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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI007146Chr1184624288465308;8465407-Transcription factor bHLH25

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI007146.m1181226PF00010.29HLHDomain36.53.70E-09
LITCHI007146.m2181226PF00010.29HLHDomain36.53.70E-09
LITCHI007146.m3181226PF00010.29HLHDomain36.53.70E-09
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>LITCHI007146.m1
ATGGATGCATCATCGGCCAAATGGTTTTCTGAACTGGGAATGGATGAATACAACATCATC
CATGAATGCGATATGGATTCTCTTGCAGAGTTTTCCACCGACCAAGACATAGCTACCGCA
CTTGGACTGAGTGGAAACCTCAAGCAATCTTTCTCCTCTGAAAGCTTTTCCTACAGTGCT
CCTTTCAATGAAATACCTCAAACAAGATTCGAGAGACCTTCCAAACAAACTAAGACTAAC
AGCTGGAACTCTACCATCACCACCGACCACCTATCCCCAGTTTCTTCTCCAACATCTCAG
TTTCTTTCTTTTGATCAATCCAACTCAGTACCTGCTACCAACTCTAAGCAGTTGTACAAG
AATATTGATTACTCCTTGAAACCCAAGGACGAGGCTGCGTCTCCACCAATAAATATTCAC
TTCCCACGTCATTTGGGTTTGGAGAATTCCTTAGACAACCAAAGCTATGCAACAAAAGCC
AATAACCATGGGACTAACATGTCTTACTCAATGACAAAAACTCCTGCCATGGCTAAAGAT
CACATACTGGCTGAAAGAAAACGAAGAGAAAAACTCAGTCAGCGGTTTATTGCTCTATCC
GCCATTGTTCCTGGCTTAAAAAAAATGGACAAGGCTTCAGTTCTTGGAGATGCTATCAAG
TATGTTAAAGAGCTTCAAGAGCGAGTGAAAGTCCTGGAGGAACAAACCAAGAAGAGAACT
GTGGAATCCGTGGTCTTTGTGAAGAAGTCTCAGTTATCTACTGATGATGAATTGTCAAGT
GATGAAATCTGTGATAATACCTTCGTATCAGCACTCCCGGAAATTGAAGCTAGAGCTTCA
GATAAGGATGTTCTCATTCGGATTCACTTTGAGAAACAAAAAGGTCTCCTACCAAAAATA
CTAAGTGACATTGAGGGGCTTCAGCTTTCAATTGTCAATAGCAGTGTCTTGCCTTTTGGA
AATTCCACTCTTGACCTAACCATAATTGCTCAGAAGAACGACGACTTCCGCATGACAATG
AAGGAATTTGTGAAAGAGCTAAGACAGGCTATATTGAAATTCGTGTAA
>LITCHI007146.m2
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CATGAATGCGATATGGATTCTCTTGCAGAGTTTTCCACCGACCAAGACATAGCTACCGCA
CTTGGACTGAGTGGAAACCTCAAGCAATCTTTCTCCTCTGAAAGCTTTTCCTACAGTGCT
CCTTTCAATGAAATACCTCAAACAAGATTCGAGAGACCTTCCAAACAAACTAAGACTAAC
AGCTGGAACTCTACCATCACCACCGACCACCTATCCCCAGTTTCTTCTCCAACATCTCAG
TTTCTTTCTTTTGATCAATCCAACTCAGTACCTGCTACCAACTCTAAGCAGTTGTACAAG
AATATTGATTACTCCTTGAAACCCAAGGACGAGGCTGCGTCTCCACCAATAAATATTCAC
TTCCCACGTCATTTGGGTTTGGAGAATTCCTTAGACAACCAAAGCTATGCAACAAAAGCC
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GTGGAATCCGTGGTCTTTGTGAAGAAGTCTCAGTTATCTACTGATGATGAATTGTCAAGT
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GATAAGGATGTTCTCATTCGGATTCACTTTGAGAAACAAAAAGGTCTCCTACCAAAAATA
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AATTCCACTCTTGACCTAACCATAATTGCTCAGAAGAACGACGACTTCCGCATGACAATG
