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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI007230Chr1197907319797582-MADS-box protein SVP

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI007230.m11057PF00319.21SRF-TFDomain882.10E-25
LITCHI007230.m192171PF01486.20K-boxFamily59.33.50E-16
LITCHI007230.m21057PF00319.21SRF-TFDomain882.10E-25
LITCHI007230.m292171PF01486.20K-boxFamily59.33.50E-16
LITCHI007230.m31057PF00319.21SRF-TFDomain882.10E-25
LITCHI007230.m392171PF01486.20K-boxFamily59.33.50E-16
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>LITCHI007230.m1
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TTCTCAAAGAGACGAAGAGGGCTTTTCAAGAAAGCTGAAGAGCTTTCTGTTCTTTGCGAT
GCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCTACTGGCAAGCTCTTTGAATATTCCAGCTCC
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AATCATTGCAATTCCACTGGTCCCCCACATGACTATGAAAGCTCAGATACATCTCTCAAG
TTAGGTTTACCCTATGGTGGTTAA
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TTCTCAAAGAGACGAAGAGGGCTTTTCAAGAAAGCTGAAGAGCTTTCTGTTCTTTGCGAT
GCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCTACTGGCAAGCTCTTTGAATATTCCAGCTCC
AGCATGAAGGAAATATTAGAAAGGCACAATTTGCACTCCAAGAACCTTGAGAAGCTGGAT
CAACCCTCTCTTGAGTTGCAGTTAGTAGAGAACAGCAACTACACCAGGTTGAGTAAGGAA
ATTGCTGACAAGAGTCACCGACTGAGGCAATTGAGGGGAGAAGAGCTTCAAGGATTGAAT
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AAAAAGGGTCAAAAGATTATGAAAGAGATCAGCCACCTTCAGGCAAAGGGCATTCAATTG
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TTAGGTTTACCCTATGGTGGTTAA
>LITCHI007230.m3
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AATCATTGCAATTCCACTGGTCCCCCACATGACTATGAAAGCTCAGATACATCTCTCAAG
TTAGGTTTACCCTATGGTGGTTAA
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>LITCHI007230.m2
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SMKEILERHNLHSKNLEKLDQPSLELQLVENSNYTRLSKEIADKSHRLRQLRGEELQGLN
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>LITCHI007230.m1
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ACACAACACAACTACCCAATTCTCACAAACCAGAAACAAAAACATTAAAAAAAAACATAA
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TCTCCTCTAAATTTGGCAACAATGCTGCCACTTTTGGGCCTGACCAGTCCCTATATATAG
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AACGGCCAGACAAGTTACTTTCTCAAAGAGACGAAGAGGGCTTTTCAAGAAAGCTGAAGA
GCTTTCTGTTCTTTGCGATGCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCTACTGGCAAGCT
CTTTGAATATTCCAGCTCCAGCATGAAGGAAATATTAGAAAGGCACAATTTGCACTCCAA
