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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006792 | Chr11 | 4458940 | 4463638 | + | Upstream activation factor subunit spp27 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006792.m1 | 2 | 55 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 60.5 | 1.20E-16 |
LITCHI006792.m1 | 175 | 246 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 105.1 | 1.40E-30 |
LITCHI006792.m1 | 397 | 434 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 41 | 1.40E-10 |
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>LITCHI015203.m1 ATGCAAGGTGGTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGAC CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT GAAACTGGCTCCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCAT AGGTTGAGCAGTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTG GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG TCCTCCTTTGTTGTTTGA >LITCHI015203.m2 ATGCAAGGTGGTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGAC CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT GAAACTGGCTCCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCAT AGGTTGAGCAGTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTG GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGCTCAGGGGGA GAGAAGGATCTGGCAACAAATTCATCCAAGCTTTTGGATGGATCGTCTGAATTTGTCCTC ACCTATGAGGATAAAGAAGGAGATTGGATGCTTGTGGGAGATGTCCCGTGGAGGATGTTT CTCAACTCGGTAAAAAGGCTTCGAATCATGAGGACTTCTGAGGCTAATGGACTCGCTCCA AGATTCCAAGAACGAACGGAGAGACATAGAGCCAAGCCCATTTAG >LITCHI015203.m3 ATGCAAGGTGGTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGAC CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT GAAACTGGCTCCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCAT AGGTTGAGCAGTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTG GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGCTCAGGGGGA GAGAAGGATCTGGCAACAAATTCATCCAAGCTTTTGGATGGATCGTCTGAATTTGTCCTC ACCTATGAGGATAAAGAAGGAGATTGGATGCTTGTGGGAGATGTCCCGTGGAGGATGTTT CTCAACTCGGTAAAAAGGCTTCGAATCATGAGGACTTCTGAGGCTAATGGACTCGCTCCA AGATTCCAAGAACGAACGGAGAGACATAGAGCCAAGCCCATTTAG >LITCHI015203.m4 ATGCAAGGTGGTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGAC CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT GAAACTGGCTCCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCAT AGGTTGAGCAGTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTG GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG TCCTCCTTTGTTGTTTGA >LITCHI015203.m5 ATGCAAGGTGGTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGAC CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT GAAACTGGCTCCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCAT AGGTTGAGCAGTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTG GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG TCCTCCTTTGTTGTTTGA >LITCHI015203.m6 ATGCAAGGTGGTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGAC CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT GAAACTGGCTCCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCAT AGGTTGAGCAGTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTG GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG TCCTCCTTTGTTGTTTGA
