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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006895 | Chr11 | 5528277 | 5530597 | + | Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 17 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006895.m1 | 6 | 272 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 178 | 2.50E-52 |
LITCHI006895.m1 | 8 | 266 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 117.8 | 5.20E-34 |
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>LITCHI006895.m1 ATGGACATGGAGTGGGAGCGAGGAGACGTTCTTGGTCACGGCAGCTTCGCGAGTGTCAAT CTTGCCAGACCCAGGAAGGGTTCTGATCGGTTCCCTTCAACGATGGCCGTCAAGTCTTGT GAAGATTGTTGCTCTTGGACGCTCAAGAACGAGAAAGCGGTGCTTGATCAAGTCGGTTCT TGCCCACAAATCGTGCGTTGTTTTGGTGAGGATTATAGTATCGAGAAGGGCGAGAGGTTG TATAATCTGTTTCTTGAGTACGCTTCGAGGGGCAGTTTGGCTGATCAGGTCAAGAAAAAC AATGGTAGCTTGAGAGAATCTGATGTTAGGCGTTACACGAGGTCGATGCTCAAAGGCCTG CGTCATATTCACGCAAAAGGGTTTGTTCACTGCGATATAAAGCTCCAAAACGTGTTGGTT TTCGATGACGGTGATGTCAAGATCGCTGATTTCGGGTTGACAAGGAAATCGGGAGAGAGT GGAGGTAGAGATGGAGATATAGAGAGCAAGTGTCAGTGCAGAGGGACTCCTCTGTATATG TCACCGGAAGCAGTAAACGACAATGAGTATGAGTCTCCTGGAGACATATGGGCTCTTGGC TGCGCTGTTGTGGAGATGGTGACTGGGAAACCTGCCTGGAATCACTGCAAGGATTCGAAT GTGTTCGCTTTGTTGATCAGAATTGGTGTTGGTGATGAGCTGCCTTTGATTCCTGAACAA TTGTCCGAACAAGGTCAGGATTTTTTGATCAAGTGTTTTGTCAGGGACCCCAGGAAACGA TGGACGGCTGAGATGCTTTTGGACCACCCTTTTGTTTTAATCGACGACAACGATCATGAT GATGAGACTATTGCATTGAAGGATTTTAAAGAGACATCACCAAGAAGTCCTTTTGGTTTC CCAGATTGGGTTTCGGTTCAATCTTCAAAGAATTCGAGGTTTGATTCGTTCTTGTCATCC CGGAATAGTGTGTTGGATCGGATCAGGAATCTGGCGGGTGATTGGAGACCCGATTGGTCA GACCAGGACTCCTGGGTTACTGTCAGATGA
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>LITCHI006895.m1 MDMEWERGDVLGHGSFASVNLARPRKGSDRFPSTMAVKSCEDCCSWTLKNEKAVLDQVGS CPQIVRCFGEDYSIEKGERLYNLFLEYASRGSLADQVKKNNGSLRESDVRRYTRSMLKGL RHIHAKGFVHCDIKLQNVLVFDDGDVKIADFGLTRKSGESGGRDGDIESKCQCRGTPLYM SPEAVNDNEYESPGDIWALGCAVVEMVTGKPAWNHCKDSNVFALLIRIGVGDELPLIPEQ LSEQGQDFLIKCFVRDPRKRWTAEMLLDHPFVLIDDNDHDDETIALKDFKETSPRSPFGF PDWVSVQSSKNSRFDSFLSSRNSVLDRIRNLAGDWRPDWSDQDSWVTVR.