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CATGAATGCGATATGGATTCTCTTGCAGAGTTTTCCACCGACCAAGACATAGCTACCGCA
CTTGGACTGAGTGGAAACCTCAAGCAATCTTTCTCCTCTGAAAGCTTTTCCTACAGTGCT
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AGCTGGAACTCTACCATCACCACCGACCACCTATCCCCAGTTTCTTCTCCAACATCTCAG
TTTCTTTCTTTTGATCAATCCAACTCAGTACCTGCTACCAACTCTAAGCAGTTGTACAAG
AATATTGATTACTCCTTGAAACCCAAGGACGAGGCTGCGTCTCCACCAATAAATATTCAC
TTCCCACGTCATTTGGGTTTGGAGAATTCCTTAGACAACCAAAGCTATGCAACAAAAGCC
AATAACCATGGGACTAACATGTCTTACTCAATGACAAAAACTCCTGCCATGGCTAAAGAT
CACATACTGGCTGAAAGAAAACGAAGAGAAAAACTCAGTCAGCGGTTTATTGCTCTATCC
GCCATTGTTCCTGGCTTAAAAAAAATGGACAAGGCTTCAGTTCTTGGAGATGCTATCAAG
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GTGGAATCCGTGGTCTTTGTGAAGAAGTCTCAGTTATCTACTGATGATGAATTGTCAAGT
GATGAAATCTGTGATAATACCTTCGTATCAGCACTCCCGGAAATTGAAGCTAGAGCTTCA
GATAAGGATGTTCTCATTCGGATTCACTTTGAGAAACAAAAAGGTCTCCTACCAAAAATA
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AATTCCACTCTTGACCTAACCATAATTGCTCAGAAGAACGACGACTTCCGCATGACAATG
AAGGAATTTGTGAAAGAGCTAAGACAGGCTATATTGAAATTCGTGTAA
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CTGCAAAGAAGGTGAGCTCACTTCCTTACTGTTTTCTGCTCTTCTATGGAGTTCTTTCTA
CATTTTTCCATCAAAATGTTATCTTCTGACACCCTCGATTTCCTCAAACTTTGCTAAATC
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ATAGCTACCGCACTTGGACTGAGTGGAAACCTCAAGCAATCTTTCTCCTCTGAAAGCTTT
TCCTACAGTGCTCCTTTCAATGAAATACCTCAAACAAGATTCGAGAGACCTTCCAAACAA
ACTAAGACTAACAGCTGGAACTCTACCATCACCACCGACCACCTATCCCCAGTTTCTTCT
CCAACATCTCAGTTTCTTTCTTTTGATCAATCCAACTCAGTACCTGCTACCAACTCTAAG
CAGTTGTACAAGAATATTGATTACTCCTTGAAACCCAAGGACGAGGCTGCGTCTCCACCA
ATAAATATTCACTTCCCACGTCATTTGGGTTTGGAGAATTCCTTAGACAACCAAAGCTAT
GCAACAAAAGCCAATAACCATGGGACTAACATGTCTTACTCAATGACAAAAACTCCTGCC
ATGGCTAAAGATCACATACTGGCTGAAAGAAAACGAAGAGAAAAACTCAGTCAGCGGTTT
ATTGCTCTATCCGCCATTGTTCCTGGCTTAAAAAAAATGGACAAGGCTTCAGTTCTTGGA
GATGCTATCAAGTATGTTAAAGAGCTTCAAGAGCGAGTGAAAGTCCTGGAGGAACAAACC
AAGAAGAGAACTGTGGAATCCGTGGTCTTTGTGAAGAAGTCTCAGTTATCTACTGATGAT
GAATTGTCAAGTGATGAAATCTGTGATAATACCTTCGTATCAGCACTCCCGGAAATTGAA
GCTAGAGCTTCAGATAAGGATGTTCTCATTCGGATTCACTTTGAGAAACAAAAAGGTCTC
CTACCAAAAATACTAAGTGACATTGAGGGGCTTCAGCTTTCAATTGTCAATAGCAGTGTC
TTGCCTTTTGGAAATTCCACTCTTGACCTAACCATAATTGCTCAGAAGAACGACGACTTC
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CATAAGAGACCAAGTTCAGTTCGTGTTGGAGGTTCTATGCTTATCAAAACCCTAGATTAT
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CTGACGTAAACTTGGTATATTTCTCCTTGGTTTGGACCATATCAACCATGGTCGTCATGC
