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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006892 | Chr11 | 5488192 | 5489488 | - | Transcription factor HEC1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006892.m1 | 170 | 210 | PF00010.29 | HLH | Domain | 28.1 | 1.60E-06 |
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>LITCHI006892.m1 ATGGATGTTGACATGATAAAAGCATCCCAAGAGGATCATATGGATATGATGTCAATCATA ATGCAAATGGAAAAGCTTCCTGAATTCTGTGAGCCTTTCAACACCTCAGAGTCACCGCCA GAGATTCAATTCTCCAATGCAAATACCAACAGCTCTACCAATACTCAAACACACCCCATA TATCACCCTACTCCAACCGTCAATTCTTCTCTTCCTAGCTTGTTGAATGCTCCTGCCACC ATACCATTTATAAGCCCAGCTCCTGTTCAAGAGCCCGTGACACCACCTCTCCATCATCAT CATCACACAGCAAGATTCAAGAATGCATTCACCTTACCAAACACCAACCCATATCAACCA TCTTTGGAGAAGAGAAACCCAATGGCCGCCATGCGAGAGATGATCTTTCGGATAGCGGCT ATGCAACCAATCCACATAGACCCCGAATCCATCAAGCCTCCCAAGAGAAGGAACGTGAAG ATATCCAAGGATCCGCAAAGCGTGGCTGCGAGGCATAGAAGGGAAAGAATAAGCGAGAGG ATAAGGATACTTCAACGACTTGTCCCTGGTGGAACCAAAATGGACACAGCTTCAATGCTA GATGAGGCTATACATTACGTGAAATTCTTGAAGAAACAGGTCCAGACTTTGGAACAAGCT GGTGCGCAGAGGCCAATGGGTGGTTTTGGATTTTCAGGAGCAGCAACGGCTAATGTGGGT TACCCTTCAATGGTCAAAGCTTGCCAACAGAATTCTCAAATGCTGGGGCGCAACATGCAA ATGTTGAGATGA
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>LITCHI001817.m1 MVDQRSVVGCVFILLLLFECTFEQVVPVSSFAERVTLLELRSSLGLRARDWPIKADPCSV WKGVRCDNGSVVGINISGFRRTRIGKQNPQFAVDSLVNLTHLASFNASSFFLPGLIPDWL GQRLLLQVLDLRSCSVRGQIPTSLGNLTTLTRLYLSDNNLTGAIPSSLGQLSNLSFLDLS KNSLTGTIPASFVSLKNLSSLDISSNFLNGLIPPGIGTLSRLQYFNVSNNNLASSIPSQL GNLDELVDLDLSMNSLSGSVPRDLRGLRNLQKMVIGNNSLSGNLPADFFPAPSQLQIIVL RHNNFTGPLPNAVWSMTQLRLLDISSNNFTGLLPNSSLNANVTGSELDMSGNMFYGSLTP LLRRFSFINLTGNYFQGRVPEYVHDNASLDRNCLRNVSNQRTSTDCRSFYAARGLSFDNF GQPNSTEPSAPKGSEKNNRKIIILAAALGGSLIILVVLVLLVLCCRKKGTTNQRGVGVGP VPAGSSPPPPPGISIDFSILGDSFTHQQLLLATGDFSDANLIKHGHSGDLFRGFLEGGIS VVIKRVDLQSVRKEAYLLELDVFSKISHTRLVPLLGHCLDNENEKFLVYKYMPNGDLSSS LHRKTANEDDLQSLDWITRLKIATGAAEGLSYLHHECTPPLVHRDVQASSILLDDKFEVR LGSLSEVCVQEGETHQSRITRFLRLPQSSEQGSSGTITSTCAYDVYCFGKVLLELVTGRL GISASSDTEMKETLEQTLPYISIYDKDLVTKIVDPSLIVDEDLLEEVWAMAIVARSCLNP KPSRRPLMRYILKALENPLKVVREETAGSARLRATSSRGSWNAAVFGSWRHSSSDVAAIP AGSTIKAEGTSSFKQSGTTGSQGSTHNGVGEHSSSHRRHSRDIFPEPSDVQEIERQDQD.
