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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006672Chr1133274033329952+Scarecrow-like protein 15

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006672.m1252622PF03514.17GRASFamily277.81.30E-82
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>LITCHI006672.m1
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TTCTCTCCCCACCACGCTTTCAAGCAATCAACAACCAAAGAGAGAGCTCTATTGGCTACT
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CGTAGCATGGACTGGGATTCCATCATGAGGGAGCTGGGCTTGGATGACGATTCTGCCCTC
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GCGCCGTGGAGGGAGGTGTTTTCTGGGGCTGGGCTGAGGCCGGTGAAGCTGAGTCAGTTT
GCGGATTTCCAGGCGGAGTTTTTGCTTGGGAAGGTGCAGGTGGGCGGGTTCCAGGTCGAC
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TGGAGGTGTTAG
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>LITCHI017015.m1
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>LITCHI017015.m2
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>LITCHI025204.m1
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TTGGCTGATGATTGTTCTCTTTCAATGGCAAGCAATAATGGCTATTATATGGGAGAGGTT
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TGAGTTTCTATTAATTATAAATAGACACTTCCCTAATTTGATAAATTTAATGAAATTTCT
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GGTTATTGTATAATAAGACTTATGTGTGTCCATCATTGAAAAGATGATAATCACTTGTAT
ATGTTTGATGGCGAGTGAACATGATGTATGAATCCATAATCGATATTGCTAAAACTTTTA
GTTATTTATGAGAGCCAACTCCCACCTACTACGTGCCCAATGTTGCTAGAAATTAATTAT
GTGCCACTGAATCAATGTAGCAAATGTTTTCTAAGCAATATTTTATTTTTCTTAAAATAT
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TCGGCTCCATATGGGGCCCACTACTCTTCAAATTATGTTG
>LITCHI025204.m2
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TGTTTGAACTACCATGCACACACACACACCCATAGTACACGAAACCAAGTAAATCATCAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGGGAGGAGATGGTGTATCATTCTTTCTTAAGAAGC
CCCAAGAAGGAAGAACAACAGGTACCGGACACCTTTAATGAAGCCGAATTCGTCCACATC
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GAGGGAATTTGGGGTTTCAATGAAAATGAAGAGGGCAAGGTCCAAGGTCACCATCAACTT
GGTTGGGAATTCATGGATTGGGAGGGGTTTCCCATTAATGGAGAAGAAGGGGAGGAGGAG
GAGGAGGAGGAAGAAAGAAACGTTAATTTTTTTGGAGAAGAAAGAGATTATGGTAAGGTT
GATATTGTAAAGAAGGAAAGTATTGGTTTTTGGGATGATGATGATGAGAAGTCCAAGTGT
TTGAAATTGAATCTGAATTATCAAAAGGTTTTGGATGCATGGTCTGATCGTGGGCCTCTT
TTGGCTGATGATTGTTCTCTTTCAATGGCAAGCAATAATGGCTATTATATGGGAGAGGTT
CCTGTGATGGAAGAAGAGAGAACAAGAAGAGAAGCAAGTGTTCTTAGGTACAAGGAGAAA
CGTCAAACTAGGCTCTTCTCCAAAAAGATAAGGTATCAAGTTCGCAAACTCAATGCAGAT
AAACGACCCAGACTCAAGGTGTGTCCTCTCTTTCTTCTTCCCATTAGAATCTAGATGAGT
