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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008340 | Chr7 | 4076329 | 4080816 | + | Integrin-linked protein kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008340.m1 | 40 | 109 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 38.4 | 1.50E-09 |
LITCHI008340.m1 | 43 | 94 | PF13857.9 | Ank_5 | Repeat | 35.3 | 1.10E-08 |
LITCHI008340.m1 | 57 | 87 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 30.9 | 2.70E-07 |
LITCHI008340.m1 | 57 | 84 | PF13606.9 | Ank_3 | Repeat | 20.7 | 0.00041 |
LITCHI008340.m1 | 58 | 95 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 22.8 | 0.00011 |
LITCHI008340.m1 | 147 | 251 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 45.3 | 7.10E-12 |
LITCHI008340.m1 | 148 | 251 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 37.5 | 1.70E-09 |
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>LITCHI008340.m1 ATGATGACGTGTAAGAAGCAGACACAGCAGGTTGACGAAGATTCTTTTGGTGGCGACTTC GACATGCAGTCCATCGGCAACTTATTGAGCTTCGCTTCAAGAGGTGACAGGGTCGGACTC AACCAGATGTTGAGGGAGGGCATTTCTCCAAATGTCCAGGACTACGACAAGAGGACTGCA CTGCATCTTGCTGCGAGCGAGGGTCATGCGCCGATCGTCGAGCTTCTTCTTCATTACAAA GCCAATGTCAACCTCCTCGACCGTTGGCAGCGAACTCCCTTGACAGATGCAAGACTTTAT GGCCATCGAGATATATGCAGGATCCTGGAAGTAAACGGAGGCAAGGATTTCATCAATGAT CAACCTATGACAGTTCGACATGAGCAATATTCAAGTGAAGTAATTAATTTTGACATTTCA GAATTGGATGTACAGAACTCCATGACTGTAGCACAGGGTGCATTTGGTGAATATCAAAAG GTCAAGTGGCGTGGAACGTGGGTGGTCAAAACTGTGATTAAGAGCCACATATACTATCCC GTTAAAATGATATTGTCTGCTAAGGAAAATACTTCTCTACAAGAACTTCGACATCCCAAT ATCTTGCAGTTTCTTGGTTCAATTGTGCAAGGAGAAGAGATGATTCTGATTACGGAGTAT CTGCCAAATGGGACATTGGAAGATATCTTGGAGAAGAAATTTCGACTTGACCTATCCACT GCATTACGCTATGCGCTTGATATTGCTAGAAATCTGTTGCAAGATGAAGGTGGTCACTTG AAGATTGGAGAGTACTGGGTTCAAATGTTGTATGAACAAATATACCCTAATCAAGACAAC TGTCAACAAAATGATGATTGTATCGTTACCAGCAACCCATCGAATGACACCAGGAAAGAT ATTCGTTCATTTGGGTACATATTTTATGAAATGCTAGAAGGAAAGTCACAGACGAAGGCA AACGTTGATTTTGTACCCAAATTTCTTATAAGTCGATGCCCTAAGCGAATTCAGCAGTAA
