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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006892 | Chr11 | 5488192 | 5489488 | - | Transcription factor HEC1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006892.m1 | 170 | 210 | PF00010.29 | HLH | Domain | 28.1 | 1.60E-06 |
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>LITCHI006892.m1 ATGGATGTTGACATGATAAAAGCATCCCAAGAGGATCATATGGATATGATGTCAATCATA ATGCAAATGGAAAAGCTTCCTGAATTCTGTGAGCCTTTCAACACCTCAGAGTCACCGCCA GAGATTCAATTCTCCAATGCAAATACCAACAGCTCTACCAATACTCAAACACACCCCATA TATCACCCTACTCCAACCGTCAATTCTTCTCTTCCTAGCTTGTTGAATGCTCCTGCCACC ATACCATTTATAAGCCCAGCTCCTGTTCAAGAGCCCGTGACACCACCTCTCCATCATCAT CATCACACAGCAAGATTCAAGAATGCATTCACCTTACCAAACACCAACCCATATCAACCA TCTTTGGAGAAGAGAAACCCAATGGCCGCCATGCGAGAGATGATCTTTCGGATAGCGGCT ATGCAACCAATCCACATAGACCCCGAATCCATCAAGCCTCCCAAGAGAAGGAACGTGAAG ATATCCAAGGATCCGCAAAGCGTGGCTGCGAGGCATAGAAGGGAAAGAATAAGCGAGAGG ATAAGGATACTTCAACGACTTGTCCCTGGTGGAACCAAAATGGACACAGCTTCAATGCTA GATGAGGCTATACATTACGTGAAATTCTTGAAGAAACAGGTCCAGACTTTGGAACAAGCT GGTGCGCAGAGGCCAATGGGTGGTTTTGGATTTTCAGGAGCAGCAACGGCTAATGTGGGT TACCCTTCAATGGTCAAAGCTTGCCAACAGAATTCTCAAATGCTGGGGCGCAACATGCAA ATGTTGAGATGA
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>LITCHI012711.m2 CCGATAAATAACGCACATTAAAATACAAAGAACGTTCTGAAAGCGCCGTTATATCGACAG GCAAAAAGATGGCCCACGTCATAACAAAGAGAGCGCCGTTGCATCGACAGGCAAAAAGAT GGTCCACGTCATAACAAAGAGAGCGCCGTTGTGTCGACAGGCAAAAAGATGGTCCACGTC ATAACAAAGAGAGCGTGGCGACACGCGCTCCCAGTTACACCGTCCAGTAGGGGCTGGCTC GCGATATTTTTCCGCGCTGACAGCTTGACAGCTGAGAGTCGGTCTCCTGTTAGACGACAC AAACGGCAAAAGGACACGTGTACCGTCCACGCTTTTATGGCCTCACAAAATATCTCCCAC AACCACGTTTCAAAGTCTCAGTTTCACTGTAACCAATAAAAATATCCAACATTTGGTTTC GATAAAAAAGAAAAAAAATCCAACATTTCAAAAAAAACAAAAGAAAAAAAAAAGTTGCAG AGATTTCGTTGAAACTGATTTTGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCGATGAAGATAC AGTGCAACGTGTGCGAGGCGGCGGAAGCGAAGGTGCTGTGTTGCGCGGACGAGGCGGCGT TGTGTTGGGAGTGCGACGACAAGGTTCATGCGGCCAACAAGCTCGCAAGCAAGCACCAGA GGGTTCCTCTCTCCGCTTCTTCTTCACAGATGCCAAAGTGTGACATTTGTCAGGAAACAT CTGGCTTTTTCTTTTGTCTACAAGATCGAGCCTTACTCTGCAGGAAATGTGATGTTGCTA TACATACAGCTAACACCTATGTGTCAGCTCATCAGAGATTTTTGCTTACCGGGGTAAAAG TAGGCTTAGAAGGAGCCGACCCTGGTGCATCCTCTTCCTCAGCCAAATCAACTTCAGGAG AAAAAGTTTCAGAAACGAAATCTCATACTTTGTCTAGAAGAGGTACCCCCATGATGATGA 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>LITCHI012711.m1 + Up_Stream_Len 2000 GATTTAAGTGTTCATTTATTTGGGTTGAATTCCTAAAATTAAAAATTTATGAATAATTAA