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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006678 | Chr11 | 3362954 | 3365894 | - | Homeobox-leucine zipper protein ATHB-21 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006678.m1 | 58 | 112 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 59 | 3.30E-16 |
LITCHI006678.m2 | 3 | 41 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 46.1 | 3.60E-12 |
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>LITCHI006678.m1 ATGACAACACCGATCATCACTCAAAATAGCGAAGATAATATAGTTCTTCTCTCCAAGTTT TACCCACCAGCAGTAGTTTTATCCCAAACTATGCAACAACAAGGGGAGGCAAAGCCACGA AGGAGGCGACGAAGAAACGGAAAAGGAGGAGAAAACCGATTGCTTGGTGCAAAGAAGAGA AAGCTAACAACTGAGCAGGTGACTCTTCTAGAAATGAATTTTGGAAATGAACATAAGTTG GAGACTGAGAGAAAGGACAAGCTCGCTTCAGAGCTTGGTCTCCACCCTCGACAAGTCGCC ATTTGGTTTCAAAACAGGCGAGCCAGGTACAAGAACAAGCAGCTGGAAGAGGAGTACATG ACCCTGAAGAAAAGTCATGACAGTGTGCTGCTTCAAAAATGTGCTCTCGAGTCTGAGGTG TTGAGGCTGAGAGAAAAACTAAAGGAGGCAGAGAGTGAGATACAGCAAATGATCCAGCAA CAACTAGCGGAGACAGACAAGGAGATCAAGAAGTTGACAGAGGGCTGCGGAGAAAATTCC CACAACAGTCCCAGTTCACAGTTCACCATTGAAACGGAGGACACTGCTGCTCATATTGAT GATTATAATCATGATCATCATGACGTCAAGGACACTCTGTTTCTCGATGAGTACTTGCCA GAACCACCCCTCATCGCCATACAGGAGCCAAACCCATCATTCGTGGTCGATGAACAACCT CTTCAAGATGGCAGTGTTGTGACAGACGATCGTGGTGGCGATGGCATCATGTATTGGACT GGCCATTATAGGGGTTACATGATGGGTTATGGTTCCCTTTGGGACGACGAGTACATCTAT CCTGTGTAA >LITCHI006678.m2 ATGAATTTTGGAAATGAACATAAGTTGGAGACTGAGAGAAAGGACAAGCTCGCTTCAGAG CTTGGTCTCCACCCTCGACAAGTCGCCATTTGGTTTCAAAACAGGCGAGCCAGGTACAAG AACAAGCAGCTGGAAGAGGAGTACATGACCCTGAAGAAAAGTCATGACAGTGTGCTGCTT CAAAAATGTGCTCTCGAGTCTGAGGTGTTGAGGCTGAGAGAAAAACTAAAGGAGGCAGAG AGTGAGATACAGCAAATGATCCAGCAACAACTAGCGGAGACAGACAAGGAGATCAAGAAG TTGACAGAGGGCTGCGGAGAAAATTCCCACAACAGTCCCAGTTCACAGTTCACCATTGAA ACGGAGGACACTGCTGCTCATATTGATGATTATAATCATGATCATCATGACGTCAAGGAC ACTCTGTTTCTCGATGAGTACTTGCCAGAACCACCCCTCATCGCCATACAGGAGCCAAAC CCATCATTCGTGGTCGATGAACAACCTCTTCAAGATGGCAGTGTTGTGACAGACGATCGT GGTGGCGATGGCATCATGTATTGGACTGGCCATTATAGGGGTTACATGATGGGTTATGGT TCCCTTTGGGACGACGAGTACATCTATCCTGTGTAA
