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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008515 | Chr7 | 7264731 | 7270578 | + | "Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1 " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008515.m1 | 259 | 412 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 173.6 | 2.40E-51 |
LITCHI008515.m1 | 441 | 539 | PF05033.19 | Pre-SET | Family | 69.6 | 3.40E-19 |
LITCHI008515.m1 | 558 | 683 | PF00856.31 | SET | Family | 65.4 | 8.80E-18 |
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>LITCHI008515.m1 ATGGATCAAACCTTTGGGCACGACTCAGTTCCTGCTTCTGGGTCATTTGATAAGTCTAGA GTTTTGGATGTACGTCCATTGCGACGCCTTGTTCCAATTTTCCCATCGCCATCTAATATG TCTTCATTTCCAACTCCTGGCGCTCCATTCGTTTGTGCACCCCCATCTGGTCCTTTTCCT CCTGGGGTTGCTCCATTTTACCCTTTTTTTGGTTCAGTGGATTCTCCGAGGCCGCCCAAT GTTCACAGCAACACAATATCCGATGCTGTTCCAATAAATTCATTTAGAACGCCACCAGCT GCAACTGCTGGGGCTCGGGTAAATGGAGATACTGGGCCATCTAGGAGTACAAGGAGTCGT TTTCAGTCACAATCCCACAGTGGCTTTACAGAAGACGATGGGTACGACAGCCAAAGCCTT AATATGAACGATGTGGAGGGTACTAGTAATACTCGGAGGTCCAAGAAGAAGCCTCATAAA AGGACTAGGGGTAGTGGGTCAGGGGATATAATTTTGGCCTCACCAGAAGTTGACACCGAT GCTATACTTAATAACATTCTCTCATCATTTAATCTTGCGGAGATTGATGCGTCCCGTAAA ACTGATGGTGACAAGGAATCTGTGGGATTTATACTCCTGATATTTGATTTGTTCCGAAGA AAAATATCACAAGCTGAGGATACAAGAGAAGTTCATGGGGTCAGCCGACGCCCTGACTTG AGAGGAGGTGCAATCTTGATGAATAAAGGGATTCGGACCAATGCTAAAAAGAGAATTGGC GTTGTGCCTGGTGTTGAAGTTGGGGATATTTTCTTTTTCAGGATGGAATTGTGCTTGGTT GGACTGCATGCCCCATCAATGGCGGGGATTGATTACATGAGTTTGAAAGTCAGTCAAGAA GAAGAGCCTTTGGCAGTCAGCATTGTTGCATCCGGAGGATATGAGGATAATGCAGAGGAT ACAGATGTGTTGATTTACAGTGGGTCAGGTGGGAATGCTAATAAGAATAATAAGGAAGTG ATGGATCAGAAGCTTGAAAGGGGTAATCTTGCTTTGGAGAAAAGTTTGCATCGGGGCAAT GAGATACGAGTCACTCGTGGTATGAGGGATGCAGCAACTCCAGGTAGTAAGATATATGTC TATGATGGTCTTTATAAAATTCAGGAGTCATGGGTGGAGAAAGGGAAGTCAGGTTGCAAT GTATTTAAGTATAAATTGGTTAGGTTACCTGAGCAACCAAAAGCATACTCGATATGGAAA TCGGTTCAGCAGTGGAAGGAGAGTATTACATCTAGAATTGGAGTCATATTGCCGGATCTT ACTTCGGGGGCAGAAAATATACCCGTATCATTAGTAAATGATGTTGATGGTGAGAAAGGA CCTCAGTACTTTACTTACTTATCTAGTCTTAAGTATTCAAAACCAGTTAATACTGTAGAT