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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006642Chr1130448383047546;3047671-Scarecrow-like protein 4

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006642.m1234603PF03514.17GRASFamily3501.50E-104
LITCHI006642.m2234603PF03514.17GRASFamily3501.50E-104
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>LITCHI006642.m1
ATGGCATATATGTGCGCCGACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAA
CAAAAGCAAGAACAAGAACAGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTC
TTCTCTCTCAATCCTTTCTCTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACC
ACCCACATGTCTAATAGTCCCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGAC
CCGTTAGATGCCGGAGAGAACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGG
TTTAGGTTCTCAGATTTTGGAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGT
TTGATGAACACCGGACACTCAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGG
CAAAATAATGCTGATTTCGGTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGA
CTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCT
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GCTCGACTCGCCGAGGCAGAACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGAC
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TCACCAGCTTCTTCACTTCTCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTC
AACTTGGACTTCGAGTTCCAGCCGATTCTAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGT
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>LITCHI006642.m2
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GATTGCATTATCTCGTACAATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCAC
TTAACGGCCAATCAAGCAATATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTC
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CAAGCGGAGATACTACTATGGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCT
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WWR.
>LITCHI006642.m2
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TTTCGTTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGA
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CAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCG
GTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCT
CTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAG
CCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCA
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AACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGACTCGGTCTCCGAACACGGAG
ATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTCTACAACAGAGTCTCTCTTC
AAGAAGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCTGATTGCATTATCTCGTACA
ATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCACTTAACGGCCAATCAAGCAA
TATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTCGATTTCGGGATTGTTCAAG
GAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGGTCCGGCGGAAAACCCATCA
AAGTTCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGACTCACCAGCTTCTTCACTTC
TCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTCAACTTGGACTTCGAGTTCC
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AGGTGGTTGCAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTACTGGACGACACACCAAACG
CTATAGAGAGCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCAGTTATCGTCACGCTTGGTG
AGTACGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGATTCAAGAACGCATTGAAGT
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GCGGGTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGTCAAGCGGAGATACTACTAT
GGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCTGACACTGAACCTGAATACA
TAACTCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCATGGTGGCGTTAATGGTGGT
GTTGGTTTCGTCTGACTAAATTGGGGTCTTTATGGGATGTAGTTACTATTTTTCTTTTTC
TTTTTTTGGATTAATTTTTTAGTGATGTTGATGTTGTTATAGTCTAGAAGCTAGAGAGAC
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AAGTTGAATTCAAAGTCGAGGTGGAAAGAAGATTTATGTTCTCAGCCCTTTTAGGTCTCC
CAATCGGATCAGCCTTTGTATATGTGATTTTGAATATTAATGTGAATGTAGTCACTAGTC
ATCTTTTAGTGGTGTGTAATTTAGAGATAACAACGATTTAAATATTATATTTATATCTAT
ATCGATTGGTCTCTTTTATTCATCTTAAACTCTCTGTTCTCTTCTGTGATTCTGTCATTT
CACTCCTATTATTTTTTC
>LITCHI006642.m1