TTATGATTAATAATAAATATGTAAAACATATTAATCAATTATTTCGTTGGATTTTACATA CTAAGTTTTTTTTTTAAAAAAAAATTTTTTACTTGCCAATTTATATTATTTGTGCACAAA AATTGTCAATCTACATTTTTTTTTTTTTTAAGTTGTAGTTTTACATATTTGTGACTAGAA AAGTGTTGCACAAATATCGGTATGTCATAATGTGTGTGACATTAGCGTTTTATATTGTGT GAAATATCAGCGTAAATGTAAAACTTTTCAGCAGTAACAAAAAATTATAGGAAAATCACC AAGTGGCATTACAACGGACATAGTGTACGTAATTTCAGTAGCAAATGGTAAGACTCTCCG AATGGCTCATTTGGAGCTTCTCTGTGTTCTCCCCTTAGTAGCTACTTTGAAAGACTTCAT TTAGCGCATGATATTGGATAGAATGAGATAAAATAAGAAGAAATGTGATTTAATAATTAT CGTAACATATTTTGTGCAATTGACAATGGATATTATTTAATTGGAACGAATTAATTTAAT AATAAATTAAATTCATTTTTAATAATAAATTAATTTTTAAATATATTCACTTTTTTATTT GATGTCAAATATGCTTTCACTTAATATAAAAAACAATTAAAATTAATAAAAATAAAAAAT TAATTATATTAAAAATAAAATTTACTTTAAAGAGTTTGACTCTATGTCCGAAATTATAAA CTCTGAATCAATCTGCATGTGTTTGAAGAGATGGTCCATCCAAAAAAGAATAAAAAAGAA AAGAATTGAACTAAATCCGAAAACTCAAATAATTTGAATTTAAATTATCCATATTGGATC CATTTGCTATCTATCACTGGTTGCTACTTTAATTTTACCCTCATTTTTCCTTTTAAGAGA ACTTTATTTTGATTCTTATATTTGTTAAAAATTTATTGGTTTAAAATGTAAATCAGTTTA TAGTATTTCATAATCTCTTATGTTTAAAAATTCATCAAATTAATCTCTCTAATATAATCT TTGATAGTCAACATCAACAAAAAATAAAAAGATTAAAAAAAAAAAACTATTTTACTCTTA ATTTTAAATACATTTTTAATTATTATTTTTATTTATTTTTTAAAAAAAAAATCATTTGAC TTGTGTCTTTATGCTATTAATTAGTATTAAAAGATAAAACAACCCCCACATACGTAATAT TTGACTGTTTGTTGACTAACAATAAAAAATAACTTGATAAATTTTTGAAAGGTAAATAAT CTTAAATGTTATAAATTGATTCGTATTTAAAAATAAAAAATTTCTTAATAACGTAGTGAC CACTTCCAGTCCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTACTTTTTGAAATAGACTTTA ATTTCACCTTGTGATTTTCTTTGACGTGAACCGATAAATAACGCACATTAAAATACAAAG AACGTTCTGAAAGCGCCGTTATATCGACAGGCAAAAAGATGGCCCACGTCATAACAAAGA GAGCGCCGTTGCATCGACAGGCAAAAAGATGGTCCACGTCATAACAAAGAGAGCGCCGTT GTGTCGACAGGCAAAAAGATGGTCCACGTCATAACAAAGAGAGCGTGGCGACACGCGCTC CCAGTTACACCGTCCAGTAGGGGCTGGCTCGCGATATTTTTCCGCGCTGACAGCTTGACA GCTGAGAGTCGGTCTCCTGTTAGACGACACAAACGGCAAAAGGACACGTGTACCGTCCAC GCTTTTATGGCCTCACAAAATATCTCCCACAACCACGTTTCAAAGTCTCAGTTTCACTGT AACCAATAAAAATATCCAACATTTGGTTTCGATAAAAAAGAAAAAAAATCCAACATTTCA AAAAAAACAAAAGAAAAAAAAAAGTTGCAGAGATTTCGTTGAAACTGATTTTGAAAAGAG AGAGAGAGAGAGAGAGGGCG >LITCHI012711.m2 + Up_Stream_Len 2000 GATTTAAGTGTTCATTTATTTGGGTTGAATTCCTAAAATTAAAAATTTATGAATAATTAA TTATGATTAATAATAAATATGTAAAACATATTAATCAATTATTTCGTTGGATTTTACATA CTAAGTTTTTTTTTTAAAAAAAAATTTTTTACTTGCCAATTTATATTATTTGTGCACAAA AATTGTCAATCTACATTTTTTTTTTTTTTAAGTTGTAGTTTTACATATTTGTGACTAGAA AAGTGTTGCACAAATATCGGTATGTCATAATGTGTGTGACATTAGCGTTTTATATTGTGT