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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008188 | Chr7 | 2099063 | 2104906 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008188.m1 | 98 | 270 | PF20167.1 | Transposase_32 | Family | 98.7 | 3.50E-28 |
LITCHI008188.m1 | 457 | 546 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 66.3 | 3.40E-18 |
LITCHI008188.m1 | 668 | 762 | PF10551.12 | MULE | Domain | 89.2 | 1.90E-25 |
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>LITCHI008188.m1 ATGGGGAAGTCCAAATACGATAATGTTTCAAAGAATCAGCATGATAGGAAAAAGAGTCTT CGGTCACAGCACTCGCATGTCAGTAAGGGTAAGAAGGCGGGTAAAAACCAGACCTCATCA TTGGGAAACAAAAATGTCATTGGTTCAAGAGCAGCATCAACAAACCATCGTTTCATCTCT TCTGAGGCTCGTTCACGATATCAGACATTCTCCGGTCGTCCGTTCATTTTTGAGAGGGCC GTGAAATTTGAAGATTTGGAGGACACCGGTCTTATGGAGGTACTTCGTGGTAGAAAATGG GTGAAATTGGCCTCTACACCAGCAAAGTCCTGTGAAAACATGGTCCGCGAGTTTTATGCA AACTTCCTGCCAGAGCCATTTATGGAAGGGAAGGGCACACCAGTAAGGGGTACTAATGTC ATCATCACCCCAACTCTGATTAATAAGTACTTCAAAGTTCCTGAAATCGCTGAGTCTGAC GAGTATAATGTTGAGCATATCGCAAAAGCTCAAATGGTTACGGATCTATATGGTTCAGAG ACTATTGAAAGTAAACAAATATTGTATCAGAAGTTCACTGTCAAGTATGCATTCTGGTGT ACATTTGCTTCACACAATCTCCTTCCAAGTAAGCACTTCGCCAAAATCAGGGAACCCAGA GCCCGACTTGTACATGCTATTGGCACTAACCGACCCATCAACGTTGGGAAGTGTATTTTC ACTGCAATATATGATGCCGGCACTGCTACAAGGTATGGATTCCCTTTTCCTGCCCTTATA ACTCAATTTTGCTTGAATGCTGGTGTTCCAACGGAAGTGTGCGATTTGTGGTTGTCTCCA CCTAAGCCAATTGATGGCGTCACATATGATACATTGCACGACCGCATTATGAATGGTAAC AAACCGATTGCAGAAGAAAAGCACAGAAAATGCGAGCGTCAAGAACAGGCCATTGCAAAC CTTAAGGTAGAGCAGGAGAAATTATTCGCATCAATGTGCTCCCAACTATCCAGTCATGGA CAGTCCCTTGCTCAAGTTACGCAGCTACTACATGAGCAATTGTCTCCTGCCACAAATGAC ACAACTTTGCAGCAGGGCGATGTACTGGGTGACGGGATGAATGACAAAAAGGTGGATTAT TTTACTCACCAGTGGTTTCCGGATGTTAACAACGATAGCTTTCATACATCACCCTCTGCA GACCAATGTACACGAACACCGTCGCTTTTCCAGACCACTGGTGATGCTGATGCTGATGAT GCTGTTGGAGGTGGCAAAAGTCCGTTGGATGATCCTAATAACTTCTCTTGTTTAAGTACA TCCGATGTTATGGGAAAAGAATTCGTTTCTGTTGATGATGCAGAAGCATTTTACCAGAAA TATTCATTTGTGGTTGGCTTTAGTGTGCGTAAGGACATGCTGCGAAAGGATGCAAATGGG TTAATAACATGTCGACGTTGGGTTTGCTCGAAGGAGGGGTTCATACAGAAAAAGTATTTG GAGCGACGAGATAGGCAGCGTGAGTCCAAAGGCATAACTCGAGAAGGTTGTCGAGCTGCA