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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006654Chr1131450553152507+ATP-dependent DNA helicase DDM1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006654.m1235398PF04851.18ResIIIFamily31.51.70E-07
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LITCHI006654.m437200PF04851.18ResIIIFamily32.21.10E-07
LITCHI006654.m441339PF00176.26SNF2-rel_domDomain238.39.90E-71
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>LITCHI006654.m1
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TTTCTTGTCTCAGAAGCTATGAAAGAAGAAGAGGAAAGGCTACTAAAAGCTCGAGTGGAG
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AAAAGATCTGAAGAAGGGGAAATAACTGAAGTGGAGAACCTGAATGAGGAAGAAAGAGTT
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CTCAAAGGTGTGAAGTGGTTGATCTCATTATGGCAGAATGGTTTGAATGGGATTCTTGCA
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GATGAGATTTCAAGGTTCGTGCCATCTATCAATGCAATTATTTACCATGGAGACAAGAAA
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TGGAAATATGTTGTGGTTGATGAGGGCCACAGGCTGAAAAACTCGAAGTGCAAACTGGTG
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CTTGAAGAATTTCAGTCATGGTTTGATCTGTCGGGAAAGAGCAACAGTGATTTTACAGAG
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CAGACATTGGGAAATTATTTACGAGAGCAAGTCGGGATAGGATATGGTATGAAAGGAAAG
CTTAATAATCTAATGATTCAGCTAAGGAAAAATTGCAACCATCCTGACCTCTTACAGGCT
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TTCTGCTTACTTGACAGACTGTTGGAACGGCTTTTTGCCCTTCAGCACAAAGTTCTTATT
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GAAGTTTGTAGAATTGATGGTCAAGTGAAATTAGATGAGAGGAAAAGACAGATTCAGGAG
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GGTATCAATCTGACTGCAGCTGATACCTGTATACTGTATGACAGTGATTGGAACCCTCAA
ATGGATTTGCAGGCCATGGATAGATGTCACAGGATTGGTCAAACCAAACCTGTCCATGTT
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AAAGGACCTGGTTGGGAGGTGGTGATCCCAGCAGCAACTGGAGGCATGCTGTCTACCCTC
AATAGTTGA
>LITCHI006654.m2
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GTCTTCCATTCTCTCTTCTCTACTGCTCTCTTGTTGCGGCCTCTGTGTCTCTTCGATTCT
CACTCCAACAAAACTCTCATTTTTGTGGTTTTGAAAATGGTTTCCGTCAACGAAACCAAA
AACGACGACGTCTCTGCTGACTCGCCGACATCGGTGCTGGAAGATGAGGATATATGCAAG
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TTTCTTGTCTCAGAAGCTATGAAAGAAGAAGAGGAAAGGCTACTAAAAGCTCGAGTGGAG