CAATGATATTTTTGTACCAAACATTAAATAGATGTAAAATATGCTAACTTCGGTTGCAGG
GTCGATTTGTGAAGAGGGTTTCCTGATGTGAAGACACTGAATCGGATGATGAGCTTAGAA
ATATCATAAACAAAATATCTTTCTCGCTCTCTCTCTCATTGGACCCTTTCTTTTCCTGTA
CATGCGTTTGTCTGTCCATGAAAAATATCTCTCCAACTCTCCCAAAAACATAAAAATATC
TATTGAAACATTTATTCAAACTTTTTATGTGCTGGTTGATGGGACCTGTACATTGACCTT
ACTGTACATATCCCAGCCAGCATGGTCTTTTTTTGCCATCTTCTATAAAACTTTCTTACG
GTTTCCTGTACATTGATCGAAAAGGTCAAATGTCAGAACGTTATAGCTTTGTATGCATGA
TTTATAGTGGGATCCAGTCTCTCATAAAGTGGTCCATTATTTATTTTCTTTCTTTTTTCT
TTGTGGGTTGTTTCTGTCTTTGTATTTTTTTCCCCTTTTTTCCTGGTGTCATTTTCCAAT
TAATTATTTGGCCAAAAATTTGAAATTTCTATCTCTTCTCCTGAGTTTCTATTAATTATA
AATAGACACTTCCCTAATTTGATAAATTTAATGAAATTTCTAAGGGAATCTCCAAATTTA
ATTAATGAATTTTTTTGTCTATAATGTCAAATTTTAAGGTAGGTTATTGTATAATAAGAC
TTATGTGTGTCCATCATTGAAAAGATGATAATCACTTGTATATGTTTGATGGCGAGTGAA
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GCAAATGTTTTCTAAGCAATATTTTATTTTTCTTAAAATATACCGTGTTCGATTATAGTT
TTTGTCACTAGAAGAAAATTTGAAAGGAATTATCATATGTGGAATAAACATTTTCATTTT
GTGGGTTTGATGAAAGTGATTGGATATTTGCACTTAACCCTTCGGCTCCATATGGGGCCC
ACTACTCTTCAAATTATGTTG
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>LITCHI019021.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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CTTCCTTCTCTCAAGTCTTACTACTTTGCATTATTTGTTGAAAAGACTTTTTTTTTATTC
TTGTCTATTTTTTGTTTCCACTTCGAAAATATATAATTGATATATCTTCCTCGACCTCCA
ATACCGTCGTCATGTCTAGAAACGAAGGAGAGAGGAAAATGACAGCAACAAAACTCAATG
TTGAGTTTCGGGTTTCATGGGTCCCACTGGAATCCCAATGGTTTTCAGTGATGGAAACTC
GTTGGTTTTCAGTTTTCCAACCATCAATAATAATGATAATTTCCAGTTTTTGAGCCTTTT
TTGTGATGATTTTCAGTTATTTTTGTTCCTTTTTGTTGATTGATGATGATGATTTTGACT
TGATGATTGATTATGATGATTTTACTGGATTGATGATAGCGAAAATTGTTAGATGGCAGA
GATCCATCCATTTTTTTTTATAAAAATATATATTTTTGAAAAGTAAAATATAATTAATTT
TTATTTTTAAATCAATCTCTACCATCACTATGAGATGAATGGTAAAGATCTAAATTGATT
ATTTTTCTTTAAATTTTTTATTTTCTATTTTTATATTTTAATATTATTTAATACTAAAGG
CAAAATTGATATTTTGATGACACACTGATATTTTCATTAGAAATTTGATGGTGGGGGGAT
TTTGAGTGAAAAATGAAGCTAGAGTGGGAAAAAGATGATTTTTTCAACCCACGAAAGGTT
TTTAGAAAATTGTCCTAAAAGAAACGGTGAGAGAAAGAAGAAAAAGAAATGAAAGAAAGA
AAAAAGAGTAATGTAAGAGAGCTTTCCATGTCATTGATAGCTTTTCTATCTATGCATATA
TATATATATATATATATATATAGAATGATTTCATCATCACTGTCTCTTTTTAAGTTATGA
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AAATGTAATAAATGAATTTGATTGGTTCGTCCTGACTTTTTAAAATTATGAGATACCAAT
GGTAAAATCAGTATATATATATATATATATATATATATTACAATGATCTCTGTGTATATT
TTGGTGCTAATAAAATTACGTGTTAATAAATTTTAAAAAGTATAAAGTAAGACTCACCGA
AGATAAACCAAGCGGTCTCATCTGTTACCATTTTCACTTGTCCATCAGATCAACAAAAGC