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>LITCHI006895.m1 + Up_Stream_Len 2000 CACCATTTTTATAGCATGCAATTAATGTTCATCTTAATTATAATGAATCAATCAAAATAT TTTAGATCTTAAGTGCATGCCACTCTATGTAAGTACTGTTTAATTGCTCTCTCTCTCTCT CTCTTTTTTTATTATTTATTATCTGTTTATCTTTCATTCTCACTAGAGATACATATAATA TTCATGGCCATACATTCTGAGCTTGTAATATAAAAATTAATACTAATATTATATCACTTC AAAAATCTTCAAATACTAAAAAAATGAGAGAACTATCTAATTATTTAATGCATAAATTCA TTCAAAAATGATGGGCGCTTGTTTAGTGCAAATGAGACACGCATGCAGAGATTTGGTGTG TCCAAAGACAGCTACAAATTGCAAGAGAATCATATGCAATTGCAAAGGTTTCATAAATCA TGGTCACCCGTTATAGACTTTGGGATCACAAGTTAATAGCATTTCTTTTTCTTGAAGTGA CAAATCACAGAGGTGCTTATGTTATTATAAATCTGAAAGTGAGTGAGAGAGATTGAGAGA TGGTTTTATAAAATTTATTTTTCTTTTCTTTTTTTTATATGTAGTGTCGTTCCCATGTAT GCACGTTTCAGGGTGTCGGTTGTGTGAACTAGCTGCTTTTACATATTATCAATTTTCTTT ACATTAGGTATGAGCAATTGATTATTCTAATATGGTTAAAACCTCACATCAATTGCAATT CTAAATAAGAGAGGGTCAGTGGCCAGTTGGCAAGGCCATTAATCCTTCTGCCTCGAAGTC ACAAGTTTTATTCCCATCAAAGAGCAAATATTTTATTATATAAAAATACGTGAATGTTCT CTTATCTTGTGTGAATTCTCTTCTTCATTTATGTGCATGTTGCTCCCTCCTATACAAAAG TTATTTCTTGAGTCATGCCATAAAGTTAAAAATTTCGTTTGGTTTTGACTGATCCTTGAA CCTGTCTTAATCATGAAAATAAATAATTAAGTAAGTGCAATTCTAAATAATTTTATTATT TATGCCAATCAACTTCACTTGAAAATTGAAATCAATGTTGTTTTTTAGGTTCCCAAAACA TACGAAATTCGGTATTGATTTGATAAATCAAAGTACACGGCACACATTTATTTATTTTTC TTTTTTTAACCATATCCTTCCCTTATATAATAATTACGATTCTAAAAACAACTTTAATGC TACTATTTATTTTACATATAAATATTAAGGGAAAGCATTTTGGGCACTATTGAGTATTGA CAACTTCATTTCCATTTCCTACTTCTAAACACACCTTAATTCAATGGTTGGAGTATACTA TATATCTTTCCTATCTTTAATTGAATTCCAAAAATGACCAATCAAAAATAATCAGAGAAA AAACAATTAAAATCTAGAATTTGATCACTGTTTAAAGTCAAGAAAACACAGCCCATATAC AAACTATTGAGTAATATAATAATATAAGTCAATTACCCAAATAAAAATCCTACAGATTGT TCACCAATAAAGTTACTTCTAATCACTAACGGCATTCTACTTAATTAAGGAAAACAATCT TTGACGGTTCATAGTTCGCTATTTACTCGTTTAATCCGACCGAATATTCCATAGCGCGTG GCGCGTGGCCCGCTATAAAACGAAAATAAATCAATTAAAAAAGGCAGAGAGAGAGAGAGA GAGAGAAGAAACAGTTGTGTTTAATGAACCACGTTTCAAAACTGAGATACCGAGTTTCAG TCCAAATACTGAAAACGAGTCCTCCTCAAAAATATCCTCGCCTATCACGTGCATTTTATT CACATGGTCAAATATATTAATATCACGTAAAATAAAATACATTAATTAGAAATTCAACAC AACCATGTATAAATAACCAACAACACACGACTGGTGTCCAGTAGTTGGGTTTTGTGTTGT GTTGTGTTGTTCTCTGACCCCTGTTTCTTCTTCAAAAGGAAACCTAAAACCTTGAATTTC TTGGATAAAAAAAAGATTCA
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>LITCHI023342.m6 GenomeSequence + AAGAAACTTACAAAATTTTGACATATGATCATTGTTAACCGAATCCAAAGTCTATAAAAT TTTAGATTTGAGTCGTTCAGATATGATTATTCGATCGATAATATTTCAGCTCGGCGGTGG CATTATAAAAGGCACCTTATTATATAAAATTTGAAAATCGAAATTAAGGTTATTCTCACG CTGAGCGAAGCAACGCTAGCTAATGGAATCCAAAAATACCAGAAGACGAACCATTGCCTG GTCCTGACACAACACACACGCACACAGTCTCTCTCTCTCTCAACAAAAACCCCATTTTTC CCCCCAAAAAAAAAATAATAAATCGAACAGACAAACATAAATCCTTTGAATTTGAATCTG TAGGTTTCTAGGGCTCGTGCTCGGATCACTTTGATTTTGTAAGTAGCCATTTTCTCATTC ACTCTTCACTCTAATTCATACTTCTTGTTGTTTTCGTTTTTATTTATTTATTTATTTTAA ATTTATTCAATTCATGTTTCTTGTGTTGAGGAAATAGCGTTCGCACACTTCAATTTGATA ATAAATGAAGGCTTTTTAGGGATTGGAAAAGGGAAATAGAGTAATTTGTGTGTAAATGGG TGGATTCTAATTGCCATTGCATATGGTTTTGTTTTGTTTTGTAGTTGGTATTTGTTTTTG TATGCATTCTATATGTGGTGAGTTTATAGAGGTTTTGAGATGAATATGTTGAGTTAGTTA ATATTGCAGGGGATTTTTGCAAAGTTATGAGCTGAAAGTGTGTTGGTAGTGGATTGGTTA TAGTTTGAGCTGTTGAGATGTATGGTCAAGGGAGTTATAATTCTCAGTTTGGGCAGGGTG GTGGTTCTCACACACCCATGCCACCACCATACCAGCAGCAGCGGTTGCCTGGTCCTCCTC 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