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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006903 | Chr11 | 5588485 | 5593151 | - | Transcription factor SPATULA |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006903.m1 | 154 | 200 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.10E-14 |
LITCHI006903.m2 | 154 | 200 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.10E-14 |
LITCHI006903.m3 | 154 | 200 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.10E-14 |
LITCHI006903.m4 | 154 | 200 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.10E-14 |
LITCHI006903.m5 | 154 | 200 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.9 | 2.90E-14 |
LITCHI006903.m6 | 154 | 200 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.9 | 2.90E-14 |
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>LITCHI006903.m1 ATGGGAGATCATGCGTATGATTACGACAGCAACTCATCGTTTCTTCATTGTAATATTCCT CCGTCTTCTTCGGACGAGATTTCTCTGCTGCTCAACCAGTTTCTGTACCGTTCTTCTTCA TCGACATCAACACCACCGAAAGCAGCAGCGATGAAAACGACAGCGACAACGAATTCTGCT GTTTTGGCGCGCGTGGGTTTGCAGGCGCAGACCTTCTCGTCGCCGCCGGAGGATGGCTCT CATGGCCCGTTGTCCAAATCGCAGAGGATCTCTGCTGGTGGGTTTTTATCAGGGAATGTG AGGCTGACTGGAGTTAACGTGTCGTCTTCTTCAGTTGCGGTTGGTGAAAACGAAACAAAT GAAGACCATGACTGTGAAAGCGAGGAGGGAATTGAAGCAGCGGTTGATGAGGGTCCAGCA AAGGTAGCTCCTCGTACAAAGAGAAGCAGAGCTGCAGAAGTCCACAATTTGTCTGAAAAG AGGAGGAGGAGCAGGATTAATGAGAAAATGAAGGCATTGCAAAACCTGATCCCAAATTCC AATAAGACCGACAAGGCATCAATGCTTGATGAAGCTATCGAGTACCTCAAGCAGCTTCAG CTCCAAGTACAGATGTTAACAATGAAAAATGGAATAAGTTTACATCCTATGTGCTTACCT GGAGCACTGCAGCCATTTCAATTCTCTCAAATGAGAACAGGCTTTGGTGGGGATAATGGA TCGGGCACACTTACTATGACCCAAGCAACCCCGACACGGTCTCTATTCAGTCTACCCAGC CAAAGCACTGCCACAAACCAGCTTCAGGTATCAAATTTAATAAATTCAGGAACCTCATTT GGGTTGGACTCATCGTTACAGGCTCATTTGGACCATTCCTGCTTCGCACTCCTTCAGAGG ACATATGCAGGGAAGACATGTTTTCTAATCAACAACTAA >LITCHI006903.m2 ATGGGAGATCATGCGTATGATTACGACAGCAACTCATCGTTTCTTCATTGTAATATTCCT CCGTCTTCTTCGGACGAGATTTCTCTGCTGCTCAACCAGTTTCTGTACCGTTCTTCTTCA TCGACATCAACACCACCGAAAGCAGCAGCGATGAAAACGACAGCGACAACGAATTCTGCT GTTTTGGCGCGCGTGGGTTTGCAGGCGCAGACCTTCTCGTCGCCGCCGGAGGATGGCTCT CATGGCCCGTTGTCCAAATCGCAGAGGATCTCTGCTGGTGGGTTTTTATCAGGGAATGTG AGGCTGACTGGAGTTAACGTGTCGTCTTCTTCAGTTGCGGTTGGTGAAAACGAAACAAAT GAAGACCATGACTGTGAAAGCGAGGAGGGAATTGAAGCAGCGGTTGATGAGGGTCCAGCA AAGGTAGCTCCTCGTACAAAGAGAAGCAGAGCTGCAGAAGTCCACAATTTGTCTGAAAAG