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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI008001 | Chr11 | 25844277 | 25846075 | - | Transcription factor MYB106 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI008001.m1 | 14 | 61 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 60 | 2.10E-16 |
LITCHI008001.m1 | 17 | 77 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 50.2 | 2.40E-13 |
LITCHI008001.m1 | 67 | 112 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 55.9 | 3.80E-15 |
LITCHI008001.m1 | 70 | 117 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 29 | 1.00E-06 |
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>LITCHI008001.m1 ATGGGAAGGTCTCCTTGTTGTGATGAGAGTGGCCTGAAGAAAGGTCCTTGGACTCCTGAA GAGGATCAAAAACTTGTGAAGTATATCCAAAAAAATGGCCATGGCAGCTGGAGAGCCCTC CCCAAACTTGCGGGTCTTAATAGATGTGGGAAGAGTTGTAGATTGAGGTGGACAAATTAC TTGAGGCCTGATATCAAGAGAGGAAAGTTTTCACAAGATGAAGAACAGACAATCCTCAAT CTCCATTCCATCCTCGGCAACAAATGGTCAGCAATTGCTAGCCACCTACCAGGAAGGACA GACAATGAAATCAAAAACTTCTGGAACACCCATCTGAAGAAGAAGCTGATTCAGATGGGA TTTGATCCGATGACTCACAGGCCTCGGACCGACATCTTCTCAAGCCTGCCTCATCTTATA GCTTTGGCTAATCTGAAAGAGCTTATGGAGAACAATCACTGCTCATGGGAAGAGCAAAGT GTGAGACTTCAAGCAGAAATGGCTAAGCTACAATACCTACAATACCTCCTTCAACCTCCA ACCACTTCAAATATTCCAACAAGCTCAAACACCATAAACAGTGCTTCTTCTTCTTTCTCT GATTTGGACACCATTAATCTTCTGAACTCACTTGCCTCAATCAAAGACAGCTCTCCAATC TCAAACTCATCATCGACCCAATTGGATGTCAATGGGGCTGCTGTCTCTCTTCAAAGTGTC CACAACTCAATCCCTTTCTCTCACATGCCAGACTTACTAGTACCCAATACTTGTAGCTAC CAAACACCACCAGCATCACTTAGTAACAACAAGGATTCCCTTCAGAATGTCCAAAACTCT CCATGGCCTGGAGCTTCATCATCTTCAACCCCATCTCCTCCTTCCATAGCTCCTCCTCCT CCTCTGCCTCTAATAGAGACTTCCCTCGACAACTTGGGAGATGCTTGCAGTACTTCAAGC TATGGAGGAGTCAATGATCCTTCAATTTGGCCCGAACTCCTCCTTGAAGATCCGTTATTT CATGAGATTTCTTAG
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>LITCHI008001.m1 MGRSPCCDESGLKKGPWTPEEDQKLVKYIQKNGHGSWRALPKLAGLNRCGKSCRLRWTNY LRPDIKRGKFSQDEEQTILNLHSILGNKWSAIASHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMG FDPMTHRPRTDIFSSLPHLIALANLKELMENNHCSWEEQSVRLQAEMAKLQYLQYLLQPP TTSNIPTSSNTINSASSSFSDLDTINLLNSLASIKDSSPISNSSSTQLDVNGAAVSLQSV HNSIPFSHMPDLLVPNTCSYQTPPASLSNNKDSLQNVQNSPWPGASSSSTPSPPSIAPPP PLPLIETSLDNLGDACSTSSYGGVNDPSIWPELLLEDPLFHEIS.