GAAATATCAGCGTAAATGTAAAACTTTTCAGCAGTAACAAAAAATTATAGGAAAATCACC AAGTGGCATTACAACGGACATAGTGTACGTAATTTCAGTAGCAAATGGTAAGACTCTCCG AATGGCTCATTTGGAGCTTCTCTGTGTTCTCCCCTTAGTAGCTACTTTGAAAGACTTCAT TTAGCGCATGATATTGGATAGAATGAGATAAAATAAGAAGAAATGTGATTTAATAATTAT CGTAACATATTTTGTGCAATTGACAATGGATATTATTTAATTGGAACGAATTAATTTAAT AATAAATTAAATTCATTTTTAATAATAAATTAATTTTTAAATATATTCACTTTTTTATTT GATGTCAAATATGCTTTCACTTAATATAAAAAACAATTAAAATTAATAAAAATAAAAAAT TAATTATATTAAAAATAAAATTTACTTTAAAGAGTTTGACTCTATGTCCGAAATTATAAA CTCTGAATCAATCTGCATGTGTTTGAAGAGATGGTCCATCCAAAAAAGAATAAAAAAGAA AAGAATTGAACTAAATCCGAAAACTCAAATAATTTGAATTTAAATTATCCATATTGGATC CATTTGCTATCTATCACTGGTTGCTACTTTAATTTTACCCTCATTTTTCCTTTTAAGAGA ACTTTATTTTGATTCTTATATTTGTTAAAAATTTATTGGTTTAAAATGTAAATCAGTTTA TAGTATTTCATAATCTCTTATGTTTAAAAATTCATCAAATTAATCTCTCTAATATAATCT TTGATAGTCAACATCAACAAAAAATAAAAAGATTAAAAAAAAAAAACTATTTTACTCTTA ATTTTAAATACATTTTTAATTATTATTTTTATTTATTTTTTAAAAAAAAAATCATTTGAC TTGTGTCTTTATGCTATTAATTAGTATTAAAAGATAAAACAACCCCCACATACGTAATAT TTGACTGTTTGTTGACTAACAATAAAAAATAACTTGATAAATTTTTGAAAGGTAAATAAT CTTAAATGTTATAAATTGATTCGTATTTAAAAATAAAAAATTTCTTAATAACGTAGTGAC CACTTCCAGTCCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTACTTTTTGAAATAGACTTTA ATTTCACCTTGTGATTTTCTTTGACGTGAACCGATAAATAACGCACATTAAAATACAAAG AACGTTCTGAAAGCGCCGTTATATCGACAGGCAAAAAGATGGCCCACGTCATAACAAAGA GAGCGCCGTTGCATCGACAGGCAAAAAGATGGTCCACGTCATAACAAAGAGAGCGCCGTT GTGTCGACAGGCAAAAAGATGGTCCACGTCATAACAAAGAGAGCGTGGCGACACGCGCTC CCAGTTACACCGTCCAGTAGGGGCTGGCTCGCGATATTTTTCCGCGCTGACAGCTTGACA GCTGAGAGTCGGTCTCCTGTTAGACGACACAAACGGCAAAAGGACACGTGTACCGTCCAC GCTTTTATGGCCTCACAAAATATCTCCCACAACCACGTTTCAAAGTCTCAGTTTCACTGT AACCAATAAAAATATCCAACATTTGGTTTCGATAAAAAAGAAAAAAAATCCAACATTTCA AAAAAAACAAAAGAAAAAAAAAAGTTGCAGAGATTTCGTTGAAACTGATTTTGAAAAGAG AGAGAGAGAGAGAGAGGGCG
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>LITCHI026260.m1 GenomeSequence - ATGCAACTGGAGATGTCAGAGGACATCCGGGTTGGGTCGCCGGACGATGCGTCGAATAAT TTGGACTCGGATTTTCACTTGATGGCCGTGAGCCAAGGCGGGAACCCAGGTGACCATCAA CAGAGGCGCGCTGACTCGTTCAGAGCCGAGTCGAGTCGGAGGTGGCAGATGCTGCAAGAG CCGTTGAGTAGTGGTCTCCAGCCACCTCCTTCGGGTTCAGGTAATGTTAGTTCAATTGTC AACTGCTGCGCTGACGGCTGATCCACTTACACTCACTAATACACACACCTTCGCTAATCA CAATCTTACCCTAGTGAAAACGTCTTTGTCCTTGACTTTCACGTCGTCATTTATGGTAGT GTCACTGTGGTCCACCCTGATTATAAAACTGAAAGGCCACTGAGCCACCGTATGATGACG TTCGGTGATGATCAGGGGCCATCAACTGATCACGATATGATGATATTCAGTGATGGTCAG AGACGCTTGATGGGCTTGTCCATGCAGGGCATGCACATGGGTTGAATTTTATCCACTCCT