TTTGTTTTACCGTTTGGTTGATCGCTCATTTTGTAATGAAATTACACGTTGTTGGATTTC
ATTTTGTTTGATGGCTTATTGCTTAAATTGAATTTGACTTCATATGTAGATGCATGATAT
ATATCATACATTTATTGTGGTATCAAAAATCCTATTGACCTTAGTTTTAATACCATAATT
GGACTATTGTCTTTATCCGTTTAAATAATTGAGTCTAGTAGTTACTAACATTCATGATTA
AAGGCCAGATTGCTGATAATGTAGGGGAGATTTTTTTAGTTTGTAAGTGAATATTCTCCA
AACATATATATATATAGTTTTATAAATCACACCATTTAATAATTAAATCACATTGCATGG
TATATTATTATTGAATTGGGCACATGTCCCCAAACAAATTGAGGCAATTCCAGTAACTGA
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>LITCHI007146.m3
CGAAAGTGACAAAATTTTCACATTTGCGGAGAGAAGAGTTGATGGACCACACGCTATTAT
AAGAGCGAGGCAAAAACAAGCTTCTTTCCAAACCCTCCGCTGCAAAGAAGGCCAATCTTG
ATCTATAGCGTGTAAAAGGAAGTCGCAAAAATGGATGCATCATCGGCCAAATGGTTTTCT
GAACTGGGAATGGATGAATACAACATCATCCATGAATGCGATATGGATTCTCTTGCAGAG
TTTTCCACCGACCAAGACATAGCTACCGCACTTGGACTGAGTGGAAACCTCAAGCAATCT
TTCTCCTCTGAAAGCTTTTCCTACAGTGCTCCTTTCAATGAAATACCTCAAACAAGATTC
GAGAGACCTTCCAAACAAACTAAGACTAACAGCTGGAACTCTACCATCACCACCGACCAC
CTATCCCCAGTTTCTTCTCCAACATCTCAGTTTCTTTCTTTTGATCAATCCAACTCAGTA
CCTGCTACCAACTCTAAGCAGTTGTACAAGAATATTGATTACTCCTTGAAACCCAAGGAC
GAGGCTGCGTCTCCACCAATAAATATTCACTTCCCACGTCATTTGGGTTTGGAGAATTCC
TTAGACAACCAAAGCTATGCAACAAAAGCCAATAACCATGGGACTAACATGTCTTACTCA
ATGACAAAAACTCCTGCCATGGCTAAAGATCACATACTGGCTGAAAGAAAACGAAGAGAA
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AAGGCTTCAGTTCTTGGAGATGCTATCAAGTATGTTAAAGAGCTTCAAGAGCGAGTGAAA
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CAGTTATCTACTGATGATGAATTGTCAAGTGATGAAATCTGTGATAATACCTTCGTATCA
GCACTCCCGGAAATTGAAGCTAGAGCTTCAGATAAGGATGTTCTCATTCGGATTCACTTT
GAGAAACAAAAAGGTCTCCTACCAAAAATACTAAGTGACATTGAGGGGCTTCAGCTTTCA
ATTGTCAATAGCAGTGTCTTGCCTTTTGGAAATTCCACTCTTGACCTAACCATAATTGCT
CAGAAGAACGACGACTTCCGCATGACAATGAAGGAATTTGTGAAAGAGCTAAGACAGGCT
ATATTGAAATTCGTGTAACATAAGAGACCAAGTTCAGTTCGTGTTGGAGGTTCTATGCTT
ATCAAAACCCTAGATTATAAGTCTAGATAAGCTGGTATGGATCCTTCTTTAGCAAAAGTT
GTCACTTCAGAGTCCGTCCTGACGTAAACTTGGTATATTTCTCCTTGGTTTGGACCATAT
CAACCATGGTCGTCATGCTTTGTTTTACCGTTTGGTTGATCGCTCATTTTGTAATGAAAT
TACACGTTGTTGGATTTCATTTTGTTTGATGGCTTATTGCTTAAATTGAATTTGACTTCA
TATGTAGATGCATGATATATATCATACATTTATTGTGGTATCAAAAATCCTATTGACCTT
AGTTTTAATACCATAATTGGACTATTGTCTTTATCCGTTTAAATAATTGAGTCTAGTAGT
TACTAACATTCATGATTAAAGGCCAGATTGCTGATAATGTAGGGGAGATTTTTTTAGTTT
GTAAGTGAATATTCTCCAAACATATATATATATAGTTTTATAAATCACACCATTTAATAA
TTAAATCACATTGCATGGTATATTATTATTGAATTGGGCACATGTCCCCAAACAAATTGA
GGCAATTCCAGTAACTGAAGTGAAG
>LITCHI007146.m2
