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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006467 | Chr11 | 1495489 | 1499453 | - | Cold shock protein 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006467.m1 | 8 | 72 | PF00313.25 | CSD | Domain | 81.9 | 2.40E-23 |
LITCHI006467.m1 | 121 | 137 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 29.5 | 5.70E-07 |
LITCHI006467.m1 | 152 | 167 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 32 | 9.30E-08 |
LITCHI006467.m1 | 177 | 198 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 16.2 | 0.008 |
LITCHI006467.m1 | 179 | 196 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 27.6 | 2.30E-06 |
LITCHI006467.m1 | 204 | 224 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 12.6 | 0.11 |
LITCHI006467.m1 | 207 | 223 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 28 | 1.60E-06 |
LITCHI006467.m1 | 245 | 261 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 10.2 | 0.62 |
LITCHI006467.m1 | 246 | 262 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 34.8 | 1.10E-08 |
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>LITCHI006467.m1 ATGGCACAGGTGACGAGATCGACGGGGAAGGTGACGTGGTTCGATGACGTGAAGGGGTAC GGATTCATCAAGCCTGACGACGGAGGAGCGGATCTGTTCGTCCATCAGAAATCCATCAAA TCCGACGGCTATCGCACGCTCTACGAGAATCAGTCTGTCGAGTTCGATGTCCAGCTCGAG GCTGATGGAAAGTACCAGGCCCTTGATGTCACGGCTCCTGGTGGCGCGCCGATTCTGTCG CCCAAGAAGGAGACCGGATTCGGCGGAGGAGGACGCGGTGGAGGAGGGCGTGCTGGTGGT GGTGGAGGATTTGGCGGGAATTGGAAGAGTGATGGAAGGAGGAACGGCGGTGGTGGTGTT GTGTGTTATAATTGTGATGGAGTTGGACATTTGGCGAGGGAGTGTACTAGTGGAAGAAGG AGCAGCGGAGGAGGAGGAGGCGGAGGTGGTGGTAGTTGTTATAACTGTGGCGATCCTGAG CATTTTGCGAGGGATTGTCCACTTCAACAAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAACC TGCTTCAAGTGTGGCGGTTTCGGGCACTTGGCAAGGGAATGCACTAACAGAGGCGGAGGA GGCGGCGGCGGCGGCGGACGTTGCTATAGTTGTGGGAAGTCAGGGCATTTGGCTAGAGAG TGTACTGAAGGAGCCGCCGCTGGCAGCGGAGGAGGCGGTTACGGGAGGTTCGGAGGCGGC GGTGCTGGTGGCTCCACCTGCTTTAATTGTGGGAAGCCAGGACACTTCGCGAGGGAGTGC ACTAAGGTCTCTGCTTGA
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>LITCHI006467.m1 GenomeSequence - TTTAGATGGATTGTATGATATATATGTACTTGTAAAGTATATCAATATTTTACTTCAAAA AAAAAGAAAAAAGTATCAATATTTTAGATGGATTGTATGATATATATATATATATATATG ATGTGCCAGACTGTGAGTGGTCGAGTGCATCATCTTGGACGCACTCAAAATTTCCGCCCA ATTAAATCGGGCTCCACGGCTGCTTATCAAGCACGAGACTACACCAGATCACTACAAACA AACAAACGCAAAAATCGTGAACTCGAAGAATTTGTAGTATATATACATATAAAGATGAAG AAGAAGCAGAGAATCGGTTTCAAGCTTGGATTAGGGTTTTTGATTTTTAGCTTTTCTTGA AACCTTTTAATTTTATTTTTTTTTGGGTTTTCTCCCAAAAAAAAAAAATCTAGAGAGAGA GAGAGATCAGATGGCACAGGTGACGAGATCGACGGGGAAGGTGACGTGGTTCGATGACGT GAAGGGGTACGGATTCATCAAGCCTGACGACGGAGGAGCGGATCTGTTCGTCCATCAGAA ATCCATCAAATCCGACGGCTATCGCACGCTCTACGAGAATCAGTCTGTCGAGTTCGATGT CCAGCTCGAGGCTGATGGAAAGTACCAGGCCCTTGATGTCACGGCTCCTGGTGGCGCGCC GATTCTGTCGCCCAAGAAGGAGACCGGATTCGGCGGAGGAGGACGCGGTGGAGGAGGGCG TGCTGGTGGTGGTGGAGGATTTGGCGGGAATTGGAAGAGTGATGGAAGGAGGAACGGCGG TGGTGGTGTTGTGTGTTATAATTGTGATGGAGTTGGACATTTGGCGAGGGAGTGTACTAG TGGAAGAAGGAGCAGCGGAGGAGGAGGAGGCGGAGGTGGTGGTAGTTGTTATAACTGTGG CGATCCTGAGCATTTTGCGAGGGATTGTCCACTTCAACAAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGG