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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI008188Chr720990632104906+Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI008188.m198270PF20167.1Transposase_32Family98.73.50E-28
LITCHI008188.m1457546PF03101.18FAR1Domain66.33.40E-18
LITCHI008188.m1668762PF10551.12MULEDomain89.21.90E-25
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>LITCHI008188.m1
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CGGTCACAGCACTCGCATGTCAGTAAGGGTAAGAAGGCGGGTAAAAACCAGACCTCATCA
TTGGGAAACAAAAATGTCATTGGTTCAAGAGCAGCATCAACAAACCATCGTTTCATCTCT
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CTTAAGGTAGAGCAGGAGAAATTATTCGCATCAATGTGCTCCCAACTATCCAGTCATGGA
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ACAACTTTGCAGCAGGGCGATGTACTGGGTGACGGGATGAATGACAAAAAGGTGGATTAT
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GCTGTTGGAGGTGGCAAAAGTCCGTTGGATGATCCTAATAACTTCTCTTGTTTAAGTACA
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AACCGTTTATTTAATAAATATTTGAGCCGTCGTTTGAAATTATTCGAGTTCGTCAGCCAA
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AATTCGCATCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTACAAATAGAGACACATGCATCAGAAGTT
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GGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAGCTGAAAATAACTTCCTATGCTCATGC
AAATTGTTTCAAACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTCAGTGTAATGAAAGCTATG
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CCTGGTATGACTCCGATCATGACTGATGCTAACGTAGCGCCAACTGAATGCTGA
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>LITCHI008188.m1
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HCHALATPNQAQFLRSHRHVPTANIAQAESWKYIGVRTCQVMEHMVHQAGSHAGVGHSRK
DLQNGLDSKHRCTSTNGDADAVIAYMTGKQQMDGNFFFKFTITEDGSLGNIFWADSQSRI
DYHYFGDVISFDSTYKTNAYNRPLVIFVGVNNHNKTTVFGFCLVVDETIATYTWVLKTFL
EAMQHKHPVAVVTDGDIAMHKALKTVMPEATRRLCAWHLERNVQTNICNVAFTREFTNCM
LTYMTELDFQQYWSMMVATYKLEDNAWVRKLFGRRKQWAETFLRTTFFGGMRSTQRSESI
NRLFNKYLSRRLKLFEFVSQTHRVMERLRHNEARDNFENINSHPMLETHLLQIETHASEV
YTRNIFLKVRDEINSEATLSIINCATDMTQKTFTFKKFACGETTWDVVYNPAENNFLCSC
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>LITCHI022986.m2
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TTGGTCTCGATTCTTGATTCTAGCATCTTCTTTTCTTCCAGACAGAACCGATTCGAATCC
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TGGCTCCGAATATATGAAGTTACTCTTATTTTCTTGCAGAACATGTAGGCACGAAAACTG
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GTAGCACTGAGAGCTCTATTAAACCAATTGAGATACCTCCTCCTCGACCTAAAAGAAAAC
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AGCCAGAAAGGACGCCATCCCCAAATGGGTTGGTTTTGGACAACCAATCTCCCACCTCGG
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GTTCTTCTCCAGCTTCTTGTACAACTGAAAATGAATATGTGACATCCAACTCAAACCCAG
AAGAAGATAACGCTTCCATGTTACCTGTCCAACTATCAGCCAGTTCAACCATGGAAGACT
TTCTGTCCGTGAAAATCGAATCACAATCGGACGACTGTGTGTGTGTTAAAGGAGATGCAA
CCACAGCACAACCTTGCTCGAGTATCAAGCTTTTTGGAAGGACAGTCTTAGTAGCAGATT
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TAGTAGATTGTGACACTGACAATGAAAATTTTGTTCAGGAATTACCATTAAAACAATTAG