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CACCAGGTTGAGTAAGGAAATTGCTGACAAGAGTCACCGACTGAGGCAATTGAGGGGAGA
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GCCCAGATCCAACGACACGGACCTTCTTTTCTCTTCAAGTATGCTGCTATTATTTGTAAT
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GAATCATAATTCTGGATATCTATGAGTGAACGTCTTGTGAGAGTGTATCGAAAAAAGCTT
GAGCTTTAAAAATATCATTAAAATAATTTAAATAAGGTTTTTTTTTTTTTCCATCAGTAT
ATGCAAAC
>LITCHI007230.m3
CTCCTTTTCACACACATCCATCCATTGGTGGCTTTTCCACGGGCAACACACAGCACAACT
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ACACAACACAACTACCCAATTCTCACAAACCAGAAACAAAAACATTAAAAAAAAACATAA
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GGGGGTTTCAGTTTTTATTCTTCTTCAAGATCTGAAAAAAATACGAGTCTCTCTCTTACT
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TGCGATGCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCTACTGGCAAGCTCTTTGAATATTCC
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CTCAAGTTAGGTTTACCCTATGGTGGTTAAAAGGTTGGAGGTGTTATATTTATCCGCAAA
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ATCTAACCTAGCCAGGCCGTGTTAACAGCTAAGAATTTGTGTAAGTTGCCCAGATCCAAC
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GGATATCTATGAGTGAACGTCTTGTGAGAGTGTATCGAAAAAAGCTTGAGCTTTAAAAAT
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>LITCHI007230.m2
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ACACAACACAACTACCCAATTCTCACAAACCAGAAACAAAAACATTAAAAAAAAACATAA
AAATACACGAGCAAGTCCAAAACCCCCCAAAACTAGTAAGGTGCAAAATGGAATGCAATT
AATATCTTGCCTCAAACCAGTCCCTGTAGTTTCCCCTTCTCTTCGTAGCCTGCGATTGGT
GGGGGTTTCAGTTTTTATTCTTCTTCAAGATCTGAAAAAAATACGAGTCTCTCTCTTACT
TAATTAGGGTTTGTCTCGCAGGTTCTCCTCTAAATTTGGCAACAATGCTGCCACTTTTGG
GCCTGACCAGTCCCTATATATAGAAACGTTTCTTGTTTTGTGCTTGTGTTTTTGCTGGAA
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CAGATCAAGAAGATCGACAACGTAACGGCCAGACAAGTTACTTTCTCAAAGAGACGAAGA
GGGCTTTTCAAGAAAGCTGAAGAGCTTTCTGTTCTTTGCGATGCCGATGTTGCTCTCATC
ATCTTCTCTTCTACTGGCAAGCTCTTTGAATATTCCAGCTCCAGCATGAAGGAAATATTA
GAAAGGCACAATTTGCACTCCAAGAACCTTGAGAAGCTGGATCAACCCTCTCTTGAGTTG
CAGTTAGTAGAGAACAGCAACTACACCAGGTTGAGTAAGGAAATTGCTGACAAGAGTCAC
CGACTGAGGCAATTGAGGGGAGAAGAGCTTCAAGGATTGAATATTGAAGAACTGCAGGTG
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ATGAAAGAGATCAGCCACCTTCAGGCAAAGGGCATTCAATTGATGGAAGAGAATGAACGG
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TGGAACGTTGACAGGTAACTAGTAATGGAAGTCAAAATCTAACCTAGCCAGGCCGTGTTA
ACAGCTAAGAATTTGTGTAAGTTGCCCAGATCCAACGACACGGACCTTCTTTTCTCTTCA