AGGAGGAGGAGCAGGATTAATGAGAAAATGAAGGCATTGCAAAACCTGATCCCAAATTCC AATAAGACCGACAAGGCATCAATGCTTGATGAAGCTATCGAGTACCTCAAGCAGCTTCAG CTCCAAGTACAGATGTTAACAATGAAAAATGGAATAAGTTTACATCCTATGTGCTTACCT GGAGCACTGCAGCCATTTCAATTCTCTCAAATGAGAACAGGCTTTGGTGGGGATAATGGA TCGGGCACACTTACTATGACCCAAGCAACCCCGACACGGTCTCTATTCAGTCTACCCAGC CAAAGCACTGCCACAAACCAGCTTCAGGTATCAAATTTAATAAATTCAGGAACCTCATTT GGGTTGGACTCATCGTTACAGGCTCATTTGGACCATTCCTGCTTCGCACTCCTTCAGAGG ACATATGCAGGGAAGACATGTTTTCTAATCAACAACTAA >LITCHI006903.m3 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CCGTCTTCTTCGGACGAGATTTCTCTGCTGCTCAACCAGTTTCTGTACCGTTCTTCTTCA TCGACATCAACACCACCGAAAGCAGCAGCGATGAAAACGACAGCGACAACGAATTCTGCT GTTTTGGCGCGCGTGGGTTTGCAGGCGCAGACCTTCTCGTCGCCGCCGGAGGATGGCTCT CATGGCCCGTTGTCCAAATCGCAGAGGATCTCTGCTGGTGGGTTTTTATCAGGGAATGTG AGGCTGACTGGAGTTAACGTGTCGTCTTCTTCAGTTGCGGTTGGTGAAAACGAAACAAAT GAAGACCATGACTGTGAAAGCGAGGAGGGAATTGAAGCAGCGGTTGATGAGGGTCCAGCA AAGGTAGCTCCTCGTACAAAGAGAAGCAGAGCTGCAGAAGTCCACAATTTGTCTGAAAAG AGGAGGAGGAGCAGGATTAATGAGAAAATGAAGGCATTGCAAAACCTGATCCCAAATTCC AATAAGACCGACAAGGCATCAATGCTTGATGAAGCTATCGAGTACCTCAAGCAGCTTCAG CTCCAAGTACAGATGTTAACAATGAAAAATGGAATAAGTTTACATCCTATGTGCTTACCT GGAGCACTGCAGCCATTTCAATTCTCTCAAATGAGAACAGGCTTTGGTGGGGATAATGGA TCGGGCACACTTACTATGACCCAAGCAACCCCGACACGGTCTCTATTCAGTCTACCCAGC CAAAGCACTGCCACAAACCAGCTTCAGGTATCAAATTTAATAAATTCAGGAACCTCATTT GGGTTGGACTCATCGTTACAGGCTCATTTGGACCATTCCTGCTTCGCACTCCTTCAGAGG TGA
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>LITCHI006903.m1 MGDHAYDYDSNSSFLHCNIPPSSSDEISLLLNQFLYRSSSSTSTPPKAAAMKTTATTNSA VLARVGLQAQTFSSPPEDGSHGPLSKSQRISAGGFLSGNVRLTGVNVSSSSVAVGENETN EDHDCESEEGIEAAVDEGPAKVAPRTKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNS NKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMKNGISLHPMCLPGALQPFQFSQMRTGFGGDNG SGTLTMTQATPTRSLFSLPSQSTATNQLQVSNLINSGTSFGLDSSLQAHLDHSCFALLQR TYAGKTCFLINN. >LITCHI006903.m2 MGDHAYDYDSNSSFLHCNIPPSSSDEISLLLNQFLYRSSSSTSTPPKAAAMKTTATTNSA VLARVGLQAQTFSSPPEDGSHGPLSKSQRISAGGFLSGNVRLTGVNVSSSSVAVGENETN EDHDCESEEGIEAAVDEGPAKVAPRTKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNS NKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMKNGISLHPMCLPGALQPFQFSQMRTGFGGDNG SGTLTMTQATPTRSLFSLPSQSTATNQLQVSNLINSGTSFGLDSSLQAHLDHSCFALLQR TYAGKTCFLINN. >LITCHI006903.m3 MGDHAYDYDSNSSFLHCNIPPSSSDEISLLLNQFLYRSSSSTSTPPKAAAMKTTATTNSA