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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007166 | Chr11 | 8784668 | 8787416 | - | Transcription factor bHLH93 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007166.m1 | 175 | 218 | PF00010.29 | HLH | Domain | 38.7 | 7.80E-10 |
LITCHI007166.m2 | 175 | 218 | PF00010.29 | HLH | Domain | 39.2 | 5.40E-10 |
LITCHI007166.m3 | 175 | 197 | PF00010.29 | HLH | Domain | 26.6 | 4.70E-06 |
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>LITCHI015918.m1 ATGAAGATTCAGTGTGATGTGTGCGAGAGAGCTCCAGCCACAGTGATATGTTGCGCAGAT GAGGCTGCTTTGTGTGCCAAATGTGACGTTGAAGTGCATGCAGCCAACAAGCTAGCAAGC AAGCACCAGAGGCTTCTTCTTCAGTGCCTTTCTAACAAGCTTCCTCCTTGTGACATTTGC CAAGAGAAGGCAGCCTTCATATTCTGTGTTGAAGACAGAGCCCTGTTTTGTAAGGAGTGT GATGAGCCTATCCATTCACCTGGCAGCCTTTCTGCCAACCATCAGCGCTTCCTGGCCACT GGAATCCGAGTAGCTTTAAGCTCTAGTTGTAGCAAGGACACCCAGAAGAGTAGGTTGGAG CCACCCAAACAGACTGCTCAGCAAACTTGTGTCAAAATACCCTCACACCAACAGCAGACA TCTAATAGTATCACTTCCTCATGGGTCATGGACGACTTATTACACTTTTCAGACTTTGAA TCCTCCTCTGAGAAGGTAACAAAAACGTCTGCAATTAAGGAGCAGCTTGAGTTCGGAGAA CTTGAATGGCTAGCAGACATGGGACTTTTCAGTGATCAACCTTCTCAGGAGGCTCTAGCA GCAGCTGAAGTTCCTCAACTTCCTGTTCCCCAGTCCAACAATATTACATCATACAGATCG ACCAAATCCAACATGCCTCACAAGAAGCCTAGAATTGAGGTCCTAGATGATGATGATGAG CATTTTACTGTCCCAGATCTTGGCTAA
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>LITCHI016345.m1 MCNKGNECLNQSLLDSDNTIDYQQSLSWMDSPSATTPASGSTDETPRVKFLCSFLGSILP RPQDGKLRYVGGETRIVSLLRDINYEELMNRMRELYEGAVVLKYQQPDEDLDALVSVVND DDVTNMMEEYEKLGSGDGFTRLRIFLFSHPDQDGSAHYVDGDDRETERRYVDALNNMNDG NELRKLQQPDSPGVGTVDDVHVAAERFFNTMSPEGGGMHNQLQYNMHHLTIPHVGSGQLQ QPVTQRHNELEGTWSPAYYSPRHYGHHDPRPLPEFPSSPSAARYRMPFGDERIPEEYARQ HVNHHPAYEHQPPFSENVVWMPPGAISGDKAGFPGNILHSHNVFDGNGICEHCRLNFHRN QIHLEQPNLGNGLPHVTPCAECPPNRENFILNAEAKLPHGMYHKDQNETRSVYNDTHGHE RGWVLQHQLNPRVEEARTHISGGGRLNDHYIVDGFSVNFPIGHGNLADGHHMPSNHVQHR AGPEIGNELFHDQAVAPAAHLHIPSPEERIVRYGNLPYGPDNLYPALHGHVHAQTLWRNV HNPIHGAPSYDVSGPLVNGSINPAFVRGTVEGNPRFGGGLDNQNSGVESSQRIPGFDGTA TPPEYSSGQSLKINPQNHNLENLHPDSVQRLDSSSVLVSKVSEAVRMEENSTTGQVKEAS LVEKNENANVLGISCPELNMTANMSVGSDCLRFVKQSDDAVKPGENSSSASPEGSKLSVN RLSFLPELIASVKRAALEGAEEVKARVDDDSEKPDSVPKDIPLNESENAHGEVEMESDND NINTSKIEPTKAEAEAIARGLQTIKNDDLEEIRELGSGTYGAVFHGKWKGSDVAIKRIKA SCFAGRPSERERLVIADFWKEALLLSSLHHPNVVSFYGIVRDGPDGSLATVTEFMVNGSL KQFLQKKDRTIDRRKRLIIAMDAAFGMEYLHGKNIVHFDLKCENLLVNMRDPQRPVCKIG DLGLSKVKQHTLVSGGVRGTLPWMAPELLSGKSHMVTEKIDVYSFGIVMWEVLTGDEPYA DMHCASIIGGIVNNTLRPQIPTWCDPEWKSLMERCWASDPAERPSFSEISQRLRSMAAAI NVK.
