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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006710 | Chr11 | 3716022 | 3717656 | - | Serine/threonine receptor-like kinase NFP |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006710.m1 | 355 | 484 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 73.5 | 1.90E-20 |
LITCHI006710.m1 | 362 | 483 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 86.3 | 2.20E-24 |
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>LITCHI006710.m1 ATGGCAGTTTCTTTGCATTCCTGGCTGGCTCTGTTCTTCCTTCTATTCTTTTTCTTCATT ACCCAGATCACAGCCCAATCACCATCTTTGAATGATACAGACTTCTCCTGCTCTGCAGAT TCTCGTAACTCATGCCGAACTTATGTTGCATACCTCGCCCAGTCTCCAGAATTCTTGAAC CTGGGTAACATATCTAGGTTGTTTGGGTTCAGTCGTTCATTGATTGCAAATACCAGTAAC CTGGCATCTGAGGATAGTCCATTGAGTCCAAACCAACTCCTGCTAGTACCTATAAATTGT GGTTGCACTGGAAGCCGATATTTTGCCAACATAACATATCAGATAAAGAAAGGTGATAAC TACTACTTACTTTCAATCACTTCATTCGAGAATCTCACTAACTGGCATGTAGTGGAACAA ATGAACCCCAATCTAAATGCAACTCTCTTGCAGATTGGTGTCAATGTAACCTTTCCATTG TTCTGTAAGTGCCCTTCGGAGAGGCATCTGCAGAATGGAATTCGATATCTAATTACTTAT GTATGGCAGCCTAATGATGACGTCTCACAAGTAGGTGCTAAGTTAAAAGCATCACCGTTT GATATCGAAAAGGAAAACAACTACAGGAACTTTAGAGCTGCAGTGAATCATCCAGTTTTG ATCCCAGTGTCAGAACTGCCAGCTCTCTCCCAATTCTATCCATCTTCTCTTAAAAAAAGT GGATTGAAAATTAGCTGGATTTTGATCACAGCTATAAGCATAGCAGGTGCTCTTTTGATT TTAAGTTTAACAGCTCTGATCATTTACACTCGCTGTTTATGCAAGAGAAGGAAGGTATTT AATCGCAGCGGTTCCTCTTTCGAGAGCACTGGATTGATTCCAGTTAAGGGACTCACGAGA TGTGAGACTTTTGAGACAAAAATTGTACAGGATAAGCTACTTCCAGGAGTTTCAGGCTAT CTAGGCAAGCCAATCATGTACGAGATTAAAGTGATTATGGAGGCAACCATGAACTTAAAT GAACATTACAGGATTGGAAGATCAGTATACAAGGCCATTATCAATGGGAAGGTCTTGGCT GTAAAGCAAATCAAGGAAGATGTCACAGAGGAACTAAGGATTTTACAGAAGGTAAACCAT GCCAATTTGGTGAAGTTGATGGGTGTTTCGTCAGATTCTGAAGGGAATCGCTTCTTGGTT TATGAATATGCTGAAAATGGGTCGTTGGATAAGTGGTTGTATCCCAAATCTTCGTCCTCT TCTGGCTCCACAGCCTTCCTTACTTGGAGCCAGAGGTTGCATGTAGCACTAGATGTGGCC AATGGCCTCCAATACATGCATGAACATACTCAACCGAGTATCGTTCACAGGGATATCAGA ACAAGAAATATACTTTTAGACTCCAGGTTCAAGGCTAAGATAGCAAATTTCTCATTGGCT GCGCCTGCTACAAATGATCTGATGCCAAAATTTGATGTGTTCTCTTTCGGGGTTATCCTG TTGGAGTTGCTTTCAGGAAAGAAAGCCGTGGAAGTGAAAGCAAATGGTAATACCACGCTG TGGAAGGAGATATGTGAGGTTTTGGAAATCGAAGAAAAGAGAGAGGCAGAGGCTGAAAAA TTGGATGGACCCTAA
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>LITCHI006710.m1 MAVSLHSWLALFFLLFFFFITQITAQSPSLNDTDFSCSADSRNSCRTYVAYLAQSPEFLN LGNISRLFGFSRSLIANTSNLASEDSPLSPNQLLLVPINCGCTGSRYFANITYQIKKGDN YYLLSITSFENLTNWHVVEQMNPNLNATLLQIGVNVTFPLFCKCPSERHLQNGIRYLITY VWQPNDDVSQVGAKLKASPFDIEKENNYRNFRAAVNHPVLIPVSELPALSQFYPSSLKKS GLKISWILITAISIAGALLILSLTALIIYTRCLCKRRKVFNRSGSSFESTGLIPVKGLTR CETFETKIVQDKLLPGVSGYLGKPIMYEIKVIMEATMNLNEHYRIGRSVYKAIINGKVLA VKQIKEDVTEELRILQKVNHANLVKLMGVSSDSEGNRFLVYEYAENGSLDKWLYPKSSSS SGSTAFLTWSQRLHVALDVANGLQYMHEHTQPSIVHRDIRTRNILLDSRFKAKIANFSLA APATNDLMPKFDVFSFGVILLELLSGKKAVEVKANGNTTLWKEICEVLEIEEKREAEAEK LDGP.
