGAAGAAAGACATCAACATTCTCAAATCCCAGGTTGATGCTGATTTATCAAGGATGAG
AGGCATGACGGCACAGGAGGCTGCTGCTGCTGCTGCACAAGCTATAGCAGAGGCAGAAGT
AGCAATTGCAGAGGCTGAAGAGGCAGCAAGGGAGGCAGAGAGAGCAGAAGCTGAAGCAGA
GGCAGCACAAGTTTTTGCTAAAGCAGCAATGAAGGCATTAAAATGTAGGACACTTAATAC
CTGGTAA
Download   Copy
>LITCHI015684.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AGTCAAAAAACCGGTTAAACTTTTTTTTTTTCCTTCTCTTTGTGAATTGGCATTTAATAA
GTGCTCTTCTCTAGCAGTAAAATTATTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTAATATTCTTTTT
TATTTCTCTTATTAATTTATTATGTTTATTACTAATTAATTTAAATATTATTAACTTAAA
ATAATATTATTTCTTATAGACATGTTTCGATATGTCGACTTATTATTAAAATAACCAAAC
TAATCATCCCTCTATTAAACTTGATTAACTTGTGACTAATAAAATGACTAATTTGATGAA
TTTTTAAAACATTAGGGATGACAGAAATTAAAAATACATGAGTGAGTAAACATAATGTTT
TGTTAAAAGTCAGGGATTAAAATGATTTTTTTTTTCCAAAAAATACTTGTGGTGATCTTA
TTATAGTGCAAATTTGGAAATATATATTATTACATTACATTATTGGAATCGACTCAGAAA
ATAATCAAGTGGAATCAGACATTAATGATATAATCCGAAAAATAACTTTCATATAAAAGG
AATAATTCATATATATATAAAAGAACAATCTACACGAGGATGAGAGAAGATCTACACTCA
GATGGGGAAAAGTGCAGCAATAAATATGGCTGTGATGTCTTGAATCCGGGGCCAAGAGTG
GTCTCTAATAGTACCGTTGCGATTAGAGCAAAGGCACATTGGACAATTTTGAACTTACAT
TATGTACTTGAAGAGCAAGTCGTTGGATTTATTCAATAGACGATTTTTTTTTGGTTGTTC
TTGGGAAGGGAGTTTTGAAAGAGCACTTCAATGCATGAGTTTCACCATGTGATGATGGTG
CATCTGATGCATTCCAGTTTTTTCCCGCTTTATAGAGTCGTATGAGTAGAACCAAGTTAA
ACCAATTACAAATTTAAGCATATTATAGTTAAAAAAAAAAAAAAACGATGCTACATTGAA
ATTACAAATTTAAGTATATTACAGTAAATAAACAATGCCAAATAGCACTAAAATTATAAA
GACATTTTGTAACTAGCACTGGATTATCCAAATGACTTTTTTTTAGCACTACATTATATA
GAATGTCTATTATACCTTTTAAAGATGTCAAAAACTCTCCACATTTTCTAAAGTTCTTTG
AAGGAATGTTCAAGAATAAACTTTTTCACTTAAATTTATGACTTCAATATTTATACATTA
ATTTCCTCACAATCTAATACTAAGAAAGAAAATTAATGGTAAATAACAATCCTTAAATTA
AAAAAAATGAAAATAAAATTGAGTGTATTGATATTAAGATCATAAGTATAGATTAAAATT
TTAAGTTGATATATAGTATAATCTCAATCTACATATAAAAAATATATATTCCAATTTAAA
ATTAGAAGTTAATTTGAAGCAAACTAATAATGAGGGGGTGTAATGTAACCTTTTGCATGT
CATTATTGTAAATATATGTTTTGAGGTGATATAAATGAAGTGACATTAAGCAATCATAGA
ATGGTAAGTGCATATCATCTTTTCATATAAAGTCGTGTATCTCTTCACTCATTTTAACGA
TAAAGATGTAAGTCTCATCAATTTATGTTATGAGGATATTTATCTCTTATTAAAAAAATA