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>LITCHI017366.m1 CATTTATTTTTTACGAATTCGTGTCGGAACCCATATTGCCACCCCTAGTTGGTGGTTCAT TTTCAAATCAGAATATCCACTCTGGCAAGCTATTAGCCACCTCAGCGACCATTGATCACA GAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGGCGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAG TTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCACGCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGC CTTATTTTGTTTATTTATTTTGGTTTCCACCAATAATAGTATCGAAATGGGCCGAAACAG AAACGACATCCGGTTCACGGACTCGTACCGCATTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACT TTGATTTCCGATTCAAATCCAGACACCCACCCACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCG TTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCAAAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCC TCCTTTACTCTCAGTCTCAGTCTCTCTGCTATTCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCG AACAGTGAAAAAAAATAAATAGAAGAGTTGTGAAGTCGAAATCGATTGGGTGATGGACGG AGGTGCAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAGGGCCGCCG AGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCACTGTGACCC TGAGAAGGAGAATCTTTGTCTTTATGGGTTTCCTAGTGAGCAGTGGGAGGTAAATTTACC TGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTTGCCAGAGA TGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCTTGGTTACT TTCTGTGGCCTTTTATTTTGGTGCTAGGTTCGGGTTTGATAAAGCTGATAGGAAACGTCT TTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACAATATTTGAGGTTGTTACAGGGACAGCCAAGAA ACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAGTCGAACTC AAAGCGTGGTGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCAAAGGATGAGGA AGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGATGATGAGGAGCATGGTGAGACATTATGTGGGGCTTG TGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAGAAATGGTT CCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAGTACAAATG CCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGAATGGTTGCTCTGTGTGTATTCTGGCA TTATTGAGCTTCTAACTGTTTAGTAGGTTTGTTATTAGTCAGGCCTTCTTCTAGGATATG TATCTTGGATGTTATGTGTAGGATGCAACTTTGCTCTTTTAAGTTTAGAGTATTTATGCA TGGGTGGGGGAATTATTTTCCCTGTTGGGATGAAGACTTGTTTTATATGTTATTGAATTT TCTTGTGTTTATAAGCAATCTATGCCCATTCTTAATTTTTTTTTTCTTCTCACTGACCAT CAGCTTTTAGCCGTATATTAAATATACTTTCAAGTGGGGTAGATGGCTGTTGGCCTAAGT TGGTTAAAACGTCAATAGTCTCATGTCAAGAGATACAGTTTTGCACTCTGTAAATACCAT CCTCCCGCCAATTGTGTGGGCAGGCCTTCCACCTTTCCGTAGGTTGATTTTTTTCATATG AAAACAGTTTTTCGAGTCGAGTTACTAATATTCTCATATTGATTGGTCCCAATAATTTTT TAAGTCAGTTTCAGTCTTAAAAAGAAAAATATACTTTCAAGTATTTGACTATATCTTAAA AAGAAAAAGCAAATAAAAAGCGGAGGCAAGCTCGTAAGTATCGCTAAACCACAAGATAGT GCATAGAGACCACGTACAGTGACAGGTTAGGAAGACAAAGCTCGAATGATTAAAATATGC ACGTATATAATTAGTTGTTAGGTGGTATAACTCGTTCTTCTGTTTGATGTGACTAATGGC ATGTAACAGTTAAAATGAAATGTGCGAGGTGCCCTGGACAACAAATTACACATCTTGTTT GGCTTATTGAGATTTTCTACTGAGAAGTGGACCTTGTTGGCTTATTCGGCTCTGGAGTCT GGACCAGTGGAGAGGCAGAGTCAAGTTGGCCTTTCAGGTGCGCAGCCGAATTTTGCCCTA TCAGAGTCGGCGCATTTTACAAAATGACTTCAGTACATTAGGCCTATAAACATAATTATA TCGCCAAGAGTCAAAAAAATGAAGACGACGAGTATCCC