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>LITCHI018852.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACATCCACATTGTAGTTACTCCAAACAGGTCATGTCCCTAATTAGTAATTCAATTTAAGA AATCAATAAAAGATACGAATTTTCTTCAATGCTTTATATTACAGCTGCTTTATTGATTTC TTAAAATCATGTCATGAAAAGCGCTTACGCAAACCTGTTAGTTGAGGTCGCGACCTTTTG GACAACTCGCTATTAAACTATCTTAGCTGAGGCTTCGATCCACTGGAGTTAGCTAGTTAT AACGCTGTTAGCTGAGGCCGACCTACTGGACAGTTCACAAAAGCATGTCACTATGATAGG AGAGGTTACAACCTACTGGACAACTCGTTATTACGCTATCTTAGCTGAGGCTTCGATCCA CTAGAGATAGCTAACTAACACTGTTAGCTGAGGTCACAACCCCCTACATAGTTCGACAAA ATATTGTTATAGTAGGTGAGGTTCCGACCCCCTACATAGCTCGCAACAATGTTTTTATAT ATTATGCTGATTGAGTTCCTGAACCAAGTTATAGTCTGGAACCACAGTTCGTGATGGTCA AGCGACCTTTCAAGCTTTCATAAGGTGTTTTTACCTTTAAGCAATACATTAATTAACACA TTGATCACCTAGATTTTTTGTTTACAAGAAAAACCAGGGGAATGAAGCACAATCATGAAA GGCTTCAAAGAAAAGCACTCAGCTCTGCAGCCTCAGTAGAGTCACCACAAGGATGGGACA AAATCTGAAAAGGCACCAAGGCATGTCGGGACGTATAGCTTTTACCAGCGGACTTTAGCT CCTAATTTGAAAATCACATTGAGAGCTGGGGGGTTTATGTTATGGGTATTTTTTGGGACT ACAAAAATGGGCTGATAAAAGCCCAAAGAACCAATCCAATAACTGATCCAATTGAAGAAG TCCAGAATCTCCAACACCCAGCTTAGGGGCAAGCTCGTAGATCGCTAAGGTCATCTCAAG TCGCTGGAAGCCCAGATCCAGCTCGCCATCAAGTCCAATGGTCAGGTCACAACATCAAGG TCGCTTCATCCTTTTTCAGTTCACGACCTCAACCAAGACCGCCTCGGTACATATCCAGCT CGCGTAAATGAGTCAGATTGTCGAGATCGCGCTAGACCGAACCTCTTGGGCCCAGATTTC CCGACCTCGTGCCTACAAGATCTATACAATCCTAAATCCCAAGGGACCATTAATGCAGTA TGACTATGATAAAATTTTAGTCAATACAATAAATACTATGTCAAAGTAGTTGATCTCTTT ACGTGTACATCACTCAATTGCATTCTCCCTTTCCTCTATAAATAAGGGGAAAAATTCATT GTAAAGAGAGAGCTCATTTACTAGTGATATAGTCACTCTGTAAAAATATATTGAAAGTAT CCCATGGATGTAAGCTCTATTGCCAAACCATGTAAAAATCTCTATGTAATCTCTTGTTCT TCTTCTTTCCTCTCTTTGGTATGCTTTGTTGCTCTTTAATTACAGGTATTGGGAGTAGAA TTTCTTGGTCGATCGATTCCGAACGTCGATACCTTTAAAAATAATTTGTTAAATCTTTTC ATATTGATTCTAGGGTAATAATGAATACCACTGAGAAAAAGGTGTGAACTAGAGTAAATA AATAGATAAATAACTAGGGCTGCATGAATATTTGAAAAAAATAGTGGGATTTCATAATTA TCCGTAACTATCGGGGTACAATATAATTTCTCTGCATAATTGCGAAGATGATCGTCGTCT TCTAAAATCTCAAAACACTATTTCACATATATTTGCAGGACTGTCAGCCACTTGGTTCGT GGAAGAGGTGAGCTTGGCAAAACATGTCTCATCGAAGCCTCACTTTTTAATATCCATTTA AATTTTATCTTGGCATCCCCAATTGCTTCACTTTTTGTTTATTCCGTTATTTTGCTATAT TCATCTGTTACTTGTTGTTGCGCTAATTTCTCTTATTTGCCAATTTAATATAATTATACG CACACAAACTGTTTGACAAA