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>LITCHI015203.m1 MQGGLGLLGGGGGSSNELTDPAESELELGLGLSLGGGGGGGGGGWKSKAIAWGECGRILT AKDFPCVVKVSQLNHNRSPNATAPSISVSGTKRAADSVPHETGSPPATSQVVGWPPIGAH RLSSLVNQAKASRSEDDKVVGSEKDKLKDASKKKICNGNKSSNVFNEKGHLGFVKVNMDG LPIGRKVDLNAHACYETLAQTLEDMFFKPPKTINSIGTFSSSFVV. >LITCHI015203.m2 MQGGLGLLGGGGGSSNELTDPAESELELGLGLSLGGGGGGGGGGWKSKAIAWGECGRILT AKDFPCVVKVSQLNHNRSPNATAPSISVSGTKRAADSVPHETGSPPATSQVVGWPPIGAH RLSSLVNQAKASRSEDDKVVGSEKDKLKDASKKKICNGNKSSNVFNEKGHLGFVKVNMDG LPIGRKVDLNAHACYETLAQTLEDMFFKPPKTINSIGSGGEKDLATNSSKLLDGSSEFVL TYEDKEGDWMLVGDVPWRMFLNSVKRLRIMRTSEANGLAPRFQERTERHRAKPI. >LITCHI015203.m3 MQGGLGLLGGGGGSSNELTDPAESELELGLGLSLGGGGGGGGGGWKSKAIAWGECGRILT AKDFPCVVKVSQLNHNRSPNATAPSISVSGTKRAADSVPHETGSPPATSQVVGWPPIGAH RLSSLVNQAKASRSEDDKVVGSEKDKLKDASKKKICNGNKSSNVFNEKGHLGFVKVNMDG LPIGRKVDLNAHACYETLAQTLEDMFFKPPKTINSIGSGGEKDLATNSSKLLDGSSEFVL TYEDKEGDWMLVGDVPWRMFLNSVKRLRIMRTSEANGLAPRFQERTERHRAKPI. >LITCHI015203.m4 MQGGLGLLGGGGGSSNELTDPAESELELGLGLSLGGGGGGGGGGWKSKAIAWGECGRILT AKDFPCVVKVSQLNHNRSPNATAPSISVSGTKRAADSVPHETGSPPATSQVVGWPPIGAH RLSSLVNQAKASRSEDDKVVGSEKDKLKDASKKKICNGNKSSNVFNEKGHLGFVKVNMDG LPIGRKVDLNAHACYETLAQTLEDMFFKPPKTINSIGTFSSSFVV. >LITCHI015203.m5 MQGGLGLLGGGGGSSNELTDPAESELELGLGLSLGGGGGGGGGGWKSKAIAWGECGRILT AKDFPCVVKVSQLNHNRSPNATAPSISVSGTKRAADSVPHETGSPPATSQVVGWPPIGAH RLSSLVNQAKASRSEDDKVVGSEKDKLKDASKKKICNGNKSSNVFNEKGHLGFVKVNMDG LPIGRKVDLNAHACYETLAQTLEDMFFKPPKTINSIGTFSSSFVV. >LITCHI015203.m6 MQGGLGLLGGGGGSSNELTDPAESELELGLGLSLGGGGGGGGGGWKSKAIAWGECGRILT AKDFPCVVKVSQLNHNRSPNATAPSISVSGTKRAADSVPHETGSPPATSQVVGWPPIGAH RLSSLVNQAKASRSEDDKVVGSEKDKLKDASKKKICNGNKSSNVFNEKGHLGFVKVNMDG LPIGRKVDLNAHACYETLAQTLEDMFFKPPKTINSIGTFSSSFVV.
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>LITCHI015203.m6 AAGTAAAATCTATGAGAATGTTTTTTTATTTAAATAATAATAGATCATTTAAGGGGCTTC TACAAGAAAACACAGTTGACGTGACAAATCCAACTAAGAACTTGGAGGGCAAGCCAGTTG TTTGAATCGGTAAATCAAGAACAGAAAAGAGATTCTAAAGAGACATGATGATGCCGAGAA AAATAAGAGTGAAAAGAGTGGTGCGAGACCGCGAGAGTGCTTGGCGCACTAGCAGACACA TGGGTCCCATCATCATCACTTCCTCCACCATCTCACACTCCACCCAAAAACCCCACAAAA CCTCTCCTTCTTCTTCCTTTATACTTTGAAAAAACTCTCTTACTTCCACTCTCTCTCTCT CTCTTTCTCTCTCTTTCTTTGGTTTCTTGTTTCTTGTTGTTGCTGCTGTCATGCAAGGTG GTCTTGGTCTACTTGGTGGTGGCGGGGGCTCGTCGAATGAGTTAACAGACCCAGCTGAGA GTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGTG GATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACAGCCAAGGACT TCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAATGCTACTGCTC CTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCATGAAACTGGCT CCCCTCCTGCTACCAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCTATCGGGGCTCATAGGTTGAGCA GTTTGGTTAACCAAGCAAAGGCTTCAAGATCTGAAGATGACAAGGTGGTGGGCAGTGAAA AGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAATCTAGTAATG TTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGACTTCCCATTG 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