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>LITCHI001817.m1 ATGGTGGATCAGAGAAGTGTGGTGGGTTGTGTATTTATCTTGTTGTTGTTATTTGAGTGT ACATTTGAGCAAGTAGTGCCAGTGAGTTCATTTGCTGAGAGAGTAACTCTACTTGAACTC AGATCGTCATTGGGACTAAGAGCCAGGGATTGGCCTATAAAAGCTGACCCTTGCTCTGTG TGGAAGGGTGTAAGATGTGACAATGGTAGTGTTGTTGGAATTAACATTTCTGGCTTTAGA AGGACTAGGATTGGTAAACAGAACCCACAATTTGCTGTTGATTCGCTTGTGAACTTGACG CATTTGGCCTCTTTCAATGCCTCAAGTTTCTTCCTGCCTGGCCTGATCCCGGATTGGTTG GGGCAGCGGTTATTGTTGCAAGTGCTGGATCTTCGGTCTTGTTCTGTGAGAGGTCAAATT CCCACGAGCCTTGGAAATTTGACTACTTTAACTAGACTGTATTTGTCTGATAATAATCTT ACTGGGGCAATTCCTTCAAGTTTGGGTCAATTATCAAACCTTTCGTTTCTTGATCTTTCC AAGAATTCGCTTACTGGAACCATTCCTGCTTCATTCGTGTCGCTGAAGAACCTGTCAAGT CTTGACATTTCATCGAATTTTCTAAATGGATTGATTCCTCCTGGCATTGGGACACTTTCT AGGCTTCAGTATTTCAATGTTTCGAACAATAACTTAGCTTCTTCGATTCCTTCGCAGCTT GGGAATCTTGATGAGTTGGTTGACCTTGATCTCAGCATGAATTCTTTGTCTGGATCAGTG CCACGGGATTTGAGAGGGTTGAGGAATTTGCAGAAGATGGTGATTGGTAACAATTCTCTA AGTGGGAATTTGCCTGCCGATTTTTTTCCGGCTCCTAGTCAGTTGCAGATTATTGTTTTA AGACACAATAACTTTACTGGTCCTCTTCCTAATGCGGTGTGGTCAATGACACAATTGCGT TTGCTCGACATTTCTAGCAATAACTTTACTGGTTTGCTTCCGAATTCTAGTTTGAATGCA AATGTGACTGGTTCAGAATTGGATATGTCTGGGAACATGTTTTATGGAAGTCTCACACCA TTGCTTAGAAGATTCAGTTTTATCAATCTCACAGGAAATTATTTTCAAGGCAGGGTTCCA GAGTATGTGCATGATAATGCATCCCTTGATAGAAATTGTCTCCGAAATGTCTCTAACCAG AGGACTTCTACAGATTGTAGATCATTCTATGCAGCAAGAGGCCTGAGTTTTGATAATTTT GGACAACCAAATTCCACCGAACCTTCTGCACCAAAAGGTTCTGAGAAGAATAACCGAAAG ATAATTATATTGGCAGCAGCTTTGGGGGGAAGTCTTATTATTTTGGTGGTGCTAGTACTG CTGGTCCTATGTTGCCGTAAGAAGGGCACTACCAATCAAAGAGGGGTTGGTGTGGGACCA GTTCCTGCAGGATCCAGTCCTCCTCCACCACCTGGAATATCAATTGACTTTTCTATTCTA GGGGATTCATTTACTCATCAGCAGCTACTCCTGGCCACTGGTGATTTTAGTGATGCAAAC CTCATAAAACATGGTCACTCAGGAGATCTGTTCAGGGGTTTCTTAGAAGGTGGGATCTCT GTGGTCATCAAAAGAGTTGACTTGCAATCTGTTAGAAAGGAAGCATACCTATTGGAATTG GATGTCTTTAGTAAGATTTCTCATACAAGATTGGTTCCTCTCTTGGGACATTGCTTAGAT AATGAAAATGAGAAGTTCCTTGTTTACAAATATATGCCAAATGGAGATTTGTCAAGTTCC TTGCATCGGAAAACTGCTAATGAAGATGATTTGCAGTCATTGGATTGGATAACAAGATTG AAAATTGCAACAGGTGCTGCAGAAGGTCTATCTTATCTGCATCATGAATGTACGCCCCCA CTTGTTCACAGAGATGTTCAAGCAAGCAGTATACTTCTTGATGACAAATTTGAAGTACGG TTAGGGAGCCTGAGTGAGGTCTGTGTTCAAGAAGGTGAAACTCATCAAAGCAGGATAACG AGGTTCCTGCGGTTGCCACAGTCATCTGAACAAGGTTCTTCAGGTACAATAACATCAACA