AGTATGCTGCTATTATTTGTAATGTGACATCCTACTCACCTAGGAGTGCTTGATGTTATT
TTATATTCATGCATGGAAATATGGAATCATAATTCTGGATATCTATGAGTGAACGTCTTG
TGAGAGTGTATCGAAAAAAGCTTGAGCTTTAAAAATATCATTAAAATAATTTAAATAAGG
TTTTTTTTTTTTTCCATCAGTATATGCAAAC
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>LITCHI007230.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TTATATTTAAATAATCATATTACAATTAATATGTTTATATTTGTATCAAATTGCAATTTT
GGTGGCATCCTGTTTAGAGTAATATTTTGTGTTAAATAAGAACCTTCTTGTTGCTGAAAT
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ACCTTAAGCTCTCATGCAAGCGAACTAACTCAAGTTGCTATATTGCCTTAGCATTATTTG
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ATATTATCTCATCCTTACTTTTAGCCATTGGGCTTGTCAGTCATTTGAGTTTTAATAGAC
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ACATTATTGTCCTATTAGCATTGGAATCAAAACACTTTATTTCAAAAGTGAGGATCATAA
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GGATTTGACTTGTGTTCCATTTTATTTAGTAGGGGCAAATAGGTAAATATACTCATCAAC
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TTGGGCCTGACCAGTCCCTATATATAGAAACGTTTCTTGTTTTGTGCTTGTGTTTTTGCT
GGTGGGTATTCTTGATTACATGCTGGTTTATTCCCTGTTTGGAGGATTACTAAGTTGTCG
TTGTTCGATGGTTTTTTTGTTGTTTTGGTTTGTAGGAAGACAAAAACAGCGTTCAAGGAA
GGAGAAAGAGAGAGAGAGAA
>LITCHI007230.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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TTATATTTAAATAATCATATTACAATTAATATGTTTATATTTGTATCAAATTGCAATTTT
GGTGGCATCCTGTTTAGAGTAATATTTTGTGTTAAATAAGAACCTTCTTGTTGCTGAAAT
TCGGTGTTGTTAAGGAAAATTACGAGCTATTTATGTTATGCGGGTTGCTATTTCATTGCA
ACCTTAAGCTCTCATGCAAGCGAACTAACTCAAGTTGCTATATTGCCTTAGCATTATTTG
GTCTGTTACACACTTCTATTGATGCAACATTTGCTAATGTGTCATAGAGTAATATGTTTC
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AATTAATATCTTGCCTCAAACCAGTCCCTGTAGTTTCCCCTTCTCTTCGTAGCCTGCGAT
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TACTTAATTAGGGTTTGTCTCGCAGGTTCTCCTCTAAATTTGGCAACAATGCTGCCACTT
TTGGGCCTGACCAGTCCCTATATATAGAAACGTTTCTTGTTTTGTGCTTGTGTTTTTGCT
GGTGGGTATTCTTGATTACATGCTGGTTTATTCCCTGTTTGGAGGATTACTAAGTTGTCG
TTGTTCGATGGTTTTTTTGTTGTTTTGGTTTGTAGGAAGACAAAAACAGCGTTCAAGGAA
GGAGAAAGAGAGAGAGAGAA
>LITCHI007230.m3 -  Up_Stream_Len 2000
TAGAATATAGACAAAACTAAGATAATCTTTTCTAATTTATTTGATATTGTAGTTAGTACT
TTATATTTAAATAATCATATTACAATTAATATGTTTATATTTGTATCAAATTGCAATTTT
GGTGGCATCCTGTTTAGAGTAATATTTTGTGTTAAATAAGAACCTTCTTGTTGCTGAAAT
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ACCTTAAGCTCTCATGCAAGCGAACTAACTCAAGTTGCTATATTGCCTTAGCATTATTTG
GTCTGTTACACACTTCTATTGATGCAACATTTGCTAATGTGTCATAGAGTAATATGTTTC
