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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI007066Chr1173923217393802+Protein SHORT-ROOT

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI007066.m1113492PF03514.17GRASFamily357.86.50E-107
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>LITCHI007066.m1
ATGGATACTTTGTTCAGACTGGTTAGTCTTCAATCCGATCAATCTATCAACTCTAGCAGA
ACCTCTAGCAGCTCTAGGTCGTCCAGACAGAACAATCACTACCAGCAAGAAGACGAAGAA
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CCTTATCATCAACCCCACCCCTCAAACACCACCACTACTCCTACCACGACGACGACCAAC
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GACCTCAATTTCGACTTCTCAGGCAAGTGGGCAACGGATATTCTCATCGAGACTGCACGG
GCTATTGCTGATAAGAACAGCGCCCGTGTCCAGCAGTTGATGTGGATGCTCAACGAGCTC
AGCTCTCCTTATGGTGATACCGACCAGAAGCTCGCTTACTACTTTCTTCAAGCTTTGTTT
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ACCTGCTCTTTCGAGTCAACGAGGAAGATGGTATTGAAGTTTCAAGAGGTGAGTCCTTGG
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AGGTACAAGGAGGGTTGGTCAATGGCACAGTGTCCCGACGCTGGAATATTCTTGTCGTGG
AAAGACCAGAAGGTGGTTTGGGCAAGTGCATGGAGACCTTAG
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>LITCHI007066.m1
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>LITCHI012747.m1
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GAAGTGCTGTTTGGATGTGGGATCTCGCGCTCAACTTTTGCCGAATGAAGAAGTGGAAAC
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TTCTTTCCCCAACAACACTTGTCATATCACTAATATCCAGCTTATGAAATTTAATTTATC
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AAATTATTTGAATGGATCAATCCCTACGTTCTTTTCTCGGCTCAAAAATCTTACAATTCT
GTCACTTGTAGATAATCATTTAAGTGGTTCAATTCCTCCAGAAATTGGTGACATTGCTAC
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AAATTTGAGGAACTTAAGAAGACTTCTTCTTTCTGCAAACAACTTTTCAGGATCAATACC
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AGGAAAGATACCTGATTTTATCGGGAACTGGACTAATCTTGAAAGACTGGACTTGCAGGG
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AAACACAAAGGGCCAATCAAACTTTGCTTCAGTAGGAACCAGGTGGGCTTACAGCAGTAC
AGGGGTCTACATGGACAATGATGACGCTAGTAACCTTGCAACAAACCAATATGGTTTGAA
TGTCACTGGTGCTGAATATTACAAAACTGCACGCGTCTCTGCCCAATCACTCAAGTATTA
TGGTCTGTGCATGCGAAAAGGTCCTTATAATGTGAAGCTGCACTTCGCCGAAATTATGTT
TACTGATGATCAGTCTTATGCAAGCCTTGGAAGGCGTATATTTGATGTATTGATTCAGGG
AAAATTAGTTTGGAAAGACTTTAACATTGCACAGGAAGCTGGAGGTGTTGGAAAAAGCTT
CACCATAGAAGTTGATAATGTCTGGGTTAATGGTAGCACTTTAGAGGTCCACTTATACTG
GGCCGGTAAAGGAACCAATGCCATTCCTGAAAGAGGTGTCCACGGACCTCTTATATCTGC