ACGCACATTTGTCACTTGGCATGGTGTCTTGTAATCGGAATGCCTCCTCATCTGGAGGGG
AGGCCCCTGATTACACTAATATGGAGCTCCTGAAAGAGCACACCAACATTGCAGCAGAAG
CTTGTTCTAGTGCTTCCCTGCCATTGTTGGCTTTGCATCAAGGCCTACCCTTGGTCTTTA
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TTCTGAAAGAAAGATCTTCCACTGGTTCAAGTAGCGGGTCTGTTAGTGAGCTGGAAACTG
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AGGTAAAATCGTCTATGGTTGCATCCGAAGAACGTGAGAGTCAACGAGCACGGGTATGCT
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AAGGAAGAAACACAGGCAATTACAGCTTCAACGTGATAGCTCTCTGGTAGTGTCCTCTGT
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AGGTTGCAAATGTGTTGTTATTGCCGTTTATAGTGACCGTCATTAGGGGACTGAAAAATA
TTGTTAAAAAATTAAGTTACTGTTTTCAATACATATTATATTTAAATTGATTTTTCTCTC
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>LITCHI022986.m1
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ACGTGTCACCTCCCACGCTGCTTTTAACCTCTCTGGTTTTTACGTTTTAGATTCCATTTC
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AAGATTTGTTTTTGGCTGGATCCAATTTTGGGAGTGGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGA
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GAAAATTTTGTTCAGGAATTACCATTAAAACAATTAGACGCACATTTGTCACTTGGCATG
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CCGTTTATAGTGACCGTCATTAGGGGACTGAAAAATATTGTTAAAAAATTAAGTTACTGT
TTTCAATACATATTATATTTAAATTGATTTTTCTCTCTAGTTAATAATATTATTTATTTA
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>LITCHI022986.m4
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AGTTACTTTCCATTATATCTTATCTTACAGCCAAATTAAAAACAAGACGAGAGAGTGAGA
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ATTCCACGGCTCGTTCTCGAATTTTCCATGATAAATTTGAAAAAAAAAAAAACCAGTCTG
ACGTGTCACCTCCCACGCTGCTTTTAACCTCTCTGGTTTTTACGTTTTAGATTCCATTTC
CCTTCTATGAAATATCTATCTGTCTATTCATCTATCTATTAAAACTCTCTCGTCTCTTCT
TTGGTCTCGATTCTTGATTCTAGCATCTTCTTTTCTTCCAGACAGAACCGATTCGAATCC
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TTGTATTCGTTTGAGAATGACCATATGCCCAGGGTATCATTTTTTTCTATAGTTTGTCGA
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GAGTGGTTGTTCTCTGTTTTAATAGGTCAGGAAACCGTACACTATCACCAAACAAAGAGA
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ACCTGTCCAACTATCAGCCAGTTCAACCATGGAAGACTTTCTGTCCGTGAAAATCGAATC
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TGTTGAGAGTTATAAGTCACCAATACCCAAGAACAATCTAGTAGATTGTGACACTGACAA
TGAAAATTTTGTTCAGGAATTACCATTAAAACAATTAGACGCACATTTGTCACTTGGCAT
GGTGTCTTGTAATCGGAATGCCTCCTCATCTGGAGGGGAGGCCCCTGATTACACTAATAT
GGAGCTCCTGAAAGAGCACACCAACATTGCAGCAGAAGCTTGTTCTAGTGCTTCCCTGCC
ATTGTTGGCTTTGCATCAAGGCCTACCCTTGGTCTTTATCACGTCAGCTGGAACCCTAAT
GGAATGTAGTGTGAACGAAACACTGAAAGAGAAGGATGTTCTGAAAGAAAGATCTTCCAC
TGGTTCAAGTAGCGGGTCTGTTAGTGAGCTGGAAACTGGGGAGAGAAGTTCTGACACTGC
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ATCCGAAGAACGTGAGAGTCAACGAGCACGGGTATGCTCATAGCATATCCTTTCCGCCAT
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TTTAAGCTGAGCCTAGCAAATAAAATTAGCAATCCTGTAAGGAAGAAACACAGGCAATTA
CAGCTTCAACGTGATAGCTCTCTGGTAGTGTCCTCTGTATCATTATATTGCTTCATGAAT
TATGACCCTCTTTTCGTTATGAGTCCTTTTTTGGGGCCAGGTTGCAAATGTGTTGTTATT
