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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007990 | Chr11 | 25694885 | 25703639 | + | Calmodulin-binding transcription activator 3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007990.m1 | 21 | 134 | PF03859.19 | CG-1 | Domain | 166.5 | 1.70E-49 |
LITCHI007990.m1 | 493 | 578 | PF01833.27 | TIG | Domain | 22.7 | 8.30E-05 |
LITCHI007990.m1 | 896 | 915 | PF00612.30 | IQ | Motif | 15.7 | 0.01 |
LITCHI007990.m1 | 920 | 939 | PF00612.30 | IQ | Motif | 21.1 | 0.00019 |
LITCHI007990.m2 | 21 | 134 | PF03859.19 | CG-1 | Domain | 167.2 | 1.00E-49 |
LITCHI007990.m2 | 493 | 578 | PF01833.27 | TIG | Domain | 23.4 | 5.20E-05 |
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>LITCHI007990.m1 ATGGCGGACTCTAGACGGTTCTCTCTCGGCAATCAGTTAGATATTGAACAGATACTTTTG GAAGCTCAACACCGATGGCTTCGTCCTGCTGAAATTTGTGAAATTCTTCGAAATTATAAG AAGTTCCAGATTGCCCCGGAGCCTCCTAACATGCCTGGAAGTGGAGCACTTTTTCTGTTT GATAGGAAGGTGTTGAGGTACTTTAGAAAGGATGGTCATAACTGGAGGAAGAAAAAAGAT GGCAAGACTGTGAAGGAAGCTCATGAGAGGCTCAAGGCTGGCAGTGTTGATGTGTTGCAT TGTTACTATGCCCATGGTGAAGAAAATGAAAATTTTCAAAGACGCAGCTATTGGATGCTC GAAGAGGAACTTTCTCACATAGTTCTTGTCCACTACCGGGAAGTAAAGGGAAATAGGACA AATTATAACCGCAGTAGAGTGACTGAGGCATCTACTCCTTATTCCCAAGAAACTGAAGAA ACTATACCCAACTCTGAGATTGAAGGCTCCCAATCTTCCAGCTTTCATCCTCACAATTAC CAAGTGCCTTCACAAACTACAGATACGGTCAGCATGAACAGTGCTCAGGCATCGGAATAT GAGGATGTCGAATCAGTTTATAATAATCAAGCGAGTTCTAGATCCCATTCTGTTCTTGAT TCACAACATCCTGTGACGGAGAAGATATATACTGGACTCTCAGATCCTTATTACTCTACA GCTTTTACAAATGATTACCAAGGGAAGTTCCCACCTGTTCCCAGTACAGATAAAAGTAAG GATGATGTTGGATTTGCATATGATCCACGGAAGCAACTTGACTTCCCATGGGAGGATGCA CCGGAAAAAGGTGCAACTGGCCTTCAACCTCTCCCTTATACATCGTTTTCCTCAACTCAG ACTGATACTGTGGGAAGCATTCCTAAACAAGAGCATGATATACTAGGACAGCTCTTTACA 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