ATGCGAATAAAATTCAACCGTGAAAAAAGTATGTGGGTTGTCGACGAGTTCGTAACGGAA CATTGTCATGCCTTAGCGACTCCAAACCAGGCGCAGTTTCTTCGTTCGCATCGTCATGTT CCGACTGCTAACATTGCACAAGCTGAATCGTGGAAATATATTGGGGTTCGCACCTGTCAA GTTATGGAGCATATGGTCCACCAAGCTGGCAGTCATGCAGGTGTTGGTCACAGTCGTAAA GACTTGCAAAATGGGTTGGATTCCAAACATAGGTGTACCTCAACCAATGGGGATGCTGAC GCAGTTATTGCGTACATGACAGGAAAACAGCAAATGGATGGTAATTTTTTTTTCAAGTTT ACTATAACTGAAGATGGGTCATTAGGGAACATTTTTTGGGCTGACTCGCAGTCTCGTATT GATTACCATTATTTTGGCGATGTTATATCTTTCGATTCGACGTACAAGACGAATGCATAC AACCGACCTCTTGTTATATTTGTGGGGGTGAATAACCATAACAAAACTACAGTCTTTGGA TTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACGTGGGTCCTCAAAACTTTTCTG GAAGCAATGCAACATAAACATCCTGTAGCTGTTGTGACGGATGGCGATATCGCGATGCAT AAAGCACTAAAAACAGTAATGCCTGAGGCAACTAGGCGATTATGTGCATGGCATCTGGAA CGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGTTGCCTTCACTAGGGAGTTCACGAACTGCATG CTTACGTACATGACCGAGCTTGACTTTCAACAATATTGGTCGATGATGGTTGCAACGTAT AAATTAGAGGACAACGCTTGGGTTAGAAAGTTGTTTGGGAGACGGAAGCAATGGGCAGAA ACATTTTTGAGAACCACATTCTTTGGCGGGATGCGAAGCACGCAACGTTCTGAGAGCATA AACCGTTTATTTAATAAATATTTGAGCCGTCGTTTGAAATTATTCGAGTTCGTCAGCCAA ACACATAGGGTGATGGAAAGACTTCGGCACAATGAGGCAAGAGACAACTTTGAGAACATT AATTCGCATCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTACAAATAGAGACACATGCATCAGAAGTT TATACTCGAAACATATTCCTAAAAGTAAGGGATGAAATCAACTCAGAAGCAACACTAAGC ATCATAAATTGTGCCACTGATATGACGCAAAAGACATTTACATTTAAAAAGTTTGCGTGC GGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAGCTGAAAATAACTTCCTATGCTCATGC AAATTGTTTCAAACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTCAGTGTAATGAAAGCTATG AACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATACTGCGTCGGTGGACAAAGAACGCAAAGGCC GACGACAACGTTCATAAGGTGGTGCACGAATGTGAAGCAAATGTTGTTCATATGGCACGG TATGGAGCATTAACCAGTCAGTGTACAAAACTATGCTACTTGGCTTCTCAAACAGCAGAA GGATTTGCAGAGACAAAAGGCAACATCCATCTTCTCACTGAGAGAATAGAAGGAATCTTG GTAAAAGAAAAGGCAGCAATGAATAATGATGAGGGGCAGGATACAATGCCCAACATTGAA CATGTAAAAGATCCATTAAAAGCTACAACCAAAGGAGGGGTAAGAAAACCGAAGAAAACC TCCCCAAAGATACGTCATTGTGGAAAATGTCGACAAGTTGGGCACACGGTGAAGACATGT CCACATATGCAGCTAGAAGATATAAGTAAAGTTGGTAGTAATAAGCCGCTTCAAGAAACG CCTGGTATGACTCCGATCATGACTGATGCTAACGTAGCGCCAACTGAATGCTGA
