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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007137 | Chr11 | 8186784 | 8193366 | - | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007137.m1 | 31 | 68 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 34.8 | 1.70E-08 |
LITCHI007137.m1 | 146 | 204 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.9 | 9.20E-08 |
LITCHI007137.m1 | 243 | 302 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.3 | 2.50E-06 |
LITCHI007137.m1 | 531 | 551 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.8 |
LITCHI007137.m1 | 555 | 573 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10 | 1.3 |
LITCHI007137.m1 | 686 | 858 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 134.1 | 6.00E-39 |
LITCHI007137.m1 | 686 | 843 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 100 | 1.50E-28 |
LITCHI007137.m2 | 31 | 68 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 34.6 | 1.90E-08 |
LITCHI007137.m2 | 146 | 204 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.7 | 1.10E-07 |
LITCHI007137.m2 | 243 | 302 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.1 | 2.80E-06 |
LITCHI007137.m2 | 531 | 551 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.4 | 0.92 |
LITCHI007137.m2 | 555 | 573 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.8 | 1.4 |
LITCHI007137.m2 | 686 | 926 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.8 | 6.70E-49 |
LITCHI007137.m2 | 686 | 910 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 142.6 | 1.40E-41 |
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>LITCHI007137.m1 ATGAAGTACCAGAGCATCAAATTATTTCTTAGCTTACTATTTTCTCTTCTGTACAGTTTT TCTCCGGTGAATTCTCTGAAAGAAGTTACTCAAGTACTGCTTCTGGTCAAGAGTGGTCAA CTTCATGACTCCAACGGAAAACTCAACGACTGGGTTCCAACAAGTGACAATAGTCCATGC AATTGGACTGGCATTACCTGTGATGCTCAAAACCAGTCTGTAGTTGGTGTAGACCTGTCC GGGTTGGGTATATCCGGTGGATTCCCAAATGGGTTTTGTCGGATTCGGACTCTCAAAAAC CTCACCTTAACAGACAATTCTTTCAACGGTACTCTCTCTCCTCTGTCCCTGTCACCTTGC TCTCACCTGCAAGTCTTGGAACTCTCCAGTAACTATTTCACCGGCGAGTTGCCTGATCTC CCACGAGAATTCAGTAGCTTGCAAGTCCTCAATCTCTATAACAACGAGTTATCCGGTGAT ATACCGACAAGTTTTGGCCGGTTTCCGGCCTTGAAAGTTCTCAACCTCGGCGCGAACTAC ATCGGCGGTTCAATTCCTTGGTTTCTAAGCAATCTCAGTGAGTTGACTACTCTTCAGCTG GGTTACAATCCATTCAAGCCAAGTCCATTGCCTCCTAGTTATGGAAACTTATCCAAGCTG GAAACTTTGTGGGCAGCCAGAGCCAACCTCGTCGGAGAAATCCCAGAGTCGATAGGGAAA CTAGCTTCTTTAACGAATCTTGATTTGTCAGACAATTTTCTCTCCGGTAAAATTCCTTAC ACTATCGGAGGATTGACGAGTGTAGTGCAAATTGAGCTTTACAACAACAGCTTGTCCGGT GAATTACCTGAAAGTTTGGCCAATTTAACTGCTCTGCTTAGACTTGATGTCTCCCAGAAC AATCTCACCGGCACTTTATCGCAGAATATCGCCTCGATGAGTCTTCAATCATTGAATCTC 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>LITCHI007137.m1 MKYQSIKLFLSLLFSLLYSFSPVNSLKEVTQVLLLVKSGQLHDSNGKLNDWVPTSDNSPC NWTGITCDAQNQSVVGVDLSGLGISGGFPNGFCRIRTLKNLTLTDNSFNGTLSPLSLSPC SHLQVLELSSNYFTGELPDLPREFSSLQVLNLYNNELSGDIPTSFGRFPALKVLNLGANY