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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006467 | Chr11 | 1495489 | 1499453 | - | Cold shock protein 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006467.m1 | 8 | 72 | PF00313.25 | CSD | Domain | 81.9 | 2.40E-23 |
| LITCHI006467.m1 | 121 | 137 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 29.5 | 5.70E-07 |
| LITCHI006467.m1 | 152 | 167 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 32 | 9.30E-08 |
| LITCHI006467.m1 | 177 | 198 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 16.2 | 0.008 |
| LITCHI006467.m1 | 179 | 196 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 27.6 | 2.30E-06 |
| LITCHI006467.m1 | 204 | 224 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 12.6 | 0.11 |
| LITCHI006467.m1 | 207 | 223 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 28 | 1.60E-06 |
| LITCHI006467.m1 | 245 | 261 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 10.2 | 0.62 |
| LITCHI006467.m1 | 246 | 262 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 34.8 | 1.10E-08 |
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>LITCHI006467.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTGCTATAATGACACACTACTAACATAATTTCTCCTTTCGTAGTAAAAATGATTGAGATA ACACTCTAAATTGATTGTAACAAAATTAATTTCTCCTTCTGTAACATTTCTACATAAATA ACCATGATCTAGAAATGTTAATCATCTTTTGAAGAAAAGTTGCTATAATGACACTAATAT AATTTCACCTTTTTCAATCCTTGTTTTACCACATTAAGAAACTATTAAGATTATCCTATT AATAGTTTATCCTACATCACATTTACAAGATCAAACATTTCTTTTAATCTTAACGTTTTT GCCGGGCGTTTTCTAATTTAGTGACCGGTTAATTCCAGCTGAGCGTTTTCTAATCTAACG AATGATTAATTCCAACCCTATCATACTTTTCTTTTGTTGAGATTATTTCAACAGTATCAC GCAGTTTTGAATGATGAATTTTATATTTTTGTTAAAACAATTCTAATAGTATATATAATC GATATCAGTCATAAATTGTTGATCATTAAATTGATTAAAAATCTTTTAAAAAATTATCCT ACATAACTTTTGTGAGCACAAAAATCTCTCGTAAACTAAATTTTTTGCCCAGCTTTTTCT AATCTAATGATAAAATAATTCAAATCATACACATTTTCATTACTATGTGTTTTATAACAG TATCATATGTCTCTATTGTTGAGATTATTCCAACAATAATCAAACAATTTTTGTTGTGAC TTCTATTTTTCCCTGAGATGATTTCAACAGTTTACTGATACCAATCCCAGAACCATTGAT CATTCGACAACTAAAAACACCGTTGGGAAGATTATCCGGAGTGTTCAAAGTTCTCTCTCC AATCCTTATCTTTCTTATTAGATTTTCCTAATCTAACTCGCACAATTCAAACTTAACCTT CACATGAACATAAATAAAATTAAACTTTCGTTTATTTTTAGAAAAATTACACTTCTATAG TTTATTTCTTCCTTTAACGAAAACAACTAAAAAGGAGAAAAACATCCTTAATACACGCAA TTATATGCAGATATTCACATAATCACGTGATCAACAAAAATATCAATCAAAAAGCATACA AACACAAACACCTCCCCCAAACCAAATCAAAGACGCCACAATAACCGTTCGATCAAAAAT TCGAATCCGATCAACGAAGCCGAGGCAACTAAGTGACAACACTGACCGCTACACTATCAG ACGTGGGCTGGGCCCCCACTTAAACAAAAACTCGGCTACACCAGTATCACTGCACCCAGC CAATCAAAAGCTGACAAATTCTAAAATCAAAGTTTGAATTTTCTCCAATATTATTAATTT TTTTAAGATAAATTTGAGTTAATTGAATTGCCTTTTTTTAAATAATAATAAATTGAATTA TTTACCTATATTGCATTATTTATTATTTTTTTAGTCCAATTAGAATAAATTTATTATATA TGATTATAATTAAATAAGTTAAATTATATTTACAATAATAAAATATATTTAGTTATTTAT