GCCGTTTATAGTGACCGTCATTAGGGGACTGAAAAATATTGTTAAAAAATTAAGTTACTG
TTTTCAATACATATTATATTTAAATTGATTTTTCTCTCTAGTTAATAATATTATTTATTT
AATAATAATTTAAAATACAATTAGATACTTCAAAAGATTATATCAGAAAATTTGTTAAA
>LITCHI022986.m3
GGGACACAATTATTTAAGAAAAAAGGACACAAATGACTAGCATTTATCCACCCGTGACCC
AGTTACTTTCCATTATATCTTATCTTACAGCCAAATTAAAAACAAGACGAGAGAGTGAGA
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ATTCCACGGCTCGTTCTCGAATTTTCCATGATAAATTTGAAAAAAAAAAAAACCAGTCTG
ACGTGTCACCTCCCACGCTGCTTTTAACCTCTCTGGTTTTTACGTTTTAGATTCCATTTC
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TTGGTCTCGATTCTTGATTCTAGCATCTTCTTTTCTTCCAGACAGAACCGATTCGAATCC
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TGGGTTTCTGTCACTGTTTTACGCTTCTTCTTCGTAAGAGTCGATACTGCACAAAAGACA
AAGATTTGTTTTTGGCTGGTGAGTTGCTGATCTGCTTATTATATATCAACTACAAATATC
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TTATGTTATTGTAATTTGTGATGTTAATAGACGTTTGTTGGATGAAAAAGAAGAAATGAC
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AAGAGTTAATGATTAAGACTAATCACTGTATTTTGTGCTAATTATGGTATGTTTTATCAA
TATTGTTTTTAGTGTTTGAGGCTTGTTTTTATATGTTTTTGTTGATCCTTGTGTGTGTCT
CTAAATGGGACTATTATGGTTGATTTGATTTGGGTTTTGAGAGCAAAATTGTTAGCTAAA
TTGTTCAATTTTTTTTTTTGGGTACAGGATCCAATTTTGGGAGTGGAAAAAAAAAAAAAA
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TTGTATTCGTTTGAGAATGACCATATGCCCAGGGTCAGGAAACCGTACACTATCACCAAA
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GGCCGTGGTTGGCGTCAGATAGAAGGTAAGGTGGTACTAAATTAAGCGATTATTGAAACT
CTTTGGAGCTTGTGGTGGCTCCGAATATATGAAGTTACTCTTATTTTCTTGCAGAACATG
TAGGCACGAAAACTGCTGTCCAAATCCGAAGCCATGCTCAAAAGTTTTTCTCTAAGGTTG
AATTTTTGTGCTTATTATGAATTTTGATGAATTGACAATCCTGTTTGTCCTGCTTAGTAA
GGTTTATCCAGCGATTATTCGCTTGCGTTTATGGATTTTCTCTTATTGGTTTCAGGTGGT
CCGGGAGTCAAATGGTAGCACTGAGAGCTCTATTAAACCAATTGAGATACCTCCTCCTCG
ACCTAAAAGAAAACCAATGCATCCTTACCCACGTAAATCGATTGATTCACTCAAAGGGAC
ATCCTTTTCGAATCAGCCAGAAAGGACGCCATCCCCAAATGGGTTGGTTTTGGACAACCA
ATCTCCCACCTCGGTGTTGTCTGCGTTTGCTTCTGATGCTTTGGGATATGGGGTCTCAGA
TCAACAAAATGGATGTTCTTCTCCAGCTTCTTGTACAACTGAAAATGAATATGTGACATC
CAACTCAAACCCAGAAGAAGATAACGCTTCCATGTTACCTGTCCAACTATCAGCCAGTTC
AACCATGGAAGACTTTCTGTCCGTGAAAATCGAATCACAATCGGACGACTGTGTGTGTGT
TAAAGGAGATGCAACCACAGCACAACCTTGCTCGAGTATCAAGCTTTTTGGAAGGACAGT
CTTAGTAGCAGATTCTCAGAAATCATATTCATCAGGTGTTGAGAGTTATAAGTCACCAAT
ACCCAAGAACAATCTAGTAGATTGTGACACTGACAATGAAAATTTTGTTCAGGAATTACC
ATTAAAACAATTAGACGCACATTTGTCACTTGGCATGGTGTCTTGTAATCGGAATGCCTC
CTCATCTGGAGGGGAGGCCCCTGATTACACTAATATGGAGCTCCTGAAAGAGCACACCAA
CATTGCAGCAGAAGCTTGTTCTAGTGCTTCCCTGCCATTGTTGGCTTTGCATCAAGGCCT
ACCCTTGGTCTTTATCACGTCAGCTGGAACCCTAATGGAATGTAGTGTGAACGAAACACT
GAAAGAGAAGGATGTTCTGAAAGAAAGATCTTCCACTGGTTCAAGTAGCGGGTCTGTTAG
TGAGCTGGAAACTGGGGAGAGAAGTTCTGACACTGCCGCTGATTCTCAATGGCTACAAGC
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TTTAGCTGAGGGAGAGGTAAAATCGTCTATGGTTGCATCCGAAGAACGTGAGAGTCAACG
AGCACGGGTATGCTCATAGCATATCCTTTCCGCCATCACGATTCAACTGATTTATATAGC
ATAATTGATGGCAAAAAATAACACTTAAGGAGATTATTTAAGCTGAGCCTAGCAAATAAA
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GTAGTGTCCTCTGTATCATTATATTGCTTCATGAATTATGACCCTCTTTTCGTTATGAGT
CCTTTTTTGGGGCCAGGTTGCAAATGTGTTGTTATTGCCGTTTATAGTGACCGTCATTAG