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>LITCHI018852.m1 GenomeSequence + ATGCCTCGCAGAAACTTTGTTCCTTGGATGGCTATGATTACTGGGTTTTCTCAAAATCAG AATTTTGTAGAAACTATTACAACCTTTTGCAATATGAGAATTGCCCAAGAAAGCTTGAAT CGGTTTGCATTTTCCAGTGTTATAAGGGCCTGTGCGTCTCTCGGGCTTGTTGAGTTTGGG GGGAAAATGCATTTTCATGCTTTGAAATGTGGGTTTGGTTGTGCGTTATTTGTGGGGAGT AACTTGTTGGATATGTATTCAAAGTGCGGCGAGATGGGAGATGCTTTTAAGGTTTTTGAA GAGAAGCATTGTCTTGTTGAGTTTGGGTGGCAAATGCATTTTCTTTAGTTCAAAATGCAA GAATTACTTTCAGTTTTGAAGTTGCTGTTGCCTTATTTCTTGTCACAAATGTTTGTTTGT GAATCTTTATGCCATTTCGTGAATTTCATTTCCAAGCACTTAACCAGGATGGTAGTCTGG TGATTTTTGGTAGAGTGTGTATGTAAAAATCACTAACATGATTAGAAACTATACTTTCAA GGTGGTAGTCTTGTCAATGAAATCTATGCTTGCTTACATTTTGTTGAGTATACTAGTTTA TTTGATCATTTATAGTTGTACATTTAACAGAACTAATGTTTGCTGCTTATTGATGTTTCT AGTTCCCAGTATATTAGGCTGAGAACTGAGATCTCACAGAAAAGGATGCAGAGTGGTGCC TCATCCAAAGAAGAAGACAAGTTTCGAGTCCGAAAATTGGAGATCTCAGACAAAAGCAAG GGTTTCATAGAGCTACTGCAGCAACTTAGTGTTTGTGATTCTGTGTCTGACAAACAATTT GAAGATAGATTTCAAGAACTGATCTCCTGCGGCGATGACCATATTGTTTGTGTGATTGAA GATCATCAGTCTGGGAAAATCATTGCAACTGGGAGCATATTCATCGAGAAAAAGTTTTTG AGGAATTGTGGTAAAGTTGGGCACATTGAAGATGTTGTAGTTGATGCCAGTGCTCAAGGG ATGCAATTAGGAAAAAAGGTTATCGAGTTTCTTGCTGATCATGGTGAGGCTATGGGATGT TACAAGGTAATACTTGATTGCAGTCTTGACAACAAAGGATTCTATGAAAAATGTGGGTTC AAGCAGAAAGAGATTCAAATGACCAAGTACTTTGTTTGAAAAACATTTGTATCACCATTA TTTTTGCCTCCTGTGCCATTGGGCAAATTTCATACAATGATAGACTGTTTGGGATAGTTT TCTTACTTAAAGCCTTTTCTTAAAGGAATGGTGAATCTTCCTTTTTGTGAGGTGCAAGCA AAATAGTGATCTTAGAACAAGCACTGTAAGATTTTTTTTTTTTTCCCTTACAGGCCTCGG CAACCAGTGATTCATATATTATCACTGGTTAACAGTCTTCAGTTGATCTGAAAATGGTTG TCTTATAAATATGGACCAAGATGCAATTTTGGCAATGTATATGTATAAGAGCAATGTGCT GTTAAGCATAAAGTCAATCGTGGATGTTGTGTTGCTTTAATTGGTATAACAGTTAGCACT TTCCTATTTGGATATAAGAATATGAATAACCTTTGCTTATGAAATTGTGGAAGTGCTTGC TAAGAGAATATGAATAACATTGAGCACTTTCCTATTTGGGTATAAGAATATGAATTACTT TTTGCTTGTGAAATTAGTGAAGTGCTTGCTAAGAGAATTTTATCCTCTAAGATTCTTTTG AATTTGATAATTGTCATCAGTGCATAGCAAAGTCTTTATAGAAGCCAAATCAAATTTTTA TGCCTGACCCTTTACGGTTCTGTTGCATTCCTTTGTTGCTCTCTAGTCTATTGAGAAATT ACACTGACGAGTCCTGAGAGGCTGTGACACAAGTATTGCACAACAGAAAGTTACCATTCC TGAATGACTTAAAGCTAGACCTTCCTTCTTGCATCATGGCTTAGGCAAGATGATTAAAGA GCGATA