GAAGAGGTTGTGGAACGAGAGGAGGAAGCTCACCTGGATGACTCACAGTTTAAGAAGCTG
GACGAGCTTTTAACACAAACCAAGCTGTACACAGAGTTTCTGATGGAGAAAATGGAAGAC
ATCACATTTAATGGAGTGGAGTCGGAGAGTGTACCAGTTAAAAAAAAGGGCCGTGGTGGA
AAGAGAAAATCAGTCCAATACAATACTAGGAAGGCCAAGAGAGCAGTTGCAGCAATGCTT
AAAAGATCTGAAGAAGGGGAAATAACTGAAGTGGAGAACCTGAATGAGGAAGAAAGAGTT
GATAAAGAGCAGAGAGAACTTGTGCCTTTGTTGACTGGTGGAAAATTAAAACCATACCAA
CTCAAAGGTGTGAAGTGGTTGATCTCATTATGGCAGAATGGTTTGAATGGGATTCTTGCA
GATCAAATGGGCTTAGGAAAGACAATTCAAACCATTAGCTTCCTTGCTCATTTAATAGGA
AAAGGACTATATGGGCCCTATTTAGTGATCGCTCCACTTTCTACACTCTCCAATTGGGTA
GATGAGATTTCAAGGTTCGTGCCATCTATCAATGCAATTATTTACCATGGAGACAAGAAA
GAGAGGGAGGCACTACGAAGGAAGCATATGCCTCGAGTGGTTGGCCCAAAATTCCCCATT
GTTGTTACTTCTTATGAGGTTGCGTTATTTGATGCAAAAAAATATTTGAGGCATTACGGT
TGGAAATATGTTGTGGTTGATGAGGGCCACAGGCTGAAAAACTCGAAGTGCAAACTGGTG
AAGGAATTGAAACATTTAAATACAGCTAATAAGCTTCTATTAACTGGGACTCCTCTGCAG
AACAATCTGGCAGAGCTCTGGTCACTGTTACATTTCATTTTGCCTGATATTTTCTCATCT
CTTGAAGAATTTCAGTCATGGTTTGATCTGTCGGGAAAGAGCAACAGTGATTTTACAGAG
GAAGACTTGGAAGAGAAGAGAAAGGCGCAAATGGTGGCCAAACTCCATGCTATATTGCGT
CCCTTTCTTCTTCGAAGAATGAAGTCTGATGTGGAGCAGATGCTTCCTCGAAAAAAGGAG
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CAGACATTGGGAAATTATTTACGAGAGCAAGTCGGGATAGGATATGGTATGAAAGGAAAG
CTTAATAATCTAATGATTCAGCTAAGGAAAAATTGCAACCATCCTGACCTCTTACAGGCT
CAATTTGAAGGATCATCATTATACCCACCTGTACAGCAGATTGTTGAACAGTGTGGGAAA
TTCTGCTTACTTGACAGACTGTTGGAACGGCTTTTTGCCCTTCAGCACAAAGTTCTTATT
TTCTCCCAATGGACTAAGGTTTTGGATATAATGGATTACTATTTTAGTGAAAAAGGCTTT
GAAGTTTGTAGAATTGATGGTCAAGTGAAATTAGATGAGAGGAAAAGACAGATTCAGGAG
TTCAATGATGTAAACAGCAATTATAGGATTTTTCTTCTCAGCACTAGGGCTGGTGGATTG
GGTATCAATCTGACTGCAGCTGATACCTGTATACTGTATGACAGTGATTGGAACCCTCAA
ATGGATTTGCAGGCCATGGATAGATGTCACAGGATTGGTCAAACCAAACCTGTCCATGTT
TACAGGCTTGCAACAGCTCAATCTGTTGAGGGTCGCATTTTGAAAAGAGCTTACAGTAAG
CTGAAGCTGGAGCATGTTGTGATTGTAAAAGGGCAGTTTCATCAAGTGGAAACCAAGTCT
ACAGATGTCACGGAGGTTGTTAATTTACATTCAGCTATTTTCAATTATGCTGTTTACTTT
TTGTTGGCATGA
>LITCHI006654.m3
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CTTGCAGATCAAATGGGCTTAGGAAAGACAATTCAAACCATTAGCTTCCTTGCTCATTTA
ATAGGAAAAGGACTATATGGGCCCTATTTAGTGATCGCTCCACTTTCTACACTCTCCAAT
TGGGTAGATGAGATTTCAAGGTTCGTGCCATCTATCAATGCAATTATTTACCATGGAGAC
AAGAAAGAGAGGGAGGCACTACGAAGGAAGCATATGCCTCGAGTGGTTGGCCCAAAATTC
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TACGGTTGGAAATATGTTGTGGTTGATGAGGGCCACAGGCTGAAAAACTCGAAGTGCAAA
