Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI007177Chr1189825058989880-MADS-box transcription factor 27

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI007177.m11057PF00319.21SRF-TFDomain837.80E-24
LITCHI007177.m183170PF01486.20K-boxFamily92.91.10E-26
Download   Copy
>LITCHI007177.m1
ATGGGGAGGGGCAAGATTGCGATTCAGAGGATCGATAATTCTACAAGCAGGCAGGTGACT
TTCTCAAAGCGAAGAAAGGGATTAATTAAAAAGGCAAGAGAGCTCGCAATTCTGTGTGAT
GCTGAAGTTGGACTCGTTATCTTCTCTAGCACTGGAAAGCTCAATGAATATGCAAGCACC
AGCATGAGAACAATTATCGAACGATATAATCACCTGAAGGAGGAACATGAACAGTTGTTG
ATTCCACAATCAGAAGCCAAGTTTTGGCAACGGGAGGCAGCAAATTTGCGACAACAACTA
CAGAACTTGCAAGAAAGCCATCGGCTATTGATGGGAGAACGACTTTATGGTTTGAATGTA
AAAGACCTACAAAATCTAGAGAACCAATTGGAATTGAGTTTGCGGGGAATTCGTCAGAAA
AAGGAACAAATATTAGCTGAGGAAATACAAGAGCTAAACAGAAAGGGACATATTATACAA
CAAGAAAATTCGGAACTGTATAAGAAGGTAGACCTTATTCGTCAAGAAAATATGGAACTG
TACAATAAGGTTTATGGCACAAGGGATGCTAATGAAGCAAGCCGAAATGCCTTCATTCCA
TATGGATCAAATACTAGAGACGATGCACACTTTCCCATCCATCTTCAGCTGAGCCAGCCT
GAGCAGCAAACTTAG
Download   Copy
>LITCHI007177.m1
MGRGKIAIQRIDNSTSRQVTFSKRRKGLIKKARELAILCDAEVGLVIFSSTGKLNEYAST
SMRTIIERYNHLKEEHEQLLIPQSEAKFWQREAANLRQQLQNLQESHRLLMGERLYGLNV
KDLQNLENQLELSLRGIRQKKEQILAEEIQELNRKGHIIQQENSELYKKVDLIRQENMEL
YNKVYGTRDANEASRNAFIPYGSNTRDDAHFPIHLQLSQPEQQT.
Download   Copy
>LITCHI007177.m1
ATGGGGAGGGGCAAGATTGCGATTCAGAGGATCGATAATTCTACAAGCAGGCAGGTGACT
TTCTCAAAGCGAAGAAAGGGATTAATTAAAAAGGCAAGAGAGCTCGCAATTCTGTGTGAT
GCTGAAGTTGGACTCGTTATCTTCTCTAGCACTGGAAAGCTCAATGAATATGCAAGCACC
AGCATGAGAACAATTATCGAACGATATAATCACCTGAAGGAGGAACATGAACAGTTGTTG
ATTCCACAATCAGAAGCCAAGTTTTGGCAACGGGAGGCAGCAAATTTGCGACAACAACTA
CAGAACTTGCAAGAAAGCCATCGGCTATTGATGGGAGAACGACTTTATGGTTTGAATGTA
AAAGACCTACAAAATCTAGAGAACCAATTGGAATTGAGTTTGCGGGGAATTCGTCAGAAA
AAGGAACAAATATTAGCTGAGGAAATACAAGAGCTAAACAGAAAGGGACATATTATACAA
CAAGAAAATTCGGAACTGTATAAGAAGGTAGACCTTATTCGTCAAGAAAATATGGAACTG
TACAATAAGGTTTATGGCACAAGGGATGCTAATGAAGCAAGCCGAAATGCCTTCATTCCA
TATGGATCAAATACTAGAGACGATGCACACTTTCCCATCCATCTTCAGCTGAGCCAGCCT
GAGCAGCAAACTTAGGGGACACCACAAAGAGCAATATAATGAAGAATTACGTTGAAGAAT