VLARVGLQAQTFSSPPEDGSHGPLSKSQRISAGGFLSGNVRLTGVNVSSSSVAVGENETN EDHDCESEEGIEAAVDEGPAKVAPRTKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNS NKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMKNGISLHPMCLPGALQPFQFSQMRTGFGGDNG SGTLTMTQATPTRSLFSLPSQSTATNQLQVSNLINSGTSFGLDSSLQAHLDHSCFALLQR TYAGKTCFLINN. >LITCHI006903.m4 MGDHAYDYDSNSSFLHCNIPPSSSDEISLLLNQFLYRSSSSTSTPPKAAAMKTTATTNSA VLARVGLQAQTFSSPPEDGSHGPLSKSQRISAGGFLSGNVRLTGVNVSSSSVAVGENETN EDHDCESEEGIEAAVDEGPAKVAPRTKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNS NKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMKNGISLHPMCLPGALQPFQFSQMRTGFGGDNG SGTLTMTQATPTRSLFSLPSQSTATNQLQVSNLINSGTSFGLDSSLQAHLDHSCFALLQR TYAGKTCFLINN. >LITCHI006903.m5 MGDHAYDYDSNSSFLHCNIPPSSSDEISLLLNQFLYRSSSSTSTPPKAAAMKTTATTNSA VLARVGLQAQTFSSPPEDGSHGPLSKSQRISAGGFLSGNVRLTGVNVSSSSVAVGENETN EDHDCESEEGIEAAVDEGPAKVAPRTKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNS NKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMKNGISLHPMCLPGALQPFQFSQMRTGFGGDNG SGTLTMTQATPTRSLFSLPSQSTATNQLQVSNLINSGTSFGLDSSLQAHLDHSCFALLQR . >LITCHI006903.m6 MGDHAYDYDSNSSFLHCNIPPSSSDEISLLLNQFLYRSSSSTSTPPKAAAMKTTATTNSA VLARVGLQAQTFSSPPEDGSHGPLSKSQRISAGGFLSGNVRLTGVNVSSSSVAVGENETN EDHDCESEEGIEAAVDEGPAKVAPRTKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNS NKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMKNGISLHPMCLPGALQPFQFSQMRTGFGGDNG SGTLTMTQATPTRSLFSLPSQSTATNQLQVSNLINSGTSFGLDSSLQAHLDHSCFALLQR .
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>LITCHI006903.m2 TTGTTTATTTAATTTTTTTTATTTTAATTAATTTTCTTCATATTTTCATTTTTATTTATG AGTCAAACAATCAATCATGTAAATCTCAAGGAATCTATTACCGTCAAGATATTATTGTCC TTTCGTACTCCTCTATAGGATATTTTGGGTGTTTTTAAAGTCAGACGGTATTTTGAAAAA AATTAAACTTTATGAGCGAAAATAGATAATTTGTTAAAGTTAGAGGCTCTTTGGGATTTT CCCATTTAGTTATTATATTTATTTAAAGCGTTAAACCCCGCCCGCAAGGCTCAAAAACTC TCCACCACCACCACCACCATCACCGTCCCTCCCTCTATCTTCGCTACCACTTAACTACAC ACGACACAACTTTGAAAAAACAAGCCAAAAGCTTAAAAAAGAAACCGAAAACAAAACCAA AAACAAAACACAAGAAAGAGGGAAAAAGAAAAAGAGGAGAAAAGAGAGGAAAAAAAAAAA ACTACAAGAAGAAGAAGCGAGAAATGGGAGATCATGCGTATGATTACGACAGCAACTCAT CGTTTCTTCATTGTAATATTCCTCCGTCTTCTTCGGACGAGATTTCTCTGCTGCTCAACC AGTTTCTGTACCGTTCTTCTTCATCGACATCAACACCACCGAAAGCAGCAGCGATGAAAA CGACAGCGACAACGAATTCTGCTGTTTTGGCGCGCGTGGGTTTGCAGGCGCAGACCTTCT