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>LITCHI006678.m2 - Up_Stream_Len 2000 GATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGACTTACTAGCATCAAGTCAGATTAATAACGAGATGA GTAATAATATAATTCTAAAGTATAGTCCAGATCTCTGCTTTCAAAAGGTGAGAGAGAGTT ATTCACATAAAAACGAGAAAAATTATACACACATTACTAGGACTTTACTATTTGAACATT TCCCTTCACTCGCATGTAAAGAAACAAAGATAGATAGAAGCCACTCCCACTTGTGAGTAT ATTTGAGGAATTTCTATGCTTTCATTTTGAAACATATTATTAAATTAGACTCTGATTTAA AAATGATAAATGAATCTTTATAAAACAATATCAAACGATTCAAACTAACCCCGGATTTGC ATGATAACGTGGCTGTTAGCATTAACATGAGCAATGAAAATGACGTCAACAGTGACGACA TCTCTGTTCTATGATTCTATCCACAAATCGCACTAATTAATATACAAATCTATTTACAAT TAAATAAAGCCTAATTAAGCAAGTGATTTGGCCCCTTGTACGACCTCTTACTAAATAAAC AGAGACTTGTGGAAACAAAATTTTTCATTTTCGCCTTCTCGAGCCACGTATTGACGAGCA AAAAAGCATTGTATTTAAATTTAAAAACTATATTAGAGGTTAAACCAAGCTGATTATAGA GGTCGGCTTCGGCTAGCTCGAAGGAGACATTGAAAGTGGAGAATACCACCTAATTGGACA ACAAAAGTGACTTAATGTCCAAATCCAGAGGCCAACCCTACTAGATTGTTTATTAACTTC GAGGTGGTCAGGATTGGGATCCCAAACACATTAATATATTTAATTACCAAATTGTTAAAT TTCGTATTTGTCCATAGTTTACATCCACAATGGCCCTCTTCTCCTTTCATATTTACTTAA TTGGGAAAGCCTAATTACACCTACCCTACAACTCTAGTGTGAAATTGTAGATCAGCAAAC TCTAATGTGAACTTTGTGGATAAGCAAAATGAGATTCATGTGAATGGTAAAAGTTGGATA AGAAAAAGAAATTAGGTATATATGTCTAATTTTATTTAATTCTATAGTTTATTTGAATGG ATAATGGTAAACATATGTTTTTGAAATACACATTAAAATATCAAATTCATTCTAATCATG TTAACAATTTATGAAAATAAGTATAAGATCTTACATAAATTCCATTTGAGTTTTCACTAA TCTACTAAGATGTTAGTATTGTTAATTATGGATCATAGAATATTCCTTTTCTACTTCTTT TATTATTATTATTATTTTATTAACTATCAATCACATGATCATATGCTTTCAAGCGAGAAA CTTAGATCAACAAAGATACCATGAACGGTTGACATTTATATATCAAGATTCCATAAAATG TGCCACATTGACATGGTCATTTCTTGGGTTTAATCAAAAGCTTAAAGAACCATTTGATTG GAAAACTTTTTGTCATGCACCATGATTGCCATTCATCATGATGGCATAGTGGAAATTTAC CTAACAATCAAGACCACTTCACAACCCAATTTTCACAAGTCATAGCACACCTCCACCACC CTATAAATTAAGGAGTCACCCCTCACAAAGAACCCACTTCATCAGCAAGAAAAAAATTTA TTATATAGAGATAGTGAGAGGAAAAAAACACAAGAGGGAAACAATGACAACACCGATCAT CACTCAAAATAGCGAAGATAATATAGTTCTTCTCTCCAAGTTTTACCCACCAGCAGTAGT TTTATCCCAAACTATGCAACAACAAGGTTAGTTTAGCTTACACAGCCAAAAACACAAACA CTTGTCACAATTCTAAGCTTGCTTGTACGTTATTGGTTGTGTTAAAAAAACTTTTATTCA ACTTTTTTCTACTTTTTGATGTCTATTCAGGGGAGGCAAAGCCACGAAGGAGGCGACGAA GAAACGGAAAAGGAGGAGAAAACCGATTGCTTGGTGCAAAGAAGAGAAAGCTAACAACTG AGCAGGTGACTCTTCTAGAA >LITCHI006678.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATGATCCTCTGTGTATATATATACATAAGGAGTTTTGAAAACTATGTTATATGAACAATG ATAAGAATTGGAAGGAGATATTTATTTTATTTTATCCCTTCCTGTTTCTGGTGACACTTC TCTTCTTAAAAGTTAAAACTGCAACAAATTCTATTAAAAGAAAACAATACTTTGATCTAC ATATTAATGATGTTTTTCATTTTAATATTAATTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAA AAAAGATACGTTTGATATTGTATTAGAAATATAAGATTGGAAATGAATCAATATCTTACT CTATATTTTCAAAAATCTCGTAGGTTTTGACATTGAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGT GACTTACTAGCATCAAGTCAGATTAATAACGAGATGAGTAATAATATAATTCTAAAGTAT