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>LITCHI008001.m1 AGACTGTATATAAATAGAAAGCTGCATTTAGTGGTTGGATTTGAGGGAGGCACAGGCAAA TCTCTAGCTGATTTACAAGTACACACAAGTAATCAAACATAGAAGAAAATTAATATGGGA AGGTCTCCTTGTTGTGATGAGAGTGGCCTGAAGAAAGGTCCTTGGACTCCTGAAGAGGAT CAAAAACTTGTGAAGTATATCCAAAAAAATGGCCATGGCAGCTGGAGAGCCCTCCCCAAA CTTGCGGGTCTTAATAGATGTGGGAAGAGTTGTAGATTGAGGTGGACAAATTACTTGAGG CCTGATATCAAGAGAGGAAAGTTTTCACAAGATGAAGAACAGACAATCCTCAATCTCCAT TCCATCCTCGGCAACAAATGGTCAGCAATTGCTAGCCACCTACCAGGAAGGACAGACAAT GAAATCAAAAACTTCTGGAACACCCATCTGAAGAAGAAGCTGATTCAGATGGGATTTGAT CCGATGACTCACAGGCCTCGGACCGACATCTTCTCAAGCCTGCCTCATCTTATAGCTTTG GCTAATCTGAAAGAGCTTATGGAGAACAATCACTGCTCATGGGAAGAGCAAAGTGTGAGA CTTCAAGCAGAAATGGCTAAGCTACAATACCTACAATACCTCCTTCAACCTCCAACCACT TCAAATATTCCAACAAGCTCAAACACCATAAACAGTGCTTCTTCTTCTTTCTCTGATTTG GACACCATTAATCTTCTGAACTCACTTGCCTCAATCAAAGACAGCTCTCCAATCTCAAAC TCATCATCGACCCAATTGGATGTCAATGGGGCTGCTGTCTCTCTTCAAAGTGTCCACAAC TCAATCCCTTTCTCTCACATGCCAGACTTACTAGTACCCAATACTTGTAGCTACCAAACA CCACCAGCATCACTTAGTAACAACAAGGATTCCCTTCAGAATGTCCAAAACTCTCCATGG CCTGGAGCTTCATCATCTTCAACCCCATCTCCTCCTTCCATAGCTCCTCCTCCTCCTCTG CCTCTAATAGAGACTTCCCTCGACAACTTGGGAGATGCTTGCAGTACTTCAAGCTATGGA GGAGTCAATGATCCTTCAATTTGGCCCGAACTCCTCCTTGAAGATCCGTTATTTCATGAG ATTTCTTAGTTTCGAAACCGCCTCTACCACCTTAATGTGTAATATTTTGAGTATATCTGT CGACTGTTCATTGTATGTATAATTAATTCCTAATATCCTACATACATATATTAAGATACA TAAGTTTGCATGTTTTGAAATCTATTTGCAAATTAATTTTGAACATAGATCACATGACAT TATGCATCCATGCATGATAGCTCAAGCTAAATATATTATCGTTTCTTGTCATTGTTTTTC TCAATTTCAAGAAATTTGTTGATGCAATGATGTTGCAGATGTCTTCGAACATATCCGTTG TTCTCCAATTATTTTCTAAGAATTGGTAGCGAAATTTCCATTCAAGATGCTTTTTGACAT TTTAAACAGCG
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>LITCHI008001.m1 - Up_Stream_Len 2000 AATCAACTCTAGTACTGCTGAATCCACTGATATTATATAAGCTGTTTTGTGAATCAGAAG AGAACAAATCACACTTGGACAAAAGAATCAACTAAGCTTCACTAGCTTTTTGTCATCATA CACATATAACCTAGAAGAGACTCTGATTGTACTTCTTTAATGGAAGAGGTGGTAGAATGT GATTGGTGAAAGATTAATAGGGATACAATGGAGTTGCTTGAGAGGACCCTAGTTTCGAGT GGGAGGAGTAGAGTGGGAAATCTGGCCGGAAACAATAATATAAATTAATGTAATTATAAA AGAGAAACTGATAATGAGGACCCATATACGATAATGGGATTTTTAAATGCATGGAATTGT ATTATAAATATGTACGTGAAATATAAAAGAGAGAAGCCATGCAATCAGTGACGACACATA GCGTGCATGGAATGGCTTCCTCTGGCCAACCGAAGACGTACCACTTGTTGCTTTGATGCT GACTTTTCCAACTTGATCAGGAGCCCCTCTTCATTTGTTTTTTTATGATTATTTTTCTTT ATTGATCCAACTGTACGTTTCTGTTTGATTCTATTGTGTCAAAAACCCCATGTAGCCCTC ACTTTTTTACATTCCCATTCTTGCCCTTCTCTTTATAGTTAAAATATTTGATGCCATTTT AAGTGATCGAAAGACCATTATGGTATGTCCTCTACTGGATCATGGTGTTGTCATCACATG