TCTGCTGCTGGCTGTACTTGTAGTGGTGGATGTCTCCCTGGTAATTCCAACTGCCCTTGC ATACAAAAGAATGATGGCTATCTTCCATATACTGCAAATGGGGTTATTGTGGATCAAAAA TCCTTGACGCACGAGTGTGGTTCTTCCTGTCTGTGCCCTTCTAATTGCCGGAATCGAGTG TCTCAAGGTGGTCTAAAAGTTCATTTGGAGGTGTTTAAAACTAGTAATAAAGGTTGGGGT CTCAGGTCCTGGGATCCCATTCGTGGTGGGGCTTTTGTATGTGAATATGCAGGGGAGGTC ATTGATATGTCCAAGATAGAGGAACTTCGACGTGAAAATGAAGATGATTATGTTTTTGAT GCCACACGCATTTATCAGCCTGTGGAACCTGTGCCTGGTGGTTCTGAAGAGCTTCCAAAG ATCCAATCCCCCTTAGCTGTAAGTGCAAAATCTGTTGGGAATGTAGCTCGTTTTATGAAC CACAGTTGCTCACCCAATGTATTCTGGAAGCCGGTTTTGCGTGAGAATAACAAGGGGTAT GAGCTTCATATTGCATTTTATGCCATCAGACACATTCCTCCAATGACAGAGTTGACATAT GATTATGGGCGGCCTGACAAAGCAGAAAGAAGGAAGCACTGCCAATGTGGTTCATCAAAG TGCAGAGGTTATTTTTTCTAG
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>LITCHI008515.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACTATATTTTATTTTAGATCAAATTATGTTTAGAATTTATGAACAATTTTTTAAAAAATT AACAAATTCTTTCTTTTTTGTTTATAGAATCATAAACAATGTTTTTTTTTTTAATTCTTT TTAAAGTTGGGGTTTCTAGCAACATGACAAAATCAATGCTCAACAATTATAGGTACAACA AGGTATAATTTCACTAAACTTGATGATTTTATAAATAACCGCGAAATTTAGAATCCCATA TGTATAAAATTTCTTCCACATTTTATCTTATTTATAAGACTTTTGAAAATAATTATAACA TTTTCTCTATGTAAGAAGTTAATTTTTATAATTAACATTATAATGATAATTATCCCAAAA TTAACATTATAATCTATTAACAATTAATAGATTTTGGGATAAGGCCTTAAAAAATATTTA TAACTTTCACATTATTCTCACATATATTTCTGCCTTTGAATTTTCTTTTTTATTTTTTTG TCCTTTTACAAGGTCCATTCAATCCAACCTTTTCTTTTAAGCCTCAAAACCTTCTGGTCT TTAAACATATTTAACAAATATTGCCCTTAATATTAAAGGATGAATGTAAAAGTGTGAGGG TCGATTATTAATAAATTAAAATGTTAGCTCTATTTGTTGTAGATCATACCTCAGGTAGGT AATTTGTAATTAACTCTAAAATTTATATTATTATATGAACAAGTGAAAATAGGTTAAGTA CAAGGTATCCCGTTTACTGTAAAAGTAATTAAAAATAAAAAACCTATTCCAATCATAGAC TAGATATCGGCCACCACAATCAAAACAGAATTCAGGTTCGGAATAGATCGATCTAACCCT AATTTTACTTATTGTCATCTCTAATTTTAATAATCTTTAAGCGAAGAGGTTAAATATGTA ATTTCGGTAACATGTGCAGAGAGACGCAGTGTTGTGCAAAGCACCGGAGTATTACCCTCC AACCTTCGATCAACAAGACAACGACATAATTAAACACGCGAAACGAAATACCAGGGGAAA TATTGTTTTGTTTCTTAAAACACAAAAACAGAAGCATCCATTTCTTTCTATTGTAAGAAT CTTAAGCCTGGAAATTTTCACATCAGGTAACCAGTCTGTTCTTCTCCAAGATCTCTCCTT TCATGGGATGTTTTTCTTTCTATGAATTTTTTAATATAATGGATTATATTTGTAGTTAAC