AACTTCCACATCGCACCAGGCAGTAGGCACCACTCATCCGTTGACGGAGCACGGCAAGCC
CAATAACACAAGTAGGGCCCTGGGCTCTATTGAGAATTTGAGCTCCTCTAGTATGCCGCC
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AACATTGTAATTTACAACATAACATCGTCAAACAGAATTATAACGAATGCATGGTCTCTT
CGGAGACATCCGATAATGAATGCATGTGATGACGTGTACAACCTTTTATTATTTTATTTA
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AAACCATAAACATAAACAACATCCGTTCCAATTATCAAAAAAATAAATTTTATTTTATTT
TATTTTTTAAAAATCGAAGTGAACCCAGAAAATGTCGCTATCTCCTCCTCCTGAACCAAC
CTGGAGTTGGACATGGCGTCATCTCCAATTTTGAAGAATCATTTCTATTTCATCACCATC
TCCTCCTTCACTAACACTCTTTGCCCACTTCCTTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTATTTGA
ATCCAACCACATTCTTTTCTTTACTTTCTTTGATCATTATTATCATTTTGTTGTTGTTGA
TGTTTCAATGATGGAATTCAAAAGAGATAGATATATCCAAATTATTAAATAAAGGGAAGG
TAGAGAGAGAGAGAGATTTG
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>LITCHI019021.m1 GenomeSequence - 
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ATTTTATTTTATTTTTTAAAAATCGAAGTGAACCCAGAAAATGTCGCTATCTCCTCCTCC
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ATCACCATCTCCTCCTTCACTAACACTCTTTGCCCACTTCCTTCCACTTCCTCTCCTCTC
TCTATTTGAATCCAACCACATTCTTTTCTTTACTTTCTTTGATCATTATTATCATTTTGT
TGTTGTTGATGTTTCAATGATGGAATTCAAAAGAGATAGATATATCCAAATTATTAAATA
AAGGGAAGGTAGAGAGAGAGAGAGATTTGATGGGAAACACATGTGTAGGACCCAATCTCA
ACGGTAATGGATTCCTCCAATCTGTTACGGCGGCTGTTTGGCGGACACGTCCTCCAGAGG
ACCGCCTTCCTCCTCCATCCAAGAACAAAAACGACGCCTCCTCCACAAAACCCGATCCAC
CACCTCCATCATCCGATTCCATTTCCATTCAGAGCACGCCTCCTCCACCGGTCAAAATCA
ACAACGTTAACGACACCCCTCCTCCGAAGCCGCCGCCGCCAGAGCCACAACCGGCCGCGG
AGGATCCGGACAAGTCGAAGAAACCGACTCACGTAAAGAGAGTGTCTAGTGTGGGGATGC
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TCGATTTTGGCCTCTCTGTTTTCTTCAAGCCAGGTCCATTTCTTACCTTTTATTGTAAGC
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GTCATGTCTATTAGAGCATCTACAACCGTGCTAGCTATCGATTGTCCTGAGCTAAAATAT
ATAGCTAGTGAACTTCACGGTAAACTAGAGCAGGTCTAGAAACTTTTTGAGTGATTGTTG
GAAGTTATGTGAGGCAGACTTGATATATATGTTCCATGTCGCATAATCATCTAATGGCGT
TGAAACTTTTGATCTGTATATAAGAATACAATTATCTTCAGTTATTATTTCACCTGGCTA
TATAAATTAATTAATTCATTGAGTTGGTCTTGTATCTAAGTGAGAAGTAGTATATCATTC
CTGCAGGTGAAACATTTGCTGATGTAGTTGGGAGCCCTTATTATGTGGCCCCAGAAGTGT
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ATTTGCTCGATCAGAAACGGAGCAAGGAATATTTGAGCAAGTTTTGAAAGGTGAACTTGA
CTTCGTATCAGAACCATGGCCTAGCATATCTGAAAATGCAAAAGATCTAGTTCGGAAAAT
GCTAGTACGGGATCCCAAGAAGCGGTTGACAGCCCATGACGTTCTTCGTGAGTCTTCATG
TTCTGATCGTATTATGTAATGAAATAAATTATCAGTTATGGTATTATTATATATATTGAA
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TAACGTTGCATAAGTGCCCCATACAGGCTTAATTTTTTGTTTCCAAGGACAAAATTTGAT