GTCATGACAGTGGAAAGATGTCATCAACTCAACATCAATCTTTGGAGAAGAATTTTTGGA
GGGAAATGAGCTACATAAAGTTTCATCAGCACCAACAAAACAGTCTGATGATATTTGTGG
AATTATATGTAACCGTTGAAATTATAATTGAAGAAAGTGTAAAGTTTCATTTTCCGAAAG
CAC
Download   Copy
>LITCHI007177.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GGAGCAATATTTTGTTTTTCGTAAAAAGTAGAAAGCATATCCAAGTTAAAATCACTTTTT
GAAAAATGTATATGGGGGGTTGTAATAGGATTTCCATTACTCCAAACAGGAAAAAAGAAG
ATTCACGAAGGGGAAACGTGCAACAACCAAGAAAGAATATGGCTTTTACATATGGATTTG
CATGAATCTTGGTTTCTTTTTTTCCCAATTTGGAAACTTGAACAAATTACTACATTACTA
CTACTACAATCTCTCTCTAACCCCAATGCTTTGTCTGACACGTGGAGAACTTCCCCGAAT
TCGTTGGCTGCACGGAACATGCACCTGCAAAATCCACCAGCTTTTGTAATCCTAGATTGC
TTTAGTTTGGTTGAGTTCACCGACTTTTTTTGAGTAAAGCGGAATTCACCAACTTAAATT
TACTTGGGAAATGCAATTCTATAATGCATCATTCCCTTTACTGAAAAAGAATAATTATTT
CAAAAAAAAAGTGAAAAATGATATGAATATGTGCTTATAACTGTGAAAATTAAACTGCTA
TATCACCAGTTTTTCCTCACTTCAACGAGACTTCTAATAGTTACAAGCACTTAAACCTTT
ATGTCCTAGATTAATGTGAAACGGTTTAAAATTACTTAATGTAAACACATCTCATCGTTA
TTTTTGTACATGAAGTCAACTTTAGTTCCTTAACTATATAATAATATCAAGGGAGTCTCT
TATCCTGAAATTTTAAATTTATATATATAGTAATTCTATTATTATTATCTTCTAACTTTA
AGAAATTAGAACAAACAAATTAAATTCGTTAATTGTATTTGAATTAAATAAAAAATAAAT
TTATTTTAGGAGAGAGAATACAATAGATGAATTTGATTGGTTTATCCTAACTTTAAAAAA
TTAAGAGACATCAATGATAAAAGTATTATATATATAGTTATAGTTAATGCAAGTATTGAT
ATATACACACAATTGTTTATACTAATCAAATTTAATAAGCTGCTCACTTCAGAACTTTTT
TTTTTTCCTGTTCTTTCTTTGTGTCCCTATCTTCATCCAAGATAGTCAACATTTTTATCT
TATATAAAAAATGACTAAAATGCATGACAGAAGTGTGAAAACCTAAAATTCAAACCGACT
GAAGCTTGGCCGGGTAAATTGATCATTATAATAATTCAACCTAGAACTTAAGCTTGGGTA
CATTGATCATTATAATAATTCAACCTAGAATATTTTAGACACGTACAAACTCTCGGGCAA
ATCTTAAACCTGTGTATAAGAAGAGGGCGTACTAAATGCTCAAATACCTGCAACTAATCT
TTCATATTTTAAATATTTGATTGGATACAAACTAAACTCATACCTAATCAATGGGTTTTA
ATTAGACATACAATAGAAACATCTAAAAATACTTGAGTTCAAGATAATACTTGTAAATTA
TGTTTTTAGGTACAAATTAGAAAACCTTCCCCGCACCGCCCCACCAAATGAATCAGTATC
AACGAATCCAAATTTTGAACATAAAAAAGTAGGTGATTTTACATTAATTTTATTTTCTAG
AAGTACTTTCATAATATCTCTTATTTTAACGTGTCACCAACGTATACGACGTTATTTTAG
CGTGTCATTAACGCATACGGCACTTGGGATAGTATTAAAGTATTCAATACACAATAAAAT
