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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006467 | Chr11 | 1495489 | 1499453 | - | Cold shock protein 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006467.m1 | 8 | 72 | PF00313.25 | CSD | Domain | 81.9 | 2.40E-23 |
LITCHI006467.m1 | 121 | 137 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 29.5 | 5.70E-07 |
LITCHI006467.m1 | 152 | 167 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 32 | 9.30E-08 |
LITCHI006467.m1 | 177 | 198 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 16.2 | 0.008 |
LITCHI006467.m1 | 179 | 196 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 27.6 | 2.30E-06 |
LITCHI006467.m1 | 204 | 224 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 12.6 | 0.11 |
LITCHI006467.m1 | 207 | 223 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 28 | 1.60E-06 |
LITCHI006467.m1 | 245 | 261 | PF13917.9 | zf-CCHC_3 | Domain | 10.2 | 0.62 |
LITCHI006467.m1 | 246 | 262 | PF00098.26 | zf-CCHC | Domain | 34.8 | 1.10E-08 |
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>LITCHI006467.m1 ATGGCACAGGTGACGAGATCGACGGGGAAGGTGACGTGGTTCGATGACGTGAAGGGGTAC GGATTCATCAAGCCTGACGACGGAGGAGCGGATCTGTTCGTCCATCAGAAATCCATCAAA TCCGACGGCTATCGCACGCTCTACGAGAATCAGTCTGTCGAGTTCGATGTCCAGCTCGAG GCTGATGGAAAGTACCAGGCCCTTGATGTCACGGCTCCTGGTGGCGCGCCGATTCTGTCG CCCAAGAAGGAGACCGGATTCGGCGGAGGAGGACGCGGTGGAGGAGGGCGTGCTGGTGGT GGTGGAGGATTTGGCGGGAATTGGAAGAGTGATGGAAGGAGGAACGGCGGTGGTGGTGTT GTGTGTTATAATTGTGATGGAGTTGGACATTTGGCGAGGGAGTGTACTAGTGGAAGAAGG AGCAGCGGAGGAGGAGGAGGCGGAGGTGGTGGTAGTTGTTATAACTGTGGCGATCCTGAG CATTTTGCGAGGGATTGTCCACTTCAACAAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAACC TGCTTCAAGTGTGGCGGTTTCGGGCACTTGGCAAGGGAATGCACTAACAGAGGCGGAGGA GGCGGCGGCGGCGGCGGACGTTGCTATAGTTGTGGGAAGTCAGGGCATTTGGCTAGAGAG TGTACTGAAGGAGCCGCCGCTGGCAGCGGAGGAGGCGGTTACGGGAGGTTCGGAGGCGGC GGTGCTGGTGGCTCCACCTGCTTTAATTGTGGGAAGCCAGGACACTTCGCGAGGGAGTGC ACTAAGGTCTCTGCTTGA