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>LITCHI008340.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACCTTATCAAAACAAATAAACCCAAAAAGAAAATTTCTACTAAAATTAATAATTGGAAAA CTTTCTAAATTGGATATGTCTAAACAATGAAATACTTCTCTCATAAACTAAGTGTTATTT CGTACATAAAGAAGTAATTCATATATTAACTAATAGCACCGAGAAACCATCGATTTAGCT TTTTGATGTTAGTGTCAAAACTTAAAATTTATTTTGTGTTATTTATTGAAATTTATACCT GAAAACTTTTATGCAAAATATGCAAGTCTGAAAAAAAAACAAAAACATGAAGAGAGGAAT TACGGGCGTCGCTATGAGGCCCATTTCCACCATTCATCACATGCGATGAAGCTGATGATC ACATTTACGCCTAAAACGAAATTTCATACTTATTCAATAGGCGACTAATTGAGACATAAA GTTTCACTAAGGAAATGATGACTTAAATATATTTGTGTCATTTCGTATTGTTTGTCTTCT TCATTTGCTTTTATTCATTGTTATTGTCATTATGATTATTCTTTTGTTATCGTTGCACCA GACAAGATGTTCACTTTGCTTTTGTCATCCTCATTAATCTTTTCATTTGTTAAACAATAA CTTTAAGGATGAAAACACAATCCCAACGACTTATATATATAAAAAACAAGGTCTTCATAC TATCATACAGATTCCAAATATTATCCATCCTTTTACAAATTATTAGATTCTCCATCTGAC ATATCAAAGAAATTAAAGTTTTAAAAATGAAAAACACTAAAAGATCAGTGTCATTCGAAC AGTATATCGTATATTAACATAATTTGAAATTAACCATGTTTAAATAATATCTACATTCAA TTACTTAATGTTTTTGGACAAAGCCATCTTACTGTCTCACATGTTACAAAAAAGAATTAC AAAAATTCAATATCCAAATAAAGCTCTTATATTCACTCTTAGATTAATAATTGCGCACCT CTTTCATACCTATGATCAACATTTAACTCTCATCGTACCTATAGAAAAACAAGTGTAGAA AGATATTTCCTCATAATATATGAATAATTATTGGACCAAAGCTAGCAGTTTTGGTAAAAC CCTCATTTAATTAATCTCTCCATTACTATAAAATAGTTCCTTTTTTTTTTAATTGTTACA AATACAGCTTTTACAACTGTCGAAACCTCATGATAGTAAATTTAATAAACGGTTTGGACT TTAACAGTTTAACTCTATTTCCGAACAATTGGAGAGAATGACTCATACTAATGGAAAAAC CATCCTTTACAACCAAAAAAACGTAAACGTAATTTGACCTATTTCATATATGAAACTTGC TCGTACGCACAGTGGGCATTTGGTATAGTGCCTCTACCAAAGCAACCGACTTGCGAGTTA CTATAAAGTAGTTGTCTCAACAACTTTAGTAATATTATTAATCTTGAGATCATGTTATCA CTATATATATATGGCACATTCTATAGCGCACTTGGCTATGAATAAATTTTGAATTTTGAT TATTTAATTTTCAATAGGTCAGATTTAAGGCTGTTAATCAATTAATTGAAAATTAAATTT CAATTCTTAAATTTGACTCATTAAAAATTAAATAATTAAGATGTCAAATGCATTTATACC CAAATACATTGTAGCCACACCTATATATATCGAGAGAGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGG GGGGGGGGGGGGGTTTGATTTAATGAATATTATATAGTTTCTGACTTAATCAGTGATTCC ATTCATTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTAACTAATCATTGAAGTCGTTAATATCAAAAGCTT ATAGTCATAGACATAACCGTCCATTTTCCCACCAAGAACCGTCTCTATACACAAACAAAT TCCTCTCTACTCAACTTACACTTTCTGTTTGTTTCCCGAGAAACCCAATTCAAAACAAAT AGAAGAATCATATTACTTACGAAATCTCACTCTTTATTCTCTCAGTCTTATTGTCTCTTG CTGCGGTGTTGACGAACAAC