AGGAGGAACCTGCTTCAAGTGTGGCGGTTTCGGGCACTTGGCAAGGGAATGCACTAACAG AGGCGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGACGTTGCTATAGTTGTGGGAAGTCAGGGCATTT GGCTAGAGAGTGTACTGAAGGAGCCGCCGCTGGCAGCGGAGGAGGCGGTTACGGGAGGTT CGGAGGCGGCGGTGCTGGTGGCTCCACCTGCTTTAATTGTGGGAAGCCAGGACACTTCGC GAGGGAGTGCACTAAGGTCTCTGCTTGATTGATTAATTAATTGATTGATTGATGATCTTT TGGTTAATTGATGAAGAAGAAAACAAAACAAAAGAAAAAAAGAAGAGAAATTTAGCAATA GTAGTATATAGTTTGGACGAGTTGGAGTCGTTGGGCTTATATAACATTTTGGGGTATTTT GTGGGTTGGAAATTGGAATTGATGATTGATAGATGATAATACGAGGGAGAGGGAGGGTCT CAGGTTTTGGTTTGGTTTGTTTGGAGAGTAGTTCTTTTAGTTTTGATACGTGTATGAGGT GGTTCGGATATGGTTTTAATATGTTCTGTTTTTTCTTTAACCTTTTTGATTTGATTGGTT TTGGTTACTTGGGTATATCTTTCTTATGGAATAGTTGTTATATCTCCAGGTGTGAATTCT TGTTTTGGTTGTATGTGTGTTTTGGATATTTGGGTGTTTGTTGTATTATGTGTTAGTGGA TTGGAATTTGGATGAGTGTTTGTGGTTGCTGATGTTGGTTTGTTGCAGTGGATGTTATTG CGATGCTATATGTATATGGTAGGAGTTTGCATGGTGATCGTATAATGTGGATTACTTGAG GCTTGTATAGCACGTGTAATCCTAGCAATCTTACTATATAGAAATCTAGGCTACGTAATT GATAGGACTTTTTGTGAAGATTGTATCTTTGGATTACTTGATGTTGGTATAGCACGTTTA ATCATAGCAACTTTATTATTTAGAAATCTACGCTATGTAATTGTTAGGACTGTTTAAGGA GATTGTATCTTTGGATTGCTTGAGGCTTGTATAGCATGTGTAATGATAGCAACCAAACTA TAAAAATAATAGGCTATGTGTTTGATAGGACATTGTATGGAGATTGTATGGCATGGACTA CTTGAGGCTTGTATGGCACGTGTAATCATACCACCTAACTATAAAGAAATCTAGGTTATT TATTTGATAGGACTTTGTACGGAGATCGTATCACCTGGATTACTCAAGGCTTGAATAGCA TGTGTACTTATAACAACCTTACTATAATTAAATGTAGGCTAGGGAAAGCTGCTGGTTGTT ACATGACTCAGGTAGTAATTTTTGTTGAGTCAAAAACGATTTCTTATTAAGACAAATCGG ACTATTGGTCTGATGGGGAAGGAGATGATACTATGATACTGGATTTTAGAGTCCCTATAC GCTGTATACAATTAAATAATGTGTTATGCGGAATGCAAAAAGGCTTTCGCTTTAAGTGAG CTGAACCCCGCAACATAATGTGAGCTGTGACTGATTTTTTACGTCCTTAGCTGCATTAGA GGATTAGGCAATATTAGTTTATGAGCATTGAATAAGTGTTAATTTATGAACATTGATTTA ATTTTCATTACAAGCTATGTTTTTGCCACATCTAGTCTTGCAGTCTTTTTTACTGTGTCC TATCCAATCACAAGTCTCTTGTTATCAGGATCCGATCCTCTCTATGTTTGGACTTCGTAA TTGGTCTCAATTTGTTAGTTTTAGAACTCTCTCTGTGCTTCAGTACAGAACATGATGATC TTTCTGCCTCTGAGCTTTTGTCTTCAAGAATGAACAGTCGTGCTTTAGTAACTTAAGCAT TTAGAACTGTTGAAGCCTGGGTTTTGAGGTGAGAGATGGGTTAAGTTCTGGGTACTGTGA CTTGTTCTGCTGAATATACTTGATTACAAATCAATCTTCAAGGTTCTGTAAATTACAGTT GCATTGCATATGGGAACTACGTTAAGGAGGTTCTTGGACAGAAGATCATATAGATTGGAG GATATCATTGTTTGTTTTAAGTCTCTTCTTCTTACATGGGTATGTTTCTTAGGATGGATG AATAGTGGTAGCAATATCGCATTCACCAGCAATTCCCTCTTTGTCATCCACATGAGGGAA ACCCCTGTGAGCTCATGGATAGATTCACAATTCTCATGCATCTAAATCTTTGTTTTAGTT GTGTTCCAATGGCTCTTGAGCCATAAGTATCTTTTCAGTGACTGCTTTGAAGATTAAACA ATGAGTTTTACTCTGCTTTGTTCTGGGCATCACATGTTGTGAATAACTTGAAAGGGATGT GTATTTCTTTCTGATTCAAATGGTTGCTGATTTATCTATTGGGCATTTTGCAATGAGAGA ATATGATAGGTAACGGCATTCTTCTTTAAATAATGAGAATCAAATTACTATTTGGCTAGT AATTAGTAATCCTAAAACGTTCCCAGTTAAAATATTATTTCTAATCGCGAATGAAATTGA AAGGGAATCAATTTTCATTAGGGATCTCTTACTCGTTCGGATTTGTGATTAGTTTATGCG CCTTTTACATCTGTTTATGGTAGGTCTCGTGGGCCTGGTTAAGAAGTTTTGCTAACTGTA GGACGTTGTAAGATCGACTTGAACCGATTTGGGTCCATTTGTATTTGTCCAATTGAACTT TTAGGTTTGGGCTTGTGTTGGCCTTCAAACTAGCATAAATGGCTACAAGTACAACTGCTG TCTTTCTTATGGCCCATCGAAGTTTCCAACCCAGTAACCTCGTGGGTTGTGAGGACATCA TTTCAAAGTTTAACCTGTCAATGTTGTTTAGTTGTCAAGTGGGTTTCTTGTGATGTTGAA ATGAGCAAGTGGGTTTCTTGTAATGTTGTAATGGCCTTCTCATGGTTTATCTTGGGCGTA GTTTGACACCATTAATGACGAGTAGTTAAGTTAATTTATAATGTAAGAGAGTTTTTCTAC CCAAG