TGAATTTTATTAAAAAGATGGGTGAAATTAATAATGGAAATGCATATAATCATATATCAT AATAATGAATAAAAATGGATGATATGGTAGAATAAAGTTCATCTCCTCATCTAAGCTTTG AATTTAAATATCATGTGTTACTTTAAATTACTTCAACATATTTAAGGTTATGAAAATTTC AGTAAATGATAAGAAAATTGATAAATTCTGAAAGTAACAGAAAAAAAAATAAAATAAAAT AAAGTTTTCATTTTTTTTTAGCACTTTACTAACAGACTACATGTTTACTCTTAAACTAAC ACTTATGTCACAAAATAACTATTTCTTAGTTTACACACACAAAAAAAAAAAAAAAATGTT CACAGGCGAACTATTGATGTTAAAAACACTAAACTTCTTTTTTCAATATTAGTAGATTTC AAAACTCATAGTTTTTTTAATGTTGAAAGGGTAAAAAAAAAAAACCTTTGAGAGCATTAA TATAAATAAATGAATCTTAACCACAAATGTGTAATTAAAATAGTATCTTTTAAAGCTCAA TAAAAGTTTAAAATTAGTAGAAGATTCTACTTATCCTTTAGGCACCATATTATAAAGATT TGTGGCAGATTTCAATTTCAATAATCGATCATTTGAATTTGTCCTTTTTCTACAGAGAAA AGTGAATCCTAATGTGAAATTCTAATTAACAATCTATTAATACATATATCATAAAACCAC TTTTTAAGTAAAATTTAAATGAGAGGGAATCCATATTCATAAAAGAAATGAAGTCTTTTG ACAATATTGTATCTGCAGTCTTACCATTGAAATAATTTAATGTACTTTCACATATAAAAC CACATTAATTCAACAAATTAATATCAGTTAATAGTGATACTTCACATATAATAACAGACT GTTTGGATGCAATATGTTAGTGGGACAGTAAGACACTGCAGAAAAACACAAGATTTGGGT CCACTTAACGATTTATATACATTCAACACAATCAATGTCGCAACCAAACGTGATAATAAT TAAATATGGGCTCATCATATACGTACATAGAAGGGTATAGTTGACATTTTGAAGAAGAAA AAAAGAGCAGAGTTGTTTTGATTTGCAAATGAAAAGCGCACACGGTGGAAGACTTTGTTA ATACGTACAAGGAGGACATGTGCAACAGACTGTATATAAATAGAAAGCTGCATTTAGTGG TTGGATTTGAGGGAGGCACAGGCAAATCTCTAGCTGATTTACAAGTACACACAAGTAATC AAACATAGAAGAAAATTAAT
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>LITCHI024897.m1 GenomeSequence - AGCTGTTATTTTCTCGGTAGAAAGAAACCATGAAGTAACTCAGAAAAACAGAAACGACAA TTGGACAAATAAATCGAAAGCTCACATCTCACCGCTATGAATCATGTTCTCATCTTCGTC AATCATCACTACCGACCCACCAAATTCTAACCCCACCTGTGAACTCCGGTGACCACCCCG CTCGATGAAAATGGAGGTCCTTAGACCACCTTCCCGGGCCCGCGAACAACCGTTTTGTCA TGACGGGCCGGAGATTGTTGAAGAAGAGGGAGGTGGTGAAGATAAAGTGTATGTTGCAGT TGGGAAGAACTCGGAGAAAGCGACGAGTTTGCTTCAATGGACGTTTCAACAGTTTTGTGG TGGAGAAATTTGTATTCTTCATATTCACCAACCCTCACCTGTCATTCCAACTCTCCGTAA CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTAGATTTTATAGATTTGGAGGGCGAATTTTGTTGTTTT TGGAAGAAGAGAAAATGGTTTGTTTTGAATTGTGTTGTTGTTGTGGTTTTTGCAGTAGGG AGACTACCGGCGAGTCAAGCTAGTGGTGAAGTGGTATCTGCGTTTAGGATGGAAGAGACA GAACAAATGAAGAAGCTTTTAGATGGTTACTTGAGCATTTGCTCTAAAGCAAAGGTCTTT TTATTTGTTTCCCTGTTTTTCACATTATTGGCTTTTTTTTTTTTAAGTTTCTAAAATCAC CTTATGAGGTGCAATGTGTTTGTTTTTTCAATTTTTTCCTGCGACATATATCAAGATTAG TGTTGTATTCTTGATTATTAAATGTTGGTATCAATGGATTTTTGTGTTGGTAGGATAGTC TGGGTTTCATGAATTATGTATACTTTTCGTGATTTTTGTGGAACTGCTCTGCAGATTTAG 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