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GGACAACTAGAATGGGCTCAAGATTGTTAGGATCAATTAAAATAAAAATACTGATATTAT
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TGGTGGGGGTTTCAGTTTTTATTCTTCTTCAAGATCTGAAAAAAATACGAGTCTCTCTCT
TACTTAATTAGGGTTTGTCTCGCAGGTTCTCCTCTAAATTTGGCAACAATGCTGCCACTT
TTGGGCCTGACCAGTCCCTATATATAGAAACGTTTCTTGTTTTGTGCTTGTGTTTTTGCT
GGTGGGTATTCTTGATTACATGCTGGTTTATTCCCTGTTTGGAGGATTACTAAGTTGTCG
TTGTTCGATGGTTTTTTTGTTGTTTTGGTTTGTAGGAAGACAAAAACAGCGTTCAAGGAA
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>LITCHI007230.m1 GenomeSequence - 
CTCCTTTTCACACACATCCATCCATTGGTGGCTTTTCCACGGGCAACACACAGCACAACT
CCCAATCTCACATAACAAAAACAAAAACATTAAAAAAAAAAAAAGACTTTTCCACAGACA
ACACAACACAACTACCCAATTCTCACAAACCAGAAACAAAAACATTAAAAAAAAACATAA
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GGGGGTTTCAGTTTTTATTCTTCTTCAAGATCTGAAAAAAATACGAGTCTCTCTCTTACT
TAATTAGGGTTTGTCTCGCAGGTTCTCCTCTAAATTTGGCAACAATGCTGCCACTTTTGG
GCCTGACCAGTCCCTATATATAGAAACGTTTCTTGTTTTGTGCTTGTGTTTTTGCTGGTG
GGTATTCTTGATTACATGCTGGTTTATTCCCTGTTTGGAGGATTACTAAGTTGTCGTTGT
TCGATGGTTTTTTTGTTGTTTTGGTTTGTAGGAAGACAAAAACAGCGTTCAAGGAAGGAG
AAAGAGAGAGAGAGAAATGGCGAGAGAGAAGATTCAGATCAAGAAGATCGACAACGTAAC
GGCCAGACAAGTTACTTTCTCAAAGAGACGAAGAGGGCTTTTCAAGAAAGCTGAAGAGCT
TTCTGTTCTTTGCGATGCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCTACTGGCAAGCTCTT
TGAATATTCCAGCTCCAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACATATTTAC
CATCTTTCAATGAAGACTCAACCTTAGTTGACTTGCAAGTTTTTATTTTTCTTTTTCTTT
TGTAAAACTGTTTTCTAATAGAGTTAAAATGAGAGTTTAATGAAGTAATAAATAAAGGGT
CTCAACTTGATACATGAGAATGAGAGTGTGAGGAGATCACAAGTGGATGAACAATTATAT
CATGGTTATGTTCTTTGGATGTTGGAGTTACTGTTTGATAGGACAGCCTAAGAATAGGTG
TTGAATGGTGATGATGCTGTTAAAGATCATATAATCTTTGAAGCTTTGTGGAGTGTTCCC
TCTCTCCATCACTGCCTGTTTATTTCAATTATTGACTAATTTCCTGTACATTTGAATGGA
CAAATAATGGGAATGCTTGCATGTTCAGTTGGTATAGTTTAATATAACAAGAAGCAAAGA
AAACCTTTGGCTGTAAGTTTAGTTGGAGATGCTCATAAGGATTCTTGATTACTTGTGTCA
ATGAAGTTGTCATGGAAAAGGTCAGTTGGAGCATAAGAGAATCATTACAGGAAAGAAGTT
ATTCATAGCTCAGCATGTATGGCAACTAGAGACTACATTTATCCATAACATTGATGTATA
TTGCTTTACTGCTGTTTTTCCTTTTTATCCTTTCCCTTTTTTCCTTTATATTCTTTTTTT
CTTGTGGTCCAAAACTCCCTAGACATAGCTAGTCTAAAGTAGAATCATGGCAATTATTGA
ACCGTATTCAGTATAGCAGTCTGTTGTTAGGATTAAGTTTGATAGCATCCGGATACGTGG
ACCAGTGAGATCTTGAACATCTCAGGAAGCTTACTGCTTGACGTTATCATGAATGGAGCC
CTAACCTGACACGTATGTTAGTGCTTACTTTTTTGATGTACGAAATGAATTTCTTTTTTG
AAGAATCTGGTTTGCAAATCCCAGTTGGGATTTTCATTATTGGTGGGATTTTTTTTATTT
