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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007198 | Chr11 | 9298521 | 9305883 | - | MADS-box transcription factor 27 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007198.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 87.1 | 4.30E-25 |
LITCHI007198.m1 | 83 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 90.3 | 7.60E-26 |
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>LITCHI007198.m1 - Up_Stream_Len 2000 GGAGCAATATTTTGTTTTTCGTAAAAAGCAGAAAGCATATCCAACTTAAAATCACTTTTT GAAAAATGTATATGGGGGGTTGTAATAGGATTTCCATTACTCCAAGCAGGAAAAAAGAAG ATTTACGAAGGGGAAACGTGCAACAACCAAGAAAGAATATGGCTTTTACATATGGATTTG CATGAATCTTGGTTTCTTTTTTTCCTAATTTGGAAACTTGAACAAATTACTACTACTACA ATCTCTCTCTAACTCCAATGCTTTGTCTGACACGTGGAGAACCCCCCCCAAATTCGTTGG TTGCACGGAACATGCAGCTGCAAAATCCACCAGCTTTTGTAATCCTAGATTGCTTTAGTT TGGCTGAGTTCACAACTTTTTTTGAGTAAAGCGGAATTCACCAACTTAAATTTACTTGGG AAATGCAATTCTATAATGCATCATTCCCTTTACTGAAAAAGAATAATTATTCCAAAAGAA AGTGAAAAATGATATGAATAAGTGCTTATAACTGTGAAAATTAAACTGCTATATCACCAG TTTTTCCTCACTTCAACGAGACTTCTAATACTTACAAGCACTTAAACCTTTATGTCCTAG ATTAATGTGAAACGGTTTAAAATTACTTAATGTAAACACATCTCATCGTTATTTTTGTAC ATGAAGTCAACTTTAGGTTCTTAACTATATAATAATATCAAGGGAGTCTCTTATCCTGAA ATTTCAAATTTATATATATGTATATGTAAATTCTATCATTATTATCTTCTAACTTTAAAA AATTAGAACAAATAAATCAAATTTATCAATTGTATTTGAATTAAATAGAAAAATTAATTT GTTTTAATTAAGAGAGATAATACAATAGATGAATTTAATTGGTTTATCTAACTTTAAAAA ATTAAGAGACACTAATGATAAAAGTACTATATATATATTATAGTTATAGTAAGTATTGAT ATATACACACAATTGTTTATACTAATCAAATTTAATAAGCTGCTCACTTCAGAACTTCTT TTTTTTTTTTCTGTTCTTTCTTTGTGGCCTATCTTCATCGAAGATAGTCAACCTTTTATC TTATATAAAAATGACTAAAATGGATGACAGAAGCGTGAAAACCTAAAATTCAAACCGACT GAAGCTTGGCCGGGTAAATGATCATTATAATAATTCAACCTAGAACTTAAGCTTGGGTAC ATTGACCATTATAATAATTCAACCTAGAATATTTTAGCCACGTACAAACTCTCGGGCAAA TCTTAAACCTGTGTATAAGAAGAGGGCGTACTAAATGCTCAAATACCTGCAACTAATCTT TCATATTTTAAATATTTGATTGGATACAAACTAAACTCATACCTAATTAATGGGTTTCAA TTAGACATACAATAGAAACATCTAAAAATACTTGAGTTCAAGATAATACTTGTAAATTAT GTTTTTAGGTACAAATTAGAAAACCTTCCCCGCACCGCCCCACCAAATGAATCAGTATCA ACGAATCCAAATTTTGAACATAAAAAAGTAGGTGGTTTTACATTAATTTTATTTTCTAGA AGTAATTTCATAATATCTCTTATTTTAACGTGTCATCAGCGCATACGGCGTTATTTTAGC GTGTCATTAACGCATACGGCACTTGGGATAGTATTAAAGTATTCAATACGCAATAAAATA TGCTGTAAATAGTACTATTGCAAGTACTTTGTTGTTGTAACCCACAAGGTTCAATACTTG AAAATCACTCATTCAATTTCTCCATTAAGGTTATATCTGCCCCAATACCACTGTTTTGGT TAGAAAAGCTCTTTTCTAACCAACCCAACACTATATATCTGATCATTTCTAAAACTGCTA CTTTGATCTCAACCAGTAAGTTTTTCTTCTAATCTGCTTTAGACTTAAGCTAATAATTAA TCCTTGGTTTATTCATTAAAATTGTTTAACTATATATCTATCTGTACTGCAGAAACCCTA GCGCACACAAGCAAGGAAGG
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>LITCHI007198.m1 GenomeSequence - ATGGGGAGGGGCAAGATTGCGATTCAGAGGATCGATAATTCTACGAGCAGGCAGGTGACT TTCTCAAAGCGAAGAAAGGGATTAATTAAAAAGGCAAGAGAGCTCGCAATTCTGTGTGAT GCTGAAGTTGGACTCGTTATCTTCTCTAGCACTGGAAAGCTTTATGAATATGCAAGCACC AGGTCAGACATTTTTATACCAAACTCGTGTTTCTTTTTCAATCTTTGATGTTACTGTGGT TTATTGTTTTAGAATTTTAGCAAGAACAGAAAACGTTTTGCCTTTGAACCTTATCTTCTT CTCTTTTATTATTAAGGGGCTGGTCATGGCTGCAGATAATATTTCAGTTTATCAAAATAT GGGCTTCTTACAAGCACAACTTATGTAGTTTAATTTATAGTCTTATGTTAAATGGGGTTT ATATATGGTGTCACTGATAAAACAGATAGTTTGCTTGACACTACTTGAAAGATGAGAAGA AGACAATGTTTTTGGCATCTGTTTGAAATGTTTCAAAGAGATAATGCACAACTTCTTGCA TCTACATGAAATATACAATCATCATAAAAAGTGTCTATATCACTTTCTCACTTTCATTAC TTTTTATGAAGTTCCACATGGTCTTAGGATGTCTATTGTGGGACAAACATGTTTAACTTA GAAACTGTGGAACGACGGGAGAGTATTATATATGGTTTGCACATTATACATTAACCTAAA TCTGACTTAATTATAAGGTGGATAGGAAATTAAGGAATGATTTGTTGTGTTTATATAATA AATGGTAAATCATGAGGTAATACTGCCTTTGCTTAGATGATTTGAGATAAATCACTCCAA ATTCAAATTCAACAAGGCAAAAGTGTAGCATGAAATCTTATAAAAGAGTAGTGAAACCAG 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