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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007561 | Chr11 | 17905011 | 17907732 | + | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007561.m1 | 78 | 159 | PF01453.27 | B_lectin | Repeat | 46.5 | 4.40E-12 |
LITCHI007561.m1 | 250 | 314 | PF00954.23 | S_locus_glycop | Domain | 34.1 | 3.50E-08 |
LITCHI007561.m1 | 513 | 775 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 146.1 | 1.20E-42 |
LITCHI007561.m1 | 514 | 775 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 163.9 | 4.90E-48 |
LITCHI007561.m1 | 581 | 670 | PF03109.19 | ABC1 | Domain | 24.3 | 1.50E-05 |
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>LITCHI007561.m1 ATGCAGAGAGATAATTTTCTTTTGATGCATTATTTAATCATCTTCTTTGTCCTGTCCACC AATCCAGTAGCTACAGCTCAACAAAGACAGTCAAATATAAGCCTCGGATCATCTCTAACA CCAACCAACACATCCTCATGGCTGTCAAGTTCCGGTGTCTACGCCTTCGGATTCTATAAG AGAGGCAACGGGTATGGTGTTGGGGTTTTTGTCGATGGAATTGCGGAGAAAACTGTGGTG TGGACTTCCCGCCGAGATGACCCGCCAGTTTCTAACAACGCCACCTTGCTCTTTACAGGC AGGCTTATCTTGCGAACAGCACGAGACCGAGATACTAAAATAGCTGACATCTCACAGTCT GCCTCTTATGCTTCCATGCTTGATACCGGCAACTTCGTGCTTTATAATTCTAGAGGAGAT ATTTTATGGCAGAGTTTTGCAAGCCCAACAGATACCCTTTTGCCAAATCAAACTCTTGTT CCAGGGATGCAGCTGATTTCTAGTGTATCAACAACTGACCAATCAACGGGCTTTTTTGGT CTTTACTTGCAACCCGACGGGAACCTTGTGCAGTACCCCAAGGATTACCATACACTTGAA AGTGCTTATTGGGCATCTAATACAAATGGAATGGGTGATAAAGTGAGTGTAAAGCTTGAT TTAGATGGCAGTCTTAACATTGTCGACGCCAATGGCTCTAACGTGCGTGATATTACAGGT GGAGTGAATGCAAACCGACGAGCCATCTGCTTGATAAGACTTGATTGGGATGGGTTATTC CGGCTATATTCTCACGATTTGAGTCATAGCAGCAGCTGGTCAATCCTGTGGAATTCTACG GGCGACAGGTGTGCTCCGTGGGGTCTTTGTGGCCTTAACAGTTATTGCGTTCAGAATGCT GTAGAACCTGAATGTGAGTGTCTTCCAGGATTTGCTCCTGTTAACCAAGACAAGTACTGG ACTTCTGGTTGCCAAAGGAATTTCACACAAAAAAGCTGCAAAAATAAGGACAAAAAGGCT TCACATCTTAGAGAATTGAAGAATACAGTTTGGGAAGACAGTGCGTGGGGATATGTTTCA TATTCTATTCTGGCAGCAACATCTAAAGAAGATTGTTCACAAGCATGTTTGCTTGACTGT AATTGTGAAGTTGCCATTTTCAATGAGCAAAATTGGGGATTTGGGGGGATGGGCCAGGGT CAGTGCAAAAAGCAAAGGCTTCCTATGAGACATGGCAGGAAAGGAGATAGTTCAGCTTTT GTTTTCATCAAAGTGGAAGAAACAACTGAATCTCACACAGATGGGATTTTGCCCACCAAA