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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006467Chr1114954891499453-Cold shock protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006467.m1872PF00313.25CSDDomain81.92.40E-23
LITCHI006467.m1121137PF00098.26zf-CCHCDomain29.55.70E-07
LITCHI006467.m1152167PF00098.26zf-CCHCDomain329.30E-08
LITCHI006467.m1177198PF13917.9zf-CCHC_3Domain16.20.008
LITCHI006467.m1179196PF00098.26zf-CCHCDomain27.62.30E-06
LITCHI006467.m1204224PF13917.9zf-CCHC_3Domain12.60.11
LITCHI006467.m1207223PF00098.26zf-CCHCDomain281.60E-06
LITCHI006467.m1245261PF13917.9zf-CCHC_3Domain10.20.62
LITCHI006467.m1246262PF00098.26zf-CCHCDomain34.81.10E-08
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TGCTTCAAGTGTGGCGGTTTCGGGCACTTGGCAAGGGAATGCACTAACAGAGGCGGAGGA
GGCGGCGGCGGCGGCGGACGTTGCTATAGTTGTGGGAAGTCAGGGCATTTGGCTAGAGAG
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CCAGCTCGAGGCTGATGGAAAGTACCAGGCCCTTGATGTCACGGCTCCTGGTGGCGCGCC
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TGGTGGTGTTGTGTGTTATAATTGTGATGGAGTTGGACATTTGGCGAGGGAGTGTACTAG
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CGGAGGCGGCGGTGCTGGTGGCTCCACCTGCTTTAATTGTGGGAAGCCAGGACACTTCGC
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ACATGACTCAGGTAGTAATTTTTGTTGAGTCAAAAACGATTTCTTATTAAGACAAATCGG
ACTATTGGTCTGATGGGGAAGGAGATGATACTATGATACTGGATTTTAGAGTCCCTATAC
GCTGTATACAATTAAATAATGTGTTATGCGGAATGCAAAAAGGCTTTCGCTTTAAGTGAG
CTGAACCCCGCAACATAATGTGAGCTGTGACTGATTTTTTACGTCCTTAGCTGCATTAGA
GGATTAGGCAATATTAGTTTATGAGCATTGAATAAGTGTTAATTTATGAACATTGATTTA
ATTTTCATTACAAGCTATGTTTTTGCCACATCTAGTCTTGCAGTCTTTTTTACTGTGTCC
TATCCAATCACAAGTCTCTTGTTATCAGGATCCGATCCTCTCTATGTTTGGACTTCGTAA
TTGGTCTCAATTTGTTAGTTTTAGAACTCTCTCTGTGCTTCAGTACAGAACATGATGATC
TTTCTGCCTCTGAGCTTTTGTCTTCAAGAATGAACAGTCGTGCTTTAGTAACTTAAGCAT
TTAGAACTGTTGAAGCCTGGGTTTTGAGGTGAGAGATGGGTTAAGTTCTGGGTACTGTGA
CTTGTTCTGCTGAATATACTTGATTACAAATCAATCTTCAAGGTTCTGTAAATTACAGTT
GCATTGCATATGGGAACTACGTTAAGGAGGTTCTTGGACAGAAGATCATATAGATTGGAG
GATATCATTGTTTGTTTTAAGTCTCTTCTTCTTACATGGGTATGTTTCTTAGGATGGATG
AATAGTGGTAGCAATATCGCATTCACCAGCAATTCCCTCTTTGTCATCCACATGAGGGAA
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GTGTTCCAATGGCTCTTGAGCCATAAGTATCTTTTCAGTGACTGCTTTGAAGATTAAACA
ATGAGTTTTACTCTGCTTTGTTCTGGGCATCACATGTTGTGAATAACTTGAAAGGGATGT
GTATTTCTTTCTGATTCAAATGGTTGCTGATTTATCTATTGGGCATTTTGCAATGAGAGA
ATATGATAGGTAACGGCATTCTTCTTTAAATAATGAGAATCAAATTACTATTTGGCTAGT
AATTAGTAATCCTAAAACGTTCCCAGTTAAAATATTATTTCTAATCGCGAATGAAATTGA
AAGGGAATCAATTTTCATTAGGGATCTCTTACTCGTTCGGATTTGTGATTAGTTTATGCG
CCTTTTACATCTGTTTATGGTAGGTCTCGTGGGCCTGGTTAAGAAGTTTTGCTAACTGTA
GGACGTTGTAAGATCGACTTGAACCGATTTGGGTCCATTTGTATTTGTCCAATTGAACTT
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TCTTTCTTATGGCCCATCGAAGTTTCCAACCCAGTAACCTCGTGGGTTGTGAGGACATCA
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>LITCHI008471.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TATCATAGCATGATTTCCAGTTTCAAGAAGTCAAATGAGTTTTTCCTAAATTATTTTTAT
GTTACCGTTACACAAAATTGTATAAAAGCTTATGTATACATTCTTTATAAATAAGGATAT
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ATTGATAAGTGTTTCTTTTACCATGCATCTTTAATTACTTCTAGTATAATTTAATATTTA
GTTTTTTAATCGATTACTATTCAATTTTAAAACGTTTTATTTCAACTTTCTTAGTTAAGC
TTAAAAGGAATAAACCTTCGCTTCAAAATAATTATAAATTATTCATTGTTTTCTTTTTTC
TTTTTTTTTGGGTTTTTGGAAAAATAATTCTAAAGCTGATTAATGAATTCTCAATGATTA