AATATTTAAACCGTATAAACGGGGAAAAGAGAGGAGGCAAGGAAAAGGTAAAAAGAAGGA
AAAAAGAGGTGACAGAAGCATGTGAATGAAGACAAATGAAAAAGTTTTGATTTGCGGTTT
AAACATTCTCTCATCTCGTTATCTTCAAATTTCCATGTACACTTTCTTCTTTTGGACGTC
ACATGAGAAACAATACCACCTGTTTTTTTGATTGTCTCGTGAGCACATGACTAGTGTATA
CATCGTTTTCATAACATATCCAACACATTTGAATCACCTATGTTTTCCTATCCTTTCTCT
TCATTTTGTGTTTCGTTATCATCAAACTCACAGAAATGAAAACAACTACCTAGCTACTCC
TCCAAAATAGTCATCAAACA
Download   Copy
>LITCHI015684.m1 GenomeSequence + 
TTTTGATTTGCGGTTTAAACATTCTCTCATCTCGTTATCTTCAAATTTCCATGTACACTT
TCTTCTTTTGGACGTCACATGAGAAACAATACCACCTGTTTTTTTGATTGTCTCGTGAGC
ACATGACTAGTGTATACATCGTTTTCATAACATATCCAACACATTTGAATCACCTATGTT
TTCCTATCCTTTCTCTTCATTTTGTGTTTCGTTATCATCAAACTCACAGAAATGAAAACA
ACTACCTAGCTACTCCTCCAAAATAGTCATCAAACAATGGAATCTTATCTTACACTAATT
TTTCTTCTTGCATTATGTTACTACATGCATATTTGCACTAGTGCTAGTGACCCTCCTAAT
GTCCAGCTCAATGATGATGTTTTAGGCCTCATCGTGTTCAAATCAGACGTTAAAGACCTT
TCTTCTCATCTTCAATCATGGAATGAGGATGATAACTCCCCATGTGCATGGAAATACATA
ACATGCAATCCAGATAATGGTCGTGTTTCTGAACTCTCGCTTGATGGCTTGGGGCTGTCG
GGGAAGCTTGGTAGAGGCCTTGAAAAGTTGCAACGCCTGAAGGTACTATCACTTGCTTAT
AACAATCTAACCGGTCAGCTTCCTGATCTCATTACTAGTACTAGTACTCTTGAGTCCCTC
AATCTCAGTCATAATAATCTCTCAGGCCCCATTCCTTCTTCACTACTTGTTTCCACTCTT
AAGTTCCTTGATCTCTCTCAGAACTCACTCTCAGGATCGCTTCCTGATCATTTCTTTCAA
AACTGTGTATCGTTAAGATACCTTTCTCTAGCTGGAAACATGCTTCAAGGTCCCATTTCT
TCCACTACAGTGCAGCTTGGAAGGTGTTTATATTTGAACCATCTCAATCTGTCTGGAAAC
CGTTTTGCTGGTGAGCCAGACTTCTCTTCTGGGGTCTGGTCATTGAGAAGGCTTAGGACT
TTGGATCTTTCCTTCAATGCATTTTCAGGATCCATTCCACAAGGTGTATTAGGCCTTCAT
AACTTGAAACAGCTGTTGTTACAAGGCAATCAGTTTTCAGGACCAATTCCTGGAGATGTT
GGATTGTGTCCACACTTGAACATGTTGGATTTGAATGGTAATCTTTTCACGGGAGCATTG
CCTGATTCTCTTTCGAAGTTGAAGTCTTTGTCCTTCATCAGTTTATCAAACAACATGTTG
ACAGGTGAGTTCCCGGTTTGGCTTAGTAATTTAACCTCCCTGGAATATGTGGATTTCTCC
AACAATGCTTTGACTGGAACCCTTCCTACATCAATTGGTGACCTGAAATCACTCAAACAT
TTGAGCTTGTCTAACAACAGACTAACTGGGAATATTCCAAACTCACTGGTTTATTGCACA
AAGTTGGAGATCATTCGTTTGCGGGGTAATAGCTTCAATGGTGGCATACCCGAGGGCTTG
TTTGAGTTGGGACTGGAAGAGGTGGACTTTTCGCGAAATGGTTTCATGGGTTCCATCCCG
TCAGGTTCTGGCAGACTTTTCGAATCTCTCACCATACTAGACTTGTCAAGTAACAATCTT