TCAGGCAAGAAAGAGATCAGCATAGATCTCCTCATCATTATCTGTTGTTTATTGTTTAGT TTACTAGTTGTTATTGCGGCAATCCTTGGAATTATTCTCCACAGATACCATGTCTCGTCT TATACAAGGATTTCTTATACTGGCAATGTCGACTTTTGTGGGGATCTTGCTCCCCGATCA TTTAGCTATGCAGAGCTCCAAAGAATGACTGATGATTTCAAGGAAGAGATTGGGAGAGGA TCATCCGGTACAGTTTATAAAGGGACTTTTATGGATGATGGTGGAAAGTTTGTAGCTGCC AAGCAACTGCAAGAAGTGTTATCTACGAGTGAACAGGAGTTCCAGATGGAATTAAAAGTA ATTGGTAGGACTCATCACAGGAACTTGCTTCGTCTATTGGGTTTTTCCATTGATGGACCC AACAAGGTTTTGGTGTATGAATACATGAGCAATGGCTCTCTTGCTGATATACTCTTCACA CCTGAAAAACAATTTAATTGGTTTGAAAGAATGGGAATCGCACGAGACATAGCTAGAGGT ATTATTTACTTGCATGATGAATGCGAGAAACAGATCATCCATTGCGACATAAAACCTCAA AACATACTCATGGATGAGAATGGATGTGCAAAAATCTCTGACTTTGGATTAGCAAAGTTA ATGAAGCCAGACCAAACAAGAACCTTCACTAGAATTAGAGGAACAAGGGGATATGTTGCA CCTGAATGGCATCGGAAGCTGCCTGTAACAGTTAAAGCAGATGTATACAGTTTTGGTATT GTTCTACTAGAGATTATATGTTGTCGAAAACATTTAAATCAGAGTCTTCCGGATGATCAA GTTATTCTTGAAGAATGGGTTTACCAATGTTTTGAGGAGGGTGAGTTGAGGCAATTAGTC GGTGTTGAAGATGTTGAACCGAAACAATTGGAGCGGATAATAAAGGTTGCTCTTTGGTGC ATTATTGATGAGCCATCACTTCGTCCTTCAATGAAGAAAGTTCTACTCATGCTGGAAGGA ACAGTAGACATCCCAACACCTCCTAATCCTTGCTCTTTTATGAGCACCATCTAA
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>LITCHI007561.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAGCCTTGTTTGTTTCCTAGTATTAGATTGGCTTTGGATTAATTTTTATCTAAACTCAA ATTTGATTTAGCCAAATGAGGCCTCACTTAATTATTCTTTCACTAAATTATCCTGCTAGG TCAAGAGAAATCAATCCCGCCAAACACCATGGGTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACT CACCTCTCCTTTCACACCACTGTCCCAGCCACATCCCAACCATCACACACATAATGCCCG TCGTTGTCACACACACACACACACAAACCCATCACTGTTCCAGTCGCATTACCATTGTGT GGACGTCGTCGTCCTTGCATCGTCGTGAATCTTGGCATAAGTGGGCTCTCTCTCTCCTCT AATCTCTTTTCCATCCTCTCCTTCCTCAATCATCTCCTGCTTCAATTGCTTGTTATATGT CAATGAGCTCTCAATTGTTGCTTCTTCTTTATTGTTGCTTTGTTTTGTCTATAAATTGAT CAAGTGATTGTGATGTAAATCTCTACAAATTGTTGCTTTGTTTCGTTGACACATAGAGTT GGTCTTGAAGAAGAAGTGGAGAAGATGGAGAAATGGCTATCTACACACAAAGACAGGGAA GAGAGTCTTCTAGAAATGGAAAATAATAAATTATTTTATTAAAAAAATACAATGGTAAAA TTTTGTTCTAACAACCCATATAAGATATAAAATATAATTTTTCTTGTATAATGTCATGTT ATACCAAATAACATATAGTGTTATTTTTAATTTGTTGTAATTGCACCAAATACATTATAA