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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008316 | Chr7 | 3659336 | 3665718 | - | E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 10 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008316.m1 | 36 | 101 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 33.6 | 4.20E-08 |
LITCHI008316.m1 | 39 | 99 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 27.9 | 2.90E-06 |
LITCHI008316.m1 | 184 | 320 | PF10536.12 | PMD | Domain | 35.9 | 5.10E-09 |
LITCHI008316.m1 | 434 | 565 | PF03145.19 | Sina | Family | 44.6 | 1.80E-11 |
LITCHI008316.m2 | 27 | 92 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 33.7 | 4.10E-08 |
LITCHI008316.m2 | 30 | 90 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 28.4 | 2.10E-06 |
LITCHI008316.m2 | 175 | 311 | PF10536.12 | PMD | Domain | 35.9 | 5.00E-09 |
LITCHI008316.m2 | 425 | 556 | PF03145.19 | Sina | Family | 44.6 | 1.70E-11 |
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>LITCHI008316.m1 ATGGTACCAAGTAAAGAAGATGCTTCAATGATAAAGAGAAAGGATGAGGAGCATGAGTTG GAAGGGAAGAGTAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAGTTGACTGTCCTCGTCCTGCATGC TCATGGGTGTATTTTAGCCGTGAGTTTATAAAGGAGTATAGTGCTTCCCATCCTGAGTCC TCAGGCCTGAAAGTCGCCACAAAGGCAGCTTCTGATGCTTGGAAGTCGATGAGCCATGAG GAGAAAGCAACATATACCAAGCGTGCTCGTGAAGTGTGGGATAATTACTTGAGCACAGCT CCTGCACGTGCTCCCAAGCCAAGAAAGCAGACTAAACTAGTTACAAGATGTTCTCCTGGC CGCTTATTCAATGTGCTACAGCGGTTAACACCTGAACAAAAAGAAGCAGTGAAGAGTATG GGATTTGGAAGCCTCCTTGGCCTTAGATGCCGGACCCTCCGTCGCAGTTTGTGCCTTTGG CTATTGGAGAGATTTAACACTACACGTCGTAGCTTGGAGATTTGTGATGAGCTCGTTCCT TTGTGTGCAAAAGATGTGGAGCTTGTGATGGGATTATCAGCTAGTGGGAAGGATGTGGTA AACTCAGGGCCTGATGACTTAATTGCAGACTTACGTCGTAGCTATAATGCTTCAAATCAT GGGATATCAGTGCGGCTTCTGGAAGAACGGTTGGCAGTTCCAGAAGCAGGAGATGACTTT AAAAGATCATTTATCCTATATGCATTGGGCACTCTTTTGTCCCCGACTGCAAGGCTGGAT GTAAGCCCTTCATTCCTTCACTTCTTGACAAACATGGATGTAATCCATCAATACAACTGG GGAAAATTTTTACTTGACCGGCTAGTTCGTGAGGTTTCTCGTTATCGTCAAGGGAAGCAA CGTGCTGTTGGTGGATGTCTTTTGTTTCTCCAGCTCTTTTATTATGAGTCTATCTCCATT GAGGGATCTGGTGCTGTGGATCCCACAGTTGTCCCACGCTTATCTTCATGGGGTGAAGAA GAGATTACTGAGAGAGAAAAACGAGAAAGAGAGCTTGGTGGTTATGGATCTGGAGAGGTA ATTTGCAAGGAAAGGTGCCTTGGTATGGAGCCATCAGAGTGCAGAGGTCAATTAGGTGGC CCACCAGCGAGGACACTAAGCACTGGTGTGGAATGTGGTCCTCAGTTTGAACAGGAGAGG AGTCAGGCTGATGAGGAACAGATGAACCAAGATATCACAATAGATGAGGTAGATATTCCA AATTTGTTTGAAGGTCATACTGTAGTTTGTGGGAACATTGACGTGGTTGTTGACTCAATG ACATCTTTTTGCCGAAACAAAGAATATGGATGCAATGAAACAGTGGATTATGCAAAGAAT