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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006642 | Chr11 | 3044838 | 3047546;3047671 | - | Scarecrow-like protein 4 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006642.m1 | 234 | 603 | PF03514.17 | GRAS | Family | 350 | 1.50E-104 |
LITCHI006642.m2 | 234 | 603 | PF03514.17 | GRAS | Family | 350 | 1.50E-104 |
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>LITCHI006642.m1 ATGGCATATATGTGCGCCGACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAA CAAAAGCAAGAACAAGAACAGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTC TTCTCTCTCAATCCTTTCTCTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACC ACCCACATGTCTAATAGTCCCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGAC CCGTTAGATGCCGGAGAGAACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGG TTTAGGTTCTCAGATTTTGGAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGT TTGATGAACACCGGACACTCAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGG CAAAATAATGCTGATTTCGGTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGA CTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCT CCAAAGAGCCCCGTCCAAGCCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAA CCGGTTGTGAAGGACACCAAACCAGCCAATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCT ACTAGCTCCTCCCCGGAAAATGACCTCTCACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGT GCTCGACTCGCCGAGGCAGAACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGAC TCGGTCTCCGAACACGGAGATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTC TACAACAGAGTCTCTCTTCAAGAAGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCT GATTGCATTATCTCGTACAATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCAC TTAACGGCCAATCAAGCAATATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTC GATTTCGGGATTGTTCAAGGAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGG TCCGGCGGAAAACCCATCAAAGTTCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGAC TCACCAGCTTCTTCACTTCTCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTC AACTTGGACTTCGAGTTCCAGCCGATTCTAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGT TTCAAGGTCGAGTCAGACGAGGTGGTTGCAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTA CTGGACGACACACCAAACGCTATAGAGAGCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCA GTTATCGTCACGCTTGGTGAGTACGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGA TTCAAGAACGCATTGAAGTACTACATGGCCGTGTTCGAGTCACTTGAGCCCAACATGAGT CGAGACTCAGTAGAGAGACTCCAAATAGAGAAACTGCTTCTGGGTCGAAGAATCGCTAAT GTGATAGGAACCGAATCCACCCATAGAAGAAGAGAGCGGTTGGAGGATGGAGAGCATTGG AGTTGTTTGATGAAAAATTGCGGGTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGT CAAGCGGAGATACTACTATGGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCT GACACTGAACCTGAATACATAACTCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCA TGGTGGCGTTAA >LITCHI006642.m2 ATGGCATATATGTGCGCCGACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAA CAAAAGCAAGAACAAGAACAGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTC TTCTCTCTCAATCCTTTCTCTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACC ACCCACATGTCTAATAGTCCCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGAC CCGTTAGATGCCGGAGAGAACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGG TTTAGGTTCTCAGATTTTGGAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGT TTGATGAACACCGGACACTCAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGG CAAAATAATGCTGATTTCGGTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGA CTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCT CCAAAGAGCCCCGTCCAAGCCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAA CCGGTTGTGAAGGACACCAAACCAGCCAATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCT ACTAGCTCCTCCCCGGAAAATGACCTCTCACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGT GCTCGACTCGCCGAGGCAGAACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGAC TCGGTCTCCGAACACGGAGATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTC TACAACAGAGTCTCTCTTCAAGAAGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCT GATTGCATTATCTCGTACAATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCAC TTAACGGCCAATCAAGCAATATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTC GATTTCGGGATTGTTCAAGGAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGG TCCGGCGGAAAACCCATCAAAGTTCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGAC TCACCAGCTTCTTCACTTCTCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTC AACTTGGACTTCGAGTTCCAGCCGATTCTAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGT TTCAAGGTCGAGTCAGACGAGGTGGTTGCAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTA CTGGACGACACACCAAACGCTATAGAGAGCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCA GTTATCGTCACGCTTGGTGAGTACGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGA TTCAAGAACGCATTGAAGTACTACATGGCCGTGTTCGAGTCACTTGAGCCCAACATGAGT CGAGACTCAGTAGAGAGACTCCAAATAGAGAAACTGCTTCTGGGTCGAAGAATCGCTAAT GTGATAGGAACCGAATCCACCCATAGAAGAAGAGAGCGGTTGGAGGATGGAGAGCATTGG AGTTGTTTGATGAAAAATTGCGGGTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGT CAAGCGGAGATACTACTATGGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCT GACACTGAACCTGAATACATAACTCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCA TGGTGGCGTTAA
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>LITCHI006642.m2 CGAGAGTCACCAGTAGATAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTAGATTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGG GACCCACTTTCTCATTTGGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGC TTTCGTTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGA AGTGAATCCAAATAGCGAACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTA TTCCGTCCGTTGTTTTTCTTGCCGGCGAGATCGGCCGGAGGATGGCATATATGTGCGCCG ACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAACAAAAGCAAGAACAAGAAC AGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTCTTCTCTCTCAATCCTTTCT CTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACCACCCACATGTCTAATAGTC CCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGACCCGTTAGATGCCGGAGAGA ACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGGTTTAGGTTCTCAGATTTTG GAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGTTTGATGAACACCGGACACT CAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCG GTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCT CTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAG CCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCA 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>LITCHI006642.m2 - Up_Stream_Len 2000 ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT ATTGAAATGAAATTAAATTGATTGGATTGGAATGAAAAATCATTATCTCATATTTGATAG AACTTGAGATTGAATTAATATTATACTATATCATGTTTGATGTAGACTAGGATTGGATTG GAATAAAATTAATCTTAAATTTTTATTTATAAATTAATTTTATAAAAAATTTGAAAAAAA AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC ATCATCAAACATGGTTTATCAATATCATCAATATAATTCGTTAATATCATTATCTCTTAC ATCAACAACATTATCAACAATATGAAAATATCAAAACGTGAAAAAAAAAGGGGTTATGAT CGAATCCAGAACCAAGAACCAGATGGATTTGGGTTTGATGTCGAACCCAAAGCCACACAA CTTAGAAGGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATGGTAGAGAGGTTATTGCCATTGTTAGTTCG TATGGATAGAAGGGGAGATGAGAGAGACGAAAAATGGTTTATGGTGGTAGTGGGTTTGCG TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC AAACTTGAGATATGGAAGAATAAAAAAAAAATAAATCCTAATTTCATCTCAAATTTCACG TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG AGAATCTAAATTTTCTGTCGTGGGTTGGCCTAATTTAAAGAATTTTAAGGTTTGATTTCT GATTAGTGACAGAAGAAGTTGATGACACGTGTCGACATTTCAAGGAGGTTTGATGGGTTG TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG CCGGCGAGATCGGCCGGAGG >LITCHI006642.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT ATTGAAATGAAATTAAATTGATTGGATTGGAATGAAAAATCATTATCTCATATTTGATAG AACTTGAGATTGAATTAATATTATACTATATCATGTTTGATGTAGACTAGGATTGGATTG GAATAAAATTAATCTTAAATTTTTATTTATAAATTAATTTTATAAAAAATTTGAAAAAAA AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC ATCATCAAACATGGTTTATCAATATCATCAATATAATTCGTTAATATCATTATCTCTTAC ATCAACAACATTATCAACAATATGAAAATATCAAAACGTGAAAAAAAAAGGGGTTATGAT CGAATCCAGAACCAAGAACCAGATGGATTTGGGTTTGATGTCGAACCCAAAGCCACACAA CTTAGAAGGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATGGTAGAGAGGTTATTGCCATTGTTAGTTCG TATGGATAGAAGGGGAGATGAGAGAGACGAAAAATGGTTTATGGTGGTAGTGGGTTTGCG TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC AAACTTGAGATATGGAAGAATAAAAAAAAAATAAATCCTAATTTCATCTCAAATTTCACG TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG AGAATCTAAATTTTCTGTCGTGGGTTGGCCTAATTTAAAGAATTTTAAGGTTTGATTTCT GATTAGTGACAGAAGAAGTTGATGACACGTGTCGACATTTCAAGGAGGTTTGATGGGTTG TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG CCGGCGAGATCGGCCGGAGG
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