TACTAATTAATCTAATTTAATACAATTCAATACATTAAAAATAATTCAATTTAATCTTGT ACATCAAACGAAACCTAAAATAACAAAATCTAAAATTCGTCAAACGAAATTACACGGCAA GAGTATGTTCATCCCAAATTCCAAATTCTACAGTTAATTACATGGTACATAAGTCAGTCA AGCATCAATGCGTCCATAAATTCTAGATCTTTTAGACGACTTTGACAACTCAACTCTTTT GCAAAGAATCTTGAATTTTTCAATCCAAAAAGGCTCTTGTTTGGACTTTGGAGATACAGA GAACCTTTAATTTTCTAACCCAAAAAGACCGCTGTTTACAATAGTTTGGATCGGAGATTT CCCATACTGACCGATGCGAGCCCTATTATCAAAACCCATAAGAGAATGAGAGATTTTTTT TTTTTTTTTTAATAATAATTTTATTATTTATTTATTAAAATAAATAATTTATTAAAATAA TAATTTATTTATTAAAATATTATAATTTATTATAATGTTAAATATATTTAATAATTATAA GTGTATTTAATAGTTTTATGAATGCAGGCGGCATTATGAAGATACATTCAAGTTTGGCTC ACAATAGAGGAAAATAAATGAACTTAAAGAACTATTTTGTAATTACAAAAGTTGTCAAAA GCAAAATGTTTCATTTTAGATATTAACAATGGCTTTTCTTTTTTTTTTTTAAGTAAATGG GTGAGGAGAGAATTTTTTGGGTTTAAATAAACAAATAAATAAATAATAAACTAGTTTAAC AAACACATCTTGTTTGACTCTCAGACCTGGAATTACATAATACATATGCAGCTGCACTTA CTCAGTATTTATAACGCAATTACTTCGCAAAATTTAAGATTTTGAATTGAAAAGTCATTT TACCACAACTTGGAAACTGACTTATACTCAACCATATATGGTCTTCAAGAACAAAAGATG TTGAATAATCTACAATTCCATCCTCCTGACATAATTTGTGAAAGAGATTCAACACCAAAC CTCAATTCCATTGTATTATATAAATGCTTTAGTGTGACTTTGAAAGAGTCAGTTTTTTAG CAACTTGACCTGGAGGACATTTTGAGTCCACATAAATTTAAATATTTGTCCACCACCAGG TTCTCATATATTGTTGAATCACACTTTCCTAAACTAAACTGAAAATTAAAATAAAAAAAA AGAAGAAGAAAACAGAGAAG
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>LITCHI007561.m1 GenomeSequence + CTGGAGGACATTTTGAGTCCACATAAATTTAAATATTTGTCCACCACCAGGTTCTCATAT ATTGTTGAATCACACTTTCCTAAACTAAACTGAAAATTAAAATAAAAAAAAAGAAGAAGA AAACAGAGAAGATGCAGAGAGATAATTTTCTTTTGATGCATTATTTAATCATCTTCTTTG TCCTGTCCACCAATCCAGTAGCTACAGCTCAACAAAGACAGTCAAATATAAGCCTCGGAT CATCTCTAACACCAACCAACACATCCTCATGGCTGTCAAGTTCCGGTGTCTACGCCTTCG GATTCTATAAGAGAGGCAACGGGTATGGTGTTGGGGTTTTTGTCGATGGAATTGCGGAGA AAACTGTGGTGTGGACTTCCCGCCGAGATGACCCGCCAGTTTCTAACAACGCCACCTTGC TCTTTACAGGCAGGCTTATCTTGCGAACAGCACGAGACCGAGATACTAAAATAGCTGACA TCTCACAGTCTGCCTCTTATGCTTCCATGCTTGATACCGGCAACTTCGTGCTTTATAATT CTAGAGGAGATATTTTATGGCAGAGTTTTGCAAGCCCAACAGATACCCTTTTGCCAAATC AAACTCTTGTTCCAGGGATGCAGCTGATTTCTAGTGTATCAACAACTGACCAATCAACGG GCTTTTTTGGTCTTTACTTGCAACCCGACGGGAACCTTGTGCAGTACCCCAAGGATTACC