AATGATCATGAACAAACATGCATGTATGCGCCATGTTCATGCCCACTCTTAGCCTGTAAC TTTGTTGGCTCATCCGAACAGTTGTCACTTCACTTCAGCAGCAAACACTGGGATTCCGGA AGGCGATTCAGGTACAATAGCCCTTTGAGTGTCTCTCTAGGGATAACTGAAGATTTCCTA GTTCTTCAAGCTGAGGAGGATGGTGTACTCTTCCTCCTCAACAAGGGTGTTGTAGCCATT GGTCACACTGTGATGATAACTTGTATTGGCCCTACTAGCACTAGCACATCAAAGGAAAAG TTCCTCTACGATCTCATTTCCGAAAGAGGAATAAGCTCACTTAGATTAAAATCAGTGACA GAATATTTCCCTGGGCGAGTGGAAGGTTTTGCTCCTATGGATTTTCTTCTGATCCCGTTT CGTTTCCTTGGTTCATCTGGGGAGCTCAACTTGGAAGTCTGTATATGGAATAATACAGAA TTTGGTGTAGGTTGTTCTTTATAA >LITCHI008316.m2 ATGATAAAGAGAAAGGATGAGGAGCATGAGTTGGAAGGGAAGAGTAAAAAGAAGAAAAAG AAGAAGAAAGTTGACTGTCCTCGTCCTGCATGCTCATGGGTGTATTTTAGCCGTGAGTTT ATAAAGGAGTATAGTGCTTCCCATCCTGAGTCCTCAGGCCTGAAAGTCGCCACAAAGGCA GCTTCTGATGCTTGGAAGTCGATGAGCCATGAGGAGAAAGCAACATATACCAAGCGTGCT CGTGAAGTGTGGGATAATTACTTGAGCACAGCTCCTGCACGTGCTCCCAAGCCAAGAAAG CAGACTAAACTAGTTACAAGATGTTCTCCTGGCCGCTTATTCAATGTGCTACAGCGGTTA ACACCTGAACAAAAAGAAGCAGTGAAGAGTATGGGATTTGGAAGCCTCCTTGGCCTTAGA TGCCGGACCCTCCGTCGCAGTTTGTGCCTTTGGCTATTGGAGAGATTTAACACTACACGT CGTAGCTTGGAGATTTGTGATGAGCTCGTTCCTTTGTGTGCAAAAGATGTGGAGCTTGTG ATGGGATTATCAGCTAGTGGGAAGGATGTGGTAAACTCAGGGCCTGATGACTTAATTGCA GACTTACGTCGTAGCTATAATGCTTCAAATCATGGGATATCAGTGCGGCTTCTGGAAGAA CGGTTGGCAGTTCCAGAAGCAGGAGATGACTTTAAAAGATCATTTATCCTATATGCATTG GGCACTCTTTTGTCCCCGACTGCAAGGCTGGATGTAAGCCCTTCATTCCTTCACTTCTTG ACAAACATGGATGTAATCCATCAATACAACTGGGGAAAATTTTTACTTGACCGGCTAGTT CGTGAGGTTTCTCGTTATCGTCAAGGGAAGCAACGTGCTGTTGGTGGATGTCTTTTGTTT CTCCAGCTCTTTTATTATGAGTCTATCTCCATTGAGGGATCTGGTGCTGTGGATCCCACA GTTGTCCCACGCTTATCTTCATGGGGTGAAGAAGAGATTACTGAGAGAGAAAAACGAGAA AGAGAGCTTGGTGGTTATGGATCTGGAGAGGTAATTTGCAAGGAAAGGTGCCTTGGTATG GAGCCATCAGAGTGCAGAGGTCAATTAGGTGGCCCACCAGCGAGGACACTAAGCACTGGT GTGGAATGTGGTCCTCAGTTTGAACAGGAGAGGAGTCAGGCTGATGAGGAACAGATGAAC CAAGATATCACAATAGATGAGGTAGATATTCCAAATTTGTTTGAAGGTCATACTGTAGTT TGTGGGAACATTGACGTGGTTGTTGACTCAATGACATCTTTTTGCCGAAACAAAGAATAT GGATGCAATGAAACAGTGGATTATGCAAAGAATAATGATCATGAACAAACATGCATGTAT GCGCCATGTTCATGCCCACTCTTAGCCTGTAACTTTGTTGGCTCATCCGAACAGTTGTCA CTTCACTTCAGCAGCAAACACTGGGATTCCGGAAGGCGATTCAGGTACAATAGCCCTTTG AGTGTCTCTCTAGGGATAACTGAAGATTTCCTAGTTCTTCAAGCTGAGGAGGATGGTGTA CTCTTCCTCCTCAACAAGGGTGTTGTAGCCATTGGTCACACTGTGATGATAACTTGTATT GGCCCTACTAGCACTAGCACATCAAAGGAAAAGTTCCTCTACGATCTCATTTCCGAAAGA GGAATAAGCTCACTTAGATTAAAATCAGTGACAGAATATTTCCCTGGGCGAGTGGAAGGT TTTGCTCCTATGGATTTTCTTCTGATCCCGTTTCGTTTCCTTGGTTCATCTGGGGAGCTC AACTTGGAAGTCTGTATATGGAATAATACAGAATTTGGTGTAGGTTGTTCTTTATAA
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