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TATTGTAGCTTCTCTAATTTACATAGATGCATATTCTTTTATTGACAAACTTGACATCTC
CATGTGTGTGTGTATACATAGATATATATATATATATACATATATCAAAACTGTGCCCTA
ATTTTTCAAAAATTTTTTCCAGGCCAATCTTGATCTATAGCGTGTAAAAGGAAGTCGCAA
AAATGGATGCATCATCGGCCAAATGGTTTTCTGAACTGGGAATGGATGAATACAACATCA
TCCATGAATGCGATATGGATTCTCTTGCAGAGTTTTCCACCGACCAAGACATAGCTACCG
CACTTGGACTGAGTGGAAACCTCAAGCAATCTTTCTCCTCTGAAAGCTTTTCCTACAGTG
CTCCTTTCAATGAAATACCTCAAACAAGATTCGAGAGACCTTCCAAACAAACTAAGACTA
ACAGCTGGAACTCTACCATCACCACCGACCACCTATCCCCAGTTTCTTCTCCAACATCTC
AGTTTCTTTCTTTTGATCAATCCAACTCAGTACCTGCTACCAACTCTAAGCAGTTGTACA
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CCAATAACCATGGGACTAACATGTCTTACTCAATGACAAAAACTCCTGCCATGGCTAAAG
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CCGCCATTGTTCCTGGCTTAAAAAAAATGGACAAGGCTTCAGTTCTTGGAGATGCTATCA
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CTGTGGAATCCGTGGTCTTTGTGAAGAAGTCTCAGTTATCTACTGATGATGAATTGTCAA
GTGATGAAATCTGTGATAATACCTTCGTATCAGCACTCCCGGAAATTGAAGCTAGAGCTT
CAGATAAGGATGTTCTCATTCGGATTCACTTTGAGAAACAAAAAGGTCTCCTACCAAAAA
TACTAAGTGACATTGAGGGGCTTCAGCTTTCAATTGTCAATAGCAGTGTCTTGCCTTTTG
GAAATTCCACTCTTGACCTAACCATAATTGCTCAGAAGAACGACGACTTCCGCATGACAA
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CAAGTTCAGTTCGTGTTGGAGGTTCTATGCTTATCAAAACCCTAGATTATAAGTCTAGAT
AAGCTGGTATGGATCCTTCTTTAGCAAAAGTTGTCACTTCAGAGTCCGTCCTGACGTAAA
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CTTTATCCGTTTAAATAATTGAGTCTAGTAGTTACTAACATTCATGATTAAAGGCCAGAT
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TATATAGTTTTATAAATCACACCATTTAATAATTAAATCACATTGCATGGTATATTATTA
TTGAATTGGGCACATGTCCCCAAACAAATTGAGGCAATTCCAGTAACTGAAGTGAAG
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TTTTAAAAACAAAATAATGATAGGGACCAAATTGCCAATTCTAGAATCTTTTAACTTGGG
GCTTAAGTTTTGTAGGCCATGAGACAGCAGGAAAAATAGTTGTTCTTATGATTAATGTTG
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GAAAATAAATATTTTATAAATATATCTTTTGAAAGAAAATTATTGATTATTTAGTTGTCA
ATAAAAAAGTTTTTTTAAATTATAGACAGTTTGATTAAATTATTTTTAAAGTATTTTAGA
TTATTAATTTACTAAAAAGAACATGAGAGGGAGGAGTAGTATATCTATTTTAGGAATGTA
ATTACTTTAACCTTAACAAAAAAAAAAAAAAATCAATCGTAGTAGTAATAATAAAGATTT
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GTACTTATTTCAGACCTATGAGTTGATTTTGTTTCTCTAATTTTTTTTTAAACAAATAAA
ATGATTTTGTTTCCTTTTTTTTTATTGTTCATTTGTACCGATTGCAGTGTATATATCTAT
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TAAAAAAAAATACAAAATACGGAAAATTTATTGGTTAAAGAGGAGTTCTTAGATATTTTC
