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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI007146Chr1184624288465308;8465407-Transcription factor bHLH25

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI007146.m1181226PF00010.29HLHDomain36.53.70E-09
LITCHI007146.m2181226PF00010.29HLHDomain36.53.70E-09
LITCHI007146.m3181226PF00010.29HLHDomain36.53.70E-09
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>LITCHI007146.m1
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CATGAATGCGATATGGATTCTCTTGCAGAGTTTTCCACCGACCAAGACATAGCTACCGCA
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>LITCHI007146.m2
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>LITCHI007146.m3
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>LITCHI007146.m1
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>LITCHI018426.m1
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GATTCTCCACTACTATTTTTATTATCTCATACAAAGAGAGGAGGGAAAAAAAAAGAAAAA
AAACCCATCAACCTTTACAAAAGAAAGAAAGAATTAAAGATCAAGAACCATGGTTTTTTC
CTCCATTCCAGCTTATCTTGATCCAGCCAACTGGCAACAACAGCCGAATCATCAAATTGG
GTCTAGTAGCGGTGCAAGTAGTCAGTTTCCTGCTCCTCCTCCACCACCACCACCACCACA
ACCTCATGGAGGTGGTGGTGCAGGCTCAATCCGACCTGGATCGATGGCTGATCGAGCCCG
GATGGCCAACATACCTATGCCCGAAGCAGCACTGAAATGTCCACGATGTGAATCAAGCAA
CACTAAATTCTGTTACTTCAACAACTACAGTCTCGCCCAGCCTCGCCACTTCTGCAAAAC
TTGTAGAAGGTACTGGACCAGAGGGGGTGCCCTTAGAAATGTCCCCGTCGGAGGCGGTTG
CCGGAGGAATAAAAGAAGCAAAGGCAGCAGCTCCAAATCTCCTGCCAGTAGCACTGATCG
TCCGACAGGTTCTGGTTCCACAAGCACTACAATGTCTTCTAACAGTGGAGCTAGTGATAT
GTTAGGCCTTGGACCCCACGTGCCTCCACTACGGTTCATGACTACTCCTTTGCATAATCT
CACTACCCATCATGAATTTGCTAGCGGTGATATTGGCTTGAATTACGGTTCACTTTCAGC
CCCTGTTGTTGGGCCAAACGACTTGAACTTCCACATCGGGAGTGCTTTGGCTAGTGGTGG
CAGTGGTGGTGGTGCTTCTCTTTTATCTTCACTTGGTGGTTTGGATCAGTGGAGGTTGCA
GCAAGCTCAGCAATTCCCGTTCCTTGGTGGGTTGGATCCTTCTTCTTCTTCTTCCGGGTT
GTACCCGTTTGAAGGTGGTGTTGAGCAGTCTGGTTACGGTGGTGGCTCGGGTCAGGTCCG
GCCAAAGTTTTTTACTTCTGGGGTTAGTCAGATGGCTTCAGTGAAAATGGAGGACAACCA
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AAATACTTACTTTGAAAAAACTCCTGAAATCATGGAAGTCTTGAAACCAGCCAAGATATG
AGATGGAAGCCTTAGTTTCTTCAAAATCAACTTTAATTAAACCCTAGAATTTTAGGTTTT
TTTTTTTTTTCTTTTCGAGTTTATTTTCCATTTGAAGTTAGTTGTTTAGGTTGCAATGTA
TGTGCATGTTTGCCATTGTGAGTGTATGAATTTATAGAGTTTCGTATGAGACATATATAT
GTTGATGATATGCAATGAACTTAGATATTTTCTCTTCGAATTCTTTGTTACAATGTC
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>LITCHI018426.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TTCTCTCTCATATTTAATTTAAATACAATGGATGAACTCGATTAATTCGTCCTAACTTTT
TAAAGTTAACATGCACTGATCATAGAAGTTTTATTCAGTGCATACTAACTTTAAAAAGTT
AAGACGAACCAATCGAATTCATCCATTGCATTTGAATTAAATCAAAGAGATAATTTATTG
TAGAAGAGAGAATATAATAAATAAATTTGATTGGTTAGTCACAACTTTTTAAAGTTATGA
GACATTAATGGTAAAATCACTATATATATATATATAGTTTTTATAATTAGGTATACCTGA
TTTTAAAAAGTGAGAACCAACCAATCAAATTCATCCATTGCATTCTCTCTCCTAAAACAA
ATTCTCTCTCCTATTTAATTTAAATGCAATAGATGAACTCGATTAATTCGTCCTAACTTT
TTAAAGTTAGTAGGCACTGATCATAGAAGTTTTATTCAATGCATGTTAACTTTAAAAAAT
TAGGACGAACCAATTGAATTCATCAATTGCATTTGAATTAAATAGAAAAAAGAATATAAT
AGATAAATTTGATTAGTTCGTCATAACTTTTTAAAGTATGAGACACTGATGGTAAAATCA
CTATATATATAGTTTTTATAATTAGGTATACCTGATTTTAAAAAATAAGAACCAACCAAT
CAAATTCATCTATTGCATTCTTTCTCCTAAAATAAATTCTATCTTCTATTTAATTTACAT
