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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI007033 | Chr11 | 7140111 | 7147094 | + | "Casein kinase II subunit alpha-4, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI007033.m1 | 126 | 411 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 219.6 | 5.10E-65 |
LITCHI007033.m1 | 128 | 316 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 69.5 | 2.90E-19 |
LITCHI007033.m1 | 236 | 275 | PF01636.26 | APH | Family | 23.9 | 3.50E-05 |
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>LITCHI007033.m1 ATGGCCATAAGGCCTCTCCATTTCACAATCTACCGCTTCAACAACAACAACAACAACAAC TCCCTGCTCCTCTCTCTCTTTTTATCAACCTCATCCTCATCATCACCAACCACACCTCTC GTCTCTCCTCCTTCTCCTTGCAAAGCCTCTCCTCGTCCTCCTCCTCATCTCTTCCTCCGC CGATTCGCCTCCTCCACCGCCTCCCTCACTCAGGCTCTCCGCCTCTCCGACACCCTGGCG CAGAAGATCGGCAAATCGATTCGCCGCCCCGGCGCCCCCTCCAAGGCTAGGGTTTACTCT GACATCAATGTCGTCCGGCCCAAGGATTACTGGGACTACGAGTCCCTTACCGTCCAGTGG GGGGAGCAGGACGATTACGAGGTGGTGAGGAAAGTTGGGAGGGGGAAATACAGTGAGGTC TTTGAAGGTGTGCACTGCACCAATAACGAGAAGTGTATTATCAAGATTCTTAAGCCTGTC AAGAAGAAGAAGATTAAGAGGGAGATTAAAATACTGCAGAATCTTTGTGGGGGACCGAAT ATTGTGAAGTTGCTTGATATTGTTCGGGATCAGCAATCAAAGACACCAAGTCTTATATTT GAATATGTGAATAATACTGACTTTAAAGTGCTTTATCCAACACTATCAGACTATGATATT CGGTATTATATCTATGAACTTCTAAAGGCTTTGGATTATTGCCATTCACAAGGTATTATG CATCGAGATGTGAAGCCCCATAATGTCATGATTGATCATGAGCAGAGGAAGCTTCGACTT ATTGATTGGGGCCTTGCTGAGTTCTATCATCCTGGCAAAGAATACAACGTCCGTGTTGCC TCAAGATACTTCAAAGGTCCTGAGCTTCTTGTTGATTTGCAAGACTATGATTACTCTTTA GACTTGTGGAGCCTCGGTTGTATGTTTGCTGGAATGATTTTCCGTAAGGAGCCATTCTTC TACGGGCATGATAATTATGATCAGTTGGTCAAAATTGCTAAGGTCCTAGGGACAGATGAA TTAAACGCATATTTGAATAAGTACCGTATAGAGTTAGATCCGCATCTTGCAGCTTTAGTT GGGAGGCATAGCCGGAAACCATGGTCCAAGTTCATCAATGTCGACAATCAACATTTGGCT GTTGCTGAGGCTGTGGACTTCCTTGACAAATTGTTGCGATATGATCACTACGAAAGGCCA ACTGCTAAAGAAGCGATGGCCCATCCTTATTTCTTCCCGATCAGAAATGCAGAAAGCAGC AGAAATCGTTCTTAA
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>LITCHI007033.m1 GenomeSequence + AATCATAAAAATTAAAATGGTGGAAAAACGACGTCGTAAAAGTAAAATAAAAAACAGACA AGAAAAACAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAGCATGAAAGAAGAATACCCGGTTCCCGTTCCG GCTAACTTTTGTAATAGTCTCTAAATAGATGGCCATAAGGCCTCTCCATTTCACAATCTA CCGCTTCAACAACAACAACAACAACAACTCCCTGCTCCTCTCTCTCTTTTTATCAACCTC ATCCTCATCATCACCAACCACACCTCTCGTCTCTCCTCCTTCTCCTTGCAAAGCCTCTCC TCGTCCTCCTCCTCATCTCTTCCTCCGCCGATTCGCCTCCTCCACCGCCTCCCTCACTCA GGCTCTCCGCCTCTCCGACACCCTGGCGCAGAAGATCGGCAAATCGATTCGCCGCCCCGG CGCCCCCTCCAAGGCTAGGGTTTACTCTGACATCAATGTCGTCCGGCCCAAGGATTACTG GGACTACGAGTCCCTTACCGTCCAGTGGGGGTATTCTTGTCCTTTTCCCTCATTTTTATT GTCTTACCTAACTTTTGGGGCTTTTATTGATTTTTTTTCCTATTCCTCATAGATGAAGTA GGTTTGCTACTTTGATTTATGTAAAATTATGCTTCAATAAGCTGTTAGGACAATCAGAGA CCCAATCGTGTGGTTTGTTTTTATCGTTTCATAGTATATGTTTGGTTAGTGAATAGTTGT TGTGTGTTTAATTTGGTTTAATAGGGAGCAGGACGATTACGAGGTGGTGAGGAAAGTTGG GAGGGGGAAATACAGTGAGGTCTTTGAAGGTGTGCACTGCACCAATAACGAGAAGTGTAT TATCAAGATTCTTAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAGGTGAATCCCAGCACGGCACCTTGTTC 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