TGTGCCTACGATGTATACTGCTTTGGAAAGGTACTGCTTGAGCTGGTAACTGGTAGGTTG GGCATTAGTGCATCCAGTGATACTGAAATGAAGGAAACATTGGAACAGACGTTACCATAC ATCAGTATATATGACAAGGACCTTGTGACCAAGATTGTAGATCCATCTCTGATTGTGGAT GAGGATCTGCTAGAGGAAGTGTGGGCAATGGCCATTGTTGCCAGGTCTTGCCTCAATCCC AAGCCCTCAAGGCGACCCCTCATGAGGTACATCCTCAAGGCCTTGGAGAATCCTTTAAAG GTAGTAAGGGAAGAGACTGCAGGCTCTGCAAGGCTTAGAGCCACCTCATCAAGAGGGTCT TGGAATGCTGCTGTTTTCGGTAGTTGGCGCCACAGCTCGTCTGATGTAGCCGCCATCCCT GCAGGCTCCACTATAAAAGCAGAAGGAACTAGTAGTTTTAAACAATCAGGAACAACTGGT TCCCAGGGAAGTACACATAATGGTGTAGGTGAACATTCATCCTCACATAGACGGCATTCT AGAGATATATTCCCGGAACCATCTGACGTTCAAGAAATAGAGAGACAAGACCAGGACTAA TAGAAAAAGTTTGATTGTTATTGATTCTTTGTTAATAATACAGCAGGCTTCCCATTCGAT TGCCTGCTTGTTGGTAGTATGTCGGCCAGCAATTCTCTGGAGGTAACTTGCATTTCAAGT CATTCTTGTATTTATCTGGGGTTGTTTCAGGAGGCAAATATCTTCAATGATCAAAAATGG ATGATTTTCGAAACTTGTATGAAGATCTTGTCTCAGGGAAGAGAGGTTTCAATTTGTGAA TAAGTCTCTAGATATATTGAAATTCAGGTAAGAGAAAAGGGTGCCATGGTAGTTTTGTTG TTATTTGTTTGAAAGCTTGTTTCTTTTGGGTGAAAACAAGCTACAATTTTTTATGTGTAG TTGATGGTTGGTTGGTTGGTTGTTGTTTGTGGGTTCTATTTTGTGCCTTGTATATTTATT TCTTCATTGAAAATGAGATTCTAATGTCAATTCAAAAGAGCAGCAATAAAAGAGACATGA ACAAT
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>LITCHI001817.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTACATATAAATCTACATACAACGAATAGTAATTAAAAAATATTATTTTTATTTCTATTT TCACATTATATAAATTCACACCAATTAAAATAAAAATTTGTTAAACACATAAAAATTGAT TTCAGTATCATAGCAGTAAAATTAGTCAAATAGTCAATCTCATTAACCTCATAATAGTAT ATTTTATTTACATATTTAATAATGATTATTTTAAAAGTCATATCAATATAAACTGGTTGA TAATATAATATCCAATGTAATATACAAATTAAAATGATAATTATACTATTATACAAACGA AAATCTGTATCATTACAATAGAAATTCTTTCTAATTTTTTCATCTTCTATAATAAATAAA AATACATCAAAATTACTACCACAACTCAAATAAGAGCAGTTGAAATATATCCTCACTAAT CTTTAAAATTTAAAGATGCCCCCTAACACAAGAACAGATTACACTTTTGGTGCATTGACC ATCTTCATTTTTTCAAATTTTAAATTAAGAAAAAAATATCATTCAATATTATTTCTAAAA AAACATAAATATAATTTCTCTGAACCAAAACAATCATTTTCTTCAAAAATTAAAAAAACA GTAACCAACGAATATTTCAAGTACAACGAGAAGACCGACACCTACTACGTCTCTATAAAG GAGCAATCCGAGCCCACGTGGACCCCTAAGAAAAATTCAGAATATAAGTTCTTAGAAAAG TTCTTGGAAAGGCATCTGCTGTGTTAAATAACTTAAATGGGACAAATTTCCATTGTTTTC CAATTTCCATTCTAAATCTGTAATTTTTTTTGCTTAAGAAGAGTCAAGTGACATAAATTT ACCATTTTTTGTTTTTGGCTTCTCAAAACAATGAGAAAAAAAAAACAAAATGAAAAATCA AAAGGCCAATATTAACTACACCAACCCTCCTCATTTGGTTAAAAAAACTATCAAACAGAA