GCTGCCAAATTTTACTGCCAAATTCTACATGTGGTCCCCAAATAACATGTGCATGATTAC GTACACGTGACTTGTGGATGTAAAAGAGAGAGATATGATTCGTGGTTTGACTTGGTCACA ATCCCCAAAAAAATACTCTTTGGTTTTGAGCCAGACAAAACCACCTATCCACCTGCCCAA CTAACAACCACTCCAAAACACAATATTTTATTATCAAAATGCCCCTCCAAAGCTCACTTT TAAGGCTAGTCGTTCGCTGATGGGAGATTGATTAATAATTACATCATTATTAGTCAGTTT CGTTGCCAACTGACCAAAATTATTACTCATTCTTGCAGGACAAGTTGGATTAGAAGAATT GACACAAGAGGACACTCACTACTCCCAAACCGTCTCTAGCATTCTCCAAAAGCAAGCAAC ACCATGGGCCGAGTCATCATCCACTGGCCACGTCGCATACTCAACCCAATCAGCGTTTGC CAAGTGGACGAACAGATCGGATCTCCACCTCCATATGCCCGTTGAAGGCACCTCCCAGTG TCTCCTCAAGTACATCTTGTTCAGTGTACCTTTTCTACACAGCAAGTACCGCGATGAGAA CTCGCCCAAGTCACGTGACGCCACCGGTGACGCCGCCTCCAAGTTCCGCAAGGGGACCCC ACAAGACGAGCTGAGCGCCAACCACGTCCTGGCGGAGCGCCGCCGCCGCGAGAAGCTAAA CGAGAGGTTCATCATATTGAGGTCGTTAGTCCCATTCGTCACCAAAATGGACAAGGCCTC CATATTGGGTGACACCATTGAGTACGTCAAGCAGTTACGTAAAAAGATTCAGGATCTTGA GGCTCGTAACAAGCAGATGGAGGCTGATCAACGGTCGAGATTGTCCGACTCTGCTAGGAC TACTAGTAGTGGCTTGAAGGAGCAGAGAAGTGGGCTGACCGTTTTGGAGCGTGCACGGGT GGGTCCTCTACAGGGTTCTGATAAGAGGAAGATGAGGATTGTGGAGGCAAGTGGAGGTGT TGCAAAGCCTAAAACGGTGGAGTCACTGCCACCGCCAACAGCTACGGCTACAACGGTGCA GGTGTCTATCATCGAGAGTGATGCCTTGGTGGAGCTGCAATGTGGGTATAGAGAAGGGTT GTTGCTTGATGTAATGCAGATATTAAGGGAGCTTCTGATTGAGGTCACATCAGTTCAGTC TTCTTTAAATAATGGTACCTTTTCAGCTCAGCTAAGGGCCAAGGTTTGCTCAATTCAACT ACATTTTCTTATTGGTAACTACAAAAAGACACTTTCTTGTGCGATAATTTGAAGCTAACT CAGTTTTAGTTTTGTTTTGATTTTCAGGTGAAAGACAATGCAAATGGGAAAAAAGCAAGC ATTGTGGAAGTGAAGAGGGCAATACATCAAATAATACCCTAATACTGACTATTGAATATT TGGGAGAGAGATTGTGGAGATATATTTACGGAGGACTCATTGTGATAATTAATTTTAAGT AGTATGCAATTAGTACGTTCTGATCAATCATATAGCCATGGCACAAAGTGTAATCTAACA AGCTCTTGTCAGGTTTTGCATAAATATGTGTAATCTTACAGTACAGAGTGACGTATATTT TAGTCGCTCAAGGCTCAAGCATGCCCATCATATTCTAATCCAAAAACGATTTCTTAATTT GCAAGGCAAGTTTGCAGAATGTAAATAGCATATTTTACCATCCCAATTTCGAATTGGCCT TGTACCGCCAAAAGTGAAGAAATGAACTGAATAGCCTCCCCCATTATTACATTCCATCCG ATACAGTTTAGACTTAATACGTGGAGTAGGAAATCCGATTTGAACATAAGTCTATCATTT TCTGATTAAATACCACATTCACTCGAACACATTTCCTACTTCATAGTTTGAAACATATTG GCCCGAAAAGGCTGCTAGTAAAGCCCTGGGTAGTGGAGAATCTCTGTACAAGACTTCAAA ATTTGTAGCTCCAAGGTGAATCTATAACAGAGTAAATTCCCAACTTCTACTGATCAGTTT TTCTAGCTTTGAACATGAAACTGCTTGCTCAGCACATCAGAACATCAAAATTTACTAACA TAAAACTATCCAGCTCCTTTGCTTGCGAATGGAGATTGGCAACAAAATTGATACAGCGAC CATTCAATCAAGATTGATACAAGGACTGAAAATTGAACTCAAGATCATCAGTACAACATT TCATTTATACTTCCGTCATTGCTCATCTTCTCCAAGTCTTCTTGTGACAAGAGAGTTTTC CTACCACTGCTGCCAGATTTGTCATAAGGTTGAGCCATTTTTCGC