TAAATATAATAAAGATATAATAAATAATTTTCAGGAACAATCACATTTTATCTTGTCGAG GATACCGATATTTAGATGGATTGTATGATATATATGTACTTGTAAAGTATATCAATATTT TACTTCAAAAAAAAAGAAAAAAGTATCAATATTTTAGATGGATTGTATGATATATATATA TATATATATGATGTGCCAGACTGTGAGTGGTCGAGTGCATCATCTTGGACGCACTCAAAA TTTCCGCCCAATTAAATCGGGCTCCACGGCTGCTTATCAAGCACGAGACTACACCAGATC ACTACAAACAAACAAACGCAAAAATCGTGAACTCGAAGAATTTGTAGTATATATACATAT AAAGATGAAGAAGAAGCAGAGAATCGGTTTCAAGCTTGGATTAGGGTTTTTGATTTTTAG CTTTTCTTGAAACCTTTTAATTTTATTTTTTTTTGGGTTTTCTCCCAAAAAAAAAAAATC TAGAGAGAGAGAGAGATCAG
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>LITCHI025771.m5 GenomeSequence - CCTCATTCTCAAAAGCTCGTCTTTCTCTCTCCATATCATCGCATCCTTGTCTCGATTATC AAACAAGAACCAATTACTCAAAACCAAAGTTGAAAAAAAAAACCGATTTGCCGAAAAGAA AAAGTAAACATTTTTCGTGTCAGCTTATGGTGTCCGTGAATCCGAACCCGGCCCAAGGGT TTTTCTTCTTCGATCCCATGAATATGGGTCATCCGTCTCTCAATTCTCTGCCTCTGACTA CTAATAATACGACGGCGACGGGGATGGTGAATACTACCGCTGCCGCTGCATCGGCTACCA AAAGTGCGAGTTCCAATACGATGTCATTTGCGGAGGATCCGAATAAGAAGATTCGGAAAC CGTATACTATTACCAAGTCTAGGGAGAGCTGGACTGAGCAAGAGCACGACAAGTTTCTAG AAGCTCTCCAACTGTAAGTTCTATTTCTTTATTTTTTCTATCGTGATGGTGTTTGGTGGA TTTAACTTTTCAAGTTGTGTTTGTTTGGTTGCTGTGAAAAGAATTAGCAAAAAAGAAAGA ATTCGAATCACGGATCATGTATATCGTGACTTGTTTTAGGTTTCTATAAAATATTGAAAA ATGAATCTGTTTTTAAATTTGGTGAACATGTATATTTTTGTTAGGCTTCATTTTTAGGTA ACATGAATGTTTGATTAGAATCTGTCACGTGTAGGTGCTTTATTGGGATCTCAGTCTATT GACAGCCTATTTTAATTTATCTTAATTCTTTACTGTTCATTGTATTGCAATTTGACTGTG TTTGGTGGTCAATAGTGTTTTTTCTACTTATAATCTGTAAATAAATAAATGTCTAGTTAG AGAGGATAGAAAAAAGAGAAAGAATTGAATTTTATGCTTTCTTCTTGTTATTGATTTGGA TAGACAAGAATTTCAATTAAGTTGAGCCAAACAGCATTGTTAGAATCTGATATTGTTTTT GAGGTGGTTATCTGAGTCATACTGTATATGTATATGAGAGCATGGTTTGTGTCTGTGGTA CTGCCTGGTTTCCTGTCAAATATGTCCACTGATTTGAATTTTGTTTTTCATTTGCTTCTT CTGGAGTCCAGATTTGATCGTGATTGGAAGAAGATTGAAGCATTTATTGGGTCCAAAACA GTTATCCAGGTAATTTTGATTTCTGAGTCAAATTTTGTCATGCTGCATATAAGAAGAGCC TAGCTACTATAGGATAAGCTTTTGGATGCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGT GCGCGTCTCTTTAGATGTCTTTTCATGTTAAATATTATGTTGACGTTGTTGAAGAATTCT TGTTTCACAGTTGTAGCTTACTTTTATTAGATATTTTTAGGATTCAAGCATTGGACTCCT TTCTTGAATCTCCTTAGTTCGAGCTGTTTGTGACAACTGAAGATATCATGGATCAGCCGT GTGTTCTTGGTATTAAGACATGTAAAGACTTGAGAATATTTTCTTATTACAATTACTTGG AATAGTACTAAACTCACTGTGTGGTTAATTTTACTGGTTTCTTGGTACTTTTGTCCTGTG TAGCTTATATATGATGAAAGTTATAGCATCTTATTATGTGTGTGAAAAAAATTATATGAT GTGTTGGATAGCTTCACTTATCCTATGTCACAATCTCTAATCATGCGCATGCACTTGCTT GTAATTCTGTTAGCTGGTTGATTATGCCTCTTCATTCTGTTTGTATATTAACTCTAAGCA ATCTTCATGGCAGATACGAAGCCATGCACAGAAATACTTTCTGAAGGTTCAGAAGAATGG GACAAGTGAGCATGTACCTCCTCCTAGGCCCAAGAGGAAAGCAGCTCATCCTTACCCACA AAAAGCACCTAAAAATGGTTTGTATAATGAGCAGTTCGTTCTTTTGTATCTATGTATATA TATATATATATATATACACACGTACATACACACACACTTTCTGGGTGGTGCTTGATTGTG GACTTATTTGGACTTATATCCCTTAATGCAGCAGCTCCTGTTGTATCCCAAGTTGCTGGG