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>LITCHI008471.m1 GenomeSequence + AACTTACAAAAATATCTTTCTGGATGCATAGACTTTTCAAGCCTTGAGATACTGTAGATT GCAAGAACCTGACCCCATATATGTAATGAGATCAAAATCATCATCTCCATAGCACGAAAA CAGAAGCAATGGAGTACCTGTCAACCTCGAGCAAAGTATTCTCACTTGTTTCCTTGATCC TCTATGTTATGTTATATTTTTCACTTCTATTGATCAAACCTACCACTTCTATTGATCAAG AAGAAGCATACGCTCTTTTGAAATGGAAGGCCACCCTTCAAAATCAGAACCTTTCTCTCT TGCCTTCATGGACTCTTGAAACCAACACAAGCCTGTGTACGTGGTCTGGAATTTCATGCA ACCAAGCTGGAAGTGTCACTGTTATAAACCTAACAACTTTAGGTTTAAGAGGTACGCTTG ATGAATTCCCCTTCTCATTGTTTCCTCAGCTTTCTTATCTTAGTCTTAGCATAAATGAAC TCTTTGGTACCATTCCGCCTCAAATCACTAACCTCTCCAAACTCAAGTACCTTGATTTGT CAAAGAATCAATTGTCTGGGAGGATACCACCAGAATTAGGCCATCTAACACATCTAGAGG TCCTTTATCTTTTTCAAAACAAGTTAAATTACTCTATTCCTGAAGAAATAGGTAACTTAA GTTCTCTTTCCAATCTAGATTTGAGCCAAAATGAATTCCACGGTTCTATTCCTTCTTCAA TTGGTAATTTGAGCAACTTAAAAGTTTTATATCTTTATCTTAACAACCTCACTGGCTTTA TTCCTGAGGAGATAGGAAAGTTGATTTCAGTTTCCAATCTAGACTTGAGCTTCAATCAAT TTACCGGTTCTATTCCTTTTTCTGTTTGTAATCTAAGCAACTTAGAGACTTTGTACCTCA ATAGCAGTAAGCTTTCTGGATATATTCCAAAGGATATAGGAAAGCTAAAGTCTCTTTTTG ATTTATCATTGAAACATAATCAATTAATAGGTTCCATTCCTCCTTCTTTTGGTAATTTGA GTAGCTTAAAATTTTTAAACCTCAGGTATAACAGTCTCTCTGGATTCATTCCTGAGGAAA TAGGAAAACTAAAATCTCTTTTCAATCTAAGTTTAGGTGAAAATCAACTCATCGGTTCTA TTCCTCCTTGGGTTGGTAATCTAAGCAACTTAAAAGAGTTGGATCTTTACAATAATATGT TTTCTGGTTCTATTCCTGAGGAAATAGGTGACTTGAAGTCTCTATTGACTCTAGAGTTGG GCGGTAATAAACTTAATGGTCATGTTCCTCCTTCTTTTGGTAATTTGAGTAACCTAATCG ATTTGTACCTCCCTGACAACCAACTTTCTGGTCCACTTTTCCCCGAAATTGGGAATTTGG TCAAGCTGGTTTCATTAATTATCAATGAAAACCACTTCACTGGTTATTTGCCTTATAACA TTTGTGGAGGTGGATCACTCAAGTTCTTCGAGGTAACTCACAACCATTTTGAAGGGCCAA TCCCCAAAAGCTTTAAAGATTGCAAGAGCCTATTCAGAATCCACCTTACAGGGAACCAAT TCACTGGAAAGATATTTGACGATTTTGGCATCTACCCAAATTTGGAGCTCTTAGATCTCA ACCAAAATAAATTTTCTGGTAAAATCTCATCAATCCAGGGAAAATTCCCACAATTAGGCA TTTTAAACATTTCAGGTAATAATATTGATGGAAGCATACCTTCTGAGATTGGAAATGCAA CTCAACTGCATCGACTTGATATTTCATCAAATCATTTATCTGGGGAGATTCCCTTGGAGC TTGGAAAGTTGACAAATCTCAACATATTGATTTTGCATGGGAATCAAATTTCTGGAAGTA TACCTATGGAGCTTGGATCACTCACTGAACTTGAGTACCTTGACTTGTCAGCAAACAGAT TAAGCAAATTCATTCCAGGTGACTGGCTGAAATTGCATTATCTGAATTTGAGCAACAATA AATTTAGTCAAGAGATTCCAGTTCAGTTTGGGATGTTGGTTCAACTGTCAGAATTAGATT TGAGTCAAAACTCATTTCGCGGAAAGATACCATCTCAAATCTGCAGATTGGAGAGCTTGG