AGTCCAGATCTCTGCTTTCAAAAGGTGAGAGAGAGTTATTCACATAAAAACGAGAAAAAT TATACACACATTACTAGGACTTTACTATTTGAACATTTCCCTTCACTCGCATGTAAAGAA ACAAAGATAGATAGAAGCCACTCCCACTTGTGAGTATATTTGAGGAATTTCTATGCTTTC ATTTTGAAACATATTATTAAATTAGACTCTGATTTAAAAATGATAAATGAATCTTTATAA AACAATATCAAACGATTCAAACTAACCCCGGATTTGCATGATAACGTGGCTGTTAGCATT AACATGAGCAATGAAAATGACGTCAACAGTGACGACATCTCTGTTCTATGATTCTATCCA CAAATCGCACTAATTAATATACAAATCTATTTACAATTAAATAAAGCCTAATTAAGCAAG TGATTTGGCCCCTTGTACGACCTCTTACTAAATAAACAGAGACTTGTGGAAACAAAATTT TTCATTTTCGCCTTCTCGAGCCACGTATTGACGAGCAAAAAAGCATTGTATTTAAATTTA AAAACTATATTAGAGGTTAAACCAAGCTGATTATAGAGGTCGGCTTCGGCTAGCTCGAAG GAGACATTGAAAGTGGAGAATACCACCTAATTGGACAACAAAAGTGACTTAATGTCCAAA TCCAGAGGCCAACCCTACTAGATTGTTTATTAACTTCGAGGTGGTCAGGATTGGGATCCC AAACACATTAATATATTTAATTACCAAATTGTTAAATTTCGTATTTGTCCATAGTTTACA TCCACAATGGCCCTCTTCTCCTTTCATATTTACTTAATTGGGAAAGCCTAATTACACCTA CCCTACAACTCTAGTGTGAAATTGTAGATCAGCAAACTCTAATGTGAACTTTGTGGATAA GCAAAATGAGATTCATGTGAATGGTAAAAGTTGGATAAGAAAAAGAAATTAGGTATATAT GTCTAATTTTATTTAATTCTATAGTTTATTTGAATGGATAATGGTAAACATATGTTTTTG AAATACACATTAAAATATCAAATTCATTCTAATCATGTTAACAATTTATGAAAATAAGTA TAAGATCTTACATAAATTCCATTTGAGTTTTCACTAATCTACTAAGATGTTAGTATTGTT AATTATGGATCATAGAATATTCCTTTTCTACTTCTTTTATTATTATTATTATTTTATTAA CTATCAATCACATGATCATATGCTTTCAAGCGAGAAACTTAGATCAACAAAGATACCATG AACGGTTGACATTTATATATCAAGATTCCATAAAATGTGCCACATTGACATGGTCATTTC TTGGGTTTAATCAAAAGCTTAAAGAACCATTTGATTGGAAAACTTTTTGTCATGCACCAT GATTGCCATTCATCATGATGGCATAGTGGAAATTTACCTAACAATCAAGACCACTTCACA ACCCAATTTTCACAAGTCATAGCACACCTCCACCACCCTATAAATTAAGGAGTCACCCCT CACAAAGAACCCACTTCATCAGCAAGAAAAAAATTTATTATATAGAGATAGTGAGAGGAA AAAAACACAAGAGGGAAACA
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>LITCHI006678.m2 GenomeSequence - TTATTATTTTATTAACTATCAATCACATGATCATATGCTTTCAAGCGAGAAACTTAGATC AACAAAGATACCATGAACGGTTGACATTTATATATCAAGATTCCATAAAATGTGCCACAT TGACATGGTCATTTCTTGGGTTTAATCAAAAGCTTAAAGAACCATTTGATTGGAAAACTT TTTGTCATGCACCATGATTGCCATTCATCATGATGGCATAGTGGAAATTTACCTAACAAT CAAGACCACTTCACAACCCAATTTTCACAAGTCATAGCACACCTCCACCACCCTATAAAT TAAGGAGTCACCCCTCACAAAGAACCCACTTCATCAGCAAGAAAAAAATTTATTATATAG AGATAGTGAGAGGAAAAAAACACAAGAGGGAAACAATGACAACACCGATCATCACTCAAA ATAGCGAAGATAATATAGTTCTTCTCTCCAAGTTTTACCCACCAGCAGTAGTTTTATCCC AAACTATGCAACAACAAGGTTAGTTTAGCTTACACAGCCAAAAACACAAACACTTGTCAC AATTCTAAGCTTGCTTGTACGTTATTGGTTGTGTTAAAAAAACTTTTATTCAACTTTTTT CTACTTTTTGATGTCTATTCAGGGGAGGCAAAGCCACGAAGGAGGCGACGAAGAAACGGA