TATTACAGTCACACCAAACTTTAAGGTAGATACTGGAGGTTTATCTGCTGGAGTCATTGC
TGGCATCGTAATTGCTTCATGTGCTGTTGTGATACTGTTGTTGGTTGGCCTGTGGATGAA
AGGTTGCTTTGGAGGAAAAGATCTCGAAAACAAAGATGGGGCAGTAATTGCTGTCAAGCA
GCTCTCCTCGAAATCTAAGCAAGGGAACCGTGAATTTGTGAACGAGATAGGAATGATATC
AGCCTTACAGCACCCAAATCTTGTGAAGCTTTATGGGTGCTGTATTGAAGGAAACCAATT
ACTGCTTGTATATGAATACCTTGAAAACAACAGTCTTGCTCGTGCACTCTTCGGTATTGC
AGGCTATATGGCTCCTGAATATGCGATGAGGGGTTACTTAACCGACAAGGCAGATGTGTA
TAGCTTTGGAGTTGTTGCATTGGAGATTGTTAGTGGGAAGAGCAACACTAATTATAGGCC
AAAGGAGGAGTTTGTTTATCTTCTTGATTGGGCGTATGTACTGCAAGAACAAGGAAACCT
TCTTGAACTTGTGGATCCAAGTCTTGGTTCGAAATTCTCCAAAGAAGAGGCATTGAGGAT
GCTTAATGTAGCTCTCTTATGCACCAATCCATCTCCCACTCTCAGACCATTAATGACTTC
TATAGTTAGCATGCTCGAAGGCAAAGTTCCGGTCCAAGCACCAATTATTAATCGCAGTTT
AGACCAGGATGCAAGGTTCAAAGCCTTTGAAATACTATCACATGACAGCCAAACCCAAGT
CACAACATACTCTCAAGAAAGCCATTCGCAGACAAATAGCTCAATGGATAGGGGAGATTC
CTTAGTTTCTCTTCCAATAACAGATGAGACTCGAGAACCTTCTTCATCAAGCATGCTTGG
AAATGTTGAAGTGAAGCAATCTTCCTGCATTGACCATGGCTGGAATCTTAATATTACTAA
AGAACTTAAAAGAAATATCACTTGTGATTGTTCTTTCAGCAACAGCAGTGTTTGTCACAT
CACTAACATTCAGCTTAAGGGTTTTAATCTATCAGCACCTATTCCTCAGGAATTTGTAAA
CCTCACTTTTCTGCGAGAACTGGACCTTACTCGCAACTACTTTAATGGATCAATCCCCAC
ATTTTTTTCTCAGCTCAACAATCTTTCCATTCTGTCCTTTATGGGAAATCGTCTTAGTGG
TTCAATTCCTCCGGAAATTGCTGACATTGCTATGCTTGAGGAGCTGGTCTTGGAAGACAA
TCAGCTTGACGGACCTCTTCCTGAAGGCATTGGAAATTTGAGGAACTTAAGAAGCCTCCG
TCTTTCTGCAAACAATTTTTCAGGATCAATACCAGAATCATATGGAAATCTGAAGAACTT
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CTCTATTTCTCGGTTGACGAACTTAGAGGAGCTGAGGATATCTGATTTGACTGGAGCAAG
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AGGAGATAGAATCACACATGAGGGAAATAATTATGAAGCAGACCTGAACAGGGGGGTCAA
TCAACCTTTGCTTTTATAG
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>LITCHI006441.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TTTTCGAAGCCTAGAGTGGTCACCAATGAGGCTGTCAAGTTAAATAAACTTGATCTTGAT
TTAACATTAGGCCCTCCTGGTGTATAAAATTAACGCCATTTTTGTATACGTTATTGTTAA
TTTTCAATCATATATAATTTTCTTATAATAAGATCATATAGAGCCAGACTACTATGGTGA
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ATTTCCTAAAACAAACCAAACATAAAGGTAACTTGTGACTTTATAAGTTGTATCTATGTA
CCTTATTTATGTTAATATTGGTTGTTGCACACCTCCACCACAATCAGTGAGATTCCCATC
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TGTCAAAAATATATGCATAAGGAGTGAAAATCCATAGAATCCTAGAAAGTTTTACCTACT
TAATTTCCGACTACTTATTTTGGCATGACCCATCTCGGACTCAGATTTATTTGAAGCCAA
TCAATGATTATCATTAATTTATATTTATATTGATCTTAATTAATGTCAAAAGATTATAAT