CCATTTCAGTCTTCATCAGCATTACTTGAACCGGGATATGTTTACGGGACAGATTCATCA TCAGGGCTTGGAAACCCGATTCCCAGTGCAACTTTGTCTTCCTGGAGTTATAACTCTATG CCACCAGTTAGTGTGCCACAAGTGACTAAAGGTATCTTCTGTCCCATGATATCTTTGCTA ACGCTTTTTTGCCCTTTTGAATATATGTAATATTGTTTATTACTAGTATCTATGTTGTTA TTGTATCTAAATAATTTGGTTTTTTAGGTGATATGGGATTGGCTGGACCAAACATTTCTC AGAATTGTTGCTACAGTAGTAGTAATGAAAGCACTCCGAGAACTTGGCCAGTTGGTGAAA CAATTGATCCGGACCACGGCAAACCAATGAGAGGTCTGTTCCCTTTGTTTGATGCATATT CATCTGGCAGTTAGACTTGAGGCATAATTTCGAATATATGATACTATCATAATCATTAGG AATTGTGTTCTTCTCATCTATCAATATAGTTAATATTATTATTGGTAACGATACTTGTAA ATTGTAGGTACAGTCTAAGATTTAGTGTTTACTATTGACTAAAACCATAATGTTCTTCTG AAGTTGATTTCTGAAACTAGCCATGTCTTTGTTATCTGAGGTTACAAAATTTTCTTTTAG CATTTTGCTTTAGTAAGGTTCTATAATGAGATATGGTTGGCCCTAGGTCCAGCTTAGTGA ATCGTTCATGTCATATTATTGAACGATGTCATTATCACAACAAATTCTTGTTTCCTGCTC ATGGAAGGTAACCTCTGATGGTTTGCGCTTAATGCTGAAAATGTGTAGGCTGCTTTAAAA ATGTGGGATGACGACAGCCTTGTAGTAGGTTTAAAGTTTGATATAAGTTTTCACTTGTTA GAATGGTTGTATGTTGTTGTGACAAGCTTCTGACAAGTGGAGCTGCATACAATTTGATGC TGCACGTCAGGTGTTGCCTTGCCTGGGTGCTTACTATCTGTCTTTTAGCATCATAAAGCA TGAAAACTGAAGAAAGTACCTTAAGGAATAAGTGCAAGGAACAACACATATTCTGGAACA TTTTATGTCTTATTCCCTGCATTGTTCATAACCCACTGCAGAATTTTTATTTTATTTTAT ATTATACTTTGTTGTGTTAATAACTTAATTCTTTGCATGATGCAGTTACGCCAGATTTTG CGCAAGTTTACAACTTCATTGGTAGTGTCTTTGATCCTGGTGCGACCGATCACATGCAGA AATTGAAGCAGATGGACCCGATAAATTTAGAAACGGTATGGTGTCTCCATTGGCAAACTG TCTCTAGTATATTTTCTTGGTCATAATAATAATGTTTTGCAGCAAAAAATTAACGTCTTG GAAGCTGCTAGCGTGCATGATTTTTCCCCCTTCTCTCCCTCTGCTCTCTTCTTTGCAGAG ATATACTATTTTGTTCTTGTTGGGAAAATGTACTTAATGTATTTTATGGCTCTTTCCCAG GCATTGCTGTTGATGAGAAATCTTGCCATCAATTTGACAAATCCTGAATTTGAGGATCAT GTAAGTGCTTTTTCTTGTTTTGAGCCTTATTTTTCTTTGCAGTTAACTGTGGTTCACTTG GGTTTATATGTTTTCTCAATGATGATCTATCAGTTTCTAATATATATACATATACACACA CACCCCCCTTAGTTCTTCTCAAGAAAAGTTGTCATGATTTACAAATCTGAACTTGTGGCA TTCATTAGTTTCATTTTTTTTATCATTGGATATCTGCTGTCCAAATTTTTCTTTTGTGAA TTTGGCTTAATTCTCCTGATAATATTACTGGGATTGGTGTATTCTGAAACAATGTTTTCC TTCTTTCCAGCACTTGTTATAGCATAGGAATTTGAGTAATAGAATTTTATGCGTATCTCT AATTAATACTTATCACGCTGAATACAGAAAAAGCTGCTTACACTTTATGAGGCGGACTCA GAGAGGGCCAAATTTGCTAGCTCATATGATAACTTGCATATTGCTAAATCAGAAAGTGTG ATCCCATCTGCATAAGAAGGTTATCAGAGCTTGCAATATATTGTAAGAATAATGGACTTG AGTGTCAAGACTCTTGCTGACCCTGTCTAGCGAATGCCGGGGGAAGTGCAAACAGCGTTT TTGGTCAAGTTGCGGAAGAAGCCATAGTGAAGGGTTGGAGTGATGTACTTATGTATATAA CTATGTGAGATAGGACTTAAAAGTCCGCCTAGGATGATTGGCTTGTAGTGTAGCATGTCA ATAATGCAATATCTTTTTCAGTTTATATGTGTATATAATACAAAGATATCTTTGTTTATG TAGAATCCAGGGGGTGCCAAGTCTGTTTGTGTTCACAGAGGCGTTGCTTGTATAAAGAGT TGAGTATCTTTGACTTATTGGCTGTATCCTGTTGTAAGATTTCTTGTTGAGATTTTTGCA TACGATGTTAGGAATTGTGTGAAATATTTTTCAATTCCCATTTTGTTTGTGTGTTATGAG TATAGATCATTTGTCAAGCCGCCGCAAATTACCACTCGAATGTATACTTTGTAGATGTCA ACAAGAT >LITCHI025771.m1 GenomeSequence - 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