ATGTGTAAATAGTACTATTGCAAGTACCTTGTTGTTGTAACCTACAAGGTTCAATACTTG
AAAATCACCCATTCAATTTCTCCATTAAGCTTATATCTGCCCCAAAACCACTGTTTTGGT
TAGAAAAGCTCTTTTCTAACCAACCCAACACTATATATCTGATCATTTCTAAAACTGCTA
CTTTGATCTCAACCAGTAAGTTTTTCTTCTAATCTGCTTTAGACTTAAGCTAATAATTAA
TCCTTGGTTTATTCATTAAAATTGTTTAACTATATATCTATCTGTACTGCAGAAACCCTA
GCGCACACAAGCAAGGAAGG
Download   Copy
>LITCHI007177.m1 GenomeSequence - 
ATGGGGAGGGGCAAGATTGCGATTCAGAGGATCGATAATTCTACAAGCAGGCAGGTGACT
TTCTCAAAGCGAAGAAAGGGATTAATTAAAAAGGCAAGAGAGCTCGCAATTCTGTGTGAT
GCTGAAGTTGGACTCGTTATCTTCTCTAGCACTGGAAAGCTCAATGAATATGCAAGCACC
AGGTCAGACATTTTTATACCAAACTCGTGTTTCTTTTTCAATCTTTGATGTTACTGTGGT
TTATTGTTTTAGAATTTTAGCAAGAACAGAAAACGTTTTGCCTTTGAACCTTATCTTCTT
CTCTTTTATTATTAAGGGGCTGGTCATGGCTGCAGATAATATTTCAGTTTATCAAAATAT
GGGCTTCCTACAAGCACAACTTATGTAGTTTAATTTATAGTCTTATGTTAAATGGGGCTT
ATATATGGTTGCACTGATAAAACAGATAGTTTGCATGACACTACTTTGAAAGATGAGAGG
AAGACAATGTTTTTGGCATCTGGTTGAAATGTTTCAAAGAGATAATGCACAACTTCTTGC
ATCTACATGAAATATACAATCATCATAAAAAGTGTCTATATCACTTTCTCACTTTCATTA
CTTTTTATGAAGTTCCGCATGGTCATAGGATGTCTATTGTGGGACAAACATGTTTAACTT
AGAAACTGTGGAACGACGAGAGAGTATTATATCTGGTTTGCACATTATAGATTAAACCTA
AATCTGACTTAATTATAAGATGGATAGGAAATTAAGGAATAATTTGTTGTATATATATAA
TAAATGGTAAATCATGAGGTAATACTGCCTTTGCTTAGATGATTTGAGATAAATCACTCC
AAATTCAAATTCAACAAGACAAAAGTGTAGCATGAAATCGTATAAAAGAGTATTGAAACC
ACGATATGAGGAAGATTTTAGGGACTACTATTGATTGAACAGTTAAAATTATACATCTTG
GACTCTTTTCTTCTCCTCTTTCGCCCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTT
TTTGTTTTTACTTTTGACTTCAAAATCAGATTGTCTTACATTTGATTGACTACTTGAAGG
AAAAGAAATCTTGATAAGGATGCATCTGTTAAGACAATGAAGTTTCGCCATATTAAGAAT
TGAAGACAAATATGAGCTCGATAATGTAACGAGGAAAGATAGAAACTCAGAAGAATGCAA
TTATAAATAATTAAATTAACAACCAAACTGAGTAAATGATAAATAATTAAAAACAGAATA
AAAGCGAACTAGGAAGTTAAAGGTTTTGGTTGTGTAAACAAATGATTAAGGAGTAAAACT
CAGTCATGAGTGGACGATGGTCATAAACAAGCTAATTAATTAATTTTCTTCAAGATGAAA
GCAATAGCTATGAGTTGTAAGTTCCTTTTAAGTTCTTGTTTGAAGTATAAATTAGGATTT
AGGAAAGAGAAATATGACTTGAACCCATACTCTCAATATGTTGGTGTGAAAGATTTATTG
ATATATGTATACAATCTCAACTTTCATTTTTAAAAACCCTTTCAAAGTTCAAACCCAATA