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>LITCHI008188.m1 + Up_Stream_Len 2000 AACAAGTTTAATTGATTATTTTTATATTTATTAATTTTAGTTTCACACATCCAAGTAATA AGTTGTAAAATATAAAATTTTAACACACAATTAACGCGTAAGGCTTGCAGTCATCATAAG TGTGTAACTAGAGTGCCACACTATAATATAATAATGTACTTATTTCGATATTCGTGTGCG GCTACACCATTGTTTTAGCGTGGCCGTGCTCATATACCAATTCAAGTCTTACAATTTTCA TGGGTTAAATTATCTTATACCAGTAAGGGGTCTTATGGACACACCATTGTTGTAGCGTGG TCAAACACTAATAGCGATACAATACGATTGCATTTTAAAATGTTAAAAGGTTGACCAATA GAATAACTAAAATTTAATTACGTTTAAAAATACTAAGTTAAATTGAATTTTTTATAGAAA ACAACTTAAATTGGATAAAAATAATATGTAATCATATTTTTAAGATTTTATTTATCAGTT AAGTTGTGACGTATTGAGGTTTTTTAATGGCAATTGTCGCTATATATACAAATTAATATT ATTTTAACACCTAATATCCCTACATAAGATTTTTTAACTAAGATTACTTCAATGAAATTG TAAAGCTTTCACACGTTAGTACTTAATATTTTGTATTTTCACCATGTACAAATAAATGTA TTACTTATACAGTGATATAATTGAAATTATGCATTTAATTTTGAATCAACATGTAATTTC ATTTTATATGAAATTAAGTTATCATTATAAAAAAATATTAATTCTTCAATTATATCACTG ATTTACAATTTAAATTTAATAGGAAAAGACTTGGTTACGGATCAAAAAATATATGGGGGG ATTCAACGCCAGTACTGTGCAAAATCGGCCCAATCGGGCCGACAGGGGCAAGCTCGGGCC GACTCGGCTCGACCGAGTCGGCCTTTTTTTAAAAAATTTTTTTTTGCCAAAACGGCGTCG TTTTGGCCAAGCGAAAACGACGCCGTTTTGGCGTCTGATATAAGTGTAGATCTCGATTTT CTGCACTCTCTGTCTGGGCTCTCCACCTCTGTCCGCCTCTCCCGATTTGGTTCTGCTTCT GCATCTGCTGTTGCTGTTGGCGCGTGGCGTGAATGGCGTGACAGCTGCTGCCGTCGTCCG TCACTCCTTCATTGCCGTCTCCGTCCGTAAGTTTTTATATTTTTGTTTTCTTTTTTTTTT TGGTTTTTTCATTTTGTTTTTTCTGTTTGCTATGGATTTGTTGTGAATGTGTGTTTCGAT TTTAGGGTTAAAATCCGAATTTTGTTTTCCTCAAATGTTGGTTGCTTGGTACGATGAATT TTGGGGGTTTTGCATGACAATGGTGTAATAGTTTCAGTTATTCCTTGTATGAAAAGTTAT ATTGATTTTAACATGTTTGGATTGTGTTTAAGATATTGGGGTTTCTTTTCCATTCTGAAA AAGGATTTGTAGTTTATTTATAGGGAGATATTTTGCATGCATATATTACATGCCATTGTG TTTTGATGGTGTGAACAGTAAGTGATTTGCATATATTAATCGATGTCATTGTGCTACATA AGGGTGTTATGTGTTGAAATGGTGCAAATGAAATACACTTGGACTAGGTGTGCCATTTTC TGTCTTTTGCTCTTATTTCTGTTGGTAGTTCATTATAAAATCGTGTCTCTGATATGGGTT TCACAGTTGTAGTAGTATTACATTCTATGAAGAAGTCTGTGTGAGAGGTTGCTGTTAAAC ATTATAATGTTATTTGTAGGACTACGACGTTGATTACAGATTTCTGTGGCACCTGTTGGT GTCGTATTAGTGTACAAACATGGTGTGATAGTTTTTTGTTAGAATATTTGTTATTGCAAA GTATCGATTATGAACAAAAACCATACAGCTTTTTATATGCATACCCATAGCATAGCACGC AAATTTTTCAGTGTGAACAATTGGTAACGTTATTTGTTATCATATTGAGTTGTATCATTA CGGTTGCAGCTGCAGAAAAA
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