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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007319 | Chr11 | 11371485 | 11380838 | + | Ribosomal lysine N-methyltransferase 3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007319.m1 | 33 | 291 | PF00856.31 | SET | Family | 35.5 | 1.30E-08 |
LITCHI007319.m3 | 169 | 310 | PF09273.14 | Rubis-subs-bind | Domain | 21.6 | 0.00029 |
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>LITCHI007319.m1 ATGGCTTCCAGGCGAGTAAGAGCATTCAAGCGGTGGATGAAGTGTCAAGGCGTCGAATAC AGCGATGCCCTCGACTTGAAAGACGACCCAGAGCAAGGAATCTCAGTGGTAGCCTTATGT GATTTGAAGGAAGGTGATGTGGTGGCAACCATACCCAAGAACGCTTGTCTAACTGTCAAA ACCAGTGGGGCCCGTGATGTTATCGAGTCAGCTGGTTTGGGTGGTTGTTTAGGTTTGTCA GTGGCCTTGATGTATGAGCGGAGCTTAGGTCATCACTCCCCTTGGTCTGGTTATCTTCAG CTCCTGCCTCATCATGAGCCTTTGCCTTTCCTTTGGTCTGTTCATGAGGTTGATTCTCTA CTTTCTGGAACTGAGCTCCACAAGACGGTTAAACAAGACAAATGTCTTATGTATGAGGAC TGGAAAGAGAGTATTCTACCACTTCTGGATTCTCCCCCTCTGAAATTTAAATCAGAATTT TTTGGCGTTGAAGAATACTTCGCTGCAAAAAGTCTTATTGCTTCTAGATCTTTTGAAATT GATGATTATCATGGGTTTGGAATGGTTCCTTTAGCAGATCTATTTAATCATAAGACGGGA GCTGAGGATGTCCACTTCACCTCCACCTCTTCAGATCATGAGTCTTACAGTGATGCTGAT GACAACTATTGTGTTCATGACAACGCTGGTAATGATGAAATGTCAACAGAAAAATCTCAA CTTGATAGAGTGGAATCTTCTGTTTCTACTGGGAAGAATTTTTCTGGCAGTAGCGACTCA GAAAGTTCTTCAGTTTCAGGAGAGGACCCTGCAGTTTTGCAAATGATTATGGTGAAAGAC GTTGCTGTTGGATTTGAGGTCTTCAACACTTACGGGTTGTTAGGAAATGCTGCATTGCTT CACAGATATGGGTTTACAGAGCCAGATAATCAGTATGACATTGTGAATATCGATTTGGAA CTGGTGCTCCAATGGAGTTCATCTCTATTTTCTGGTCGATATAGTAGAGCGAGGTTATCC TTATGGAGAAGATTAGCTTATTCTGGATGTGTTAGTCAAGAGACCGAGTATTTTGAAATA ACATCTGATGGGGAAACCCAAAGCGAGCTGTTGATATTGTTGTACATCATATTATTACCA GAAGATGCATATCATAAGTTGGATATTTCTGTATCAACTGCTGGGAGTCAGGATGAAGCT ATATGTGTATGTTTGTCAGAGAAAAACAACGTTCCATTGGAAAAAGCTACAGAGATGATC AAAGAACTATTGCTCACTGAAAGTGTTTGCAAGGCACTTTATTCACTCGCTGAATTGAGG GAAAGTTTCTATGCTTCGAATTCAAAAAAAGAGGATCTAGAAGTCTTGAAAACTTGTTCC ATAAGAGATAGGAAGAAATACCATTCTTCGGTGTTACGTGTATGTGAGAGAAGGATTCTA GAAAAGTTGAGAACTTTTGCAGCTATTCATATGCAGACATTCAAAACTACTAAGAGAAGC TCCTCAAGAAAGAGATTGAAGAGGAATTAG >LITCHI007319.m2 ATGAGCCTTTGCCTTTCCTTTGGTCTGTTCATGAGGTTGATTCTCTACTTTCTGGAACTG AGCTCCACAAGACAGACGGTTAAACAAGACAAATGTCTTATGTATGAGGACTGGAAAGAG