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TTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGA
ATCCAAATAGCGAACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTTGCAGA
TTCCGTCCGTTGTTTTTCTTGCCGGCGAGATCGGCCGGAGGATGGCATATATGTGCGCCG
ACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAACAAAAGCAAGAACAAGAAC
AGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTCTTCTCTCTCAATCCTTTCT
CTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACCACCCACATGTCTAATAGTC
CCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGACCCGTTAGATGCCGGAGAGA
ACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGGTTTAGGTTCTCAGATTTTG
GAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGTTTGATGAACACCGGACACT
CAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCG
GTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCT
CTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAG
CCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCA
AACCAGCCAATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCTACTAGCTCCTCCCCGGAAA
ATGACCTCTCACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGTGCTCGACTCGCCGAGGCAG
AACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGACTCGGTCTCCGAACACGGAG
ATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTCTACAACAGAGTCTCTCTTC
AAGAAGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCTGATTGCATTATCTCGTACA
ATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCACTTAACGGCCAATCAAGCAA
TATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTCGATTTCGGGATTGTTCAAG
GAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGGTCCGGCGGAAAACCCATCA
AAGTTCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGACTCACCAGCTTCTTCACTTC
TCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTCAACTTGGACTTCGAGTTCC
AGCCGATTCTAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGTTTCAAGGTCGAGTCAGACG
AGGTGGTTGCAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTACTGGACGACACACCAAACG
CTATAGAGAGCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCAGTTATCGTCACGCTTGGTG
AGTACGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGATTCAAGAACGCATTGAAGT
ACTACATGGCCGTGTTCGAGTCACTTGAGCCCAACATGAGTCGAGACTCAGTAGAGAGAC
TCCAAATAGAGAAACTGCTTCTGGGTCGAAGAATCGCTAATGTGATAGGAACCGAATCCA
CCCATAGAAGAAGAGAGCGGTTGGAGGATGGAGAGCATTGGAGTTGTTTGATGAAAAATT
GCGGGTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGTCAAGCGGAGATACTACTAT
GGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCTGACACTGAACCTGAATACA
TAACTCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCATGGTGGCGTTAATGGTGGT
GTTGGTTTCGTCTGACTAAATTGGGGTCTTTATGGGATGTAGTTACTATTTTTCTTTTTC
TTTTTTTGGATTAATTTTTTAGTGATGTTGATGTTGTTATAGTCTAGAAGCTAGAGAGAC
AACTAAGCATTGAAAACACTGCATTTTGATGGATGCTTTTGGGTTGTTTAATTGTTATTA
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GGGCTCACAGACTGGGAACTTTTGTATGACAAAATTGTAAGGAAAAAAAAAGTAAAGTAA
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CAATCGGATCAGCCTTTGTATATGTGATTTTGAATATTAATGTGAATGTAGTCACTAGTC
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ATCGATTGGTCTCTTTTATTCATCTTAAACTCTCTGTTCTCTTCTGTGATTCTGTCATTT
CACTCCTATTATTTTTTC
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>LITCHI006642.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT
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AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC
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TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA
AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC
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TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA
GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA
TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC
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ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT
ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT
GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA
ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA
TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA
TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT
GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT
ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG
AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT
CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC
TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG
CCGGCGAGATCGGCCGGAGG
>LITCHI006642.m1 -  Up_Stream_Len 2000
ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA
TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT
ATTGAAATGAAATTAAATTGATTGGATTGGAATGAAAAATCATTATCTCATATTTGATAG
AACTTGAGATTGAATTAATATTATACTATATCATGTTTGATGTAGACTAGGATTGGATTG
GAATAAAATTAATCTTAAATTTTTATTTATAAATTAATTTTATAAAAAATTTGAAAAAAA
AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC
ATCATCAAACATGGTTTATCAATATCATCAATATAATTCGTTAATATCATTATCTCTTAC
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CGAATCCAGAACCAAGAACCAGATGGATTTGGGTTTGATGTCGAACCCAAAGCCACACAA
CTTAGAAGGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATGGTAGAGAGGTTATTGCCATTGTTAGTTCG
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TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA
AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC
AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC
AAACTTGAGATATGGAAGAATAAAAAAAAAATAAATCCTAATTTCATCTCAAATTTCACG
TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG
AGAATCTAAATTTTCTGTCGTGGGTTGGCCTAATTTAAAGAATTTTAAGGTTTGATTTCT
GATTAGTGACAGAAGAAGTTGATGACACGTGTCGACATTTCAAGGAGGTTTGATGGGTTG
TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA
GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA
TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC
GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC
ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT
ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT
GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA
ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA
TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA
TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT
GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT
ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG
AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT
CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC
TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG
CCGGCGAGATCGGCCGGAGG
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>LITCHI011340.m1 GenomeSequence - 
ATGTCATTAGTTAGGTCTGCAGAGCCATCTACTACATCGTATGGAAATTCTAAGCTTTAT
TCGTTAAAGGGGAGGGGTGACAATTCTGCCTTGTCTACTCAAGTATTCAGCTCTGACAAA
CATAAGATGATGTACATGACTGATTCTTACAGCAGTGAGAGCTACGAGAAGTACTTCCTT
GACTCTCCAACAGAAGAACTCGTGCATCCTTCAAGTTCTACTGTCTCAGACAATTACTTT
CCCCCGGAAGATGCCTCTTCTTACCAGCTAAGAGTTGGTTCAAACTCCACCATGGCTGTG
CAAAACCCACTGAATACTTCTTTCATGTCCATGAGACTTCGTGATAGCTATCAATCCAAC
TTTGAGTGTGATTATCTGGAAAGTCCAAGCCTAGATCATTTAGACTATGATGAAATAACG
ATGAGATTGAAGCTTCAAGAACTTGAGAGAGCATTGCTTGATGATAATGATGGTGATGAT
GACAATGACATGTTTGCTACTGGTCAAAACATGGAAGTTGATGGTGAATGGTCTGACCCG
GTCCAGAATGTGCCATTCCACGACTCACCGAAGGAGTCTTCATCCTCAGATTCTAACCTT
AGCAGCATCAGCTGCAACAAAGAAGTATCGCAGATATCTCCTCGGAGTCCTAAGCAAATG
CTTATAGATTGTGCTGCTGTGCTTTCAGAAGGAAACATTGAGGAAGCAACAGCTATAATA
AATGAACTCCGGCAGATGGTCTCAATTCAAGGAGATCCTCCTCAAAGGATTGCAGCCTAC
ATGGTGGAAGGGCTTGCAGCTCGCATGGCTGCTTCTGGAAAGTTTCTCTATAAAGCTCTG
AAATGCAAAGAGCCTCCTTCTTCTGATAGGCTTGCAGCGATGCAGATCCTCTTTGAGGTG
TGCCCTTGTTTTAAATTTGGATTTATGGCAGCAAATGGTGCAATTATTGAGGCATTTAAA
GATGAAAAGAGAGTGCATATAATAGATTTTGACATAAATCAAGGTAGTCAATACATAACA
TTGATACAAACAATTTCTTCACAGTCTGGTAAGCCACCCCATTTAAGGTTAACTGGGGTT
GATGACCCTGAGTCAGTTCAACGGCCTGTTGGAGGCCTTCAAATTATTGGATTAAGACTT
GAGAAGCTAGCCGAAGCACTGGGGGTACCGTTTGAGTTTCATATAGTGCCTTCAAAGACT
TCAATTGTCACTCCATCAATGCTCGACTGCAGGCCTGGGGAAGCACTTATTGTAAACTTT
GCTTTTCAGCTTCATCATATGCCTGATGAGAGTGTTTCAACTGTAAATCAGCGAGACCAG
CTGCTTCGGATGATTAAGAGCTTAAATCCGAAACTTGTAACTGTTGTTGAACAAGATGTG
AACACAAACACTGCCCCCTTTTTTCCAAGGTTTATTGAAGCCTACAATTACTACTCTGCT
GTGTTTGAGTCTCTTGATGCAACTCTCCCAAGGGAGAGTCAGGACAGGATGAATGTTGAA
CGACAATGCCTGGCACGGGATATAGTTAACATTGTTGCATGTGAGGGAGAGGAGCGAATA
GAGCGGTATGAGGTTGCAGGGAAATGGAGGGCAAGGATGAAGATGGCCGGCTTCACTTCG
TGTCCAGTGAGTCAGAATGTGATTGATATGATTCAGAAACTTATAAAGCAATACTGTGAC
AGGTACAAGATGAGGGAGGAAATGGATCTGCTGCATTTTGGGTGGGAAGACAAAAGCTTG
ATCGTTGCTTCAGCCTGGAGGTAA