GGGACTGAAAAATATTGTTAAAAAATTAAGTTACTGTTTTCAATACATATTATATTTAAA
TTGATTTTTCTCTCTAGTTAATAATATTATTTATTTAATAATAATTTAAAATACAATTAG
ATACTTCAAAAGATTATATCAGAAAATTTGTTAAA
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>LITCHI022986.m4 +  Up_Stream_Len 2000
ATTTAATTCCTTACCCATAACCATTTATGTTATATTATTTTATAATTAGATAGAGACGTC
TTTTTATCTTTTAAGGGAAACTATACAGGTACATCAATCTCAGCATTGAAGTAAATATAA
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AAAAAAAAAAATGGGACACAATTATTTAAGAAAAAAGGACACAAATGACTAGCATTTATC
CACCCGTGACCCAGTTACTTTCCATTATATCTTATCTTACAGCCAAATTAAAAACAAGAC
GAGAGAGTGAGAGAGACTGACTTTACCAAAAAATGCCGCGTGTCACGAGTCCCGTCCATT
CTCAGCCACAAGATTCCACGGCTCGTTCTCGAATTTTCCATGATAAATTTGAAAAAAAAA
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AGATTCCATTTCCCTTCTATGAAATATCTATCTGTCTATTCATCTATCTATTAAAACTCT
CTCGTCTCTTCTTTGGTCTCGATTCTTGATTCTAGCATCTTCTTTTCTTCCAGACAGAAC
CGATTCGAATCCGGAAAAAAAGCCTCCGATTTCGCGCTCACTTAAAAAAGCAGAAAAGAG
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GCACAAAAGACAAAGATTTGTTTTTGGCTGGTGAGTTGCTGATCTGCTTATTATATATCA
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GTATTTACTTTGAAGAGTTAATGATTAAGACTAATCACTGTATTTTGTGCTAATTATGGT
ATGTTTTATCAATATTGTTTTTAGTGTTTGAGGCTTGTTTTTATATGTTTTTGTTGATCC
TTGTGTGTGTCTCTAAATGGGACTATTATGGTTGATTTGATTTGGGTTTTGAGAGCAAAA
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AAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAATGTCAAGCACTTGTGTACCGAAATCTGAAAGTTCGCTC
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>LITCHI022986.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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CTCGACCTAAAAGAAAACCA
>LITCHI022986.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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GTTGAATTTTTGTGCTTATT
>LITCHI022986.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI022986.m4 GenomeSequence + 
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GTTACTGTTTTCAATACATATTATATTTAAATTGATTTTTCTCTCTAGTTAATAATATTA
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GTTAAA
>LITCHI022986.m2 GenomeSequence + 
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GTTAAA
>LITCHI022986.m3 GenomeSequence + 
GGGACACAATTATTTAAGAAAAAAGGACACAAATGACTAGCATTTATCCACCCGTGACCC
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CAAATGGTAGCACTGAGAGCTCTATTAAACCAATTGAGATACCTCCTCCTCGACCTAAAA
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CCCTGCCATTGTTGGCTTTGCATCAAGGCCTACCCTTGGTCTTTATCACGTCAGCTGGAA
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CTTCCACTGGTTCAAGTAGCGGGTCTGTTAGTGAGCTGGAAACTGGGGAGAGAAGTTCTG
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CCGCCATCACGATTCAACTGATTTATATAGCATAATTGATGGCAAAAAATAACACTTAAG
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GCAATTACAGCTTCAACGTGATAGCTCTCTGGTAGTGTCCTCTGTATCATTATATTGCTT
CATGAATTATGACCCTCTTTTCGTTATGAGTCCTTTTTTGGGGCCAGGTTGCAAATGTGT
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GTTAAA
>LITCHI022986.m1 GenomeSequence + 
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