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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006500 | Chr11 | 1776660 | 1782390 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006500.m1 | 28 | 66 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 32.2 | 1.00E-07 |
LITCHI006500.m1 | 167 | 226 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.2 | 7.20E-08 |
LITCHI006500.m1 | 167 | 187 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.7 | 1.6 |
LITCHI006500.m1 | 292 | 352 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.5 | 2.40E-07 |
LITCHI006500.m1 | 413 | 473 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 43.4 | 2.40E-11 |
LITCHI006500.m1 | 462 | 484 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.9 | 1.4 |
LITCHI006500.m1 | 529 | 589 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.6 | 2.40E-07 |
LITCHI006500.m1 | 554 | 613 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.9 | 3.70E-07 |
LITCHI006500.m1 | 602 | 661 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.3 | 5.80E-07 |
LITCHI006500.m1 | 796 | 1010 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 112.4 | 2.30E-32 |
LITCHI006500.m1 | 801 | 1058 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 117.5 | 7.30E-34 |
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>LITCHI006500.m1 ATGAACTCTCTTGCTGTTTCTCTTCTCATTGTTTGTACAATTACGTTTTTATCCTCCGCC GACCGTACACCTGAAAACCTATCAGAAATCGAAGCTTTGACTTCCTTCAAATTGAATCTC TACGACCCACTTGGCGCTTTAAACGGCTGGGATCCCTCCACGCCTGCAGCTCCATGCGAT TGGCGTGGAGTCGTCTGCACTACAACCACTAACAAACGAGTCACCGAGCTCCGCTTGCCT CGACTCCAACTCGCCGGCCAACTCAGTGACCGGCTTTCGGGTTTACGCATGCTAGAAAAA CTGAGCCTGCGTTCCAACTGGCTCAATGGCACCATCCCTCCATCTCTCTCCCAATGCACG CTCCTCCGCGCTGTCTTCCTCCAGTACAACTTCCTCTCCGGCAGACTCCCGGCGGAACTC GCCAACCTGACGAGCCTCGAGATCCTCAACCTCGCACAGAACAGCCTCTCCGGCCAAATC TCCGGCAACCTCCCGACGAGCCTCAAGTACTTGGATCTCTCCTCCAACGGATTCTCCGGT CCGATACCTCCAACAATCTCGGACCTATCTCAGCTCCAGCTCATCAATTTATCGTACAAT CAATTTTCTCGCGAGATACCAGCGAGTTTAGGACAGCTTCAAAATCTCGAGTATCTCTGG CTGGACTTCAACCGTCTGGAAGGGACACTGCCGTCGGTGATCGCCAACTGCTCGTCGTTA GTCCACTTGAGCGCCGAAGGCAATGCGCTCGGGGGCGTCATTCCGTCGGCTATCGGAGCT CTGCCGCAGCTCCAAGTGGTCTCCCTCTCGCTGAACAACCTATCCGGTAGGGTTCCGTCG TCAATGTTCTGCAAAGCCTCTGCTTCTCCGCCGCCGTCAATAAGAATCATACGGTTAGGG TCCAATTCCTTCACCGACATAATCGGACCCGAATCCGGGTCATGTTCCAGTGTTTTGCAG CTGTTGGATCTCCAACACAACCGGATTCGAAGTGTTTTTCCAGGATGGATGACAAAAATC ACTACTTTGACAATGTTGGATTTGTCAAGTAACATGTTTTATGGTCAGATTCCAGCTGAG