GACTCTAATGTGTCAGCCTGTATATTAACCTTATAATTTCATCATCAATAATAGAAAGAT
TTCTTTATTGTAAGGATTAACATTTTAGTTGGGAATTTTAATTGCTGAATGTAGGTCGTT
TTATTAAACCGTATTAAGTTATGAACTCAGGTTTGTTTTCTGTATTTCTTCTACCTATAA
CGTAGCAATGAATTGACGGTGTTTTCATCATTGCGCAGGCCACCCTTGGGTTCAGGATGG
TGCCGCCCCTGATAAACCACTTGATTCTGCTGTTCTAAGTCGCTTGAAGCAATTTTCTGC
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AATTATTAGTTGTGGAAATCAATTGAATTGCTTCTTAAAAGAATTCTTTCCCCTTTTTTC
AAATCTTTATTCATGTATATATTAATTAGGCTAAAACACTTAAGCTATAGGTTAAAGATG
CAAAATGTAGTGTATGAAGCTCTCTATTCATTCCTTCAAGTTGATCTTGTCACACGGACC
AAACTCACATTGCGATTATAAATAAATGCAGAACAAATTCATATAACAAATACACATAAT
TATACGAGGGAACCCAAATCTAGGATTTCCTATTAAAACTAGTCTTAGTACTATGTTAAG
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AAAAAATGGTTGCTTAATATATGGCTCTTTAAAATGATGCCTCTTTATAGAGTTCTCATG
ATCAGTGTTTGACATTTTATTCGTTCAGTTTCTTTGAGATATGACTTTTCGAATTTGGCG
TTAAATAATAGACTTGTATATTCTTGCAGGTTATTGCAGAGAGCTTGTCTGAAGATGAAA
TCGCAGGAATGAAAGAAATGTTCAAGATGATAGATGCAGATGGTAGTGGACAAATCACTC
TTGAGGAACTAAAGAAAGGTTTGGAAAGAGTGGGTGCTAATCTCAAGGATTCCGAAATTA
ATGGATTAATGCAAGCAGTAAGTGTCTAAAATCCAGGTCTTTGTGCAAGCACCTAGTGTA
TGATCTATATAAATAGAGGTTTGGTTACTTTATTGGTTGAGTAACTGTATCCATAAATTA
TATTAATTTGATTGGTTGTAATGATAATTATTAAAGTCAATCTAATTATTGTAATTGTTG
AATAAGGTTACTCAACCTGTAAGATAGTCAAATCTTATAATCAGTTATAATCAATTATCC
CTGTGTTAAAGGAAGTTGATAGAATTTCCTTGCTCAGTAAATTGACTTCCCATCACTAAA
ATGACTCAAGTTAGCCTAAATGAATAGTTTGGTGAATCTTTAAGTGGTTGAAATACTCAT
ACACATGAATATAGAATTCTATACAGTCTATGTCACTTCTAGCATATTTACAGTTTTTTA
CAAAGAAAATTTTAACAATGAGATATTCATGGTAGAAGAAACAATTAGGCTTGTATGAAG
AATTATAAAAGTTGTAGCTATTATTGAGTTGTAGGTATTCAGATGTGGAAAGTGTTACCT
AGGTATAAGGAGGCATATTATTGATTTCATCTTGTGTCTCTTATTATAATCTTTATTTTG
AAAATTTCAGGCGGATGTTGACAACAGTGGTACAATAGACTATGGTGAATTCATTGCAGC
CATGCTTCATATTAACAAGATCCAGCAGGAGGATCACTTGTTTGCTGCCTTCTCATACTT
TGACAAAGACGGAAGTGGTTACATCACTCAAGATGAGCTCCAACAGGCCTGTCTTCAGTT
CGGCTTTGACGATACTCATTTAGAAGAGCTAATTCGTGAAGTTGACCAGGATAATGTAAA
CGACTTAACCTTCCAATTTGCTTTGCTTTTTCTATTTCTAGTCTAAACTGTTCTCATGAC
CATTTATTTTTTCAGGACGGGCGCATTGATTATAGTGAGTTTGTGGATATGATGCAAGAC
ACGGGTTTTGGTAAGGCATTCAAACTATGATGCAAAACACAGGTTTAATTGGGCATAAAT
GGTATTAAAAGTGAGATCTAGTATCGAATCCAGGGAGGCTTCAACTATCAACAGAAATGT
CAAAGCCGAAAATCCACAGTACGTTGGTGGGTTATCTTGTATATGTACTTAACAAGTTTG
CCTCTGCCCTCCGGAACACAACAGTGTTTCAATTGCATAGTGTTGTAAAGATCAGCCAGG
CTACAGAGAAGGGCTAGATTGTCCTCTTCATTTTTCTAGTGTTCTCTTGTATTTACCTTT
TCAATTTTCTGTTGATTATATTAAATCAGATTAGTCTATAATTTTTGTTTTTGTTTCTGA
GAAGCAATATATTGTTCATAATATAATCAATTTCTATTTCATAATATAATCAGTTAGTTT
ATAATCTATGATTGTAGAAACTTTAATTTGTCGGAAAGAAA