ATGAAATAAAAAGTAAATGAAAGTAGAGACTATGTATTTATATTTATAAAGAAAGTATAA
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AAAAAAAAGCTTAAAAACATTAACTTGGAAAAGCTCAAAATTTGAGCTTCTTCAAGTAAA
CGTTTTTAGTTTTTTTAATTCTTTAAAAGTTCTATTAGGATGTCAATCAAATGACGTAAA
AAAAATCAAGTAAAACTTTTAGCATTAAAAAAGTACTTTTGGTCAGAAGATAAGTTGTAC
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TGTAGTAGTTAAAAAATATTAATAATTTTTTTCTATCTATAATTGGTGTTAAAATCTCAC
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GCTGGAAATGTACCTCACCCTACTGGAGCAGTGAATAAGCGAAAGTGACAAAATTTTCAC
ATTTGCGGAGAGAAGAGTTGATGGACCACACGCTATTATAAGAGCGAGGCAAAAACAAGC
TTCTTTCCAAACCCTCCGCTGCAAAGAAGGTGAGCTCACTTCCTTACTGTTTTCTGCTCT
TCTATGGAGTTCTTTCTACATTTTTCCATCAAAATGTTATCTTCTGACACCCTCGATTTC
CTCAAACTTTGCTAAATCAGCTAGATCATTCATTGAACACAATCATCTTAGTATGCCTCT
TGAGCTGCTTTTGTTTTCTTATTATTATTATTTTTTTAAGATCAAATGGTGTTTTAAGTT
TTAATCTTGATTTCTAAATATTGTAGCTTCTCTAATTTACATAGATGCATATTCTTTTAT
TGACAAACTTGACATCTCCATGTGTGTGTGTATACATAGATATATATATATATATACATA
TATCAAAACTGTGCCCTAATTTTTCAAAAATTTTTTCCAGGCCAATCTTGATCTATAGCG
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GCTTAAGTTTTGTAGGCCATGAGACAGCAGGAAAAATAGTTGTTCTTATGATTAATGTTG
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GAAAATAAATATTTTATAAATATATCTTTTGAAAGAAAATTATTGATTATTTAGTTGTCA
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TTATTAATTTACTAAAAAGAACATGAGAGGGAGGAGTAGTATATCTATTTTAGGAATGTA
ATTACTTTAACCTTAACAAAAAAAAAAAAAAATCAATCGTAGTAGTAATAATAAAGATTT
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TATTTCTCAACCTTTTTTTTTTTTTTTAAATCCATTTCATGGTTCTCATAAAGTTCATCC
GTACTTATTTCAGACCTATGAGTTGATTTTGTTTCTCTAATTTTTTTTTAAACAAATAAA
ATGATTTTGTTTCCTTTTTTTTTATTGTTCATTTGTACCGATTGCAGTGTATATATCTAT
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TAAAAAAAAATACAAAATACGGAAAATTTATTGGTTAAAGAGGAGTTCTTAGATATTTTC
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AAAAAAAAGCTTAAAAACATTAACTTGGAAAAGCTCAAAATTTGAGCTTCTTCAAGTAAA
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AAAAATCAAGTAAAACTTTTAGCATTAAAAAAGTACTTTTGGTCAGAAGATAAGTTGTAC
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ATTTGCGGAGAGAAGAGTTGATGGACCACACGCTATTATAAGAGCGAGGCAAAAACAAGC
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TCTATGGAGTTCTTTCTACATTTTTCCATCAAAATGTTATCTTCTGACACCCTCGATTTC
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TGAGCTGCTTTTGTTTTCTTATTATTATTATTTTTTTAAGATCAAATGGTGTTTTAAGTT
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TGTAAAAGGAAGTCGCAAAA