TACAATTAATATGGACCTAAATCAAATTTATAATAGGAGACTAATTTATAAATTTGGAGT
TAAATGAATATTATTTATAAAAGTAGGAAATTTCAAGTTTTTTCCTTAGATATTTTTATA
TCACCCCATATTTAAATTCAACTACTCTCTACCTAGTAAGAAAAGGGTTTGAAATTAAGA
CTTATACAATGATAAAAGATACCATTAATTAAGCTAACTAGTAGCATATCAAAATGAAAA
ATTCATGCAAGGTCAATCTTAAGGTTGAATTCAAGGCTTTTTGGTTCTTCTTTTACAGCT
TTCTACCGATGATAATCTAACGAAGTTATGTTGATCATCTTTATCATTCTCAATCAGTTA
TGTTGTTAATGATAATCTTTGTCATCTTTATCATTTAGTTCAAAGCATACTTATGTTGTT
AATGATAAGTGTCTTTCTTTATCCCTGGCCTTGAGAATGTAGTCCATTAAAATTGTGTAT
AGATAGTTGAATGGAGTGAGTTAGCTTGGATTATCATCATTAAGTTAGCAGTATATAGGA
TATAGCCATTCCATTTCCCAACAGACTTCTATAATTTCTTGAATACTCCTGGTCTTAATG
GAAGTTATAATTAAACTTATGATACAACTAATTAATTACCACCATTATCTCTAACTTTCC
GCGCCTATATCTATGACCCTTGGTTGTTGTATATGTGATCCCATTATTATTAGTAGCATA
TTATATGGAAACAACTGGTACTAAACACGACTTTAATAATTAGGATTCAAAATAGTACAA
CCCTAGAAGTAGCATTAAGTAACAAACCTAATTATAATTGTTAGTTAATTAGCATGATCC
TAAAAGCTTATACTTTATTTCGATTTAGGATCGGAGTATATAAATGTTAACGTTATCACG
ATTCATTTTATTATAATGAACCTAGCTAGGTCATTTTGTCTACCAACCAGGTTGTCCTTA
CAAAAGTAACGATATATAAATTTCTAAATTCTAGCTAGTCTTTTGAACGATATCATTCAT
GCATCGAGCAAGCTTTTTTTACAAGGAATTAACTATATAGTTGCCTCTATTTTGTAGTGG
CAGCACCCTTATAACTTTAAAAAGAACATTAGGCTGGCCCAAACTCCTTTTAAATCCTCC
ATGCATATAATGAGTCATCATTATTGGTATTCAATGAACTTCAAACAATTGAATGCTTTG
TATAGATAAAATAAATTTTAAATTTGTATATATAATTCTTATTTTGGAATGCCTCAAACA
AAATCAAGTGAATTCTCAATTTAGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGC
ATAATATTGAGGCCTTTTAATTCTTTATACATTCAAAGGATTCTACTTACAAAAAAGTTA
ACCTGGGTGTGAATTTTTTTTATACAGTAATTGAATTCGTTGCATGTAAAAATTAATTCT
ACATACAAATAATTGAAGGCCCTTAACTTATAAAGAGAAATGAGACTCACATGAGAAGAA
CTCTATTAATAACTTTCATCCCGCTGCTTCTGCAGCCTTCTGCCTTAATTCAACAGAAGA
AAATTTTCTTCTAGTTCTTCAATTTTCTTTTTCCATTAACTTAAGTACGTTTGTCGTATT
TCAAACTACATATCTAAAATCATATTTTATAACACAAATTAATACGTATCATTTAAATAA
TAATTTCATGTTTTTGATGTGTTTATCCAATTAAAGGCAATTAAGAGGTACTTGGATGGA
AATTCACTTATATTGTGCTCCAAGACTACAGACGAGTGTATACCAAGCATCTCCACATGC
TAACCGCGTGTGTGCAAATTTCTTTCAAAATGATAATTTAGAAATTTGCTAAAATACCTT
TATAAATTCTCTTAGTCTTAGAGCATGTTTGTATTTTAATGAACTCACATCAGTATTATT