AGAAGCTGAATCTCTCGCACAATAACCTCTCTGGTGTAGTTCCAAGAGAATTTGAAGAAG CGAGTGGCTTGTCAAGCATTGACATTTCATATAATGATTTGGAGGGTTCAATTCCCAATT CCAAAGCATTTCAAGAGGCTCCCTTGGAAGCTTTTCAAGGGAACAAAGACTTGTGCGGTG CTGTTCATGGATTGCAACCTTGCAAAGTTCTCACGTCACACAAACATGTCTTCAAATCGA GAAAGATAATGTTTATAGTTGTGTTTTCGCTATTAGGAACTCTTACACTAACAATTGGGT TGATTGGGCTATTCTTTGGTTTCCGAAGAAGGCAGAGACACTCAGAAAAAGAAGCGATAA ATAGTGAGAACAACCAAGCAATGCTTTCAATTTTAACGTTTGAAGGCAAAAAGATGTATG AGGAAATCATAAGAGCAACAAATAATTTTGATGACAGTTATTGCATCGGGAAGGGTGGAC ATGGAACTGTTTACAAAGCCGAGCTACAATCTTGGGAAATTGTCGCAGTAAAGAAATTGC ATTCGTCATGCGTTGGTGAAAGTGAAAATGCCTATCAAAAAGAATTCGAAAATGAAATAA GGGCATTAACAAATATACGACATCGAAACATTGTCAAATTTTATGGATTTTGCAGACACA ATGAAAACTCACTTTTGATATATAATTACCTTGTGAGGGGTAGCTTGGCCTCAGTTTTGA GTAATGAAGCAACGGCAATAGAGCTAGACTGGAGTAGGAGGATTAATGTTATAAAAGGTG TTGCCCATGCCTTGTCATATTTGCACTATGGTTGCTTCCCACCTATTGTCCATAGAGATG TATCAAGCAAGAATGTGTTGTTAGATTTGGAATACGAAGCTCATGTTTCTGATTTTGGTG TTGCTAAGCTTCTCAAGGTAGATTCATCCAATTTCACCGAACTTGCAGGCACCTATGGAT ATGTTGCACCAGGTATATATGTCTAATTCATTCATTATTGTAGCCTTATTTGTCAAATAC AATTAACTTGTATTACATAATCATGATATCTTCCATCTTGTAGAGCTTGCATACACAATG GAGGTAACTGAAAAATGTGATGTATACAGCTTTGGAGTTTTAGCTTTGGAAGTAATCAAC GGAGATCATCCAAGAGACCTTCTCTTCGCACTTTCAACTTCATCTGATAATCTAAACATA ACACTTCATGATGTGATAGACCAACGGATTTCAACTCCTTCATTTCAAGTTGAGAACAAA CTAAAATCCATTATGGAAGTGGCCTTGTTATGCTTGGATGTGAATCCACAATCTAGACCG ACCATGCAGATTGTGTCTCAACTTCTTTGTGACTAGGTCGTTTTTTGCACAAGTCATTAC ATGGTGATAACTCTTGTAGGGTTAATTTTATGCTAGTTGTTCTTTGTGATTATTCAAATT TCTTTTTGTCACAAGTGTTATGCATTAAATATAATCAAAGGGCTATTATCATTTCTCCCT TTGAGGTTTCACAATATATTGATTTCCCCTTTCAGTTCATGTTCTGTTCATTGATTTGCC TTTTTGAACTTCTGTTTCAATTGAGAAGAAAAAAGTACACTTAACCTTTCAAATAAGAAA TAACTATTCTATCATTACAAGAAATGTGAATATTAGATACCATACATTTGGAGTCGAATA GATATTTGGTCTCTAAATAACACTTTTGAGAACGCATTCTATCATTCGTCTCTGTAAATA TGAAATTTTGTTTTGTGGTAGGACTTTTAACTTAGGGGACATTTTGAGACGATATAGTTC GTCTCTGAATGAAGTAATCTACTACAATTCCTATTTAGTACCCAAATGTTGGTTATATTT TCAATCCAATTCATTTTTTGTCTTCAACTGAAGCTCTTAGCAACAAATTTTAGTACTCGT CTCAGTAGATATGGATTTCAAATTCATCATTTGTTTAGGGGAAGATTAAGAGACGATAGA GTGTGTCTCTAAATCATATTTTCTACTACAATATGATATTTTATCTCTAAATACTAGTTA CCTTTTGAGTCTAAATTAAATTTAGTCTCCAAAGAAAGTTTTT