TTTATTTGAACTTGTTTTGCAGGACTTATCATATCATATGTGAAACCGTGTCATCATAAG
TGCAGTTTCTTTAATTAATATTTTCACTGACTGAAATAGAGAGGTTTTGTTTCTTGATTA
ACTTTATATGTCATGAAAATGTCAAAGATGATTGGATAGTGACACGTTCTCTACTTTTTT
CTTTCATCTTGCCATGTATTCTTGCTTTGTACAAAATATTTTTTGGGTATGTACAAATAA
TATTGTACATTATATTTTGAAAGGTGTTAATTTGAACTTCAGATCAAGAAAAAAAATCTT
TCATGGAACTGTTTTATGTTAATGTGATGAGATAGATTAATGAGAAAGGTAAGAGAAAAA
GAAAAGACTAATTACAAAGTTAAGAGAAAAATAAATGATATTATTTCATTAATCCGTCTT
ACCACATTAACTGTAAGACGGTTCTGTAAAAGATTTTCTTCAAATTAAGATGAAAGTAAT
AAGTACTCTTCTGAATGTATTTTATTATAAAACTATTTTGAAAGTAATATTGGTTTGGAA
TATGAAAATGCTAATATTATTTTTGAAATACAAAAAGCGTAATTATTTCTGTATTTACAT
TGATTTGATTGCTTTGCGTTCTCGTTTAAGGAATTATGTTGCACATTGCACTATAATATT
GCAGCAATTTGTTAGCTGATTTCCATGCAGAAATGGTACAATAAATCAGGCTAAAGTGGC
CTGCGAGGAAATTTTGAAAATTTGAAAGGGAATGATATCAGCATTTGTAGTAGGACTGCA
ACTTGTGTGCTGAAAAAGTAAAAAGATGATACAAAGACAAATTAATTTGGTTGTCTGGAT
AATAGTACACTAAGCTTTTGCATATTTGGGTTGCATTATTCATGGCTTGAAGATTTGGAG
CAAGAAATTAAATGGCTTCTATATATCTGTACATGTACTCCATGACTCATGGTAGCACAG
AGAAACTCCTACACTAAAACACTTCTATAATTTAATGGATAACTGTTCTCTTTTTTGCTT
ACTCTCACATTCTGAGATTTGTTTTGTTGTGTTTGCATTTTAATTTGAGGTGGTCATAGA
TAATGGTTGCAGTAATTGTATATTCACTCACATCAAGATGCTTACTCTATCATACTCATG
ATTATGTTTTTGTTAGGCTTGTCTGTCTGATTATAAACATAAACTGATGTAGTTATTCTG
TTGGTGTCTTTTTTTTTTTTTCTCCTCTGCTATGTCTCTCCTCTAGGCCATGACGCCATG
TTGCTAATTAGGTTTGTCCAATCTTTTAAGCTAAAGCCTAATGAGCTACGTGGTGTCAAA
ATGGTTGTTTATCTTTAAGACAAATTATGATTAATTCTATATATGTAAATCCATTTCGAT
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>LITCHI007230.m2 GenomeSequence - 
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GTTGAGAAAAGGAGGTTGATCCAATAATATGTTTTCACATCCACATTATTAAGATTGTGG
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GCTTGAGCTTTAAAAATATCATTAAAATAATTTAAATAAGGTTTTTTTTTTTTTCCATCA
GTATATGCAAAC
>LITCHI007230.m3 GenomeSequence - 
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GAAAAGACTAATTACAAAGTTAAGAGAAAAATAAATGATATTATTTCATTAATCCGTCTT
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AAGTACTCTTCTGAATGTATTTTATTATAAAACTATTTTGAAAGTAATATTGGTTTGGAA
TATGAAAATGCTAATATTATTTTTGAAATACAAAAAGCGTAATTATTTCTGTATTTACAT
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TTGCTAATTAGGTTTGTCCAATCTTTTAAGCTAAAGCCTAATGAGCTACGTGGTGTCAAA
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GTTTCAGCTATTTGCTTGTATTGTCATTTTGAAGATATTTGCTAAAGAGCAATGCATGTG
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ATTGCATGATCGAATCCTAATTAATCAACTCAACTTCTGGAAGTATTTGTTCTTAATTAT
TGCCATCTGGCTTAGGGTATATATCCAAACTCCCAAAACCACAGTGGTATGACATGTTTT