AAGCAGAAAGCTAACACTGCAAAGTTTTGGTTCATTTTTGAGAAAGCAGAAGTTGCTTGC
TGTAGCGAGATGGGTAATCGCGCTTACTCTCTATAAGCAGGGCGCTCAATTAATGACATT
CGATTTCCTCATTCCTGTTTGTAGTGGTTTTTAATATGTTTATGTTTCTTTGTTGGCAGT
TTTTCTATGTTTGGCCGTTTTAAGGATTTGAAAACATTTAAAACTTCTTCAAGAAAATAT
GTATGAGTTAAAAACCCATTGAAAAACAATAAAACTTAACAAGATAACTTGTGTGACACA
TTTATGCACAAGAAAAAGAAATATAGAGAGGAGTCTTCACGAATGTTTGACATAATCTGA
ATAAGGGATGCATGGTACATTGGTTGTATAGAAGCTCTTCTATTTCGATGAAGTGTGAAT
ATCTTTGAGAGGAAAAGATTGATTAAATAGAAAGTATCCGCATGATCTTTGTATTTGCTG
CTAATTTTATAGGGGAAGAAACACTGCAACACCTTTTTTCAGCTCATAAATTTTAGTTTT
CTCATACCAGATTGTGATTGTTTTGTCGACCCATAGGATATTGGGGGATTAATGAGTAAC
AAAGCTCGTACCTAGATACTTTAAGAATAGGACTTGTAGGTATATTTGAAGTAGCGACAT
TGGATTAAGCTCCATAAAAGGTCTGTAGCATAATATGCTTGTGTATGTGATTTCATACCA
TATCATATTATCATCTTTATAAGAACTCTTTTTCTATATAATACTAAAATTAGTGTGAGC
TTTGTAATTAACATAAAATAATTTAAAAGAGTTTTTTAAAAATAAAATGGTTCATGCTAC
TTAGTTCGCAAATAAGGATGGTGTTAAAATAAATTAATCATTAAAGTTTAATGTTAGTTA
CAAAACTCACACTAATTTTAATATTATTTACTTAACTTTCCTTTCAACCATGAGATAATA
TTGCTACTAAATGGTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGTTATTTGACAAAATCC
TTGAATATGTCTTAAAAATTCATTCCTACACATTTTGCATGGAAGATGCTACTTTCATTA
ATAATCATGTGAATTAACTTGAGATGATGATGTCAAATCTAAAAGTTTGAGAAGTTAAAA
ATTAAGGAACAATATTCTCATGATATCATCCTTTTATAGTGAGTTAAACAGCTTTGGTGA
TAAGGTCTTTTATCTTCCTACAAGATATTCTATGTTCAAATCCCCCTAACATCAATATAG
AGAAATAATTGGGTTTGTTTGATTATTTATTGTAATATAATTTGAGTCTGTACCTCTCAC
CTTAGCGGTACTCGTTTAATCCAGTGAAAAAGAACCGAGGACCAGTCTTTAATTATATAT
AATTAAATATCTCATAACTTCTTTATAGCATTATCGATTCCATAATTGTGCAAAAGACTT
TGTTGGCTGAACAGCATGAGAACAATTATCGAACGATATAATCACCTGAAGGAGGAACAT
GAACAGTTGTTGATTCCACAATCAGAAGCCAAGGTACACTCTGTCAACGACAATCTAAAC
TGTGCAGCATAACTGTAACTATATTTCACATATTCTTCATGCACCACATCTGTCATCTGC
GTTTATTGGCCAGTTGAAAAGTAGCAAACACGAAATACAGCACTGTAGGTTTATGATGAT
CCTTACAATGAGGAGCACTTTTGAATTTAAGTTATAGGTTCTTAGCCTGCTCAGTATGCT
TTCCAGCTTCTCCACAATGTTTAAATCTATTTTGACAAACTGAACAAAAGAAACCATATG
AAGTTTTATTTCTGTTATTGTACTTGGTAGTTTTGGCAACGGGAGGCAGCAAATTTGCGA
CAACAACTACAGAACTTGCAAGAAAGCCATCGGTAAAATATATCCTTTTTGAAGCTCATA