AGTATTCTACCACTTCTGGATTCTCCCCCTCTGAAATTTAAATCAGAATTTTTTGGCGTT GAAGAATACTTCGCTGCAAAAAGTCTTATTGCTTCTAGATCTTTTGAAATTGATGATTAT CATGGGTTTGGAATGGTTCCTTTAGCAGATCTATTTAATCATAAGACGGGAGCTGAGGAT GTCCACTTCACCTCCACCTCTTCAGATCATGAGTCTTACAGTGATGCTGATGACAACTAT TGTGTTCATGACAACGCTGGTAATGATGAAATGTCAACAGAAAAATCTCAACTTGATAGA GTGGAATCTTCTGTTTCTACTGGGAAGAATTTTTCTGGCAGTAGCGACTCAGAAAGTTCT TCAGTTTCAGGAGAGGACCCTGCAGTTTTGCAAATGATTATGGTGAAAGACGTTGCTGTT GGATTTGAGGTCTTCAACACTTACGGGTTGTTAGGAAATGCTGCATTGCTTCACAGATAT GGGTTTACAGAGCCAGATAATCAGTATGACATTGTGAATATCGATTTGGAACTGGTGCTC CAATGGAGTTCATCTCTATTTTCTGGTCGATATAGTAGAGCGAGGTTATCCTTATGGAGA AGATTAGCTTATTCTGGATGTGTTAGTCAAGAGACCGAGTATTTTGAAATAACATCTGAT GGGGAAACCCAAAGCGAGCTGTTGATATTGTTGTACATCATATTATTACCAGAAGATGCA TATCATAAGTTGGATATTTCTGTATCAACTGCTGGGAGTCAGGATGAAGCTATATGTGTA TGTTTGTCAGAGAAAAACAACGTTCCATTGGAAAAAGCTACAGAGATGATCAAAGAACTA TTGCTCACTGAAAGTGTTTGCAAGGCACTTTATTCACTCGCTGAATTGAGGGAAAGTTTC TATGCTTCGAATTCAAAAAAAGAGGATCTAGAAGTCTTGAAAACTTGTTCCATAAGAGAT AGGAAGAAATACCATTCTTCGGTGTTACGTGTATGTGAGAGAAGGATTCTAGAAAAGTTG AGAACTTTTGCAGCTATTCATATGCAGACATTCAAAACTACTAAGAGAAGCTCCTCAAGA AAGAGATTGAAGAGGAATTAG >LITCHI007319.m3 ATGAGCCTTTGCCTTTCCTTTGGTCTGTTCATGAGGTTGATTCTCTACTTTCTGGAACTG AGCTCCACAAGATTTAATCATAAGACGGGAGCTGAGGATGTCCACTTCACCTCCACCTCT TCAGATCATGAGTCTTACAGTGATGCTGATGACAACTATTGTGTTCATGACAACGCTGGT AATGATGAAATGTCAACAGAAAAATCTCAACTTGATAGAGTGGAATCTTCTGTTTCTACT GGGAAGAATTTTTCTGGCAGTAGCGACTCAGAAAGTTCTTCAGTTTCAGGAGAGGACCCT GCAGTTTTGCAAATGATTATGGTGAAAGACGTTGCTGTTGGATTTGAGGTCTTCAACACT TACGGGTTGTTAGGAAATGCTGCATTGCTTCACAGATATGGGTTTACAGAGCCAGATAAT CAGTATGACATTGTGAATATCGATTTGGAACTGGTGCTCCAATGGAGTTCATCTCTATTT TCTGGTCGATATAGTAGAGCGAGGTTATCCTTATGGAGAAGATTAGCTTATTCTGGATGT GTTAGTCAAGAGACCGAGTATTTTGAAATAACATCTGATGGGGAAACCCAAAGCGAGCTG TTGATATTGTTGTACATCATATTATTACCAGAAGATGCATATCATAAGTTGGATATTTCT GTATCAACTGCTGGGAGTCAGGATGAAGCTATATGTGTATGTTTGTCAGAGAAAAACAAC GTTCCATTGGAAAAAGCTACAGAGATGATCAAAGAACTATTGCTCACTGAAAGTGTTTGC AAGGCACTTTATTCACTCGCTGAATTGAGGGAAAGTTTCTATGCTTCGAATTCAAAAAAA GAGGATCTAGAAGTCTTGAAAACTTGTTCCATAAGAGATAGGAAGAAATACCATTCTTCG GTGTTACGTGTATGTGAGAGAAGGATTCTAGAAAAGTTGAGAACTTTTGCAGCTATTCAT ATGCAGACATTCAAAACTACTAAGAGAAGCTCCTCAAGAAAGAGATTGAAGAGGAATTAG