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>LITCHI017366.m1 - Up_Stream_Len 2000 GGGTGGCAAAAAGGGTTGACGTGTCGGGTTGAACCGAATTCGATTCGATTCGTTTACGAA TTCGACCAATTCGACACGAATTCGTTTAAGAAACGGGTTGATATTTTTGGATTCGACACG AATTCGTTTATAAACGAATGACACGACCCGACACGATTAATTCGTTTAATACTTGAATCA TAAAATATTCTAACCCATTAACCCGTTAATTCGTATAATCCATTAATTCGTTTAATTCAT TTAACCCATTTAACTCGTTCAACCCATTTAACCCGTTTAACTCGTTCAATTCGTTTATTC GTTCGATTCATTTAACTCGTTTAATCTTAATAATATTTTAATCATATACATAATAAATCA TTCGCATTTAAATATTCTAACAACAAATTCAACGGATAAAAAACAAAATCCAAAATCAAC AGAATCAACACAAAAACTAAACACCAAATTCATCAGAATCAAATATTCAAACAACAAATT CAACGGATAAAAACCAAAATCCAAAATCAACAGAATCAACACAAAAACTAAACACCAAAT TCATCAGAATCCACACATAAAAACCAAATACCAAATTCAACATAATCAACACATAAAAAC CAACACAATCATTTTCAAAAAAATAAAAAATAGTAAATTTTTTCAACAACAAAATCAAAT CAAATCATGCTCAAACTCAATACAAAATTACAAATACATGAAAATTAAATTTGCATAACA TTATGGTGGTGGAGCCGTGGATCTGGTGGCGGAGTCGTGGATCTGGTGGGGAGCCGTGGA TCTAGTGGCGGAGTCGTGGATCTGGTGGCGGAGCCGTGGATCTGGTGGCGGACCGTGGAG AAGAGGCAAGATCTTTAGGAGAAATGGAGAAGGGGAGTCGACCGTGAGAGAGGAGGGGAG CACAGACGGCGACTGTGAGGGAGGAGGAGTGAATAGGCGACGAGCGTGAGGGAGGAGGGA AGAACGACCAGCGACCGTGAGGGAGCAAAGAAGATAGGACGGCGAGCGTGAGGGAAGAGG GAAGAACGACCAGCGACCGTGAGGGAGGAGAGAAGATAGGACGGCGAGCATGAAGGACGA AGGGAGAACGGGTGGCGACCGTGGAGAGAAGGTGGCGACTGGACGGCGACGGTGAGGGAG AAGGGGTGACTCGGCGGAAAGGGTAGTGGGGTGTGAGTGTGGTTGCCGAAAAATGAGTGA AAAGGTTTAGGTTTTGGATGAATATGTGTGTATATATAAATGCATAATTACACACTAATC CTTCTAATATGTTAAATTATAATTTACCCCTATTTTAATCGGGTCAACCTGCGATTCGTT TAAGCAAACCCAATTCGTTTCGTTTAATAAACGGGTTAAGCGGGTTGACACGATTACGAC ACGAATTCGTTTAACTCCAACCCATACCCATTTATTTTTTACGAATTCGTGTCGGAACCC ATATTGCCACCCCTAGTTGGTGGTTCATTTTCAAATCAGAATATCCACTCTGGCAAGCTA TTAGCCACCTCAGCGACCATTGATCACAGAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGG CGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAGTTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCAC GCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGCCTTATTTTGTTTATTTATTTTGGTTTCCACCA ATAATAGTATCGAAATGGGCCGAAACAGAAACGACATCCGGTTCACGGACTCGTACCGCA TTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACTTTGATTTCCGATTCAAATCCAGACACCCACCC ACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCGTTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCA AAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCCTCCTTTACTCTCAGTCTCAGTCTCTCTGCTAT TCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCGAACAGTGAAAAAAAATAAATAGAAGAGTTGTG AAGTCGAAATCGATTGGGTG