TTCATATATTATTGTTATGTAAAATGTTAGTTCTTCATAGTAGAATGTATAGTATATTCA
CTTTCGATACAAAGACAAATGGCCCAGTAACAAACAAGATAATGTAAAGATAACAACAAA
AAATATATGTTTTTTTTTTTTTAAATAAACAAAAATACTTGTTGACATTCAAGAATGATA
GAATAGAAAAGCTTCTTCTATGATAAATCAATATGCATAAAAACCTTGAACAAAAGAAAG
GAAATGAGTAACTAGCATCACATGGGCATCCACCTTATCATTGAGTTGCACCGGCACCAT
GTGACTCATTCATCATGGTTGGTTAGTCGACAATTATTGCATCGGGGAAAAGTACTGTTT
AATGCATTTCAAGTACTATAATAAGTTAGGATTGAATGATTGTTGTTGATCTCCTTTAGT
TAAACAAAGCTAAAATAGTTCTAGGTTTTTAAGCATTTAGAGGAATTATAAAACTCACCT
TAATTAAAATAATACACTTATATAATTCCTTAAAACTTCAAAAGTTAGGTGACATTAAAT
ACATACCTAAGAAGTGAAAGCATAGAAATAAGTTGCCTGCTTATGACTAAATTTCTACCT
GTTGGACTTCATGGGATCAATCTGTCTTTAAGAAAAGAATCAAAATCAAAAATTAATAAA
TAAAAACACCTTATATATGCGCTTTATCTTCTACACCAATTTGATTCCTTTAAACCAAAC
TATATATAGTTGTGTAATGTAATATATACTTTCATAATGCTAAAAAGTTCCCAACATGCA
AAAATTAGATTGTTATAGGAAAACCACTTATATAGATGACCTCATAAATATGTCCAAAAC
TAGCTTTCTGAAGGTTGCTCTTTTGCTTTCTCTATATATCTAACCAATATATACAAAACT
AATAGATGTTAGATACGGAAACAAATGAAATGACTAGTGGTTGACCAACGTTTTACATTT
TCATTCGACAGGCTATTGATGGGAGAACGACTTTATGGTTTGAATGTAAAAGACCTACAA
AATCTAGAGAACCAATTGGAATTGAGTTTGCGGGGAATTCGTCAGAAAAAGGTCAGAACC
TTTTCAGCGTTCATGGAGAGCTTATTGTATAATTACATCAATCCATTCTCATTCATGAAA
TTAACAAGCTCTTTTAGCTTCTGCAGGAACAAATATTAGCTGAGGAAATACAAGAGCTAA
ACAGAAAGGTCTCCCGCAAATACAACAAGTTATGCTCACATTATACATTCTATCAAGAAC
TTTATTTAACTAATAATATATCTACCCTTTGTTGCCTTCATTACAGGGACATATTATACA
ACAAGAAAATTCGGAACTGTATAAGAAGGTAGACCTTATTCGTCAAGAAAATATGGAACT
GTACAATAAGGTATCATAACTCATTCACTCAGATACCTTTAGCCATGACCATCATTAAGT
CTTCTAAACCTGTAAAATGTGAAACTAAGAATCTCACCAACTATGAGGTATCATTTCTTA
GGTTTATGGCACAAGGGATGCTAATGAAGCAAGCCGAAATGCCTTCATTCCATATGGATC
AAATACTAGAGACGATGCACACTTTCCCATCCATCTTCAGCTGAGCCAGCCTGAGCAGCA
AACTTAGGGGACACCACAAAGAGCAATATAATGAAGGTAAAACTTCCACATTATTGAAAA
CACAAAATGGACACAGAAGACATAAAAGGACTATTGTTGCATCTCTTATATCTTTCATTT
AAAACTTGATCCCATATGTATCGTTTTCAAACTGCAGAATTACGTTGAAGAATGTCATGA
CAGTGGAAAGATGTCATCAACTCAACATCAATCTTTGGAGAAGAATTTTTGGAGGGAAAT
GAGCTACATAAAGTTTCATCAGCACCAACAAAACAGTCTGATGATATTTGTGGAATTATA
TGTAACCGTTGAAATTATAATTGAAGAAAGTGTAAAGTTTCATTTTCCGAAAGCAC