ACAGGAAAATTTCCTGCTGAGATTGGTCTTTTTGCCCACTTGAAATACTTGAATTTATCA
TGGAACAATCTTGAGTCAAGCATGCCTCCAGAGATTGGTTACTTGCAGAGCCTAAAAGAA
TTAGATCTTCGAAACAACGAGTTACATGGCTCAATTCCTGGAGATATATGTGAGTCTGCA
AGTCTAGGCATTCTACAATTGGATGGCAATTCATTGTCAGGCTCAATTCCCGAAGAAATT
GACAATTGCTCATCTCTCTATTTGTTGTAAGTCTTATTGTTTTGATTCCTTTTTGTCTGT
CTGATTAATGCATTTTATGTTGATGGTCAACACCAATCTTGAATGGTTATGTTTTTCAAT
TTTGCAGGAGCTTGTCCCACAATAATTTAACTGGTTCCATCCCTAAATCAATTTCAAAGC
TGAACAAGCTAAAGATTTTAAAGTTGGAGTGGAACGAATTAGGTGGAGAGATACCTCAAG
AGCTTGGAAAGATGGAGAGTCTTGTAGCAGTAAATGTATCATTTAACAGGCTCATAGGTA
GGCTTCCTGTGGGTGGTGTATTTCCAAGCTTGGACCAAAGTGCTTTACAGGGAAATCTGG
GGATATGCTCACCCTTATTGAAGGGACCTTGTAAGATGAATGTACCAAAGCCTCTTGTAC
TTGACCCTGATGCATATTACAAGCACAGACAGAGAAATGAGTCCTCAGATTCCACAAATT
CACGTCGTGATCACCGCATGTTCCTTAGTGTTTCATCTATCGCTGCTATTGCAGCAGCCA
TTCTGATTGCATTTGGTGTCATAGTAATCAGTCTCTTAAATGTATCCGCTCGAAGAAGGC
TTGCATTTGTGGACACTGCCCTGGAAAGCATGTGCTCAAGTTCTTCAAAATCTGCTAATC
CAGCCACAGGAAAGCTGGTTCTGTTCGATTCCAGATCATCCCCTGATTGGAACATCAATC
CTGAAACCCTCCTACAAAAGGCCTCTGAAATTGGTGAAGGAGTTTTTGGAACAGTGTACA
AGGTCTCATTGGGGACTTCTCAACCAAATATTGTAGCTATTAAAAAGCTTGTTACCTCAA
ACATAATACAAAATCCTGGAGACTTCGAACGAGAGGTTGGGGTCCTGGGGAAAGCAAGGC
ATCCAAATTTGATATCATTGGAAGGATATTATTGGACTCCTCAGTTACAGCTTCTCGTAT
CTGAATATGCACCAAACGGTAGCTTGCAGGCCAAGCTTCACGAACGGCTTCCTTCTGCTC
CACTGCTTACTTGGCTTCAAAGATTCAAAATAATCCTTGGAACAGCAAAAGGACTTGCTC
ATTTGCATCATTCTTTCCGTCCACCAATCATTCACTACAACATAAAACCAAGCAACATCT
TGCTTGATGAGAACTACAACCCCAAGATTTCAGATTTTGGATTGGCAAGGCTTGTGACAA
GGCTTGACAAGCACGTATTGAACCACAGGTTTCAGAGTGCAATAGGGTATGTTGCACCAG
AGCTAAGTTGCCGAAGCTTAAGAGTGAATGAGAAATGTGACATATATGGCTTTGGGGTAC
TGATCCTAGAGGTTGTGACAGGCAGGAGGCCAGTTGAATATGGAGAAGACAATGTGGTAA
TACTAAGTGACCATGTCAGGGTCTCGCTTGAGGAAGGAAATGTGTTGGAGTGTGTTGACC
AAAGCATGGGAGATTTCCCTGAAGATGAGGTCTTGCCAGTACTCAAATTGGCCTTAGTTT
GCACTTCTCAGATACCATCAAGCAGGCCTTCCATGCCTGAAGTTGTCCAAATATTGCAAG
TCATCAAGACCCCACTTCCACAAAGAATGGAAAACTTTGCTTCTTTTTAATTTTACTATT
ATGTTCCTATGTTTTTATTTGGATTTGATGAGAAATATGTCATCTGTTATTTGCAATCTG
CTTCTTTATTTATTGTGTTTATGTCCAAATTAAACTTGGATGAATTAACTATATATGAGT
TTGTTTGTCATTCAATAAGTCCATATTTTTGC