ATACACTTGAAAGTGCTTATTGGGCATCTAATACAAATGGAATGGGTGATAAAGTGAGTG TAAAGCTTGATTTAGATGGCAGTCTTAACATTGTCGACGCCAATGGCTCTAACGTGCGTG ATATTACAGGTGGAGTGAATGCAAACCGACGAGCCATCTGCTTGATAAGACTTGATTGGG ATGGGTTATTCCGGCTATATTCTCACGATTTGAGTCATAGCAGCAGCTGGTCAATCCTGT GGAATTCTACGGGCGACAGGTGTGCTCCGTGGGGTCTTTGTGGCCTTAACAGTTATTGCG TTCAGAATGCTGTAGAACCTGAATGTGAGTGTCTTCCAGGATTTGCTCCTGTTAACCAAG ACAAGTACTGGACTTCTGGTTGCCAAAGGAATTTCACACAAAAAAGCTGCAAAAATAAGG ACAAAAAGGCTTCACATCTTAGAGAATTGAAGAATACAGTTTGGGAAGACAGTGCGTGGG GATATGTTTCATATTCTATTCTGGCAGCAACATCTAAAGAAGATTGTTCACAAGCATGTT TGCTTGACTGTAATTGTGAAGTTGCCATTTTCAATGAGCAAAATTGGGGATTTGGGGGGA TGGGCCAGGGTCAGTGCAAAAAGCAAAGGCTTCCTATGAGACATGGCAGGAAAGGAGATA GTTCAGCTTTTGTTTTCATCAAAGTGGAAGAAACAACTGAATCTCACACAGATGGGATTT TGCCCACCAAATCAGGCAAGAAAGAGATCAGCATAGATCTCCTCATCATTATCTGTTGTT TATTGTTTAGTTTACTAGTTGTTATTGCGGCAATCCTTGGAATTATTCTCCACAGATACC ATGTCTCGTCTTATACAAGGATTTCTTATACTGGCAATGTCGACTTTTGTGGGGATCTTG CTCCCCGATCATTTAGCTATGCAGAGCTCCAAAGAATGACTGATGATTTCAAGGAAGAGA TTGGGAGAGGATCATCCGGTACAGTTTATAAAGGGACTTTTATGGATGATGGTGGAAAGT TTGTAGCTGCCAAGCAACTGCAAGAAGTGTTATCTACGAGTGAACAGGAGTTCCAGATGG AATTAAAAGTAATTGGTAGGACTCATCACAGGAACTTGCTTCGTCTATTGGGTTTTTCCA TTGATGGACCCAACAAGGTTTTGGTGTATGAATACATGAGCAATGGCTCTCTTGCTGATA TACTCTTCACACCTGAAAAACAATTTAATTGGTTTGAAAGAATGGGAATCGCACGAGACA TAGCTAGAGGTATTATTTACTTGCATGATGAATGCGAGAAACAGATCATCCATTGCGACA TAAAACCTCAAAACATACTCATGGATGAGAATGGATGTGCAAAAATCTCTGACTTTGGAT TAGCAAAGTTAATGAAGCCAGACCAAACAAGAACCTTCACTAGAATTAGAGGAACAAGGG GATATGTTGCACCTGAATGGCATCGGAAGCTGCCTGTAACAGTTAAAGCAGATGTATACA GTTTTGGTATTGTTCTACTAGAGATTATATGTTGTCGAAAACATTTAAATCAGAGTCTTC CGGATGATCAAGTTATTCTTGAAGAATGGGTTTACCAATGTTTTGAGGAGGGTGAGTTGA GGCAATTAGTCGGTGTTGAAGATGTTGAACCGAAACAATTGGAGCGGATAATAAAGGTTG CTCTTTGGTGCATTATTGATGAGCCATCACTTCGTCCTTCAATGAAGAAAGTTCTACTCA TGCTGGAAGGAACAGTAGACATCCCAACACCTCCTAATCCTTGCTCTTTTATGAGCACCA TCTAAACTTGGTTTCTGTGTTTGTTTTTGCGTGTCATGTTTATCGTTATATGTGTTATTT ATATGCTGCATTTGGGTTTTGTTCTCATTCTTACGTATCGATGTTCTCTGTTTTGTAGCA AGGGTTTCAATTCATGAATAAGTTGGTTTCTTGACTGTCCAACAAGCAGAATAATAACTC CGTGCCTGTAAATACTTTTGTG