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>LITCHI009809.m1 GenomeSequence + GCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGTTGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATG AATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAAATGGTTGCTGTTAGTTAATAAGATTCATGTG ATTTAGGGTTTGGATTGAATAGAGTGGAGTAAAAGAGAGAGAGTGATTGATGGCCAACCA GCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCCAACAAGCGTCTACACTTCTCGTTCGATGACGGA CGCTGCTCTCCATTACGATCCCGATCATTCTCTTTACCATTACTCTCACACTGATATGTT GAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTCCCAACCCTGGCCTCCTGGTGTCGATCCCACTTC TGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGGTTCCTCCTCTTAATTTCATTTGCCCTGCATTTCTAT CATTTAACACTCCTTCATTTAGTCTTTGTCTCATGTGTCGGAGTTCAGATATTCTGCTTT TTTATACAATATATCGAATAGCTACAAGATTGGGCACCTGTATAATGTATCATAACATGT GCTTGCATTGGCATGCATGCCTCTATTGACAACTCTGCTTTCCTTTCACTTAAGTTTTAA CATATGCTACAAATATCATTATATTTTCATTTGTTTATTTCAATTATTATTAGTAGTTGC TAATAATATCTGTGAGGAGAGGTTAGTAATAATGGTTAGGCCTATGGTTTGCTCCCACAA GGTCTGAGCTTCAAACCCTCATGGTCATGGGTACCTACTTGGCCAAAGCCCATAGCATCT TGCTTCCTAAAGATTCTAGAGTTTGGTCGGAGTTCCAATATTGAACTCAGATTCGCTAGG CGGCAGCAGGGGATTTCTGGATTATCAAAATAAAGAAAAAAAAATTGTAGTTGCTTGTAT ATTTCAAGCCATATTAATATAGTTTTTCCCTTAAATATAAAATTTTAAGATTGTTTTGCT TACCTGATGTACTGTTGCATTGGGCTACTTTTATATTTTGTAAGTGTAAAGTTTACTTAT TTCTATAGTAACTGTATTTCTTAGCTGGTATTACTCTTCGTATATAATTTTTATTTCCAT GTATCTGTATATAGTTATTTACATTTGTAGTTAAAAATTATTTTATACATTATACTTATT TAGTAGCATATAACTTTTTTTCCTGTTTTGTTGTATAAATATATATACTATGTATTATAG TGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGTACCCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGT ATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGCACTAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTAT ATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGATTGTGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAAT TTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCATCCTATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATT GGAAAGAGGTGAAAGCACGTTGCTGTTTTCTATGTCTCTTATAATATATCTTATTAAACT AAACATTGATATATAATTCTATAATCTAATAAGTTTTATCTTGAGATGGATATCTGCTTT ATACTGATGAGGGTATTGATATAACATATGAGCTTTATTTTAATATATGTATATACAGAA TTTTTGACATAATATATGAGACAGCAGTAAGATAGTATGTATATACATTTACCACTATTT ACATAGATTATTTCCCTAGGTTTCCCCTTTCATTTGTTTTTGAGACAGGCTTTTCGCCCC TATGTGTTTCTCTCTTCTCTTACACTCGTTTTTCTCTTAGATATCTAGGTAAAGTAATTG TTGTACCAGATGAGTAGTATTCTTAGTTTACTTGAAGTGGTTAATTTGATAATTAATGCC CGAGCCTTTGTAGCTTGCTTTTGTAGTTTATGTTACCTGGATGTTTTAAGAGTGAACTGT GTTATTGGAAAAGGTATCTGTAGTTGTTCTAGCCTCTAGGTGAGGAGAAGTGATTTATAT AGGTTAGTTATTTTGTGTTTCATCGTACCCTGGAGACACAAATAAGTAGAGTAACAAAGT TGGCTTCTCTCTGTTACACATCAATAGCATAGCATATCAATCATGAGCAACATTTCTTAC TTTAAGATAACATCGTCATTGATTCGTTGTTAATCAGGTTCCACTTATCACAACGACTGA ATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTGTCCCGTAAGCAAGATTTTAAACTTTCT TATATTTGCAAGTTATGTAATTATATTTTGGAGCTGTTAAAGTCTTAACCATTTCATCTT CTGTTTAATTTGTTGCAGTACTTTCTGAAAACTCAAAGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGC AAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTGGTTACTTCGGTAGGTGCAATTTGCATATAATGT GCCCAGTTAGTTCAAGTTTATTCTGAGTTATTTTCTTTAATTCATAAGAATATGTTGTTT TACTTTTGTTTCAGAGTGCTTCAGGAAATGCTGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTT CTGAGCCTGCATGTGCTGTAAGATTTTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTT GGTTCTGTGATTTGCTCTTCCTATATCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACCG GGGCTTGTAAATTTGGTGCAACATGCAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCAT CAGCTGGACAAGAAAATGCTAGTGGCAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACA CAACAGGTGGTATGAATCCATATAATCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATA ACACAAAAGGACTTCCTTTGAGACCGGTAACTAACTATTTTGTCTGCTGTACTGGTGCAC ATGGTTTTAGTTACTTATATAATCATATACACACACACATACATATTTTTTGGAACTGGT GCTTGTGTGGTCTGTTGTTATAATTATTATCATTATTATATTGCAAGTTGTACTTGTGTG ATGACATCTTTTGTCTCCTTTATCATTTTGTTGAGCTTGTGATTTTCTTTTTCTTGAGGG TCTTTGAGGATAGTTAGCTACTTAGCTTACAAGAGTTTAGTGCTAGCTTACAACAATTTA GTGCTTCTATGGGTGAGTATAATTCACATTGGCTGTGAACTGAAGATAGGTTCTTGTCAT TTATTAGATTTCTAGAATCTTTTCTCATTAAATATTAGAGACTAAAAATGAGATGGTTTT TGAGTTTCAAATTACGTAACAATTGTTATTTAAAATGAAGGTGACTCTTTCCTTTTTGAT TGTTAGTATGTTAGGCTTTGCATTGACAATGTAGCTTTTGCTTCTCTCAGGGTGAAGTGG ATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGGTGAATATATGAATATATGCCCATTGATGTTT AATGTTTTAGATACATATAAAGGAAGTGACAGAAGATGCTTAGATGTCTTTCATGTTTTG TGTATCAGTTGCAAATATGGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGGTATG CTTGGAATTAAGAATAATTGTTCAATCTTCTCAAATGTCAATTTCAACACTTTTTTTTCT TTAAATTTCATTGCTCAATGTGTGCAGCAATTAATCCTCCTGCTGCTGCAATAGGTCACC CACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATCCAGCTGTCTCAA TATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTGTAAGTGTGGTTTTTCCCTGCC TCTAAAACAACCATTTTGTTGTGATTATACCCAAACAAAATGGCCAGTTATTTCCAGGTT TTCTCTTGACACTCTGGCTATAAATAAAGTAACTTTGTGGTCATATTTGAGACGTGATGT TTTCTGTTGTTTGCCTTTTGCAGCTTGGAGTTGGCCCAAATATCTATCCTCAACGCCCTG GGCAGATGGAATGTGATGTGCGCATTTATTTAATTTAATATTCTTCTAGTAGCAACTTAT CCTATTGCCATTATCTTGTCACTGATTCTGAATTACTGAGACTTGGGGAATTTTCCTTAA CCTCTTTTCATACTTGTACATTAATTTTGTTCAATTACATTTGGGGGTGAATTTTCTAGT TTCTTTTGCTGTACAATGGATGAAAACTTCCTTGTGGCTAAGCTCTTTTTGTCAAGACAC CTCTTATTAGATTTAGTGCACCCTTAATGACTTATTTTTCTATTGTATTTTGTATTTTAC ATGCTGTAGTACTATATGAAGACTGGGGAGTGTAAGTTTGGCGAAAGATGCAAGTTTCAT CACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACATTGTCAGCAGCTGAGCAAACTTTTCTAGAGCCT GTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCTAGGAGAGAGGTATCAAATTCCTTTTGA