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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006654 | Chr11 | 3145055 | 3152507 | + | ATP-dependent DNA helicase DDM1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006654.m1 | 235 | 398 | PF04851.18 | ResIII | Family | 31.5 | 1.70E-07 |
LITCHI006654.m1 | 239 | 537 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 237.8 | 1.50E-70 |
LITCHI006654.m1 | 570 | 673 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 70.4 | 1.60E-19 |
LITCHI006654.m2 | 235 | 398 | PF04851.18 | ResIII | Family | 31.7 | 1.50E-07 |
LITCHI006654.m2 | 239 | 537 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 238 | 1.20E-70 |
LITCHI006654.m2 | 570 | 673 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 70.5 | 1.50E-19 |
LITCHI006654.m3 | 37 | 200 | PF04851.18 | ResIII | Family | 32.5 | 8.70E-08 |
LITCHI006654.m3 | 41 | 339 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 238.7 | 7.60E-71 |
LITCHI006654.m3 | 372 | 475 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 71.2 | 9.10E-20 |
LITCHI006654.m4 | 37 | 200 | PF04851.18 | ResIII | Family | 32.2 | 1.10E-07 |
LITCHI006654.m4 | 41 | 339 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 238.3 | 9.90E-71 |
LITCHI006654.m4 | 372 | 475 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 71 | 1.10E-19 |
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>LITCHI006654.m1 ATGGCGTTTACAAAAAATAATAAAAATAAATATCCGGTGCCCACTATAATGTCTCGATTT GTCTTCCATTCTCTCTTCTCTACTGCTCTCTTGTTGCGGCCTCTGTGTCTCTTCGATTCT CACTCCAACAAAACTCTCATTTTTGTGGTTTTGAAAATGGTTTCCGTCAACGAAACCAAA AACGACGACGTCTCTGCTGACTCGCCGACATCGGTGCTGGAAGATGAGGATATATGCAAG GCAAAAATTGGAGTTAATTTGGAGGAAGAGGCACTTGTAAATGGAAAAAGTGATGATGCC TTTCTTGTCTCAGAAGCTATGAAAGAAGAAGAGGAAAGGCTACTAAAAGCTCGAGTGGAG GAAGAGGTTGTGGAACGAGAGGAGGAAGCTCACCTGGATGACTCACAGTTTAAGAAGCTG GACGAGCTTTTAACACAAACCAAGCTGTACACAGAGTTTCTGATGGAGAAAATGGAAGAC ATCACATTTAATGGAGTGGAGTCGGAGAGTGTACCAGTTAAAAAAAAGGGCCGTGGTGGA AAGAGAAAATCAGTCCAATACAATACTAGGAAGGCCAAGAGAGCAGTTGCAGCAATGCTT AAAAGATCTGAAGAAGGGGAAATAACTGAAGTGGAGAACCTGAATGAGGAAGAAAGAGTT GATAAAGAGCAGAGAGAACTTGTGCCTTTGTTGACTGGTGGAAAATTAAAACCATACCAA CTCAAAGGTGTGAAGTGGTTGATCTCATTATGGCAGAATGGTTTGAATGGGATTCTTGCA GATCAAATGGGCTTAGGAAAGACAATTCAAACCATTAGCTTCCTTGCTCATTTAATAGGA AAAGGACTATATGGGCCCTATTTAGTGATCGCTCCACTTTCTACACTCTCCAATTGGGTA GATGAGATTTCAAGGTTCGTGCCATCTATCAATGCAATTATTTACCATGGAGACAAGAAA 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