CTGGTGAAGGAATTGAAACATTTAAATACAGCTAATAAGCTTCTATTAACTGGGACTCCT
CTGCAGAACAATCTGGCAGAGCTCTGGTCACTGTTACATTTCATTTTGCCTGATATTTTC
TCATCTCTTGAAGAATTTCAGTCATGGTTTGATCTGTCGGGAAAGAGCAACAGTGATTTT
ACAGAGGAAGACTTGGAAGAGAAGAGAAAGGCGCAAATGGTGGCCAAACTCCATGCTATA
TTGCGTCCCTTTCTTCTTCGAAGAATGAAGTCTGATGTGGAGCAGATGCTTCCTCGAAAA
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GGGAAATTCTGCTTACTTGACAGACTGTTGGAACGGCTTTTTGCCCTTCAGCACAAAGTT
CTTATTTTCTCCCAATGGACTAAGGTTTTGGATATAATGGATTACTATTTTAGTGAAAAA
GGCTTTGAAGTTTGTAGAATTGATGGTCAAGTGAAATTAGATGAGAGGAAAAGACAGATT
CAGGAGTTCAATGATGTAAACAGCAATTATAGGATTTTTCTTCTCAGCACTAGGGCTGGT
GGATTGGGTATCAATCTGACTGCAGCTGATACCTGTATACTGTATGACAGTGATTGGAAC
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TACTTTTTGTTGGCATGA
>LITCHI006654.m4
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AGAGTTGATAAAGAGCAGAGAGAACTTGTGCCTTTGTTGACTGGTGGAAAATTAAAACCA
TACCAACTCAAAGGTGTGAAGTGGTTGATCTCATTATGGCAGAATGGTTTGAATGGGATT
CTTGCAGATCAAATGGGCTTAGGAAAGACAATTCAAACCATTAGCTTCCTTGCTCATTTA
ATAGGAAAAGGACTATATGGGCCCTATTTAGTGATCGCTCCACTTTCTACACTCTCCAAT
TGGGTAGATGAGATTTCAAGGTTCGTGCCATCTATCAATGCAATTATTTACCATGGAGAC
AAGAAAGAGAGGGAGGCACTACGAAGGAAGCATATGCCTCGAGTGGTTGGCCCAAAATTC
CCCATTGTTGTTACTTCTTATGAGGTTGCGTTATTTGATGCAAAAAAATATTTGAGGCAT
TACGGTTGGAAATATGTTGTGGTTGATGAGGGCCACAGGCTGAAAAACTCGAAGTGCAAA
CTGGTGAAGGAATTGAAACATTTAAATACAGCTAATAAGCTTCTATTAACTGGGACTCCT
CTGCAGAACAATCTGGCAGAGCTCTGGTCACTGTTACATTTCATTTTGCCTGATATTTTC
TCATCTCTTGAAGAATTTCAGTCATGGTTTGATCTGTCGGGAAAGAGCAACAGTGATTTT
ACAGAGGAAGACTTGGAAGAGAAGAGAAAGGCGCAAATGGTGGCCAAACTCCATGCTATA
TTGCGTCCCTTTCTTCTTCGAAGAATGAAGTCTGATGTGGAGCAGATGCTTCCTCGAAAA
AAGGAGATTATTTTATATGCTACATTGACTGAACATCAAAGAAATTTCCAGGATCATTTA
ATTAATCAGACATTGGGAAATTATTTACGAGAGCAAGTCGGGATAGGATATGGTATGAAA
GGAAAGCTTAATAATCTAATGATTCAGCTAAGGAAAAATTGCAACCATCCTGACCTCTTA
CAGGCTCAATTTGAAGGATCATCATTATACCCACCTGTACAGCAGATTGTTGAACAGTGT
GGGAAATTCTGCTTACTTGACAGACTGTTGGAACGGCTTTTTGCCCTTCAGCACAAAGTT
CTTATTTTCTCCCAATGGACTAAGGTTTTGGATATAATGGATTACTATTTTAGTGAAAAA
GGCTTTGAAGTTTGTAGAATTGATGGTCAAGTGAAATTAGATGAGAGGAAAAGACAGATT
CAGGAGTTCAATGATGTAAACAGCAATTATAGGATTTTTCTTCTCAGCACTAGGGCTGGT
GGATTGGGTATCAATCTGACTGCAGCTGATACCTGTATACTGTATGACAGTGATTGGAAC
CCTCAAATGGATTTGCAGGCCATGGATAGATGTCACAGGATTGGTCAAACCAAACCTGTC
CATGTTTACAGGCTTGCAACAGCTCAATCTGTTGAGGGTCGCATTTTGAAAAGAGCTTAC