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AATTTGTTTTATTATCAACTTTAAAGCATAGCTATGAAATTTTGTATATTTTACGTAATA
TATTTGTTAGAACTTCTCACCTAATAACTAAAACTTTTAGGTTAAGTAATCACTAACATA
TTATCAATTCATATTAAACCTACCAACTAAATATATAACTTTTTTCAATCAATACATTTA
TTTTCAATCAAAACTGAGAAATGAGTCTCATTCATGAAAACAACATTAAGACTTTTTAAG
TCAGATTAGTGGAATAGTATTAATTACATGTGGGTATTTATTTAATTATCACTGTCCCCA
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TGCCTTCATGGACTCTTGAAACCAACACAAGCCTGTGTACGTGGTCTGGAATTTCATGCA
ACCAAGCTGGAAGTGTCACTGTTATAAACCTAACAACTTTAGGTTTAAGAGGTACGCTTG
ATGAATTCCCCTTCTCATTGTTTCCTCAGCTTTCTTATCTTAGTCTTAGCATAAATGAAC
TCTTTGGTACCATTCCGCCTCAAATCACTAACCTCTCCAAACTCAAGTACCTTGATTTGT
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GTTCTCTTTCCAATCTAGATTTGAGCCAAAATGAATTCCACGGTTCTATTCCTTCTTCAA
TTGGTAATTTGAGCAACTTAAAAGTTTTATATCTTTATCTTAACAACCTCACTGGCTTTA
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TTACCGGTTCTATTCCTTTTTCTGTTTGTAATCTAAGCAACTTAGAGACTTTGTACCTCA
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TTTCTGGTTCTATTCCTGAGGAAATAGGTGACTTGAAGTCTCTATTGACTCTAGAGTTGG
GCGGTAATAAACTTAATGGTCATGTTCCTCCTTCTTTTGGTAATTTGAGTAACCTAATCG
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CTCAACTGCATCGACTTGATATTTCATCAAATCATTTATCTGGGGAGATTCCCTTGGAGC
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TACCTATGGAGCTTGGATCACTCACTGAACTTGAGTACCTTGACTTGTCAGCAAACAGAT
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TGAGTCAAAACTCATTTCGCGGAAAGATACCATCTCAAATCTGCAGATTGGAGAGCTTGG
AGAAGCTGAATCTCTCGCACAATAACCTCTCTGGTGTAGTTCCAAGAGAATTTGAAGAAG
CGAGTGGCTTGTCAAGCATTGACATTTCATATAATGATTTGGAGGGTTCAATTCCCAATT
CCAAAGCATTTCAAGAGGCTCCCTTGGAAGCTTTTCAAGGGAACAAAGACTTGTGCGGTG
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TGATTGGGCTATTCTTTGGTTTCCGAAGAAGGCAGAGACACTCAGAAAAAGAAGCGATAA
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ATGGAACTGTTTACAAAGCCGAGCTACAATCTTGGGAAATTGTCGCAGTAAAGAAATTGC
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GGGCATTAACAAATATACGACATCGAAACATTGTCAAATTTTATGGATTTTGCAGACACA
ATGAAAACTCACTTTTGATATATAATTACCTTGTGAGGGGTAGCTTGGCCTCAGTTTTGA
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TTGCCCATGCCTTGTCATATTTGCACTATGGTTGCTTCCCACCTATTGTCCATAGAGATG
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ATGTTGCACCAGGTATATATGTCTAATTCATTCATTATTGTAGCCTTATTTGTCAAATAC
AATTAACTTGTATTACATAATCATGATATCTTCCATCTTGTAGAGCTTGCATACACAATG
GAGGTAACTGAAAAATGTGATGTATACAGCTTTGGAGTTTTAGCTTTGGAAGTAATCAAC
GGAGATCATCCAAGAGACCTTCTCTTCGCACTTTCAACTTCATCTGATAATCTAAACATA
ACACTTCATGATGTGATAGACCAACGGATTTCAACTCCTTCATTTCAAGTTGAGAACAAA
CTAAAATCCATTATGGAAGTGGCCTTGTTATGCTTGGATGTGAATCCACAATCTAGACCG
ACCATGCAGATTGTGTCTCAACTTCTTTGTGACTAGGTCGTTTTTTGCACAAGTCATTAC
ATGGTGATAACTCTTGTAGGGTTAATTTTATGCTAGTTGTTCTTTGTGATTATTCAAATT
TCTTTTTGTCACAAGTGTTATGCATTAAATATAATCAAAGGGCTATTATCATTTCTCCCT
TTGAGGTTTCACAATATATTGATTTCCCCTTTCAGTTCATGTTCTGTTCATTGATTTGCC
TTTTTGAACTTCTGTTTCAATTGAGAAGAAAAAAGTACACTTAACCTTTCAAATAAGAAA
TAACTATTCTATCATTACAAGAAATGTGAATATTAGATACCATACATTTGGAGTCGAATA
GATATTTGGTCTCTAAATAACACTTTTGAGAACGCATTCTATCATTCGTCTCTGTAAATA
TGAAATTTTGTTTTGTGGTAGGACTTTTAACTTAGGGGACATTTTGAGACGATATAGTTC
GTCTCTGAATGAAGTAATCTACTACAATTCCTATTTAGTACCCAAATGTTGGTTATATTT
TCAATCCAATTCATTTTTTGTCTTCAACTGAAGCTCTTAGCAACAAATTTTAGTACTCGT
CTCAGTAGATATGGATTTCAAATTCATCATTTGTTTAGGGGAAGATTAAGAGACGATAGA
GTGTGTCTCTAAATCATATTTTCTACTACAATATGATATTTTATCTCTAAATACTAGTTA
CCTTTTGAGTCTAAATTAAATTTAGTCTCCAAAGAAAGTTTTT