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>LITCHI008340.m1 GenomeSequence + ATGATGACGTGTAAGAAGCAGACACAGCAGGTTGACGAAGATTCTTTTGGTGGCGACTTC GACATGCAGTCCATCGGCAACTTATTGAGCTTCGCTTCAAGAGGTGACAGGGTCGGACTC AACCAGATGTTGAGGGAGGGCATTTCTCCAAATGTCCAGGACTACGACAAGAGGACTGCA CTGCATCTTGCTGCGAGCGAGGGTCATGCGCCGATCGTCGAGCTTCTTCTTCATTACAAA GCCAATGTCAACCTCCTCGACCGTTGGCAGCGAACTGTGAGCAACCCTTTTTGTTGATTT TGATGTCTTTGATGTTGTATTTTATTTCATGTTTGTTTGCATGGGGTTGATGCTTCGTTT CGTCGACCTCAAGTGGTTAGTATACTTTACCTTTATATTCATGATAAGGATTTCACCTTA CCTATTTATCAGCATGAGTGAGTCTTCTCCTAATATATCCCTTAGTGTTATAGTATTAGA TTTCTAAACCACACGTAGTATATAAACTTGGTAGGTCTTAGATAAAATACTCTTGAACAT CAGTGTCAATATAACTAGCAACATAATACACTTATTATAGGAGTCGATATCTGTTCCTAT TAAGAGGGTCTTTGGACCGCATGTGTTGTATTTAATCTTGATAAATCATGGAAAAATATC ATTGACCATTGGTGCTAATTACCTTGTAATTATATCAAAAGATGAAAAAGTTTGAATGTC TACCTTGTTTATGCGAAAGTGCTTAGAAAATGCGTGAATTTTAGATCTATTTCAAGTTGA TTGGTGTAGATTTTTTTTTTTTTTTTCCAATGGGCTTTTCAAATGTTGGATCATTAAAGA CCCTTTATTGTGATTATTTTGATGAAATTCTGTTTGATTTTGTCTTTTAGCAAATTTAAA ATTTACAAATTGGTTGTTCGCATAGACTTTTTTGCCTATGACTCTATGCAATCTATAAGT TTTTACTTTATAAATATGCAGTGTCTTGGTCATACTTTAGGTGAAATTATTTATTGATTT TAACATCAAGTACCTGAATCTTTAATTCGACTGTGAAGCCCTTGACAGATGCAAGACTTT ATGGCCATCGAGATATATGCAGGATCCTGGAAGTAAACGGAGGCAAGGATTTCATCAATG ATCAACCTATGGTAATTGTTTTACTAAGATAATTTGTGACTAGTTATAAGAGCTAAATTC TTCATGTCAAACTGATCATATTTTGGAATTGAAAAATATGTTATGTGCAAAATGAAAATG ATGGAGAACATGTTAATACTTGCAAGTAATTGTCTTAAGCTTTCAATGGCTTGATAACCT ATAAGCCTCCATAACCAAAGGTAACAAATGATGTTAAACAGGGAAGATTTGTCGTTTGGC TAGGACAATTGTTTTTTCTCCCTTCATTTTAGTGGAGGAAGAAGAATTAAATTCAGAAAA AACTATTTATACATTTTTGACCTCTTAGGATTAAAGGAAGTGCTCAACCACTATTACTAA AGAGTAGTGTGCATTTTAACTAAGAAGATTGCTGATGTGGGGCAGCATTTAAACTAAGAA GATTGCCAATGGTATTAAGTTATAAACATAAAATGGGATAGATAGTTGATTTTGTTGTCC AAGTTCTTTGATGTTAAGGTAAGTTCTTGCATATATAACAACTTTGCTTCTCTATGATGA AGAAAGAAATTTTATAATATTTTGCATGTTTTTATAACTTCATGTTCTTCATTCTATGTA GACAGTTCGACATGAGCAATATTCAAGTGAAGTAATTAATTTTGACATTTCAGAATTGGA TGTACAGAACTCCATGACTGTAGCACAGGTACATAAAGAAAAAAGTGATTGCTTCATTAA TCAAAGTTTGCCTTCAATGTTGAAACAAGCCGCTTATAGTAGTTTCCTACTTCCTTTTTC TTGTACCAAAGCAACGAATAATACTTTCATTTTGAAAGAACATACTACTAGTTTAAATTT ATTATACAAAACTTGAGGTCAATTTCTGTGTTATGTCCAATGATTTTCTTTGTGATTCTA ATTGATTAGAGACATTTCTTCTTGTGTTAGGGTGCATTTGGTGAATATCAAAAGGTCAAG TGGCGTGGAACGTGGGTGGTCAAAACTGTGATTAAGAGCCACATATACTATCCCGTTAAA ATGTATATGATGAGATAAATGAGATTGTACATATTGTCATCTCATGCCTTGTGTTTATAT ACTATTTTGTTTAATTCAGTGGTGCCTCAAGCATACTCGTATAACCTTTTTTGTCAAGCA TGATGCAGGATATTGTCTGCTAAGGAAAATACTTCTCTACAAGAACTTCGACATCCCAAT