TAAACTGGTTATATATACTAATAGGAAGTATATATACATGGAAATCGTCTTGGAATTCCG
ACTTGAATGAAACTCAACACATAAGCAACTTCTTTTCTTCTTTGATCATATAAGTTTGTA
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GTCTGATGATTAGTCACTATAAGTTTAGCTGAAATCATGCACCCTACAGACAACCGCTGC
AATATTAATAGTTGTCCCTAACTTCTAATTATTATCAAATTTCAATGGACACATGAATAC
ACATGATTCAATCTGGAGTGACTTGCTGCAGCATGCTTGTGAGTACTGATATTTCTCTTT
TAATGTCTTCCTAGTGCATTAATTTTAAAGATCACCACAGCTTTAATCAGAGATGGCAAA
AGCTCCCTGCTGTCGAATGGTCAAAGAACCATGGACCATGGACAAAAAATGAGTGTCTTA
TCACGCGTATCGAAGTTCAAAATTGTAGGAAAGCCTATTTTAATGAAATAAGATTCTTAA
GGAATTAATCCTTATCTTATACATTCTTTTTATTTTTTATTTTTATCAAAAGAAGGCATT
AATAAAATATTAAATGAAGATTATTTTTTGAAACATCACCTATGGTGGGGATGACTCCAA
TCCGATACATTACCAAATTAAATGAGCATTTTATGCTACTATAAGTCATATTAAATAAAG
ATGCAATATAGAGATATAAATTAATAACCTTTATCTCTTAAAAATTATGTAAAATATGAA
ATAGTGGAGAAGCCAACAACAACACAAAATAATTAAAAACAACCAATGGATCGTTATAAA
CAAAAACTGTATTATCCATTTGATATGATGCTTTGTCATAAAGAAGATTTACTTGTATTT
ATGATAAATACAATATATTATGACTTATGAGCAAAAAAATGTTAAAAAGGAAAAAAATTC
ATCTCTTAAATAATCTAACCATTAAAGACTCAATATTCAATTTTTTATTTAAAGAGCAAT
GAGTACTTAATATGTACCACTGTATATACTTTTACAGATCTGTATATTTTGGCGTTACTT
TCCATCTTCTGACTCTTCTCTTTGCTACATGACTCAACCCCAAATGATAGACACATATAA
TTGTGCTGAGAAACGAGAGGCCAATAACATATATAATTGTTCTGATCACTAACTTAGGCA
CCTATGATATGAACCCAGACAAGTGACACATTATTGTGACAAACATTTTCGAAATCCGAG
CACTCTTGATTCCATCTGTGAGTGGTGCATGCATGTATGTAGGTATACCAAAACTTCTAT
AAAATCTCATCCAATTTTCAATTCAAATTCACTCCTATATCAACTCACTACGTGTACTCC
TAATTAGTTCTGGTTTCACT
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>LITCHI006441.m1 GenomeSequence + 
ATTGTGACAAACATTTTCGAAATCCGAGCACTCTTGATTCCATCTGTGAGTGGTGCATGC
ATGTATGTAGGTATACCAAAACTTCTATAAAATCTCATCCAATTTTCAATTCAAATTCAC
TCCTATATCAACTCACTACGTGTACTCCTAATTAGTTCTGGTTTCACTATGGCCAAGTTC
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CTGTGTCTTCTAGCTTGTGTTCAAGGTGACAACCGTGTGAGTTTTAAGAGCTCCGTCTCC
AAAGTCATACGTCGAAGTTTCACTGAAAAACAAGAAGAGCTTGTTATGAAGTTACATTGT
GTACTTGGCAACCAGTAAGTACTCTCTAAATTATACAATGGTTTTTATTAATCACTTCCC
ACAATTTAGCTAATTAGTAAGAAAACTTTATTTTGATGTATATATAAATTTTTCTTTATT
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TGCTTTTGTAAATGAAGCTAAAATTTCAGAGGAAGAGAAGGGCACTAGACTGGATATGAT
TGACCTTAATCAACTCCCTAGTGGTAGTGAAGGGTACACGGAAGATTTCGGGTGGAAAAG
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TATTTTGAGTACTTTCTATTCGTGTTTATGTAATAATTCTTATACGTTGATGGGATTTTA
CCTAGTGGAATACTCCTCCCAATGTTTTGAGGAAATTTCTCTCCTAATTAATTAGTTGCG
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