>LITCHI007146.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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CATTTGAAAGAGAGGTGGGAACGTATCTATTCATAATTTAAATGATCAGTACATATCATC
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GAAAATAAATATTTTATAAATATATCTTTTGAAAGAAAATTATTGATTATTTAGTTGTCA
ATAAAAAAGTTTTTTTAAATTATAGACAGTTTGATTAAATTATTTTTAAAGTATTTTAGA
TTATTAATTTACTAAAAAGAACATGAGAGGGAGGAGTAGTATATCTATTTTAGGAATGTA
ATTACTTTAACCTTAACAAAAAAAAAAAAAAATCAATCGTAGTAGTAATAATAAAGATTT
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TATTTCTCAACCTTTTTTTTTTTTTTTAAATCCATTTCATGGTTCTCATAAAGTTCATCC
GTACTTATTTCAGACCTATGAGTTGATTTTGTTTCTCTAATTTTTTTTTAAACAAATAAA
ATGATTTTGTTTCCTTTTTTTTTATTGTTCATTTGTACCGATTGCAGTGTATATATCTAT
AAATATATATATATCAATGAACTAATAATAAAAAAAATTGTATTGTTGGTTAAAACTAAT
TAAAAAAAAATACAAAATACGGAAAATTTATTGGTTAAAGAGGAGTTCTTAGATATTTTC
ATGAAATAAAAAGTAAATGAAAGTAGAGACTATGTATTTATATTTATAAAGAAAGTATAA
TAGGGTTATAAAGACATAGAAATATTAATAAAATAAAATAGATTAAATATTTTAATATTA
AAAAAAAAGCTTAAAAACATTAACTTGGAAAAGCTCAAAATTTGAGCTTCTTCAAGTAAA
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AAAAATCAAGTAAAACTTTTAGCATTAAAAAAGTACTTTTGGTCAGAAGATAAGTTGTAC
CAAATATATATTAAGTAACCTTATTCAATCTAATAATTAATACCGAATAGTTATACCACA
TGTAGTAGTTAAAAAATATTAATAATTTTTTTCTATCTATAATTGGTGTTAAAATCTCAC
CATGATACCTTGTATAAAAAATAAGAGGTGAGGAGTATGTCACGTGCCTTAATAGAAGTA
GCTGGAAATGTACCTCACCCTACTGGAGCAGTGAATAAGCGAAAGTGACAAAATTTTCAC
ATTTGCGGAGAGAAGAGTTGATGGACCACACGCTATTATAAGAGCGAGGCAAAAACAAGC
TTCTTTCCAAACCCTCCGCTGCAAAGAAGGTGAGCTCACTTCCTTACTGTTTTCTGCTCT
TCTATGGAGTTCTTTCTACATTTTTCCATCAAAATGTTATCTTCTGACACCCTCGATTTC
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TGAGCTGCTTTTGTTTTCTTATTATTATTATTTTTTTAAGATCAAATGGTGTTTTAAGTT
TTAATCTTGATTTCTAAATATTGTAGCTTCTCTAATTTACATAGATGCATATTCTTTTAT
TGACAAACTTGACATCTCCATGTGTGTGTGTATACATAGATATATATATATATATACATA
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TGTAAAAGGAAGTCGCAAAA
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ATGGACTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTACAAAGGATAATGATTTTCATGTTCTGGCTGTG
GATGACAATCTCGTTGATCGGAAACTGGTCGAAAAGTTGCTCAAGAATTTCTTCTTTAAA
GGTACTATACGATCAACAAGTTTTCAATTAAAAAAGGATTATTTTGAAGGGGTACTAACA
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GAGTTCTTGGGCTTGGTAGATGGGCAAAAGCAGAAAACCTCTGTAAGCGACTTGTGCAAA
AATTTTTGGTGTTGTATTCACTTTTGGGTAGAACTACTTTTTCATAAAAGCACTTATTAT
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