IGGSIPWFLSNLSELTTLQLGYNPFKPSPLPPSYGNLSKLETLWAARANLVGEIPESIGK LASLTNLDLSDNFLSGKIPYTIGGLTSVVQIELYNNSLSGELPESLANLTALLRLDVSQN NLTGTLSQNIASMSLQSLNLNDNHFTGEIPEILALNPNLSELKLFNNSFSGKLPENLGKF SDLQDFDVSTNDFTGELPRFLCHRNLLQNLVIFSNRFSGNLPESYGQCQPLYYVRMGNNR LSGEVPAKFWGLPRLEFLEMYNNNFDGPISPSISRARNLTHLLISGNNFSGRIPSAICDL RQLLFFNTGRNRLSGEVPSCIAQLNKLQKLDLHQNMFTGELPGRLDLLTDLTELNLSNNR FTGEIPRELGNIPVLEHLDLSNNMLTGEIPVELTKLKLNQFNVSNNQLYGKVPSGFDHLL FVSSLLGNLALCSRDLKPLPPCPRNRPETVFFASILAICAVLTLGSVVWFIKTNTNYVNK PKGRWKVTTFQRVGFTEEDIIPYLTEENLIGSGGSGQVYKVKLKTGQTVAVKRLWSGKLK LETETVFNSEIEILGRIRHGNIVKLLQCCSGEECRILVYEYMENGSLGDVLHGERGGAGL QDWRTRFTIARGVAQGLAYLHHDCVPTIVHRDVKSNNILLDAEMVPRLADFGLAKTLEAD GSMSRLAGSYGYIAPAWSSGKQLPWT. >LITCHI007137.m2 MKYQSIKLFLSLLFSLLYSFSPVNSLKEVTQVLLLVKSGQLHDSNGKLNDWVPTSDNSPC NWTGITCDAQNQSVVGVDLSGLGISGGFPNGFCRIRTLKNLTLTDNSFNGTLSPLSLSPC SHLQVLELSSNYFTGELPDLPREFSSLQVLNLYNNELSGDIPTSFGRFPALKVLNLGANY IGGSIPWFLSNLSELTTLQLGYNPFKPSPLPPSYGNLSKLETLWAARANLVGEIPESIGK LASLTNLDLSDNFLSGKIPYTIGGLTSVVQIELYNNSLSGELPESLANLTALLRLDVSQN NLTGTLSQNIASMSLQSLNLNDNHFTGEIPEILALNPNLSELKLFNNSFSGKLPENLGKF SDLQDFDVSTNDFTGELPRFLCHRNLLQNLVIFSNRFSGNLPESYGQCQPLYYVRMGNNR LSGEVPAKFWGLPRLEFLEMYNNNFDGPISPSISRARNLTHLLISGNNFSGRIPSAICDL RQLLFFNTGRNRLSGEVPSCIAQLNKLQKLDLHQNMFTGELPGRLDLLTDLTELNLSNNR FTGEIPRELGNIPVLEHLDLSNNMLTGEIPVELTKLKLNQFNVSNNQLYGKVPSGFDHLL FVSSLLGNLALCSRDLKPLPPCPRNRPETVFFASILAICAVLTLGSVVWFIKTNTNYVNK PKGRWKVTTFQRVGFTEEDIIPYLTEENLIGSGGSGQVYKVKLKTGQTVAVKRLWSGKLK LETETVFNSEIEILGRIRHGNIVKLLQCCSGEECRILVYEYMENGSLGDVLHGERGGAGL QDWRTRFTIARGVAQGLAYLHHDCVPTIVHRDVKSNNILLDAEMVPRLADFGLAKTLEAD GSMSRLAGSYGYIAPEYAYTSKVNEKSDVYSFGVLLMELIMGKRPNDDCFGENKDIVKWV TGTALSCPERETTENDSSYCKDLRKLVDPRIKQSTYNYEEIEKVLKVALLCTASFPFNRP SMRRVVALLNAKATI.
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>LITCHI007137.m2 ATATGTTCTCAATTGACACAAACCAACTCTCCCCATTTCTCTCCCTCACTGACGCCAAAA TGAAGCTAATCACGCTCATTGTCAAAGACTCACCCCAACCATAACCCCACACACCACATG TATTTTGCCTAACCAAAAAAATCTTACATAATTTCACTGCCTCCAAAGATAGAACCGGGC CCCTTTTTCAATACCCTAGAAAATTTCGCACCTTTTTTGACAGTTACCTGTTTTGGCCTG AAAGTACTTGCCACTGTCACCACCAATAAAACTCAAACAACTAGATTTTCTCTTTATTGA AAAGCCAAAGCCAAAATGGCAAAATCATGATGTTTCACTTGCACTACGCGTTCATGATCC ATCTTAGTCCCTGATTAACAAATGGTCTGTCACGCACAATCCCAAAATTTAAATGTAACT GTCAAGCATTTAACACACCATTACACAGCTCTTTTCATGTGACTTCTTTTAGATTGTTCA TTTTCTTTTCACACCCCAAAATTTAAATGTGACTGCCAAGCACTTGACACACCATTACAC AGCTCTTTCCATGCGACTTCTTTTAGATTGTTCTTTTTCTTTTCACACACGCTCTTTCTT TTTCTTGCTGCTGTGGCATTTGATCTCTATCCATGAAACCAAGTACCACCAATTCGTTTG TGTCACCAGCAGAGTCTCTGTTGCTCTCATTGCAAAATGAAGTACCAGAGCATCAAATTA TTTCTTAGCTTACTATTTTCTCTTCTGTACAGTTTTTCTCCGGTGAATTCTCTGAAAGAA GTTACTCAAGTACTGCTTCTGGTCAAGAGTGGTCAACTTCATGACTCCAACGGAAAACTC AACGACTGGGTTCCAACAAGTGACAATAGTCCATGCAATTGGACTGGCATTACCTGTGAT GCTCAAAACCAGTCTGTAGTTGGTGTAGACCTGTCCGGGTTGGGTATATCCGGTGGATTC 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