AGTAAGCTGAAGCTGGAGCATGTTGTGATTGTAAAAGGGCAGTTTCATCAAGTGGAAACC
AAGTCTACAGATGTCACGGAGCAAGAGGATTTATTAGCACTTCTTCGGGATGAAGAAACC
GCTGAAGACAAATTGATTCAGACAGATATCAGTGATGAAGATCTGGACAGGGTCTTGGAT
CGCAGTGACCTGATTGTTGGTTCATCAGGTGATGAAGGAAAGACTGATGGTGCTGCTTAT
CCGCTTAAAGGACCTGGTTGGGAGGTGGTGATCCCAGCAGCAACTGGAGGCATGCTGTCT
ACCCTCAATAGTTGA
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TAAAATGGCGTTTACAAAAAATAATAAAAATAAATATCCGGTGCCCACTATAATGTCTCG
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GGAGGAAGAGGTTGTGGAACGAGAGGAGGAAGCTCACCTGGATGACTCACAGTTTAAGAA
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TCAGTCTTTTTTTTTTTAATAAACTGATTGAGTTTTGTGTGAATTGCATTGCTAGAATGG
AGTGGAGTCGGAGAGTGTACCAGTTAAAAAAAAGGGCCGTGGTGGAAAGAGAAAATCAGT
CCAATACAATACTGTAATATAATTCTTCCCGCTTTCACCGTGTAGATATAGCTTATTTTG
GTCTGTTGCTCGTAAAGTTATGCCTACCTACAATTGGTGTTGTTACATAGTATTACATGA
CATTTGTTGATTAGATATTCCTTATTGTTTATTATTGTTGGGTTAGGTATTTTATCTTAG
ATGGTAAATCAGTGATGAGATGGATTTTAAATTCTTAGTCATGTTATAAATTTGAGATAA
TACTGTGACATTTCATCAGAGGAAGGCCAAGAGAGCAGTTGCAGCAATGCTTAAAAGATC
TGAAGAAGGGGAAATAACTGAAGTGGAGAACCTGAATGAGGAAGAAAGAGTTGATAAAGA
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TGTGAAGTGGTTGATCTCATTATGGCAGAATGGTTTGAATGGGATTCTTGCAGATCAAAT
GGGCTTAGGAAAGACAATTCAAACCATTAGCTTCCTTGCTCATTTAATAGGAAAAGGACT
ATATGGGCCCTATTTAGTGATCGCTCCACTTTCTACACTCTCCAATTGGGTAGATGAGAT
TTCAAGGTTCGTGCCATCTATCAATGCAATTATTTACCATGGAGACAAGAAAGAGAGGGA
GGCACTACGAAGGAAGCATATGCCTCGAGTGGTTGGCCCAAAATTCCCCATTGTTGTTAC
TTCTTATGAGGTTGCGTTATTTGATGCAAAAAAATATTTGAGGCATTACGGTTGGAAATA
TGTTGTGGTTGATGAGGGCCACAGGCTGAAAAACTCGAAGTGCAAACTGGTGAAGGAATT
GAAACATTTAAATACAGCTAATAAGCTTCTATTAACTGGGACTCCTCTGCAGAACAATCT
GGCAGAGCTCTGGTCACTGTTACATTTCATTTTGCCTGATATTTTCTCATCTCTTGAAGA
ATTTCAGTCATGGTTTGATCTGTCGGGAAAGAGCAACAGTGATTTTACAGAGGAAGACTT
GGAAGAGAAGAGAAAGGCGCAAATGGTGGCCAAACTCCATGCTATATTGCGTCCCTTTCT
TCTTCGAAGAATGAAGTCTGATGTGGAGCAGATGCTTCCTCGAAAAAAGGAGATTATTTT
ATATGCTACATTGACTGAACATCAAAGAAATTTCCAGGATCATTTAATTAATCAGACATT
GGGAAATTATTTACGAGAGCAAGTCGGGATAGGATATGGTATGAAAGGAAAGCTTAATAA
TCTAATGATTCAGCTAAGGAAAAATTGCAACCATCCTGACCTCTTACAGGCTCAATTTGA
AGGATCATCATTATACCCACCTGTACAGCAGATTGTTGAACAGTGTGGGAAATTCTGCTT
ACTTGACAGACTGTTGGAACGGCTTTTTGCCCTTCAGCACAAAGTTCTTATTTTCTCCCA
ATGGACTAAGGTTTTGGATATAATGGATTACTATTTTAGTGAAAAAGGCTTTGAAGTTTG
