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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006467Chr1114954891499453-Cold shock protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006467.m1872PF00313.25CSDDomain81.92.40E-23
LITCHI006467.m1121137PF00098.26zf-CCHCDomain29.55.70E-07
LITCHI006467.m1152167PF00098.26zf-CCHCDomain329.30E-08
LITCHI006467.m1177198PF13917.9zf-CCHC_3Domain16.20.008
LITCHI006467.m1179196PF00098.26zf-CCHCDomain27.62.30E-06
LITCHI006467.m1204224PF13917.9zf-CCHC_3Domain12.60.11
LITCHI006467.m1207223PF00098.26zf-CCHCDomain281.60E-06
LITCHI006467.m1245261PF13917.9zf-CCHC_3Domain10.20.62
LITCHI006467.m1246262PF00098.26zf-CCHCDomain34.81.10E-08
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>LITCHI006467.m1
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>LITCHI006467.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI006467.m1 GenomeSequence - 
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AATTAGTAATCCTAAAACGTTCCCAGTTAAAATATTATTTCTAATCGCGAATGAAATTGA
AAGGGAATCAATTTTCATTAGGGATCTCTTACTCGTTCGGATTTGTGATTAGTTTATGCG
CCTTTTACATCTGTTTATGGTAGGTCTCGTGGGCCTGGTTAAGAAGTTTTGCTAACTGTA
GGACGTTGTAAGATCGACTTGAACCGATTTGGGTCCATTTGTATTTGTCCAATTGAACTT
TTAGGTTTGGGCTTGTGTTGGCCTTCAAACTAGCATAAATGGCTACAAGTACAACTGCTG
TCTTTCTTATGGCCCATCGAAGTTTCCAACCCAGTAACCTCGTGGGTTGTGAGGACATCA
TTTCAAAGTTTAACCTGTCAATGTTGTTTAGTTGTCAAGTGGGTTTCTTGTGATGTTGAA
ATGAGCAAGTGGGTTTCTTGTAATGTTGTAATGGCCTTCTCATGGTTTATCTTGGGCGTA
GTTTGACACCATTAATGACGAGTAGTTAAGTTAATTTATAATGTAAGAGAGTTTTTCTAC
CCAAG