ATTGGTGGTTTAACGAGATTGGATGTTTTTAAAGTAGCCAACAATTCACTCACTGGTGTA ATCCCTGTTAAGATAAAGCAATGTGCTTCGCTGCGGGTACTTGATCTTGAAGGGAATAAG TTTTCGGGACAGATTCCTTCCTATTTGGGTGATATGAGAGGTTTAACGACTCTAATTCTT GCTGGGAATCTGTTTTCGGGTTTGATTCCTGCAAGTTTTGGGAATCTTTCGGAGTTGGAG ACTTTGGACTTGAGTCACGATAACTTGAGTGGAGGGTTTCCTGCGGAGGTACTTGGTATG AGCAATTTGACGACTTTGGATTTGAGTGGGAACAAGTTGGCTGGTGAAGTGCCTGCCAGC GTTGGGAACTTGAGTCGGTTGAGTGTCTTCAATCTGAGTGGTAATGCGTTTTCGGGGCGT TTACCTGCTAGTTTGGGGAGTCTGTTGAGGCTGACTAGTCTTGATTTGAGTAAGCAGAGC TTTGCTGCGACTTTTGGGTTTCTCCGGTCGCTTGTGGTTCTCTCATTGTCTGATAATCAC ATTTCTGGGATGATACCAGCTGAGATTGGGAACTGCTCTGGGCTTGGAGTGCTTGATTTA AAGTCGAATTCTTTGACAGGTCACATTCCTGATGAGGTCTCTCAACTTGGGAATTTGAAT GTGCTTGATTTGGGTAAAAATAATTTGACTGGAGAAATCCCTTATGGTATCTCCGAATGC TCATCTTTGCGGTCTTTGTTACTGGACAGTAATCATCTCTCAGGGAGCATACCCGCCTCA ATGTCTAATTTGTCAAAGCTAGCAGTGTTGGATCTCTCTGCTAACAACTTAAGTGGGGAG ATTCCAGATAATCTAACGGACATAACCGGTTTGGTGTATTTCAATGTCTCGAGTAATAGA CTAGAAGGCCAGATTCCGGTATTGTTGGGTACTAGATTTAACAATCCATTAGATTTTGCG AATAATCAAGGTTTATGTGGAGAGCCACTGGGGCGCAAATGTGAGAACTTGGGTAATAAA AACAGGAAGAAGAGGTTGATTTTGTTGATTGTTATAGTTGCATGCGGAGGCTGTTTGATG GCATTGTGTTGTTGCTTCTACATTTTCAGTCTCTTGAGGTGGCGCAAGAAGCTCAAAGAG GCTGCAGCTACGGAGAAGAAACGTAGCCCAGCAAGGGCGAGCTCAGGAGCAAGTGGGGGG CGTGCAAGTACGGATAATAATGGAGGGCCGAAACTGGTGATGTTCAACAACAAAATCACG CTTGCAGAAACCGTGGAAGCAACCAGGAATTTCGATGAGGAAAACGTGCTTTCGAGAACC CGATATGGTCTCGTTTTCAAGGCCTGCTTCAATGACGGAATGGTGCTCTCAATCCGGCGC TTACCGGATGGATCGCTAGACGAAAACGTGTTCCGGAAAGAAGCTGAATTCTTAGGCAAA GTCAGGCACCGAAACCTGACCGTGCTCCGCGGATACTACGCAGGAGCCCCGGATTTAAGA CTCCTTGTCTATGACTACATGCCTAATGGAAACCTTGCTACTCTGCTCCAAGAAGCATCA CACCAAGACGGGCACGTCCTAAACTGGCCAATGCGCCACCTCATAGCCCTAGGCATAGCT CGAGGTCTGGCTTTTCTACATACATCAAACATGGTTCATGGCGACGTGAAGCCGCAGAAC GTCCTCTTCGATGCAGATTTCGAAGCACATTTATCTGATTTCGGGCTAGACCGTCTAACA ATCCCAACCCCAGCAGAGGCCTCCACTTCAACAACCCAAGTAGGCACATTGGGTTACGTT TCCCCGGAAGCAGTACTAACCGGGGAGACCTCCAAAGAGTCAGACGTATACAGTTTCGGA ATAGTACTACTTGAATTACTAACGGGAAGAAGACCCGTCATGTTCACACAAGACGAAGAC ATTGTCAAGTGGGTCAAGAAACAACTCCAAAAAGGCCAAATCACTGAACTACTAGAACCA GGCTTGCTTGAACTCGACCCAGAATCATCAGAATGGGAAGAATTCCTACTTGGAGTCAAA GTTGGGTTACTCTGCACATCACCAGACCATCTTGATCGACCCACCATGTCCGATATCGTC TTCATGCTAGAAGGCTGCCGTGTCGGCCCCGATATTCCCTCCTCCGCCGACCCCACTACC CAGCCATCACCCGCATAA
