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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI007121Chr1180138178016214-Transcription factor RAX3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI007121.m11462PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain50.61.80E-13
LITCHI007121.m11776PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain41.71.10E-10
LITCHI007121.m169111PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain38.79.40E-10
LITCHI007121.m171117PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain25.71.10E-05
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>LITCHI007121.m1
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GAAGATGCCAAACTCAAAGGTTACATCGAGCAGCACGGCACGGGCGGCAACTGGATAGCC
TTGCCTCAGAAGATAGGCCTCAAGAGATGTGGCAAGAGCTGTCGGCTTAGATGGTTAAAT
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AGCATCCCACAAGATTCTACATTTGAACAGCCAGGCTATTTTGGCCACCAATAA
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IWLKEKWIPGEVKDFICAIIVVICLVGLSNRF.
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>LITCHI016323.m2
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ACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTCAAT
GCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCTCAA
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ATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGTATT
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GTTATTTGTTTAGTAGGACTTTCGAATAGATTCTGAATTCGAAATATTTAAATACATTTT
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GCGTTTGTTATGTGAACTGCCAGCATACAAACCACACAAACTATTGATGTTGCATTCAAG
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GATGATAGGAAACTGAGGAAGAATGATATTAATGGTGTGAATGAAGAATTAATTTAGTAG
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TTTAAGGGAAAGCGTTTGTTATACGGCGTCGGTCCATATTTATCTGATCTTATATTGTAT
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AG
>LITCHI016323.m3
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ACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTCAAT
GCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCTCAA
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>LITCHI016323.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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GGGTCTTTTTAGTGAAGGAG
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GTTGTAGAATTTGGCAGATGAAGTTGCAATTTGGTAACATCGATGTTGGAATTTAGTTGT
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GGGTCTTTTTAGTGAAGGAG
>LITCHI016323.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TTCAGATAAAAAAATAAACGACCTCTGAATTTTAAGTCTCAACCAAACATGAGATTAGAT
TTTATATATATATATATATATATATATATTTTATTTTTTTAAAAACCGAGAGAAATGGGC
TGATCGGATGGTTAAGACCAGCCCCACCCATCCCAATTCAAGTGGTAATGGGTTTTAACC
CTCCAACCAACTCACTCTTTTCAGTTATAGTAATATATATATATATATATATATATATAT
TAATAGCTAAAATTTTTGGTATACAATGCTATAATTTGTTAACACTGGGTTGTTAACACT
GGGTCTTTTTAGTGAAGGAG
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>LITCHI025642.m5 GenomeSequence + 
GTTGGTTGTTAATGGAGTTTATTGGTGGGCTCTGTGTCTGCCTAAAAGAAGCCCAACTTT
AACTTAACCGCCAAAAGGAGCGTCAATGACTGGTCAAGAGCTCCAGAATATTCGGTTCGC
ATAAATCTCTGTCTGAAATCCCTTTCTCGTAGATACTCCAAAAAACCCAAGGCTATTATT
GTAAACTCAGTAACCGAACTCTCCTCACTACTCAAAAGAAACACCTAGCAACCACCGTCC
GATCAAATATAATTACCAATTGACGGTCGAGAATCCACGTTTGACTGAAGTACAAAAAAT
GAGGCTGGAATGATTGGCTTTGATCGAGCTTTGACCACGAAAAATCAAAACAAAAAGACA
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GAGAGAGGAAGAGGAGGTGGTGAGAGATTTTTCAGTTTTGATTGTGTAGCTAGCTCTGTC
ATTTATTTTCTTGTTTCAGTGTTTCAATTTTTTTGAACGGAGAGGAGGAGAGAGAAAAAA
TATCTCTCTCTCTCTTCTTGTGAAGCGATTTTTTTTTTTTGATAAATTGAAAAGGAAGGA
AAGTGTTCCAGTTGAAGAAATTAGGGTTCTTTGGAAGAAACCATGAATGTGATGCGTCGA
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TTTGTTATTTTGCTTGTGTTTTGGCGTCAATTTTTGGCTTTTGCATTGTGTGTTTGTTTC
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TTAATTTGGGCTGCGATTTTGATGATGATTTAGCTGGGATTTTCATGAAATATTAAGATT
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ATTAAACAAGCATGAAGGTATGTAAAGGTTTTGGTATCTATAAGACAGAGAATTAAAAAA
AAAAAAGACAGGAGTAAGTTATTTGCGTAAGTTGCTTTGTCTTTATGTGATGTTGGTTGC
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ATGCAGATTGAGACTTTGGTTTTGCTCTTATGTTTTTGTAATCTCATTACTTCTCACATC
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GCTATATCTGGAGTCAATTACTTGAGCTTTTATCTGAGATTTATATGTTTTGTTATAATA
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CTCAAGATACTACAGAGCCCCAGAACTCATATTTGGGGCTACGGAGTACACCACTGCTAT
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CAGCCTCTGTTTCCTGGGGAAAGTGGAGTTGATCAGTTGGTAGAAATCATTAAGGTGTGA
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