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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006642Chr1130448383047546;3047671-Scarecrow-like protein 4

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006642.m1234603PF03514.17GRASFamily3501.50E-104
LITCHI006642.m2234603PF03514.17GRASFamily3501.50E-104
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>LITCHI006642.m1
ATGGCATATATGTGCGCCGACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAA
CAAAAGCAAGAACAAGAACAGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTC
TTCTCTCTCAATCCTTTCTCTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACC
ACCCACATGTCTAATAGTCCCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGAC
CCGTTAGATGCCGGAGAGAACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGG
TTTAGGTTCTCAGATTTTGGAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGT
TTGATGAACACCGGACACTCAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGG
CAAAATAATGCTGATTTCGGTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGA
CTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCT
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CCGGTTGTGAAGGACACCAAACCAGCCAATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCT
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GCTCGACTCGCCGAGGCAGAACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGAC
TCGGTCTCCGAACACGGAGATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTC
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GATTTCGGGATTGTTCAAGGAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGG
TCCGGCGGAAAACCCATCAAAGTTCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGAC
TCACCAGCTTCTTCACTTCTCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTC
AACTTGGACTTCGAGTTCCAGCCGATTCTAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGT
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>LITCHI006642.m2
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CTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCT
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ACTAGCTCCTCCCCGGAAAATGACCTCTCACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGT
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TCGGTCTCCGAACACGGAGATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTC
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GATTGCATTATCTCGTACAATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCAC
TTAACGGCCAATCAAGCAATATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTC
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GTGATAGGAACCGAATCCACCCATAGAAGAAGAGAGCGGTTGGAGGATGGAGAGCATTGG
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CAAGCGGAGATACTACTATGGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCT
GACACTGAACCTGAATACATAACTCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCA
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WWR.
>LITCHI006642.m2
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TTTTTTTTTTTTTTAGATTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGG
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TTTCGTTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGA
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CAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCG
GTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCT
CTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAG
CCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCA
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AACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGACTCGGTCTCCGAACACGGAG
ATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTCTACAACAGAGTCTCTCTTC
AAGAAGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCTGATTGCATTATCTCGTACA
ATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCACTTAACGGCCAATCAAGCAA
TATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTCGATTTCGGGATTGTTCAAG
GAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGGTCCGGCGGAAAACCCATCA
AAGTTCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGACTCACCAGCTTCTTCACTTC
TCGCTACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTCAACTTGGACTTCGAGTTCC
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AGGTGGTTGCAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTACTGGACGACACACCAAACG
CTATAGAGAGCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCAGTTATCGTCACGCTTGGTG
AGTACGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGATTCAAGAACGCATTGAAGT
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TCCAAATAGAGAAACTGCTTCTGGGTCGAAGAATCGCTAATGTGATAGGAACCGAATCCA
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GCGGGTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGTCAAGCGGAGATACTACTAT
GGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCTGACACTGAACCTGAATACA
TAACTCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCATGGTGGCGTTAATGGTGGT
GTTGGTTTCGTCTGACTAAATTGGGGTCTTTATGGGATGTAGTTACTATTTTTCTTTTTC
TTTTTTTGGATTAATTTTTTAGTGATGTTGATGTTGTTATAGTCTAGAAGCTAGAGAGAC
AACTAAGCATTGAAAACACTGCATTTTGATGGATGCTTTTGGGTTGTTTAATTGTTATTA
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AAGTTGAATTCAAAGTCGAGGTGGAAAGAAGATTTATGTTCTCAGCCCTTTTAGGTCTCC
CAATCGGATCAGCCTTTGTATATGTGATTTTGAATATTAATGTGAATGTAGTCACTAGTC
ATCTTTTAGTGGTGTGTAATTTAGAGATAACAACGATTTAAATATTATATTTATATCTAT
ATCGATTGGTCTCTTTTATTCATCTTAAACTCTCTGTTCTCTTCTGTGATTCTGTCATTT
CACTCCTATTATTTTTTC
>LITCHI006642.m1
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TTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGA
ATCCAAATAGCGAACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTTGCAGA
TTCCGTCCGTTGTTTTTCTTGCCGGCGAGATCGGCCGGAGGATGGCATATATGTGCGCCG
ACAGCGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAACAAAAGCAAGAACAAGAAC
AGCAACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTCTTCTCTCTCAATCCTTTCT
CTCTAAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACCACCCACATGTCTAATAGTC
CCAACTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGACCCGTTAGATGCCGGAGAGA
ACGAGTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGGTTTAGGTTCTCAGATTTTG
GAGGTGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGTTTGATGAACACCGGACACT
CAACGGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCG
GTCTGTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCT
CTTCTCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAG
CCTGGCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCA
AACCAGCCAATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCTACTAGCTCCTCCCCGGAAA
ATGACCTCTCACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGTGCTCGACTCGCCGAGGCAG
AACCCAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGACTCGGTCTCCGAACACGGAG
ATCCAATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTCTACAACAGAGTCTCTCTTC
AAGAAGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCTGATTGCATTATCTCGTACA
ATGCATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCACTTAACGGCCAATCAAGCAA
TATTTGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTCGATTTCGGGATTGTTCAAG
GAGTCCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGGTCCGGCGGAAAACCCATCA
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AGTACGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGATTCAAGAACGCATTGAAGT
ACTACATGGCCGTGTTCGAGTCACTTGAGCCCAACATGAGTCGAGACTCAGTAGAGAGAC
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GCGGGTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGTCAAGCGGAGATACTACTAT
GGCACTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCTGACACTGAACCTGAATACA
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GTTGGTTTCGTCTGACTAAATTGGGGTCTTTATGGGATGTAGTTACTATTTTTCTTTTTC
TTTTTTTGGATTAATTTTTTAGTGATGTTGATGTTGTTATAGTCTAGAAGCTAGAGAGAC
AACTAAGCATTGAAAACACTGCATTTTGATGGATGCTTTTGGGTTGTTTAATTGTTATTA
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GGGCTCACAGACTGGGAACTTTTGTATGACAAAATTGTAAGGAAAAAAAAAGTAAAGTAA
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CAATCGGATCAGCCTTTGTATATGTGATTTTGAATATTAATGTGAATGTAGTCACTAGTC
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ATCGATTGGTCTCTTTTATTCATCTTAAACTCTCTGTTCTCTTCTGTGATTCTGTCATTT
CACTCCTATTATTTTTTC
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>LITCHI006642.m2 -  Up_Stream_Len 2000
ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA
TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT
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AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC
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TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA
AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC
AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC
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TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG
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TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA
GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA
TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC
GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC
ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT
ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT
GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA
ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA
TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA
TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT
GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT
ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG
AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT
CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC
TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG
CCGGCGAGATCGGCCGGAGG
>LITCHI006642.m1 -  Up_Stream_Len 2000
ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA
TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT
ATTGAAATGAAATTAAATTGATTGGATTGGAATGAAAAATCATTATCTCATATTTGATAG
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GAATAAAATTAATCTTAAATTTTTATTTATAAATTAATTTTATAAAAAATTTGAAAAAAA
AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC
ATCATCAAACATGGTTTATCAATATCATCAATATAATTCGTTAATATCATTATCTCTTAC
ATCAACAACATTATCAACAATATGAAAATATCAAAACGTGAAAAAAAAAGGGGTTATGAT
CGAATCCAGAACCAAGAACCAGATGGATTTGGGTTTGATGTCGAACCCAAAGCCACACAA
CTTAGAAGGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATGGTAGAGAGGTTATTGCCATTGTTAGTTCG
TATGGATAGAAGGGGAGATGAGAGAGACGAAAAATGGTTTATGGTGGTAGTGGGTTTGCG
TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA
AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC
AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC
AAACTTGAGATATGGAAGAATAAAAAAAAAATAAATCCTAATTTCATCTCAAATTTCACG
TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG
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TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA
GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA
TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC
GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC
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ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT
GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA
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GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT
ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG
AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT
CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC
TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG
CCGGCGAGATCGGCCGGAGG
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>LITCHI006474.m1 GenomeSequence - 
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AGCACAATAAACTCCAAGACAAAACCATCAACAAACAATCCTCTTCGAACAACAAAATTA
CAATAATCCGATCAAAATTGAGGTGGCTTGGTCTCGATCCAAAATCATTTTCTCTTCCCT
CCTAGCTTTCAAATTTATAATATTTTCGATGAAGAAATTATATTAATGTAATAAAAGTAT
AATTAATAATAATAACAATTTTAAAATTTATTTTTTTGATTATTTTATTTTTGGATTCAA
AAAGTCTCTTTTGACCACCTCCACCTTCTTTCGTCGACCCATCTCTCTTTCTTCTCTTCT
TCTTCCCATCTGCTTCCATGTTTCCTTTCTCTTCCATTCTCAATCATTTCCATTGAATAT
AATCTCACGGACTGGTACTCTCAACAACACGCACAATATTTTGGTGCAATAAAAAAAAAA
AAAAACAACGGAAAAATCATCAAAAAAGAAAAACAAACAAGATGGGTGCTTGTCTTTCTT
CGACCAAGGTAAGTGGTTCCAACAACAACAACCGCAAAGATGGCACCAAACCCACCTCGA
CGAAGAACAAGGAAGCGGTGACGACACGTCAGAATCGTCATCATGCAAGAAATGAGACGA
CAACAACAACAACGAACATAATGGGACAGAGACAGCGACAGCAGGAAGAACACAAGAATA
GAAAGGACAAAGCGAGTGCGAGGCGGCAAAGTGGGGTGGTAGCGTGCGGGAAGAGGACGG
ATTTCGGCTACGCAAAGGACTTTGATAGGAGGTACACGATCGGGAAGCTGCTTGGACATG
GGCAGTTTGGTTACACCTATGTGGCAACCGACAAGGCCAATGGAGATCGTGTTGCTGTCA
AGAAGATTGAGAAGAACAAGGTAGTGGTTTTGGTTTGTTTGGTTGTTTAATGAATTGGGT
GTGTTTTGTTTGGTTTGAATTCTGGTAAAAATTGAGTCTTTGGTTTGTTTTTGGATCCAA
GATTTTTTGGTGGGGGTGGGTGGATATGTGAATATTCTTTGATTTTGGGATTTGGTAATG
GTGATTTGATTTGATTTGAGGATTCTAAGGAAGGTTTGTTTTTGTTTTGCTTTTCATTGT
AGATTCTCTGCTTTTGTTGTTTATTTATTTTTGTGAATTTTTAATTAGGCTTGCCTTTAC
TTGATAATCAATTTTATCCGGTTGATGGTACTGTTGTGGGTGTGTCAATTGTTGTTGTTG
GTGTTTTTGTGGATAATTTTGTCAAGGCAGGATGTTTAAAGTTGTATAGTATCGTTGACT
TGGGATTCTTGTATTAGTTTAACTTGATTAGAAGGATTGCAAGTTGGTGCGCATTGCACA
GATGATGGACTTGTTTGGAGGATTAATGTTTGCGCTTATTGACTGCTTTGAGTTTAAGTG
TTTCGTGCAATGTTTTTCCCTTAATTTAGTTGTTCTCAATGCTGTTTGTTTGTTTTGTGT
ACATGCTCGATTGTCGGTCACTTTATTTAGAGAAGGAAAATGTTGCCACTGTAACAGGTA
AAAGGTCTGTAGGGTGTTTTGATTACAATCGTGGAAAATCAATCAATTTTAGGTAGATAG
GTGGGATATAGAGACTATAGAGCAGGCAGTGTGAAGGGGGATGAGTATTGATAATGTGGA
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TATTATGGAGATCTCCCATGAATTTTTCTTTTTCTTTTTGTTTCTATTGCTTTCTGTAAA
TAGTCTGGAATGTTTCAAACCAGTCCTTGGCTTTTGTCACAGATGATTCTTCCTATAGCT
GTTGAGGATGTCAAGCGAGAGGTCAAGATTTTGCAGGCCCTTACTGGTCATGAGAATGTA
GTTCAATTTTATAATGCATTTGAAGATGACTCCTATGTATATATAGTAATGGAGTAAGTT
TCAAATTTACAATCATTTTGAGTTTTTCTTTTATAAATTTCAAATTTACAATCATTTTGA
GTTTTTCTTTTATCAAACTATTCTATGGTTTTGTCTGCATAATTCATATACTTGCACTGT
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TGTATTGCACTCTTATTCATACAAGTCCAAAACTGTTTTTTTTTCTGCAATGTGTACATC
ACATCTCTTTTGCCTTTTCAATCTTTATATTTTCATCTGTTCTATAAAATTGATCTCTTC
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