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>LITCHI009641.m1 ATGATGCATGAGTTTCGCCTTCCAAGCTCCAGCAATAATAGCAGTAAGAGTGATGGTAAA ATCAATCTCCAAGAAGCGGAAGTATGGACAATATGTAGAATTTTCAAGCGAAATGTATCA CAGAGAAAGTTGTACACCCCAGATTTGAGATCATCAGATCAATCAAAACGTGATTCAACA GTACCACAACAAGGTTCTACAATAAGCAGTGCAGATACTAGCAATATCATACAACAAAAT GAAGGCTACATTAGCTTTGAAGCTCCTGTTCTTCATCATATGATCAATAAGAAACCTGTA GTTAATCATTATCCTCATCATCATCATTATCATCAACACCAACATATCAATCAGACGGTC AGTAATATCCCAAACCTGGTAAGTCCTGTAGATCAGCAGTTGATGGTCACCAACAACACC ACCATAGTTCATATTCCTCCACTGCCGCCACCGCTGTCGATGGCACCCTCGTCTTCAACC TTTCAAACTAACAATCCATTTGGAAACGATCATCAGCTCTTCACGGGTGATCAGCATTGG GATGAACTTAGGTCAGTAGATGATGATGATGAAGTTCATGAGCTTCCAGGGTTTCGATTT CATCCAACAGACCAAGAACTTGTCGGGTTTTATCTTCGACGAAAGGTTGACAAGAAACCG CTGAGAATTGAACTCATCAAACAGATTGATATCTACAAGTTTGATCCTTGGGATCTTCCA AAAACAAGTACTTCACCAGACAAGGAAGGCTATTTCTTTTGCAAGAGAGGGAGAAAATAC AGAAATAGTATAAGACCAAACAGAGTGACCGGTTCTGGATTTTGGAAAGCAACCGGCATC GACAAACAGGTGTATTCACACGGAGGAGAAGGTCCAGACTGCATTGGACTCAAGAAAACT CTCGTTTACTACCGAGGAAGTGCAGGCAAAGGCACCAAAACTGATTGGATGATGCACGAG TTTCGCCTTCCGAGCTCCAGCGATAATGGAACCAAGAATAATGCTAAAATCGATCTCCAG GAAGCGGAAGTATGGACAATATGTAAAATTTTCAAGCGAATTGCATCACAAAGAAAGTTG TACGACGCAGATTGGAAATCATCACATCAATCGAAACATAATTCAAGAGTACTACAACCG AGCTCTGGTACTACTAGTACTACTACATACAGTGCAGATACTACCAGCTATATACATCAA CAGGAAGGTTACATTAGCTTTGAAGCTCCTGTTTTTCATCATCAGATCAATAAGAAACCT AGAGTCGATAATCATAATCAAATCAATCAGACGATCACGAATATACCGAACCAGGTAAGT ACTGTAGATCAGCAGTTGATGATCACTAGCAGCTCCATAGCTCATAATTCTCCGCTGCTG CCCTCGATGGTGCCCTCTTCTCCAACCTTTCATGCTAATTATAGTAATCTACATGGAAAT GATCATCAACTCTTCACGTATGATCAGAATTGGGATGAGCTTAGATCAGTTTTAGATCGC TTTGGTTTCGATCCTTCTCTTCTGTTGGATAGATAGGAGGTACGTATGTGCATCTAGTTA CATATTATTATTATTTACATGAAAATTCTCAGGTGCGGATGCCTATACGGAAGTAAAATG TGTATTTGTCTTTTTCAGTGAACTTCTTGTGTAAAGAATTTCACTAGAAGATAAAATAGT GCACTTTACCGTCACGGATATATTAGTTATGACATTCAATAACATTAATAAATCCTTAAC GTCCGCACCAGAGGAGAACTAATTATTATATTGTCG
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>LITCHI009641.m1 - Up_Stream_Len 2000 TATAAATAGGGTTAATATTATTCCAATTCTGTAGGGTCGATCCACCAAGTAAATAAATAC TAAAAGTTCTTTTGCATGCTTTTTTGACCCAAATTGAGTTACTGTGTCACACTTTATTTT TATTTTTTTAATCGGGACGGATCTATAGGACTATTGAGATCAATCGAAATAGAAATACTA GTGACGTGACTCGAGATACTGTTCCTAATTGAGAGAAATCCAACCACATGGAGATGAAGG GAGGCCTACACAAGAGTACAAGGTCAACCCACACATAATATTGAGAGAATTGTTACCATC ATCATCATCATCATCATTATATATAAATTATTTGGATTTTACGGTGGGTGTCGAACCTTG TGCATGGGGCTGTGGGCCAGCAGCCAAAGACTGTCACAGTGTTATTGGCACATAGATATT GTATAGAGTTAATAAACTAATCACCTTGACTTAAGCATATTCAAACCATGATCAATTCGT CTAAGACTTATTCCAAATATTCTTATAAAGGCTTGGCCTTTGGAGAGATAGTCAACATCA AGAAGAGAGAGATCAGTCAAGACGAATGACTTGACCAGATAAATGAAAACCAACTCTCTA TCACAAAGACCTTTTAATTTATTTTGAAACTTTTTTCACATTATATTAAAGCAACCAACG