ACAAACGAATTTGATTGATTAGTCTTTACTTTTTAAAATAAAATATACCTAATTAGTAAA
ACATTAATATATATAAATGAAGGTATAATTTGAATAGGACATCCCAACCTTAATTGAGAG
GTGTGATTATAGTTATATATTTTTATAATATGAAGACGTAATTTGAATAGGACATCGCAA
CCTTAATTGAGAGGTGTGATTATAATTACTGACTGTATTTTCGATCATATATTGCTTGTA
ATGTTAATGTAATATGAAGATTTTTACAACTTTCAAAAGGTAATTAACAGGAGTACTAAT
TAACTACTAAGACATAAGAGATAAAATTCTTAGTAAGACTATCTCTGAACACACATTGCC
CATGTCAATAACGTGGGAAGAAAACTTTTAAAGCTTTCAGAGGGTAATACGACTCCTAAT
TAACTACTAACAGGATACAGACGTCTAGCCCAAATACCCAATCCTTGTACAGACAGGAGA
GTGAAGGGACGCGCCAAGAGAGCGTGAGAGAAAGCAGTGATGTATATGTATATATATTCT
CATGCAAAAGAAATAAAAGAGTAGGGAAGGGAACATACCGGACCGGGAAAAGGTTCATTC
GGTCGGGACACTTCTACTGTAGTACATCGAAGCACCAAGAGCAAGAACATCTTTTATTTA
TTATAAATTCTTAATTATTTTTTAAAATTAAAACTATTCTTTACATTAATTTACTTTGTT
TTAATATCATAATAATAATCATCATAATCATAATTATAAAATAACAAAAAATCTTTTTTG
GCTGTAAACACCAAACTGATATAAGCTGGTTTGCACTCTGATCTCACTGAAACTCACTAA
AATATATGTATACATTAATACTTTTTTCATGCAAGAGGAGATCTGGGGAGGCACTAATCA
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AGTACAATAATTTAATAATTTAATAAAAACTATTTATAATTTATTATATAAAGCCACTTC
CTTTATTTTGGCTCCTCATTCTACACCACCCCCCACTCTTTCTTTATATCTTTCTCATCA
TCTCCCTGCAACCCTCTCTTCTTGTTGATGTGATTCTCCACTACTATTTTTATTATCTCA
TACAAAGAGAGGAGGGAAAAAAAAAGAAAAAAAACCCATCAACCTTTACAAAAGAAAGAA
AGAATTAAAGATCAAGAACC
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>LITCHI018426.m1 GenomeSequence - 
ATAAAAACAAAAAGAGGCGAGTGAGCAGCAGTACAATAATTTAATAATTTAATAAAAACT
ATTTATAATTTATTATATAAAGCCACTTCCTTTATTTTGGCTCCTCATTCTACACCACCC
CCCACTCTTTCTTTATATCTTTCTCATCATCTCCCTGCAACCCTCTCTTCTTGTTGATGT
GATTCTCCACTACTATTTTTATTATCTCATACAAAGAGAGGAGGGAAAAAAAAAGAAAAA
AAACCCATCAACCTTTACAAAAGAAAGAAAGAATTAAAGATCAAGAACCATGGTTTTTTC
CTCCATTCCAGCTTATCTTGATCCAGCCAACTGGCAACAAGTAAGGGTTTTTCTTCAATC
GTGTTCCACATATCAAAAAAGCAAAAAAATTTCAAAAGAAAATATTCTTGTTACTTTTGT
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GCTCAATCCGACCTGGATCGATGGCTGATCGAGCCCGGATGGCCAACATACCTATGCCCG
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GGGGTGCCCTTAGAAATGTCCCCGTCGGAGGCGGTTGCCGGAGGAATAAAAGAAGCAAAG
GCAGCAGCTCCAAATCTCCTGCCAGTAGCACTGATCGTCCGACAGGTTCTGGTTCCACAA
GCACTACAATGTCTTCTAACAGTGGAGCTAGTGATATGTTAGGCCTTGGACCCCACGTGC
CTCCACTACGGTTCATGACTACTCCTTTGCATAATCTCACTACCCATCATGAATTTGCTA
GCGGTGATATTGGCTTGAATTACGGTTCACTTTCAGCCCCTGTTGTTGGGCCAAACGACT
TGAACTTCCACATCGGGAGTGCTTTGGCTAGTGGTGGCAGTGGTGGTGGTGCTTCTCTTT
TATCTTCACTTGGTGGTTTGGATCAGTGGAGGTTGCAGCAAGCTCAGCAATTCCCGTTCC
TTGGTGGGTTGGATCCTTCTTCTTCTTCTTCCGGGTTGTACCCGTTTGAAGGTGGTGTTG
AGCAGTCTGGTTACGGTGGTGGCTCGGGTCAGGTCCGGCCAAAGTTTTTTACTTCTGGGG
TTAGTCAGATGGCTTCAGTGAAAATGGAGGACAACCAGCAGGTGCTCAACTTGTCAAGGC
AGTTTGTGGGGATTCAAGGAAATGAACAGTACTGGATTAACAATACTGGTAGTGCATGGA
CAGATCTTTCTAGCTTTAGTTCTTCTTCAACTAGCAATCCCTTATAGAGATTTGGTCTCT
CTCAGGTGTTGTTGCAAGTACTAAACGCTGAAGCTTCGATTTTTTTTTGTCAGTGTAGCT
TCAATTGAGGAAAAATTAATTATGACGATCAAGACAAAAATACTTACTTTGAAAAAACTC
CTGAAATCATGGAAGTCTTGAAACCAGCCAAGATATGAGATGGAAGCCTTAGTTTCTTCA
AAATCAACTTTAATTAAACCCTAGAATTTTAGGTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCGAGTTTA
TTTTCCATTTGAAGTTAGTTGTTTAGGTTGCAATGTATGTGCATGTTTGCCATTGTGAGT
GTATGAATTTATAGAGTTTCGTATGAGACATATATATGTTGATGATATGCAATGAACTTA
GATATTTTCTCTTCGAATTCTTTGTTACAATGTC