ATCTTGCAGTTTCTTGGTTCAATTGTGCAAGGAGAAGAGATGATTCTGATTACGGAGTAT CTGCCAAATGTATTGTACTTTTCACCGTGAATACCTGAAGTGTTGTCTTTGTAGTTATTT TATCTCATAGAATCAGAAAAAATGGTTAAATTTTCTGTTGGAACTATGCCTTTTGATTTA ACTTCTTTATGGACTATAAATATCTCTATATATAAAGAAAATCTATAACCCTTGATGACA TGTATTTCTGTCAATTTGTACTGAGATATTATTCGAATAAGAATGTTGTTTTGTTATAGG TGAACTGCAATTCTACCAGCTTTTTAGAAATATAACATTGTGATTTGAGGCATCATTAAG TAAATGCATACATGCATCTGAGTTACAATCAATATATTTTACACCTTGGACATAGATAGA GCGTATGCACCTAACGAAGATGCAATAATAGTTCTAATTCTATATCAAATGTAATGTTTC CTAGCCAAGTCAGATGATTAAGACAGCAAAATGGGAAGCTTTTTTACTATAAGTCTGTAT TTGTGATCATAGCTTGAGCCTACTAAGTGGTTACTTGTGCTAATGTAGGGGACATTGGAA GATATCTTGGAGAAGAAATTTCGACTTGACCTATCCACTGCATTACGCTATGCGCTTGAT ATTGCTAGGTAATGTACTTCTGTTTCCCTACCTGCAATTTGATAGGAAGCAACTAACGTT GGCTTACAAGGCATGTTCTTTGGATGCAAACCTTATCCCCTGCTTAGAGAAAATTCATTT CCAATTCCTTTTTATTTCTTTTCTTTTTTAATTAAGCATATATATGAAATTTGTTTGAGT GTTTAAACACTATATAGGGTCATTTTCGAACAACTAATTTGTTGGGTTTAATGGTTTCTG ATATGGTATTAAAGAAACTTATAGCAATACTTCCTAACTTCAACTCCTCTAGTAACTGAA TTCATGTTTGTTGTTGGTGTTTGCTCTGAATTTGTGTTTGGGTTGTCATGTGGCCAATGC ATTAAACATGCATGTGATGGGAAGTGTTCAAGTGTCTAAATACTACTAATGGATAATTTC CTAATTATTTAAGACTTTTGAGTGTAGCGGTAACTAGCAACACTATAATTGGTAAATCTA TATCTACAACTGTATATATATATATTCTGTGTATGTTGACATGTATATACATAACTGCAT AAGCATATAAATTATACACTATGTAGATTTCTAATTTTGTAGTTCTTATACACATTCTCT GCATTATTCAATTTCTCTTAAACATTAACGATATGGTAATTTGTGCAACAACTGGCAGAG GAATGAATTACCTTCATGAGCACAAACCGCTCCCCATAGTTCACAATCATTTGAGTACCA GGTACGCTTTCATGTCAAGAATCATAATTTTGCTTAATTTGCTCCTGGTACCATATTATG GAAGGATTTTGAAGATGATTTTCTATCAATTAAATCATGAAATAAGAATAGACTTCTGTT TGGTTAATGTGACTAGCCAATGATAAAATTTGGTCATACACATGAAATGGTTTCACTAGT GTTATATGTTGTCTGGACTAAGTTCTAACATTTAATTACTAATTAATGTGTGCGATCGAA TGCTGATCATATTAAATTTTCCTTTATTTGTAAAATGTAGAAATCTGTTGCAAGATGAAG GTGGTCACTTGAAGATTGGAGAGTACTGGGTTCAAATGTTGTATGAACAAATATACCCTA ATCAAGACAACTGTACGTGACCTAACATTTTCATTAACTTCAAGGCTTTCAACATATTTG CTATTGCATCTCAAGAACCTGTTTGGTTTTACAGGTCAACAAAATGATGATTGTATCGTT ACCAGCAACCCATCGAATGACACCAGGAAAGATATTCGTTCATTTGGGTACATATTTTAT GAAGTATGTATTCGGATTAGATTAATTAAACACGAGCTATAACTTCAATCTTGATTTCTA TAGTGATAAACACTCTCCATATCATTCTTGAAATATACATATATCCTTATTATCTAAAAA TGATTGTGTTACATACAGATGCTAGAAGGAAAGTCACAGACGAAGGCAAACGTTGATTTT GTACCCAAATTTCTTATAAGTCGATGCCCTAAGCGAATTCAGCAGTAA