CGTCGCCGCCGGAGGATGGCTCTCATGGCCCGTTGTCCAAATCGCAGAGGATCTCTGCTG GTGGGTTTTTATCAGGGAATGTGAGGCTGACTGGAGTTAACGTGTCGTCTTCTTCAGTTG CGGTTGGTGAAAACGAAACAAATGAAGACCATGACTGTGAAAGCGAGGAGGGAATTGAAG CAGCGGTTGATGAGGGTCCAGCAAAGGTAGCTCCTCGTACAAAGAGAAGCAGAGCTGCAG AAGTCCACAATTTGTCTGAAAAGAGGAGGAGGAGCAGGATTAATGAGAAAATGAAGGCAT TGCAAAACCTGATCCCAAATTCCAATAAGACCGACAAGGCATCAATGCTTGATGAAGCTA TCGAGTACCTCAAGCAGCTTCAGCTCCAAGTACAGATGTTAACAATGAAAAATGGAATAA GTTTACATCCTATGTGCTTACCTGGAGCACTGCAGCCATTTCAATTCTCTCAAATGAGAA CAGGCTTTGGTGGGGATAATGGATCGGGCACACTTACTATGACCCAAGCAACCCCGACAC GGTCTCTATTCAGTCTACCCAGCCAAAGCACTGCCACAAACCAGCTTCAGGTATCAAATT TAATAAATTCAGGAACCTCATTTGGGTTGGACTCATCGTTACAGGCTCATTTGGACCATT CCTGCTTCGCACTCCTTCAGAGGACATATGCAGGGAAGACATGTTTTCTAATCAACAACT AAATGTTAATCACTCTGAGACAAATCCATCAGATGCAGCTTTGCTTCCCTTCAATACACA AGATTCTGATCTGAAGGACAGTGGCTCTTTAGAAGCATGCGTAATGGCTAGAAGCCGGCG AGAAAGTGTGCGTTCAAAGAACCTAGAGCACAATCTTATTTGTACTTTCCCCACACTTAA CTGGGTAAAAGTACTTAGTTTGCGAACGGGAAGAAGTCTCCCCGGTGATTGCAAGCTAGA AAGAAACAATCTCTGAAGTTTCTTGGACTCGTTCTGCTCAATTAAGCTTTTGGACTTAGT ACAGCTGTAGTTTACTGGCAGCTTTAGTATCTACTTCATGGGTCAGGAAATCCTCAATGT GAAGGTGGTACTGCTTTGGACATGCCTCTAGCAACCTTTTTTCATCAAAATTTGTCAGAT CAACCCATTGGGCAACGCCTGTGGTCAAAAGTTGGCATGATTCATGTAAACTTTTTGTTT 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>LITCHI006903.m4 TTGTTTATTTAATTTTTTTTATTTTAATTAATTTTCTTCATATTTTCATTTTTATTTATG AGTCAAACAATCAATCATGTAAATCTCAAGGAATCTATTACCGTCAAGATATTATTGTCC TTTCGTACTCCTCTATAGGATATTTTGGGTGTTTTTAAAGTCAGACGGTATTTTGAAAAA AATTAAACTTTATGAGCGAAAATAGATAATTTGTTAAAGTTAGAGGCTCTTTGGGATTTT CCCATTTAGTTATTATATTTATTTAAAGCGTTAAACCCCGCCCGCAAGGCTCAAAAACTC TCCACCACCACCACCACCATCACCGTCCCTCCCTCTATCTTCGCTACCACTTAACTACAC ACGACACAACTTTGAAAAAACAAGCCAAAAGCTTAAAAAAGAAACCGAAAACAAAACCAA AAACAAAACACAAGAAAGAGGGAAAAAGAAAAAGAGGAGAAAAGAGAGGAAAAAAAAAAA ACTACAAGAAGAAGAAGCGAGAAATGGGAGATCATGCGTATGATTACGACAGCAACTCAT CGTTTCTTCATTGTAATATTCCTCCGTCTTCTTCGGACGAGATTTCTCTGCTGCTCAACC AGTTTCTGTACCGTTCTTCTTCATCGACATCAACACCACCGAAAGCAGCAGCGATGAAAA CGACAGCGACAACGAATTCTGCTGTTTTGGCGCGCGTGGGTTTGCAGGCGCAGACCTTCT CGTCGCCGCCGGAGGATGGCTCTCATGGCCCGTTGTCCAAATCGCAGAGGATCTCTGCTG GTGGGTTTTTATCAGGGAATGTGAGGCTGACTGGAGTTAACGTGTCGTCTTCTTCAGTTG CGGTTGGTGAAAACGAAACAAATGAAGACCATGACTGTGAAAGCGAGGAGGGAATTGAAG CAGCGGTTGATGAGGGTCCAGCAAAGGTAGCTCCTCGTACAAAGAGAAGCAGAGCTGCAG 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