TAGAATTGATGGTCAAGTGAAATTAGATGAGAGGAAAAGACAGATTCAGGAGTTCAATGA
TGTAAACAGCAATTATAGGATTTTTCTTCTCAGCACTAGGGCTGGTGGATTGGGTATCAA
TCTGACTGCAGCTGATACCTGTATACTGTATGACAGTGATTGGAACCCTCAAATGGATTT
GCAGGCCATGGATAGATGTCACAGGATTGGTCAAACCAAACCTGTCCATGTTTACAGGCT
TGCAACAGCTCAATCTGTTGAGGGTCGCATTTTGAAAAGAGCTTACAGTAAGCTGAAGCT
GGAGCATGTTGTGATTGTAAAAGGGCAGTTTCATCAAGTGGAAACCAAGTCTACAGATGT
CACGGAGGTTGTTAATTTACATTCAGCTATTTTCAATTATGCTGTTTACTTTTTGTTGGC
ATGACTGTTCTTTCTTGGATATGGTGATCTTAGCATGCTTTAGGCTACAGAGTTGAAACA
CTTGGAGAGTCTCATTGGTGTCATTTCTCATCTTCCCTTGTTTTGCTTCTTATCCTCTAT
TTTACTTTTTCTGAACTCATTATCTTTCACAGCAGGGATTTATAATAGTTTTTACTTGTG
TTTCTAGTTTTATAATCAGCTTCTCTCTGCAGTAAGTTCATCTAGGCCAGTTTTTTATTT
GTGAAGATCATGTGTAGGAATGTGAAATTGCTAGGTCTAGGTTTCTGACCATCTCCCTTT
GGCATTCATGCGACGAGACATAGTGTCAACACTTGGAATCTTTGGATGATGCAATAGTGA
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ATACTTGTTAATTTTAGCAAGAGGATTTATTAGCACTTCTTCGGGATGAAGAAACCGCTG
AAGACAAATTGATTCAGACAGATATCAGTGATGAAGATCTGGACAGGGTCTTGGATCGCA
GTGACCTGATTGTTGGTTCATCAGGTGATGAAGGAAAGACTGATGGTGCTGCTTATCCGC
TTAAAGGACCTGGTTGGGAGGTGGTGATCCCAGCAGCAACTGGAGGCATGCTGTCTACCC
TCAATAGTTGAAGATCTTTTTATGTGAATGCGGAGCAGTGGATTTTGTCGTGGTTTTTGC
TTTCGGATTTGGCCTTAATAGTAGTCAGCCTAGTTACCTTTGCAGCAGTTTTGGGGACCT
GAAAGATGCTGTAAAGGGGTATATTCATCTCTTCAAGGGATGCTTTTGTAAATGTCGATT
TTGAATTATCATGCCTGCTCTGCGTTTGTATACTTAATTAGATGTAGACGTGATATTTTT
AGACATTGGCAGATGAAGTTAAATATTAGTATTATTGCTTTGTATGGAAGATGTCCTGGT
TGCAAGAAATTTGTGGTATTGCTAGACATTGGTAGATGAAGTTAAGTATTAGTACTGCTT
TTTATGGAAGATGTCTTGGTTGCAAGCTGATCCATGAAATTTATGGTATTACTAGACATT
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TCCATGAAATTTATGGTGTGTTTACTTATCTGATCAGGGATGTGAGTTAATTAGGGAATG
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GAAATCGAGAATTTCATATAAATT
>LITCHI006654.m4
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>LITCHI006654.m2
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CGTAATGAGAATGAAATCGAGAATTTCATATAAATT
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CCAAGAGAGCAGTTGCAGCA
>LITCHI006654.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI006654.m1 GenomeSequence + 
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>LITCHI006654.m4 GenomeSequence + 
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GGAGGAAGAGGTTGTGGAACGAGAGGAGGAAGCTCACCTGGATGACTCACAGTTTAAGAA
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