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>LITCHI002304.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGCATTCTGGTGTACCTTTGCTTCACACAATCTCCTTCCAAGTAAACACTTCACCAAAAT CAGGGAACCCAGAGCGAGACTTGTACATGCTATTGGCACTAACCGACCCATCAACGTTGG GAAGTGTATTTTCACGGCAATATATGATGCCGGCACTGCTACGAGGTATGGATTCCCTTT TCCTGCCCTTATAACTCAATTTTGTTTGAATGCTGGTGTTCCAACGGAGGTGGGCGATTT GTGGGTGTCTCCACCCAAGCCAATAGATGGCGTCACATATGATACCTTGCACGACCGCAT TATGAATGGTAACAAACCGAATGCAGAGCGGAAAGCAAAGAAAATCCGTAAGGACAGTTG CCCGTCAACATGTAGCAATGAGGCACAACCACCTGCTTGGGTTTCTGATATTTTTGCTGC AGTTAATGCTATACAGGAGCGTCAAGAACAAGCCATTGCAAACCTTAAGGCACAGCAGGA GAAATTGTTCGCATCAATGTGCTCCCAACTTACGAGTCATGGACAGTCCCTTACTCATGT TACGCAGCTACTGCATGAGGCAAAAACACCTGCCACAAAAGAAACAACTGTGCAGCAGGG CGATGTACTGGGTGAGGGATAACATGTATGGTGGATGTTATATAGGTGTCAGTTGGATGC AGATGGTAAGGTACATATAAAGGTGGCAAAATTGAAGTTATGACAACAGTTGTATTTAAA CCAAACACTGTCGGCGCTTTTGGTTTTAAGTGGATGGTCCACGGTGACGGCTTATGGTTG CTGTTTTTGTTTTCGCAGTGACTGTACTGACTTTGTATTTGTCTGCTGCAAGTGTAAGCC TGTGGTGATAGGCATGGTGCAGTGCTACCATGTATGAACTTATTGTTTGGTAATGTTAAT AGAATTTTATTTGCTGCTTGTTTTGCGGATGTACGGAATGCCATGCAACTGCATCTAATT GCCATTCACCATCTCGATGCTGATAGTTGATAGGAGTTGAAGTTGCAAACTGGTGTGGTT AAAATACCTCATCAGGGATAGTTACATATATAACTATATGTATATTTGACCTACTGTGTG TGTTAGTAATTAACTGTTCGCGCATCCAATGTAATGCACATTTAATCTTTTTTTAACAAG TATGTTTTTTTTTTAAGGTTGATGCCATGTATATTATCATACTATTGACAATTTCGTTTA TGTCATTTTATGTTGACATAGATAAAACTTTAAAAATTTCAGGAGATTGATTTACAAATG TGAAAACAATGTTCCCGGCATATAGGGTATCATTTCACATTCAAGATATATGTAGTCAAC GTCGATTTTTGGAAGTTACAAGCTGAAATTCCCTTAACAAACTGTTTAACCAACCCCCTC TTAATGTTGTGAACAAACCTTTTAACCAACCACCTCCTCCCTTGGTTACGTGGGCAAATG TCTCATAAATGGATTTATATCAACCACCAACCACTTTCCCTAAAACAACAACATATTAAG TCTTATACAGCTCCATTTTGCCTATTTCCTGCAACATCCAACTTGGGTCAAACAACACCA ACAACGGTTGCAGTTGCTTCATACAAGCTACAGAGGTCATGATCAAGTGTCCCACAAAGG CATAGGTAATAATATATGTGCTGGTGGTGTAGTTGCTTTGCAAGTAAACAAAATGTGGGT GTACTCTGGTATTGGTTATATGCATGAACCTTGACACAGAATAACACATTGGTCATCATA CACCCAGATATATATACACAGACACATATATATGCTTGTGTATATATATATATATATACT TATACGCACACAGACACACATATATATATATATATGTATCTATGACATCAACATATAATA ATACATGTACCACCGTAGCTAGATCAGTACATTCCACAGTAAGTGACCTTTATTTTGTTT GGATCGTGCAGGGATGGATGAAAAAAAGGGCATTTATTTGAGTCACCAGTGGTTTCCGGA TGTTAATAACGATACCTTCC