AGTTTCCAAGCTATCTCTCTACTGTGTTACAAGTACTTGATCAGAAAATAAGAAGAATCG ATCATGATCAGCTCCAGCGACCAAAATATCACTACTCGGAATATTATTGTTAAAGAAGAT GATGATCATGAAGAAGTTGACGAACTTCCGGGGTTTCGATTTCATCCGACGGATGAAGAA CTAGTCGGGTTTTATCTTCAACGAAAGGTTGACAAGAAACCGTTGAGCATCGAACTCATC AAAGAGATTGATATCTACAAATTTGATCCTTGGGATCTTCCAAGTATGACATATATGTTT ATTATTCAAAGTCTTTTGAATTTAATTTCTTTTAAAGAAATTTTAGTCTAGCTAGGGTTT ATTGCAAGTTGATCATGAGTGAAGCTAGTAATCGAGGCCATAAATAAGAGATGGTCTGGT TTGTGTTATTAATTAAGCTGATGAAGTGATGCTATTTGTCATCATAGAAGAGATCAGAGT GAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGGTGTTATTTTTTATTTTGTTGTTATACTTACAG GTAATTATAAGACTTAAAGGACGATATATATCTTCTCTTCTTCGACTTTAGATAATCAGC TGAATATGAAATAATACAAATACAATTTCATGCATGCAGATTTTACACGAAGTAGTATTT TTTAGAGAAACCCTAAAACAGTTTTTATCCATGTAAAACCTTTCGTATTCTAATTAAGAA CTTTTTGAAGCTAGTTTAATTCACTTTGTTGGATTAATCACTTGCTTGTACAAAAACCCC TTCTTTTTCTTGTAAATCGAAAGCCATTTATTGGCTTCTTCGAATTTCATATCACCATTT CAATTTGGTCATTTTGATGTTTATATCTTGATTCTCGGTTGATCTGATTTTTTTTAGTGT TTTTTTTTATGTCTATGATCGATTTATTAACAATGTTGATTTATATCTTCTCTTTATTAA CAATGTTAATGCATCACTACATATCTTTAATTAGCACAATACATTAAAAAAAAAAAAAAA AGGTGTTAGCATAAATTTGTATCAGCAAAATTCTCGATTCGTCTTTAATATTTTATCAAC ATATATATCTACAATTTTTTTTTTCATGCATGCAGAAACAAGTAGTACACCAGACAAGGA AGGTTATTTCTTCTGCAAGAGAGGGAGAAAATACAGAAACAGTATAAGACCAAACAGAGT GACCAGGTCCGGATTTTGGAAAGCAACCGGCATCGACAAACAGTGTATTCACAAGGAGGA GAAGGCCAGACTGCATTGGACTCAAGAAAACTCTAGTTTACTACAGAGGAAGTGCAGGCA AAGGCACCAAAACTGATTGG
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>LITCHI009641.m1 GenomeSequence - ATGATGCATGAGTTTCGCCTTCCAAGCTCCAGCAATAATAGCAGTAAGAGTGATGGTAAA ATCAATCTCCAAGAAGCGGTAAGCAAGCAGAAATTATTAGTACATATATAGGCTACTAAA TGTTCCTAGTGTGAACGTTTACATCTTTTTCTCTATCAATAAGTGGTTGTGAATTATCAT GATCACGATATAATTGCAAGCATGAAGAATTCTTATAAATAGATATTATCAAAATACCCC TAAAAATGAAACTAATATAAAATCACGTTTTTTTTTATATTCAAAAATAGGGTTCAATGA TATTATTTTTTATTTTAGGGGATTGTTTATGTTTTTTCCTTATTATAAATAGTTGCTCAA TGTATCATTCACAATTGAGAAATAGTCTATTTGATTTTATTAAATTATAATAGAGTTTGA TAGGTGATTGCAAGTAAGAACAATAAGCTTAATGTTAATGCTAAGATTTCAACATGCTTT TAAATGTATTTGAACAAAATTTTGACTCTCTGCACAAGAATTAATAATGAAACATGCATT TCAAGTTTGATATCCCAAAAAAAAAAAGAAGATAGTTTTAATTTGTAAGGAAACAAGAAC TTTAATAACAAATAGTAGTTGTAGGGCAGTCATCATATGTTTTTGAGTAATCATCATGTA TGATTACAAATCTCGTATAGTGATAAGACCTTCAATCAATACATCTGTTACGTGATGTGT ATGTTTAATTACTTTTTTTATCCATTATTACATGTTTTTTTTTTTGGCTTATTTCATAGG AAGTATGGACAATATGTAGAATTTTCAAGCGAAATGTATCACAGAGAAAGTTGTACACCC CAGATTTGAGATCATCAGATCAATCAAAACGTGATTCAACAGTACCACAACAAGGTTCTA 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