AAAGGAGGAGAAAACCGATTGCTTGGTGCAAAGAAGAGAAAGCTAACAACTGAGCAGGTG ACTCTTCTAGAAATGAATTTTGGAAATGAACATAAGTTGGAGACTGAGAGAAAGGACAAG CTCGCTTCAGAGCTTGGTCTCCACCCTCGACAAGTCGCCATTTGGTTTCAAAACAGGCGA GCCAGGTACAAGAACAAGCAGCTGGAAGAGGAGTACATGACCCTGAAGAAAAGTCATGAC AGTGTGCTGCTTCAAAAATGTGCTCTCGAGTCTGAGGTACATATATGTTACTATTATCTC ACTTTAGTCATTCTACATGTGCTAGAGATTTGCTGTTATTTTCCTTCGGTTTCTTTGTAA CCAAACAGAAACGGGAAGGGTGCCGTCTCACATTTGGGTTGATCAAATTTTTTTGAATAT TTTTATATAAAAAACGCATTTCATGACTTTCTTGCTCAACATGCAAAGCTAGTATTTTAT TTGTGAAAGATAGGTGGCTAGTACTTCCATGGCTCCGTAATTTAAGACTACAAATTCTGA TCACGACTAAAATAAAGAGAATCAAAACTGTGGCAAGGCTCCCTCGAGTGTTATCAACGT GTAATCTACTATATTTAAATGTGCATGAGCTCTGGGCTCGAAGAAAGCCATGCCATGTTG TTGGTTGATTTTATGACTATAATATTGACAAGAATGTGGAAAAAAAAGAGAAAAAATATT GACAAGGGAACAAAATTCTGCCACCTCATTTGACAGCAAAATTTTAAAAGCCAACCCCCA TCACACATTGTCATTCACATGTTCCTCAGTTTCAATCCATAAAGTGTTTTTGTTGTTGGG CCTGGAACAAGGCCCACTTTAGGGAGCAACACGTGTGAGACGTAGTTTTACACCCCCACG CGTGCGAGACTAGACTTCAACAATATTGTTGTTTGGGTTTCAGGTGTTGAGGCTGAGAGA AAAACTAAAGGAGGCAGAGAGTGAGATACAGCAAATGATCCAGCAACAACTAGCGGAGAC AGACAAGGAGATCAAGAAGTTGACAGAGGGCTGCGGAGAAAATTCCCACAACAGTCCCAG TTCACAGTTCACCATTGAAACGGAGGACACTGCTGCTCATATTGATGATTATAATCATGA TCATCATGACGTCAAGGACACTCTGTTTCTCGATGAGTACTTGCCAGAACCACCCCTCAT CGCCATACAGGAGCCAAACCCATCATTCGTGGTCGATGAACAACCTCTTCAAGATGGCAG TGTTGTGACAGACGATCGTGGTGGCGATGGCATCATGTATTGGACTGGCCATTATAGGGG TTACATGATGGGTTATGGTTCCCTTTGGGACGACGAGTACATCTATCCTGTGTAAACTGA ACCGTCCTCGCGTTCTCGTCATGTCTATAGCTAGCGTACGTATGTTGTAGTGTGTCTAGA CTCTAGTGTATGTGTGTTATTGTCGTAGAGAGGTTGGTGTCGCACAACTAGTGGAAATTG TACTGGTTAACTGTAAGTAGCTCGCTATCGATTTTCACGTATGTATAACTAATGCTAATC GTTTCGTTAATATAAAGTACTATTAATGACCGATGAGTACAAGTTGGAACTAGTTTTTCC TCTTTAAATCACGTTATCTCTTTTTTTTATATATAATTTTTAATGTAGCAATTTAAACTT TAGTCATTATGAAACGAATGAGTTTCTAAACTTCATGTTTGATGTAATTAGCTCGAAATA ATTGTAAAATGAATGAGGGCGGATGCGTAACTTGGATACACAATTCTTTGTATGTAGGGG GTGGAAGGACTTGTACTTTACAGCCTGAATTTATTTGATAATGATAGAATCGACTTGTAG CTAGTGGTGTACATGACACCTTAGCACAATAAAGCAAACAAGATAAGCATGAGTTGACGA TAAAAATTTTGAAGAGATGATCTTACTAAATTGAACTCAATAATACAAGATAAAAAGCAT TTACTTTGGGAAATGTTTTCGCTGTACACTTCATCTAACATAAACGAGAGGTCAGAAAGA GGAGATGGTTGGGATGCTTGGATTTAACATGAAAATGTAGGCTAGTGGGATTTACTTGTG TCTTCATCGACCCCTCTTTATTTGTTCTTAAGAGTAAAAATTAGTTTTAATTATTTGACA GACCCCTCTTTTACTACTAATGGTCATGTAGGCTGGAGTTCTTCAGAGTTAAGACATCTC AGTGTACCCAGTACCCATTTACAGTTGGTACTTACAACTAATTATTAATTTTACGATAAA A >LITCHI006678.m1 GenomeSequence - 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