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>LITCHI002304.m1 GenomeSequence + ATGTATCGCCCTCTGGAGACCAATGTACACGAATGTCGTCGCTTTCCCAGAGCACTGGTA ATGCTGATGCTAGGTTGCAAAAGTCCGTTAGACGCTCCTAATAACTTCTGTTGTTTAAGT ACATCCGATGTTATGGGAAAAGAATTCATTTCTTTTGATGATGCAGAAGCATTTTACCAT AAATATTCAGTTGTGGTTGGTTTTAGTGTGCGTAAGGATATGCTATGAAAGGATGCAAAT GGGTTAATAACATGTCGACGTTGGGTTTGCTCCAAGGAGGGGTTCATACAGAAAAAGTAC TTGGAGCGACGAGATAGGCAGCGCGAGTCAAAAGGCATAACTCGGGAAGGTTGTCGAGCT GCTATGCGAATAAAATTCAACCGTGAAAAAAGTATGTGGGTTGTGAACGAGTTCGTAACG GAACATTGTCATCCCTTAGCGACTCCAAACCAGGCGCAGTTTCTTCGTTCGCATCGTCAT GTTCCGCCTGCCAACATTGCACAAGCTGAATCGTGGAAATATATTGGGGTTCGCACCTCT CAAGTGATGGAGCATATGGTCCACCAAGCAGGCAGTCATGCAGCTGTTGGTCACACTCGT AAAGACTTACAAAATGGGTTGGATTCCAAACATAGGTGTACCTCAACCAATGGGGATGCA GACGCAGTTATTGCGTACATGACAGGAAAACAACAAATGGATGGTAATTTTTTTTTCAAG TTTACTATAACTGAAGATGGGTCATTAGGCAACATTTTTTGGGCCGACTCGCAGTCTTGT ATTGATTACCATTATTTCGGCGATGTTGTATCTTTCGATTCGACGTACAAGACGAATGCG TACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTCGGCGTGAATAACCATAACAAAACAACAGTTTTT GGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACATGGGTCCTCAAAACATTT CTGGAAGCAATGCAACATAAGCATCCTGTAGCTGTTGTGACGGATGGCGATATTGCGATG CATAAAGCACTAAAGACAGTAATGCCTGGGGCAACTAGGCGATTATGTGCATGGCATCTG GAACGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGTTGCCTTCACTAGGGAGTTCACGACCTGC ATGCTTACGTACATGACCGAGCTTGACTTTCAACAGTATTGGTCGATGATGGTTGCAACG TATAAATTAGAGGATAACGCTTGGGTTAGAAAGTTGTTTGGCAGACGAAAGCAATGGGCA GAAACGTTTTTGAGAACCACTTTCTTTAGGGGCATGCGAAGCACGCAATGTTCTGAGAGT ATAAACCGTTTATTTAATAAATATTTGAACCGTCGTCTGAAGTTATTCGAGTTCGTCAGC CAAACACATAGGGTGATGGAAAGACTTCGCCACAATGAGGCAAGAGACAACTTTGAGAAC ATTAATTTGCAGCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTGCAAATAGAGACACATGCATCAGAA GTTTATACTCGTAACTTATTCTTAAAAGTAAGGGATGAAATCAATTCAGAAGCAACGCTA AGCATCGTAAACTGTGCCACTGATATGACACAACAGATATTTACATTTAAAAAGTTTGCG TGTGGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAACTGAAAATAGCTTCCTATGCTCA TGCAAATTGTTTCAGACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTCAGTGCAATGAAAGCA ATGAACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATATTGCGTCGGTGGACAAAGAATGCAAAG GCCGACGACGACGTTGATAAGGTGGTGCACAAAGGTGAAGCAAATGTTGTTCACATGGCA CGGTAA