ATCACTATTCAAACCCAGAAATAAATACACACAAACCAAAAAAAAAAAAAGGGACAAAAA TGACCACGCAAGACACTCAAGAGACTAGAGAGAGGGAGAGTTTTGATACGTACATTAAAA GTTGGAAAATTAAGTAGTTTATGTTCGAGCTTAGCTGGCAAAAGCGGCATAACCGGAGGT CAAACCTAACCGGCACCGGACCCTGGATCAACCCAGACCAGACCAGTCTCATTAGTGTCA GACCAAAGCAATCATCATCAAGTCACCGGTTCAGTCACTTGGCTTGGCTCTTTGTCTTTG CTTAAATTTTTACCAACTTTTTCTGCTATAAAGTTTTGATCATTTTGAACACCCATTTTT TTATTGTCAATAGAGAGAGAATTGTCAGCTCTTAAAAATCAAGTCTTTGCCTTTGCCTTC TTCTTCATTTTTTTTCCTTGATTTGTTTTTTCATTGTTTAGTACCAGAAAGGCAGCTTTG TTATTATTGATGACAGAGTGAGTCCACTTCACAGTTTTTTGACCACCATCTCTCTCTCTC TCTTTCTCTTCATTTTTTTTTAATTGATAGATCACAACACATTTTTATTTTTATTTTTTT TGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTCTCTCATTTGTCAACTGACGGATTTAGAGAGAGTAGG TAGAGGGAGAAGAGAGGAAAAGAAAAGAAGCAAAAGAAGAGTGAAAATAGATTGGTCTCC AACAGTTTTTGAGGAAGAAGAAAACCCCCAGAAATAAAAGAAAACAAAGGCTTATAGTTA CAAGGTAAGATTTTTTTTTTTTTTGTTTTAGTTTTCGTTTAAGTGAAAAGCGAAACTTGA GGGTGGTCTTTTATTGGAGGCCAAAAGGATGTGTTTTCGTCATCTGGGTATGTCTAATTC TATAAGATTACAATTGTTTCATTACATTGATAGTCAAATATAGCTGAGAGAATACATAGG TGGTTGATCAGAGGAAGAATATGAAGGATGATATTCTGAGTAGACTAGTGTTGCATGTTA AAGGGTGCGTGTAAAAAGCC
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>LITCHI003934.m4 GenomeSequence + AGTGAATTCAGATTGAACAAAAAAACATAAAACATAAAACATAAAAGCACTTGAAACCAT AAAAAGGCCAAAACTTCTGACTTGTTAAGTCAGAATCGAAGACACGCTCTCACAGCTTTT GTTTTTTTTCATTTGCAAGCTCTAGGTTCGTTCGTTCTTCAACACCCCACGGAAAAAAAA AAAGAAACAAAACCCATCTTTTTAATGATTACACACCAAAAAAAGAAAGAAAAAATGAAT TACTAAGATGATTCTTTCAAAACCCTGAGAAGAATCTGTTATCCATAAACAGATCCTGTT TTGTACGGATAAAATAGCCCAGAATATTTTTTGGTTAAAGATTGAAACTTGAAGCAATAA ATTGTGTTTGTTCATGTTGGATCTCTAAAAAGATGTTGTTTTGCTTTGTTTTTCAGGGTT ATAAAGGGAAAACACAATCTGGGTTGACAAGGAAAAGAGAAGAAATACAGGTGCATGTGT GTGCGTGTGTATGCAGTTGCATGTGTGCAGTTGGTTTTGTGTTTCTGTTGTTATGAGATG GTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTTGGTTTTGGATTCTCTTCTAGGT TTCATGGCTTTTTGATGGTGTTTGTTGTTTTGTGTTTTTATGGTTTTTGGTCTTTTGGTG GTTATTATTAGCTATGATCTTGGTTTTTTTTTTATGACAAGTTTCAAGTTTTTGATGTGA TCTTTATATATCATTTTTTTCAACCTTTGTGATCTAGTCAGGTAATATAAATCCAAATAT GAATTAGACTAATTTTCGATAGTGTTCAATTCATTGGATTTCATTGATTTTTTTTTGTTT TTATTTTTTTTCTTATTGTGTATTGATCCAAGTTCTTGAAAGAAATATTAAGAAAAAGTA 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