TTTGTTTGTGCTTTGATCTGCTGTGACTAGTTTTGTGACGTTTTAACTTCATTTTTGTTG GTTTTTTAACACTTTGTGTGTTTATACTTTGATTTTGCCATCTGTGTTGATGAGAAAATG AAAGGAAATGATTTGAGATGTCTAGGTTGTGTTAGTGAAATGACAACTTCATTTGCAGTT GAGTTTGGTTTGAGCTCTGATCTGTTATGACAAATTTTTCAGATGTTTTGGTGTTTTTTT TGTTGTTTCTTCCACTTTGTGTGTTGTAAGTTATATTTTGGCATCTGGGTTGTTGAGAAA ATGAATGGAGAAATGTTGTGAGATTTTTAGGTTCTGTTAGTGGAATGACAACTTCATGTT TGCTTCTTTGTAATATAATTTCCTCTGTAAGTAAACAGTTTGGTTACTTGTCTTATTTCA CTGTTTAGATTTTTAGTTTTTTCGTACAAGCCGAGGACTTGTACTGGTTCTAGGGTTTAG GTTATGCTTTTGTATGTTTTTTGAGATATTGCCTTACCTGTGTATCTTTTTTTGTGTTCA CTATCATGTTTCAGATATTCGTTGAGTTCGTCAATTAAATCAGATTTGTGTGTTGGTGTG GAAGTTTTTAGATTTATAGTGAAATGTTGCAGTTGTGATTGCTGTTGTTGTGGTAGTGTA TTTAACCTCTATCGGTGTGTATTATTGAAACTTATGCGATAGTTTAGGGGTTGAGATCAC AAGAAGAAGAGAAGTGGGTTTTGTTTAGGATTTGGTGATAGGAAACTTTGTTCTTTCGTG TGTTGCTGGTTAGCATTGTA
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>LITCHI008515.m1 GenomeSequence + ATGGATCAAACCTTTGGGCACGACTCAGTTCCTGCTTCTGGGTCATTTGATAAGTCTAGA GTTTTGGATGTACGTCCATTGCGACGCCTTGTTCCAATTTTCCCATCGCCATCTAATATG TCTTCATTTCCAACTCCTGGCGCTCCATTCGTTTGTGCACCCCCATCTGGTCCTTTTCCT CCTGGGGTTGCTCCATTTTACCCTTTTTTTGGTTCAGTGGATTCTCCGAGGCCGCCCAAT GTTCACAGCAACACAATATCCGATGCTGTTCCAATAAATTCATTTAGAACGCCACCAGCT GCAACTGCTGGGGCTCGGGTAAATGGAGATACTGGGCCATCTAGGAGTACAAGGAGTCGT TTTCAGTCACAATCCCACAGTGGCTTTACAGAAGACGATGGGTACGACAGCCAAAGCCTT AATATGAACGATGTGGAGGGTACTAGTAATACTCGGAGGTCCAAGAAGAAGCCTCATAAA AGGACTAGGGGTAGTGGGTCAGGGGATATAATTTTGGCCTCACCAGAAGTTGACACCGAT GCTATACTTAATAACATTCTCTCATCATTTAATCTTGCGGAGATTGATGCGTCCCGTAAA ACTGATGGTGACAAGGAATCTGTGGGATTTATACTCCTGATATTTGATTTGTTCCGAAGA AAAATATCACAAGCTGAGGATACAAGAGAAGTTCATGGGGTCAGCCGACGCCCTGACTTG AGAGGAGGTGCAATCTTGATGAATAAAGGGATTCGGACCAATGCTAAAAAGAGAATTGGC GTTGTGCCTGGTGTTGAAGTTGGGGATATTTTCTTTTTCAGGATGGAATTGTGCTTGGTT GGACTGCATGCCCCATCAATGGCGGGGATTGATTACATGAGTTTGAAAGTCAGTCAAGAA 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AAGAGTATTTTGGCGTGCTTAAATCGATTTTGGACTCATGTGCAATTGCCTTGTTCTATC ACCAGATGATCAGTAGGGAGATAACAGCCAGTAGATGACTCTGGGCAGTGCAAGTCCCTT TCTGGAGTTCGTTGTGGTTATCGGTATT