CATGGACTTTCTTTCATTTTTTCATCTTCATTTTTCAATATTTTGTATATCAACTCAATA
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ATTTTTTAACCGTTCTGATAAATCTTGCTTGTAAATGCTTTGCTTTAAGCTTCTCATCCA
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TGCCATGTCAAATAAATTATAAACGTCCATTTTCGTTGCCTTATTTAAAATGAGCAACTT
TGTAATATTGTAGTTAGTAGAGAACAGCAACTACACCAGGTTGAGTAAGGAAATTGCTGA
CAAGAGTCACCGACTGAGGTATGAGTCCTTCTCGTTCATATATCTTTCATACATTTTGAA
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AGCTTCAAGGATTGAATATTGAAGAACTGCAGGTGCTAGAAAAGTCTCTTGAAGTTGGAT
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CATTTGTCAATCAAGCTTAGGGCCTACTTGCTTATGATTTTGAAAATCCCTCTTAATTAT
TTTTTAAATGTTTTTTCAGGGTCAAAAGATTATGAAAGAGATCAGCCACCTTCAGGCAAA
GGTTGGACACCTTTCTTTTTTTTTGCTGTGATAGCAAGCATACATAGTATTCACCTTTTT
TTTTTGGTTGTTGTCTTACAGTTTTTATTTGGTAAAATGTAGGGCATTCAATTGATGGAA
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ATTTTATGGGATGAATGTTCATATATTTGAGGTGGGAAGATTATTCTCCCGTATATTATA
TTTTGATAGTGCATTTGTTAATGAGAATATAACTGAAGGTGGTGGAGATCACTAGCGGCC
GGAGACGTGTTGGTGGTGATTCGGAAAATGTGGTTTACGAGGAAGGCCAGTCATCAGAGT
CGGTTACCAATCATTGCAATTCCACTGGTCCCCCACATGACTATGAAAGCTCAGATACAT
CTCTCAAGTTAGGGTGAGTTCTAACTCCAAAGATATACTTAGTCTCTCTCTATATATATA
TTGAGAATAATTCTCTGGTACAAACTAATCTGAAAATATTCAGGATATTTGATTTCTATC
ACTCTTGCATACAGATTCCGTCATTCATTATGATGTTAGTTGAAAATGAGTGGTGAAAAT
TGAATGATTCTGAACACAAATTTATAGTATATAGTGTTAATCTATTGGCAGCCAAACACA
ACTAATCAAAATTGTTGAGTCTGCCTAGTGTTTTAGAATTATGATAAGACTCCAACAAGT
CATGGGAAATTAAGGAAATTTCTCATGACTGGTTAACTTTTAGATCCCTTCTTGATCTAA
GATACTGAATATGTTAGGTCTGTCACTGCCAGAAGCTTTTAAGTAGCAAGCTGCTTGGTC
GAATTTAATTAGATAAATTAAATTTAATTAGTAAGCTGTACATGTTAAAATTTAATTGGA
TAAAAAATACTCTAAGTAAGTGCAGACATGGTGCATATCATGCGACCTAGACTTTAAATT
GTTGAGATTGTGGTCAACCAATCTTTTAACATCCTAAAATGATGAGTTACAAAGTTTGTG
GTTGAGAAAAGGAGGTTGATCCAATAATATGTTTTCACATCCACATTATTAAGATTGTGG
TTCAAGTCACGCTCCCCAACTCTAAAAAATGAGCACGAAATTATGATCTATGTCATATTT
TTTATTATTATTTTTAATTAAGTTTTGATGTTTTTGTGAGGGAAAATCATTTTATTTAAC
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TTATATTTATCCGCAAAAGGTGGAGCTGTGGCCTCTTATTTTGGAACGTTGACAGGTAAC
TAGTAATGGAAGTCAAAATCTAACCTAGCCAGGCCGTGTTAACAGCTAAGAATTTGTGTA
AGTTGCCCAGATCCAACGACACGGACCTTCTTTTCTCTTCAAGTATGCTGCTATTATTTG
TAATGTGACATCCTACTCACCTAGGAGTGCTTGATGTTATTTTATATTCATGCATGGAAA
TATGGAATCATAATTCTGGATATCTATGAGTGAACGTCTTGTGAGAGTGTATCGAAAAAA
GCTTGAGCTTTAAAAATATCATTAAAATAATTTAAATAAGGTTTTTTTTTTTTTCCATCA
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